MOMENTO 3

TRABAJO COLABORATIVO 1
CURSO: BIOQUIMICA
GRUPO: 201103_36

ESTUDIANTES:
JOHN ALBERTO HENAO LOPEZ CC: 15.453.719
FRANCISCO JAVIER ECHEVERRI CC:
CESAR AUGUSTO RIOS CC: 94.398.757
NGELA MARA OSPINO OROZCO CD. 67.027.1177

TUTOR
ALBERTO GARCIA JEREZ

UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA

ABRIL 9 DE 2015

PROBLEMA 1
Los autores Chou y Fasman (1978) consideraron que la estructura secundaria de una protena
puede estar en uno de estos 3 estados: hlice-, hoja- o giro. Analizaron la base de datos de las
secuencias de protenas y encontraron la distribucin de residuos en cada una de estas
estructuras. De lo cual analizaron la tendencia intrnseca de un aminocido a estar en una
determinada estructura secundaria. Esta tendencia es propia de cada residuo, pero el que ese
residuo est o no en una determinada estructura no slo depende de l sino tambin de los
aminocidos contiguos en la secuencia. Analizando las tendencias de los aminocidos a formar
parte de una hlice-, P(), de una hoja-, P(), o de un giro, P(turn), se puede predecir si un
determinado segmento de una cadena peptdica formar o no determinada estructura
secundaria.

1. INDICA QUE AMINOCIDO TIENDE A ESTABILIZAR LA -HLICE Y CUALES

SON LA CONSECUENCIAS DEL NO PLEGAMIENTO.

AMINOCIDOS Y PROTENAS
Los aminocidos son los precursores moleculares de las protenas, ya que las protenas son
polmeros de aminocidos, los que varan en cuanto a cantidad y tipo entre protena y protena
(Maynard et al., 1998). Bohinski (1991) y Murray et al. (2001) mencionan que existen alrededor
de 300 aminocidos diferentes de origen natural. Muchos de ellos se observan en determinadas
formas de vida, algunos slo aparecen en una especie. Sin embargo, todos los organismos usan
slo 20 de ellos para la biosntesis de protenas.
Los aminocidos son los monmeros que se combinan para formar las protenas. El grupo amino
est unido al carbono alfa que es el carbono contiguo al grupo carboxilo. Al carbono alfa de cada
aminocido tambin estn unidos un tomo de hidrgeno y una cadena lateral (R). Los distintos
alfa aminocidos se diferencian por sus cadenas laterales. El pKa de los grupos carboxilo y amino
de los alfa-aminocidos es aproximadamente 2 y 10, respectivamente (Mathews et al., 2005).

Los aminocidos son derivados de los cidos grasos de cadena corta y contienen un grupo bsico
amino (-NH2) y un grupo carboxilo cido (-COOH). En la naturaleza los aminocidos asumen la
configuracin L, comparados con la L-glicerosa (Figura 3.2). La mayora de ellos son solubles en
agua y todos, excepto la glicina, muestran actividad ptica. Ya que tienen tanto el grupo amino
como el grupo carboxilo son anfteros, pues asumen propiedades cidas o bsicas dependiendo
del pH del medio. En un pH cido el aminocido es un catin, mientras que en un pH bsico es
un anin, y al pH en que es elctricamente neutro es un ion dipolar y se llama zwitterion. Este pH
se llama punto isoelctrico del aminocido (Maynard et al., 1998).
Los aminocidos son molculas orgnicas pequeas que contienen un grupo carboxilo (COOH) y
un grupo amino (NH2). El grupo carboxilo es cido dbil, mientras que el grupo amino es bsico
dbil.

Todas las protenas se construyen a partir de 20 aminocidos, aunque se conocen otros ms. A
continuacin un listado de los conocidos como -aminocidos:
Protena
Alanina
Arginina
Asparagina
Asprtico

Sigla
Ala
Arg
Asn
Asp

Inicial
A
R
N

Caracterstica
Hidrofbico
Bsico e hidroflico, por la presencia del grupo amino libre
Sitio de unin covalente (N-glicosdico) de los

carbohidratos
cido e hidroflico, por la presencia del grupo carboxilo

Cistena
Fenilalanina
Glicina
Glutmico

Cys
Phe
Gly
Glu

C
F
G
E

libre
Oxidacin del grupo sulfhidrilo (-SH) forma enlaces (S-S)
Fuertemente hidrofbico
Amfiflico, puede existir en todo tipo de ambientes
cido e hidroflico, por la presencia del grupo carboxilo

Glutamina
Histidina
Isoleucina
Leucina
Lisina

Gln
His
Ile
Leu
Lys

Q
H
I
L
K

libre
Moderadamente hidroflico
Bsico e hidroflico
Hidrofbico
Hidrofbico
Fuertemente bsico e hidroflico

Metionina
Prolina
Serina

Met
Pro
Ser

M
P
S

Hidrofbico
Su presencia provoca torcimientos de la cadena proteica
Sitio de unin covalente (N-glicosdico) de los

Tirosina
Treonina

Tyr
Thr

Y
T

carbohidratos
Moderadamente hidroflico por la presencia del grupo -OH
Sitio de unin covalente (N-glicosdico) de los

Triptofano
Valina

Trp
Val

W
V

carbohidratos
Poco frecuente en las protenas vegetales
Hidrofbico

CARACTERSTICAS GENERALES DE LAS PROTENAS

Las protenas desempean una gran variedad de funciones: unas transportan y almacenan
molculas pequeas; otras constituyen gran parte de la organizacin estructural de las clulas y
los tejidos. La contraccin muscular, la respuesta inmunitaria y la coagulacin de la sangre se
producen mediante las protenas. Tal vez las protenas ms importantes son las enzimas, que son
catalizadores que facilitan la variedad inmensa de reacciones del metabolismo.
Las protenas no son slo polipptidos: sino que son polipptidos de secuencia definida (Mathews
et al., 2005). De todas las molculas que se encuentran en los seres vivos, las protenas son las
que tienen las funciones ms diversas participando en la catlisis (enzimas), estructura
(proteccin y sostn), movimientos (endocitosis, exocitosis, movimiento ameboide de los
leucocitos por la actina y tubulina), defensa (queratina, inmunoglobulinas, fibringeno y
trombina en la coagulacin sangunea), regulacin (factores de crecimiento, hormonas),
transporte (transportador de glucosa), almacenamiento (reservas de nutrientes), respuesta a las
agresiones (secuestrantes de metales txicos, protenas de choque trmico), entre otras (McKee y
McKee, 2003).
La alteracin de la concentracin o estructura de una protena puede disminuir la funcin celular
y conducir a la aparicin de una enfermedad, por ejemplo, la reduccin de la concentracin de
insulina o la falla de esta produce diabetes mellitus. Existen procedimientos de separacin para
purificar y caracterizar las protenas. Las protenas en disolucin muestran cambios profundos de
su solubilidad en funcin del pH, la fuerza inica, las propiedades dielctricas del disolvente y la
temperatura. Estas variables que son reflejo del hecho de que las protenas son electrolitos de
peso molecular muy grande, pueden utilizarse para separar mezclas de protenas, ya que cada

protena posee una composicin en aminocidos caracterstica, la cual determina su

comportamiento como electrolito. (Laguna y Pia, 2002)

ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS

La funcin de la protena depende de su estructura tridimensional. La estructura tridimensional es
nica y depende de la secuencia de aminocidos. Est estabilizada por enlaces covalentes (enlace
peptdico y puentes disulfuro) y enlaces dbiles (puentes de H, fuerzas de Van der Waals e
interacciones inicas).
Todas las protenas comparten patrones estructurales comunes, pero proporcionan diferente
funcin en cada caso. Se diferencian diferentes niveles estructurales:
-Estructura primaria: Es una descripcin de todos los enlaces covalentes que unen los
aminocidos de una cadena peptdica. Lo ms importante de la estructura primaria es la secuencia
de los residuos de los aminocidos.
-Estructura secundaria: Se refiere a disposiciones particularmente estables de los aminocidos
que dan lugar a patrones estructurales repetitivos.
-Estructura terciaria: Describe todos los aspectos del plegamiento tridimensional de un
polipptido.
-Estructura cuaternaria: Disposicin en el espacio cuando una protena posee dos o
ms subunidades polipeptdicas.
1. Formacin de estructuras secundarias (-hlice y -lmina)
Actan como ncleos de plegamiento, estabilizando otras regiones ordenadas de la protena.
2. Formacin de dominios
Por agregacin cooperativa de distintos ncleos de plegamiento
3. Formacin del glbulo fundido
En protenas con varios dominios, dichos dominios se agregan formando un glbulo fundido
4. Transformacin del glbulo fundido en una estructura terciaria
que adopta la estructura nativa de una protena monomrica Se logra mediante pequeos cambios
conformacionales.

5. Adquisicin de la estructura cuaternaria y obtencin de la forma nativa

Estructura cuaternaria exclusivamente en protenas multimricas.

ESTRUCTURA PRIMARIA
Secuencia de aminocidos codificados por ADN sufriendo una previa traduccin y transcripcin.
Se estabiliza mediante enlaces peptdicos. Los aminocidos hidroflicos polares forman puentes
de hidrgeno. Esto hace que tenga una mayor movilidad y distribucin, gracias a la polaridad.
Mientras los aminocidos hidrofbicos tienen una nica posicin, estn fijos y agrupados. El
codn de iniciacin traduce siempre al empezar por metionina. La secuencia no se encuentra en
ningn momento en la clula ya que al ir traducindose se pliegan y se forma directamente
la estructura secundaria.
La secuencia de aminocidos determina la posicin espacial de la estructura primaria. Algunas
caractersticas de los aminocidos son:- Glicina: Mayor flexibilidad.- Prolina: Mayor limitacin
esfrica- Cistena: Proporciona la formacin de puentes disulfuro.- Lisina, arginina, histidina,
glutamina, glutmico, asprtico y asparagina: Mayor superficie y mayor cantidad de puentes de
hidrgeno- Valina, leucina, isoleucina y triptfano: Disminuye los grados de libertad de giro y se
encuentran en el exterior. (Esto es debido a que no interaccionan con el agua y estn todos
agrupados, teniendo as menor libertad de distribuirse).

ESTRUCTURA SECUNDARIA
Disposicin regular y repetida del esqueleto polipeptdico en una direccin determinada. El
carcter parcial del doble enlace del enlace peptdico limita su capacidad de giro. Los giros
permitidos son C- N y C -C. Las posibilidades de giro van a determinar la estructura final de la
protena, y con ello su funcin. No todas las conformaciones son posibles fsicamente ya que

pueden existir impedimentos estricos. Se adoptan las conformaciones energticamente

favorables, estas son las que menos impedimento estrico tienen, generan menos tensin fsica y
tiene una menor repulsin electroesttica. Dentro de las estructuras hay algunas que no se
organizan, ya sea por interacciones electroestticas o impedimentos. Por tanto, hay regiones con
diferentes plegamientos o incluso sin plegar.
ADN-A
Sentido de giro de la hlice
Forma y tamao

Dextrgiro
Ms ancha y
corta

ADN-B

ADN-Z

Dextrgiro

Levgiro

Intermedia

Ms estrecha y larga

Estrecho,

Amplio, profundidad

profundo

media

Amplio, no

Estrecho, profundidad

profundo

media

2,55 nm

2,37 nm

1,84 nm

Par de bases

Par de bases

Dos pares de bases

11

10,4

12

0,23 nm

0,34 nm

0,53 nm (GC) / 0,41 nm (CG)

2,53 nm

3,54 nm

4,56 nm

32,7

34,6

30

19

1,2

Balanceo

5,9

-1

3,4

Alabeo

15,4

11,7

4,4

E C3'-endo

E C2'-endo

Anti

Anti

+ Sinclinal

+ Sinclinal

Surco mayor

Surco menor
Dimetro de la hlice
Unidad estructural
Pares de bases/vuelta
Distancia entre pares de
bases
Paso de hlice o vuelta
completa
Rotacin por residuo
Inclinacin de los pares de
bases

Plegamiento del azcar

Conformacin enlace Nglucosdico
Conformacin enlace C4'C5'

Sin profundidad

Estrecho, profundo

E C2'-endo (pirimidinas) / E C3'endo (purinas)

Anti (pirimidinas) / Syn (purinas)
+ Sinclinal (pirimidinas) /
Antiperiplanar (purinas)

Los elementos de estructura secundaria El diagrama de Ramachandran muestra claramente que

existen, grosso modo, dos zonas de ngulos y permitidos, ambas con valores negativos del
ngulo , que se diferencian por el valor positivo o negativo del ngulo . Al analizar la
estructura tridimensional de cualquier protena, se aprecian regiones en las que los carbonos de
varios residuos consecutivos adoptan ngulos y similares, que caen, todos ellos, en una de las
dos zonas permitidas del diagrama de Ramachandran. Este simple hecho determina que la cadena
polipeptdica adopte, en dichas regiones, una disposicin peridica de sus unidades peptdicas.
Las dos disposiciones peridicas tienen, respectivamente, forma de hlice o de cadena extendida
y se conocen como hlice- y lamina-. La asociacin mediante puentes de hidrgeno de varias
hebras adyacentes da lugar a las lmina-.
Las interacciones hidrofbicas se dan entre las cadenas laterales de los aminocidos hidrofbico,
estos aminocidos suelen disponerse en el interior de la protena, evitando de esta manera las
interacciones con el agua. Este tipo de fuerzas hidrofbicas intervienen en el correcto
plegamiento de la protena. Por lo cual esta capacidad hidrofbica brinda una ventaja ya que
como se mencion anteriormente en la presencia del agua la estabilidad de los puentes de
hidrgeno disminuye. Cuando un aminocido esta disuelto en agua, se puede comportar segn el
pH en como cido o como base: los aminocidos a pH bajo (cido) se encuentran
mayoritariamente en su forma catinica (con carga positiva), y a pH alto (bsico) se encuentran
en su forma aninica (con carga negativa). Es por esto que al tener una cadenas laterales y sin
carga, como en polipptidos constituidos anilanina, estos tienden a formar espontneamente alfa
hlice, en una solucin acuosa a pH 7, mientras que si se tiene polipptidos formados
principalmente por aminocidos con carga positiva o negativa en su cadena lateral, estos no
forman alfa hlice con un pH de 7, ya que las cargas iguales se repelen.

LAS HLICES
Una hlice- es cualquier secuencia de 5 o ms aminocidos consecutivos de una protena con
ngulos de ~ -57 y de ~ -47. Al adoptar estos ngulos, el grupo CO del aminocido yqueda
a la distancia y orientacin adecuadas para formar un puente de hidrgeno con el NH del
aminocido i+4. Los 4 grupos CO del extremo carboxilo de la hlice y los 4 grupos NH del

extremo amino no cumplen esta regla, sencillamente, porque la hlice termina en ellos. Las
hlice- completan una vuelta alrededor de su eje cada 3.6 aminocidos, recorrido en el que
avanzan 0.54 nm a lo largo del eje (cada residuo avanza 1.5 ). Como los planos de los enlaces
peptdicos quedan dispuestos de forma casi paralela al eje de la hlice, sus dipolos quedan
automticamente alineados. Por su parte, las cadenas laterales de los residuos salen del "cilindro"
de la hlice apuntando hacia el exterior de forma no enteramente perpendicular, sino inclinadas
ligeramente hacia el extremo amino. Las hlices, en general, son objetos quirales, no idnticos a
sus imgenes especulares. Las hlices- de las protenas son de tipo R. Aunque una hlice-
puede tener cualquier longitud a partir de 5 residuos, las hlices de las protenas globulares
solubles en medio acuoso constan, en promedio, de unos 12 residuos. Sin embargo, las hlices
transmembrana caractersticas de las protenas que atraviesan las membranas biolgicas suelen
ser bastante ms largas. (Laguna y Pia, 2002).
Por otra parte, el grado de exposicin al disolvente de una hlice- de una protena se puede
deducir fcilmente utilizando la representacin denominada rueda helicoidal. Cuando los
residuos polares se agrupan en una cara y los apolares en otra, se trata de una hlice anfiptica
(con dos pasiones: el agua y la membrana). Si, en cambio, la prctica totalidad de la hlice
consta de residuos apolares, se trata de una hlice enterrada en el interior de la estructura proteica
y, si consta de residuos esencialmente polares, se trata de una hlice totalmente expuesta (no son
frecuentes, pero en ocasiones aparecen conectando dos dominios de una protena). (Laguna y
Pia, 2002).
La -hlice es segundo nivel de organizacin proteica en el cual el esqueleto peptdico esta
enrollado, como una estructura en espiral. En esta estructura cada vuelta est formada 3.6
aminocidos y su desplazamiento de la espiral, despus de una vuelta completa es de 5.4
Angstroms. Esta presenta un patrn

caracterstico de puentes de hidrgeno entre el grupo

carbonilo de cada residuo y el NH del esqueleto del quinto residuo a lo largo de la cadena.

Fig.1 Modelo de una hlice- que gira hacia la derecha, donde los carbonos aparecen numerados.
Fuente: Peret, et al (1996)
Este arreglo es el ms favorecido, ya que permite la mxima interaccin con puentes de
hidrgeno del grupo carbonilo como aceptor del puente de la unin peptdica y el nitrgeno como
donador del puente de la unin peptdica situada en la siguiente vuelta de la espiral. Es decir que
la distancia que separa ambos grupos peptdicos es la que permite que se establezcan puentes de
hidrgeno. En la presencia del agua la estabilidad de los puentes de hidrgeno disminuye, por el
contrario cuando una protena se disuelve en solventes con menor capacidad de formar puentes
de hidrgeno que el agua o se encuentra rodeada por grasas, se aumenta la estabilidad de los
puentes de hidrgeno formados en la cadena polipeptdica y la molcula aumenta su contenido
helicoidal.
La formacin de las cadenas polipeptdicas depende de las caractersticas y el orden de las
cadenas laterales.
Cuando se dispone de una cadena en forma de hlice-, las cadenas de los aminocidos estn
muy cerca unas de otras, y en consecuencia no todas pueden arreglarse en forma de hlice-.
Las hlices alfa de las protenas, formadas por L-aminocidos, son R. Las hlices (no
transmembranales) tienen una longitud media de 12 aminocidos.
La estabilidad de una hlice alfa depende de: los aminocidos que la componen, de las
interacciones que se puedan establecer entre cadenas laterales.
La estabilidad de la hlice- est afectada por diversos factores que incluyen, entre los ms
importantes:
1. La interaccin electrosttica entre aminocidos sucesivos con cadenas R que contienen grupos
cargados.

2. Los tamaos de los grupos R adyacentes.

3. Las interacciones entre grupos R espaciados por tres o cuatro residuos.
4. La presencia de residuos de prolina (recurdese que la prolina es un aminocido con una
configuracin diferente a la de los otros aminocidos).
Acorde con esto existen varios tipos de aminocidos que tienen estabilizar y desestabilizar la
hlice alfa, a continuacin se muestra en la siguiente tabla:

Tabla 1. Distribucin de aminocido de acuerdo a su capacidad de estabilizar y desestabilizar la

formacin de alfa hlice. Fuente: Pena, et al (2004)

2. COMO SE ESTABLECEN LA FORMACIN DE LA HOJA-

Esta estructura secundaria se define como el nivel secundario de organizacin de las protenas en
el cual el esqueleto de la cadena peptdica (beta hebras) se extiende en un forma de zigzag y las
cadenas de los aminocidos que compone a las cadenas polipetdicas se dispone arriba y debajo
de stas en forma alterna, similar a una serie de pliegues, con los enlaces peptdicos organizados
en planos de inclinacin alterna (alternando planos descendentes y planos ascendentes). Las
cadenas polipeptdicas se unen una a la otra por medio de puentes de hidrgeno. Es hoja es
estable solo cuando las aminocidos que la componen tienen cadenas laterales pequeas y sin
carga.

Las lminas- son ms o menos estables dependiendo de los aminocidos que las componen, de
las interacciones que establecen las cadenas laterales de hebras adyacentes y del
empaquetamiento de la lmina con el resto de la protena de la que forma parte. En general, la
energtica de las lminas- se comprende peor que la de las hlices-, entre otras razones, porque
tienden a ser insolubles en agua y, por tanto, ms difciles de estudiar.
3. EXISTE DOS VARIANTES LA CONFORMACIN ANTIPARALELA Y LA
PARALELA. DESCRIBA LA IMPORTANCIA.
CARACTERSTICAS DE LA HOJA PLEGADA (LAMINA-):
1. Cada enlace peptdico es planar y tiene configuracin trans.
2. Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptdicos de cadenas adyacentes (o de segmentos
adyacentes de una misma cadena) estn en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal
forma que se hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos.
3. Los puentes de hidrogeno son ms o menos perpendiculares al eje principal de la estructura en
hoja plegada.
3.- Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero arriba del eje de la lmina,
despus abajo del mismo, y as sucesivamente.
Hay dos clases de estructura lmina-beta:
Antiparalela: se forma cuando las dos cadenas polipeptidicas corren en direccin opuesta (una
corre del grupo amino al carboxilo y la otra del carboxilo al amino).
Paralela: Si las cadenas polipeptidicas adyacentes corren en la misma direccin.
Cuando la lmina- son antiparalelas los puentes de hidrgeno que estabilizan la estructura son
prcticamente perpendiculares a las cadenas polipeptdicas y los grupos carbonilo y amino de dos
residuos forman puentes de hidrgeno entre s. Esto no acurre en las lminas- antiparalelas,

donde los puentes de hidrgeno no son perpendiculares al esqueleto polipeptdico y los grupos
carbonilo y amino de un residuo forman puentes de hidrgeno con dos residuos diferentes.

GIROS Y BUCLES
Los giros son estructura que permiten cambiar la direccin de una cadena 180. Establezcan la
relacin de estas estructuras en la conformacin espacial de las protenas.
La hlice- u lmina- se caracterizan por ser zonas de conformacin repetitiva, es decir, se
repiten los valores de fi y psi. Tambin se pueden encontrar regiones no repetitivas.
Muchas de estas zonas no repetitivas son giros que provocan cambios en la direccin de la
cadena polipeptdica y que posibilitan que la protena tenga una estructura compacta.
Se conocen varios tipos de giros:
-

En los giros tipo I, podemos encontrar cualquier tipo de residuos con exepcin de la prolina en

posicin 3.
En los giros tipo II, la glicina debe estar en posicin 2 y casi siempre aparece una prolina en

posicin 3.
Los giros tipo III son una porcin de hlice 310, y no hay restricciones en cuanto a la
identidad de sus componentes.

A veces puede conseguirse un giro completo de la cadena polipeptdica con tan solo dos residuos
como es el caso de los giros tipo g. En estos residuos n debe ser una prolina.
Las protenas pueden clasificarse en dos grandes grupos, el de las protenas fibrosas y las
protenas globulares. Las protenas fibrosas son generalmente protenas estticas, cuya funcin

principal es la de proporcionar soporte mecnico a las clulas y los organismos, suelen ser
insolubles y estn formadas por una unidad repetitiva simple que se ensambla para formar fibras.
Entre las protenas fibrosas podemos encontrar la alfa-queratina, componente principal del pelo y
las uas; el colgeno, presente en la piel, los tendones, huesos y dientes.
Los tipos principales de elementos estructurales secundarios, las hlices- y las lminas-
plegadas, aparecen corrientemente en las protenas, pero en proporciones y combinaciones
variables. La mayor parte de las protenas poseen cantidades significativas de ambos tipos de
estructura secundaria (por trmino medio, ~ 27 % de hlice y 23 % de hoja ).
Caso de la anemia falciforme en donde la tiene valina en lugar de glutamato y ocurre la
alteracin.
La anemia falciforme es un trastorno sanguneo que afecta a la hemoglobina, la protena que
contienen los glbulos rojos y que ayuda a transportar el oxgeno por todo el cuerpo.
La anemia falciforme ocurre cuando una persona hereda dos genes anmalos (uno de cada
progenitor), lo que determina que sus glbulos rojos tengan una forma anmala. En vez de ser
flexibles y en forma de disco, son rgidos y curvos, adoptando la forma de una antigua
herramienta de labranza denominada hoz de donde proviene el nombre de la enfermedad
(falciforme significa relativo a la hoz)-, parecida a una luna en cuarto creciente.
La anemia falciforme tiene lugar cuando se produce una forma anmala de hemoglobina (HbS).
Las molculas de HbS tienden a amontonarse, convirtiendo los glbulos rojos en unas clulas
pegajosas, rgidas y ms frgiles y hacindoles adoptar una forma similar a la de una hoz.
Desde el punto de vista clnico que afecta la estructura de la hemoglobina es el cambio de A por
U en cualquiera de los codones del glutamato GAA o GAG, para dar codones de valina con GUA
o GUG en la sexta posicin de la cadena de la hemoglobina.
El grupo hidrfobo de la valina es la clave del fenmeno de la adopcin de la adopcin de la
geometra falciforma. La sexta posicin est localizada en el exterior de la molcula de la
hemoglobina, y por consiguiente la hemoglobina mutada (HbS) lleva una sustitucin en la sexta
posicin de la cadena : en vez de portar un resto de glucomato hidrofilico aparece un resto
hidrofbico de valina. Esto origina un botn hidrofbico que encaja perfectamente en el
agujero hidrofbico de una cadena de otro tetrmero de hemoglobina. Inicialmente se asocian
las cadenas de dos molculas de HbS por medio de uno de estos botones de presin. Como
cada molcula de HbS dispone de una segunda subunidad de , se van juntando a ambos lados
hasta formar por polimerizacin largas cadenas de hemoglobina. En total se pueden enrollar 14

cadenas entre s para configurar haces de fibras gruesos y rgidos que son los que confieren la
estructura falciforme.

Estructura terciaria: las protenas solubles en agua se pliegan en

estructuras compactas con un ncleo no polar. Aunque las protenas
globulares

suelen

contener

cantidades

significativas

de

elementos

estructurales secundarios, otros factores contribuyen a su estructura. El

trmino estructura terciaria seala las conformaciones tridimensionales nicas que asumen las
protenas globulares al plegarse en sus estructuras nativas (biolgicamente activas). El
plegamiento proteico, un proceso en el que una molcula desorganizada naciente (recin
sintetizada) adquiere una estructura muy organizada, se produce como una consecuencia de las
interacciones entre las cadenas laterales en su estructura primaria. (Laguna y Pia, 2002).

Estructura cuaternaria: sobretodo las protenas que tienen pesos moleculares

elevados estn formadas por varias cadenas polipeptdicas. Cada componente
polipeptdico se denomina subunidad. Las subunidades en un complejo proteico
pueden ser idnticas o diferentes. Las protenas con varias subunidades en las
que alguna o todas sus subunidades son idnticas se llaman oligmeros. Los oligmeros estn
formados por protmeros, que pueden estar formados por una o varias subunidades. Un gran
nmero de protenas oligomricas contienen dos o cuatro subunidades protomricas,
denominadas dmeros y tetrmeros, respectivamente
CLASIFICACIN
Una forma de clasificar a las protenas es por su forma, su composicin y su funcin.
Segn su forma se clasifican en fibrosas y globulares. Las protenas fibrosas son molculas
largas con forma de varilla, insolubles en agua y fsicamente correosas. Ejemplos son la queratina
de la piel, pelo y uas que protegen y dan estructura, y la elastina. Las protenas globulares son
molculas esfricas compactas, generalmente hidrosolubles y tienen funciones dinmicas o

mviles en la clula y como ejemplos estn la mayora de las enzimas, inmunoglobulinas,

hemoglobina, albmina, etc. Las protenas fibrosas-globulares se parecen a las fibrosas por sus
largas estructuras cilndricas y a las globulares por ser solubles en disoluciones acuosas salinas,
por ejemplo la miosina y fibringeno.
Segn su composicin, las protenas se clasifican en simples y conjugadas. Las protenas
simples contienen slo aminocidos como la albmina srica, lactoalbmina, ovoglobulinas,
prolaminas, colgeno, histonas y la queratina. Cada protena conjugada consta de una protena
simple conjugada con un componente no proteico, que se denomina grupo prosttico (una
protena sin un grupo prosttico se llama apoprotena. Una molcula proteica combinada con su
grupo prosttico se llama haloprotena). Las protenas conjugadas se clasifican de acuerdo con la
naturaleza de su grupo prosttico, por ejemplo en glucoprotenas (contienen un componente de
hidratos de carbono), lipoprotenas (contienen molculas lipdicas), metaloprotenas (contienen
iones metlicos) (Laguna y Pia, 2002).

PROBLEMA 2
Dentro de la bioqumica de protenas, frecuentemente se usa el trmino prion para designar
algunas variantes patognicas de ciertas protenas naturales que son producidas por las clulas
nerviosas y algn otro tipo de clula. S en el organismo animal o humano por varias razones se
han producidos priones, ocasiona que stos obligan a cambiar de forma a las protenas
normales del cuerpo, especficamente ocasionan un cambio en su estructura secundaria, este
cambio se considera como la infeccin por priones altamente mortal para la especie humana.
Dentro de la bioqumica de protenas, frecuentemente se usa el trmino prion para designar
algunas variantes patognicas de ciertas protenas naturales que son producidas por las
clulas nerviosas y algn otro tipo de clula.
S en el organismo animal o humano por varias razones se han producidos priones, ocasiona
que stos obligan a cambiar de forma a las protenas normales del cuerpo, especficamente
ocasionan un cambio en su estructura secundaria, este cambio se considera como la infeccin
por priones altamente mortal para la especie humana.

 El estudiante y su grupo de trabajo tendrn que aportar a la solucin del problema, explicando
en donde radica el problema del contexto, bases tericas para explicar el contexto.
Las protenas que actan como agentes infecciosos en ausencia de DNA O RNA se conocen
como priones.
Se cree que esta enfermedad est causada por la forma conformacional de la protena prinica
PrP, que modificara la conformacin de la forma soluble celular normal, PrP c, para dar la
conformacin txica PrPSC que polimeriza en fibras amiloides insolubles que causan patologas
neurales. El plegamiento de la PrPC soluble consiste en tres segmentos en la hlice y dos
pequeos segmentos en conformacin . La transformacin en la forma PrPsc se caracteriza por la
conversin de dos de los segmentos y dos pequeos en conformacin . La PrP c est compuesta
en un 43% por una estructura secundaria hlice- y un 3% de estructura lmina-. En contraste
PrPsc contiene un 43% de estructura secundaria lmina-.
PrPC es una protena capaz de unir especficamente Cu2+, para la cual se postula un papel activo
en la homeostasis de este catin implicado en procesos de oxido-reduccin (Brown y cols., 1997;
Stckel y cols, 1998). Con respecto al metabolismo celular de PrP C, estudios de translocacin in
vitro han identificado tres formas topolgicas de PrP: una forma de secrecin (coincidente con la
anclada por GPI) y dos formas transmembranas que difieren en su orientacin (el N-terminal
luminal y el C-terminal luminal) (Hedge y cols., 1998).
Acorde con investigaciones desarrolladas (Sabaini M. y Dettorre L, 2008), las enfermedades
causadas por priones constituyen, por mltiples razones, patologas atpicas. Esto se debe
primordialmente a que el dispositivo de transmisin de estas afecciones contradice el Dogma
Central de la Biologa Molecular, puesto que el agente etiolgico de estas enfermedades es capaz
de replicarse a s mismo en ausencia de cido nucleico, y adems, se opone al principio biolgico
que establece que la estructura primaria de una protena determina de manera unvoca el
plegamiento o estructura terciaria de la misma. Este cambio conformacional de la protena prin,
el cual resulta ser el evento clave en el desarrollo de las EPRs, aun en la actualidad contina
siendo investigado. Por dichas razones, resulta imperioso involucrar esfuerzos para la generacin
y profundizacin del conocimiento referente a este fenmeno, en particular, para desarrollar
terapias eficientes al respecto, y en general, para dilucidar en forma fehaciente la dicotoma

conformacional que manifiestan estas macromolculas, de modo de adquirir nuevos

conocimientos biofsicos que permitan en forma determinante resolver cuestiones asociadas a la
naturaleza el plegado de protenas in vitro e in vivo.
PROPIEDADES DEL PRIN O PROTENA PRINICA
El prin o protena prinica es una partcula acelular, patgena y transmisible y posee la
propiedad de desnaturalizar otras protenas. Teoras ms recientes sugieren que los priones son
protenas modificadas bajo circunstancias que favorecen su cada a un nivel energtico muy
estable, confirindole nuevas propiedades biolgicas, tales como ser insolubles, resultar inmunes
a las proteasas y cambiar su configuracin tridimensional. 7, 8 Adems cuentan entre sus
propiedades las siguientes:

No contiene ADN ni ARN.

Carece de cuerpos de inclusin.
Perodo de incubacin prolongado (meses, aos, dcadas).
No ocasiona respuesta inflamatoria.
No genera respuesta antignica.
Curso crnico progresivo.
Invisible al microscopio electrnico.

La falta de respuesta inmunitaria a las infecciones por priones no implica que estas protenas
eludan el sistema inmunolgico, sino que por el contrario, lo utilizan en las etapas iniciales de
acumulacin y replicacin prinica. Los ltimos indicios al respecto apuntan a que los priones se
acumulan y se replican, inicialmente en las clulas dendrticas foliculares (FDC) de los centros
germinales y que las clulas B estn implicadas en la neuroinvasin, fundamentalmente,
mediante su participacin en la maduracin de las FDC.
Aunque las protenas estn conformadas por largas lineales de aminocidos, en realidad no son
estructuras lineales una vez conocemos que se conforman estructuras espaciales secundarias,
terciarias y cuaternarias. La estructura proteica se convierte en pieza clave para su forma,
propiedades fisicoqumicas y funcionalidad, y de ah los efectos que se ejemplarizan en el tema
de los priones, donde se pueden dar situaciones anmalas a nivel biolgico por pequeos que
parezcan los cambios en las estructuras secundarias.

CMO ACTA UN PRIN?

Los priones como todas las partculas infectivas necesitan entrar dentro del cuerpo de un ser vivo
para multiplicarse. En este caso cuando la protena infecciosa entra en un individuo empieza
a interaccionar con las protenas de su misma clase (producidas por un gen homlogo). Entonces
el prin mediante modificaciones de la estabilidad de la estructura secundaria de la protena
sana el prin la convierte en otro prin. Cmo se produce el cambio no se ha aclarado todava,
aunque parece ser que existe interaccin entre los aminocidos de ambas protenas que podran
dar lugar a la rotura de los puentes disulfuro y la transformacin de las hlices alfa de la protena
en lminas

beta.

Pero los priones no son exclusivamente nocivos para el ser vivo. Estudios realizados en 2003
parecen sugerir que los priones podran ser tiles para introducir variabilidad evolutiva y
formacin de la memoria a largo plazo o en rutas metablicas que requieran una estabilidad
proteica prolongada, puesto que los priones son ms resistentes que las protenas normales a la
digestin

enzimtica.

A QUIN AFECTAN LOS PRIONES?

Hasta el momento solo se han encontrado enfermedades debidas a estas partculas infecciosas
en animales. Si bien es verdad que se han observado priones en otros organismos, como hongos y
levaduras.

La enfermedad de la encefalopata espongiforme bovina, la mal conocida como enfermedad de

las vacas locas, est ocasionada por un prin. En ovejas y cabras se conoce desde el siglo XVIII
la enfermedad neurodegenerativa espongiforme denominada tembladera o scrapie, que en el siglo
XX se descubri que tambin la ocasionan priones. Ambas enfermedades pueden transmitirse a
otros seres vivos que se alimenten de tejido neuronal de un animal infectado, cerebro o tutano.
Las enfermedades por priones, son trastornos neurodegenerativos progresivos rpidos e
invariablemente fatales que afectan tanto a seres humanos como a animales. Tienen formas de
presentacin espordica, gentica e infecciosa. Los priones son protenas celulares. No contienen

cidos nucleicos y no son virus o microorganismos. En todos los casos, provocan muerte
neuronal, espongiosis comn del cerebro, que caracteriza a estas enfermedades, as como
agregacin de la protena amiloide prin en forma de placa. La teora ms importante hasta el
momento, es la que trata de explicar el cambio de conformacin de la pro tena prin para
producir copias de s misma y para su agregacin y la muerte de las neuronas. Sin embargo,
nuevas formas de explicacin toman auge actualmente. Una de las ms importantes se basa en
entender el contenido y cambio de la glicosilacin de la protena prin patolgica. Esto permite
explicar algunas de sus interacciones, para entender el cambio de conformacin y las propiedades
fsicoqumicas de la protena. As como algunas de las primeras funciones biolgicas (como
transportador de iones Cu++2) descritas para esta molcula. En esta revisin abordamos todos los
tpicos importantes acerca de estas patologas por dems fascinantes.
En el ser humano podemos encontrar 5 enfermedades originadas por priones. A parte de las que
afectan a vacas y ovejas existen otras neuropatas, algunas espongiformes, en humanos. Kuru, por
prcticas canbales en Nueva Guinea. O de origen gentico y de transmisin familiar: insomnio
familiar fatal, Enfermedad de Gerstmann-Strassler-Scheinker y Encefalopata espongiforme
familiar, presente solo en una familia brasilea, debido a una nueva mutacin en el gen PrP.

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