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BC 108 Biologa Molecular

Febrero Junio 2013
Dra. en Cs. Alma Rosa Villalobos Armbula
Cromosomas
28.1 Introduccin
En la organizacin de todo material gentico es evidente un principio general, se
trata de una masa compacta confinada en un volumen limitado, y sus diversas
actividades, como replicacin y transcripcin, deben tener lugar en ese espacio.
La comprensin global del DNA suele describirse mediante la relacin de
empaquetamiento (RE), que corresponde a la longitud del DNA dividida por la
longitud de la unidad que lo contiene.
Por ejemplo, el cr humano ms pequeo, el 22;
Contiene ~4.6x107 pb de DNA (~10 veces el tamao del genoma de E. coli).
Esto equivale a 14,000 m (=1,4 cm) de DNA extendido.
En el estado mximo de condensacin del material gentico el cr metafsico
mide ~2 m.
Por lo que la RE es de 7,000.
28. 2 Los genomas vricos estn empaquetados en sus cubiertas
Conceptos principales
La longitud del DNA que se puede incorporar a un virus depende de la
estructura de su casco.
El AN del casco est muy condensado.
Los virus de RNA filamentosos condensan el genoma de RNA conforme
ensamblan la cpside a su alrededor.
Los virus de DNA esfrico insertan el DNA en una cubierta protenica
preensamblada.

Una partcula viral es engaosamente simple en su aspecto superficial. El AN

genmico est contenido dentro de una cpside, una estructura simtrica o cuasi
simtrica ensamblada por la unin de una o unas pocas protenas.
Tipos de cpsides virales:

Cpside helicoidal, la estructura proteica puede ensamblarse alrededor del

AN, condensando el RNA o DNA por interacciones protena-AN durante el
ensamblaje.
Cpside icosadrica, la cpside se construye a partir de sus componentes
formando una estructura vaca en donde se insertar el AN, siendo
condensado mientras entra.

28.3 El genoma bacteriano es un nucleoide

Conceptos principales
El nucleoide bacteriano es de ~80% DNA en cuanto a masa, y puede ser
desplegado por agentes que actan en el RNA o las protenas.
Las protenas que condensan el DNA no han sido identificadas.
En E. coli se han aislado varias protenas de unin al DNA semejantes a las protenas
cromosmicas de eucariotas. La protena HU es un dmero que tal vez condensa el DNA al
envolverlo en una estructura similar a una burbuja y que tiene relacin con IHF, que presenta
actividad estructural para la formacin de un complejo protenico en reacciones
especializadas de recombinacin.

28.4 El genoma bacteriano esta superenrollado

Conceptos principales
El nucleoide tiene ~100 dominios independientes superenrollado
negativamente.
La densidad promedio del superenrollamiento es ~1 superhlice/100 pb.
28.5 El DNA eucaritico tiene asas y dominios unidos a un bastidor
Conceptos principales
El DNA de la cromatina de interfase esta superenrollado en forma negativa en
dominios independientes de ~ 85kb.
Los crs en metafase tienen un bastidor de prots al que se unen las asas del
DNA.
El andamio en la metafase consiste de una densa red de fibras y hebras de DNA que
sobresalen del andamio, aparentemente como bucles de 10-30 m (30-90 Kb). Los bucles
de DNA de 60 Kb se organizan fijndose a un andamio central de protenas.

28.6 Secuencias especficas unen el DNA a una matriz nuclear de interfase

Conceptos principales
El DNA est unido a la matriz nuclear en secs especficas llamadas MAR o
SAR.
Las MAR son ricas en AT, pero no tienen una sec consenso.

Los sitios de DNA unidos a estructuras de protenas en ncleos interfsicos se llaman

MARS- regiones de unin con la matriz (matrix attachment regions) o SAR (scaffold
attachment regions).
La cromatina a menudo aparece fijada a la matriz nuclear lo que al parecer es necesario
para la transcripcin y replicacin.

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28.7 La Cromatina se divide en eucromatina y heterocromatina
Conceptos principales
Los crs individuales se observan slo durante la mitosis.
En la interfase, la masa general de la cromatina esta en forma de
eucromatina, con empaquetamiento menos compacto que los crs en
mitosis.
Las regiones de heterocromatina se mantienen densamente empaquetadas
durante la interfase.
Cada cr eucaritico tiene:
- Una nica fibra muy larga de DNA con sitio de origen de la replicacin
- Un centrmero
- Telmeros
La cromatina se divide en dos tipos:

La eucromatina material disperso en el ncleo, que ocupa la mayor parte de

ste y permite la expresin gnica.
La heterocromatina constitutiva comprende regiones de la cromatina
densamente empaquetadas en fibras que le confiere un estado comparable al
de los crs mitticos, por lo general est en los centrmeros; por lo que no se
transcribe y replica tardamente.
La Heterocromatina se divide en dos tipos: constitutiva y facultativa.

28.8 Los crs tienen patrones de banda

Conceptos principales
Ciertas tcnicas de tincin hacen que los crs parezcan una serie de estras
llamadas bandas G.
Las bandas tienen un menor contenido de GC que los espacios intermedios
(interbandas).
Los genes se concentran en las interbandas, ricas en GC.
28.9 Los crs en escobilln (o plumulados) se extienden
Concepto principal
Los sitios de expresin gnica de los crs en escobilln muestran asas que se
extienden a partir de su eje.
Los crs en escobilln se forman durante una meiosis inusualmente larga que puede
durar meses o aos.

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28.10 Los crs politnicos forman bandas
Concepto principal
Los crs politnicos de los dpteros tienen una serie de bandas que se pueden
usar como mapa citolgico.
Mapeo gnico por Hibridacin in situ que usa:
Una sonda radiactiva (o fluorescente) que representa a un gen (DNAc derivado de un
RNAm) hibrida con el DNA desnaturalizado de los crs politnicos in situ. Por autorradiografa
se identifican las posiciones de los genes correspondientes por la superposicin de granos
en una o varias bandas especficas.

28.11 Los crs politnicos se expanden en sitios de expresin gnica

Concepto principal
Las bandas son sitios de expresin gnica en crs politnicos que se expanden
para dar lugar a abultamientos.
28.12 El cr eucaritico es un dispositivo de segregacin
Conceptos principales
Un cr de eucariota se mantiene en el huso mittico por unin de microtbulos
al cinetcoro, que se forma en su regin centromrica.
Los centrmeros a menudo tienen heterocromatina rica en secs de DNA
satlite.
Durante la mitosis las cromtides hermanas migran a los polos opuestos de la clula
(anafase), movimiento que depende de la unin de los crs a los microtbulos,
conectados a los polos en el otro extremo. Los sitios de las dos regiones en que se
organizan los extremos de los microtbulos cerca de los centriolos, en polos y crs, se
llaman MTOC (centros de organizacin de microtbulos).
La regin del cr encargada de su segregacin en mitosis y meiosis es el
centrmero. La regin centromrica de cada cromtide hermana est sujeta a
traccin por los microtbulos hacia el polo, y para oponerse a esa fuerza motriz, las
protenas goma cohesinas, mantienen juntas las cromtides.

28.13 Los centrmeros pueden contener DNA repetitivo

Conceptos principales
Los centrmeros de los crs de eucariotas superiores contienen grandes
cantidades de DNA repetido.
Se desconoce la funcin del DNA repetido.
Para que el centrmero funcione la sec de DNA debe ser bastante larga. En
levaduras los centrmeros son regiones de 40 a 100 kb, con DNA parcial o
completamente repetitivo. En Drosophila la regin es de 200 a 600 kb, en
Arabidopsis una regin de 500 kb tiene una serie de 180 pb repetidos. En primates
el segmento primario incluye DNA satlite con repeticiones de 170 pb.

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28.14 Las secuencias de DNA de los centrmeros de S. cerevisae son cortas
Conceptos principales
En S. cerevisae, los elementos CEN se identifican por la capacidad de
permitir que un plsmido se segregue de manera precisa en la mitosis.
Los elementos CEN consisten en secs cortas conservadas CDE-I y CDE-III,
las cuales flanquean una regin CDE-III rica en AT.
Si una sec centrmerica es responsable de la segregacin, cualquier molcula de
DNA con esta sec se mueve adecuadamente en la divisin celular, mientras que
cualquier DNA sin ella no puede segregarse.
28.15 El centrmero se une a un complejo protenico
Conceptos principales
En CDE-II se forma un complejo protenico especializado alterno a la
estructura usual de la cromatina.
El complejo protenico CBF3 que se une a CDE-III es indispensable para la
funcin del centrmero.
Las protenas que conectan esos dos complejos podran proporcionar la
conexin de los microtbulos
28.16 Los telmeros tienen secuencias de repeticin simples
Conceptos principales
Para la estabilidad del extremo cromosmico, se requiere el telmero.
Un telmero consiste en una repeticin sencilla en la que una cadena rica en
C+A tiene la sec C1 (A/T)1-4.
28.17 Los telmeros sellan los extremos de los cromosomas
Concepto principal
La protena TRF2 cataliza una reaccin en que la unidad repetida 3de la
cadena rica en G+T forma un asa por desplazamiento de su homloga en una
regin de flujo ascendente respecto del telmero.
28.18 Los Telmeros son sintetizados por una enzima de ribonucleoprotenica
Conceptos principales
La telomerasa hace uso del 3-OH de la cadena telomrica G+T para cebar la
sntesis de repeticiones seriadas de tipo TTGGGG.
El componente RNA de la telomerasa tiene una sec que se aparea con
repeticiones ricas en C+A.
Una de las subunidades protenicas es una transcriptasa inversa que utiliza el
RNA como molde para la sntesis de la sec rica en G+T.
Los telmeros tienen dos funciones:
Proteger el extremo cromosmico
Permitir que el telmero se extienda, de lo contrario se har ms corto en cada ciclo
de repeticin (porque la replicacin no puede iniciarse en el extremo mismo)

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La telomerasa es una transcriptasa inversa. La telomerasa se ubica a s misma por
apareamiento de b entre el molde de RNA y el cebador de DNA unicatenario que
sobresale; agrega b de G y T al cebador, una a la vez segn el molde.
28.19 Los Telmeros son indispensables para la supervivencia
La prdida de telmeros produce efectos nocivos. Cuando la longitud del telmero
llega a cero, a las clulas se les dificulta dividirse con xito. Los intentos de divisin
por lo general causan roturas y translocaciones cromosmicas.