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4.

Le gnome et ses modifications


physiologiques
Parmi les propositions suivantes, laquelle (ou lesquelles) est (sont) exacte(s) ?

A. Le nombre de gnes humains est denviron 2500.

B. Les gnes dARN reprsentent environ 10 % des gnes humains.

C. La majorit de la squence dun gne nest pas codante.

D. La plupart des familles de gnes contient plusieurs gnes dont les produits
possdent une forte homologie fonctionnelle.

E. Les pseudognes sont des versions tronques dun gne fonctionnel.

4. Le gnome et ses modifications physiologiques

Parmi les affirmations suivantes, laquelle (ou lesquelles) est (sont) exacte(s) ?

A. 90% des gnes humains codent des polypeptides.

B. La taille moyenne dun gne humain est de lordre de 30 kilobases.

C. Les gnes de la famille de la globine sont regroups dans deux clusters


diffrents.

D. Les pseudognes correspondent des gnes non fonctionnels.

E. Les gnes nichs sont de petite taille et on les trouve gnralement dans les
grands introns dun autre gne..

4. Le gnome et ses modifications physiologiques

Lesquelles des squences suivantes sont des squences rptes ?

A. microsatellite

B. intron

C. squence Alu.

D. transposon

E. site dinitiation de la rplication

4. Le gnome et ses modifications physiologiques

Quelles sont les diffrences entre les gnomes des diffrents tres vivants
eucaryotes ?

A. le nombre de molcules dADN

B. la nature des bases

C. la longueur des molcules dADN

D. la localisation cellulaire

E. la forme linaire ou circulaire

4. Le gnome et ses modifications physiologiques

LADN mitochondrial:

A. double brin circulaire

B. contient des gnes sans intron

C. pourrait provenir dun ADN bactrien

D. code toutes les protines de la mitochondrie

E. est transmis selon les lois classique de Mendel

4. Le gnome et ses modifications physiologiques

LADN mitochondrial:

A
est transmis surtout par le pre
B
code pour toutes les protines mitochondriales
C
est circulaire
D
n'a pas d'intron
E
les mutations de cet ADN se traduisent cliniquement surtout par des atteintes
musculaires et encphaliques

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

A la suite d'une prise de sang sur anticoagulant, l'extraction de


l'ADN se fait partir

A - du srum
B - des plaquettes
C - des leucocytes
D - du plasma
E - des globules rouges.

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

ADN polymrase
A la T4 ligase
B lenzyme de klenow
C la Taq polymrase
D la transcriptase rverse
E la DNAase I

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Enzymes de Biologie Molculaire


A la ligase peut lier deux extrmits dADN double brin uniquement sils
sont tous les deux 3OH et 5P

B une phosphatase enlve le P en 5 dun brin dADN


C la DNase I est une une endonuclase
D la nuclase S1 ne coupe que lADN simple brin
E la T4 kinase phosphoryle lextrmit 5 dun oligonuclotide.

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Les enzymes de restrictions


A exonuclases
B coupent les deux brins de lADN
C bouts francs ou cohsives
D deux bouts francs produits par deux enzymes diffrents peuvent tre
religus entre eux.
E deux bouts cohsives produits par deux enzymes diffrents peuvent tre
religus entre eux

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Retrouvez la (ou les) proposition(s) inexacte(s).

A. Les endonuclases de restriction reconnaissent gnralement une squence


spcifique de 4 8 pb.

B. La sparation des acides nucliques utilise couramment llectrophorse.

C. La PCR est une technique de clonage cellulaire.

D. Le clonage cellulaire ne permet pas lamplification de fragments dADN dune


taille suprieure 10 kilobases.

E. Le Northern Blot permet de dtecter des molcules dARNm.

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

sonde
A simple brin ou double brin
B composition en nuclotides identique la squence cible
C <10 nuclotides
D hybrider totalement ou partiellement la squence cible
E froide si son marquage nest pas radioactif

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les molcules suivantes, lesquelles sont utilises


pour marquer radioactivement l'extrmit 5' d'un
oligonuclotide ?
A T7 DNA polymrase
B a-32P-dATP
C g-32P-dATP
D g-32P-ATP
E T4 polynuclotide-kinase

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Pour marquer radioactivement une sonde d'ADN par la


mthode de multi-amorage au hasard "multi-random
priming", on utilise

A
B
C
D
E

T4 polynuclotide-kinase
a-32P-dCTP
a-32P-CTP
g-32P-CTP
Fragment de klenow

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Caractristiques ncessaires dun vecteur


A pouvoir intgrer un fragment dADN tranger
B possder la rsistance lantibiotique
C tre introduit /sintroduire dans un organisme hte
D se rplique dans lorganisme hte
E pouvoir dtruire lorganisme hte

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

propos de la technique du Southern Blot, indiquez la (ou les) proposition(s)


exacte(s).
A Elle apporte une information qualitative sur une squence cible
B Elle utilise un clivage dADN par une enzyme de restriction
C Elle ncessite une ADN polymrase
D Elle utilise un fragment dADN simple brin complmentaire dune
partie de la squence cible et dnomme sonde
E Elle peut tre utilise pour le typage gntique des individus

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Classer dans lordre les tapes de la mthode du Southern blot


1 - Electrophorse
2 - Hybridation
3 - Transfert sur membrane
4 - Digestion de lADN par une enzyme de restriction
5 Autoradiographie
a. 4 3 1 2 5
b. 1 4 3 5 2
c. 4 1 3 2 5
d. 2 5 3 4 1
e. 1 4 5 3 2

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5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Aprs avoir digr l'ADN d'un sujet par l'enzyme de restriction Eco RI, le gne ci-dessous est
tudi par la mthode de Southern. Ce gne est reprsent schmatiquement: les rectangles
noirs reprsentent les exons, les flches les sites de restriction de l'enzyme Eco RI, le nombre
en kilobases (kb) entre deux flches correspond la distance entre deux sites de restriction.

2,6 kb
5'

1,5kb
1

3,5kb

4,5kb
2

1kb

3kb
3

3'

Une seule combinaison ci-dessous correspond l'ensemble des fragments s'hybridant avec
une sonde reprsentant tout l'ADN complmentaire de ce gne :
A - 2,6 kb - 1,5 kb - 3,5 kb - 4,5 kb - 3 kb - 1kb
B - 2,6 kb - 4,5 kb - 3 kb - 1kb
C - 2,6 kb - 4,5 kb - 3 kb
D - 2,6 kb - 1,5 kb - 4,5 kb - 3 kb - 1kb
E - 3,5 kb - 1kb

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5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

A l'aide des deux squences ci-dessous, il est possible de voir qu'il existe
un intron.
Squence d'une partie d'un gne :
1
86
5' AGGCA GCACA AGGTG GGGAC TGTCC.......CCA TAGCAG
GAGA GCCTC 3'
Squence de l'ADN complmentaire qui correspond cette partie du gne :
5' AGGCA GCACA AGGAG AGCCTC 3'
Par quels nuclotides commence et finit cet intron?
A - 11.......84
B - 14.......87
C - 12.......85
D - 13.......86
E - 22.......86

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5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

A l'aide des deux squences ci-dessous, il est possible de voir qu'il existe un intron.
Squence d'une partie d'un gne :
1
86
5' AGGCA GCACA AGGTG GGGAC TGTCC.......CCA TAGCAG GAGA
GCCTC 3
Squence de l'ADN complmentaire qui correspond cette partie du gne :
5' AGGCA GCACA AG GAG AGCCTC 3'
Par quels nuclotides commence et finit cet intron?
A - 11.......84
B - 14.......87
C - 12.......85
D - 13.......86
E - 22.......86

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

propos de la technique du Northern Blot, indiquez la (ou les) proposition(s)


exacte(s).
A identifier ARN et ADN
B identifier la prsence dun ARNm dans un tissu donn.
C dterminer la taille de lARNm
D dterminer la quantit de lARNm

E identifier des ARNm de tailles diffrentes codant une mme protine

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Les ARN extraits du cytosol de diffrents tissus sont analyss par la technique
dite du
"Northern" en utilisant comme sonde un oligonuclotide correspondant une
partie du premier exon du gne de la calcitonine (hormone
hypocalcmiante).

a. Interprtez cette image en indiquant les diffrentes hypothses


possibles.

b. Lorsque la mme exprience est ralise sur des ARN nuclaires de


thyrode ou de cerveau, on observe surtout des bandes trs faibles et
diffuses, de plus haut poids molculaire qu'en partant d'ARN cytosolique. A
quoi correspondent-elles ?
22

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les propositions relatives la PCR, laquelle (lesquelles) est (sont)


exacte(s) ?
A. Cest une technique damplification de lADN in vitro.
B. Elle ncessite lutilisation damorces dARN.
C. Elle ncessite la rptition de cycles alternant dnaturation, hybridation
et synthse.
D. Elle ncessite une polymrase thermostable.
E. Elle permet damplifier un fragment dADN pouvant atteindre 1 Mb.

23

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les applications de la PCR, relevez la (ou les) proposition(s) exacte(s).


A. Cest une technique de clonage cellulaire
B. elle permet lamplification de nimporte quel fragment dADN dont
la squence est connue
C. Elle est trs utile au diagnostic des gnopathies
D. Elle peut tre utilise pour lamplification de lADN de nimporte
quel gnome
E. Elle peut tre utilise pour la dtection dun agent infectieux

24

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les molcules suivantes, lesquelles sont utilises pour


amplifier un fragment d'ADN humain par la mthode de PCR
?
A - l'ADN humain
B - oligonuclotides servant d'amorces
C - l'enzyme de restriction Taq I
D - des ribonuclotides

E - la Taq polymrase

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5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Vous voulez tudier un fragment d'ADN de 536 paires de base correspondant la rgion
rgulatrice situe en amont (5') du gne de votre protine favorite. Cette squence est la
suivante :
Brin sens :
5' GATTCAGGAGATTCACAC- - 500 nuclotides- -TCGGTACAGCTATACAGG 3'
Brin antisens:
3' CTAAGTCCTCTAAGTGTG- - 500 nuclotides- -AGCCATGTCGATATGTCC

Parmi les 8 amorces suivantes quelles sont les 2 amorces ( dsigner par leurs
lettres) qui permettront 'amplification par PCR de ce fragment ?
a) 5' GATTCAGGAGATTCACAC 3'
b) 5' CTAAGTCCTCTAAGTGTG 3'
c) 5' CACACTTAGAGGACTTAG 3'
d) 5' TCGGTACAGCTATACAGG 3'
e) 5' AGCCATGTCGATATGTCC 3'
f) 5' GTGTGAATCTCCTGAATC 3'
g) 5' CCTGTATAGCTGTACCGA 3'
h) 5' GGACATATCGACATGGCT 3'

26

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Dcrire brivement mais prcisment les diffrents ingrdients requis et le principe de


base de cette mthode de PCR ?
Quelle exprience simple vous permettra de savoir si l'amplification spcifique
de votre fragment a russi ?

27

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

On utilise la mthode de PCR pour dterminer si un sujet est porteur d'une mutation d'un gne
responsable d'une maladie gntique.

Voici la liste des produits et de mthodes pouvant tre utiliss


1- Taq polymrase
2- l'enzyme de restriction Taq I
3- ADN gnomique
4- dnaturation -hybridation des amorces- extension (25 cycles)
5- hybridation des amorces-dnaturation de l'ADN gnomique- extension (25 cycles)
6- dsoxynuclotides (dATP, dCTP, dGTP, dTTP)
7- didsoxynuclotides (ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP)

Parmi les propositions suivantes, laquelle permettra d'amplifier ce fragment ?


A
on met dans le mme tube (3 + 1 + 7) puis on ralise 4
B
on met dans le mme tube (3 + 1 + 6) puis on ralise 5
C
on met dans le mme tube (3 + 2 + 7) puis on ralise 4
D
on met dans le mme tube (3 + 2 + 7) puis on ralise 5
E
aucune solution juste
28

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Pour trouver les meilleures conditions d'amplification


spcifique d'un fragment d'ADN de 500 bp par la mthode de
PCR, on fait varier un seul paramtre, la temprature.
De quelle temprature s'agit-il?
A - de la temprature de dnaturation de l'ADN
B - de la temprature d'extension des amorces
C - des tempratures de dnaturation et d'hybridation des
amorces
D - de la temprature d'hybridation des amorces
E - des tempratures de dnaturation et d'extension des
amorces
29

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Une mutation non-sens (CAC/TAG) du gne X engendre une modification du site


spcifique (CAG/CTG) de lenzyme de restriction Pvu II.
Parmi les techniques suivantes, toutes permettent de faire le diagnostic de la
prsence ou de labsence de cette mutation chez un sujet, sauf une, laquelle
A.

Extraction dARN+RT-PCR+digestion par Pvu II+gel dagarose

B.

Extraction dADN+PCR+digestion par Pvu II+gel dagarose

C.

Extraction dADN+PCR+digestion par Pvu II+gel dagarose+Southern blot et


hybridation sonde ASO

D.

Extraction dARN+digestion par Pvu II+gel dagarose

E.

Extraction dADN+digestion par Pvu II+gel dagarose+Southern blot avec sonde


du gne X

30

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

Dans la liste suivante, relevez la (ou les) proposition(s) exacte(s).


A. Le clonage consiste amplifier une squence prcise dADN en
produisant un nombre lev de copies

B. lors de leur sparation par lectrophorse en gel dagarose, les


acides nucliques de faible taille migrent moins loin que les molcules
de grande taille
C. Une sonde est un fragment dacide nuclique sur lequel est fixe une
molcule dtectable par un systme de rvlation appropri
D. le facteur damplification dun ADN cible par la technique PCR
peut dpasser un million
E. A chaque cycle de PCR, le nombre de copies de lADN cible
augmente environ dun facteur 100
31

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

La squence suivante est celle d'un exon avec ses bordures


introniques. La partie codante reprsente 300bp :

5'
AGTACCTTGATGGCATGACTAGTACCCGGGCTAATCGATCCC

Ile Gln Gln Arg Leu Gln Glu


Glu Leu Asp His Glu Leu
GATCATTCCCCAG [ ATT CAG CAG CGA CTG CAG GAG GAG
CTA GAC CAC GAA CTG
Gly Pro Gly Ala Ser Ser Ser Arg...............//................
Thr Arg Pro Ser Se
GGC CCT GGT GCC TCC AGC TCC CGG
...............//................ACA CGG CCC AGC AG ]
GTGACTCCCGAGGGTTGGGGAGTCATTCGATGGCATAGCT
3'

32

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Quelles sont parmi les amorces suivantes les deux qui vous
demanderez synthtiser pour amplifier par la mthode de
PCR cet exon ?

A
B
C
D
E

5'
5'
5'
5'
5'

TCGATACGGTAGCTTACTGA
AGTCATTCGATGGCATAGCT
AGCTATGCCATCGAATGACT
TCATGGAACTACCGTACTGA
AGTACCTTGATGGCATGACT

3'
3'
3'
3'
3'

33

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Quelle est la longueur du fragment amplifi ?


A 355 bp
B 395 bp
C 375 bp
D 300 bp
E aucune

34

Mthodes dexploration des acides nucliques

Pour rechercher la mutation chez les apparents du sujet tudi, une tude
par PCR-RFLP a t pratique.
a. Quel est le principe de cette mthode et son intrt par rapport au
Southern blot?
b. Avec la squence mute apparat un site supplmentaire de digestion par
lenzyme de restriction E.
Lamplification par PCR de lexon concern du gne du rcepteur du
calcium, conduit lobtention dun fragment de 504 paires de bases.
Ce fragment est soumis ensuite une digestion par E qui gnre diffrent
fragments

35

Sur larbre gnalogique ci-contre est


reprsent le rsultat de la migration sur gel
dagarose de ce produit de PCR, non digr
puis digr par E, issu de lamplification de
lADN gnomique des individus A, B, C et
D.
Lesquels de ces sujets prsentent la
mutation?

36

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Soit lADN complmentaire double brin (ADNc) qui a t synthtis partir de


lARN messager de lapolipoprotine A-II (apoA-II).
La squence du brin sens de cet ADNc est :
1 AGGCACAGAC ACCAAGGACA GAGACGCTGG CTAGGCCGCC
41 CTCCCCACTG TTACCAAC AT GA A G C T G C T C G C A G C AACTG
81 TGCTACTCCT CACCATCTGC AGCCTTGAAG GAGCTTTGGT
121 TCGGAGACAG GCAAAGGAGC CATGTGTGGA GAGCCTGGTT
161 TCTCAGTACT TCCAGACCGT GACTGACTAT GGCAAGGACC
201 TGATGGAGAA GGTCAAGAGC CCAGAGCTTC AGGCCGAGGC
241 CAAGTCTTAC TTTGAAAAGT CAAAGGAGCA GCTGACACCC
281 CTGATCAAGA AGGCTGGAAC GGAACTGGTT AACTTCTTGA
321 GCTATTTCGT GGAACTTGGA ACACAGCCTG CCACCCAG TG
361 AA G T G T C C A G A C C A T T G T C T T C C A A C C C C A G C T GGCCTCT
401 AGAACACCCA CTGGCCAGTC CTAGAGCTCC TGTCCCTACC
441 CACTCTTTGC TACAATAAAT GCTGAATGAA TCC

37

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

1. Parmi les constituants suivants, quels sont ceux qui ont t utiliss
pour la synthse de cet ADNc :

a. une ARN polymrase


b. une transcriptase rverse
c. une ADN ligase
d. les ribonuclosides triphosphates : ATP, UTP, GTP, CTP
e. les dsoxyribonuclosides triphosphates : dATP, dTTP, dGTP, dCTP.

38

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

2. Cet ADNc:

a. comporte la squence du promoteur du gne de lapoA-II


b. reproduit la squence de lARNm de lapoA-II
(hors mis la coiffe et la queue polyA)
c. reproduit la squence de tous les exons du gne de lapoA-II
d. reproduit en partie la squence du brin sens du gne de
lapoA-II
e. reproduit en partie la squence du brin antisens du gne de
lapoA-II

39

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

3. Les deux squences de 3 nuclotides en caractres gras


comprennent :

a. un site dinitiation de la transcription du gne de lapoA-II


b. un signal de fin de traduction de la protine apoA-II
c. un site dpissage du transcrit primaire de lapoA-II
d. un signal de polyadnylation du transcrit primaire de
lapoA-II
e. un lment cis-rgulateur dexpression du gne de lapoA-II

40

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

4. Sachant que le gne de lapoA-II comporte 4 exons et


que le 1er exon nest pas traduit, cet ADNc :
a. a la mme longueur que le gne de lapoA-II
b. a la mme longueur que la squence du gne de lapoA-II
situe entre les sites dinitiation et de terminaison de la
transcription
c. a la mme longueur que le transcrit primaire de lapoA-II
d. a la mme longueur que la squence codante du gne de
lapoA-II
e. a la mme longueur que lARNm de lapoA-II
(hors mis la coiffe et la queue polyA)
41

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

5. Vous souhaitez partir de ce cDNA, synthtiser par


raction de polymrisation en chane (PCR), le fragment
situ entre les deux squences en caractres gras. Parmi les
constituants suivants, quels sont ceux que vous utiliserez
pour cette synthse :

a. loligonuclotide : 5-ATGAAGCTGCTCGCAGC-3
b. loligonuclotide : 5-CAGCCTGCCACCCAGTGA-3
c. loligonuclotide : 5-TCACTGGGTGGCAGGCTG-3
d. les didsoxyribonuclosides triphosphates :ddATP, ddTTP,
ddGTP, ddCTP
e. une ADN polymrase
42

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

7. Le produit de PCR ainsi obtenu, est soumis une digestion par


lenzyme de restriction HypCH4 V pour laquelle il nexiste quun site
de restriction dans lADNc de lapoA-II (situ aux nuclotides 98-101),
puis une lectrophorse en gel dagarose.
Sachant que lenzyme HypCH4 V hydrolyse lADN de la faon
suivante :
5TG CA3
3AC GT5

vous observerez llectrophorse :


a. deux fragments de 41 pb et 262 pb
b. deux fragments de 99 pb et 342 pb
c. quatre fragments de 41 pb, 99 pb, 262 pb et 342 pb.
d. trois fragments de 99 pb, 342 pb et 473 pb.
e. trois fragments de 41 pb, 303 pb et 473 pb.
43

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

8. Une dltion des deux nuclotides numrots 100-101


dans la squence dADNc sera accompagne :
a. dun dcalage du cadre de lecture
b. de la synthse dune protine tronque (plus courte que la
protine normale)
c. dun dfaut dpissage du transcrit primaire
d. dun changement du 14me acide amin de lapoA-II (le 1er
tant la mthionine)
e. de la disparition du site de restriction de lenzyme de
restriction HypCH4 V dans lADNc

44

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Soit lADN complmentaire double brin (ADNc) qui a t synthtis partir de


lARN messager de lapolipoprotine A-II (apoA-II).
La squence du brin sens de cet ADNc est :
1 AGGCACAGAC ACCAAGGACA GAGACGCTGG CTAGGCCGCC
41 CTCCCCACTG TTACCAAC AT GA A G C T G C T C G C A G C A ACTG
81 TGCTACTCCT CACCATCTGC AGCCTTGAAG GAGCTTTGGT
121 TCGGAGACAG GCAAAGGAGC CATGTGTGGA GAGCCTGGTT
161 TCTCAGTACT TCCAGACCGT GACTGACTAT GGCAAGGACC
201 TGATGGAGAA GGTCAAGAGC CCAGAGCTTC AGGCCGAGGC
241 CAAGTCTTAC TTTGAAAAGT CAAAGGAGCA GCTGACACCC
281 CTGATCAAGA AGGCTGGAAC GGAACTGGTT AACTTCTTGA
321 GCTATTTCGT GGAACTTGGA ACACAGCCTG CCACCCAG TG
361 AA G T G T C C A G A C C A T T G T C T T C C A A C C C C A G C T GGCCTCT
401 AGAACACCCA CTGGCCAGTC CTAGAGCTCC TGTCCCTACC
441 CACTCTTTGC TACAATAAAT GCTGAATGAA TCC

45

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

9. La squence dADNc dun sujet homozygote pour la


dltion des nuclotides numrots 100-101 est soumise
comme dans la question 4 une amplification du fragment
situ entre les deux squences en caractres gras, puis
une digestion par lenzyme de restriction HypCH4 V.
Vous observerez llectrophorse en gel dagarose :

a. trois fragments de 41 pb, 262 pb et 303 pb


b. un fragment de 301 pb
c. un fragment de 473 pb
d. deux fragments de 41 pb et 262 pb
e. deux fragments de 99 pb et 342 pb
46

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

squenage
Parmi les affirmations relatives la technique de squenage, relevez la (ou
les) proposition(s) exacte(s).

A. Elle utilise le principe de terminaison de chane.

B. Le milieu ractionnel contient une trs faible proportion de dNTP.

C. Elle ncessite une sparation de fragments dADN avec une rsolution dun
nuclotide.

D. Chaque fragment est gnralement repr par la prsence son extrmit 5 dun
didsoxynuclotide fluorescent.

E. Elle ncessite lamplification pralable du fragment squencer.

47

5. Mthodes dexploration des acides nucliques

propos de la technique de squenage, relevez la (ou les) proposition(s)


inexacte(s).
A. Elle utilise le principe de la terminaison en chaine

B. Elle ncessite laction dune ADN polymrase


C. Elle utilise exclusivement des didsoxynuclotides

D. Chaque fragment est marqu par un nuclotide fluorescent son


extrmit 5
E. Elle permet la dtection de mutation dans le diagnostic des
gnopathies.
48

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les propositions suivantes concernant le squenage de l'ADN


par la mthode de Sanger, lesquelles sont exactes?

a. les ractions parallles de squenage ne diffrent entre elles que par la


nature du
didoxynuclotide

b. l'ADN squencer doit tre sous forme double brin

c. les ractions de squence sont des ractions de polycondensation de


l'ADN

d. chacune des 4 ractions parallles de squence se fait en prsence d'un


seul
Nuclotide

e. la rgion squence est dtermine par la matrice d'ADN et non l'amorce


49

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

L'autoradiographie d'un gel de polyacrylamide ralise pour


dterminer la squence d'un fragment d'ADN selon la mthode
de Sanger estreprsente ci-contre. Chaque indication figurant sur
le schma en haut du gel: G, A, T, C correspond l'incubation en
prsence d'un des 4
didoxynuclotides triphosphate.
Quelle est la squence de 5' vers 3' du fragment d'ADN matrice?

50

L'autoradiographie d'un gel de polyacrylamide ralise pour


dterminer la squence d'un fragment d'ADN selon la mthode
de Sanger est reprsente ci-contre

a. 5'-TACCTAGACATTGGTACCC-3'
b. 5'-GGGTACCAATGTCTAGGTA-3'
c. 5'-ATGGATCTGTAACCATGGG-3'

d. 5'-CCCATGGTTACAGATCCAT-3'
e. 5'-TACCTACACATTGGTACCC-3'

51

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Classer dans lordre les tapes de la mthode du


Southern blot
1 - Electrophorse
2 - Hybridation
3 - Transfert sur membrane
4 - Digestion de lADN par une enzyme de restriction
5 Autoradiographie
.
a. 4 3 1 2 5
b. 1 4 3 5 2
c. 4 1 3 2 5
d. 2 5 3 4 1

e. 1 4 5 3 2
52

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

LADN complmentaire
a. lADN complmentaire est synthtis par
transcriptase inverse partir dARN messager
b. les banques dADN complmentaire sont
identiques quel que soit le tissu humain (foie,
poumon, coeur, rein) partir duquel elles sont
prpares
c. les banques dADN complmentaire prpares
partir de diffrents tissus humains (foie, poumon,
coeur, rein) ont en commun les squences
correspondant aux gnes domestiques
d. la squence en acides amins dune protine
peut tre dtermine partir dune squence
dADN complmentaire
e. la squence dun intron peut tre dtermine
partir dune squence ADN complmentaire
53

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les enzymes suivantes, laquelle ou


lesquelles sont utilises dans la technique de
RT-PCR
a. ligase
b. ADN polymrase thermostable
c. transcriptase inverse
d. ARN polymrase
e. hlicase

54

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Les didsoxyribonuclosides triphosphates


a. possdent trois liaisons riches en nergie
b. ne possdent pas de groupement OH en 3
c. peuvent tre incorpors par lADN polymrase
lextrmit 3-OH dun brin dADN
d. empchent lextension du brin dADN dans
lequel ils sont incorpors
e. peuvent tre utiliss dans les techniques de
squenage de lADN

55

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

La transcriptase inverse
a. est une ADN polymrase ARN dpendante .
b. est une enzyme qui permet l'entre d'un
rtrovirus dans la cellule hte.
c. est utilise pour la synthse in vitro d'ADNc.
d. a t isole partir d'un virus ARN.
e. est une enzyme qui permet la synthse
d'ADN partir d'ARN.

56

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Parmi les propositions concernant la PCR


a. permet l'amplification de fragments d'ADN de
squence compltement inconnue
b. ncessite des amorces ARN.
c. deux amorces diffrentes sont ncessaires
d. fait intervenir une ADN-ligase
e. l'longation par la Taq-polymrase se fait
72C

57

5.

Mthodes dexploration des acides nucliques

Les enzymes de restriction


a. interviennent dans la rplication.
b. ont une fonction chez les bactries d'o on les
extrait.
c. reconnaissent le plus souvent des
palindromes.
d. coupent l'ADN simple brin.
e. peuvent couper un ADN circulaire.

58

Un fragment Bgl II-Xba I d'ADN humain reprsentant un gne a t isol partir d'une
librairie gnomique. Pour en faire la carte de restriction et le squenage, on veut le sous
cloner dans un plasmide de 3 kb. Le site de clonage comprend plusieurs sites uniques
d'enzymes de restriction dont la localisation de 5' vers 3' est la suivante: Eco RI - Bam HI Xba I - Sac I - Hind III. On rappelle les sites de reconnaissance et de coupure des enzymes
suivants :
Site Bam HI
5' G G A T C C 3' Site Bgl II 5' A G A T C T 3'
3' C C T A G G 5'
3' T C T A G A 5'
Site Eco RI

A
B
C
D
E

5' G A A T T C 3' Site Xba I 5' T C T A G A 3'


3' C T T A A G 5'
3' A G A T C T 5'

le sous-clonage est impossible


le sous-clonage ncessite la coupure du plasmide par Eco RI
le sous-clonage ncessite la coupure du plasmide par Eco RI et Xba I
le sous-clonage ncessite la coupure du plasmide par Bam HI et Xba I
le sous-clonage ncessite la coupure du plasmide par Xba I
59

Les rsultats obtenus aprs digestion de ce plasmide recombinant avec diverses


enzymes de restriction sont les suivants :
- avec Xba I : un fragment de 10 kb
- avec Eco RI : un fragment de 10 kb
- avec Sac I : deux fragments de 4 kb et de 6 kb
On en dduit :
A
le fragment gnomique insr est de 3 kb
B
le fragment gnomique insr est de 7 kb
C
le fragment gnomique insr contient 2 sites Sac I
D
le fragment gnomique insr contient 1 site Sac I
E
le fragment gnomique insr peut tre rcupr par une digestion simultane
Eco RI et Xba I

60

On utilise la mthode de PCR pour dterminer si un sujet est porteur d'une mutation
d'un gne responsable d'une maladie gntique.
Voici la liste des produits et de mthodes pouvant tre utiliss
1- Taq polymrase
2- l'enzyme de restriction Taq I
3- ADN gnomique
4- dnaturation -hybridation des amorces- extension (25 cycles)
5- hybridation des amorces-dnaturation de l'ADN gnomique- extension (25
cycles)
6- dsoxynuclotides (dATP, dCTP, dGTP, dTTP)
7- didsoxynuclotides (ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP)

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Parmi les propositions suivantes, laquelle permettra d'amplifier ce fragment ?


A
on met dans le mme tube (3 + 1 + 7) puis on ralise 4
B
on met dans le mme tube (3 + 1 + 6) puis on ralise 5
C
on met dans le mme tube (3 + 2 + 7) puis on ralise 4
D
on met dans le mme tube (3 + 2 + 7) puis on ralise 5
E
aucune solution juste

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