VI-18Hr-A

AO DE LA DIVERSIFICACIN PRODUCTIVA Y DEL

FORTALECIMIENTO DE LA EDUCACIN

UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS

Universidad del Per, DECANA DE AMERICA.
FACULTAD DE INGENIERIA GEOLOGICA, MINERA, METALURGIA Y
GEOGRAFICA.
E.A.P INGENIERIA GEOLOGICA.

LABORATORIO DE FISICOQUIMICA.
Ing. Francisco Torres

TERMOQUIMICA
Alumnos:
Monica Martha Caballero Guzman 14160116
Yaku Francisco Gutierrez Diaz
14160093

08-05-2015

INDICE
1. INTRODUCCION
2. RESUMEN
3. DESARROLLO
3.1. Qu es un biomarcador?
3.2. Extraccin
3.3. Biomarcadores mas importantes
3.3.1. n-Alcanos
3.3.2. Isoprenoides
3.3.3. Sesquiterpenoides Bicclicos
3.3.4. Diterpenoides
3.3.5. Terpanos tricclicos extendidos
3.3.6. Terpanos Tetracclicos
3.3.7. Esteranos
3.3.8. Hidrocarburos Aromticos
3.3.9. Porfirinas
3.3.10. Triterpanos
3.4. MARCADORES BIOLGICOS Y SUS UTILIDADES
4. MARCADORES BIOLGICOS Y SUS UTILIDADES
5. BIBLIOGRAFIA

1. INTRODUCCION

Un biomarcador, o marcador biolgico, generalmente se refiere a un medible

indicador de un estado o condicin biolgica. El trmino tambin se utiliza
ocasionalmente para referirse a una sustancia cuya presencia indica la
existencia de un organismo vivo. Adems, las formas de vida son conocidas
por verter los productos qumicos nicos, incluyendo ADN, en el medio
ambiente como evidencia de su presencia en una ubicacin particular.
Biomarcadores suelen medirse y evaluarse para examinar normales procesos
biolgicos, patgenos procesos o farmacolgicos respuestas a una
intervencin teraputica. Los biomarcadores se utilizan en muchos campos
cientficos.
En el campo de la geologa los Biomarcadores son un grupo de compuestos
orgnicos que se encuentran en materia orgnica sedimentaria, por ejemplo,
de hulla, lignito, petrleo o kergeno, cuyos precursores son compuestos
orgnicos que se producen en los organismos vivos.

2. RESUMEN
Muchos compuestos orgnicos juegan un papel importante en investigaciones
sobre exploracin y produccin de petrleo. A estos compuestos orgnicos se
les denomina "marcadores biolgicos, biomarcadores o fsiles qumicos". Dos
reas principales en las cuales los Biomarcadores tienen gran impacto son la
exploracin y la caracterizacin qumica de nuevas fuentes de petrleo.
Es trascendental, en las investigaciones sobre biomarcadores, precisar el
origen qumicos o sustancia precursora, su estructura qumica actual y la
relacin precursor/producto. Es de especial importancia esta relacin, porque
permite inferir hiptesis sobre la formacin de aceites y crudos, que cobran
importancia desde la ptica de la geologa econmica.
Estos compuestos se encuentran en extractos de petrleo, en concentraciones
muy bajas, asociados con muchos otros compuestos orgnicos, lo que dificulta
su separacin e identificacin. Por fortuna, los qumicos utilizan mtodos
cientficos apropiados para separarlos e identificarlos.
Para estas mezclas complejas de compuestos, encontradas en muestras de
aceites fsiles, se hacen importantes las tcnicas de separacin, tales como al
cromatografa lquida de alta presin (HPLC), cromatografa de columna,
cromatografa en fase gaseosa (GC), separaciones gravimtricas y las
extracciones con base en mezclas de solventes orgnicos. Una vez separados
y purificados los componentes, son tambin muy importantes las tcnicas
instrumentales de identificacin, tales como la espectrometra de masas,
espectrofotometra infra-roja, espectrometra ultravioleta y visible, resonancia
nuclear magntica de Carbono y resonancia nuclear magntica de Hidrgeno.
El estudio de este tipo de sustancias y su aplicacin, es parte de un rea nueva
en geologa, la geoqumica orgnica.

3. DESARROLLO
3

3.1

Qu es un BIOMARCADOR?

Los trminos marcadores biolgicos o biomarcadores permiten

pensar e otro termino apropiado para el fenmeno de su conservacin
fsiles qumicos. Este trmino enmarca los compuestos orgnicos
encontrados en rocas antiguas, que pudieron derivar de material
orgnico depositado en sedimentos. Son fsiles, por haberse
preservado en estos sedimentos, tal como los fsiles clsicos
conocidos.
Los biomarcadores son compuestos orgnicos presentes en a
geoesfera, cuyas estructuras qumicas estn ntimamente ligadas con
las estructuras de las sustancias precursoras, que a su vez provienen
del material fuente del petrleo fsil.
Tres aspectos han contribuido al incremento de las investigaciones
sobre biomarcadores:
a) Los avances de en la capacidad analtica instrumental.
b) Comprensin de mecanismos de transformacin de precursores.
c) El incremento en el nmero de grupos interdisciplinarios
dedicados a investigarlos.
Cuando en 1930 Treibs aisl porfirina de una muestra de combustible,
contribuyo a que los medios cientficos aceptaran el origen biogenico
del petrleo. Este hecho acelero el estudio de los biomarcadores en
muestras de crudo, shale y carbones.
Muchos otros trabajos han detectado, cuantificado e identificado
Estereanos y Triterpanos, combinando tcnicas de cromatografa y
espectometria de masas.
En trabajos anteriores, se detectaron y aislaron triterpenos cristalinos
y su identificacin se realiz por comparacin de sus puntos de fusin
con los estndares preparados. Este tipo de trabajos, intereso no solo
a gelogos sino a paleobotnicos, que les ayudo a clasificar en forma
clara los diversos tipos de carbones.
Muchos biomarcadores son hidrocarburos saturados que provienen de
compuestos oxigenados o insaturados, que en los procesos de
diagnesis y maduracin de los combustibles fsiles, encontraron
medios y condiciones favorables de transformacin y su presencia se
detecta como fsiles qumicos.
Dentro de los biomarcadores reportados en la literatura, se
encuentran los n-Alcanos, Hidrocarburos ramificados, Isoprenoides,
Sesquiterpenos, Diterpenoides, terpanos tricclicos y tetracclicos,
Esteranos, Hidrocarburos aromticos y Porfirinas (Demaison, 1991).
Todos ellos provenientes de una inmensa variedad de metabolitos
4

primarios y secundarios de origen vegetal, de hongos, algas, lquenes

y bacterias, que han sufrido ciclizaciones, fraccionamientos,
condensaciones, reducciones, sustituciones qumicas, saturaciones y
alargamientos estructurales.

3.2 EXTRACCIN

Paralelamente con el avance en la perfeccin de las tcnicas

cromatogrficas y de espectrometra, se descubrieron nuevos
biomarcadores, y se confirmaron las estructuras qumicas de los ya
analizados por otras tcnicas qumicas elementales. En las primeras etapas
del desarrollo de la cromatrografa, fue muy til la cromatrografa de
columna (columnas empacadas), seguida de tecnologa de alta resolucin,
baja actividad y que acompaada del incremento en las mejoras de las
tcnicas de masas, facilitaron la identificacin de los biomarcadores e
increment la posibilidad de identificar ms cantidad de biomarcadores
posibles en estas mezclas de hidrocarburos.
La extraccin de los marcadores biolgicos est prcticamente determinada
por el tipo de muestra, que hace diferir el esquema de extraccin. Por lo
general, consiste en el empleo de solventes orgnicos que arrastran los
componentes por una columna cromatogrfica, para obtener compuestos
puros, los cuales se someten a anlisis espectromtrico de masas, Infra-rojo
y de resonancia nuclear magntica de Carbono o de Hidrgeno. (Esquemas
grficos).

3.3

BIOMARCADORES MAS MPORTANTES

Los principales biomarcadores estudiados haste el presente son los

siguientes:

3.3.1 n-Alcanos
Los n-Alcanos son hidrocarburos saturados, fcilmente identificables,
abundantes en muestras de combustibles y se emplean para inferir la
fuente de material orgnico de una muestra. La biodegradacin influye la
distribucin de los n-Alcanos en combustibles fsiles. En las primeras etapas
de degradacin bacteriana, ocurre la remocin de alcanos

C16 C25

mayores. Por lo general, la degradacin bacteriana es seguida de del lavado

o lixiviado con agua, que dispersa y distribuye de manera no uniforme estos
hidrocarburos en el crudo.

Ilustracin 1: frmula general de los alcanos

3.3.2 Isoprenoides
Los isoprenoides estn en menor concentracin que los n-Alcanos en los
estractos de crudos. Su identificacin hace necesario emplear y combinar
tcnicas de cromatografa (GC), masa (MS), monitoreo con ion simple (SIM)
y deteccin con ion mltiple (MID). Los isoprenoides son empleados en
muchos estudios de exploracin, que incluye identificacin de la fuente,
medidas e ndices de maduracin y estudios de correlacin. Los
isoprenoides no han sido ampliamente usados en otras reas de produccin
de combustibles fsiles. El descubrimiento del Botryococano, compuesto
solo encontrado solo en un alga marina, Botryococcus braunii, permite
proponer que los crudos son generados de material orgnico con relativa
prehistoria cercana.

Ilustracin 2:Modelo de bolas de la estructura molecular del isopreno, la unidad qumica de

los terpenos.

Ilustracin 3:Muchos terpenos son extrados de la resina de las conferas, aqu un pino.

3.3.3 Sesquiterpenoides Bicclicos

Su caracterstica comn, es poseer mnimo de anillos tipo hexano fusionado,
ramificado y sustituido por grupos alquilos cclicos o no. Se han investigado
poco en muestras de combustibles fsiles, pero se han detectado en
investigaciones de exploracin del petrleo. Para su deteccin e
identificacin se emplean combinaciones de tcnicas GC/MS. Es posible que
muchos de los ismeros presentes, sean producto del proceso de
maduracin de las muestras, lo que dara posibilidad de emplearlos como
parmetros de maduracin. Estos compuestos no son afectados por la
biodegradacin y complementaran estudios de maduracin, dado que los
Esteranos s son afectados por la biodegradacin, y se emplean como
parmetros importantes en este tipo de investigacin.

10

Ilustracin 4:Los esqueletos de sesquiterpenos provienen de un percursor comn: el

pirofosfato de farnesilo

3.3.4 Diterpenoides
Los diterpenoides se caracterizan por presentar mnimo tres anillos tipo
hexano fusionados, sus precursores son los diterpenoides cidos basados en
los esqueletos tipo Abietano, Pimarano y Llabdano. Los diterpenoides se
emplean como indicadores de materia terrestre fuente, particularmente de
resinas de aceites, rocas fuente y carbones. Su identificacin se ha basado
en datos espectrales de masas nicamente, en la mayora de los casos
donde han sido reportados son estudios sobre carbones.

11

Ilustracin 5: esqueleto de los diterpenos.

3.3.5 Terpanos tricclicos extenddos

Estos compuestos parecen tener un origen marino, se identifican
rpidamente por GC/MS/MID, particularmente por la presencia del in a m/z
191 y de la serie extendida

C19 a C30 . Se ha propuesto como precursor al

triciclo-hexaprenol, formado anaerbicamente desde el componente

universal celular hexaprenol. El compuesto saturado ha sido encontrado
tanto en petrleo como en la fraccin lipdica de Archeabacteria. La serie de
hidrocarburos tricclicos encontrada, extendida desde el rango

C19 a C30 alC 19 aC 45 , soporta el origen biognico de los terpanos tricclicos,

provenientes de la ciclacin de polipropenoles regulares presentes en las
membranas bacteriales.

Ilustracin 6:.Estructura base de los terpanos

12
pentacclicos (a) y de los esteranos (b).

3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
3.3.6
Terpanos Tetracclicos
Son compuestos qumicos caracterizados por la fusin de cuatro anillos tipo
hexano. Son una nueva especie de biomarcadores. Detectados por
GC/MS/MID Y se caracterizan por la presencia del ion fragmento m/z 191. Se
encuentra en esponjas marinas que actualmente crecen en la baha de
Npoles, lo que sugiere un posible origen para los hidrocarburos tetraciclicos
en la diagnesis de diterpenos contenidos por esponjas contemporneas
con los procesos de sedimentacin de sedimentos arcillosos.
3.3.7 Esteranos

Ilustracin 7: estructura de los esteranos.

Son derivados de los esteroles, compuestos ampliamente distribuidos en

las plantas y microorganismos. Los esteroles
microorganismos marinos y los esteroles

C29

C27 C28

provienen de

de plantas superiores.

Variaciones en las cadnas sustituyentes y en su estereoqumica se usan

para obtener informacin especfica de organismos fuente.
3.3.8 Hidrocarburos Aromticos
Se encuentran en cantidades apreciables en crudos, son relacionados a
esteroides y triterpenoides provenientes del material biolgico y son de
13

particular uso, por la comparacin estructural con sus precursores. La

presencia de aromticos en una muestra es indicio del grado de maduracin
trmica de material orgnico fuente.

Ilustracin 8: hidrocarburos aromticos

3.3.9 Porfirinas
La primera clase de compuestos usados como marcadores biolgicos, fueron
las porfirinas, que permitieron la hiptesis sobre el origen del petrleo,
proveniente de remanentes orgnicos de plantas y animales.
Las porfirinas provienen de la degradacin y desfuncionalizacion de la
clorofila. Actualmente se separan empleando columnas de capilaridad con
derivados de silica. Las porfirnas esta ampliamente distribuidos en
carbones, provenientes de clorofila de plantas y bacterias.

Ilustracin 9:Estructura del ncleo de porfirina.

14

Ilustracin 10: clorofila a

3.3.10

Triterpanos

Los triterpanos son los biomarcadores ms diversificados estructuralmente,

empleados como indicadores de madurez, fuentes, migracin y
biodegradacin. Presentan dos tipos: triterpanos pentacclicos basados en el
esqueleto del hopano y moretanos relacionado, y aquellos que no tienen ese
tipo de estructura.

4. MARCADORES BIOLGICOS Y SUS UTILIDADES

Las molculas orgnicas (fsiles qumicos) son abundantes en muchos
sedimentos y rocas sedimentarias, y se denominan marcadores biolgicos
"biomarker". Su estudio e identificacin requieren tcnicas sofisticadas de
toma de muestra y anlisis. Conservan un registro muy detallado de la
actividad biolgica del pasado y estn relacionados con molculas orgnicas
actuales. Las posibles fuentes de marcadores biolgicos en muestras
geolgicas son tantas como molculas se conocen en los organismos.

15

5. BIBLIOGRAFIA
Esteranos y terpanos como marcadores biolgicos en la
prospeccin petrolera. Jorge A. Garca 1 *, Jos A.
Snchez 1 y Mario A. Guzmn.
Biomarkers - Biomarcadores - Marcadores Biolgicos.
Carlos Arturo Correa Maya. Qumico, Magister en Qumica, Profesor
Universidad EAFIT.
Departamento de Geologa.

El uso de biomakers en la contaminacin marina. Julin

Blasco.

16

17