TALLER 3 DE BIOQUMICA 2015-I PROFESOR: CSAR A. GODOY V.

BIOMOLCULAS Y ENERGA
1. Defina claramente desde el punto de vista bioqumico y desde el punto de vista fisiolgico:
metabolismo, catabolismo y metabolismo, anaerbico, aerbico.
2. Diferencie claramente entre macronutrientes y micronutrientes. D un ejemplo de cada uno
de ellos. Por qu las vitaminas son claves en el metabolismo?
3. Hongos y bacterias son capaces de emplear celulosa como fuente de carbono
(carbohidratos) mientras que los humanos no podemos; especficamente por qu sucede
esto?
4. Por qu los seres vivos emplean reacciones de hidrlisis y sistemas electroqumicos para
aprovechar la energa de los alimentos y no una reaccin de combustin convencional?
5. Existen diversas molculas empleadas por los seres vivos empleadas para almacenar energa,
entre ellas el ATP. Qu hace del ATP una molcula rica en energa? Por qu es la ms
usada en los seres vivos? La Acetil-CoA es otra molcula rica en energa, investigue las razones
de por qu esto es as, averige el valor usual de energa liberada cuando se hidroliza.
6. El hecho de que el ATP sea una molcula rica en energa implica que es inestable? Cmo
se suele hidrolizar el ATP en un ser vivo? Averige los valores de la constante de equilibrio de
la primera hidrlisis del ATP (y en lo posible el valor de la energa de activacin asociada),
mostrando en la ecuacin los debidos balances de carga y masa. Con esa informacin y otra
que considere pertinente, argumente su respuesta.
7. Muchas de las reacciones biolgicas son per se desfavorables desde el punto de vista
termodinmico, sin embargo los seres vivos son capaces de llevarlas a cabo. Cmo es esto
posible? D un ejemplo concreto diferente a lo visto en clase.
8. Se dice que lo seres vivos son capaces de modular la cantidad energa til obtenida a partir de
una reaccin qumica dada. Qu explica que la primera hidrlisis por mol de ATP pueda
generar en ocasiones ~28kJ o hasta ~40 kJ? Explique esto desde el punto de vista
termodinmico. Averige adems bajo qu condiciones termodinmicas se pueden obtener
los mencionados valores extremos.
RUTAS METABLICAS.
9. Por qu es necesario regular las vas metablicas? Qu mecanismos se aprovechan/
emplean para regularlas? Qu pasos, dentro de una ruta metablica, requieren de controles
regulatorios ms estrictos? Aada ejemplos a su respuesta.
GLICLISIS
10. Ustedes deben minimizar el costo asociado al gasto de la materia prima en un proceso
fermentativo donde a partir de glucosa (materia prima) se produce energa Sugerira un
diseo aerbico o anaerbico para el biorreactor del proceso? Hasta cunta masa de glucosa
ahorrara con el diseo que Ud. sugiere por unidad arbitraria de energa obtenida? Argumente
su respuesta desde el punto de vista bioqumico dejando de lado el punto de vista ingenieril.

11. En un cultivo de levadura o bacterias que crece en medio rico en carbohidrato la tendencia
del pH es a descender en la medida que pasa el tiempo. Cul/es son/seran las razones de
esto?
12. En la fermentacin lctica los microorganismos transforman glucosa a cido lctico. Realice
la ecuacin qumica balanceada de la reaccin global. Es una reaccin tipo redox? Qu
relacin tiene esto con que algunos organismos deban cambiar a modo anaerbico en
ausencia de oxgeno?
ENTRADA AL/Y CICLO DE KREBS (O CICLO DE LOS CIDOS TRICARBOXLICOS)
13. Por qu una deficiencia o mutacin del complejo de la Piruvato Deshidrogenasa puede
causar acidosis?
14. Por qu se dice que la entrada de Acetil-CoA al ciclo de Krebs no es una reaccin
anaplertica? Cules son las dos funciones principales del ciclo de Krebs? En su respuesta
debe quedar claro por qu se considera a este ciclo como anfiblico dando ejemplos.
15. Este ejercicio fue dejado en clase. Cuantos ciclos de Krebs como mnimo debe sufrir una
molcula de Acetil-CoA para ser convertida en CO2. Argumente su respuesta con esquemas
claros. Nota: el succinato y el fumarato son molculas simtricas.
16. Averige cmo el Ca2+ regula del ciclo de Krebs. A travs de que metabolito no
coenzimtico se regulan a la vez la gliclisis y el C. de Krebs? Por qu se dice que el
oxgeno sera un activador indirecto del ciclo de Krebs?
CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES (CTE)
17. A qu se debe el nombre de la cadena de transporte de electrones. De dnde vienen
originalmente, en qu intermediario/s se acumularon y a donde van finalmente esos
electrones?
18. Si ud. hace cuentas, desde la gliclisis y hasta el C. de Krebs se produjeron
10NADH+2FADH2. Sin embargo en las diapositivas para los clculos de produccin de ATP
se tienen en cuenta 8NADH+4FADH2. Por qu? Pista: Tenga en cuenta dnde se produjeron
c/u de esos diez NADH.
19. De acuerdo a lo visto en la CTE se sabe que cada NADH sirve para sacar al espacio
intermembrana (de la mitocondria) 12H+, mientras que cada FADH2 lo hace con 8H+.
Explique las razones de esto desde el punto de vista de la CTE.
20. Calcule el valor en Julios/mol que en condiciones estndar produce la oxidacin de NADH
(emplee la ecuacin de Nerst). Teniendo en cuenta que para producir ATP desde ADP se
requiere cerca de 30,5KJ/mol calcule la cantidad de ATP que se podra producir a partir de
su primer clculo. Por qu el valor en moles de ATP que obtiene est por encima del que
realmente se produce?
21. Se calcula que en promedio el cuerpo humano requiere ingerir alrededor de 2500Kcal/da
(Asumiendo que se aprovecha el 40%) calcule la masa necesaria de ATP que se debe
hidrolizar a ADP+Pi para llegar a ese requerimiento neto. Le parece que su respuesta tiene
sentido? Qu no ha tenido en cuenta en sus clculos?

ENTRADA A LA GLICLISIS DE OTROS AZCARES

22. Organismos como el ser humano aprovechan no solo la glucosa sino otros monosacridos
como fuente de energa. En algunos casos sin embargo defectos genticos pueden causar
que la ingestin de ciertos monosacridos (o sus precursores oligosacridos) causen
enfermedades. Describa brevemente una de ellas y explique qu reaccin en especfico no
se lleva a cabo.
VA DE LAS PENTOSAS FOSFATO
23. Mencione el/los objetivos principales de la va de las pentosas fosfato.
SNTESIS DE GLICGENO, GLICOGENLISIS Y GLUCONEOGNESIS.
24. El glicgeno es una manera de glucosa (energa) en los mamferos. Por qu es necesario
reservar la glucosa como glicgeno (cuya sntesis implica cierto gasto energtico) y no
dejarla tal cual?. Pista: propiedades coligativas.
25. Describa brevemente una enfermedad asociada a la sntesis de glicgeno o la glicogenlisis,
escriba la/s reaccin/es qumica/s que no se llevan a cabo asociadas a tal patologa.
26. Cul es el objetivo de la gluconeognesis? Por qu el ciclo de Krebs es clave para esta va
y cul/es reaccin/es anapletrica/s la hacen posible?
27. La gluconeognesis y la gliclisis son vas opuestas, el que se lleguen a realizar a la vez
pueden generar lo que se llama ciclos intiles. Uno de los mecanismos para evitar esto es
el de la regulacin alostrica. Por ejemplo la 1,6-Fructosabifosfatasa es activada por la
presencia de ATP mientras que es inhibida por AMP. En general los niveles de AMP indican
con mayor sensibilidad el estado energtico de la clula que los de ADP. Explique desde el
punto del equilibrio qumico por qu esto sera as. Pista: una enzima, la adenilato quinasa.
NADPH Y METABOLISMO DE GRASAS.
28. Por qu se hace nfasis en estudiar el metabolismo de triglicridos y no tanto el del resto de
lpidos (exceptuando el colesterol) como por ejemplo fosfolpidos o esfingolpidos.
29. Roche (Xenical) y otras compaas farmacuticas han comercializado un principio activo
(Orlistat) que en principio puede ayudar a disminuir el peso corporal. Cul sera el
fundamento bioqumico de esto?
30. Aun cuando se dejen de lado las grasas de la dieta es posible acumular grasa en el
organismo, bioqumicamente a qu se debe esto.
31. A partir de una misma masa de glucosa y de una de grasa (tome como ejemplo un cido
graso saturado de su eleccin) calcule compare la cantidad de ATP que es posible producir
cuando se convierten en CO2 +H2O segn las vas metablicas estudiadas. En este ltimo
caso argumente su respuesta empleando un esquema que muestre cada uno de los
productos obtenidos y en que rutas metablicas estos se transforman hasta llegar
finalmente a convertirse en ATP.