Biotup: Meio Fsico,

Diversidade Biolgica e Sociocultural do Baixo Rio Negro, Amaznia Central

Edinaldo Nelson SANTOS-SILVA, Fbio Marques APRILE, Veridiana Vizoni SCUDELLER,
Srgio MELO (Orgs.),
Editora INPA, Manaus, 2005

Captulo 14

Diversidade Biolgica

Bancos de dados sobre biodiversidade

na Amaznia: a experincia do Projeto
Biotup
Mauro Jos CAVALCANTI
e-mail: maurobio@acd.ufrj.br
Departamento de Vertebrados, Museu Nacional/Universidade Federal do Rio de Janeiro
Quinta da Boa Vista, So Cristvo, 20940-040 Rio de Janeiro, RJ Brasil

RESUMO - A criao de bancos de dados por projetos que envolvem a coleta e o estudo de
espcimes biolgicos, as espcies a que pertencem e os locais em que ocorrem, um prrequisito indispensvel para a conservao e uso sustentvel dos recursos naturais.
Contudo, o grande volume de dados oriundos de levantamentos ecolgicos de campo
demanda a aplicao de novas tcnicas e instrumentos para seu armazenamento,
recuperao, anlise e disseminao. O Projeto Banco de Dados do Biotup est
direcionado ao manejo e anlise dos dados sobre a Reserva de Desenvolvimento
Sustentvel do Lago Tup e sua integrao em um sistema de informao distribudo sobre
biodiversidade, que possa fornecer apoio para as atividades de pesquisa e extenso em
andamento na rea. Os recursos computacionais disponveis ao projeto so utilizados no
gerenciamento dos dados sobre espcies e indivduos coletados em campo, atravs da
utilizao de sistemas gerenciadores de banco de dados especficos para levantamentos
ecolgicos de campo e inventrios biolgicos (ECOLOG e ALINE); na produo de guias de
campo e manuais de identificao, por meio de sistemas de identificao auxiliada por
computador baseados no formato DELTA; e na anlise multivariada de dados ecolgicos
atravs de vrios mtodos de ecologia numrica. A estratgia do sistema de informao

Cavalcanti

adotada pelo Projeto Biotup de baixo risco, usando tecnologia e programas j

disponveis e testados em outros projetos, e espera-se que possa oferecer um modelo
operacional til para as organizaes e indivduos envolvidos no desenvolvimento
sustentvel e conservao da biodiversidade na Amaznia.
PALAVRAS-CHAVE: bancos de dados, bioinformtica, levantamentos ecolgicos,
inventrios de biodiversidade, DELTA.

Introduo
O Projeto Biotup uma proposta de estudo
multidisciplinar de longo prazo em execuo na Reserva
de Desenvolvimento Sustentvel do Tup (RDS do Tup),
envolvendo pesquisadores de vrias instituies. O
principal objetivo deste projeto inventariar, identificar
e quantificar a biodiversidade dessa rea. Para isso esto
sendo desenvolvidos estudos sobre vegetao,
hidrologia, hidroqumica, zooplncton, fitoplncton,
esponjas, peixes, coliformes, insetos aquticos,
crustceos intersticiais, uso de recursos e estudos scioambientais. Assim, o Projeto Biotup compreende uma
coleo de projetos interrelacionados, cada um deles
com seus prprios objetivos e prioridades locais.
Todavia, uma necessidade comum a todos estes projetos
o armazenamento, recuperao e disseminao das
informaes sobre a diversidade biolgica na rea
pesquisada.
A criao de bancos de dados por projetos que
envolvem a coleta e o estudo de espcimes biolgicos, as
espcies a que pertencem e os locais em que ocorrem,
constitui-se num pr-requisito indispensvel
conservao da biodiversidade e uso sustentvel dos
recursos naturais. Contudo, o manuseio do volume
considervel de dados oriundos de levantamentos
ecolgicos de campo e inventrios biolgicos constitui-se
em um grande problema (Yoon, 1993; Janzen, 1994;
Lawton et al., 1998; Sharkey, 2001), demandando o
emprego de novas tcnicas e instrumentos para a
utilizao eficaz das informaes disponveis nos
processos de tomada de decises referentes
administrao do meio ambiente (Cavalcanti, 1998a).
Neste contexto, a implementao de sistemas de
bancos de dados apresenta-se como uma forma eficiente
de organizao e armazenamento das informaes

200

obtidas pelos diversos projetos

envolvidos no estudo da RDS do Tup,
possibilitando aos mesmos compartilhar e disseminar eficazmente os dados
coletados e armazenados de forma
padronizada por cada um deles,
reduzindo consideravelmente o tempo
de processamento da informao e
acelerando a produo de resultados
teis.
O PROJETO BANCO DE DADOS DO
BIOTUP
O Projeto Banco de Dados do
Biotup direcionado ao manejo e
anlise dos dados sobre a RDS do Lago
Tup e sua integrao em um sistema
de informao sobre a biodiversidade
desta rea, que possa fornecer apoio
para as atividades de pesquisa,
conservao e uso sustentvel dos
recursos naturais.
O sistema de informao sobre
biodiversidade do Projeto Biotup
funcionar como um grupo de bancos
de dados individuais, ligados atravs
de padres comuns de dados,
protocolos de intercmbio de dados e
programas aplicativos. O sistema assim
estabelecido canalizar dados crticos,
acumulados no mbito de cada projeto
individual ou armazenados nas fontes
existentes, para os projetos de uso de
recursos e desenvolvimento sustentvel e disseminar a informao dos

Bancos de dados sobre biodiversidade na Amaznia: a experincia do Projeto Biotup

projetos para um pblico mais amplo.

A flexibilidade oferecida pelos
sistemas gerenciadores de bancos de
dados utilizados, dar a cada projeto
total autonomia para controlar os tipos
de dados que sero compartilhados
(espcies, indivduos, descritores
morfolgicos, variveis ambientais,
etc.). Esta flexibilidade crtica para o
Projeto Biotup, uma vez que
diferentes bancos de dados devem ser
implementados por diferentes
projetos, de acordo com as suas
necessidades e prioridades especficas. Contudo, para que o sistema de
informao do Projeto Biotup alcance
seu maior objetivo, a integrao,
ser necessrio estabelecer um alto
grau de padronizao na definio de
categorias de dados como habitats
(comunidades vegetais, por exemplo)
e certos descritores (outros,
entretanto, podero ser definidos por
cada projeto para atender a suas
prprias necessidades e prioridades
especficas) visando assegurar a
compatibilidade entre os diferentes
bancos de dados (Dalcin, 1998). O
estabelecimento de padres para os
dados e a adoo de estruturas de
armazenamento comuns gerenciadas
por sistemas utilizados por todos os
projetos integrantes do Projeto
Biotup possibilitar uma troca efetiva
de informao entre os vrios grupos
de pesquisa envolvidos. Esta
estratgia j foi aplicada com sucesso
em outros sistemas de informao
sobre biodiversidade, envolvendo
projetos desenvolvidos em
colaborao por vrias instituies,
como International Legume Database
and Information Service (Bisby, 1989,
1993, 2000; Zarucchi et al., 1993),
World Biodiversity Database (Schalk,
1992) e Plantas do Nordeste (Allkin,

1997, 1998).
O ncleo de informao de cada projeto (nomes
cientficos, distribuio geogrfica, tipos de utilizao
de plantas e animais, nomes vulgares, etc.) ser idntico
e seguir uma padronizao (por exemplo, por tipos de
ambiente, nomes de localidades e cdigos de unidades
de amostragem). A disponibilidade de uma base de dados
taxonmica nica para cada grupo botnico ou
zoolgico, fornecendo s bases de dados orientadas aos
indivduos (colees biolgicas) um nome nico do
txon, partilhado por todos os projetos, permitir a
integrao consistente e efetiva dos dados, assegurando
sua confiabilidade e facilitando o seu intercmbio
(Dalcin, 1998). Outros padres de dados e terminologias,
entretanto, podero ser estabelecidos individualmente
por cada projeto, segundo suas prprias necessidades.
O Projeto Banco de Dados do Biotup ir assegurar
que os dados, os programas aplicativos e o equipamento
computacional disponveis sejam gerenciados de uma
maneira efetiva e apropriada atravs do:
1) Estabelecimento e apoio aos bancos de dados
independentes desenvolvidos pelos projetos individuais
no mbito do Projeto Biotup;
2) Interligao destes bancos de dados a fim de que os
projetos possam compartilhar informaes;
3) Desenvolvimento de padres de dados, formatos e
mecanismos para assegurar que os dados possam ser
intercambiados.
Alm disso, o Projeto Banco de Dados do Biotup tem
por objetivo criar uma maior auto-suficincia dentro da
regio em todos os nveis. Isto ser efetuado com o:
1) Fornecimento de treinamento especializado em
gerenciamento de dados biolgicos, inclusive
oferecendo cursos tcnicos de treinamento no uso de
sistemas de informao e na anlise de dados sobre
biodiversidade;
2) Formao de pessoal tcnico capacitado na rea de
bioinformtica e manejo de bancos de dados biolgicos.
RECURSOS COMPUTACIONAIS
Hardware
O equipamento computacional utilizado no mbito do
Projeto Biotup foi escolhido com base nos custos,
confiabilidade e fcil acesso. So utilizados basicamente

201

Cavalcanti

microcomputadores da linha IBM-PC ou compatveis. O

intercmbio eletrnico de dados ser efetuado atravs
de redes locais (intranet do INPA) e de longa distncia
(internet).
Software

Sistemas de confiana so um fator crtico para o

sucesso dos projetos de bancos de dados sobre
biodiversidade (Allkin & Winfield, 1993). Dados
biolgicos complexos e variveis requerem estruturas de
dados adequadas para represent-los e programas
sofisticados para manej-los, mas que tambm sejam de
fcil utilizao (Allkin, 1988; Allkin & Bisby, 1988; Allkin
et al., 1992b; White et al., 1993). Os custos para o
desenvolvimento de tais sistemas so elevados e, em
geral, grosseiramente subestimados. Projetos
individuais de levantamentos ecolgicos de campo e
inventrios biolgicos raramente dispem do tempo ou
dos recursos necessrios para criar os prprios sistemas
de gerenciamento de bancos de dados de que
necessitam.
Com freqncia, os sistemas de bancos de dados de
muitos projetos no funcionam adequadamente quando
so necessrios ou so de uso to complexo que apenas
especialistas ou membros da equipe especialmente
treinados podem acessar o sistema. Os participantes de
tais projetos dispendem uma considervel quantidade
de tempo entendendo sistemas comerciais (como
planilhas eletrnicas e gerenciadores de bancos de
dados), tentando adapt-los s suas necessidades
especficas e muitas vezes duplicando esforos dentro da
comunidade cientfica. Estes problemas tornam os dados
efetivamente inacessveis e incertos a longo prazo e
impedem que seus usurios se beneficiem integralmente
da moderna tecnologia disponvel de banco de dados
(Allkin & Winfield, 1993).
A estratgia adotada pelo Projeto Banco de Dados do
Biotup de baixo risco, usando tecnologia simples e
programas aplicativos j desenvolvidos e testados. O
sistema de informaes do Projeto Biotup utilizar
sistemas j disponveis e facilmente acessveis,
preferencialmente programas de aplicao cientfica
difundidos, cujo funcionamento conhecido e que esto
em uso bem sucedido em muitos projetos similares. O

202

sistema ir se beneficiar, assim, dos

investimentos prvios efetuados no
desenvolvimento desses programas. O
Projeto Banco de Dados do Biotup
oferecer a cada projeto individual um
conjunto de ferramentas para o
manejo de dados sobre
biodiversidade, cada qual projetada
para um propsito diferente (Diederich & Milton, 1993; White et al.,
1993), proporcionando uma grande
flexibilidade na gesto, compartilhamento e publicao de suas informaes. Trs sistemas bsicos sero
utilizados por todos os projetos
integrantes do Projeto Biotup: ALINE
para o manejo de dados sobre
espcies, ECOLOG para o manejo de
dados sobre espcimes e DELTA para o
manejo de dados taxonmicos (Fig. 1).
Os recursos computacionais
disponveis ao projeto sero utilizados
basicamente:
1) No gerenciamento dos dados
sobre espcies e indivduos coletados
em campo, atravs da utilizao de
sistemas gerenciadores de banco de
dados com capacidade relacional,
especficos para o manejo de dados
obtidos em levantamentos ecolgicos
de campo e inventrios de
biodiversidade (ECOLOG e ALINE);
2) Na produo de guias eletrnicos
e manuais de identificao de campo,
para diferentes usurios, por meio de
sistemas de identificao auxiliada por
computador baseados no formato
DELTA (Dallwitz, 1980, 1993).
3) na anlise dos dados atravs de
mtodos estatsticos e tcnicas
multivariadas (Gauch, 1982; Digby &
Kempton, 1987; Ludwig & Reynolds,
1988; Legendre & Legendre, 1998);
Cada uma destas aplicaes de
ferramentas computacionais no
Projeto Biotup ser descrita mais

Bancos de dados sobre biodiversidade na Amaznia: a experincia do Projeto Biotup

detalhadamente a seguir.
O SISTEMA ECOLOG
O armazenamento, recuperao e
anlises bsicas dos dados sobre
espcies e indivduos coletados em
campo sero efetuados atravs do
sistema gerenciador de bancos de
dados ECOLOG desenvolvido por
Cavalcanti (1991, 1993), que ser
usado por todos os projetos que
envolvem a coleta e o estudo de
espcimes biolgicos.
O sistema ECOLOG foi especificamente projetado para o manejo de
dados obtidos em levantamentos
ecolgicos de campo e inventrios
biolgicos em microcomputadores da
linha PC e conta com mais de 10 anos
de investimento em seu desenvolvimento. Sua flexibilidade, que pode ser
testemunhada pela natureza diversa
dos projetos que o utilizam (S et al.,
1991; Dalcin et al., 1997; Kurtz &
Araujo, 2000) e maturidade inspiram
confiana em seus usurios. Este
sistema apresenta como principais
caractersticas a utilizao em
equipamentos de baixo custo e fcil
acesso (microcomputadores da linha
IBM-PC); a rapidez e facilidade de
operao, dispensando conhecimentos
especializados em computao por
parte dos usurios; a validao
completa dos dados de entrada; a
flexibilidade na recuperao de
registros para consulta e produo de
relatrios (a partir de qualquer
atributo ou combinao de atributos);
a possibilidade de produzir anlises
quantitativas de dados ecolgicos
(clculo de ndices de diversidade,
freqncia e dominncia, curvas de
rarefao, etc.); a emisso de
listagens de espcies e de etiquetas de

Gerenciamento
dos dados sobre
espcimes

ECOLOG

ALINE

ATF

Etiquetas
de coleta

Gerenciamento
dos dados sobre
espcies

Relatrios de
Manuteno

Divulgao

DELTA

DELTA

Lista de espcies,
monografias

Chaves de
identificao
gias de campo

Figura 1. Sistemas do Projeto Biotup

coleta de campo; a exportao de dados em vrios

formatos padronizados para utilizao em outros
sistemas; e a integrao com dispositivos eletrnicos de
aquisio de dados, como computadores de mo e
sistemas de geoposicionamento (Morain, 1993; Herring,
1996).
O sistema ECOLOG utiliza uma estrutura relacional
simples e eficiente, baseada em trs tabelas de dados
principais (indivduos, espcies e locais) e duas tabelas
auxiliares (descritores morfolgicos e variveis
ambientais), que se relacionam por campos
compartilhados (Fig. 2). Esta estrutura pode ser
considerada uma verso simplificada do modelo geral de
informao para colees biolgicas proposto por
Berendsohn et al. (1999). As tabelas de dados do sistema
armazenam dados sobre as caractersticas gerais de cada
espcie (como taxonomia e nomenclatura, os dados de
coleta de cada espcime (coletor, data, procedncia,
biometria, morfologia, notas) e a localizao espacial
(coordenadas geogrficas, altitude/profundidade) de
cada unidade amostral. A partir de cada uma destas
tabelas de dados, so criados arquivos de ndices que
permitem a busca e recuperao de informaes atravs
de mltiplas chaves. A utilizao de uma estrutura
relacional permite reduzir a duplicao e a redundncia
nos dados e favorece a eficincia no seu armazenamento. Assim, por exemplo, uma vez que cada espcie
compreende um registro nico na tabela de espcies,
necessrio armazenar apenas o nmero do txon para os
registros daquela espcie, ao invs de repetir o nome

203

Cavalcanti

Tabela de Espcies
Tabela de Indivduos
Nmero do Indivduo
Nmero da Espcie
Local
Coletor
Data da Coleta
Hora da Coleta
Observaes
Tabela de Descritores
Nmero do Indivduo
Descritor
Descrio

Nmero da Espcie
Grupo
Famlia
Gnero
Espcie
Autor
Subespcie
Tabela de Locais
Local
Nome do Local
Altitude/Profundidade
Latitude
Longitude
Tabela de Variveis Ambientais
Local
Data
Hora
Varivel
Valor

Figura 2. Tabelas relacionadas do Sistema ECOLOG

completo da espcie para cada coleta no banco de

dados. Da mesma forma, qualquer alterao em um
registro nas tabelas de espcies ou locais
automaticamente refletida em todos os registros de
indivduos relacionados quela espcie ou quele local.
Como as tabelas de dados do sistema possuem campos
de tamanho fixo, procurou-se otimizar ao mximo o
tamanho de cada campo para assegurar o
armazenamento adequado dos dados, sem um consumo
excessivo de espao em disco. Esta restrio implica no
aumento do espao de armazenamento necessrio ao
banco de dados, bem como da complexidade da
estrutura lgica do mesmo, porm no impe limites ao
tamanho do mesmo.
O SISTEMA ALINE
Todos os projetos no mbito do Projeto Biotup iro
administrar seus bancos de dados sobre espcies
utilizando o sistema ALINE desenvolvido por Cavalcanti

204

(1998b). O sistema ALINE uma

ferramenta genrica, fundamentada
em um modelo de dados relacional
projetado pelo International Legume
Database and Information Service
(ILDIS), que tem como objetivo criar e
manter um banco de dados global com
informaes taxonmicas, ecolgicas
e econmicas sobre as leguminosas,
envolvendo grupos de pesquisa em
mais de 20 pases (Bisby, 1989, 1993,
2000; Zarucchi et al., 1993). Esta
estrutura assegura a qualidade e
integridade dos dados armazenados,
permitindo ainda aos usurios definir
seus prprios descritores morfolgicos
e configurar seus bancos de dados de
acordo com suas necessidades
especficas (Fig. 3).
ALINE um sistema orientado ao

Bancos de dados sobre biodiversidade na Amaznia: a experincia do Projeto Biotup

txon com capacidade relacional,

disponvel para microcomputadores da
linha IBM-PC (Cavalcanti, 1998b). O
ALINE ser usado por todos os projetos
para a criao e manuteno de bancos
de dados sobre a flora e a fauna da rea
de estudo, incluindo informaes
sobre taxonomia e nomenclatura, usos
econmicos, nomes vulgares,
ecologia, morfologia, distribuio
geogrfica e bibliografia relevante
para cada espcie. O sistema
apresenta vrias caractersticas que
garantem a consistncia das informaes armazenadas no banco de dados,
tais como: completa verificao dos
dados assim que introduzidos,
ferramentas para a manuteno dos
bancos de dados e referncias cruzadas, com todos os dados relacionados
s suas fontes bibliogrficas. De
particular importncia a capacidade
de exportao de quaisquer subconjuntos de dados, selecionados pelo
usurio, em vrios formatos padronizados, como DELTA (Dallwitz, 1980),
NEXUS (Maddison et al., 1997) e XDF
(White & Allkin, 1992). Isto permite aos
projetos individuais utilizarem outros
programas quando necessrio (por
exemplo, para identificao interativa
e construo de chaves taxonmicas
atravs do sistema DELTA) e
compartilhar subconjuntos selecionados de dados com outros projetos. A
capacidade de exportar dados em
vrios formatos oferece segurana e
assegura a longevidade das informaes armazenadas atravs do ALINE,
permitindo ao projetos integrantes do
Projeto Biotup o intercmbio de
informaes entre si e com outras
organizaes. Entre suas funes,
incluem-se tambm aquelas
necessrias disseminao da
informao, pois os bancos de dados

famlia

espcie

Referncias

bibliogrficas

sinnimos
nomes vulgares
usos
dicionrio
geogrfico

dist. geogrfica
habitats
notas

dicionrio de
descritores

descries
imagens

Figura 3. Tabelas relacionadas do Sistema ALINE

criados atravs do ALINE podem ser publicados como

relatrios impressos, guias eletrnicos em CD's ou como
pginas na Internet, utilizando o formato HTML.
O SISTEMA DELTA
O sistema DELTA (DEscription Language for
Taxonomy) consiste de um formato flexvel para a
codificao da informao taxonmica descritiva e um
conjunto de programas especficos para o
processamento de descries taxonmicas (Dallwitz,
1980, 1993; Askevold & O'Brien, 1994). Este sistema foi
desenvolvido na Austrlia em meados dos anos 70,
inicialmente para computadores de grande porte e
depois adaptado para microcomputadores da linha IBMPC, oferecendo uma srie de facilidades para o manejo e
a organizao da informao taxonmica. Especialmente teis so a possibilidade de construo de chaves de
identificao de diversos tipos, a produo de descries
em linguagem natural e a preparao de matrizes de
dados para anlises fenticas e cladsticas, alm da
identificao interativa e recuperao de informaes.

205

Cavalcanti

O formato DELTA aceita todos os tipos de caracteres,

tanto qualitativos (duplo estado e multiestado,
ordenados ou no ordenados) quanto quantitativos
(contnuos e descontnuos) e inclui instrues (diretivas)
para controlar o processamento dos dados pelos diversos
programas componentes do sistema. Uma vez
codificados no formato DELTA, os mesmos dados podem
ser utilizados para produzir descries e chaves de
identificao com prpositos gerais ou especficos,
omitindo parte dos caracteres, ou dando nfase a alguns
deles. Isto torna possvel a construo, a partir da
mesma base de dados, de diferentes tipos de chaves,
adequadas ao uso em laboratrio ou em campo,
especficas para a fauna ou a flora de certas localidades
ou determinados estgios do ciclo de vida dos organismos
(Stevenson et al., 2003).
Em 1988, o formato DELTA foi adotado pelo
International Working Group on Taxonomic Databases for
Plant Sciences (TDWG) como um padro internacional
para a representao e intercmbio de dados
taxonmicos descritivos. Desde ento, o sistema DELTA
j mostrou-se uma valiosa ferramenta para inventrios
sistemticos de biodiversidade (Allkin et al., 1992a;
Sharkey, 2001) e levantamentos ecolgicos de campo
para estudos de impacto ambiental (Ellis, 1988).
O sistema DELTA original composto de quatro
programas principais (Dallwitz et al., 1993; Askevold &
O'Brien, 1994): CONFOR (para converso de formatos,
produo de descries em linguagem natural e anlise
estatstica de dados), DELFOR (para ordenao, incluso
ou excluso de caracteres e seus estados), KEY (para
construo de chaves de identificao) e INTKEY (para
identificao interativa e recuperao de informaes
do banco de dados taxonmico). Alm destes, existem
programas complementares, que permitem preparar
construir matrizes de distncia fentica entre txons
(DIST) e realizar anlises de agrupamento e similaridade
(PCLASS e NSIM). Ambientes interativos para a utilizao
integrada dos vrios programas que compem o sistema
DELTA esto disponveis (Cavalcanti, 1996; Dallwitz et
al., 1999).
O programa INTKEY, para identificao interativa e
recuperao de informaes, permite ao usurio acessar
o contedo de um banco de dados taxonmico a partir de
qualquer carter e na ordem ou combinao em que
desejar, iniciando de novo tantas vezes quantas

206

necessrias at a determinao de um
txon ser confirmada (Dallwitz, 1993;
Dallwitz et al., 1995). O INTKEY
permite tambm o armazenamento de
ilustraes digitalizadas associadas s
descries dos caracteres para guiar o
usurio ao longo da chave. Vrios
bancos de dados taxonmicos tm sido
criados com o sistema DELTA,
compreendendo desde gneros de
gramneas e leguminosas at espcies
de corais, formigas e besouros
(Askevold & O'Brien, 1994). Muitos
destes bancos de dados incluem
imagens digitalizadas dos txons e
caracteres, e vrios deles esto
disponveis na Internet (www.deltainkey.com). No mbito do Projeto
Biotup, o sistema DELTA ser usado
para produzir guias de identificao
(em forma eletrnica ou como manuais
impressos) a partir de descries das
espcies. Estas descries estaro
armazenadas em bancos de dados do
sistema ALINE e, quando necessrio,
subconjuntos de dados (por exemplo,
as plantas de uso medicinal da RDS do
Tup) sero exportados do ALINE para o
formato DELTA, j prontos para a
produo dos guias. Desta forma, o
Projeto Banco de Dados do Biotup
espera contribuir para a implementao de uma metodologia prtica e
eficaz para a elaborao de guias
eletrnicos de biodiversidade (Stevenson et al., 2003), para diferentes
usurios, que permitam a pessoas
tecnicamente capacitadas, mas no
especializadas em botnica ou
zoologia, identificarem as espcies de
plantas e animais da regio.
ANLISE DE DADOS
O uso de tcnicas de anlise
multivariada em ecologia de comuni-

Bancos de dados sobre biodiversidade na Amaznia: a experincia do Projeto Biotup

dades tem se intensificado bastante

nos ltimos anos, devido, sobretudo,
grande disponibilidade dos microcomputadores e pacotes estatsticos. Estas
tcnicas permitem considerar simultaneamente os padres de variao e
covariao de um grande nmero de
atributos do sistema sob estudo,
mostrando-se muito teis na classificao e ordenao de comunidades
ecolgicas (Green, 1980; Gauch, 1982;
Digby & Kempton, 1987; Ludwig &
Reynolds, 1988; Legendre & Legendre,
1998) e possibilitando que parmetros
importantes subjacentes s relaes
entre amostras ou espcies possam ser
mais facilmente detectados e interpretados. Em vista de sua utilidade na
descrio e interpretao de dados
ecolgicos complexos, bem como na
gerao de hipteses que podem ser
testadas em campo (Green, 1980) e
inclusive no manejo e conservao de
comunidades vegetais (Cooper, 1984;
Margules, 1984; DeVelice et al., 1988),
de se esperar que a aplicao de tais
mtodos produza resultados valiosos
nos estudos ecolgicos realizados no
mbito do Projeto Biotup.
As tcnicas de classificao
permitem agrupar as amostras
("anlise normal ou do tipo Q") ou as
espcies ("anlise inversa ou do tipo
R") de acordo com seus atributos
comuns (Sneath & Sokal, 1973; Ludwig
& Reynolds, 1988; Legendre &
Legendre, 1998). As tcnicas de
ordenao, por sua vez, podem ser
usadas tanto para a classificao pelo
agrupamento de amostras ou espcies,
quanto para o arranjo das amostras ou
espcies em relao a gradientes
ambientais, com o objetivo de
detectar a variao conjunta na
composio da comunidade em funo
de fatores do ambiente (Gauch, 1982).

Para a classificao das amostras e das espcies,

sero computadas matrizes de similaridade pelo
coeficiente de distncia de Bray-Curtis (Digby &
Kempton, 1987; Ludwig & Reynolds, 1988), calculado
entre cada par de amostras (anlise normal) ou de
espcies (anlise inversa) da matriz bsica de dados.
Essas matrizes sero submetidas anlise de
agrupamentos pelo mtodo de ligao mdia noponderada (UPGMA; Sneath & Sokal, 1973), obtendo-se
dendrogramas que representam, em graus de
similaridade, as relaes entre o conjunto de amostras
ou de espcies consideradas. A distoro produzida pelos
dendrogramas ser avaliada mediante o cmputo do
coeficiente de correlao cofentica (Sneath & Sokal,
1973). Os valores deste coeficiente variam geralmente
entre 0,60 e 0,90, sendo os valores superiores a 0,80
indicadores de baixa distoro em relao matriz de
similaridade original (Sneath & Sokal, 1973). O nvel de
similaridade considerado para a delimitao dos
agrupamentos ser de 50%.
Como tcnicas de ordenao sero utilizadas a
anlise de componentes principais (Sneath & Sokal,
1973; Digby & Kempton, 1987; Ludwig & Reynolds, 1988)
e a anlise de correspondncias pelo mtodo das mdias
recprocas (Gauch, 1982; Digby & Kempton, 1987).
A anlise de componentes principais ser efetuada a
partir da matriz de covarincia no centrada (Ludwig &
Reynolds, 1988; Legendre & Legendre, 1998) entre as
espcies. Desta matriz sero extrados os autovalores e
seus autovetores associados, sendo os dados originais
combinados aos autovetores e projetados sobre os dois
primeiros eixos ortogonais resultantes. Esses eixos,
mutuamente perpendiculares e no correlacionados
entre si, explicam sucessivamente a maior parte da
variao presente nos dados originais, com um mnimo
de perda de informao.
A anlise de correspondncias pelo mtodo das
mdias recprocas ser aplicada a uma matriz de
associao de qui-quadrado, computada simultaneamente entre as espcies e as amostras, sendo os valores
resultantes ajustados em percentagens. A anlise de
correspondncias tambm uma tcnica vetorial;
porm difere da anlise de componentes principais pela
ordenao simultnea das amostras e das espcies,
permitindo destacar a correspondncia entre ambas, e
pelo uso de uma matriz de associao de qui-quadrado

207

Cavalcanti

em lugar de uma matriz de covarincia ou correlao

(Gauch, 1982).
A eficincia das anlises de ordenao efetuadas por
esses mtodos ser julgada de acordo com os seguintes
critrios: 1) facilidade de interpretao ecolgica; 2)
disperso efetiva dos pontos em contraste com sua
aglomerao em um nico grupo; 3) anulao do "efeito
de arco" uma distoro curvilinear do segundo eixo de
ordenao devida dependncia quadrtica, ou de
maior grau, deste eixo com o primeiro, e que pode afetar
seriamente o resultado de uma ordenao (Gauch, 1982;
Ludwig & Reynolds, 1988).
Todas as anlises numricas sero efetuadas atravs
dos sistemas de computao cientfica Octave (Eaton,
1997) e R (Ihaka & Gentleman, 1996), que combinam a
capacidade analtica com a visualizao grfica em
ambientes interativos versteis e flexveis. dotados de
uma linguagem de programao extensvel.
INTERCMBIO DE INFORMAO
Os maiores obstculos ao intercmbio efetivo de
informao biolgica no so tcnicos, mas resultam de
diferenas entre as opinies dos pesquisadores e as
prticas de manejo dos dados biolgicos.
A adoo de definies comuns para terminologias
biolgicas, ecolgicas e geogrficas um pr-requisito
para a comunicao genuna (Blake et al., 1994; Karp,
1993; Allkin, 1997, 1998). O Projeto Banco de Dados do
Biotup possibilitar uma troca efetiva de informao
atravs do estabelecimento e documentao da
padronizao de dados e de protocolos para o intercmbio de dados. Padres internacionalmente
aceitos (como o formato DELTA), quando existirem,
sero adotados e seguidos.
Tambm necessrios so protocolos de troca de dados
comuns a todos os projetos. No mbito do Projeto
Biotup, ser usada para intercmbio de dados a
Linguagem de Marcao Extensvel (XML), entre projetos
individuais e sistemas de software. A Linguagem de
Marcao Extensvel (XML) uma linguagem de
marcao poderosa e independente de plataforma,
crescentemente usada para representao e
intercmbio de informao na Internet (Bosak & Bray,
1999). Aplicaes que consomem e servem seus dados
em XML esto imediatamente aptas a interoperar,
mesmo que implementadas em linguagens diferentes e

208

executando em plataformas
diferentes. Muitos grupos de pesquisa
j vem usando XML para troca de
grandes volumes de informao entre
bancos de dados em instituies
cientficas que utilizam plataformas
computacionais, programas e
estruturas de dados completamente
diferentes (Cavalcanti, 2001).
Aplicaes especficas de XML tm
surgido em reas da Biologia como a
Sistemtica Biolgica (Gilmour, 2000).
Por fim, alm de seu potencial para a
definio de formatos padronizados
para o intercmbio de informao
cientfica, XML oferece ainda uma
soluo simples e flexvel para o
problema da representao de
metadados especficos do domnio de
conhecimento, de difcil suporte em
modelos de dados predefinidos
(Diederich et al., 1989; Diederich &
Milton, 1991; Michener et al., 1997;
Senso & Rosa Piero, 2003).
DISSEMINAO DA INFORMAO
Cada banco de dados criado no
mbito do Projeto Biotup ser usado
para prover uma srie de produtos de
informao e publicaes especficas,
cada qual com um contedo e formato
diferenciado, dependendo da audincia identificada.
Um dos modos mais inovadores pelo
qual o Projeto Biotup estar tornando
disponvel a informao gerada pelos
seus projetos integrantes ter lugar na
Internet. Esta forma de publicao
permitir ao Projeto Biotup alcanar
u m a a u d i n c i a m a i o r, p r o v e r
informao atualizada regularmente e
meios para buscar contribuies
diretamente, estabelecendo um
contato com a informao mais direto,
atual e interativo entre os potenciais
colaboradores e usurios dos bancos

Bancos de dados sobre biodiversidade na Amaznia: a experincia do Projeto Biotup

de dados (Green, 1994; Bisby, 2000;

Edwards et al., 2000; Stevenson et al.,
2003).
Os crditos sero, em todos os
casos, atribudos aos autores das
informaes includas nos bancos de
dados. Todas as informaes adicionadas aos bancos de dados sero,
tambm, associadas fonte original da
informao. Isto possibilitar a todos
os participantes do Projeto Biotup e
aos usurios de seus bancos de dados
conhecer no s quem foi responsvel
por uma determinada informao, mas
tambm porque esta informao foi
includa.
Ser dada prioridade publicao
de certos tipos de informao, tais
como:
1) Publicao de revises
taxonmicas e monografias de grupos
importantes de plantas e animais;
2) Elaborao de listas de espcies,
faunas e floras;
3) Produo de manuais de
identificao sobre grupos animais e
vegetais importantes, guias de campo
ilustrados e vrios outros tipos de
publicao dirigidos ao grande
pblico.
Alm disso, espera-se publicar
verses eletrnicas (em CD-ROM e na
Internet) dos diferentes bancos de
dados, regularmente atualizadas,
buscando manter um alto grau de
confiabilidade e acessibilidade da
informao.

Biotup durante os ltimos dois anos. No decorrer dos

prximos anos estes bancos de dados crescero em
termos do nmero de espcies e indivduos, aumentaro
em quantidade de conhecimento para cada espcie e
melhoraro em termos de consistncia e confiabilidade.
Os projetos de bancos de dados no consistem apenas
de dados, programas e computadores, envolvendo a
considerao e discusso de diversos aspectos
tecnolgicos, epistemolgicos, cognitivos e sociais
interrelacionados (Wersig, 1993). Para que estes
projetos sejam bem sucedidos, necessrio que sejam
organizados de maneira a serem sensveis s
necessidades, capacidades e interesses dos seus
participantes.
O Projeto Banco de Dados do Biotup pretende
estabelecer uma confederao de bancos de dados e no
um nico banco de dados monoltico, ou mesmo impor
uma estrutura de dados rgida a todos os participantes
(Fig. 4). Este modelo reconhece que cada projeto tem
seus prprios interesses locais e prioridades que
necessitam ser acomodados, ao mesmo tempo em que
tambm reconhece a necessidade de coordenar e
padronizar o manejo dos dados tanto quanto possvel.
Esta forma de organizao implica que os programas
escolhidos para utilizao por todos os projetos devero
atender a certas demandas especficas.

INPA

Rede
de
Rede de
Comunicao
Comunicao
SGBD
Distribudo
SGBD Distribudo

Peixes

ULBRA

Consideraes Finais
Vegetao

Atualmente, o Projeto Banco de

Dados do Biotup est dando os
primeiros passos para compilar e
integrar a informao obtida pelos
vrios projetos integrantes do Projeto

UCDB

Vegetao

INPA
Plncton

Figura 4. Bancos de dados distribudos do Projeto Biotup,

organizados em uma federao virtual de SGBDs baseados em
esquemas globais.

209

Cavalcanti

Um benefcio adicional da distribuio do controle da

informao que o Projeto Banco de Dados do Biotup
no ser dependente do sucesso individual de nenhum
dos projetos componentes dentro de um tempo
determinado. Nenhuma estrutura rgida ser imposta
dentro de um esquema ambicioso ou centralizado, e a
base de conhecimento do Projeto Biotup crescer
gradativamente, na medida em que forem dando
entrada os dados de alta qualidade provenientes dos
projetos participantes.
Uma ampla gama de usurios ser capaz de acessar
estes recursos de informao em vrios locais, para
diferentes propsitos. Os pesquisadores participantes
tero mais facilidades para publicao, e os usurios
tero pronto acesso a dados de qualidade atravs de
qualquer aspecto dos organismos, incluindo usos, nomes
vulgares ou sinnimos.
A abordagem do Projeto Banco de Dados do Biotup,
com respeito ao manejo da informao sobre biodiversidade, enfatiza a flexibilidade, o compartilhamento e o
controle local da informao. O modelo permite integrar
dados de alta qualidade sobre biodiversidade, com
informaes sobre uso e as propriedades relativas ao
uso, e apresentar esta informao em um formato til
para as instituies e indivduos responsveis pelo desenvolvimento sustentvel, conservao da biodiversidade
e planejamento ambiental na Amaznia.

Agradecimentos
Aos Drs. Robert Allkin (Royal Botanic Gardens, Kew),
Mike Dallwitz (CSIRO Division of Entomology, Canberra) e
Richard Pankhurst (Royal Botanic Gardens, Edinburgh)
pelo envio de publicaes; ao Prof. Paulo Roberto Duarte
Lopes (UEFS) pelas valiosas sugestes; e, em especial,
aos Drs. Eduardo Couto Dalcin (CNIP/PNE), Edinaldo
Nelson dos Santos Silva (CPBA/INPA) e Veridiana Vizoni
Scudeller (CEULM/ULBRA), pelo contnuo apoio e
incentivo.

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