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ISSN 0102-0110
Setembro, 2006
189
Documentos 189
Braslia, DF
2006
1 edio
1 impresso (2006):
M 587 Metabolmica: aplicaes e perspectivas. / Thales Lima Rocha ... [et. al.].
Braslia: Embrapa Recursos Genticos e Biotecnologia, 2006.
38 p. (Documentos / Embrapa Recursos Genticos e Biotecnologia,
0102 0110; 189)
Autores
Sumrio
As micas ................................................................................................................. 6
A Genmica............................................................................................................... 6
A Transcriptmica .................................................................................................... 9
A Protemica .......................................................................................................... 10
A Metabolmica ...................................................................................................... 11
Os metablitos........................................................................................................ 13
Metaboloma,
Metabolmica,
Metabolic
profiling
Engenharia
de
metabolismo......................................................................................................... 15
Seqncia de etapas da metabolmica ................................................................ 16
Aplicabilidade da Metabolmica ........................................................................... 21
Farmacologia .......................................................................................................... 22
Nutrio ................................................................................................................... 24
Ecologia e Evoluo............................................................................................... 25
Perspectivas para a metabolmica....................................................................... 27
Consideraes Finais ............................................................................................ 28
Referncias Bibliogrficas..................................................................................... 31
3 bilhes
30.000
Mus musculus
2,6 bilhes
30.000
Arabidopsis thaliana
100 milhes
25.000
Caenorhabditis elegans
97 milhes
19.000
Drosophila melanogaster
137 milhes
13.000
12,1 milhes
6.000
Escherichia coli
4,6 milhes
3.200
9700
Saccharomyces
cerevisiae
10
11
N de artigos publicados
200
150
100
50
0
1975 - 1994
1995 - 1999
2000
2001
2002
2003
2004
2005*
Ano
12
13
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contm uma poro acar (diferente da glicose) ligada a uma poro no-glicdica
(aglicnio), que neste caso um pigmento. Esses compostos possuem cores de
acordo com o tipo de pigmento presente na molcula, por exemplo, as flavonas so
amarelas e os flavonides antocinicos so azuis. Nas plantas atuam na colorao
dos rgos vegetais e na diferenciao celular. Por fim, os glicosdeos so
compostos que contm um acar ligado a um aglicnio, sendo esse a poro ativa
da molcula. Possuem gosto muito amargo, e so classificados de acordo com o
tipo de aglicnio. Por exemplo: glicosdeos alcolicos (o aglicnio um lcool);
glicosdeos cianognicos (liberam cido ciandrico quando hidrolisados); glicosdeos
esterides (o aglicnio um esteride); glicosdeos antraquinnicos (o aglicnio
uma antraquinona). Nos vegetais, a funo varia de acordo com a poro noglicdica (MARASCHIN e VERPOORTE, 1999; ZHANG et al., 2003).
Metaboloma, Metabolmica, Metabolic profiling e Engenharia de
metabolismo
O conjunto de todas essas pequenas molculas (metablitos primrios e
secundrios) de uma dada clula, fluido corporal ou organismo conhecido como
metaboloma (GOODACRE, 2005). Uma vez conhecida a composio do
metaboloma, pode-se prever que genes e rotas metablicas esto ativos naquele
momento na clula (GOODACRE, 2005; ROBERTSON, 2005).
O interesse em se conhecer melhor os metablitos (primrios ou
secundrios), assim como suas vias de sntese e a regulao das mesmas tem
crescido muito nos ltimos anos (ROCHFORT, 2005). Dessa forma, a Metabolmica,
ou Metabonmica, j figura entre as grandes plataformas tecnolgicas para o estudo
de sistemas biolgicos, como a Genmica, Transcriptmica e Protemica
(BINNECK, 2004). Os dois termos (Metabolmica e Metabonmica) esto corretos.
O que os diferencia so apenas as suas origens etimolgicas (ROBERTSON, 2005).
Para todos os fins, nesse trabalho ser utilizado somente o termo Metabolmica.
A metabolmica tem como objetivo isolar e caracterizar todos os metablitos
de uma dada amostra biolgica em condies normais e sob algum tipo de estresse
(ROCHFORT, 2005; WECKWERTH e MORGENTHAL, 2005). Mesmo utilizando as
mesmas tcnicas, ela se difere da anlise de perfil metablico (Metabolic profiling),
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evitar grandes variaes experimentais, a mesma quantidade da amostra, avaliandose o peso seco do mesmo tipo de rgo deve ser coletada. E tudo isto deve ser feito
no mesmo horrio (ROBERTSON, 2005). O processo de extrao o ponto mais
crtico. A macerao, quando necessria, deve ser realizada obedecendo a
rigorosos padres (FIEHN, 2002; FUKUSAKI e KOBAYASHI, 2005). Se a anlise for
feita com biofluidos, essa etapa mais simples. No entanto, esse um tipo de
amostra muito sensvel s variaes citadas anteriormente, exigindo bastante
cuidado dos responsveis por essa etapa (ROBERTSON, 2005; ROCHFORT,
2005).
Muitas das amostras, antes de serem analisadas, necessitam de um prfracionamento. Isso vai depender, principalmente, dos equipamentos a serem
utilizados no fracionamento (FIEHN, 2002; FUKUSAKI e KOBAYASHI, 2005;
ROBERTSON, 2005; ROCHFORT, 2005; WECKWERTH e MORGENTHAL, 2005;).
Esse pr-fracionamento serve para agrupar os compostos presentes na amostra de
acordo com suas caractersticas moleculares utilizando diferentes solventes (WANT
et al., 2006). Dessa forma, pode-se definir qual ferramenta ser utilizada (FUKUSAKI
e KOBAYASHI, 2005; ROBERTSON, 2005; WECKWERTH e MORGENTHAL,
2005). O ponto mais crtico desse pr-fracionamento a escolha do solvente usado
para a separao (FUKUSAKI e KOBAYASHI, 2005). Deve-se prestar muita ateno
nas possveis interferncias que esse solvente pode causar nos equipamentos de
anlise, assim como nas possveis reaes indesejadas que podem ocorrer entre o
solvente e a amostra, produzindo novos compostos (ROBERTSON et al., 2000;
BECKWITH-HALL et al., 2002; ROBERTSON, 2005; WANT et al., 2006).
Outras consideraes devem ser feitas acerca da utilizao da metabolmica
no que tange estudos com animais (ROBERTSON et al., 2002). Uma vez que essa
tecnologia extremamente sensvel, variaes fisiolgicas ou ambientais que o
animal pode sofrer durante o teste sero detectadas e podem mascarar os
resultados. Por exemplo, uma diferena de apenas quatro semanas na idade pode
resultar em uma notria discrepncia no perfil metablico de ratos (ROBERTSON et
al., 2000).
O fracionamento da amostra a etapa mais importante da metabolmica
(FIEHN, 2002; GERMAN et al., 2005). Embora qualquer ferramenta que permita
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Escolha do organismo
Fracionamento
Converso de
Preparo da
amostra
Prfracionamento
Anlise estatstica
Farmacologia
A metabolmica tem uma gama de aplicaes na rea farmacutica (figura 3),
tendo grande destaque as pesquisas para seleo de frmacos efetivos e seguros, a
identificao de marcadores biolgicos de toxicidade e doenas e o entendimento
dos mecanismos de toxicidade (ROBERTSON, 2005).
Na seleo de frmacos efetivos e seguros, tem-se utilizado bastante os
ensaios in vitro. Isso porque este tipo de ensaio mais rpido e mais fcil de ser
executado. Entretanto, por mais que se use no ensaio clulas do mesmo tecido onde
o frmaco ir atuar, essas linhagens celulares cultivadas no respondem da mesma
maneira do que as clulas que esto no organismo. Com isso, muitos dos frmacos
bem sucedidos nos ensaios in vitro acabam por fracassar nos ensaios in vivo por
provocarem efeitos colaterais indesejados, no observados anteriormente
(ROBERTSON, 2005).
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Seleo
Ensaios de toxicidade in
vitro e in vivo
Sntese
Industrializao
Busca de marcadores
de toxicidade
Mecanismos de
toxicidade
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Nutrientes
Macro-nutrientes
No-nutrientes
Micro-nutrientes
Contaminantes
Insumos agrcolas
Fitoqumicos
Defensivos
Figura 4: Esquema da diviso dos compostos oriundos dos alimentos em nutrientes e nonutrientes, assim como suas respectivas subdivises. (Adaptado de GIBNEY et al., 2005).
Ecologia e Evoluo
Outro campo de notria aplicabilidade da metabolmica a ecologia
(ROBERTSON, 2005; ROCHFORT, 2005). A utilizao dessa plataforma nos
estudos com vegetais tem sido constante nos ltimos anos (FIEHN et al., 2000;
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Consideraes Finais
O desenvolvimento destas plataformas tecnolgicas conhecidas como
micas tem trazido uma srie de conhecimentos para a cincia. Sem dvida, a
genmica a mais desenvolvida. Isso porque ela j tem protocolos determinados e
ferramentas de fracionamento e anlise dos resultados bem desenvolvidos.
Entretanto, ainda h muito que se descobrir e melhorar na genmica (BINNECK,
2004).
Contudo, muitas das reaes e interaes que definem um processo
biolgico, a diferenciao de um organismo ou mesmo a interao entre vrios seres
est fora da esfera genmica (GOODACRE, 2005; HTTENHOFER e VOGEL,
2006). Por isto que existe a necessidade de se desenvolver as outras plataformas
(HTTENHOFER e VOGEL, 2006; BINNECK, 2004).
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