CFX96 ™ y CFX384 ™ en Tiempo Real

CFX96 y CFX384 en
tiempo real
Sistemas de deteccin de
PCR
Manual de instrucciones
Catlogo # 184-5384
# 185-5384
# 184-5096
# 185-5096
Copyright 2008 Bio-Rad reproduccin Laboratories, Inc., en cualquier

forma, ya sea impreso o electrnico, es sin previa autorizacin escrita de
Bio-Rad Laboratories, Inc.
Adobe y Reader son marcas comerciales de Adobe SystemsIncorporated. Cy
es una marca comercial de GE Healthcare empresas del grupo. Fluor y
Quasar son marcas comerciales de Biosearch Tecnologas de SYBR, Inc. y
Texas Red son marcas registradas de Invitrogen Corporation. Bio-Rad
Laboratories, Inc. est autorizada por Invitrogen Corporacin para vender
reactivos que contienen SYBR Green I para su uso en PCR en tiempo real,
para fines de investigacin solamente. Otras marcas o nombres de
productos son marcas comerciales de sus respectivos propietarios.
LICENCIA DE AVISO AL COMPRADOR

Bio-Rad en tiempo real termociclador CFX96 o CFX384 es licenciado en
tiempo real termociclador (s) bajo los Applera de Patente No. 6.814.934
Estados B1 para su uso en la investigacin y para todos los campos excepto
los campos del diagnstico y humanos diagnsticos veterinarios.
Este CFX96 o CFX384 Mdulo de deteccin, cuando se combina con un
termociclador C1000 para los que el tiempo real de aplicacin tarifa trmica
de regalas ciclador se ha pagado, constituye un termociclador en tiempo
real con licencia bajo la patente de EE.UU.
No. 6.814.934 reclamaciones y cualquier patente correspondiente en su
homlogo canadiense propiedad de Applera Corporation, para el uso
exclusivo en investigacin y todos los campos de aplicacin, salvo humano y
veterinario en el diagnstico in vitro. Estos derechos de licencia slo son
eficaces si el mdulo de deteccin se combina con un termociclador Bio-Rad
trmica para que el tiempo real de aplicacin tarifa trmica de regalas
ciclador se ha pagado y no con cualquier otro termociclador. Los derechos
no se transmiten expresamente, no por implicacin o de impedimento de las
patentes sobre mtodos en tiempo real, incluyendo pero sin limitarse a 5
'nucleasa ensayos, o de cualquier patente que reivindique una o kit de
reactivos. Para ms informacin sobre la compra de derechos de licencia,
pngase en contacto con el Director de Licencias de AppliedBiosystems, 850
Lincoln Centre Drive, Foster City, California, 94404, EE.UU.
Este producto est cubierto por una o ms de las siguientes patentes de
EE.UU., sus contrapartes extranjeras, o de sus extranjeros patentes
pendientes, propiedad de Eppendorf AG: Patente de EE.UU. N 6.767, 512 y
7074367.
Bio-Rad Recursos
La Tabla 1 enumera otras Bio-Rad recursos y la forma de localizar lo que
necesita:
Tabla 1. Bio-Rad recursos

Recurso
Local Bio-Rad
Laboratories
representantes
Notas tcnicas y la
literatura
Especialistas tcnicos
Cmo ponerse en contacto

Encontrar informacin local y los contactos en el sitio
web de Bio-Rad
mediante la seleccin de su pas en la pgina principal
(www.bio-rad.com). Buscarla oficina ms cercana
internacionales
que aparece en la parte posterior de este manual
Ir ala pgina web de Bio-Rad (www.bio-rad.com) o Gene
Expresin Gateway (www.bio-rad.com/genomics/).
Escriba un
trmino de bsqueda en el cuadro Buscar y seleccionar
informacin para encontrar
enlaces alas notas tcnicas, manuales y otra literatura
Departamento de soporte tcnico de Bio-Rad est
dotada con cientficos con experiencia para ofrecer a los
clientes con la prctica y soluciones expertas
Para encontrar soporte tcnico local en el telfono,
pngase en contacto
ms cercana oficina de Bio-Rad. Para obtener asistencia
tcnica en los Estados Unidos
Estados Unidos y Canad, llame al 1-800-424-6723
(nmero gratuito),
y seleccione la opcin de soporte tcnico
Convenciones de Escritura Utilizadas en

Este Manual
Este manual utiliza las convenciones de la escritura en la Tabla 2.
Tabla 2. Convenciones utilizadas en este manual
Convenci
n
Significado
SUGERENCI
A:
Se proporciona informacin til e instrucciones, incluida la

informacin que se explican con ms detalle en otras partes
de este manual.
NOTA:
Se proporciona informacin importante, incluyendo la

informacin se explica en mayor detalle en otras partes de
este manual
ADVERTEN
CIA!
Explica una informacin muy importante acerca de algo que

podra
daar el investigador, el dao de un instrumento, o causar
la prdida de datos.
Seleccionar X y Y a continuacin, seleccione desde la

ventana de la barra de herramientas, mens o software.
> Y
Para obtener informacin sobre las etiquetas de seguridad utilizados en este

manual y en el sistema o el sistema de CFX96 CFX384, vase, "La seguridad
y el cumplimiento de normativas" en la pgina iii.
Seguridad y Cumplimiento Normativo

Para un funcionamiento seguro del sistema o el sistema de CFX96 CFX384,
le recomendamos que siga las especificaciones de seguridad que figuran en
esta seccin ya lo largo de este manual.
Etiquetas de Advertencia de Seguridad

Las etiquetas de aviso en el instrumento y en este manual le advertir sobre
las fuentes de lesin o dao.
Consulte la tabla 3 para revisar el significado de cada etiqueta de
advertencia de seguridad.
Tabla 3. Significado de las etiquetas de advertencia de seguridad
PRECAUCIN: Riesgo depeligro!Este smboloidentifica los
componentesque presentan unriesgo de lesiones personales
lesiones odaos en el instrumento, si no se maneja
adecuadamente. Dondequiera queaparece este smbolo,
consulte el manualpara obtener ms informacinantes de
proceder
PRECAUCIN: Superficie caliente!Este smboloidentifica los
componentesque presentan unriesgo de lesiones
personaleslesionespor exceso de calorsi no se maneja
Advertencias instrumento de seguridad

Las etiquetas de advertencia que se muestra en la Tabla 4 muestran
tambin en el instrumento, y se refieren directamente al uso seguro de el
sistema o el sistema de CFX96 CFX384.
Tabla 4. Instrumento etiquetas de advertencia de seguridad
Icono
Significado
Advertencia sobre el riesgo de dao al cuerpo o del equipo.

Funcionamiento de la CFX96 o CFX384 sistema en tiempo real la
deteccin por PCR
antes de leer este
manual puede constituir un peligro de lesiones personales.
Para un uso seguro, no utilice este instrumento de alguna manera
no especificada en este manual. Slo el personal de laboratorio
cualificado formado en el uso seguro de los equipos elctricos
deben utilizar este instrumento. Siempre maneje todos los
componentes del sistema con cuidado y con manos limpias y
secas
Advertencia sobre el riesgo de quemarse.
Un termociclador genera suficiente calor para causar quemaduras
graves. Utilizar gafas de seguridad proteccin para los ojos en
todo momento durante la operacin. Siempre deje que el bloque
de la muestra para volver a temperatura de inactividad antes de
abrir la tapa y extraer las muestras. Siempre permiten elmximo
autorizacin para evitar quemaduras accidentales piel
Advertencia sobre el riesgo de explosin.
Los bloques de la muestra puede calentarse lo suficiente durante
el curso de la operacin normal de la causa
lquidos en ebullicin y explotar
NOTA: Para obtener informacin acerca de la C1000 termociclador, se
refieren a la cicladora C1000 trmica manual de instrucciones.
Especificaciones del Uso Seguro y

Cumplimiento
Tabla 5 se enumeran las especificaciones de uso seguro para el sistema o el
sistema de CFX96 CFX384. Cables blindados (Suministrado) debe ser
utilizado con este dispositivo para asegurar el cumplimiento de los lmites
de Clase A de la FCC.
Tabla 5. Especificaciones de Uso Seguro
Requisitos deUso
Seguro
especificaciones
Temperatu
ra
Temperatura ambiente de15-31oC. humedad relativa

del aire
mximo del 80%sin condensacin
Hasta 2.000metros sobre elnivel del mar
altitud
Uso en
interior
es
CUMPLIMIENTO DE LA NORMATIVA
Este instrumento ha sido probado, y se encontr que de acuerdo con todos
los requisitos aplicables de la siguientes normas de seguridad y

electromagnticas:
IEC 61010-1:2001 (2 ed.), EN61010-1: 2001 (2 Ed.). Equipos elctricos
para
Use la medicin, control y de laboratorio - Parte 1: Requisitos generales
IEC 61010-2-010:2005, EN61010-2-010: 2003. Requisitos de seguridad
para equipos elctricos
de medida, control y uso en laboratorio. Parte 2-010: Requisitos particulares
para
equipos de laboratorio para el calentamiento de materiales
IEC 61010-2-081:2001 + A1, EN61010-2-081: 2002 + A1. Requisitos de
seguridad de
equipos de medida, control y uso en laboratorio. Parte 2-081: Requisitos
particulares
para equipos de laboratorio automticos y semiautomticos para anlisis y
otros fines
(Incluye Enmienda 1)
EN 61326-1:2006 (Clase A) Equipos elctricos para medida, control y
laboratorio
uso. Requisitos de compatibilidad electromagntica, Parte 1: Requisitos
generales
Este equipo genera, utiliza y puede, si no irradiar energa de radiofrecuencia
y, se instala y utiliza
acuerdo con el manual de instrucciones, puede causar interferencias
perjudiciales a las comunicaciones por radio.
El funcionamiento de este equipo en una zona residencial puede causar
interferencias perjudiciales, en cuyo caso el
usuario deber corregir la interferencia a sus propias expensas.
Requisitos de especificaciones de uso seguro
Temperatura de la temperatura para uso en interiores ambiente de 15-31oC.
Humedad relativa del aire
mximo del 80% sin condensacin
Altitud de hasta 2.000 metros sobre el nivel del mar
CFX96 y CFX384 Manual de Sistemas
Tabla de contenidos
Bio-Rad recursos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . ii
Escritura utilizados en este manual.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . ii
Seguridad y Cumplimiento Normativo.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . iii
Captulo 1.El sistema de instalacin. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . .. 1
Desembalaje del mdulo de reaccin ptica.
................................1
Requisitos del sistema.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
Descripcin general del sistema.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 2
Configuracin del sistema.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 3
Instalacin del software CFX Manager.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... 6
Llevar a cabo experimentos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
........... .9
Captulo 2.Introduccin al Software Manager CFX. . . . . . . . . . . . . .
.. . . . . .. . . . 11
Ventana principal del software. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 11
Asistente de inicio.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
Los instrumentos detectaron panel.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 16
Propiedades de instrumento de la ventana.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
Los archivos de software.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
Consejos y trucos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 20
Captulo 3. Llevar a cabo experimentos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 21
Experimento ventana de configuracin.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 21
Protocolo Tab.
.......................................................
. 22
Placa Tab. .
........................................................
. . . 23
Inicio Ejecutar Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Abra la ventana de detalles.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 25
Instrumento ventana de resumen.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 28
Captulo 4.Protocolos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . .. . 31
Protocolo de ventana del editor.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 31
Protocolo de Control Editor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 33
Modo de control de temperatura.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 37
Protocolo AutoWriter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 37
Tabla de contenidos
VI
Captulo 5.Placas.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Placa ventana del editor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 41
Seleccione Ventana fluorforos.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 45
Configuracin del experimento de la ventana. . . . . . . . . . . . . . . . . .. . .
. . . . . . . . . . 48
Bueno Grupos gestor de ventanas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . ... . . 50
Hoja de clculo Plate la ventana de visualizacin. . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 51
Captulo 6.Funcionamiento autnomo.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..53
Panel de control.
.................................................... ..
53
Men Principal.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..
54
Montaje del ensayo.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
Exportacin de datos para el anlisis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . .. . . . 61
Creacin de un archivo de datos.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
Configurar el correo electrnico. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . .. . . . . 65
Captulo 7.Anlisis de Datos Descripcin. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . .. 69
Datos de la ventana de anlisis.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Anlisis de los datos de la barra de mens.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Cuantificacin Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Configuracin de anlisis de datos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 73
Selectores de bien.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . .75
Grficos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 78
Hojas de clculo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 79
Captulo 8.Anlisis de datos de Windows. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . .. . . 81
Cuantificacin Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
Los datos de cuantificacin Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Derretir Tab curva. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 87
Derrita la curva de la ficha de datos.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . 89
Punto Final Tab. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 91
Distincin del allica.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
QCTab. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 95
Informes de los archivos de datos.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 97
Captulo 9. Anlisis de expresin gnica.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
De la expresin gnica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . .101
Placa de instalacin de anlisis de expresin gnica. . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 102
Gene Expresin Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
Configuracin del experimento de la ventana.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . 107
Estudio de genes.
......................................................
109
Estudio de genes de datos de hoja de clculo. . . . . . . . . . . . . . . . . . .. .
. . . . . . . . . . . 112
Estudio de genes Informe de la ventana.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
Preguntas Frecuentes.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Los clculos de la expresin gnica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 115
VII
Captulo 10. Los usuarios y las preferencias.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121
Entrar o seleccione un usuario. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 121
Preferencias de usuario de la ventana. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . .. . . . . 122
Email Tab. . .
........................................................
. . . 123
Ficha Archivos.
........................................................
. 124
Protocolo Tab.
........................................................
. 124
Placa Tab. . .
................................................... ....
. . . . 125
Anlisis de datos Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
Gene Expresin Tab.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
QCTab. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 128
Administracin de usuarios.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129
Captulo 11. Los recursos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 131
Mago de la calibracin. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . .131
Instrumento de mantenimiento.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
Solicitud de registro.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Herramientas de ayuda del software.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 135
Solucin de problemas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . .. . . . . . 136
Instrumentos, piezas y accesorios.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 138
Referencias. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . .. 139
ndice. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 141
Tabla de contenidos
viii

1 Un sistema de instalacin
Lea este captulo para obtener informacin sobre la configuracin

del sistema o CFX96 CFX384:
Desembalaje del mdulo de reaccin ptica (abajo)

Los requisitos del sistema (pgina 1)
Vista general del sistema (pgina 2)
Configuracin del sistema (pgina 3)
Instalacin de software CFX Manager (pgina 6)
Ejecucin de experimentos (pgina 9)
Desembalaje del mdulo de reaccin ptica

Su CFX96 o CFX384 envo ptico mdulo de reaccin incluye los
siguientes componentes:
Mdulo de reaccin ptica
Cable USB
CFXManagerTM CD de instalacin de software
Manual de instrucciones
Gerente de software CFXuick guas para la instalacin del sistema, el
protocolo, la placa, los datos
anlisis y anlisis de expresin gentica
Retire todos los materiales de embalaje y almacenamiento para uso futuro.
Si falta algn elemento o daado, pngase en contacto con su oficina local
de Bio-Rad oficina.
Requisitos del sistema

Para operar el sistema CFX96 o CFX384, utilice la siguientes fuentes de
alimentacin y cables:
Potencia de entrada. 100-240 VAC, 50-60 Hz
Para uso en interiores. Temperatura ambiente de 15-31oC. Mximo de
humedad relativa del 80%
(Sin condensacin)
Cable USB. Si el sistema CFX96 va a ser controlado por una computadora
mediante un cable USB
cable, el cable que viene de la empresa Bio-Rad es lo suficientemente
blindado para su uso.
NOTA: Para obtener una lis
ta completa de los requisitos de seguridad y el cumplimiento de este
instrumento,
consulte la seccin "Cumplimiento de normativas y seguridad" en la pgina
iii.
El sistema de instalacin
2 Descripcin general del sistema
El sistema CFX96 o sistema CFX384 incluye dos componentes:

El mdulo de reaccin ptica. Este mdulo incluye un sistema ptico para
recoger fluorescentes
de datos y un bloque termociclador
NOTA: El nmero de serie del mdulo de CFX96 o CFX384 se encuentra en la
parte posterior.
Base de C1000Tm termociclador. La base C1000 incluye una interfaz de
usuario para controlar el
sistema cuando se ejecutan en modo stand-alone y el botn de encendido y
los puertos (tanto
en el panel trasero)
para conectar a un
ordenador
Indicador LED
Boton de apertura
Del panel frontal
Figura 1. Vista
frontal del sistema
CFX96.
Cuando est abierto, el sistema CFX96 o CFX384 incluye las caractersticas
que se muestran en la Figura 2.
Tapa interna con placa de calefaccin
Bloque
botn de cierre
Figura 2. Vista interior del sistema CFX96.

ADVERTENCIA! Evite tocar la tapa interior o bloque: Estas superficies
pueden estar calientes.
CFX96 y CFX384 Manual de Sistemas 3

Tapa interior con placa de calefaccin. La tapa del calentador
mantiene la temperatura en la parte superior de la
de consumo para evitar la evaporacin de la muestra. Evite tocar o
contaminantes de otro modo
la placa de calefaccin. Nunca introduzca nada en los agujeros, el sistema
de transporte ptico podra
daarse
Bloquear. Cargar las muestras en este bloque antes de la carrera
El botn Cerrar. Pulse este botn en el interior de la tapa para cerrar la
tapa del motor
ADVERTENCIA! Evitar la contaminacin de los instrumentos por los
derrames, y nunca ejecutar un
reaccin con una tapa de la muestra o abre. Para obtener ms informacin
acerca de la limpieza en general
y el mantenimiento del aparato, consulte "Mantenimiento del instrumento"
(pgina 133).
El panel trasero del chasis C1000 incluye las siguientes caractersticas
(Figura 3):
El interruptor de encendido. Pulse el botn de encendido para
encender la alimentacin del sistema
Potencia de entrada. Conecte el cable de alimentacin aqu
Puerto Ethernet. Conecte un cable Ethernet para correo electrnico los
registros y ejecutar archivos independientes de datos
Conexiones USB. Utilizar estos puertos para conectar el sistema o el
sistema de CFX96 CFX384 a un ordenador o para conectar un termociclador
S1000Tm
El interruptor de encendido. Potencia de entrada.
Puerto Ethernet
Conexiones USB.
Figura 3. Panel trasero de C1000 termociclador.
ADVERTENCIA! Evite el contacto con el panel posterior de la C1000

durante la operacin.
Configuracin del sistema

El CFX96 o CFX384 en tiempo real sistema de deteccin de PCR se deben
instalar en un lugar limpio, seco, nivel de la superficie con suficiente flujo de
aire fresco para funcionar correctamente. El sistema CFX96 o sistema
CFX384 se puede ejecutar en dos modos: autnomo o controlado por
software. Si est ejecutando el sistema en el modo controlado por software,
asegrese de que hay espacio suficiente para un equipo durante de
configuracin.
Para insertar el mdulo o CFX96 CFX384 reaccin ptica en el
compartimento del mdulo de reaccin el chasis C1000, siga estas
instrucciones:
1. Coloque el chasis C1000 en un lugar adecuado con la barra de bloqueo
hacia abajo. Eliminar cualquier previamente instalado mdulos de reaccin.
Alimentacin
interruptor de entrada de conexiones USB
Ethernet
puerto
2. Levante el mdulo de reaccin ptica utilizando los guiones manejar por
encima de las rejillas de aire laterales
(Figura 4).
Figura 4. Levantar el mdulo de reaccin ptica en el chasis C1000.

3. Coloque el mdulo en el compartimento modular la reaccin de la C1000
chasis, dejando alrededor de 2 cm de espacio en la parte delantera. Cuando
en la baha del chasis, el mdulo ptico se debe cubrir el Bio-Rad logotipo

en frente de la baha del chasis C1000.
4. Y alcance y tire hacia arriba el pestillo de la C1000 hasta que est
alineada con los lados del compartimento para mdulos. Esta accin se
traslada el mdulo hacia adelante, de bloqueo en su lugar (Figura 5)
Figura 5. El bloqueo del mdulo ptico en su lugar.

5. Compruebe que el mdulo est completamente
uniformemente en la base de C1000. Como se muestra en
asentado
comprobar
espacio
comprobar
espacio
comprobar
espacio
Figura 6, marque el espacio que rodea la parte inferior del mdulo.

No debe haber ningn extra
el espacio entre el mdulo y la base, el espacio debe ser uniforme.
Figura 6. Compruebe que incluso el espacio entre el mdulo y base.
NOTA: Si el espacio entre el mdulo y la base de C1000 es desigual, vuelva

a instalar el
mdulo a partir del Paso 2 (pgina 4).
6. Conecte el cable de alimentacin en la parte posterior de la base de
C1000 (Figura 3 en la pgina 3), y en unadecuada triple toma de corriente
elctrica.
7. Pulse el botn de encendido en el panel posterior del termociclador
C1000 para iniciar el
del sistema.
8. Siga las instrucciones en el panel frontal C1000 para quitar el tornillo de
envo de color rojo
la tapa del calentador interno (Figura 7). Gire el tornillo hacia la izquierda
para salir del agujero.
Figura 7. Instrucciones para retirar el tornillo de envo.

NOTA: Si el tornillo de envo no se elimina en este paso, ser detectado por
CFX
Gerente de software. Siga las instrucciones en el software para quitar el
tornillo
(Pgina 19).
CONSEJO: El tornillo de transporte debe estar en su lugar cuando el mdulo
se suministra. Guardar este tornillo en un lugar seguro para el envo futuro.
9. Retire la placa de envo desde el bloque termociclador para operar.
Instalacin
Administrador
del
software
de
de
CFX
Software CFX Manager es ejecutado en un ordenador PC, ya sea con el

Windows XP o Windows Vista sistema operativo y es necesario para analizar
datos en tiempo real PCR del sistema o CFX96 CFX384 sistema. Este
software tambin se puede utilizar para controlar el sistema CFX96 o
CFX384 sistema en el software de modo controlado. La Tabla 6 enumera los
requisitos del sistema para el software en Windows XP y Windows Vista.
Sistema
sistema operativo
Conducir
Disco Duro
Velocidad del
procesador
RAM
resolucin de la
pantalla
USB
navegador de
Internet
Software
Mnimo
Windows XP ProfessionalSP2y
Windows XP ProfessionalSP2y
Por encima oWindows Vista
Home
Premium ypor encima de
CD-ROM
10GB
2.0 GHz
Recomendado
por encima o Windows
Vista Home
Premium ypor encima de
1GB RAM (2 GB de Windows

Vista)
1024 x 768concolor
verdaderomodo de
USB2.0 Hi-Speed
Internet Explorer
2 GB RAM
CD-ROM
20GB
2.0 GHz
1280 x 1024concolor
verdaderomodo de
USB2.0 Hi-Speed
Internet Explorer
Microsoft Office Suite
NOTA: La ejecucin de un sistema CFX96 CFX384 o con el software de

Administrador de CFX en un PC computadora con un sistemas operativos
Windows de 64 bits no es compatible debido a la incompatibles de los
controladores USB. Un PC con un procesador de 64 bits (como Intel) en un
de 32 bits del sistema operativo Windows es compatible.
Para instalar el software CFX Manager:
1. El software debe estar instalado en la computadora de un usuario con

privilegios administrativos. Asegrese de que est conectado con
privilegios administrativos.
2. Coloque el Administrador de CFX CD de software en la unidad de CD del
ordenador.
Tabla 6. Requisitos del equipo de software de gestin CFX
3. La pgina de inicio de software debera aparecer automticamente. Haga
doble clic en Instalar software en la pgina de inicio del software (Figura 8).
CONSEJO: Haga clic en el botn de la documentacin para obtener copias en
PDF de la bsqueda manuales del instrumento y otra documentacin.
4. Siga las instrucciones en pantalla para completar la instalacin. Cuando
se haya completado, el Bio-Rad CFX icono de software de gestin van a
aparecer en el escritorio de la computadora.
5. Si la pgina de inicio no aparece automticamente, haga doble clic en (la
unidad de CD): \ Bio-Rad CFX, a continuacin, abra y siga las instrucciones
en el archivo Readme.txt. Consulte
Figura 8. Software pantalla de instalacin.

"Instalacin del Software de forma manual "en la pgina 136.
Instalacin de los controladores Si el sistema o el sistema de CFX96 CFX384
se va a ejecutar en el software de modo controlado, los conductores deben
estar instalados en el ordenador. Utilice slo el cable USB suministrado, lo
cual es suficientemente protegidos para evitar la prdida de datos.
Para instalar los controladores del sistema:
1. Conectar el chasis C1000 al ordenador conectando un cable USB al
puerto USB 2.0 A
puerto situado en la parte posterior del chasis (Figura 3 en la pgina 3), y
luego conectar el
cable en el puerto USB 2.0 B ubicado en el equipo.
2. Si an no est activada, a su vez en el sistema utilizando el interruptor de
encendido en la parte posterior de la
el chasis C1000. Siga las instrucciones del Asistente para nuevo hardware
encontrado que
pone en marcha despus de que el instrumento se detect por primera vez
por el ordenador.
3. En la primera pantalla, seleccione S, esta vez slo para indicar al sistema
operativo Windows para conectarse a Windows Update para buscar software
(Figura 9). Haga clic en
Figura 9. Asistente para hardware nuevo.

4. Instruir al asistente para "Instalar automticamente el software." Haga
clic en Siguiente para continuar instalacin de los controladores (Figura 10).
Figura 10. Software (driver) de instalacin de la pantalla.

5. Haga clic en Finalizar en la pantalla del software de completar la instalacin cuando los controladores
estn instalados.
Los experimentos en ejecucin
Recomendada de consumo de plstico

Ejecutar slo 384 y placas en el sistema de CFX384. Para obtener resultados
ptimos, Bio-Rad recomienda la siguientes consumibles para el sistema de
CFX384 (nmeros de catlogo se proporcionan en negrita):
HSP-3805. De bajo perfil de 384 pozos de tapa dura placas con claros
shell y pozos blancos
HSP-3866. De bajo perfil de 384 pozos de placas duras de color negro
concha blanca y pozos
MSB-1001. Sellos adhesivos 'B' Microseal, pticamente transparente
El sistema CFX96 acepta placas de bajo perfil 0.2 ml y tubos. Para obtener
resultados ptimos, BioRad recomienda el consumo siguientes:
MLL-9601. De perfil bajo placas de 96 pozos unskirted con pozos claro
MLL-9651. De perfil bajo placas de 96 pozos unskirted con blanco pozos
HSP-9601. Hard-Shell placas de 96 pozos bordeado con cscara blanca y
pozos claros
HSP-9655. Hard-Shell de 96 y placas de concha blanca bordeada de blanco
y los pozos
TLS-0801. De bajo perfil de 0,2 ml tiras de 8 tubos sin tapas, pozos claro
TLS-0851. De bajo perfil de 0,2 ml tiras de 8 tubos sin tapas, blanco pozos
TCS-0803. ptica plana de 8 cap tiras, para tubos de 0,2 ml y placas

MSB-1001. Sellos adhesivos 'B' Microseal, pticamente transparente
Carga del Bloque
Para cargar sus reacciones en el bloque, siga estas sugerencias:
Haga clic en el botn Abrir la tapa situada en la pestaa Inicio, Ejecutar
software (vea "Iniciar TabRun" en la pgina 24), o pulse el botn tapa en la
parte frontal del sistema (Figura 1) para iniciar
abrir la tapa del motor.
asA10
(180 de rotacin)
asH3
(correcta)
ADVERTENCIA! La tapa se mueve lentamente al principio, y luego aumenta

la velocidad cuando se abre o se cierra.
Coloque el micro de 0,2 ml o tiras de tubos con tapas selladas en el
bloque. Compruebe que
los tubos estn completamente sellados para evitar fugas. Para muestra
ptimo de carga los resultados volmenes de 10-25 l para el sistema y los
volmenes de carga CFX96 muestra de 5.20 l para los el sistema CFX384.
NOTA: Para el anlisis de datos precisos, compruebe que la orientacin de

las reacciones en el
bloque es exactamente lo mismo que la orientacin de los contenidos y en
el software
Lengeta de la placa (ver "lengeta de la placa" en la pgina 23). Si es
necesario, editar el contenido antes de, durante o despus de la carrera.
Como se muestra en la Figura 11 en la pgina 10, la rotacin de la
microplacapor 180 o el programa se queda esperar que la lectura y H3 de
ser un vaco A10 as.
Figura 11. Placa de la ventana Editor mostrando orientacin de la placa.
ADVERTENCIA!Cuando se ejecuta el sistema CFX96, siempre equilibrar las
tiras de tubo o de corte
microplacas en los pozos (Figura 12). Por ejemplo, si ejecuta una tira en el
tubo
lado izquierdo del bloque, ejecute una tira de tubo de vaco (con
maysculas) en el lado derecho de la bloque para equilibrar la presin
ejercida por la tapa trmica.
Tubo de llenado tira

Tubo de la tira para
balance
Figura 12. Balance de las tiras de tubo o de corte microplacas en el bloque.
ADVERTENCIA!Asegrese de que nada est bloqueando la tapa cuando se
cierra. A pesar de que
es un mecanismo de seguridad para evitar que la tapa se cierre si se
detecta una obstruccin, se
No coloque nada en el camino de la tapa de cierre.
11
2 Introduccin al Administrador de
CFX Software
Lea este captulo para obtener informacin sobre cmo empezar con el
software de Administrador de CFX.

ventana principal del software (continuacin)
Asistente de inicio (pgina 15)
Detectado Instrumentos panel (pgina 16)
Propiedades de la ventana del instrumento (pgina 18)
Los archivos de software (pgina 20)
Consejos y trucos (pgina 20)
Ventana principal del software

Para obtener instrucciones sobre la ejecucin del sistema, se refieren a uno
de los software de gestin rpida CFXguas que se suministra con el
sistema:
Gua de instalacin rpida
Protocolo Gua rpida
Placa de gua rpida
Anlisis de Datos Gua rpida
Anlisis de la expresin gnica Gua rpida
Sugerencia: Vea el programa de ayuda para obtener guas acerca de los
experimentos en marcha.
Comience en la ventana principal del software mediante el uso de estas
caractersticas (Figura 13):
Barra de estado. Ver el software actual y el estado del instrumento (pgina
12)
Barra de mens. Seleccionar los comandos del software (pgina 12), como
la creacin o apertura de archivos
Botones de la barra de herramientas. Haga clic en estos botones (pgina
14) para abrir los archivos de software, el inicio Asistente (pgina 18), la
ventana Configuracin del experimento (pgina 21)
Detectado panel de instrumentos. Ver una lista de los instrumentos
conectados (pgina 15)
2 Introduccin al Software Manager CFX

ventana del asistente de inicio. Comandos de software de acceso comn
(pgina 16)
Figura 13. La ventana principal del software.

La barra de estado
La barra de estado en la parte inferior de la ventana principal del software
muestra el estado del software.
Ver el lado izquierdo de la barra de estado (Figura 14) para ver el estado
actual de los instrumentos.
Figura 14. El lado izquierdo de la barra de estado en la ventana principal del

software.
Ver el lado derecho de la barra de estado (Figura 15) para ver el nombre de
usuario, la fecha y la hora.
Figura 15. Lado derecho de la barra de estado en la ventana principal del

software.
Haga clic y arrastre la esquina inferior derecha de la barra de estado para
cambiar el tamao de la ventana principal.
Barra de men
La barra de mens de la ventana principal del software proporciona los
elementos enumerados en la Figura 16:
Figura 16. Barra de men en la ventana principal del software.

13
Seleccionar los comandos que se muestra en la barra de men (Tabla 7).
Tabla 7. Los elementos del men de barras en la ventana principal del
software
tem del men de comandos de funcin Nuevo archivo Crea un nuevo
protocolo, la placa, la experimentacin, Gene Estudio
Menu del
articulo
Expediente
comando
Funcion
Nuevo
Crear un nuevo protocolo, la placa, la

experimentacin,Geneestudio
Apertura de archivos existentes, incluyendo
el protocolo(. PRCL), la placa de
(. PLTD), datos (. PCRD), y elestudio de
genes(. mgxd) archivos,archivos
independientesde ejecucin (. zpcr)
Ver una lista de los diez datos ms vistos
archivos y seleccione una para abrir en el
anlisis de datos
Abra laventana Configuracin del
experimentocon laprotocoloy la placade una
carreracompletade forma rpidaRepetir el
ensayo
Salga del programa desoftware
Mostrarel registro de aplicacinpara el
software
Seleccione un informede ejecucinpara
revisarde una lista
Abierto
Archivos de
datosrecientes
Repetir un experimento
Ver
Salir
registro de aplicaciones
Los informes se
ejecutan
Asistentede inicio
Montaje del ensayo
Resumende
instrumentos
Los
instrumentosdetectaron
barra de herramientas
Abra el Asistentede inicio

Abra laventana Configuracin del
experimento
Abra la ventana deResumende instrumentos
Mostrar uocultar el panel
deinstrumentosDetectado
Mostrar u ocultar labarra de herramientas desoftware
dela ventana principal
la barra de estado
Usuario
seleccione Usuario
Cambiar la
contrasea
Preferencias de
usuario
Administracion de
Mostrar u ocultarla ventana principaldel

softwarebarra de estado
Abrir la ventanaSeleccionar usuariopara
cambiarde softwarelos usuarios
Cambie su contrasea de usuario
Abra la ventana de preferencias de
usuario
La gestin de usuariosen la ventana
Instrumentos
usuarios
Tinte mago de
calibracion
ProtocoloAutoWriter
TaCalculadora
Ver registro deBloque

de estado
Datos de la
aplicacinde carpeta
Los datosde
usuariode carpeta
Todas laspropiedades
instrumentos
Datos deZip yarchivos
de registro
opciones
mendel
artculo
ventanas
comando
ayuda
Mosaico vertical
cascada
TileHorizontal
Cerrar todo
Contenido
Indice
Busqueda
Expresin Gnica
Puerta de entradadel
sitioWeb
PCR de plstico
deadministracin de usuarios
Abra la ventanade calibracinpara
calibrar untinteinstrumento paraun
fluorforonuevo
Abra la ventanaAutoWriterProtocolopara
crear unnuevo protocolo
bra la ventana dela calculadorapara
calcular elTa
temperatura deanillamiento de los
cebadores
Ver un registrodel bloquetermociclador
Abra la carpetaDatos de programapara
versoftware
archivos
abra la carpetade datos para verel
protocolo, la placa yarchivos de datos
Ver las propiedadesde todos
losinstrumentos detectaron,
incluyendo nmeros de serie
Elijay condensarlos archivos
seleccionadosen formato comprimido
para el almacenamientode archivoso
correo electrnico a
Configurar las opciones desoftware de
correo electrnico
Funcin
Organizar las ventanasde softwareen la
parte superiorde cada uno
Organizar las ventanasde softwarede
arriba a abajo
Organizar las ventanasde softwarede
derecha a izquierda
Cierre todas las ventanasde software
libre
Abrirla ayuda del softwarepara obtener
ms informacin sobre la ejecucin
dePCRyPCRen tiempo real
Verel ndice enla Ayuda del software
Buscarla ayuda del software
Abra un sitioweb para
encontrarinformacin sobre la ejecucin
PCRen tiempo reallos experimentos de
PCR
Ver un sitio webque las listas deBio-Rad
consumibles para
PCRen tiempo real yreactivosPCR
Ver un sitio webque las listas deBio-Rad
consumibles sitio Web
Actualizaciones de
software
sobre
consumibles para
PCRen tiempo reallos experimentos de
PCR
Buscar actualizaciones de softwarede
Bio-Rad
Abriruna ventana para verla versin de
software
Introduccin al Software Manager CFX

14
Botones de la barra de herramientas
Haga clic en un botn en la barra de herramientas de la ventana principal
del software (Tabla 8) para acceder rpidamente a
los comandos ms comunes de software.
NOTA: Para mostrar u ocultar la barra de herramientas, seleccione Ver>
Barras de herramientas en la barra de men.
Tabla 8. Botones de la barra en la ventana principal del software
Botn Nombre de la funcin
Abrir un archivo de datos Abrir una ventana del navegador para localizar un
archivo de datos (*. PCRD
de extensin) y abrirlo en la ventana de Anlisis de Datos
(Pgina 69)
Abrir un estudio de Gene Abra una ventana del navegador para localizar un
archivo de estudio de genes
(. Mgxd extensin) y abrirlo en el estudio de genes
ventana (pgina 101)
Crear un nuevo gen
Estudio
Abra la ventana del estudio de genes (pgina 101) para aadir archivos
y crear un nuevo estudio
Imprimir la ventana actual del software
Asistente de arranque Abra el Asistente de arranque que le vincula con
comunes
las funciones del software (pgina 16)
Tabla 7. Los elementos del men de barras en la ventana principal del
programa (continuacin)
tem del men de comandos de funcin
15
Asistente de inicio
El asistente de inicio aparece automticamente cuando el software CFX
Director se abre por primera

(Figura 17). Si no se muestra, haga clic en el botn Asistente de inicio en la
ventana principal del software
barra de herramientas.
Figura 17. Ventana del Asistente de arranque.

Opciones en el Asistente de inicio son los siguientes:
Configuracin del experimento Abra la ventana Configuracin del
experimento para ejecutar una
experimento (pgina 21)
AutoWriter Protocolo Abra la ventana AutoWriter Protocolo para crear un
nuevo
protocolo (pgina 37)
El usuario selecciona Abrir la ventana Seleccionar usuario para cambiar de
software
los usuarios (ver "Entrar o seleccione un usuario" en la pgina 121)
Preferencias de usuario Abra la ventana de preferencias del usuario (pgina
121)
Ayudar a abrir la ventana de ayuda del software para obtener ms
informacin
sobre la ejecucin de PCR y PCR en tiempo real
Tabla 8. Botones de la barra en la ventana principal del software
(continuacin)
16
Crear un nuevo experimento (pgina 21). Configurar el protocolo y la

placa para comenzar una nuevaexperimento.
NOTA: Seleccione el instrumento adecuado en la lista desplegable para
asegurarse de que la
configuracin predeterminada de la placa coincida con el instrumento a ser
utilizado para el experimento.
repetir un experimento. A cabo un experimento con el protocolo y la placa
de un
completado ejecutar. Si es necesario, puede modificar el experimento antes
de la carrera
Abra un archivo de datos (pgina 69). Abrir un archivo de datos para
analizar los resultados
Abrir un estudio de genes (pgina 101). Abrir un estudio de genes de
varios archivos para analizar la expresin
los resultados de varios experimentos de expresin gnica
Abra las preferencias del usuario (pgina 121). Abra la ventana de
preferencias del usuario para personalizar
configuracin del software
Panel de Instrumentos detecta

Software CFX Manager se ejecuta estos instrumentos de la serie 1000:
CFX96 CFX384 y sistemas en tiempo real PCR. Los sistemas incluyen un
termociclador C1000
y un mdulo de reaccin ptica
C1000 termociclador. El ms verstil de los instrumentos a cargo de
Gerente de CFX
software. Agregar y quitar estos mdulos reaccin de PCR para el chasis
C1000 en
segundo:
Mdulo de reaccin rpida de 96 pozos, gradiente permitido
384-y la reaccin del mdulo
Mdulo de doble 48/48 de reaccin, gradiente permitido
ciclador trmico S1000 conectado a un termociclador C1000. Para ms
informacin,
ver S1000 y C1000 manuales de instrucciones ciclador trmico
Envo de tornillo. Retire el tornillo de transporte para ejecutar el
instrumento, o instalar el
envo de tornillo cuando se desea transportar el instrumento
Calibrado tintes. Ver la lista de los fluorforos calibrado
Figura 20. Propiedades instrumento ventana.
Ficha Propiedades
El nombre predeterminado de un instrumento es el nmero de serie C1000

termociclador, lo que parece
en muchos lugares, incluyendo el panel de instrumentos ha detectado
(Figura 18).
Para cambiar el nombre de un instrumento para facilitar su identificacin,
siga estas instrucciones:
En la ficha de instrumentos Propiedades, escriba un nombre en el cuadro
Cambiar el nombre en la parte superior de la

Ficha Propiedades y pulse el botn Cambiar nombre para guardar el nuevo
nombre
NOTA: En el panel de instrumentos ha detectado, haga clic en el icono del
instrumento y seleccione
Cambiar el nombre para abrir la ventana Propiedades del instrumento.
La ficha Propiedades muestra importantes nmeros de serie para el
instrumento conectado, incluyendo
el termociclador y el mdulo de reaccin. Las versiones de firmware
tambin se muestran.
19
Envo Tab tornillo
La ficha de tornillo envo incluye las instrucciones para instalar o quitar el
tornillo de envo de color rojo.
Para evitar daos a los mdulos de reaccin ptica, instalar el tornillo de
envo en cualquier momento que
enviar el sistema o el sistema de CFX96 CFX384.
NOTA: Si el tornillo de envo es detectado por el software, las propiedades
del instrumento
ventana se abre automticamente con la ficha de envo de tornillo en el
frente. Siga las
instrucciones para retirar el tornillo.
La informacin de esta ficha cambia en funcin de si el tornillo de transporte
martimo se ha instalado o
eliminado. Por ejemplo, para instalar el tornillo de envo, haga clic en el
botn Instalar el envo de tornillo
y siga las instrucciones de la ficha (Figura 21).
Figura 21. Las instrucciones para instalar el tornillo de envo.

Calibrado Colorantes Tab
Abra la ficha calibrado Colorantes para ver la lista de fluorforos calibrado y
placas para el
seleccionados instrumento. Haga clic en un botn de informacin para ver
informacin detallada acerca de la calibracin.
Figura 22. Calibrados ficha Colorantes en la ventana de Propiedades de
instrumentos.

20
Archivos de software
CFX Manager almacena la informacin sobre los experimentos en archivos
especficos (Tabla 9):
Consejos y trucos
Trucos y consejos para el uso de software de gestin CFX se enumeran a
continuacin.
Abra cualquier protocolo, la Plata, de datos o un archivo de Estudio Gene
arrastrndolo desde una carpeta a un
ventana del software libre
Imprimir o exportar la informacin mostrada en muchas ventanas
haciendo clic derecho en un grfico,
hoja de clculo, o bien selector
Cambiar el tamao de cualquier ventana haciendo clic y arrastrando los
bordes
Abra la ventana de preferencias del usuario de elegir la configuracin por
defecto que se activan todos los
vez que inicie sesin en el software
Agregar archivos de datos de un estudio de Gene arrastrando desde una
carpeta a un estudio de Gene abierto
ventana
Anlisis de datos Abrir varios archivos y Gene estudio, al mismo tiempo
Haga clic en Configuracin y Herramientas de mens para encontrar las
funciones avanzadas
Para aadir o eliminar archivos en el men de carga Express, agregar o
eliminar los archivos (. PRCL
extensiones and.pltd) en la carpeta ExpressLoad, seleccione Herramientas>
Carpeta de Usuario de datos en
la barra de men de la ventana principal del software
Para ver toda la informacin cargada en un pocillo de una placa, haga
doble clic en el pozo para
abrir la ventana de informacin bien
Haga clic en cualquier grfico o tabla para cambiar las opciones de
visualizacin y anlisis de datos
Modificar el contenido y, antes, durante o despus de la carrera
Seleccione un grupo y para ver y analizar un subconjunto de los pozos de
la placa. Seleccione cada
as el grupo por su nombre en el grupo bien el men desplegable en la barra
de herramientas
Tabla 9. Abrir este tipo de archivos con el software de Administrador de CFX
Extensin Tipo de archivo Cmo ver y editar archivos
Protocolo. PRCL Seleccione en Configuracin del experimento y editar en el
Protocolo Editor
Plato. PLTD Seleccione en Configuracin del experimento y editar en el
Editor de Plata
De datos. PCRD Ver y analizar en la ventana de Anlisis de Datos
Estudio de genes. Mgxd Ver y analizar en la ventana de Gene Estudio
Independiente antes de los datos
expediente
. Zpcr Contiene las lecturas de fluorescencia de stand-alone
operacin que se convierte en un archivo de datos
21
3 Experimentos Running
Lea este captulo para obtener informacin sobre la ejecucin de
experimentos utilizando el software CFX Manager:
Experimentar la ventana de configuracin (continuacin)
Protocolo de la ficha (page22)
Punto final slo se ejecuta (pgina 22)
Placa de la ficha (pgina 23)
Inicio, Ejecutar pestaa (pgina 24)
Detalles de ejecucin de la ventana (pgina 26)
Instrumento ventana Resumen (pgina 28)
Ventana de Configuracin de experimento
La ventana Configuracin del experimento proporciona acceso rpido a los
archivos y configuraciones necesarias para crear
y realizar un experimento. Para abrir la ventana Configuracin del
experimento, siga una de estas opciones:
Haga clic en la opcin Crear un nuevo experimento en el Asistente de
inicio (pgina 16)
Haga clic en el botn Configuracin del experimento en la barra de
herramientas de software principal (pgina 14)
Seleccione Archivo> Nuevo> Experimento en la barra de men principal
de software (pgina 12)
La ventana Configuracin del experimento incluye tres pestaas:
Protocolo. Haga clic en la ficha Protocolo para seleccionar un protocolo
existente para ejecutar o modificar, o crear
un nuevo protocolo en la ventana del editor de Protocolo (pgina 31)
Placa. Haga clic en la lengeta de la placa para seleccionar una placa
existente para ejecutar o modificar, o crear una nueva
placa en la ventana Editor Plate (pgina 41)
Inicio Ejecutar. Haga clic en la pestaa Inicio Ejecutar (pgina 24) para
comprobar la configuracin de ejecucin, seleccione una o
ms bloques de instrumentos, y comienza la carrera
NOTA: Si el protocolo seleccionado en la ficha Protocolo no incluye un paso
con una placa de lectura para anlisis en tiempo real PCR, la lengeta de la
placa que est oculto. Para ver
la lengeta de la placa, aadir una "Placa de lectura" (pgina 34) en al
menos un paso en el protocolo.
NOTA: Inicie un nuevo experimento de una ejecucin anterior, seleccione

Archivo> Repetir una
Experimento en la barra de men principal del software. A continuacin,
seleccione el archivo de datos (. PCRD) para el
experimento que desea repetir.
22
La ventana Configuracin del experimento abre con la ficha de protocolo
delante (Figura 23). Para abrir
otra ficha, haga clic en esa ficha o haga clic en Anterior y Siguiente en la
parte inferior de la ventana.
Figura 23. Experimento ventana de configuracin, incluyendo el Protocolo de
la Plata, y las pestaas Inicio Ejecutar.
Protocolo Tab
En la ficha Protocolo muestra una vista previa del archivo de protocolo
seleccionado cargado en la Configuracin del experimento
(Figura 23). Un archivo de protocolo contiene las instrucciones para los

pasos de instrumentos de temperatura, como as como las opciones de
instrumentos que controlan la velocidad de la rampa y la temperatura de la
tapa.
Seleccione una de las siguientes opciones para seleccionar un protocolo
existente, crear un nuevo protocolo, o de modificar
el protocolo seleccionado:
Crear botn Nuevo. Abra el Editor del Protocolo para crear un nuevo
protocolo
Seleccione el botn existente. Abra una ventana del navegador para
seleccionar y cargar un protocolo existente
archivo (. PRCL extensin) en la ficha Protocolo
Load Express en el men desplegable. Seleccionar rpidamente un

protocolo para cargarlo en la ficha Protocolo
TIP: Para agregar o eliminar los protocolos en el men de carga Express,
aadir o eliminar archivos (PRCL.
de extensin) en la carpeta ExpressLoad. Para encontrar esta carpeta,
seleccione Herramientas>User
La carpeta de datos en la barra de men de la ventana principal del
software
Editar botn seleccionado. Abra el protocolo seleccionado en el Editor de
Protocolo
Punto final slo se ejecuta
Para ejecutar un protocolo que contiene slo un punto final de datos de
adquisicin de paso, seleccione Opciones> Fin
nico punto de ejecucin de las opciones en la barra de men de la ventana
Configuracin del experimento. El valor por defecto
protocolo de punto final, que incluye dos ciclos de 60,0 C durante 30
segundos, se carga en el
Protocolo de ficha.
23
La figura 24 muestra el final por defecto del protocolo punto.
Figura 24. Punto final solo protocolo.

Para cambiar la temperatura de paso o volumen de muestra para el punto
final slo se ejecuta, haga clic en el men Inicio
Ejecutar ficha y edite la temperatura Paso o volumen de muestra. La figura
25 muestra el paso
la temperatura se cambia a 55.0oC.
Figura 25. Cambiar el volumen de la muestra en la ficha Inicio Ejecutar.

Placa Tab
La lengeta de la placa muestra una vista previa del archivo seleccionado
placa cargada en la configuracin del experimento
(Figura 26). En un experimento de PCR en tiempo real, el archivo de la placa
contiene una descripcin de los contenidos
de cada bien, el modo de exploracin, y el tipo de placa. Software CFX
Manager utiliza estos
descripciones para la recoleccin de datos y anlisis.
Seleccione una de las siguientes opciones para seleccionar una placa

existente, crear una nueva placa, o editar el
plato seleccionado:
Crear botn Nuevo. Abra el Editor del Plata para crear una nueva placa
Seleccione el botn existente. Abra una ventana del navegador para
seleccionar y cargar un archivo de placa existente
(. PLTD extensin) en la lengeta de la placa
Load Express en el men desplegable. Seleccionar rpidamente un plato a
la pila en la lengeta de la placa
TIP: Para agregar o eliminar las placas en el men de carga Express, aadir
o eliminar archivos (PLTD.
de extensin) en la carpeta ExpressLoad. Para encontrar esta carpeta,
seleccione Herramientas>User
La carpeta de datos en la barra de men de la ventana principal del
software.
24
Editar botn seleccionado. Abra la placa seleccionada en el Editor de Plata
Figura 26. Placa de ventana de la ficha.
Inicio Ejecutar Tab
La ficha Inicio Ejecutar (Figura 27) incluye una seccin para verificar la
informacin sobre la carrera que se
va a ser iniciado, incluyendo el protocolo seleccionado y los archivos de la
placa, y una seccin para la seleccin
el bloque de instrumento.
Ejecutar panel de informacin. Vea el archivo de protocolo seleccionado, el
archivo de la Plata, y adquisicin de datos
Ajustes de escaneado modo. Escriba notas opcionales sobre el experimento
en el cuadro Notas
Ejecutar el bloque seleccionado (s) panel. Seleccione uno o ms bloques,
modificar los parmetros de ejecucin
(Si es necesario) y haga clic en el botn Ejecutar en Iniciar para comenzar el
experimento
Figura 27. La pestaa Inicio, Ejecutar.

25
De manera predeterminada, el Inicio, Ejecutar el bloque seleccionado (s)
panel muestra el nombre del bloque, bloque tipo y
estado de cada instrumento detectado por el software. Estas descripciones
no se pueden editar.
NOTA: Se puede reemplazar el volumen de muestra cargada en el archivo
de Protocolo de la seleccin
el volumen en la celda de hoja de clculo y escribir un nuevo volumen.
NOTA: Un identificador de ejecucin se puede realizar por cada bloque
mediante la seleccin de la celda y escribiendo un ID
o seleccionando la celda y el escaneado con un lector de cdigo de barras.
Para aadir o eliminar los parmetros de ejecucin de la hoja de clculo en
el men Inicio Ejecutar el bloque seleccionado (s)
panel, haga clic en la lista y seleccionar una opcin en el men de pantalla.
Elija el valor de
cambio haciendo clic en el texto dentro de la celda para seleccionarla y
despus de escribir en la celda, o mediante la seleccin de
un nuevo parmetro en el men desplegable. Parmetros editables
incluyen:
Temperatura de la tapa. Ver la temperatura de la tapa. Reemplazar la tapa
de la temperatura
seleccionar el texto y escribiendo una nueva temperatura
La tabla 10 muestra otras opciones en el men de botn derecho del ratn
en Inicio, Ejecutar en la Seleccin

Bloque (s) panel:
Los botones para controlar el instrumento
Haga clic en los siguientes botones en la ficha Ejecutar comenzar a operar
de forma remota los instrumentos seleccionados:
Inicio Ejecutar. Iniciar el experimento en los bloques de instrumento
seleccionado
Flash Indicador de bloqueo. Flash del indicador LED en los bloques de
instrumento seleccionado
Abrir la tapa. Abra la tapa motorizado en bloques de instrumento
seleccionado
Cierre la tapa. Cierre la tapa motorizado en bloques de instrumento
seleccionado
Abra la ventana de Detalles
Al hacer clic en el botn Ejecutar en Inicio, software CFX Gerente le pide que
guarde el nombre de
el archivo de datos y luego se abre la ventana Ejecutar Detalles. Revise la
informacin en esta ventana para
monitorear el progreso de la carrera.
Ejecutar ficha Estado. Comprobar el estado actual del protocolo, abrir la
tapa, hacer una pausa en ejecucin, agregue
repite, omita los pasos, o detener la ejecucin
en tiempo real la ficha Estado. Ver la PCR en tiempo real los datos de
fluorescencia, ya que se recogen
Tiempo de la ficha Estado. Ver una cuenta atrs de pantalla completa para
el protocolo
Tabla 10. Inicio Ejecutar el bloque seleccionado (s) de opciones que el men
Haga clic derecho Opcin Funcin
Copiar Copiar el texto seleccionado
Copiar como imagen copia una imagen del inicio de ejecucin en el bloque
seleccionado (s) panel
Imprimir ... Imprimir la vista actual de la lista de los bloques seleccionados
Imprimir Seleccin ... Imprimir la columna que se encuentra seleccionado
Exportar a Excel ... Exportar la lista de bloques a un archivo de hoja de
clculo Excel
Exportar a texto ... Exportar la lista de bloques a un archivo de texto
Buscar ... Bsqueda de texto en la lista de bloques
Ordenar ... Ordenar un mximo de tres columnas en la lista de bloques
26
La figura 28 muestra las caractersticas de la ventana Ejecutar Detalles.
Figura 28. Abra la ventana de detalles.

Ejecutar ficha Estado
La ficha Estado de ejecucin (Figura 28) muestra el estado actual de una
carrera en curso en los detalles de ejecucin
botones de la ventana y ofrece (pgina 26) para controlar la tapa y cambiar
la carrera en curso.
Ejecutar el panel de estado. Muestra el progreso actual del protocolo,
incluida la actual
paso, repetir GOTO actual, la temperatura del bloque, el tiempo restante
para mantener el paso actual,
temperatura de la muestra, la tapa y la temperatura de transporte
Ejecutar los botones de estado. Haga clic en uno de los botones para
manejar a distancia el instrumento o
interrumpir el protocolo actual
Ejecutar panel de informacin. Muestra los detalles de experimento
Ejecutar botones de estado Tab
Haga clic en uno de los botones que se enumeran en la Tabla 11 para
utilizar el equipo con el software, o para
cambio de la carrera que est en curso.
NOTA: El cambio de protocolo durante la carrera, como se repite aadiendo,

no cambia el
archivo de protocolo asociado con la carrera. Estas acciones se registran en
el Registro de ejecucin.
El cuadro 11. Ejecutar botones de estado y sus funciones
Botn de funcin
Abra la tapa del motor de los instrumentos seleccionados
ADVERTENCIA! Abrir la tapa durante una pausa en la ejecucin
ejecutar durante el paso de corriente y puede alterar los datos.
Cierre la tapa del motor de los instrumentos seleccionados
27
Estado en tiempo real Tab
La ficha Estado en tiempo real (Figura 29) muestra datos en tiempo real PCR
recogidos en cada ciclo durante el
el protocolo despus de la primera placa de dos lecturas. Esta ficha tambin
muestra el texto y seleccin, y
describir el estado del protocolo en la parte inferior de la ventana.
CONSEJO: Haga clic en Ver / Editar botn Plate para abrir la ventana Editor
de la Plata. Durante el
de ejecucin, puede introducir ms informacin sobre el contenido de cada
pocillo en la placa.
Figura 29. La ficha Estado en tiempo real muestra los datos durante una
carrera.
Aadir ms repeticiones con el actual paso GOTO en el protocolo.
Este botn slo est disponible cuando un paso GOTO se est ejecutando.
Omitir el paso de corriente en el protocolo. Si usted se salta un paso GOTO,
el software verifica que desea omitir todo el GOTO
bucle y continuar con el siguiente paso en el protocolo.
Flash del LED en el instrumento elegido para identificar la
bloques seleccionados
Pausa el protocolo
NOTA: Esta accin se inscribe en el Registro de ejecucin.
Reanudar un protocolo que se ha detenido
Detener la ejecucin antes de que termine protocolos, que pueden alterar
sus datos
El cuadro 11. Ejecutar los botones de estado y sus funciones (continuacin)
Botn de funcin
28
Sustitucin de un archivo de Plata
Durante la carrera, reemplazar el archivo placa haciendo clic en el botn
Cambiar Plate (Figura 29) en el tiempo real

La ficha Estado. Seleccione el archivo de la nueva placa (. PLTD) de la lista
en el explorador de Windows.
NOTA: El software CFX gerente controla el modo de exploracin y tamao de
la placa de la placa
archivo, los cuales deben coincidir con las configuraciones de ejecucin que
se iniciaron durante el experimento.
SUGERENCIA: Sustitucin de un archivo de la placa es especialmente til si
se inicia una carrera con un plato rpido
archivo en la carpeta de carga Express.
Tiempo ficha Estado
La ficha Estado muestra un tiempo de temporizador de cuenta atrs para la
ejecucin actual (Figura 30).
Figura 30. La ficha Estado muestra un contador de tiempo de cuenta

regresiva para la ejecucin actual.
Instrumento ventana Resumen
La ventana de Resumen de instrumentos muestra una lista de los
instrumentos detectados y su estado.
Abra el resumen del instrumento haciendo clic en el botn Ver resumen
(Figura 19 en la pgina 17)
en el panel de instrumento detect.
La figura 31 muestra la ventana Resumen de instrumentos, incluyendo la
lista de nombre del bloque y el
estado actual de todos los instrumentos detectados. Seleccione uno o ms
bloques y haga clic en los botones
la barra de herramientas para cambiar el estado de cada instrumento.
Figura 31. Instrumento ventana de Resumen.

29
Instrumento barra de herramientas Resumen
Resumen de la barra de herramientas de instrumentos incluye los botones y
funciones que se enumeran en el cuadro 12.
Men de clic derecho
Haga clic derecho en la ventana Resumen de instrumentos para cambiar la
lista de opciones que aparecen:
Nombre del bloque. Ver el nombre del bloque
Tipo. Ver el tamao y el tipo de bloque
Estado. Ver el estado actual del bloque
usuario. Ver el usuario actual que se registra en el software
restante. Ver el resto del tiempo en la ejecucin actual
Tabla 12. Botones de la barra en la ventana Resumen de instrumentos
Prepar el experimento Monte un experimento en el seleccionado
bloque mediante la apertura de la Configuracin del experimento
ventana
Detener Detiene la marcha actual de los bloques seleccionados
Pausa la ejecucin actual de los bloques seleccionados
Reanudar Reanudar la ejecucin de los bloques seleccionados
Flash Bloque indicador de flash, el indicador LED en la tapa de la
bloques seleccionados
Abrir la tapa abierta de un bloque seleccionado tapa motorizada
Cierre al cerrar la tapa de un bloque seleccionado tapa motorizada
Ocultar los bloques seleccionados Ocultar los bloques seleccionados en el
Resumen de la lista de instrumentos
Mostrar todos los bloques muestran los bloques seleccionados en el
Resumen de la lista de instrumentos
Mostrar Seleccione los bloques para mostrar en la lista.
Seleccione una de las opciones para mostrar todos los
bloques detectados, todos los bloques de inactividad, todos los
bloques que se estn ejecutando con el actual
usuario, o todos los bloques de funcionamiento

30
Copia. Copia de la lista completa
Copiar como imagen. Copia de la lista como un archivo de imagen
Impresin. Imprimir la lista
Seleccin de impresin. Imprimir slo las celdas seleccionadas en la lista
Exportacin a Excel. Exportar la lista como un archivo de Excel con
formato
Exportar a texto. Exportar la lista como un archivo de texto
Buscar. Bsqueda de texto en la lista
Ordenar. Ordenar la lista mediante la seleccin de un mximo de tres
columnas de datos en la ventana para ordenar
31
4 Protocolos
Lea el captulo siguiente para obtener informacin sobre cmo crear y editar
archivos de protocolo:
Protocolo de ventana de Editor (a continuacin)
Protocolo de control de Editor (pgina 33)
Temperatura del modo de control (pgina 37)
Protocolo AutoWriter (pgina 37)
Protocolo de ventana del editor
Un protocolo de instrucciones del instrumento para controlar los pasos de la
temperatura, la temperatura de la tapa, y otros
opciones del instrumento. Abra la ventana del editor de Protocolo para crear
un nuevo protocolo o para editar el
protocolo seleccionado en la ficha Protocolo. Una vez que el Protocolo se
crea o modifica en el
Editor de protocolo, haga clic en Aceptar para cargar el archivo de protocolo
en la ventana Configuracin del experimento y ejecutarlo.
Abrir el editor de Protocolo
Para abrir el Editor de protocolo, siga una de estas opciones:
Para crear un nuevo protocolo, seleccione Archivo> Nuevo> Protocolo o
haga clic en la Nueva Creacin
botn en la ficha Protocolo (pgina 22)
Para abrir un protocolo existente, seleccione Archivo> Abrir> Protocolo, o
haga clic en el Abierto de Botn existente en la ficha Protocolo (pgina 22)
Para modificar el actual protocolo en la ficha Protocolo, haga clic en el
botn Editar Seleccionado en la Protocolo de la ficha (pgina 22)
SUGERENCIA: Para cambiar la configuracin predeterminada en la ventana
del editor de Protocolo, entrar en el
cambios en la ficha Protocolo en la ventana de preferencias del usuario
(pgina 124)
Protocolo de ventana del editor
La ventana del editor de Protocolo (Figura 32) incluye las siguientes
caractersticas:
Barra de mens. Seleccionar la configuracin del protocolo

Barra de herramientas. Seleccione las opciones para la edicin del
protocolo
Protocolo. Ver el protocolo seleccionado en un grfico (arriba) y el texto
(abajo) vista. Haga clic en el la temperatura o tiempo de permanencia en el
punto de vista grfico o texto de cualquiera de los pasos para introducir un
nuevo valor
Protocolos
32
Protocolo de botones del editor. Editar el protocolo, haga clic en uno de los
botones a la izquierda de la vista de texto
Figura 32. Protocolo de ventana Editor de botones para los protocolos de

edicin.
Editor Protocolo barra de mens
La barra de mens en la ventana del editor de Protocolo establece los
elementos de men que aparecen en la Tabla 13
La barra de herramientas (Figura 33) en la ventana del editor de Protocolo
de proporcionar un acceso rpido para importantes
funciones:
Figura 33. Protocolo de la barra de herramientas del editor.

Tabla 13. Editor Protocolo men de la barra
Guardar archivo Guardar el protocolo actual
Guardar como guardar el protocolo actual con un nombre nuevo o en una
nueva
ubicacin
Cierre Cierre el Editor del Protocolo
Configuracin de ajustes de tapa abierta la ventana de Configuracin de la
tapa para cambiar o ajustar la tapa
Temperatura
Herramientas de degradado
Calculadora
Seleccione el tipo de bloque de un paso gradiente. Elija 96 Wells
o 384 Wells
En tiempo de ejecucin
Calculadora
Seleccionar el modo de instrumento y anlisis que se utilizarn para
calcular el tiempo de ejecucin estimado en la Configuracin del
experimento
ventana
33
Tabla 14 enumera las funciones de los botones de la barra de herramientas
Protocolo Editor:
Protocolo de Control Editor
La ventana del editor Protocolo incluye botones para cambiar el protocolo.
En primer lugar, seleccionar y resaltar
un paso en el protocolo de la izquierda haciendo clic con el puntero del
ratn. A continuacin, haga clic en uno de los Protocolo
Editor de botones en la parte inferior del lado izquierdo de la ventana del
editor de Protocolo para cambiar el protocolo.
La ubicacin de la insercin de una nueva etapa, "Antes" o "despus" del
paso actualmente seleccionado se
determinado por el estado del cuadro de Paso Insertar situado en la barra de
herramientas.
Insertar botn Paso
Para insertar un paso de temperatura antes o despus del paso actualmente
seleccionado:
1. Haga clic en el botn Paso Insertar.
2. Edicin de la temperatura o tiempo de espera haciendo clic en el valor
por defecto en la vista grfica o de texto,
e introducir un nuevo valor.
Tabla 14. Protocolo de botones de la barra de herramientas del editor
Barra de herramientas de botones y mens de funcin Nombre
Guardar Guarde el archivo de protocolo actual
Imprimir la ventana seleccionada
Inserte el paso Seleccione antes o despus de insertar los pasos de un
posicin en relacin con el resaltado
paso
Volumen de la muestra Introduzca un volumen de muestra en l entre 0 y
50 (para el bloque de 96 pozos), o entre 0 y 30
(Por 384-y bloque)

Volumen de la muestra determina la temperatura
Control de modo (pgina 37). Escriba cero (0) a
seleccionar el modo de bloque
Tiempo de ejecucin Ver un tiempo de ejecucin estimado basado en la
pasos del protocolo y la velocidad de rampa
Ayuda Abrir la Ayuda del software para obtener ms
informacin sobre los protocolos
Protocolos
34
3. (Opcional) Haga clic en el botn Paso opciones para introducir un
incremento o ampliacin de la opcin de la
el paso (pgina 36). La figura 34 muestra el nuevo paso que se ha insertado
despus del paso 2.
Figura 34. Protocolo con el paso inserta.

Agregar o quitar una etiqueta leer Plate
Para agregar una placa de lectura a un paso o para remover una placa leer
de un paso:
1. Seleccione el paso haciendo clic en el paso, ya sea en la vista grfica o de
texto.
2. Haga clic en la placa de Lee Agregar a paso para agregar una placa de
lectura al paso seleccionado. Si el
paso ya contiene una placa de lectura, el texto del botn cambia, as que
ahora mismo
botn lee Remueva la Placa de lectura. Haga clic para quitar una placa de
lectura de la etapa seleccionada.
En la figura 34, observe que el icono de la cmara en el punto de vista
grfico (arriba) muestra que el paso 4 incluye una placa de leer.
Insertar botn de degradado
Para insertar un paso gradiente antes o despus del paso actualmente

seleccionado:
1. Insertar un paso gradiente de temperatura haciendo clic en el botn de
degradado en Insertar.
2. Asegrese de que el tamao de la placa para el gradiente coincide con el
tipo de bloques del instrumento, el 96
bien o bien 384. Seleccione el tamao de la placa para el degradado,
seleccione Herramientas>Gradient
Calculadora en la barra de men Protocolo Editor.
3. Modificar el intervalo de gradiente de temperatura, haga clic en la
temperatura por defecto en el grfico o
ver el texto, y entrando en una nueva temperatura. Alternativamente, haga
clic en el botn Opciones de Paso
entrar en el rango de gradiente en la ventana de Opciones de Paso (pgina
36)
4. Editar el tiempo de espera haciendo clic en el tiempo predeterminado en
el punto de vista grfico o texto, y entrando en un nuevo tiempo.
35
La figura 35 muestra el paso gradiente inserta. Las temperaturas de cada
fila en el gradiente se
trazado en la parte derecha de la ventana.
Figura 35. Protocolo con el paso del gradiente inserta.

Insertar Botn GOTO
Para insertar un paso GOTO antes o despus del paso seleccionado:

1. Haga clic en el botn Insertar GOTO.
2. Editar el nmero del paso GOTO o el nmero de repeticiones GOTO
haciendo clic en el nmero predeterminado
en el punto de vista grfico o texto, y entrando un nuevo valor.
La figura 35 muestra un paso GOTO inserta al final del protocolo. Tenga en
cuenta que el bucle GOTO
incluye los pasos 2 a 4.
Inserte Melt botn Curva
Para insertar un paso curva de fusin antes o despus del paso
seleccionado:
1. Haga clic en el botn Insertar Melt Curve.
2. Modificar el intervalo de temperatura de fusin o de incremento de
tiempo haciendo clic en el nmero por defecto en la grfica o de texto, e
introducir un nuevo valor. Alternativamente, haga clic en Opciones de Paso
botn para entrar en el rango de gradiente en la ventana de Opciones de
Paso (pgina 36).
NOTA: No se puede insertar un paso curva de fusin dentro de un bucle
GOTO.
NOTA: El paso de la curva de fusin incluye una espera de 30 segundos al
principio de la etapa de
que no se muestra en el protocolo.
Protocolos
36
La figura 36 muestra una curva de paso derretir aadido despus del paso
6:
Figura 36. Protocolo con el paso inserta curva de fusin.

Opciones de Paso
Para cambiar una opcin de paso para el paso seleccionado:
1. Seleccione un paso haciendo clic en el paso en el punto de vista grfico o
texto.
2. Haga clic en el botn Opciones de paso para abrir la ventana Opciones de
Paso.
3. Agregar o quitar opciones de introducir un nmero, la edicin de un
nmero, o hacer clic en una casilla de verificacin.
CONSEJO: Para mantener un paso para siempre (una bodega infinita),
escriba cero (0.00) para la poca.
La figura 37 muestra el avance seleccionado, con un gradiente de 10 C.
Tenga en cuenta que algunas opciones no son
disponibles en un paso de gradiente. Un paso pendiente no puede incluir un
incremento o cambio de velocidad de la rampa.
Figura 37. Paso opcin para un gradiente.

NOTA: Un gradiente se ejecuta con la temperatura ms baja en la parte
delantera del bloque (fila H)
y la temperatura ms alta en la parte trasera del bloque (lnea A).
La ventana de Opciones de paso muestra las siguientes opciones que usted
puede agregar o quitar de los pasos:
Placa de lectura. Marque la casilla para incluir una placa de leer
Temperatura. Introduzca una temperatura de destino para el paso
seleccionado
Gradiente. Introduzca un intervalo de gradiente para el paso
37
Incremento. Ingrese una temperatura para incrementar el paso
seleccionado, la cantidad de incremento es
aadido a la temperatura deseada en cada ciclo
Velocidad de rampa. Introduzca un tipo para el paso seleccionado, el
rango depende del tamao de bloque
El tiempo. Introduzca un tiempo de espera para el paso seleccionado
Extender. Introduzca una hora de ampliar el paso seleccionado. Ampliar la
cantidad se aade a la
tiempo de espera en cada ciclo
Sonido. Marque la casilla para incluir un pitido en la final de la etapa
CONSEJO: Cuando se introduce un nmero que est fuera del rango de
opcin, el software
cambia el nmero de la entrada ms cercana dentro de la gama.
Botn Eliminar Paso

Para eliminar un paso en el protocolo:
1. Seleccione un paso en el punto de vista grfico o texto.
2. Haga clic en el botn Borrar para borrar el paso de la etapa seleccionada.
ADVERTENCIA! No se puede deshacer esta funcin.
Modo de control de temperatura
El instrumento utiliza uno de dos modos de control de temperatura para
determinar cundo la muestra alcanza la temperatura deseada en un
protocolo.
SUGERENCIA: El volumen de la muestra se puede cambiar antes de una
carrera mediante la edicin de la Muestra
Volumen de parmetros en la ficha Ejecutar Start (vea "Iniciar ficha
Ejecutar" en la pgina 24).
Entrar en un volumen de muestra en el editor de protocolo para seleccionar
un modo de control de la temperatura:
Calculado modo. Cuando se introduce un volumen de muestra entre 1 y 50
l (96-y bloque)
o entre 1 y 30 l (384-y bloque) el termociclador calcula la muestra
temperatura basado en el volumen de la muestra. Este es el modo estndar
Bloquear el modo. Cuando se introduce un volumen de muestra de cero
(0) l, los registros trmicos ciclador
la temperatura de la muestra como el mismo que mide la temperatura del
bloque
Protocolo AutoWriter
Abra el AutoWriter Protocolo para escribir rpidamente los protocolos de
PCR y PCR en tiempo real
experimentos. Para abrir el AutoWriter Protocolo, seleccione una de estas
opciones:
Haga clic en el botn AutoWriter Protocolo en la barra de herramientas de
software de la ventana principal
Seleccione Herramientas> Protocolo AutoWriter la barra de mens en la
ventana principal del software
Protocolos
38
La figura 38 muestra un protocolo (parte inferior de la ventana), escrito por
el AutoWriter Protocolo.
Figura 38. Protocolo de ventana AutoWriter con un nuevo protocolo.
Descripcin general del protocolo AutoWriter
La ventana AutoWriter Protocolo utiliza la informacin acerca de su reaccin
de forma automtica
generar un archivo de protocolo. Introduzca la siguiente informacin acerca
de su experimento de PCR:
la temperatura de recocido (Ta) o secuencia de cebador. Introducir la
temperatura de recocido para
los cebadores. Si la temperatura de recocido es desconocida, haga clic en el
botn de la calculadora de Ta
entrar en la secuencia del cebador para calcular la temperatura de
anillamiento en la calculadora de Ta
ventana
Longitud de amplicn (pb). Introduzca la duracin prevista del producto de
PCR
enzima. Seleccione la enzima ADN polimerasa (ITAQ, iProof, u otro) (ADN
iTagTm
Polimerasa, ADN polimerasa iProofTm de alta fidelidad), introducir
informacin adicional
incluyendo el tiempo de activacin del inicio caliente, y el tiempo de
extensin final
Tiempo de funcionamiento y el tipo. Introducir una velocidad (estndar,
rpido y ultrarrpido) para ajustar el tiempo de ejecucin total,
y seleccionar el tipo de PCR (PCR en tiempo real o PCR)
El tiempo de ejecucin de cualquier protocolo se ve influenciada por el
nmero de pasos y de los ciclos, la incubacin
tiempo en cada paso, y el tiempo que tarda en llegar a la uniformidad, a la
temperatura deseada. Para reducir
el tiempo de ejecucin del conjunto de la AutoWriter Protocolo de hace uno
o ms de los siguientes cambios:
Reduce el nmero total de pasos del protocolo
Reduce el nmero de repeticiones GOTO
Minimiza el tiempo de espera en cada paso de temperatura
Minimiza el tiempo de rampa entre los pasos por la reduccin del cambio
de temperatura de
un paso a la siguiente
39
Por ejemplo, un tpico protocolo de PCR incluye los siguientes tres conjuntos
de medidas con un recorrido total
tiempo de 1,5 a 2,0 horas:
1. Plantilla inicial de desnaturalizacin y la activacin de la enzima (95 C
durante 30-10 minutos).
2. Ciclos de tres pasos de temperatura (30 a 40 ciclos): La desnaturalizacin
de la plantilla (94-95 C
durante 15-30 segundos), hibridacin de los cebadores (recocido durante
15-30 segundos), y la extensin de
producto (72 C durante 15-60 segundos).
3. La extensin final (72 C durante 10 minutos).
El Protocolo de AutoWriter podra hacer estas modificaciones para acortar
un protocolo tpico:
Cambiar la plantilla de desnaturalizacin inicial y activacin de la enzima
paso de 95 C durante 3 minutos a 98 C durante 30 segundos
Cambie el primer paso de desnaturalizacin en cada ciclo de 95 C
durante 30 segundos a 92 C durante 1 segundo
Combinar los pasos de recocido y extensin en un solo paso a 70 C
durante 20 segundo
NOTA: La combinacin de los pasos de recocido y extensin impone lmites a
la fusin
la temperatura de los cebadores. Si las temperaturas de fusin de los
cebadores no estn
dentro del rango especificado, ajustar los cebadores. Por ejemplo, acortar
los cebadores por
2 a 3 pares de bases (pb), o redisearlos para ajustar la temperatura de
fusin.
Crear un protocolo con el Protocolo de AutoWriter
Siga estos pasos para utilizar el AutoWriter Protocolo para crear un nuevo
protocolo:
1. Haga clic en el botn AutoWriter Protocolo sobre la barra de herramientas
para abrir el Protocolo AutoWriter
ventana.
2. Introduzca la temperatura (Ta) y amplicn longitud en los cuadros dentro
de la
Introducir valores objetivo / panel de enzimas. Si usted no sabe la
temperatura de recocido para primers, haga clic en el botn de la
calculadora Ta para entrar en el primer secuencias y calcular el
la temperatura de recocido. Para obtener ms informacin acerca de los
clculos utilizados en la calculadora de Ta
ver Breslauer et al. 1986.
3. Seleccione un tipo de enzima de la lista de opciones (ITAQ, iProof, u otro).
4. Agregar parmetros en el panel de parmetros adicionales (opcional) si
desea agregar un
Rango de gradiente, la temperatura caliente de inicio de activacin, o el
tiempo de extensin final de la
protocolo.
5. Seleccione una velocidad de protocolo (estndar, rpido o ultrarrpido)
moviendo la barra deslizante en la
Tipo panel. Cuando se mueve la barra deslizante, el software ajusta el
tiempo de ejecucin total. Seleccionar
PCR en tiempo real para indicar al software para recopilar datos de
fluorescencia.
6. Revisar el protocolo en el panel de vista previa en tiempo de ejecucin
total. Hacer los cambios necesarios.
Consejo: Introduce la temperatura tapa y volumen de la muestra antes de
cada ejecucin mediante la edicin del
parmetros en la pestaa Inicio Ejecutar (vea "Iniciar ficha Ejecutar" en la
pgina 24).
7. Haga clic en Aceptar para guardar el nuevo protocolo, o en Cancelar para
cerrar la ventana sin guardar
el protocolo.
Sugerencia: Para editar un protocolo escrito con las AutoWriter Protocolo,
abra el archivo de protocolo
(. PRCL extensin) en la ventana del editor de Protocolo (pgina 31).
NOTA: Bio-Rad Laboratories no garantiza que la ejecucin de un protocolo
por escrito en
la ventana AutoWriter Protocolo siempre dar como resultado un producto

de PCR.
Protocolos
40
41
5 placas
Lea este captulo para obtener informacin sobre cmo crear y editar
archivos de la placa:
Placa de la ventana del editor (seccin siguiente)
Placa de tamao y tipo (pgina 44)
Analizar el modo (pgina 45)
Los fluorforos ventana Select (pgina 45)
Los controles de carga Bueno (pgina 46)
Grupos Bueno ventana del Administrador (pgina 50)
Placa ventana del editor
Un archivo de la placa contiene los parmetros de ejecucin, tales como el
modo de exploracin y fluorforos, y el contenido, as
e instruye a los instrumentos sobre cmo analizar los datos. Abra la ventana
del editor de placas de
crear un nuevo plato o para editar la placa seleccionada en la ficha de la
Plata. Una vez que un archivo de la placa es
creados o editados en el Editor de la Plata, haga clic en Aceptar para cargar
el archivo de la placa en la Configuracin del experimento
ventana y ejecutarlo.
Para ejecutar un experimento de PCR en tiempo real, debe cargar la
informacin mnima requerida en la Plata
Editor: al menos un pozo debe contener un tipo de muestra cargada y
fluorforo.
TIP: Cambiar el contenido y, antes, durante y despus de ejecutar el
experimento.
Sin embargo, el tamao del modo de exploracin y la placa no se puede
cambiar durante o despus de la carrera.
Abra el Editor del Plata
Para abrir la ventana del editor de placa (Figura 39), siga una de estas
opciones:
Para crear una nueva placa, seleccione Archivo> Nuevo Plate> o haga clic
en el botn Crear Nuevo
la lengeta de la placa (pgina 23)
Para abrir una placa existente, seleccione Archivo> Abrir Plate>, o haga
clic en Abrir existentes
botn de la lengeta de la placa (pgina 23)
Para modificar la corriente de placa en la lengeta de la placa, haga clic
en el botn Editar Seleccionado en la Plata
pestaa (pgina 23)
Para abrir la placa asociada con un archivo de datos, en la ventana de
Anlisis de Datos (pgina 69),
haga clic en Ver / Editar la Plata en la barra de herramientas

Placas
42
Figura 39. Placa de la ventana Editor.

Placa ventana del editor
La ventana del editor placa incluye las siguientes caractersticas:
Barra de mens. Seleccionar la configuracin del tamao de la placa, tipo
de placa, nmero de convenciones, y las unidades
(Pgina 43)
NOTA: Una placa de 96 pocillos recoge datos de hasta 5 canales (todos los
canales de exploracin). A
384 y placa recopila datos para un mximo de cuatro canales (todos los
canales de exploracin).
Barra de herramientas. Seleccionar la configuracin del modo de escaneo
(pgina 45) o Grupos Bueno (pgina 50)
Gua de Carga de la Plata. Abra la ventana de Carga Placa Gua de la barra
de herramientas para un
visin general rpida de las instrucciones para cargar una placa (pgina 42)
Placa de vista. Ver el contenido y actual. Pozos de carga mediante el uso
de las opciones de carga de planchas
en el lado derecho de la opinin de la placa (Figura 39)
Bueno carga controles. Elegir el contenido de la carga en los pozos (pgina
46) de la
controles en el lado derecho de la placa de vista
El ejemplo del editor Plate muestra algunos pozos cargados de incgnitas

(Desc) y las normas (estndar)
(Figura 39). La parte inferior de la placa muestra el tipo de placa (BR claro) y
un selector para ver
Nombre de destino o de concentracin cuando los pozos se cargan con el
tipo de muestra estndar.
43
Editor de la placa de la barra de mens
La barra de mens en la ventana Editor Plate proporciona los elementos de
men se muestra en la Tabla 15.
Placa de la barra de herramientas del editor
La barra de herramientas en el Editor de placas proporciona acceso rpido a
funciones importantes de placa de carga:
SUGERENCIA: Para cambiar la configuracin predeterminada en la ventana
del editor de la Plata, abierta al Usuario
Preferencias ventana e introduzca los cambios en la lengeta de la placa.
Cuadro 15. Elementos de la barra de men en el Editor de Plata
Guardar archivo Guardar los archivos de la placa
Guardar como Guarda el archivo plato con un nuevo nombre de archivo
Salir Salir del Editor Plate
Tamao de la configuracin Plate Seleccione el tamao de la placa que
refleja el nmero de pozos en el bloque de instrumento. Elija de 384 pozos
para el CFX384,
De 96 pozos para el CFX96
NOTA: Tamao de la placa debe ser el mismo que el tamao del bloque del
instrumento en el que ejecuta el experimento
Placa de elegir el tipo de pozos en la placa que tiene sus
muestras, incluyendo BR BR blanco y transparente. Para
anlisis de los datos precisos, el tipo de placa debe ser el mismo
como la placa y tipo de los utilizados en el experimento
NOTA: Es necesario calibrar los nuevos tipos de placas (pgina 131).
Convenio nmero Seleccionar o cancelar la seleccin de notacin cientfica
Seleccione las unidades de las unidades para mostrar en las hojas de
clculo cuando
realizar la cuantificacin de incgnitas en comparacin con un estndar
curva. Seleccione el nmero de copias, diluciones, micromoles,
nanomoles, picomoles, femtomoles, attomoles,
miligramos, microgramos, nanogramos, picogramos,
femtomoles, attograms por ciento, o
Herramientas del clculo
Ver
Mostrar la informacin de la placa en una vista de hoja de clculo para
exportacin o la impresin
Gua de placa de carga Mostrar una gua rpida sobre cmo configurar una
placa y
carga de los pozos

Mostrar Bueno Notas Seleccionar para mostrar el panel de los controles de
carga tambin.
Escribe una nota acerca de uno o ms pozos
Mostrar Coleccin
Nombre
Seleccione para mostrar este panel en los controles de carga tambin.
Seleccione esta opcin para introducir los nombres de la coleccin de uno o
ms pozos
Ayuda de Contenidos Abiertos de la Ayuda para obtener ms informacin
sobre las placas
Placas
44
Tabla 16 enumera las funciones disponibles en la barra de herramientas del
editor de la Plata.
Tamao de la placa y el tipo de
El software se aplica estos ajustes placa a todos los pozos durante el
experimento:
Tamao de la placa. Seleccione un tamao de la placa que representa el
tamao del bloque de mdulo de reaccin de
su instrumento. La eleccin del tipo de instrumento, o CFX96 CFX384, en el
men desplegable
opcin de men en el Asistente de arranque va a cambiar el tamao de la
placa por defecto carga de la Plata
pestaa de la ventana de Configuracin experimento. En el Editor de la
Plata, seleccionar el tamao de la placa de la
Men de configuracin (ver Tabla 15). Tamao de la placa no se puede
cambiar durante o despus de la
experimento
Tipo de placa. Seleccione pozos claro o blanco en el men Configuracin.
Asegrese de que el
fluorforo ser utilizados en el experimento est calibrado para el tipo de
plato seleccionado
NOTA: CFX96 e instrumentos CFX384 se calibran en fbrica para muchos
fluorescentes
tintes y combinaciones de placas. La calibracin es especfica para el
instrumento, medio de contraste, y
placa de caractersticas. Para calibrar una nueva combinacin de tipo de
medio de contraste y la placa en un instrumento,
seleccione Herramientas> mago de la calibracin (ver "mago de la
calibracin" en la pgina 131)
Tabla 16. Elementos de la barra de herramientas en el Editor de Plata
Funcin Nombre del elemento barra de herramientas
Guardar Guarde el archivo corriente de placa
Zoom Aumentar o disminuir la ampliacin a la vista la placa
Modo de exploracin Seleccione un modo de exploracin para instruir el
instrumento lo
canales para recoger los datos de fluorescencia de durante la carrera.
Seleccionar todos los canales (por defecto), SYBR / FAM solo, o FRET
Grupos bien Abra la ventana de grupos bien Manager y crear as
grupos de la corriente de placa
Ayuda Abrir la Ayuda del software para obtener informacin sobre las placas
Placa de carga
Gua
Mostrar una gua rpida sobre cmo configurar una placa y la carga
los pozos
45
Modo de Escaneo
El sistema detecta CFX96 excita y fluorforos en seis canales. El sistema
CFX384
excita y detecta fluorforos en cinco canales. Ambos sistemas utilizan
adquisicin de datos mltiples
explorar los modos para recopilar datos de fluorescencia de durante la
carrera.
Seleccione uno de estos modos de escaneo int l Editor Plate barra de
herramientas de la ventana:
Todos los canales. Incluye los canales 1 al 5 en el sistema CFX96 o los
canales 1
a 4 en el sistema CFX384
SYBR / FAM solamente. Incluye slo el canal 1, y proporciona un anlisis
rpido
FRET. Incluye solamente el canal de FRET y proporciona un anlisis rpido
Fluorforos Seleccione Ventana
Seleccione las listas de los fluorforosfluorforos ventana que puede ser
seleccionado para la carga de la Plata
Editor y cargar los controles. Para abrir la ventana Seleccionar fluorforos,
haga clic en el botn Seleccionar
Fluorforos botn en el lado derecho del editor de la Plata.
NOTA: Los fluorforos mostradas dependen del modo de exploracin,
cuando SYBR / FAM slo es
elegido, slo el canal 1 fluorforos se muestran en la ventana Seleccione
fluorforos.
NOTA: No se puede agregar o quitar fluorforos de la lista, debe calibrar el
fluorforos nuevo en un instrumento en el mago de la calibracin (pgina
131). Despus de
calibracin, el fluorforo se aade a la ventana Seleccione fluorforo.
Haga clic en la casilla de verificacin junto al nombre del fluorforo para
aadir o eliminar los fluorforos
a la lista en la parte derecha de la ventana del editor de la Plata.
En este ejemplo, SYBR se selecciona de la lista de los fluorforos disponibles
(Figura 40).
Figura 40. Seleccione la ventana fluorforos.

Haga clic en el cuadro de color junto al nombre del fluorforo y seleccionar
un nuevo color para representar
cada fluorforo en la ventana Editor de placas y grficos de anlisis de datos
NOTA: Antes de comenzar la ejecucin, el software verifica que los
fluorforos que
se especifica en la placa se calibran en ese instrumento. No se puede
ejecutar un plato si
incluye fluorforos que no han sido calibrados en ese instrumento.
Placas
46
Los controles de carga, as
Un archivo de la placa contiene informacin sobre el contenido de cada bien
cargado con la muestra de un
experimento. Despus de la ejecucin, el software de los enlaces de los
contenidos y los datos de fluorescencia
recogidos durante el protocolo y se aplica el anlisis correspondiente en la
ventana de anlisis de datos.
Por ejemplo, los pozos cargados con el tipo estndar de la muestra se
utilizan para generar una curva estndar.
Cuando la creacin de un experimento de expresin gnica, considere las

siguientes directrices para as
contenido:
Nombre de destino. Uno o ms objetivos de inters (genes o secuencias)
en cada uno cargado bien.
Cada objetivo se asigna a un fluorforo
Ejemplo de nombre. Un identificador o una condicin que corresponde a la
muestra en cada
carga, tales como "0 horas", "1 hora", o "2 horas"
SUGERENCIA: Los nombres de destino y nombre de la muestra deben
coincidir entre los pozos para comparar los datos
en la ficha de la expresin gnica en la ventana de Anlisis de Datos. Cada
nombre debe contener
la puntuacion mismo y el espacio. Por ejemplo, "actina" no es lo mismo que
"Actina", y "2h" no es lo mismo que "dos horas". Para facilitar la coherencia
en los nombres,
entrar en los nombres de destino y muestra las bibliotecas en la lengeta de
la placa en el usuario
Preferencias de la ventana (pgina 125).
Seleccione un bien para cargar contenido en haciendo clic izquierdo con el
puntero del ratn en la vista de la placa.
Mantenga pulsado el botn del ratn y arrastre para seleccionar mltiples
pozos. Los botones y las listas de lado derecho de la opinin de la placa de
incluir todas las opciones necesarias para cargar los pozos (Tabla 17).
Cuadro 17. Opciones para la carga de la placa y los pozos en el Editor de
Plata
Opcin Funcin
Despus de seleccionar los pozos, el tipo de muestra se debe cargar
en primer lugar. Seleccione un tipo de muestra en el men desplegable para
carga en los pozos seleccionados, incluyendo desconocido,
Estndar, NTC (sin control de la plantilla), control positivo,
Control negativo, y TRN (no de la transcriptasa inversa)
Haga clic en una caja de carga para aadir un fluorforo al seleccionado
pozos, cada fluorforo corresponde a un nombre de destino. A
aadir a la lista de fluorforos de carga, seleccione en el
Fluorforos ventana de seleccin
Para el anlisis de expresin gnica o para distinguir entre
mltiples objetivos, seleccione un nombre en la lista desplegable Nombre
del destino
y pulse la tecla Enter para cargar el objetivo
nombre en el pozo. Para borrar un nombre de destino, seleccinelo, pulse
la tecla Supr, y presione la tecla Enter
TIP: Para agregar un nombre nuevo objetivo para el men desplegable de
la corriente de placa nica, escriba un nombre en el cuadro desplegable
y pulse la tecla Enter
47
Para el anlisis de expresin gnica o para distinguir entre
varias muestras, seleccione un nombre de ejemplo desde el men
desplegable
men a la carga que el nombre de la muestra en el seleccionado
pozos. Para borrar un nombre de la muestra, se selecciona en el men,
pulse la tecla Supr en el teclado, y luego pulse
Intro.
TIP: Para agregar un nombre a la nueva muestra del men desplegable de
la corriente de placa, escriba un nombre nuevo en el cuadro desplegable
y pulse la tecla Enter
Para cargar los nmeros se replican, pozos seleccionados deben contener
idntico contenido bien. Si no lo hacen, el software
desactiva este control de carga
Haga clic en la caja de carga para aadir una rplica a los seleccionados #
pozos. Haga clic en la Replicar # Borrar para borrar la
replicar el nmero de las celdas seleccionadas.
TIP: Para cargar varios nmeros de replicar a travs de una serie de
pozos, haga clic en el botn Reproducir de la serie.
En el panel de la serie Replicar puede aplicar una rplica
serie a un conjunto de pozos seleccionados. Introduzca el Replicar
Tamao del grupo mediante la seleccin de un nmero que representa el
nmero de muestras (pozos) en cada grupo de rplicas.
Seleccionar una rplica # de comenzar a aadir repeticiones.
NOTA: Puede cargar grupos de replicar con replicar
nmeros progresando de izquierda a derecha (horizontal), o
progresando de arriba a abajo (vertical).
Entrar en una concentracin de los pozos seleccionados con la norma
muestra el tipo de edicin o escribiendo un nmero en el
Concentracin de la caja. Para solicitar la concentracin de un
fluorforo en la fuente, seleccione un solo fluorforode
el men desplegable (<Todos>) en la concentracin
box.To eliminar una concentracin, seleccinela, pulse el botn Volver
Espacio en el teclado y luego presione Enter
Seleccione varios pozos con un tipo uniforme de muestra para
activar el botn de la serie de dilucin
Plata (continuacin)
Opcin Funcin
Placas
48
Configuracin del experimento ventana
Para abrir la ventana de Configuracin experimento, siga una de estas
opciones:
En el Editor de la Plata, haga clic en el botn Configuracin del
Experimento
Al analizar los datos en la ventana de anlisis de datos, haga clic en la
configuracin del experimento

botn en la ficha de la Expresin Gnica
Abra la ventana de Configuracin Experimento para ver o cambiar la lista de
objetivos y muestras
(Figura 41) o para establecer la expresin gnica anlisis de grupos de la

muestra a analizar si la coleccin de Los nombres se han aadido a los
pozos.
Haga clic en el botn de la serie de dilucin para introducir una serie de
diluciones
para la concentracin de las muestras estndar, y cargar un
curva estndar
Introduzca la concentracin inicial de la serie de dilucin,
las rplicas de (a partir del nmero de replicar) y
(Que termina el nmero replicar), y el factor de dilucin
(Cantidad a cambio de la concentracin con cada repeticin
grupo). Seleccione creciente de una serie de dilucin que
aumento o disminucin de seleccionar una serie de dilucin que
disminuye. Finalmente, seleccione el fluorforo utilizado para la
serie de dilucin en el men desplegable y haga clic en Aplicar
Seleccione Herramientas> Mostrar Bueno Notas para mostrar este panel.
Entrar
notas acerca de uno o ms pozos mediante la seleccin de los pozos y
escribiendo las notas en el men desplegable. Cualquier notas
aadiendo a la hoja de clculo en la cuantificacin de datos
pestaa (pgina 78)
Seleccione Herramientas> Mostrar Nombre de la coleccin para mostrar
este
panel. Ingrese la informacin recogida de muestras acerca de uno o
ms pozos mediante la seleccin de los pozos y escribiendo una coleccin
nombre en el men desplegable. Cualquier nombre de la coleccin que
agregar a los pozos aparecen en el anlisis de expresin gentica
ventana y permite opciones de agrupacin de la muestra
Haga clic en el botn Configuracin experimento para abrir el
Configuracin del experimento de ventanas para gestionar las listas de
Objetivos y las muestras, y la creacin de una expresin gentica
experimento
Haga clic en la Replicar # Borrar para borrar las repeticiones
nmero de pozos en el seleccionado
Haga clic en el botn Borrar Wells para borrar todos los contenidos en el
pozos seleccionados
NOTA: Al hacer clic en el botn Borrar de forma permanente Wells
elimina el contenido de los pozos.
Plata (continuacin)
Opcin Funcin
49
Objetivos. Una lista de nombres de destino para cada reaccin de PCR,
tales como los genes o secuencias de
de inters. Haga clic en la columna de referencia para asignar genes de
referencia en un experimento
Muestras. Una lista de los nombres de las muestras que indican la fuente
de la meta, como una muestra
tomadas en una hora (1 hora), o tomado de un individuo en particular
("mouse1"). Haga clic en el control
columna para asignar la condicin de control para un experimento
La figura 41 muestra la ficha Destinos con la configuracin de anlisis de
muestra.
Figura 41. Objetivos de la ficha en el experimento ventana de configuracin.

La figura 42 muestra la ficha de la muestra con la configuracin de anlisis
de muestra.
Figura 42. Muestras de la ficha en el experimento ventana de configuracin.

Para ajustar las listas de estas fichas, utilizar las siguientes funciones:
Agregar un destino o nombre de la muestra, escriba un nombre en el
cuadro nuevo y, haciendo clic en Agregar
Retirar un objetivo o nombre de la muestra de la lista, haga clic en el
botn Seleccionar para quitar el cuadro
de esa fila y haciendo clic en los elementos de quitar marcada (s) botn
Seleccione el destino de referencia para la expresin de genes de anlisis
de datos haciendo clic en el cuadro de
en la columna de referencia al lado del nombre para ese objetivo
Placas
50
Seleccionar la muestra como una muestra de control de la expresin
gnica de anlisis de datos, haga clic en
la casilla de la columna de control al lado del nombre de la muestra
Haga clic en el cuadro Configuracin del anlisis muestran en la ventana de
Configuracin del experimento para ver o cambiar
parmetros de anlisis aplicados en la pestaa de expresin gnica.
Para ajustar los parmetros de destino:
Haga clic en una celda de la columna de color para cambiar el color de los
objetivos grafican en la
Gen grfica expresin
Introduzca un nmero para la eficacia de un objetivo. El software calcula la
relacin
eficiencia para el mismo objetivo con eficiencia Auto si los datos para un
objetivo incluye un
curva estndar. Por otra parte, el tipo de una eficacia sin determinar
Para ajustar la configuracin de una muestra en la ficha de muestras:
Haga clic en un color en la columna de color para cambiar el color de las
muestras grficamente en la
Gen grfica expresin
Haga clic en una casilla de la columna Mostrar grfico para mostrar la

muestra en la expresin gnica
grfico con un color que est seleccionado en la columna de color
Nombre de la muestra Agrupacin Opcin
Cargando nombres de las colecciones en los pozos permite muestras a
analizar en una de las cuatro
configuraciones definidas por la opcin de la muestra Agrupacin nombre.
Estas opciones estn disponibles
desde el men desplegable en la pestaa Configuracin experimento.
Destino vs Muestra
Destino vs Coleccin
Destino vs Sample_Collection
Destino vs Collection_Sample
Bueno Grupos Gestor de ventanas
Grupos bien dividir una sola placa en subconjuntos de los pozos que pueden
ser analizados de forma independiente en
la ventana de Anlisis de Datos. Una vez que los grupos y se establecen,
seleccione uno en el anlisis de datos
ventana para analizar los datos en un grupo independiente. Por ejemplo,
crear grupos, as que
analizar los mltiples experimentos se ejecutan en un plato, o para analizar
cada grupo y con diferentes curvas estndar.
NOTA: El grupo por defecto y es uno de los pocillos.
Crear grupos bien
Para crear los grupos y en la ventana del Administrador de Grupos Bueno,
siga estas instrucciones:
1. Haga clic en el botn de grupos bien en la barra de herramientas del
editor de la Plata.
2. Haga clic en Agregar para crear un nuevo grupo. El men desplegable
muestra el nombre del grupo como el Grupo
1 para el primer grupo.
3. Seleccione los pozos que componen el grupo y en la vista de la placa y
haciendo clic en
arrastrando a travs del grupo de pozos. Pozos seleccionados a su vez de
color azul (Figura 43).
4. (Opcional) Cambie el nombre del grupo, seleccione el nombre del grupo
en el men desplegable
men y escribir un nuevo nombre.
51
5. (Opcional) Crear grupos de ms y repitiendo los pasos 1 y 2.
6. (Opcional) Elimine los grupos y seleccionando el nombre del grupo en la
lista desplegable, y
clic en el botn Eliminar.
7. Haga clic en Aceptar para finalizar y cerrar la ventana, o en Cancelar para
cerrar la ventana sin
hacer los cambios.
Figura 43. Color de los pozos en la ventana del Administrador de Grupo

Bueno.
Hoja de clculo Plate la ventana de visualizacin
La hoja de clculo Plate ventana Vista muestra el contenido de una placa en
el Editor de la Plata. Abierto
la hoja de clculo Plate Ver ventana (Figura 44), seleccione Herramientas>
Ver hoja de clculo Mostrar
en la barra de men del editor de Plata.
Figura 44. Hoja de clculo Plate Ver ventana.

Placas
52
Abra la vista de hoja de clculo para importar o exportar el contenido bien a
Excel oa otro TabDelimited
formato:
Haga clic en Importar plantilla para importar los contenidos y de un
archivo delimitado por comas
Haga clic en Exportar plantilla para exportar contenidos y en el archivo de
Excel (. Csv)
Ordenar o editar una columna, seleccinela y uso de estos mtodos:
Ordenar la hoja de clculo de acuerdo a los datos de una columna
haciendo clic en el diamante
al lado de un nombre de columna
Editar el contenido de una columna que tiene un asterisco (*) en la parte
superior, haga clic y escribiendo
cada pozo
NOTA: Seleccione las unidades de los datos de la curva estndar en la
columna de Cantidad por
abrir el Editor de Plata y seleccionando Configuracin> Unidades en la barra
de men. Despus de la
funciona la placa, los datos de estas normas aparecen en la tabla de la
curva estndar de la
Ficha de cuantificacin (ventana de Anlisis de Datos) con las unidades que
usted seleccione. Abrir
la hoja de clculo para importar o exportar el contenido de la placa de Excel
o de otra
TabDelimited formato.
Haga clic derecho en la hoja de clculo para seleccionar una de estas
opciones en el men del botn derecho:
Copia. Copia de la hoja de clculo completa
Copiar como imagen. Copia de la hoja de clculo como archivo de imagen
Impresin. Imprimir la hoja de clculo
Seleccin de impresin. Imprimir slo las celdas seleccionadas
Exportacin a Excel. Exportar el archivo como un archivo de Excel con
formato
Exportar a texto. Exportar el archivo como un archivo de texto
Buscar. Bsqueda de texto en la hoja de clculo
Ordenar. Ordenar la hoja de clculo mediante la seleccin de un mximo
de tres columnas de datos en la ventana para ordenar
53
6 Funcionamiento autnomo
Lea este captulo para obtener informacin sobre la ejecucin del sistema de
CFX96 o CFX384 sistema
modo independiente:
Panel de control (continuacin)
Men principal (pgina 54)
Montaje del ensayo (pgina 55)
Exportacin de datos para el anlisis (pgina 61)
Creacin de un archivo de datos (pgina 64)
Configuracin del correo electrnico (pgina 65)
Panel de control
El panel de control en el termociclador C1000 proporciona acceso a todas
las funciones necesarias para
ejecutar el instrumento que utilizan los siguientes tres componentes:
Pantalla de cristal lquido (LCD): Muestra el men principal y otras
pantallas
Teclado: navegar por las pantallas e introducir comandos con las teclas
Puerto USB: Conecte un dispositivo USB, el ratn o el teclado.
La figura 45 muestra los componentes del panel de control:
Figura 45. Panel de control trmocicladora.

Las teclas de funcin
Protocolo
Comando
Alfanumrico
LCD
Puerto USB
(Continuacin)
las claves
Navegacin
las claves
AutoWriter clave
las claves
Funcionamiento autnomo
54
El panel de control consta de cinco juegos de llaves con las funciones
enumeradas en la tabla
Tabla 18:
Men Principal
Cuando se inicia, el sistema o el sistema de CFX96 CFX384 funciona un
auto-test para verificar las funciones propias,
y luego muestra el men principal. Use el men principal para empezar a
operar el instrumento. La
men principal permite acceder a todas las operaciones del sistema,

muestra la fecha y la hora, el nombre de
el usuario conectado, el estado del sistema, el tipo de mdulo de reaccin y
el nombre del termociclador,
y cualquier S1000 adjunta termocicladores (Figura 46).
NOTA: Para cambiar el nombre del termociclador, abra la biblioteca de
archivos (archivos (F2) botn) y
a continuacin, seleccione Cambiar el nombre de Ciclador.
Tabla 18. Funciones de las teclas del panel de control
La tecla de funcin
Teclas de comando
Seleccione Ejecutar y ejecutar un protocolo de
EDICIN Seleccionar protocolo y el cambio
ESTADO Ver el estado de uno o ms protocolos de funcionamiento
VER cambiar entre la vista grfica y el texto de un protocolo de
TECLAS DE FUNCIN
F1, F2, F3, o nombres de botones de funcin F4 "y cambiar las funciones de
cada pantalla
Teclas alfanumricas
Del 1 al 9 Introduccin de nmeros o letras del alfabeto. Pulse una tecla
varias veces para cambiar a cada letra asociada
0, incubar Inserte un cero (infinito), o iniciar la incubacin inmediata
punto decimal (.) Introduzca un punto decimal
el signo menos (-) Introduzca un signo negativo
Protocolo AutoWriter
Inicie el Protocolo AutoWriter
Teclas de navegacin
Flecha a la derecha Mueve el cursor a la derecha
Izquierda Mueve el cursor hacia la izquierda
UP cursor de flecha Mover hacia arriba
ABAJO cursor de flecha Mover hacia abajo
Entrar confirmar un ajuste
VOLVER cancelar una funcin. Borrar una letra, nmero o palabra
55
Figura 46. Pantalla de inicio en el panel frontal.

Para iniciar las funciones en el men principal, pulse las teclas de funcin
asociada (F1 a F4):
Iniciar sesin (F1). Inicie sesin en el termociclador C1000. Una vez que
ingrese el nombre del botn
cambios para cerrar la sesin
Archivos (F2). Ver los archivos y carpetas en la biblioteca de archivo
Servicios pblicos (F3). Abra el men Herramientas
El nuevo Protocolo (F4). Crear un nuevo protocolo
Montaje del ensayo
El sistema CFX96 o el sistema de CFX384 puede ejecutar en tiempo real los
experimentos de PCR sin
equipo. Puede exportar los datos de fluorescencia adquiridos durante la
carrera con la memoria USB
clave. Tambin puede optar por tener los datos por correo electrnico
directamente a usted, si la base es C1000
conectado a la internet y la funcionalidad de correo electrnico se ha
configurado (consulte "Exportacin de datos
Uso del correo electrnico "en la pgina 62). Los datos requiere un software
de Administrador de CFX para su anlisis.
NOTA: La C1000 tiendas termociclador a 20 en tiempo real PCR experimento
funciona.
56
Para crear un nuevo experimento:
1. Seleccione Nuevo Protocolo (F4) en la pantalla de inicio para abrir una
plantilla de un nuevo protocolo
(Figura 47).
Figura 47. Default PCR en tiempo real del protocolo.

NOTA: Por defecto, el modelo de protocolo contiene una placa de leer el
paso cuando un CFX96
o un mdulo de CFX384 reaccin ptica es insertado en el chasis C1000.
SUGERENCIA: Para cambiar un protocolo existente, presione la tecla de
comando Editar para abrir el archivo
biblioteca y seleccione un protocolo para editar.
2. Para cambiar la temperatura deseada y el tiempo de espera en un paso
de temperatura, presione las teclas de flecha para navegar entre los pasos
y para seleccionar un parmetro (la temperatura o el tiempo).
Presione las teclas alfanumricas para introducir un nuevo nmero para
cada parmetro que destacar.
Consejo: conecte un ratn de la computadora mediante un puerto USB en el
chasis C1000 para navegar.
NOTA: Pulse la tecla VIEW para cambiar entre la vista grfica y el texto de la
protocolo.
3. (Opcional) Para insertar un nuevo paso, seleccione la opcin Insertar (F1)
botn. Para eliminar un paso, seleccione la
Delete (F3) botn (Figura 47).
4. (Opcional) Para cambiar las opciones de paso, seleccione las opciones
(F4) botn (Figura 47). En el Paso
Ventana de opciones, seleccione un parmetro para el cambio, incluyendo la
temperatura y el tiempo de
el paso, o aadir / quitar una placa de leer con el paso (Figura 48)
Figura 48. Opciones de Paso de la ventana.

57
NOTA: Presione las teclas alfanumricas para introducir un rango de
gradiente que va desde 1 a
24oC.
Consejo: Una vez un paso tiene una pendiente, puede editar las
temperaturas altas y bajas en
el punto de vista grfico o texto sin necesidad de abrir la pantalla de
opciones.
5. El paso GOTO instruye el termociclador para repetir un conjunto de
medidas en un bucle para crear
los ciclos en el experimento de PCR. Seleccione un paso GOTO, pulsar las
teclas de flecha para seleccionar
y luego editar el nmero del paso en un paso GOTO o para cambiar el
nmero de repeticiones.
Entrar en el nombre del protocolo:
Al crear un nuevo protocolo, usted tiene la opcin de guardarlo con un
nombre. Utilice el
teclas de flecha para desplazarse hasta el cuadro Nombre de Protocolo y
pulse las teclas alfanumricas
las teclas varias veces para entrar en una letra o nmero que escriba un
nombre nuevo protocolo
(Figura 47 en la pgina 56).
Presione ENTER para aceptar el nombre.
Cambiar los parmetros de ejecucin:
Para cambiar el volumen de la muestra por defecto, seleccione la casilla
de volumen de muestra (Vol) (Figura 47
en la pgina 56). Utilice las teclas alfanumricas para introducir un volumen
de muestra nueva en microlitros.
El volumen de la muestra se introduce determina el modo de control de la
temperatura que se utiliza
durante una carrera
SUGERENCIA: Introduccin de un volumen de muestra 1 a 50 selecciona el
modo de control de temperatura,
que es el modo estndar. Entrar en cero (0) selecciona el modo de bloqueo.

Temperatura
es el modo recomendado, ya que la mayora de los representa con exactitud
la real
temperatura de la muestra.
Para cambiar la temperatura de la tapa por defecto, seleccione la casilla
de la temperatura tapa (LID) por
pulsando las teclas de flecha (Figura 47 en la pgina 56). Utilice las teclas
alfanumricas para introducir
una nueva temperatura. Para que el sistema CFX96, utilice una temperatura
de 105 C la tapa, para la
CFX384 sistema de uso de una temperatura de 95 C de la tapa
NOTA: El calentamiento de la tapa evita la condensacin en los recipientes
de reaccin sellado.
La ejecucin del Protocolo:
1. Para ejecutar el protocolo, haga clic en el Hecho (F2) en la ventana de
Protocolo (Figura 47 en la pgina
56).
CONSEJO: Tambin puede hacer clic la tecla de comando RUN para iniciar la
ejecucin sin guardar o
editar el nombre del protocolo.
58
2. Escriba un nombre de protocolo, si usted tiene no lo ha hecho, o de
modificar el nombre con anterioridad
creado en la ventana de Protocolo. Utilice las teclas de flecha para
seleccionar una carpeta de destino (Figura 49).
Figura 49. Ahorro de un protocolo.

3. Haga clic en Editar Nombre (F1) y escriba un nombre nuevo en el cuadro
(Figura 50).
Figura 50. Introducir un nombre de protocolo.
4. Haga clic en Guardar (F2) (Figura 50).

59
5. Haga clic en Ejecutar (F2) para continuar y ejecutar el protocolo (Figura
51).
Figura 51. Protocolo guardado con xito.

6. Editar el volumen de muestra o la temperatura tapa que se utilizarn
para la carrera (Figura 52).
7. Introduzca el ID de la muestra o de usuario que se registra en la pantalla
de informacin en Ejecutar.
Figura 52. Edicin de un volumen de muestra y la temperatura de la tapa.

8. Haga clic en Aceptar (F1) para continuar.
60
9. Seleccione un modo de exploracin para instruir el instrumento en el que
los canales para recoger la fluorescencia
los datos durante un plazo (Figura 53).
Figura 53. Modo de exploracin y el nombre del archivo de datos.

Modos de escaneo detectar fluorforos calibrado en estos canales:
Todos los canales. Recoge datos de los canales 1 al 5 en el sistema CFX96,
o
los canales 1 a 4 en el sistema CFX384
SYBR / FAM solamente. Recoge nicamente los datos de un canal en
cualquier sistema, y proporciona un rpido
escanear
FRET. Recopila datos slo desde el canal de FRET en cualquier sistema y
proporciona un rpido
escanear
Por defecto 10.A independiente nombre de archivo de datos se crea antes
de la carrera. Si desea cambiar la
nombre, utilice las teclas de flecha para desplazarse hasta el cuadro
Nombre de archivo de datos y pulse el
teclas alfanumricas para introducir una letra o nmero que escriba un
nuevo archivo de datos (. zpcr) nombre.
11.Haga clic en el botn OK (F1) para iniciar la carrera.
Ejecucin de un protocolo previamente guardadas
Para cambiar un protocolo existente, presione la tecla EDIT para abrir la
biblioteca de archivo y seleccione
un protocolo para editar
Para ejecutar un protocolo existente, presione la tecla de comando RUN y
seleccione una previamente
protocolo de salvado de la biblioteca de archivo
NOTA: Pulse la tecla RUN desde cualquier pantalla para abrir la biblioteca de
archivo y seleccione una
carpeta para localizar un archivo de protocolo para ejecutar
Supervisin de un plazo
Cuando comienza una carrera, la ventana de estado de ejecucin aparece.
Revise la informacin en esta ventana para
monitorear el progreso de la carrera.

Estado. Pulse la tecla de comando STATUS para comprobar el estado
actual del protocolo,
una pausa en la ejecucin, cancelar a correr, saltar un paso, o acceder al
men principal (Figura 54)
61
el estado del tiempo. Pulse la tecla de comando para ver una pantalla
completa la cuenta atrs del temporizador
el protocolo. Pulse la tecla VIEW de nuevo para volver a la pantalla de
estado.
Figura 54. La monitorizacin del estado de ejecucin.

Exportacin de datos para el anlisis
Cuando la carrera ha terminado, los datos de fluorescencia debe ser
transferido a un equipo que ejecuta
CFX software de gestin para su anlisis. El archivo de datos independiente
se guarda automticamente en la
Carpeta RT_DATA encuentra en la carpeta del sistema (Figura 55).
Figura 55. Carpeta RT_DATA tiendas en tiempo real PCR se ejecuta.

Los datos pueden transferirse al ordenador utilizando el anlisis de una llave
USB, o puede ser enviado por correo electrnico directamente

el equipo con el servidor SMTP una vez que una conexin de correo
electrnico est configurado.
NOTA: La C1000 permite almacenar hasta 20 en tiempo real se ejecuta
experimento de PCR.
Exportacin de datos Uso de la llave USB
Si una llave USB se ha colocado en un puerto USB en el termociclador
C1000, los datos (. Zpcr)
se guardar automticamente en el directorio raz de la llave USB.
Si una llave USB no est en el termociclador en la final de la carrera, siga
estas instrucciones:
1. Prensa de los archivos (F2) botn en la pantalla principal para acceder a
las carpetas de archivos.
62
2. Utilice las teclas de flecha hacia arriba y hacia abajo para desplazarse a la
carpeta RT_DATA y pulse latecla de flecha derecha para abrir la carpeta.
3. Seleccione el archivo usando las teclas de flecha hacia arriba y hacia
abajo.
4. Pulse el archivo de exportacin (F1) para exportar una copia de los datos
de ejecucin (. Zpcr) a la llave USB,
como se muestra en la Figura 56.
Figura 56. Exportacin de stand-alone datos de la carrera en una llave USB.

5. Utilice las teclas de flecha para acceder a la carpeta del USB en el que
desea guardar el archivo.
6. Haga clic en S (F1) para confirmar la exportacin (Figura 57).
Figura 57. Confirmacin de exportacin a la llave USB.

Exportacin de datos de uso del correo electrnico
Usted puede optar por correo electrnico sus datos a usted directamente de
la cicladoraC1000 trmica despus de la carrera
se completa mediante la configuracin de los ajustes de correo electrnico
(consulte "Configuracin de correo electrnico" en la pgina 65).
63
Para enviar un correo electrnico con datos adjuntos (. Zpcr) al final de una
carrera, siga estas instrucciones:
1. Despus de guardar el nombre del protocolo o la seleccin de un
protocolo de la biblioteca de archivos utilizando
la tecla de comando Ejecutar, seleccione Opciones (F4) en la pantalla de
informacin de ejecucin (Figura 58).
Figura 58. Ejecutar la pantalla de informacin.

2. Utilizando las teclas de flecha para seleccionar la opcin Enviar correo
electrnico de notificacin (Figura 59).
Figura 59. Seleccin de notificacin por correo electrnico.

3. Haga clic en Aceptar (F1) para regresar a la pantalla de informacin en
Ejecutar.
4. Utilice las teclas de flecha para desplazarse a la caja de direccin de
correo electrnico y luego utilice el teclado
teclas para introducir el nombre de una direccin de correo electrnico.
64
5. Haga clic en Aceptar (F1) para continuar a realizar el ensayo.
Figura 60. Confirmacin de exportacin a la llave USB.

Creacin de un archivo de datos
Los datos independiente de ejecucin (. Zpcr) de datos debe ser convertido
en un archivo de datos (. PCRD) por CFX
Software de gestin de con el fin de ser analizado. Siga estas instrucciones
para crear un archivo de datos de un
independiente de ejecucin.
1. Haga clic y arrastre el archivo. Zpcr desde el directorio de memoria USB
en la ventana principal del software,

o Seleccione Archivo> Abrir> Stand-alone Ejecutar en el men principal de
opciones de software de la ventana
para seleccionar el nombre del archivo.
2. En la ventana Ejecutar procesador de archivos haga clic en el botn
Seleccionar Plate para importar el nombre de
el archivo de la placa del software a utilizar para crear el archivo de datos
(Figura 61).
Figura 61. Asignacin de un archivo de placas.

65
NOTA: El software CFX gerente controla el modo de exploracin y tamao de
la placa de la placa
archivo, estos deben coincidir con las configuraciones de ejecucin actual
que se iniciaron durante el
experimento.
SUGERENCIA: Carga un archivo de fijacin rpida para acceder rpidamente
a los datos de todos los pozos.
Configuracin del correo electrnico
Despus de una carrera, un archivo. Zpcr pueden ser enviados directamente
a un ordenador con software CFX Manager.
Para configurar el correo electrnico saliente del termociclador C1000, sigue
estas instrucciones:
1. Conecte un cable Ethernet al puerto en la parte posterior del chasis
C1000.
2. En el men principal, seleccione Log In (F1) para iniciar sesin en el
termociclador como administrador

(Figura 46 en la pgina 55).
NOTA: La sesin en el nombre de usuario aparece en la fecha y hora de
regreso
a la ventana principal.
3. Seleccione Utilidades (F3) en la pantalla principal (Figura 46 en la pgina
55) para poner en marcha los servicios pblicos
men.
4. En el men Herramientas, seleccione 5: Configuracin de administrador
(Figura 62).
Figura 62. Men Utilidades.

66
5. En el men de configuracin del administrador, seleccione 9:
Configuracin del servidor SMTP (Figura 62).
Figura 63. Administrador de Configuracin de la ventana del men.

6. Pngase en contacto con su administrador de red para su el nombre del
servidor SMTP.
NOTA: El nombre del servidor SMTP es proporcionado por su ISP.

7. Seleccione Agregar nombre del servidor (F1) (Figura 64).
Figura 64. Configuracin de servidor SMTP de la ventana.

8. Escriba el nombre del servidor en el cuadro de texto usando el teclado
virtual.
NOTA: El nombre del servidor SMTP utilizar la siguiente nomenclatura:
SMTP.YourInstitution.com. No utilice Bio-Rad.com en el nombre.
67
9. Haga clic en Guardar (F1) para guardar el nombre del servidor SMTP
(Figura 65).
Figura 65. Ahorro de nombre de servidor.

10.El agreg el nombre de servidor aparece en el nombre del servidor SMTP
en el men desplegable, como muestra en la Figura 66.
Figura 66. Agreg el nombre de servidor.

11.Seleccione el conjunto de servidores actual (F3) para configurar el
servidor actual que se utiliza para el correo electrnico (Figura 66).
68
12.Use las teclas de flechas para seleccionar el botn de prueba del servidor
actual y haga clic en la tecla Intro
botn de navegacin (Figura 67).
Figura 67. Pruebe el servidor actual.

13.Type una direccin de correo electrnico en el cuadro de texto y
seleccione Servidor de prueba (F1) (Figura 68).
Figura 68. Ingrese correo electrnico para probar el servidor actual.

14.El C1000 termociclador enviar un correo electrnico a la direccin
indicada como una prueba de la
Configuracin del servidor SMTP.
NOTA: Algunos servidores SMTP no permiten que los archivos adjuntos, y
permitir que otros
adjuntos slo hasta ciertos tamaos. Si va a utilizar el software CFX
Manager o el
C1000 chasis a los archivos de datos de correo electrnico y / o informes, es
posible que desee probar su
la capacidad del servidor de correo electrnico archivos adjuntos, marcando
la casilla Adjunto de prueba, y
establecer el tamao del archivo adjunto en MB con un mximo de 5
megabytes (MB) o ms.
69
7 Anlisis de Datos Descripcin
Lea este captulo para obtener informacin sobre el anlisis de datos:
Anlisis de datos de la ventana (abajo)
Cuantificacin de la ficha (pgina 72)
Grupos de Bueno (pgina 73)
Anlisis de los datos de configuracin (pgina 73)
selectores Bueno (pgina 75)
Grficas (pgina 78)
Hojas de clculo (pgina 79)
Anlisis de datos Ventana
Durante el anlisis de datos, cambiando la forma de los datos se muestran
al cambiar el contenido de
pozos en el Editor de placas no cambia los datos de fluorescencia que se
obtuvieron de cada
bien durante la carrera. Una vez que el mdulo recoge los datos de
fluorescencia no se pueden eliminar los datos,
pero usted puede optar por eliminar los datos de la vista y el anlisis.
Para cambiar el contenido de los pozos despus de una carrera, abra el

Editor Plate haciendo clic en el men Edicin / Vista
Placa en la parte superior de la ventana de Anlisis de Datos.
SUGERENCIA: Puede agregar o editar informacin sobre el contenido del
pozo antes, durante,
o despus de ejecutar el experimento de PCR en tiempo real. Debe asignar
el modo de exploracin y
tamao de la placa antes de la carrera, y estos parmetros no se puede
cambiar despus de la carrera.
Software CFX Gerente de procesos de datos en tiempo real PCR
automticamente al final de cada carrera,
y abre la ventana de anlisis de datos para mostrar estos datos. Elija uno de
estos mtodos para
abrir archivos de datos existentes en la ventana de Anlisis de Datos:
Arrastre un archivo de datos (. PCRD extensin) sobre la ventana principal
del software y lo liberan
Seleccione Archivo> Abrir> Archivo de datos en la ventana principal del
software para seleccionar un archivo en el
Las ventanas del navegador
Haga clic en el botn de Anlisis de Datos en la barra de herramientas de
software de la ventana principal para seleccionar un archivo en
el explorador de Windows
Seleccione Archivo> Archivos de datos recientes para seleccionar de una
lista de los diez ms reciente apertura
archivos de datos
Anlisis de Datos Descripcin
70
La ventana de anlisis de datos muestra hasta nueve pestaas (Figura 69).
Cada pestaa muestra los anlisis
los datos de un mtodo de anlisis especfico:
Figura 69. Todas las fichas que se pueden mostrar en la ventana de Anlisis
de Datos.
El software slo se muestra una ficha en la ventana de anlisis de datos si
los datos se recogen en el
ejecutar y los datos estn disponibles para ese tipo de anlisis. Por ejemplo,
la curva de fusin y fusin
Datos de la curva las pestaas no aparecen si el experimento no incluye un
paso de curva de fusin.
Barra de herramientas de anlisis de datos
La barra de herramientas en la ventana de Anlisis de Datos (Figura 70)
proporciona acceso rpido a los datos importantes
funciones de anlisis.
Figura 70. Barra de herramientas en la ventana de Anlisis de Datos.

La Tabla 19 enumera las funciones de los botones en la barra de
herramientas.
Cuadro 19. Barra de herramientas en la ventana de Anlisis de Datos
Botn de la barra Nombre de la funcin
Guardar Guarda el archivo de datos actual
Estilo trace Abrir ventana de Estilo
Informe abrir un informe para el archivo de datos actual
Ver / Editar Plate Abra el Editor del Plata para ver y editar el contenido de
los pozos
Grupos bien ...Seleccione un nombre de grupo y en el men desplegable.
La seleccin predeterminada es todos los pozos
Ayudar a abrir el sitio de ayuda del software para obtener ms informacin
sobre el anlisis de datos
71
Anlisis de los datos de la barra de mens
La barra de mens en la ventana de Anlisis de Datos (Figura 71)
proporciona estos elementos de men:
Figura 71. Barra de men en la ventana de Anlisis de Datos.

Tabla 20 enumera las funciones de los elementos de la barra de mens.
Cuadro 20. Los elementos del men de barras en la ventana de Anlisis de
Datos
Guardar archivo Guarde el archivo
Guardar como Guarda el archivo con un nombre nuevo
Repitiendo el experimento Extracto del protocolo y archivo de la placa
experimento actual para volver a ejecutar
Salir Salir de la ventana de Anlisis de Datos
Ver registro de ejecucin Abra una ventana de Registro de ejecucin para
ver la carrera
registro de los archivos de datos
Anlisis de la configuracin de seleccin del modo de lnea de base mtodo
de sustraccin
los grupos seleccionados y en los datos
C (t) Determinacin de seleccin del modo de regresin o nico umbralel modo de determinar la forma en C (t) son
calculado para cada traza
Los umbrales de referencia Abra la ventana de lnea de base a los umbrales
ajustar la lnea de base o el umbral
Estilos traza Abra la ventana Seguimiento Estilos

Ver / Editar Plate Abra el Editor del Plata para ver y editar la
placa
Destacando ratn Activar o desactivar la simultnea
destacando de datos con el ratn
puntero
SUGERENCIA: Si el ratn Destacando se apaga,
a continuacin, mantenga presionada la tecla Control para
temporalmente a su vez en el relieve
Los valores de umbral de visualizacin de pantalla el valor de la lnea de
umbral en
la tabla
Informes de herramientas Abrir el Informe de este archivo de datos
Calibracin de importacin fluorforo Seleccione un archivo de referencia
para aplicar a la
archivo de datos actual
Vuelva a colocar placas Reemplace el archivo corriente de placa en los datos
anlisis
Todas las hojas de datos de exportacin a Excel Exportar todos los puntos de
vista de hoja de clculo
todas las pestaas por separado a un formato Excel
expediente
Ayuda software de cdigo abierto para ms informacin
sobre el anlisis de datos
Anlisis de Datos Descripcin
72

CFX96 ™ y CFX384 ™ en Tiempo Real

Загружено:

Сведения о документе

Оригинальное название

Авторское право

Доступные форматы

Поделиться этим документом

Поделиться или встроить документ

Параметры публикации

Этот документ был вам полезен?

Это неприемлемый материал?

Авторское право:

Доступные форматы

CFX96 ™ y CFX384 ™ en Tiempo Real

Загружено:

Авторское право:

Доступные форматы

CFX96 y CFX384 en

Copyright 2008 Bio-Rad reproduccin Laboratories, Inc., en cualquier

LICENCIA DE AVISO AL COMPRADOR

Tabla 1. Bio-Rad recursos

Cmo ponerse en contacto

Convenciones de Escritura Utilizadas en

Se proporciona informacin til e instrucciones, incluida la

Se proporciona informacin importante, incluyendo la

Explica una informacin muy importante acerca de algo que

Seleccionar X y Y a continuacin, seleccione desde la

Para obtener informacin sobre las etiquetas de seguridad utilizados en este

Seguridad y Cumplimiento Normativo

Etiquetas de Advertencia de Seguridad

Advertencias instrumento de seguridad

Advertencia sobre el riesgo de dao al cuerpo o del equipo.

Especificaciones del Uso Seguro y

Temperatura ambiente de15-31oC. humedad relativa

los requisitos aplicables de la siguientes normas de seguridad y

Requisitos del sistema.

Estudio de genes Informe de la ventana.

Herramientas de ayuda del software.

CFX96 y CFX384 Manual de Sistemas

Lea este captulo para obtener informacin sobre la configuracin

Desembalaje del mdulo de reaccin ptica (abajo)

Desembalaje del mdulo de reaccin ptica

Requisitos del sistema

El sistema CFX96 o sistema CFX384 incluye dos componentes:

Figura 2. Vista interior del sistema CFX96.

CFX96 y CFX384 Manual de Sistemas 3

Figura 3. Panel trasero de C1000 termociclador.

ADVERTENCIA! Evite el contacto con el panel posterior de la C1000

Configuracin del sistema

Figura 4. Levantar el mdulo de reaccin ptica en el chasis C1000.

en la baha del chasis, el mdulo ptico se debe cubrir el Bio-Rad logotipo

Figura 5. El bloqueo del mdulo ptico en su lugar.

Figura 6, marque el espacio que rodea la parte inferior del mdulo.

NOTA: Si el espacio entre el mdulo y la base de C1000 es desigual, vuelva

Figura 7. Instrucciones para retirar el tornillo de envo.

Software CFX Manager es ejecutado en un ordenador PC, ya sea con el

1GB RAM (2 GB de Windows

NOTA: La ejecucin de un sistema CFX96 CFX384 o con el software de

1. El software debe estar instalado en la computadora de un usuario con

Figura 8. Software pantalla de instalacin.

Figura 9. Asistente para hardware nuevo.

Figura 10. Software (driver) de instalacin de la pantalla.

CFX96 y CFX384 Manual de Sistemas

Los experimentos en ejecucin

Recomendada de consumo de plstico

TCS-0803. ptica plana de 8 cap tiras, para tubos de 0,2 ml y placas

ADVERTENCIA! La tapa se mueve lentamente al principio, y luego aumenta

NOTA: Para el anlisis de datos precisos, compruebe que la orientacin de

Tubo de llenado tira

software de Administrador de CFX.

Ventana principal del software

2 Introduccin al Software Manager CFX

Figura 13. La ventana principal del software.

Figura 14. El lado izquierdo de la barra de estado en la ventana principal del

Figura 15. Lado derecho de la barra de estado en la ventana principal del

Figura 16. Barra de men en la ventana principal del software.

Crear un nuevo protocolo, la placa, la

Abra el Asistentede inicio

Mostrar u ocultarla ventana principaldel

Ver registro deBloque