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Los parciales genes bacterianos 16S rRna (los fragmentos de 16S rDna
son alrededor de 230 bp) que fueron amplificados con el cebador directo
F357 (5-CCT ACG GGC AGC AG-3) Y el cebador reverso R518 (5-ATT
ACC GCG GCT GCT GG-3) ( Zhou et al., 1996). Como cebador directo,
una base de 40 GC abrazadera ( 5-CGC CCG CCG CGC GCG GCG GGC
GGG GCG GGG GCA CGG GGG G-3) se aadieron al extremo 5 para
estabilizar el comportamiento de fusin de los fragmentos de ADN. Las
PCR se presentaron con la aplicacin del biosistema gen al sistema PCR
amp 2700. Las siguientes condiciones del ciclo fueron usadas por el par
de cebadores: 95C por 15 min ( para la activacin enzimtica y la
desnaturalizacin del destino), seguidos por 20 ciclos de 95C por un
minuto, 65C (reducido por 0.5C cada ciclo) por 45s, y 72C por 1min;
10 ciclos de 95C por 1 min, 55C por 45s, y 72C por 1min, y una
extensin final a 72C por 5min.
1.6)
Anlisis DGGE
El sistema Dcode para DGGE( bio rad laboratorio) fue esado. Se cargaron
muestras en 10% polyacrylamide-bisacrylamide (37.5:1) geles,
teniendo gradientes de desnaturalizacin de 35% a 60% ( donde el
100% es 7mol/L urea y 40% (v/v) formamida desionizada) en 1xTAE
tampn de electroforesis. La electroforesis se llevo a cabo en 180V a una
T de 60C para 4.5h. los geles se tiieron con EB en 1Xtae durante 30
min a temperatura ambiente y observados bajo iluminacin ultravioleta.
Las bandas de inters fueron extirpados y el ADN fue eludido con un
volumen igual de tampn de difusin (0.5 mol/L acetato de aminio,
10mmol/L acetato de magnesio, 1 mmol/L EDTA (ph=8) y 0.1% (wt/v)
dodecil sulfato de sodio) a 50C por 30min. La solucin resultante (1ul)
se utilizo ADN objetivo para la siguiente amplificacin PCR con
cebadores F357 y R518. La pureza y la posicin correcta de ejecucin se
confirmaron por un anlisis DGGE adicional.
1.7)
Analisis biolgico
Discusin de Resultados
la contaminacin del suelo con metales pesados puede tener un efecto
perjudicial sobre la actividad y funcin microbiana. contaminacin de metales
pesados disminuye la respiracin del suelo y la biomasa microbiana y dificulta
la descomposicin de la hojarasca en el suelo. en este estudio, los suelos
contaminados de la muestra alrededor de la mina de plomo y zinc haban sido
objeto de contaminacin durante un largo perodo de tiempo. los cambios en la
estructura de la comunidad microbiana alrededor de la mina de plomo y zinc
de relaves podran ilustrar los cambios reales en las tesis comunidades de
organismos microbianos en suelos contaminados con Cd, Pb, y Cr. suelos
alrededor de la mina de plomo y zinc haban recibido altas cantidades de
metales pesados como el Cd y Pb, que fueron consideradas como
contaminantes dominantes en este estudio, la diversidad disminucin
comunidad microbiana fue encontrada usando el mtodo de BIOLOG.
muchos estudios han demostrado que incluso pequeas cantidades de metales
pesados en el medio ambiente tienen efectos perjudiciales en todos los