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TEMA 4
Como su nombre indica los aminoácidos son compuestos que poseen un grupo
amino (-NH2 ) y un grupo ácido (carboxílico -COOH) en su estructura. Los
aminoácidos son los precursores de los péptidos y las proteínas, y en ellos el grupo
amino y el grupo carboxilo, se encuentran unidos al mismo átomo de carbono,
conocido como carbono-É (É-aminoácidos) . La estructura general de los É-
aminoácidos (a excepción de la prolina, que es cíclica) se muestra en la Figura 1.
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Figura 1.
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· Neutros o apolares
· Polares sin carga
· Polares con carga negativa
· Polares con carga positiva
Neutros o Apolares. jon 8 los aminoácidos que se cla sifican como poseedores de
cadenas laterales no polares. La alanina, valina, leucina e isoleucina , poseen
cadenas laterales de hidrocarburos alifáticos. La metionina posee una cadena
lateral de éter tiólico ( C-S-C). La prolina es el único aminoácido cíclic o, pues el
grupo -R se cierra sobre el N del grupo É -amino (realmente es un amina
secundaria). Por su parte, la fenilalanina y el triptófano contienen grupos
aromáticos.
Polares sin carga. jiete son los É-aminoácidos cuyo resto -R es polar pero sin
carga. La glicina posee la cadena más simple, un átomo de hidrógeno. La serina y
la treonina son portadores de un grupo hidroxilo (-OH). La asparragina y la
glutamina , poseen cadenas laterales portadoras de un grupo amida, y por hidrólisis
dan lugar, respectiva mente, a aspartato y glutamato, dos aminoácidos con carga
negativa. La tirosina posee un grupo fenólico y la cisteína debe su polaridad a la
presencia de un grupo tiólico (-jH).
Polares con carga negativa. Existen dos É-aminoácidos cuyo resto polar posee
carga negativa a pH fisiológico, debida a la presencia de un grupo carboxilo ( -
COOH) , el ácido glutámico y el ácido aspártico .
Polares con carga positiva. Tres son los É-aminoácidos que poseen restos -R
cargados positivamente a pH fisiológico. La lisina posee una cadena lateral de
butilamonio, la arginina presenta un grupo -R de guanidina y la histidina es
portadora de un grupo -R de imidazolio.
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Figura 2.
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Dentro del conjunto de los aminoácidos natu rales, existen unos que pueden ser
sintetizados por las células humanas a partir de otras sustancias, pero también hay
aminoácidos que debemos tomarlos en la dieta, ya que nuestras células no pueden
sintetizarlos o, cuando menos, no en cantidad suficiente para satisfacer la demanda
del organismo; se conocen con el nombre de aminoácidos esenciales y son valina,
leucina, isoleucina, treonina, metionina, fenilalanina, triptófano y lisina.
Las propiedades ácid o-base de un aminoácido vienen determinadas por los grupos
protonables que posea. Un aminoácido puede actuar bien como ácido o como base
(sustancias anfóteras ), pudiendo tener hasta tres grupos con carácter ácido -base:
el É-amino, el É-carboxilo y, en algunos casos, el resto -R. Lo importante es que
estos grupos poseen un carácter ácido-base débil, lo que hace que, dependiendo
del pH, el correspondiente equilibrio pueda desplazarse en un sentido o en otro
(hacia la forma protonada o hacia la desprotonada, Figura 3).
Figura 3
Ionización de un L -aminoácido.
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Ô
<
<
<
< <
Tomemos los grupos por separado y veamos como les afecta el pH. El grupo É-
amino presentaría dos formas, una protonada (P) y cargada positivamente ( -NH3+),
y otra desprotonada (DP) y sin carga ( -NH2), según el siguiente equilibrio:
Ô Ô Ô ø ø
: :
Pero, ¿qué ocurre a pHs intermedios?. Para ello debemos tener en cuenta la K a
para cada equilibrio, o mejor dicho su pK a (que sería el -logKa). El grupo É-amino de
la valina tiene un pK de 8, y esto quiere decir que a pH 8 el 50 % de los grupos
amino estarán protonados (si tenemos 100 moléculas de vali na, 50 tendrán el grupo
amino protonado y 50 lo tendrán desprotonado, al menos teóricamente, según se
desprende de la constante de ionización). Por su parte el grupo É-carboxilo de la
valina, que tiene un pK de 2, estará protonado al 50 % cuando el pH del medio sea
2.
É < É
<
<
<
<
: :
GRUPO 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
É-carboxilo 0 -0,5 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
(pK=2)
-carboxilo 0 0 0 -0,5 -1 -1 -1 -1 -1 -1
(pK=4)
É-amino +1 +1 +1 +1 +1 +1 +1 0,5 0 0
(pK=8)
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Como se puede apreciar en la tabla, la carga total del aminoácido depende del pH
de la disolución en que se encuentre.
En la siguiente tabla pueden localizarse los aminoácidos que, al igual que el ácido
glutámico, poseen grupos ±R protonables.
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3. El enlace peptídico
Figura 4.
Luego dedujeron que los 4 átomos que rodeaban al enlace peptídico C -N (O, CÉ,
CÉ, H) estaban situados en el mismo plano, de tal manera que el oxígeno del grupo
carbonilo y el hidrógeno del N -H estarían en posición
. Esta ordenación es
rígida, y es el resultado de la estabiliza ción por resonancia de las formas
anteriormente citadas.
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Figura 5.
4. Secuenciación de un péptido
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Figura 6.
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Por otro lado, la determinación del resto C -terminal, se puede realizar con
: este compuesto reacciona con todos los enlaces peptídicos del péptido,
provocando la hidrólisis de los mismos y dando lugar a aminoacil -hidracinas con
todos los aminoácidos excepto con el último (C-terminal), pudiendo separarse del
resto fácilmente y determinarse con posterioridad su naturaleza.
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situarse entre estas dos conformaciones como sería el caso de la miosina de los
músculos o el fibrinógeno de la sangre. :
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Figura 7.
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Figura 8.
Esquema de la hélice-É:
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Figura 9.
Aunque las dos conformaciones (hélice-É y hoja plegada- son posibles dentro de
una misma proteína (como veremos en la estructura terciaria), existen también
proteínas que presentan sólo una de las dos.
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Figura 11.
Hoja plegada- de la
fibroina de la seda.:
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£ Los grupos polares sin carga, apa recen distribuidos por la totalidad de la
cadena, si bien mayoritariamente, también aparecen en las partes
externas, en contacto con la disolución acuosa.
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Fig.12.
Estructura de la
Mioglobina, donde se
aprecia el grupo hemo (en
rojo) y los 8 segmentos en
hélice-É
io lobina
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Fig.13.
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Fig.14
Estructura cuaternaria
de la hemoglobina
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Fig.15b
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