UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

FACULTAD DE QUIMICA Y BIOLOGIA

DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA
Gua de ejercicios aminocidos, protenas y enzimas
Bioqumica
1. Un huevo de pollo pierde dixido de carbono a travs de la cscara a medida que
envejece. Qu efecto tendr la prdida de este gas sobre el pH del huevo?. Explique
utilizando las ecuaciones apropiadas
2.- En el siguiente grfico se muestra la curva de titulacin de la ala. Algunos puntos de la
curva son numerados del (I) al (V).

En cada una de las siguientes afirmaciones identifique a que parte de la curva de titulacin
corresponde ((I) al (V)).
a. Ala est presente predominantemente con carga neta +1.
b. La mitad de los grupos aminos est ionizados.
c. El pH es igual al pKa del grupo carboxilo
d. El pH es igual al pKa del grupo amino protonado
e. Ala tiene su mxima capacidad buffer
f. La carga neta de la ala es cero

g. La carga neta de la Ala es -1.

h. Est en el pI

3.- Prediga que ocurrir con el pKa de la cadena lateral de un glutmico si:
a. En la protena este aminocido se encuentra prximo a la cadena lateral de una
lisina
b. En la protena este aminocido se encuentra prximo al carboxi-terminal de la
protena
c. La [NaCl] de la solucin se cambia de 0,05 M a 0,10 M.
d. El residuo glutmico se mueve a la regin nopolar interior de la protena
4.- La tirosina es poco soluble en agua a pH 7,0 (~0.5 g/L).
a) Cul ser la solubilidad del decapptico (Tyr)10 a pH 7, ser mayor, igual o menor
que el aminocido libre.
b) Cmo ser la solubilidad del decapptico si se aumenta el pH?
Explique
5.- Discuta que ocurrir en una clula si se cambia el agua del citoplasma por metanol

6.- Qu pptido espera usted que sea ms compacto a pH neutro polilisina o polivalina?

7.- Qu efecto provoca agregar cloruro de guanidinio en altas concentraciones en la

estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de una protena?

8.a) Dibuje la cadena lateral de dos aminocidos que interacten cada uno con los residuos
aminoacdicos dibujados a continuacin.

b) Identifique qu aminocidos dibuj e indique el tipo de interaccin

c). Cul de las dos interacciones que usted dibuj es ms fuerte
d). La interaccin ms fuerte que usted eligi, indique si participar estabilizando las
estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de una protena

9.- Cuantos aminocidos son requeridos para formar una -hlice de 10 vueltas y cuntos
enlaces de hidrgeno habrn en esta estructura?

10.- Prediga el efecto de una mutacin de Asp 102 de la quimiotripsina por Asn
a) Sobre la unin al sustrato
b) Sobre la catlisis

11.- Las encefalinas son pequeos pptidos que alivian el dolor. Uno de ellos la, Metencefalina tiene la siguiente estructura

Tyr-Gly-Gly-Phe-Met
a) Dibuje la estructura qumica de este pptido a pH 7
b) Cul ser la carga neta a:
pH 1:
pH 7:
pH 12:

c) Indique qu enlaces podrn ser hidrolizados por:

1. Tripsina
2. Quimotripsina

12.- Numerosas investigaciones han demostrado que al hidrolizar protenas se obtienen

pptido de sabor amargo. Esto ltimo afecta la calidad de los alimentos. Al hidrolizar la
hemoglobina con pepsina se obtienen numerosos pptidos uno de ellos se muestra a
continuacin.
V-V-Y-P-W-T-Q-R-F
a) Con respecto a este pptido prediga si absorbe fuerte o dbilmente a 280 nm.
Fundamente su respuesta
b) Para predecir si un pptido tendr sabor amargo se elabor la regla Q. Segn esta
regla los pptidos que tienen una masa molecular menor a 6000 D y presentan
caractersticas hidrofbicas son amargos. Basado en la regla Q prediga si este
pptido ser amargo.

13.- Cual de las siguientes afirmaciones sobre las enzimas no es correcta. Explique
a) Las enzimas son casi exclusivamente protenas
b) Las enzimas son los nicos catalizadores biolgicos
c) Las enzimas unen a su sustrato de manera especfica
d) La propiedad cataltica de las enzimas puede ser regulada
e) Las enzimas provocan disminucin del G de la reaccin
f) Las enzimas aumentan la velocidad de la reaccin

14.- Explique porqu hay un alto grado de estereoespecificidad en la interaccin de la

enzima con su sustrato.

15.- Cual de las siguientes afirmaciones sobre la cintica enzimtica de Michaelis -Menten
son correctas. Explique
a) La Km es expresada en trminos de una velocidad de reaccin (mol/seg)
b) Km es la constante de disociacin del complejo enzima-sustrato
c) Km es la concentracin de sustrato requerida para alcanzar la mitad de la velocidad
mxima
d) Km es la concentracin de sustrato requerida para convertir la mitad de la enzima
total en el complejo enzima-sustrato

16.- Cual es la proporcin de S a Km cuando la velocidad de una reaccin alcanza el 80%

de la velocidad mxima
17.- Los siguientes datos corresponden a los de una reaccin catalizada por una enzima.
a) Determine si la enzima sigue una cintica michaeliana
b) Si es as calcule Km y velocidad mxima
S (mM)

v (mmol ml-1 min-1)

0,1
0,2
0,5
0,8
1,0
2,0

3,33
5,0
7,14
8,0
8,33
9,09

18.- Los siguientes datos corresponden a reacciones catalizadas por enzimas michaelianas,
en presencia y ausencia de un inhibidor, para ambos casos
a) Determine el tipo de inhibicin
b) Explique si el inhibidor se une a la enzima, al complejo enzima sustrato o a ambos
S (mM)
0,2
0,4
0,8
1,0
2,0
4,0

Sin inhibidor
5,0
7,5
10,0
10,7
12,5
13,6

v (mmol ml-1 min-1)

Con inhibidor X
3,0
5,0
7,5
8,3
10,7
12,5

Sin inhibidor
5,0
7,5
10,0
10,7
12,5
13,6

v (mmol ml-1 min-1)

Con inhibidor Y
2,0
3,0
4,0
4,3
5,0
5,5

S (mM)
0,2
0,4
0,8
1,0
2,0
4,0

19.- Qu tipo de reacciones cataliza cada una de las siguientes enzimas

a) una oxidasa
b) una transmetilasa

c) una hidrolasa
d) una oxidoreductasa
20.- Para una reaccin catalizada por una enzima michaeliana, grafique:
a) Concentracin de sustrato versus tiempo
b) Concentracin de producto versus tiempo
c) Concentracin del complejo enzima sustrato versus tiempo
d) Velocidad de reaccin versus tiempo
e) Velocidad de reaccin versus concentracin de sustrato en presencia de un inhibidor
no-competitivo
f) Velocidad de reaccin versus concentracin de sustrato en presencia de un inhibidor
competitivo

21.- Investigue que es un inhibidor acompetitivo

22.- En las imgenes que se muestran a continuacin se representa el sitio activo de una
enzima. Estas enzimas son activas slo en esa forma. Para cada una de estas enzimas
represente en un grfico la actividad enzimtica en funcin del pH
a)

NH3+

SH

b)

COO-

NH3+

(pKa 9,0)

(pKa 5,0)

(pKa 6,0)

(pKa 10,0)

23.- Con respecto a la siguiente protena:

C
D

a) Identifique las subunidades

b) A qu corresponden los fragmentos A-B y C-D
c) Si A es el amino-terminal, identifique el carboxilo terminal en ambas subunidades