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1,60, de modo que a absorbncia tambm pode ser utilizada para medir a
degradao dos cidos nucleicos.
Se uma soluo de DNA lentamente aquecida, e A 260 medida em vrias
temperaturas, obtida uma curva de dissociao. Nesta curva possvel verificar
diferentes estgios: (1) Antes que a subida comece, a molcula totalmente
bifilamentar; (2) Na regio da subida, os pares de bases de vrios segmentos da
molcula so rompidos. Este nmero varia gradualmente; (3) Na parte inicial do plat
superior, alguns pares de bases ainda permanecem unidos at que uma temperatura
critica seja atingida, na qual o ltimo par de bases se rompe e os dois filamentos se
separam completamente. Durante a dissociao toas as ligaes covalentes, incluindo
as fosfodister, permanecem intactas. Apenas as pontes de hidrognio e as interaes
de empilhamento so rompidas. Um parmetro conveniente para caracterizar uma
transio de dissociao a temperatura na qual a subida de A 260 a metade
completa. Esta temperatura chamada de TEMPERATURA DE DISSOCIAO;
designada como Tm .
Um grande nmero de informaes obtido observando como a T m varia com a
composio de bases e condies experimentais. Por exemplo, foi observado que a T
M aumenta com a porcentagem de G + C, que foi interpretada em termos do maior
nmero de pontes de hidrognio em um par G-C
(trs) do que um par A-T (duas). Isto , necessria uma temperatura mais alta (mais
energia) para romper uma dupla C-G do que uma A-T, porque a estrutura da dupla
hlice est estabilizada, pelo menos em parte, por pontes de hidrognio.
1.2.2. Renaturao do D A:
Uma soluo de DNA desnaturado pode ser tratada de tal modo que o DNA nativo
reconstitudo. Este processo chamado de RENATURAO ou REELICOIDIZAO,
e o DNA reconstitudo chamado de DNA RENATURADO.
Aps a desnaturao, a soluo de DNA composta de uma mistura de filamentos
essencialmente unifilamentares. Para se renaturar, o fragmento deve encontrar seu
parceiro complementar na soluo. Se as concentraes do fragmento e de seu
parceiro complementar na soluo forem baixas, eles levaram muito mais tempo para
se encontrar um com o outro do que se os fragmentos estiverem em altas
concentraes. A renaturao pode ser acompanhada observando a absorbncia da
soluo a 260nm, pois durante a renaturao as bases se organizam e a A 260 ir
diminuir como tempo. A velocidade de diminuio a taxa de renaturao, que est
marcante das seqncias LINE e SINE, que algumas delas podem gerar cpias de si
mesmas, as quais podem ento ser inseridas em outras partes do genoma. Essa
insero pode, algumas vezes, interromper um gene codificante de uma protena,
causando um distrbio gentico.
Elementos intercalantes curtos ou SINEs variam em tamanho de 90 a 500pb. Um
dos tipos mais importantes de SINEs denominado repetio Alu. Essas unidades
repetitivas, que medem ~300pb, contm uma seqncia de DNA que pode ser cortada
pela enzima de restrio Alu.
Elementos intercalantes longos ou LINEs variam em tamanho em at 7.000pb.
o DNA satlite (10% do genoma) apresentam-se agrupadas em certos locais do
cromossomo, onde ocorrem em tandem (isto , o comeo de uma repetio encontrase imediatamente adjacente ao final da outra). O DNA minissatlite e microssatlite
so de especial interesse para a gentica humana porque variam em comprimento
entre os indivduos, o que os torna extremamente teis para o mapeamento gnico.
DNA -satlite repeties em tandem de uma seqncia de 171pb ou mais, situadas
prximo aos centrmeros. DNA minissatlites repeties em tandem de uma
seqncia de 4 a 500pb. DNA microssatlite repeties em tandem de seqncias
com 2-4pb de comprimento.
1.4. Replicao do D A:
Durante o processo de sntese do DNA (replicao do DNA), as duas fitas de DNA de
cada cromossomo so desenroladas pela enzima helicase, e cada uma deles dirige a
sntese de uma fita complementar a si. Disso resultam dois dplices de DNA filhos,
cada um dos quais idntico molcula parental. Como cada dplice filho contem
uma fita da molcula parental e outra recm-sintetizada a partir dele, diz-se que o
processo de replicao semiconservativo. A enzima DNA polimerase catalisa a
sntese de novas fitas de DNA usando os quatro desoxinucleotdeos trifosfatados
(dATP, dCTP, dTTP, dGTP) como precursores de nucleotdeos.
A replicao do DNA inicia em pontos especficos, que so denominados origens de
replicao. Iniciando em uma dessas origens, o comeo da replicao do DNA resulta
em uma forquilha de replicao em que o duplex de DNA parental se bifurca em dois
novos dplices-filho. Como as duas fitas do duplex parental de DNA possuem
polaridades opostas, mas agem individualmente como moldes para a sntese de uma
fita-filha antiparalela complementar, as duas fitas-filhas tambm devem ter direes
opostas (i.e., a direo do crescimento da cadeia tem de ser 5 3 para uma das
fitasfilhas, a fita lder; e 3 5 para a outra fita-filha, a fita de crescimento lento).
As reaes catalisadas pela DNA polimerase incluem a adio de substrato de dNMP,
fornecido pelo dNTP precursor (os dois resduos distais de fosfatos do dNTP (resduos
e ) so clivados e descartados), ao grupamento livre hidroxila 3da cadeia de DNA
crescente. Esse requisito introduz uma assimetria no processo de replicao do DNA:
somente a fita lder possuir o grupamento 3-OH livre no ponto de bifurcao. Isso lhe
permitir uma adio continuada de nucleotdeos e um alongamento contnuo na
mesma direo em que a forquilha de replicao se move. A sntese da fita
descontnua, porm precisa ser realizado por meio de uma srie progressiva de
pequenos fragmentos (100 a 1.0 nucleotdeos de comprimento), denominados
fragmento de Okazaki. Uma vez que s a fita-lder sintetizada de forma contnua,
diz-se que a sntese das fitas de DNA semidescontnua. Cada fragmento da fita
atrasada sintetizado na direo 5 3, que oposta direo em que se move a
forquilha de replicao> As extremidades dos fragmentos, que so sintetizados em
sucesso, ligam-se covalentemente, sendo que a enzima DNA-ligase garante o
crescimento da cadeia na mesma direo do movimento da forquilha de replicao.
Nos cromossomos de mamferos, a replicao do DNA bidirecional, formando-se
bolhas de replicao a partir dos mltiplos pontos de iniciao. A distncia entre
origens de replicao adjacentes de cerca de 50 a 300kb. O incio da replicao do
DNA, na fase S do ciclo celular, d-se em momentos diferentes nas diversas origens,
mas, eventualmente, bolhas de replicao adjacentes podem fundir-se.
Enzimologia da replicao do DNA
Incio da Replicao (Primossoma): o Topoisomerase (DNA girase > desenrola o DNA)
o Helicase (separa as fitas do DNA) o SSBP (ptn que se liga ao DNA fita simples e
serve para estabiliz-lo) o RNA Primase (faz primer com ~30 nucleotdeos)
Alongamento - Replissoma (sntese no sentido 5>3): o PCNA (Proliferating Cell
Nuclear Antigen) liga-se as DNAs polimerases; o DNA polimerase - DNA polymerase
- sntese e iniciao da fita atrasada
- DNA polimerase - reparo do DNA
- DNA polimerase - sntese da fita lder e atividade 3> 5 exonuclease
Antes de realizar uma anlise de HRM, uma seqncia alvo deve ser amplificada por
meio de PCR na presena de um corante intercalante a DNA dupla fita. O corante no
interage com DNA fita simples mas se intercala ativamente ao sulco menor do DNA e
fluoresce fortemente quando assim ligado.Essa mudana na fluorescncia pode ser
usada primeiramente para medir o aumento da concentrao do DNA durante a fase
de amplificao pr-HRM e depois sim, para medir a dissociao do DNA induzida por
temperatura (HRM).Inicialmente a fluorescncia alta em uma anlise de melt porque
o DNA est na forma de dupla hlice, entretanto, essa comea a decair a medida que
a temperatura aumentada e o DNA se dissocia em fitas simples. O comportamento
de melting observado caracterstico de cada amostra de DNA em particular.
O mtodo de PCR-HRM pode ser usado para: detectar variaes de base nica tais
como SNPs (single nucleotide polymorhphisms) ou descobrir mutaes genticas
desconhecidas, identificar genes candidatos de pr-disposio, estudos de associao
(comparando casos e controles, gentipo fentipo), determinao de prevalncia de
alelos dentro de uma populao ou grupo, anlises de metilao de DNA, entre outros.
1.5.7. Arranjos de DNA por PCR em Tempo Real:
As anlises das atividades gnicas e a identificao de mutaes e polimorfismos so
realizadas de forma sistematizada usando o princpio da hibridizao de DNA. As
seqncias de genes que contem mutaes conhecidas so fixadas na matriz de vidro
(sondas de captura). Produtos da PCR so gerados utilizando-se iniciadores
especficos marcados com fluorforos. A seguir os produtos da PCR so hibridizados
com as sondas capturadas na matriz de vidro e os arranjos de sinais fluorescentes so
medidos utilizando-se um sistema ultra-rpido de deteco de fluorescncia e a
intensidade de cada ponto determinada. A localizao do ponto associado com a sua
intensidade determina a seqncia e a quantidade de material presente na amostra.
Estes dados so processados por programas sofisticados de computadores que
possibilitaro a anlise refinada dos resultados. A possibilidade de se colocar milhares
dos fatores de transcrio e ento ativada para iniciar a sntese de RNA a partir de
um nico ponto.
Tabela 2: Caractersticas dos Elementos Cis-atuantes
Elementos Cis Comentrios CG box Situado a -200pb a montante do gene. TATA box
Situado a -25pb a montante do gene. Pouco freqente, inclusive nos promotores de
genes de manuteno. CAAT box Localizado a 80pb do incio da transcrio. o
maior determinante da eficincia do promotor. Alm do promotor, existem outros
elementos cis que atuam potencializando a transcrio (acentuadores ou enhancers)
ou inibindo-a (silencidores). Ambos so elementos regulatrios, porm esto situados
bem distantes dos pontos de incio da transcrio.
2.2.5 Expresso Tecido-Especfica:
A expresso gnica tecido-especfica envolve a ativao seletiva de genes especficos
(denominados: genes com expresso tecido-especfica). Alm deste grupo, observa-se
que um nmero razovel de genes que esto ativos em toda e qualquer clula. Tais
genes so essenciais para a manuteno das atividades gerais da clula, e por isso
so denominados de GENES DE MANUTENO. Parte dos genes para mRNA
TECIDO-ESPECFICO, enquanto que todos os genes de rRNA, tRNA e alguns de
mRNA so genes de manuteno.
A distino entre as regies do DNA de uma clula que esto transcrevendo e as que
esto inativas reflete-se na estrutura da cromatina. A cromatina inativa apresenta uma
conformao altamente condensada e frequentemente relacionada s regies do
genoma que sofrem replicao tardia, durante a fase S do ciclo celular. O DNA ativo
na transcrio, por sua vez, apresenta uma conformao mais aberta e costuma
replicar-se logo no incio da fase S. Ele se caracteriza por uma ligao relativamente
fraca com as molculas de histonas H1 e pela ampla acetilao dos quatro tipos de
histonas que compem o nucleossomo. Alm disso, na cromatina ativa, as regies
promotoras no costumam apresentar metilaes.
2.3. Processamento do RNA:
O transcrito de RNA da maioria dos genes eucariticos sofre uma srie de reaes de
processamento. Freqentemente, isso envolve a remoo de segmentos internos
indesejveis e a reunio de segmentos remanescentes (encadeamento do RNA). No
caso de transcritos resultantes da RNA polimerase I, um nucleotdeo especializado
RNA splicing involves endonucleolytic cleavage and removal of intronic RNA segments
and splicing of exonic RNA segments
ponto. Por fim, a enzima poli(A)- polimerase adiciona cerca de 200 resduos de
adenilato (AMP), para formar uma cauda poli(A). Supe-se que essa cauda tenha
vrias funes, tais como: (1) facilitar o transporte do mRNA para o citoplasma; (2)
maior durabilidade a molcula; (3) facilitar a traduo, ao permitir uma intensificao
do reconhecimento do mRNA pela maquinaria ribossmica. As excees a esta regra
so os mRNAs de histonas e snRNAs, que no sofrem adio de cauda poli(A).
2.4. Traduo do mRNA:
Para a traduo, somente o segmento central do mRNA determina a seqncia de
aminocidos do polipeptdio a ser transcrito. As seqncias adjacentes, isto , a regio
no-traduzida 5-P e no-traduzida 3-OH auxiliam a ligar e estabilizar o mRNA nos
ribossomos, onde ocorre a traduo do segmento central.
Os ribossomos so grandes complexos de RNA e protenas compostos por duas
subunidades. Nos eucariotos, os ribossomos citoplasmticos contm duas unidades: a
subunidade maior de 60S (formada por cerca de 50 protenas ribossmicas e rRNAs
28S, 5,8S e 5S), e a subunidade menor de 40S (formada por 30 protenas
ribossmicas e rRNA 18S).
O gene do rRNA 45S policistrnico, pois um nico transcrito possui a informao
gentica para trs tipos de rRNA. Aps a transcrio o pr-rRNA sofre metilao nas
regies referentes aos rRNAs 18S, 5,8S e 28S. Estas marcaes auxiliam na
determinao das seqncias iniciais e terminais de cada rRNA. Aps a adio desta
marcao, os introns (Classe I ou I) catalisam a sua prpria remoo.
Figura: (A) ensaio de proteo a nuclease S1. (B) ensaio de extenso de primer
2.6.2.2. Mapeamento dos limites exon/intron
A presena de introns pode ser usualmente inferida por meio de mapeamento
comparativo de clones genmicos e de cDNAs relacionados. Uma vez que toda a
seqncia de cDNA estabelecida, primers para o seqenciamento podem ser
definidos a partir dos vrios segmentos de cDNA e usados para o seqenciamento de
DNA por PCR com clones de cosmdeos desnaturados como moldes de DNA. As
sequencias obtidas devem cruzar a regio limtrofe exon/intron.
2.6.3. Mtodos aplicados ao estudo da expresso gnica:
Uma vez eu um clone genmico ou de cDNA torna-se disponvel, pode ser marcado e
usado como sonda para detectar a expresso daquele gene ao nvel de RNA. H
diferentes mtodos a disposio para se estudar a expresso de RNA, tais como:
Hibridizao pela tcnica de orthern blot - esse um mtodo de baixa resoluo, mas
que permite detectar padres de expresso por meio da hibridizao de uma sonda
gnica ou de cDNA, com extratos de RNA total ou RNA poli(A)+ preparados a partir de
diferentes tecidos ou de linhagens de clulas. O fato de o RNA ser fracionado por
tamanho em um gel possibilita estimar o tamanho de transcritos. A presena de
mltiplas bandas de hibridizao em uma canaleta pode indicar a presena de
isoformas de diferentes tamanhos.
Hibridizao in situ em tecidos neste procedimento, os tecidos so congelados ou
embebidos em parafina e cortados usando-se um micrtomo, para obter cortes muitos
finos, os quais so montados em uma lmina de microscpio. A hibridizao de uma
sonda especfica para um gene, no tecido presente em lmina, pode oferecer imagens
detalhadas de expresses representativas da distribuio de RNA no tecido de origem.
afetado,
no afetado,
x R/r) R/R
x r/r) R/r
afetado
no afetado
Afetado com afetado (r/r x r/r) S r/r Todos afetados
Quando dois genitores que so ambos portadores tm filhos, em mdia, deles sero
portadores, ser homozigoto afetado e o restante ser homozigoto normal.
Caractersticas da herana autossmica recessiva
Homens e mulheres so igualmente afetados; Em geral, apenas os membros de uma
famlia so afetados; A probabilidade de que um irmo ou irm de um afetado tambm
seja afetado de 1 em 4 (25%).
Distrbios que apresentam herana autossmica recessiva Albinismo ocolocutneo,
alcaptonria, anemia falciforme, doena de Tay-Sachs, fenilcetonria, fibrose cstica,
hemocromatose, galactosemia, e quase todos os erros hereditrios do metabolismo.
qual o outro cromossomo X est ativo. Ambas as populaes celulares nas mulheres
so prontamente identificadas para alguns distrbios. Por exemplo, na distrofia
muscular de Duchenne, os portadores femininos exibem a tpica expresso mosaica,
permitindo que sejam identificados pela imunocolorao para a distrofina. Dependendo
do padro de inativao aleatria do X dos dois cromossomos X, duas mulheres
heterozigotas para uma doena ligada ao X podem apresentar quadros clnicos muito
diferentes, uma vez que diferem na proporo de clulas que possuem o alelo mutante
no X ativo em um tecido relevante.
3.1.4.1. Herana Recessiva Ligada ao X:
A herana recessiva ligada ao X segue um padro bem definido e facilmente
identificvel.Uma mutao recessiva ligada ao X tipicamente expressa no fentipo
de todos os homens que a receberam, mas somente nas mulheres que so
homozigotas para a mutao. Conseqentemente, os distrbios recessivos ligados ao
X geralmente esto restritos aos homens e raramente so observados em mulheres.
Caractersticas da herana recessiva ligada ao X a incidncia da caracterstica maior
em homens do que em mulheres; as mulheres heterozigotas geralmente no so
afetadas, mas algumas podem expressar a condio com gravidade varivel,
conforme determinada pelo padro de inativao do X;
O gene responsvel pela condio transmitido de um homem afetado para todas as
suas filhas. Qualquer um dos filhos das suas filhas tem 50% de chance de herda-lo;
O alelo mutante geralmente nunca transmitido por um homem afetado para todas as
suas filhas;
O alelo mutante pode ser mantido atravs de uma srie de portadores femininos; se
assim o for, os homens afetados em uma famlia so aparentados atravs das
mulheres.
Distrbios que apresentam herana recessiva ligada ao X daltonismo verdevermelho, distrofia muscular de Duchenne e Becker, Hemofilia (A e B), Sndrome de
Hunter, deficincia de glicose-6-fosfato desidrogenase.
3.1.4.2. Herana Dominante Ligada ao X:
molculas de mtDNA. Quando surge uma mutao no mtDNA, inicialmente ela s est
presente em uma das molculas de mtDNA em uma mitocondria. Com a segregao
replicativa, porm, uma mitocndria contendo um mtDNA mutante ir adquirir mltiplas
cpias da molcula mutante. Com a diviso celular, uma clula contendo uma mistura
de mtDNA normal e mutante pode distribuir propores muito diferentes do DNA
mitocondrial mutante e do tipo selvagem s suas clulas-filhas.Uma clula-filha pode,
por acaso, receber mitocndrias que s contm uma populao pura de mtDNA
normal, ou uma populao pura de mtDNA mutante (uma situao conhecida como
homoplasmia). Alternativamente, a clula-filha pode receber uma mistura de
mitocndrias, algumas com algumasa sem mutao (heteroplasmia). Uma vez que a
expresso fenotpica de uma mutao no mtDNA depende das propores relativas a
de mtDNA normal e mutante nas clulas constituintes dos diferentes tecidos, a
penetrncia reduzida, e a expresso varivel e a pleiotropia so todas caractersticas
tpicas dos distrbios mitocondriais.
Herana materna do mtD A A caracterstica determinante da gentica do mtDNA a
herana materna. As mitocndrias dos espermatozides geralmente so eliminadas do
embrio, de modo que o mtDNA herdado da me. Portanto, todos os filhos de uma
mulher que seja homoplasmtica para uma mutao no mtDNA herdaro esta
mutao, enquanto que nenhum dos descendentes de um homem portador da mesma
mutao herdar o DNA defeituoso.A herana materna de uma mutao
homoplasmtica do mtDNA causadora da neuropatia ptica hereditria de Leber est
exemplificada na figura abaixo.
Isto , o gene transmitido por um dos genitores sofreu alterao no DNA, resultando
em uma mutao de um alelo normal para um causador de doena. Os genes neste
lcus nas outras clulas germinativas do genitor seriam normais. Neste caso, o risco
de recorrncia para a prole subseqente do genitor no elevado acima do da
populao em geral. Entretanto, a prole da criana afetada pode ter um risco de
ocorrncia substancialmente elevado. Uma grande proporo dos casos observados
de muitas doenas autossmicas dominantes resulta de mutaes novas. Por
exemplo, estima-se que 7/8 de todos os casos de acondroplasia so devidos a
mutaes novas, enquanto que apenas 1/8 so transmitidas por pacientes
acondroplsicos. Isto ocorre principalmente porque a doena tende a limitar o
potencial de reproduo.
Mosaicismo germinativo: Ocasionalmente, duas ou mais pessoas da prole
apresentaro uma doena autossmica dominante quando no h histrico familiar da
doena. Como a mutao um evento raro, improvvel que isso seja devido a vrias
mutaes na mesma famlia. O mecanismo mais provvel como responsvel
chamado mosaicismo germinativo. Durante o desenvolvimento embrionrio de um dos
genitores, ocorreu uma mutao que afetou toa ou parte da linhagem germinativa, mas
poucas ou nenhuma das clulas somticas do embrio. Assim, o genitor tem a
mutao em sua linhagem germinativa, mas de fato no expressa a doena. Como
resultado, ele (ou ela) pode transmitir a mutao para vrios descendentes. Este
fenmeno, embora relativamente raro, pode ter efeitos significativos nos riscos de
recorrncia, quando ele ocorre. Exemplos de doenas com mosaicismo germinativo
so: acondroplasia, neurofibromatose tipo 1, DMD e hemofilia A.
Idade atrasada de manifestao: Enquanto algumas doenas genticas se expressam
ao nascimento, ou logo aps, muitas outras no so aparentes seno j na vida
adulta. Isto conhecido como idade atrasada de manifestao. O atraso na idade de
incio reduz assim a seleo natural contra um gene de doena, aumentando a sua
freqncia na populao.
Penetrncia reduzida: a probabilidade de que um gene venha, de fato, a possuir uma
expresso fenotpica. Quando a freqncia de expresso de um fentipo de menos
de 100% - ou seja, quando alguns falham completamente em express-los -, diz-se
que o gene exibe uma penetrncia reduzida. A penetrncia um conceito de tudo-ounada. a percentagem de pessoas com um gentipo predisponente que so
afetadas, pelo menos em alguma medida. Estudos familiares mostraram que cerca de
10% dos portadores obrigatrios do gene de suscetibilidade ao retinoblastoma no
possuem a doena. Neste caso, a penetrncia do gene dita ser de 90%.
significativo desta proporo, ento isto indica que os alelos neste lcus, ou em um
lcus adjacente ligado, esto de algum modo implicados em causar a doena.
Uma vez que tenha sido feita a localizao aproximada com base na anlise de
ligao ou estudos de associao, a etapa seguinte geralmente envolve uma tentativa
de situar a regio candidata usando-se a abordagem de desequilbrio de ligao. A
lgica desse enfoque baseada na hiptese de que a maioria dos membros afetados
da populao em estudo compartilhariam um mesmo segmento genmico curto,
equivalente a um hapltipo em comum, circundado por alelos de suscetibilidade.
Assim, uma vez identificada a(s) regio(es) de interesse, esta(s) (so) analisada(s)
usando-se marcadores polimrficos (geralmente SNPs) a fim de estreitar a regio de
interesse, para ento tentar identificar de genes candidatos. Infelizmente, este
processo no fcil, uma vez que: 1) grupos tnicos ou populaes diferentes podem
desenvolver a mesma doena por motivos totalmente diferentes e, portanto, ter fatores
genticos de risco distintos; e 2) em populaes heterogenias provvel que muitos
alelos de suscetibilidade estejam presentes, o que dificulta a deteco de eventos de
desequilbrio de ligao.
3.3.3. Exemplos de distrbios multifatoriais:
Doena de Alzheimer esta doena a causa mais comum de demncia senil e prsenil, com uma prevalncia de cerca de 20% em pessoas com mais de 80 anos de
idade. Na maioria das famlias acometidas, observa-se que um padro de herana
multifatorial. Estudos por anlise de ligao, realizados em famlias com casos da
doena, permitiram a deteco de um lcus polimrficos no cromossomo 19 associado
doena. A presena de alelos de risco no gene da apolipoprotena E (ApoE) est
freqentemente aumentada em pacientes com o diagnstico de Alzheimer a ponto de
que as chances dos portadores dos alelos de risco vir a desenvolver a doena de
cerca de 35% para os homens e 50% para as mulheres. Estudos de ligao sugerem
que ainda existam quatro outros genes que conferem suscetibilidade a doena.
Diabetes mellitus tipo 1 esta forma relativamente rara, com prevalncia de 1/200,
geralmente se apresenta na infncia ou no incio da idade adulta. Esta doena
causada pela destruio das clulas pancreticas que produzem insulina. Tanto os
estudos familiais quanto de gmeos so consistentes com a herana multifatorial. O
risco de recorrncia para irmos e prole da pessoa afetada de 5-6%. As taxas de
concordncia em gmeos MZ e DZ so de aproximadamente 30-49% e de 5-10%,
respectivamente. A pesquisa de genes de suscetibilidade identificou dois loci definidos.
O primeiro o lcus IDDM1, onde se situa o gene HLA, que contribui com 30-40% da
suscetibilidade total. Cerca de 95% das pessoas afetadas e portadoras tm o antgeno
HLA-DR3 e/ou HLA-DR4, enquanto que eles so encontrados em apenas 50% da
populao geral. O segundo lcus, IDDM2, inclui o gene de insulina no cromossomo 1,
juntamente com a regio que contem vrias cpias de seqncias microssatlites
novo por um gene quimrico criado por rearranjo cromossmico). Essas mudanas
so dominantes e normalmente afetam um s alelo do gene.
Ativao do Oncogene por amplificao gnica: A amplificao gnica um fenmeno
caracterizado pela presena de mltiplas cpias normais de um gene ou de um
segmento genmico na clula, resultando no aumento do nvel da expresso gnica. A
amplificao gnica comum em muitos cnceres, incluindo neuroblastoma,
gliobastomas e cncer colorretal. Os segmentos amplificados do DNA so
prontamente detectados por tcnicas de citogentica molecular (hibridizao genmica
comparativa) ou convencional (bandeamento cromossmico). Neste ltimo caso, a
amplificao gnica pode se apresentar como cromossomos acessrios muito
pequenos (diminutos duplos) ou como regies de colorao homognea (regies
genmica que normalmente no so bandeadas e contm mltiplas cpias
amplificadas de um segmento particular de DNA). Como e por que os diminutos duplos
ou as regies de colorao homognea ocorrem ainda pouco compreendido, mas
sabe-se que as regies amplificadas incluem cpias extras e normais de protooncogenes, tais como os genes que codificam myc, ras e o receptor de crescimento
epitelial, que estimulam o crescimento celular ou bloqueiam a apoptose, ou ambos.
Ativao do Oncogene por mutaes pontuais: O gene H-RAS pertence a uma famlia
de genes que codificam protenas envolvidas na transduo de sinais dos receptores
acoplados protenas G. Um sinal do receptor desencadeia a ligao da GTP
protena RAS e o complexo GTP-RAS retransmite o sinal na clula. A protena RAS
tem atividade de GTPase, logo o complexo GTP-RAS convertido rapidamente em
GDP-RAS inativo. Mutaes pontuais especficas nos genes RAS so encontradas
freqentemente nas clulas de vrios tumores, como os de cncer de colo, de pulmo,
de mama e de bexiga. Elas levam substituio de aminocidos, que fazem diminuir a
atividade de GTPase da protena RAS. Em conseqncia, o sinal de GTP-RAS
inativado mais lentamente e a resposta celular ao sinal do receptor se torna excessiva.
O RAS mutante estimula o crescimento da linhagem celular, transformando-a, portanto
em um tumor.
Ativao do Oncogene por translocaes cromossmicas: Nem sempre os oncogenes
so resultados de uma mutao do DNA. Em alguns casos, um oncogene ativado
por uma mutao cromossmica, geralmente atravs de translocao. Mais de 40
translocaes cromossmicas oncognicas foram descritas, principalmente em
leucemias espordicas e linfomas.Em alguns casos, os pontos de quebra das
translocaes so dentro de introns de dois genes, fusionando dois genes em um
gene anormal que codifica uma protena quimrica com novas propriedades
oncognicas. O exemplo mais bem conhecido a translocao entre os cromossomos
9 e 2 que observada na leucemia meilide crnica. Neste caso, a translocao move
Metilao do D A: A inativao de GSTs pode tambm ser causada por uma mudana
no estrutural decorrente da hipermetilao de regies de controle da expresso
gnica (promotor). A hipermetilao dos dinucleotdeos CpG presentes em regies
regulatrias de genes supressores tumorais um achado comum em muitos tumores,
e existem evidencias que este mecanismo epigentico seja o responsvel pela
inativao dos genes CDKN2A, VHL, RB1 e MLH1.
MDULO 5 GE TICA DE DOE AS I FECCIOSAS
A variabilidade gentica humana na resistncia/suscetibilidade a infeces um
processo complexo e influenciado por mltiplos genes. Em principio, podemos
distinguir dois tipos diferentes de variao na resistncia a patgenos infecciosos: uma
resistncia natural primria, dependente de fatores genticos que influenciam a
adeso de agentes infecciosos s clulas do hospedeiro e sua subseqente
penetrao intracelular, e uma resistncia secundria, dependente na maior parte da
ao do sistema imunolgico.
5.1. Pesquisa de genes de suscetibilidade a doenas infecciosas.
Uma primeira questo a ser abordada na pesquisa de mecanismos genticos
associados suscetibilidade seria a procura de indivduos geneticamente resistentes
que no se infectam e/ou no desenvolvem a doena mesmo compartilhando o
mesmo ambiente com indivduos infectados e que teoricamente constituem um foco de
infeco.
Um segundo indicador da existncia de fatores genticos na suscetibilidade a doenas
a maior concordncia em gmeos monozigticos do que em gmeos dizigticos. Um
exemplo disso proporcionado por estudos sobre a tuberculose em grupos de
gmeos mono- e dizigticos. Enquanto 87,2% de monozigticos eram concordantes
em relao tuberculose, entre dizigticos a concordncia era de s 25,6%.
Outro aspecto de importncia na procura de determinantes genticos da
suscetibilidade o estudo das correlaes intrafamiliares. Cabello et al (1995)
trabalhando sobre residentes em zonas endmicas da leishmaniose visceral (LV)
verificaram a no existncia de correlao para a LV entre os pais (pai x me), porem
correlaes significativas foram observadas nas comparaes pais x filhos e entre
pares de irmos; sabendo que o compartilhamento de genes entre os pais
relativamente baixo (dependendo das freqncias populacionais), mas que a
correlao gentica entre pais e filhos e entre irmos de aproximadamente e ,
respectivamente, os resultados da agregao familiar antes observados so
evidencias claras da existncia de mecanismos genticos na infeco pela LV.
este alelo foi associado com resistncia a esta forma clnica de hansenase. J Leve
et al. no encontraram associao de SNPs no gene TNF com a hansenase
estudando famlias multiplex na Polinsia Francesa. A implicao funcional deste
polimorfismo ainda controversa; alguns estudos indicam que a presena do alelo A
resulta em maior produo desta citocina, enquanto outros no indicam relevncia
funcional do mesmo. Ainda nesta regio, localiza-se o gene LTA, que codifica uma
quimiocina com mltiplos efeitos na regulao do sistema imune. Shaw et al.
estudando famlias brasileiras no verificaram correlao do SNP LTA+252A/G isolado
com hansenase. Entretanto, em anlise estendida, encontraram associao com
hansenase deste SNP em hapltipos formados com TNF-308, o que foi replicado em
estudo com a populao brasileira
Gene HLA: A regio 6p21 do cromossomo 6 humano, que abrange os genes do
Complexo Principal de Histocompatibilidade de classe I e I (HLA) e o do fator de
necrose tumoral (TNF) e linfotoxina- (LTA), tem sido associada com a ocorrncia de
hansenase em diversos estudos, uma vez que a segregao dos hapltipos de HLA
parentais no se d de modo aleatrio entre filhos saudveis e queles acometidos
pelas formas tuberculide e virchowiana. Estudos familiares tm apontado para a
associao das regies gnicas do HLA com a hansenase per se. O refinamento
destes estudos levou a associao dos loci HLA-DQB1, HLA-DQA1 e HLA-DRB1 com
a doena, assim como forte ligao da regio 6p21.32/HLA-DQ3 foi identificada. Todd
et al. e Hegazy et al. associaram HLA-DR2 e HLA-DQw1 com a ocorrncia de
hansenase per se. Semelhante associao de HLA-DR2 foi previamente observada
no Japo. Na populao chinesa por outro lado, no houve associao de HLA-DR2
com a doena. Com relao s formas clnicas HLA-DR2, HLA-DR3 e HLA-DQw1, j
foram relacionados com a hansenase tuberculide. Enquanto DR2, DRw8, DQw1
foram associados com a forma virchowiana. Os genes altamente variveis
relacionados cadeia MHC de classe I A (MICA) e B (MICB) tambm tm sido
associados hansenase. Essas protenas so expressas durante a apresentao de
antgenos e funcionam como co-estimulatrias para a ativao de linfcitos T ,
linfcitos T CD8+ e clulas NK. Entre os chineses HLAB e MICA-A estiveram
relacionados com proteo contra a forma multibacilar da hansenase; enquanto na
ndia, Tosh et al. relataram associao de HLA-DRB1 e MICA*5A5.1 com a doena per
se. O gene TAP2, tambm localizado na regio 6p21, codifica a cadeia 2 da protena
transportadora associada ao processamento antignico (TAP) que atua na
translocao de peptdeos do citosol para o retculo endoplasmtico e na ligao de
peptdeos ao MHC de classe I. So relatados vrios polimorfismos deste gene que em
combinao originam diferentes alelos (AH) os quais podem diferir quanto
capacidade de apresentar antgenos via MHC de classe I. Rajalingam et al estudaram
a implicao destes SNPs na hansenase e observaram que a freqncia do alelo
TAP2-B estava significativamente aumentada na hansenase tuberculide e
Uma mutao genmica que deleta ou duplica um cromossomo inteiro pode alterar os
nveis de expresso de centenas ou milhares de genes. De modo semelhante, uma
mutao cromossmica que deleta ou duplica grandes pores de um ou mais
cromossomos tambm pode afetar a expresso de centenas de genes. Mesmo uma
pequena mutao gnica pode ter grandes efeitos fenotpicos, dependendo de qual
gene tenha sido afetado e de qual efeito a alterao tenha sobre a expresso do
mesmo. Uma mutao gnica consistindo em uma mudana de um nico nucleotdeo
na seqncia
Algumas alteraes no DNA, entretanto, no tm efeito fenotpico. Uma translocao
ou inverso cromossmica pode no afetar a poro crtica do genoma e pode no ter
quaisquer efeitos fenotpicos. Uma mutao dentro de um gene pode no ter efeito, ou
porque a mudana no altera a seqncia primria do aminocido de um polipeptdio
(mutao silenciosa) ou porque a mudana no alterara as propriedades funcionais da
protena (mutao neutra). Nem todas as mutaes, portanto, tem conseqncias
clnicas.
Todos os trs tipos de mutao ocorrem com freqncia aprecivel em muitas
diferentes clulas. Se uma mutao ocorre no DNA das clulas que iro fornecer a
populao da linhagem germinativa, a mutao pode ser passada para as geraes
futuras. Em contraste, mutaes somticas ocorrem por acaso em apenas um
subgrupo de clulas em certos tecidos e resultam em mosaicismo somtico, como
visto, por exemplo, em muitas situaes de cncer. As mutaes somticas no
podem ser transmitidas prxima gerao.
6.1.2. Tipos de Mutaes Humanas 6.1.2.1. Mutao por substituio de nucleotdeos:
Mutao de Sentido Trocado este tipo de mutao reconhecido quando a
substituio de um nico nucleotdeo (ou mutao de ponto) em uma seqncia de
DNA capaz de alterar o cdigo em uma trinca de bases, e assim causar a
substituio de um aminocido por outro no produto gnico. Em muitos distrbios, tais
como as hemoglobinopatias, so derivados de mutaes de sentido trocado.
Mutao Sem Sentido ou Mutao de Trmino de Cadeia este classe identificada
quando uma mutao pontual no DNA causa, na seqncia do mRNA, a substituio
do cdon normal por um dos trs cdons terminais. Como conseqncias da formao
de um cdon de parada prematuro, o mRNA carregando a mutao freqentemente
instvel, e no possvel a sua traduo; e mesmo que o mRNA esteja estvel o
bastante para ser traduzido, a protena gerada ser truncada e normalmente to
instvel que ser rapidamente degradada. Uma mutao de ponto no apenas pode
Pequenas inseres so designadas por ins aps dois nucleotdeos entre os quais
ocorreu a insero, seguida pelo novo nucleotdeo inserido. Exemplo:
c.1277_1278insTTAC
Uma mutao espontnea ou sem sentido pode ser descrita ao nvel da protena pela
doao do aminocido correto, a posio daquele resduo, e o aminocido que
substituiu o normal. Ex: Glu6Val
As mutaes na seqncia do DNA podem ocorrer de forma espontnea (mutao
espontnea) ou induzida (mutao induzida). No primeiro caso, as mutaes so
decorrentes de erros cometidos ela DNA polimerase, durante o processo de replicao
do DNA. O surgimento de mutaes espontneas ocorre quando DNA polimerase
insere uma base incorreta que no pode formar pontes de hidrognio com a base no
filamento parentalmolde. As mutaes espontneas tambm podem surgir como
conseqncia de mudanas tautomricas nas bases dos nucleotdeos. Cada uma das
quatro bases nitrogenadas capaz de existir em uma forma rara, isomrica alternativa
(tautmero), tendo propriedades diferentes de pontes de hidrognio. As raras formas
imino (A*) e citosina (C*) fazem pares de bases com citosinas e adenina,
respectivamente, enquanto que as raras formas enol de timina (T*) e guanina (G*)
fazem pontes de hidrognio com guanina e timina, respectivamente. Uma base pode
ser incorporada em sua forma normal e ento sofrer uma mudana tautomrica aps a
incorporao. Durante a rodada subseqente de replicao do DNA, a presena de
um destes tautmeros raros no molde pode resultar na incorporao de uma base
incorreta na molcula-filha de DNA (um processo similar ocorre quando agentes
mutagnicos chamados de anlogos de bases sofrem tautomerizao).
Depurinao refere-se a quebra de ligaes N-glicoslica entre a base (neste caso
uma purina) e a desoxirribose do nucleotdeo, com a perda subseqente da base
nitrogenada. A menos que tal dano seja reparado antes da replicao do DNA, h uma
grande probabilidade de que surja uma mutao, pois o stio apurnico no tem a
informao necessria para especificar a insero da base complementar correta n o
novo filamento de DNA. Se a DNA polimerase atingir o stio apurnico antes que o
reparo tenha ocorrido, a replicao pode parar e/ou uma base incorreta pode ser
inserida no novo filamento de DNA em oposio ao sitio apurnico. Novamente,
existem mecanismos especficos de reparo envolvendo enzimas chamadas de
ENDONUCLEASES AP (AP = apurnico) para lidar com tal dano.
A desaminao um outro processo que origina mutaes. Esta mutao
caracterizada pela perda do grupo amino presente na citosina. Esta, por sua vez,
transforma-se em uracila. Aps uma rodada de replicao, esta mutao leva a
substituio do par original G-C por um A-U, que se tornar ento um par A-T aps
outra rodada de replicao.
J as mutaes induzidas so causadas por agentes conhecidos coletivamente como
mutgenos. Os mutgenos de principal destaque so:
Radiao ionizante (raios-X): ons eletricamente carregados quando situados dentro
ou prximos de molculas de DNA podem promover reaes qumicas que mudam as
bases do DNA. A radiao ionizante tambm pode quebrar a DNA unifilamenar ou
bifilamentar. Esta forma de radiao pode atingir todas as clulas do corpo, inclusive
as da linhagem germinativa;
Radiao no-ionizante (raios U.V.): esta classe de radiao forma ligaes covalentes
entre bases pirimidnicas adjacentes (citosina ou timina). Estes dmeros de pirimidina
so incapazes de se parear apropriadamente com purinas durante a replicao do
DNA. Isto resulta em uma substituio de pares de bases. Como a radiao UV
absorvida pela epiderme, no atinge a linhagem germinativa, mas pode causar cncer
de pele.
Anlogos de bases: podem substituir uma base verdadeira do DNA durante a
replicao. O anlogo no exatamente igual base que substitui, de modo que pode
causar erros de pareamento durante as replicaes subseqentes.
6.2. RECOMBI AO
Uma importante propriedade do DNA das clulas a sua capacidade de sofrer
rearranjos, que podem ocasionar desde novas combinaes entre os genes presentes
em qualquer genoma individual at alteraes qualitativas e quantitativas na
expresso desses genes. Trata-se de uma fonte de variao gentica fundamental
para permitir que os organismos evoluam em resposta a mudanas ambientais. Esses
rearranjos do DNA so realizados pela recombinao gentica. Duas amplas classes
de recombinao so comumente reconhecidas: a recombinao geral e a stioespecfica. Na recombinao geral (ou recombinao homloga), a troca gentica
envolve seqncias homlogas (complementares) de DNA. Um dos exemplos mais
importantes desse tipo de troca entre cromossomos homlogos (denominado
crossingover) acontece na meiose. O crossing-over ocorre entre cromossomos
altamente relacionados nos estgios iniciais de desenvolvimento de vulos e
espermatozides. Na recombinao stio especfica no necessria homologia
extensa do DNA. Nesse caso, as trocas ocorridas so curtas. Seqncias especficas
entre os dois dplices, que formam uma molcula unida. O ponto no qual uma fita de
DNA cruza de um ponto para outro chamado de juno recombinante. Uma
caracterstica importante de uma juno recombinante a sua capacidade de moverse ao longo do dplex. Tal mobilidade chamada de migrao da ramificao. O ponto
de ramificao pode migrar em ambas as direes, medida que uma fita deslocada
pela outra. Quando a molcula unida rota um dplex em relao ao outro, isso pode
ser visualizado em um plano como uma estrutura de Holliday.
A molcula unida, formada pela troca de fitas, deve ser resolvida em dois dplices
separados. A resoluo necessita de um par de clivagens adicional. Se os cortes
forem feitos no par de fitas que no foram originalmente clivadas (o par de fitas que
no iniciou a troca), todas as 4 fitas originais so clivadas. Isso resulta em molculas
de DNA recombinantes combinadas. Se as mesmas duas fitas envolvidas nas
clivagens originais forem clivadas novamente, as outras duas fitas permanecero
intactas. As clivagens liberam os dplices parentais, os quais permanecem intactos,
salvo que cada um possuir um vestgio do evento de recombinao, na forma de uma
regio de heterodplex. Esses recombinantes so chamados de recombinantes
remendados.
Protena RecA - RecA possui um papel central na recombinao, atuando tanto como
uma protena estrutural como em reaes catalticas. Essa enzima capaz de parear
duas molculas de DNA homlogas e catalisar as reaes de trocas de fitas, levando
formao do heterodplex de DNA.RecA reconhece especificamente DNA de fita
simples e anela esse segmento a uma seqncia complementar de um dplex
homlogo, substituindo, simultaneamente, a fita original complementar pela nova fita.
Se ATP est presente, a protena RecA do filamento pode, ento, ir desenrolando
sucessivamente diferentes partes do dplex, na tentativa de anelar o filamento de fita
simples a uma regio desenrolada. Uma vez que uma pequena poro corretamente
pareada, usando como molde a cadeia intacta, a energia do ATP direciona a reao de
pareamento at o final. A protena RecA deslocada quando a nova molcula de DNA
hbrida formada. A protena RecA possui um papel central na regulao da
recombinao gentica, na reparao do DNA e na mutagnese induzida por
UV.Estudos demonstraram que a protena RecA ATPase DNA-dependente. No
entanto, a reao de troca de fitas isoenergtica (para cada par de bases quebrado,
outro par formado) e ocorre mesmo na ausncia de ATP.A protena RecA pode atuar
guiando a formao de uma hlice com quatro fitas, composta pelas duas molculas
de DNA, acelerando o processo de troca de fitas e permitindo que a juno se mova
ao longo de toda a regio do dplex.
Enzimas Acessrias
Todas essas leses devem ser reparadas para a clula sobreviver. A importncia de
sistemas de reparao eficientes destacada por doenas graves que afetam
pessoas com deficincias nos sistemas de reparao. A reparao do DNA
freqentemente envolve a simples eliminao da mudana que causou a leso. Quase
sempre uma fita de DNA contendo o(s) nucleotdeos(s) danificado(s) removida e a
lacuna preenchida atravs de re-sntese. Existem ao menos cinco tipos principais de
reparao do DNA nas clulas humanas:
6.3.1. Reparo por reverso direta: O mecanismo mais simples de reparo de bases
alteradas restaura-las ao normal sem uma grande cirurgia na molcula de DNA. No
caso dos dmeros de pirimidina formados no DNA por luz UV, esta reverso mediada
pela enzima fotoliase (ativada por luz visvel). A fotoliase corta os dmeros de
pirimidina gerando pirimidinas intactas. Outro exemplo de reverso direta a
metiltransferase, uma enzima que reconhece O6 metil guanina no DNA e remove o
grupo metil agressor. Nessa reao, a guanina normal do DNA restaurada e a
enzima inativada.
6.3.2. Reparo por Exciso de Base: Este procedimento utiliza enzimas glicosidases
para remover bases anormais. Uma endonuclease, AP- endonuclease, corta o
arcabouo de acar-fosfato na posio da base perdida. Uns poucos nucleotdeos da
dita de DNA so retirados por exonucleases, a lacuna preenchida por re-sntese, e o
corte remanescente fechado pela DNA ligase-I. O mesmo processo utilizado para
reparar depurinaes espontneas. interessante ressaltar que no se conhece
nenhuma doena humana causada por falha neste mecanismo de reparo do DNA.
Talvez qualquer defeito desse tipo seja letal, uma vez que este mecanismo
responsvel pela correo de um grande nmero de leses no DNA.
6.3.3. Reparo por Exciso de ucleotdeo: Remove dmeros de timina e grandes
aductos qumicos. O mecanismo de ao deste processo envolve a protena XPA, que
reconhece o DNA danificado e liga-se a ele ou por ligao a RPA (protena que se liga
a fita simples). O complexo DNA-XPARPA recruta o fator de transcrio TFIIH (um
complexo multiproteico que inclui as protenas XPB e XPD). As protenas XPB e XPD
so helicases e atuam na abertura das fitas de DNA, um seguimento com cerca de 30
nucleotdeos de extenso. Em seguida, dois cortes so feitos na cadeia de acarfosfato da fita danificada. XPF+ERCC1 cortam as extremidades 5, e XPG corta a
extremidade 3.Em seguida, a DNA polimerase , juntamente com o fator de replicao
C e a subunidade DPE2 sintetizam DNA para preencher a lacuna. Por fim, a DNA
ligase une as lacunas. Defeitos neste mecanismo de reparo causam a doena
autossmica recessiva Xeroderma pigmentar (XP) Pacientes XP so extremamente
sensveis luz UV, peles expostas ao sol desenvolvem milhares de sardas, muitas das
quais progridem para o cncer de pele.