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Lecture 5
Interconversions of energy
Glycolytic pathway
One molecule of glucose !
two molecules of pyruvate!
~30 ATP
1 molecule of pyruvate
can become 1 molecule of
alanine in one step
B r
A
C
k
k+
Protein structure
Hydrogen bonds!
~5-30 kJ/mole
Mechanical equilibrium
U(x) =
1
2
k ( x x0 ) mg ( x x0 )
2
Optical tweezers
dU
dx
x +
eq
1 d 2U
2 dx 2
( x )2
eq
Optical traps
ktrap =
kBT
x2
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20
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20
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Time (s)
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100
80
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25
20
15
10
Configurational energy
L
L
F
L
=E
A
L
EA L L
dx
2 0 L
2
Estrain =
Free Energy
free energy = energy - temperature x entropy
S = kB lnW
Calculating entropy
S = kB ln
N!
Np! N Np !
ln(N!) N ln N N
S = kB N c ln c + (1 c ) ln(1 c)
( S
E )V ,N = 1 T
( S
V )E,N = p T
( S
N )E,V = T