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UNIVERSITE MOHAMMED V - RABAT FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE BIOSTATISTIQUE Pr R, Razine

UNIVERSITE MOHAMMED V - RABAT FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE

MOHAMMED V - RABAT FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE BIOSTATISTIQUE Pr R, Razine Pr-Ass E.

BIOSTATISTIQUE

Pr R, Razine

Pr-Ass E. Bouaiti- Pr M. Mrabet

Objectif pédagogique

principale

Expliquer les grands aspects de la biostatistique ainsi que son utilité dans le domaine de la santé

Objectifs pédagogiques

spécifiques (1)

Discuter l’intérêt des biostatistiques en

sciences médicales

Enumérer les principales sources de variabilité biologique

Expliquer les concepts d’échantillon, de

population, de représentativité.

Définir les variables et citer un exemple pour chaque type de variables

Objectifs pédagogiques

spécifiques (2)

Reconnaître la loi normale, citer les autres lois

de probabilité.

Comprendre et utiliser les concepts de fluctuation d’échantillonnage et d’intervalle

de confiance.

Décrire une série statistique

Expliquer les tests statistiques ainsi que les résultats qui en découlent

Programme

1.

Principes de base en Biostatistiques

2.

Les statistiques descriptives

3.

Les principales lois de probabilité

4.

Estimation et fluctuations d’échantillonnage

5.

Principes des tests statistiques

6.

Les tests de comparaison de pourcentages

7.

Les tests de comparaison de moyennes

8.

Organisation et Présentation des données

Principes de base en biostatistique

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

I.

Introduction

Pourquoi un module de biostatistique? Exercice médicale

Raisonnement

Incertitude

Méthodologie statistique

Exemple: tabac et cancer du poumon

• Exemple : tabac et cancer du poumon 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 9

I.

Introduction

Formation médicale

I. Introduction Formation médicale Écart type Test statistique Population Prévalence Recherche clinique Moyenne

Écart type

Test

statistique

Population

Formation médicale Écart type Test statistique Population Prévalence Recherche clinique Moyenne Probabilité Facteur
Formation médicale Écart type Test statistique Population Prévalence Recherche clinique Moyenne Probabilité Facteur
Formation médicale Écart type Test statistique Population Prévalence Recherche clinique Moyenne Probabilité Facteur

Prévalence

Recherche

clinique

Test statistique Population Prévalence Recherche clinique Moyenne Probabilité Facteur de risque Groupe a risque

Moyenne

Probabilité

Facteur de risque

Recherche clinique Moyenne Probabilité Facteur de risque Groupe a risque Incidence Estimation Sensibilité

Groupe a

risque

Incidence

Estimation

Sensibilité

Efficacité

Échantillon

Essai

clinique

Variance

Spécificité

15/09/2015

Pourcentage

Fréquence

Biostat/1AM/2015-2016

10

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

II.

Statistique :

Définition

Ensemble des méthodes scientifiques consistant à

réunir, organiser, présenter des données numériques sur une/plusieurs particularité(s)

commune(s) chez un groupe de personnes ou de

choses, puis à analyser, tirer des conclusion et

prendre des décisions.

Une statistique : un nombre calculé à partir d'observations.

III. Historique

Dénombrement de populations humaines

pour les besoins de la guerre et de l'impôt.

Véritable début : 18 ième siècle :

Première classification des causes de décès

Calcul des probabilités (P. S. de Laplace, K. F. Gauss, S. D. Poisson)

1853: premier congrès

III. Historique

Première moitié du 20 ième siècle

Statistiques biologiques et psychologiques

Biométrie et Psychométrie

1940 Recherche opérationnelle

Deuxième moitié du 20 ième siècle

Développement de l'informatique

Analyse des données

Domaines d’utilisation de la statistique

Statistique officielle

Banques Assurances

Santé et Sciences de la vie

Environnement ( air, eau, foresterie, pêche …)

Sciences humaines

Entreprises Industrie (contrôle de qualité, études de marché, management…)

(contrôle de qualité, études de marché, management…) Presse – Médias • • 15/09/2015 Discipline

Presse Médias

15/09/2015

Discipline transversale

Biostat/1AM/2015-2016

15

IV. Biostatistique

1. Définition

Application des concepts et principes statistiques

à des données médicales, biologiques et de santé public.

2. Exemples

Les effets d’un médicament.

L’effet du niveau du cholestérol sur la pression artérielle.

Le nombre de patients admis aux urgences.

Biostatistique

Deux branches distinctes

3.

Statistique descriptive
Statistique descriptive

Organisation, présentation

et analyse des données

Synthèse de l’information:

résumés statistiques.

Expression des résultats :

représentation graphique.

Étape préliminaire

Echantillon
Echantillon
Statistique inférentielle • Permet de généraliser à de grands ensembles d'éléments les conclusions tirées
Statistique inférentielle
• Permet de généraliser à de
grands ensembles
d'éléments les conclusions
tirées des résultats obtenus
à partir d’un nombre réduit
d’observations
Population ?
Inférence
Inférence

Inférer = tirer une conclusion à partir de propositions ou de faits, et de règles

4. A quoi sert la biostatistique?

Gestion des observations (des données)

Recueillir, présenter, analyser

Aider à la prise de décisions et à la résolution de problèmes.

Comprendre et mener correctement des

Expériences

Enquêtes

Travaux de recherche

5. Pourquoi des statistiques en

médecine ?

Variabilité?

Échantillon?

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

V.

Variabilité

exemple

On s'intéresse à la taille des étudiants de la faculté de médecine. Les données sont présentées comme elles ont été recueillies.

Ainsi, il n'est pas facile de répondre à une

question comme: quel est le pourcentage des étudiants ayant une taille supérieure à 180?

Taille en cm de 30 étudiants de la faculté de médecine

150

168

153

174

177

188

160

180

183

187

175

175

162

174

189

180

185

176

167

160

182

185

185

160

164

180

185

153

187

182

Fluctuation d’échantillonnage

Tirage au sort :

Fluctuation d’échantillonnage • Tirage au sort : Échantillon représentatif • Plusieurs échantillons peuvent

Échantillon représentatif

Plusieurs échantillons peuvent être constitués

Echantillon 1 :

n1=30

m1= 172

Echantillon 2:

n2=30

m2= 174

Echantillon 3 :

n3=130

m3= 175

Santé publique/5AM/2013-2014

Variabilité

Variabilité intra-

individuelle

Variabilité inter- individuelle

Variabilité

expérimentale

Variabilité

appareil de

mesure

expérimentale Variabilité appareil de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité
expérimentale Variabilité appareil de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité

Variabilité

biologique

appareil de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité métrologique La
appareil de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité métrologique La

Variabilité totale

de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité métrologique La variabilité = la règle et
de mesure Variabilité biologique Variabilité totale Variabilité métrologique La variabilité = la règle et

Variabilité

métrologique

La variabilité = la règle et non l’exception

1. Variabilité biologique

Variabilité inter-individuelle

Caractéristiques qui différent d’un individu à l’autre

Si vous observez des

personnes dans la rue vous

constatez qu’elles n’ont pas toutes la même couleur de

cheveux.

Variabilité intra-individuelle

Caractéristiques évoluant dans le temps chez un même individu

Si vous mesurez la tension artérielle d’un individu à différents moments de la

journée vous obtiendrez des

valeurs différentes.

La variabilité = la règle et non l’exception

2. Variabilité métrologique

Variabilité de la mesure

Variabilité expérimentale

Variabilité appareil de mesure

Essayer de mesurer plusieurs (100) fois la taille en mm d’un individu : vous trouverez des valeurs différentes cependant dans l’absolu un individu a une taille et une seule.

La variabilité = la règle et non l’exception

3. Variabilité : conséquences

Il n’existe pas de « vraie valeur »

Valeur usuelle

Valeur exceptionnelle, hors norme

• Valeur usuelle • Valeur exceptionnelle, hors norme Difficulté pour interpréter et utiliser les informations

Difficulté pour interpréter et utiliser les informations mesurées

4. Variabilité : résumé

Caractéristique dans le domaine des sciences

de la santé : VARIABILITE

Chez un même individu

Entre les individus

Entre les groupes d’individus

etc.

Biostatistique : Traiter les problèmes de

variabilité dans les données

La variabilité = la règle et non l’exception

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

VI. Unité statistique ou individu

1) Définition

Une unité distincte chez laquelle on

peut observer une ou plusieurs caractéristiques données.

Élément sur lequel sont effectuées

des observations ou des mesures

2) Exemples

Individu, animal, organe, cellule, champ de microscope,

Regroupement d’unités: Grappe ou

cluster

Patients d’un service

• Regroupement d’unités: Grappe ou cluster • Patients d’un service 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 29

VI. Unité statistique

ou individu

La définition de l’individu dépend

des paramètres étudiés

Exemple 1 : paramètre étudié : note d’un étudiant dans un groupe de TD

Un individu = un étudiant

Exemple 2 : paramètre étudié : note moyenne de chaque groupe de TD d’étudiant

Un individu = un groupe de TD

(Grappes)

d’étudiant • Un individu = un groupe de TD (Grappes) 1 9 / 0 9 /

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

VII. Population

1. Définition

Ensemble d’individus (ou unités

statistiques ) sur lequel on étudie

une ou plusieurs caractéristiques et

qui sont de même nature

2. Exemples

Femmes atteintes du cancer du

sein.

Ensemble des patients hospitalisés dans un hôpital

Toutes les naisances de l’année en

cours Ensemble des étudiants inscrits à la faculté de médecine

cours – Ensemble des étudiants inscrits à la faculté de médecine – … 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 32

VII. Population

On peut ne pas connaitre tous les individus qui composent une

population

Une population peut être partitionnée en sous populations:

Hommes atteints du VIH.

Femmes fumeuses et atteintes

du cancer du poumon.

Taille de la population

Le nombre d'individus constituant la population.

Généralement très grande

constituant la population. – Généralement très grande N o t a t i o n :

Notation : N

VII. Population

VII. Population Population • Si population limitée : Exhaustive – Recensement : Tous les sujets de

Population

Si population limitée :

Exhaustive

Recensement : Tous les sujets de la population sont « examinés »

Exemple : les étudiants de la 1 ère année médecine

VII. Population

• •
VII. Population • • Si population importante : Une partie des sujets de la population sont

Si population importante : Une

partie des sujets de la population sont « examinés »

Exemple : tous les étudiants de la faculté de médecine

Échantillon

Population

Plan

Introduction

La biostatistique : Définition et intérêt

Variabilité

Unité statistique

Population

Échantillon

Variables statistiques

Les mesures de bases

Conclusion

VIII.Échantillon

1. Définition

Sous ensemble d’une

population et qui est de de taille finie

2. Exemples

200 Femmes atteintes du cancer du sein

100 étudiants inscrits à

la faculté de médecine

du cancer du sein – 100 étudiants inscrits à la faculté de médecine 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 37
du cancer du sein – 100 étudiants inscrits à la faculté de médecine 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 37

VIII.Échantillon

VIII.Échantillon • On connait tous les individus qui composent un échantillon • Taille de l'échantillon :
VIII.Échantillon • On connait tous les individus qui composent un échantillon • Taille de l'échantillon :

On connait tous les

individus qui

composent un échantillon

Taille de l'échantillon :

le nombre d‘individu dans l'échantillon.

Notation : n

3.

Pourquoi travaille-t-on sur un échantillon ?

3. Pourquoi travaille-t-on sur un échantillon ? temps coût 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 39
temps
temps
coût
coût

4. Échantillon : Inférence

4. Échantillon : Inférence Population Caractéristiques? REPRESENTATIVITE Échantillon 15/09/2015

Population

Caractéristiques?

REPRESENTATIVITE

: Inférence Population Caractéristiques? REPRESENTATIVITE Échantillon 15/09/2015 Biostat/1AM/2015-2016 40

Échantillon

4. Échantillon : Inférence

Échantillon représentatif :

Échantillon qui reflète fidèlement la complexité et

la composition de la population.

Échantillonnage aléatoire :

Prélèvement au hasard, et de façon indépendante,

d’un certain nombre " n " d’éléments à partir d’une population de " N " éléments. Chaque élément de la population doit avoir la même probabilité d’être sélectionné.