Filogenia

Filogenia
- Qu : del griego: phylon: "tribu, raza" y gene:
"nacimiento, origen, procedencia".
Diagrama arborescente que representa lneas evolutivas de
diferentes especies, organismos o genes (ramas) desde un
antecesor comn (raz). Reconstruir/Inferir la historia evolutiva de las
especies
- Por qu : La biologa es una ciencia histrica; debemos conocer el
pasado para resolver cuestiones actuales
- Cmo : Se postulan hiptesis sobre posibles escenarios,
otorgndoles significacin estadstica.
- A qu nos estamos refiriendo :
- Relaciones entre ramas (topologa)
- Distancias entre ellas (largo de rama)

rboles filogenticos

Charles Darwin fue el primero en dibujar

una rbol filogentico

Embriologa comparada

La filogenia recapitula la ontogenia...

Propuesto por Haeckel (1868/1876)

Filogenia
rbol Filogentico
- Conjunto de INDIVIDUOS en una misma
zona
- POBLACIN durante varias generaciones.
gnico durante generaciones.
- ESPECIE; fenmenos de especiacin.
- FILOGENIA completa

rbol Filogentico - Leyendo un,

- Un unico linaje ancestral (Fig. A) da lugar a 4 especies

- Especies A y B comparten antecesor comn ms reciente
entre si que con C D
- Por su parte el ACMR de C y D es ms reciente que el de A
yB

rbol Filogentico - Interpretacin

- El patrn de ramificacin (topologa) es lo que aqu

importa.
- El largo de rama es indiferente.
- Topologas alternativas:

rboles con y sin raz

Sin Raiz: Simplemente, muestran relaciones topolgicas entre

las especies, pero es imposible definir si los nodos muestran una
condicin derivada o ancestral. No sabemos quin se diversific
primero.

rboles sin raz

rboles con y sin raz

Outgroup : Grupo de secuencias/especies empleadas en el
anlisis, pero que no estn incluidas en las secuencias
estudiadas. Relativiza el estudio de los rboles

Con Raiz: Muestran las relaciones filogenticas basales y

derivadas entre hojas.

rboles con raz

rboles filogenticos - Filograma

Largo de rama significativo
Aportan informacin adicional

Monofilia, Parafilia & Polifilia

- Los grupos representados en el rbol, deben representar una
comunidad de organismos, que descienden de un antecesor
comn.
- El mtodo de clasificacin se basa en el criterio nico de la
existencia de un antecesor comn, y en el reconocimiento de
caracteres derivados compartidos (sinapomorfismo) por varias
especies, as tenemos:
-Grupos monofilticos, parafilticos y polifilticos.

Grupo Monofiltico

Grupo donde todos los organismos incluidos en l han

evolucionado a partir de una poblacin ancestral comn, y
todos los descendientes de ese ancestro estn incluidos en el
grupo

Grupo Parafiltico

Un grupo es parafiltico cuando incluye al antepasado comn

de sus miembros, pero no a todos los descendientes de este.
(Ej.: la clase de los reptiles, que no incluye aves. Se hace
monofiltico si las incluimos).

Grupo Polifiltico

Polifiltico; se dice de aquel grupo que no incluye al

antepasado comn ms reciente de todos sus miembros. Se
trata de una unin artificial de ramas dispersas del rbol
evolutivo. (Ej: Homeotermos => Aves y Mamferos.)

rboles consenso
Si obtenemos hiptesis de reconstruccin de filogenias
alternativas, es preciso obtener un nico rbol consenso para
todo el conjunto de arboles.
- Consenso estricto: Incluye slo los grupos monofilticos
presentes en todos los rboles.

rboles consenso
- Norma de la mayora: Se decanta por aquella topologa
que ms se repite.

Aplicaciones
- Aplicaciones en gentica evolutiva
Deducir duplicaciones gnicas
Translocaciones
- Gentica de poblaciones
Cuantificar flujo gnico
Tasas de mutacin
Tamaos de poblacin
Seleccin natural
Adaptacin
- Estimar tasas y fechas
Relojes moleculares
Datar eventos en epidemiologa

Homologa
- Trmino introducido por Richard Owen (1847)
- "Mismo rgano en diferentes animales, bajo cualquier forma o
funcion pero que presenta un mismo origen evolutivo."

Concepto filogentico de homologa

Homologa - Homoplasia
Similitud morfolgica
entre delfines y
tiburones.

Homologa - Homoplasia
Desarrollo por separado de
un corazn de cuatro cavidades
en aves y mamferos

Homologa - Homoplasia
Cambios en las condiciones del
entorno por la actividad humana.
(Melanismo industrial)

Concepto filogentico de homologa

- De la misma manera que se crean rboles filogenticos con
especies, podemos hacer lo mismo para la evolucin de genes,
a partir de secuencias moleculares (DNA/Proteinas).
- Para datos de secuencia molecular, homologa significa que
dos secuencias, o incluso dos caracteres de la secuencia
descienden de un antecesor comn.
- MUY IMPORTANTE: No confundir con similaridad..
--> "Dos secuencias son homlogas en un 63%"
INCORRECTO!
- Homologa = Variable discreta. SI/NO
- Similitud = Variable continua.

Dos tipos de homologa

En estudios moleculares, distinguimos dos tipos de
homologa.
- ORTOLOGA : Genes HOMOLOGOS que han divergido uno
del otro tras eventos de especiacin. (e.g., globina humana y -globina de chimpanc).
- PARALOGA : Genes HOMOLOGOS que han divergido uno
de otro tras duplicacin gnica (e.g., - y -globina)

Dos tipos de homologa

Dos tipos de homologia. Ms

relaciones

Homologa de secuencias

- Sitios bajo presin selectiva

- Sitios conservados
- Delecciones

Reconstruccin filogentica

Un caso de aplicacin de la filogenia.

-Juan Maeso- Brote de Hepatitis C en dos hospitales de Valencia
- >200 personas infectadas
- Cmo han encontrado el origen de a infeccin?
- Mediante mtodos de filogenia (secuenciando una regin del
genoma de los virus), se vio que todos los virus procedan de
una unica fuente
- Los virus se haban diferenciado en el cuerpo de los
pacientes, pero mediante mtodos filogenticos se
pudo reconstruir un origen comn.

Un caso de aplicacin de la filogenia.

-Juan Maeso-

Filogenia aplicada a otros campos...

Puzzles con rboles (I)

Dada la topologa de la izquierda,

cul de las siguientes
topologas es falsa?

Puzzles con rboles (II)

In the above tree, assume that the ancestor had a long tail, ear flaps, external testes,
and fixed claws. Based on the tree and assuming that all evolutionary changes in these
traits are shown, what traits does a sea lion have?
mas prsimoniosa - solucin minimo de cambios que se aportan al arbol para explicar
una topologia.

Puzzles con rboles

Garras fijas, cola corta, presencia de orejas y testculos intra-abdominales