UE Pharmacie - Microbiologie

Le monde Microbien : Partie 3 :

La socit microbienne : leur

vie sur la terre, chez lhomme
Professeur Emmanuel DROUET
Anne universitaire 2010/2011
Universit Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits rservs.

Chapitre 8: Vie sociale des microbes

Intimit (symbiose et endosymbiose)
La communaut microbienne
Les parasites: le visiteur non dsir!

Symbiose
Vivre ensemble
Symbiose = Vie en commun de deux (ou
plus) organismes diffrents ou symbiontes
Les scientifiques classent les relations
symbiotiques comme:
Mutuelles (bnfice pour chaque partie)
Commensales (bnfice pour seulement un
symbionte)
Parasites (lun exploite ou endommage (voire
tue) lautre

Symbiose mutuelle: le biofilm

Agrgat de micro-organismes constituant un film adhrant
une surface immerge ou soumise un environnement liquide
(eau ou autre)
Dans leur habitat naturel, les bactries vivent le plus souvent
attaches des supports (mode de vie sessile )
Les bactries tendent sassocier en communaut en formant
des micro-colonies et se recouvrir de polymres organiques
Adsorption
reversible
(sec.)

Attachement
irrversible
(sec./min.)

Croissance
&division
(h/j)

Production de
lexopolymre &
formation du
biofilm (h/j)

Attachement
dautres
organismes au
biofilm (j/m)

Diffrents biofilms

Intestin grle
Cathters

Un biofilm pathologique:
La carie dentaire

Commensalisme
qui mangent la mme table
Un microbe X semble rsider dans un
organisme Y dans un tat normal
Comme tous les animaux, les hommes
hbergent galement un grand nombre de
commensaux (notre microflore
bactrienne) la surface de la peau et de
toutes les muqueuses qui sont en contact
avec le monde extrieur (bouche, tube
digestif, etc.).

Bactries commensales (suite)

Un petit groupe de micro-organismes sest adapt des
formes de vie suprieures (vgtaux et animaux) et les
utilise comme habitat fixe ou temporaire et en tant
quenvironnement o ils peuvent trouver des nutriments.
Dans une flore (ex. digestive): certains donnent des
bnfices, dautres peuvent avoir un potentiel de nuisance
(infections opportunistes )

Les flores chez lhomme

Endosymbiose
Endosymbiose = Vie dun organisme
lintrieur dune cellule dans une
association stable et souvent symbiotique
Exemples: Legionella lintrieur des
amibes

Virusesarefundamentalplayersinthehistoryoflife
RoleoftheHERVintheplacentation

Le parasitisme
Parasites exploitent ou endommagent (voire tuent)
lautre organisme
Un commensal peut devenir parasite (ex Giardia
intestinalis)
Beaucoup de micro-organismes pathognes peuvent
tre considrs comme parasites
En mdecine humaine, sont appels parasites
essentiellement les pathognes de type eucaryote
Protozoaires (Plasmodium falciparum, )
Champignons
Mtazoaires (nmatodes, trmatodes,)

Chapitre 9: Le systme immunitaire:

La vie dans la zone de combat!!
La lutte contre la maladie
Limmunit inne
Les barrires naturelles et la veille
Lappel au combat des dfenseurs

Limmunit adaptative
La mmoire immunitaire
Le dveloppement de limmunit
Les maladies du sytme immunitaire

Introduction
Les organismes sont toujours en
concurrence les uns par rapport aux autres
(lutte pour la nourriture, lespace,)
Les microbes se combattent entre eux, mais
aussi attaquent des organismes plus
complexes (vgtal, animal), notamment
laide de facteurs de virulence
A leur tour, ces organismes complexes
(homme) ont dvelopp des stratgies
sophistiques pour se protger (immunit)

Limmunit
Limmunit : ensemble des phnomnes
contribuant
- maintenir lintgrit de lorganisme
- assurer son rtablissement
(agression)

 Soi non soi

Une capacit de reconnaissance entre
- les constituants de lorganisme : le soi : tolr
- et les molcules trangres : le non-soi :
rejet

Soi et non Soi

Les Protines du Complexe Majeur dHistocompatibilit (CMH)

Immunit inne et adaptative

- Deux catgories de mcanismes
troitement intriqus :
- Immunit non spcifique ou naturelle ou inne
- Immunit spcifique ou acquise ou adaptative
(mmoire immunologique)

Objectifs du systme immuniatire

le systme immunitaire lutte contre :
- 1 agent infectieux (tranger lorganisme)
- 1 organe tranger (transplantation)
- 1 cellule tumorale (reconnue trangre
aprs sa transformation)

Facteurs influenant le systme

immunitaire

Balance immunitaire

Etapes des interactions Hteenvironnement au cours dune infection

ENVIRONNEMENT
Facteurs
non microbiens

Facteurs microbiens
(Virulence)
Phnotypes
Biologiques

Exposition aux
Micro-organismes

Infection
Immunit inne

Facteurs
non gntiques

Infection
Immunit
adaptative

Facteurs
gntiques

HTE

Phnotypes
Cliniques

Lymphocyte immunit adaptative

Macrophage Phagocytose
Monocyte Prsentation des Ag
Neutrophile Phagocyte
PNN
Anti-bactrien

Eosinophile Immunit
Anti-parasitaire
PNE

Basophile
PNB

Mastocyte

Protection des
Surfaces muqueuses?
Protection des
Surfaces muqueuses?

Les cellules
du systme
immunitaire
Progniteur
Commun
lymphode

Cellule-souche
pluripotente
Hmatopotique

Progniteur
Mylode

Les organes lymphoides

Organes lymphodes I

Organes lymphodes II
& tissus
Amygdales

Thymus
Molle osseuse

Tissu lymphode
Associ aux bronches
Ganglions lymphoides

Molle osseuse
Rate
Lamina propria
Ganglions lymphoides
Msentriques
Plaques de Peyer
Tissu lymphoide
Urognital
Ganglions lymphoides

Effecteurs (solubles et cellulaires) de

limmunit
L immunit inne ou naturelle de dclenchement rapide, sans mmoire des
vnements passs

L immunit spcifique ou adaptative de cintique lente et

doue de mmoire

La raction inflammatoire
Vasodilatation: Erythme
Augmentation de la permabilit capillaire: dme et douleur
Migration hors des vaisseaux de diffrentes cellules
sanguines (PNN, PNE, Monocytes-Macrophages,
lymphocytes)
Facteurs chimiotactiques
Intervention de nombreux mdiateurs chimiques (cytokines ou interleukines)
IL1, IL6
TNF alpha
IFN gamma

Kinines (Bradykinines)
Prostaglandines, leucotrines, histamine, srotonine, protines du
complment

Etapes de la rponse inflammatoire

1. Lsions tissulaires
Relarguage dhistamine

3. Les phagocytes absorbent les

bactries, les dbris cellulaires
et les cellules mortes
4. Migration des plaquettes vers la
zone lse
2. Histamine induit une fuite capillaire
de phagocytes et de facteurs de
la coagulation

Lappel aux dfenseurs

Monocytes et lymphocytes
Lymphocytes en migration

Le macrophage: une part importante de

limmunit inne, un jeu essentiel pour
limmunit adaptative

Immunit spcifique
Les deux types de rponses immunitaires
La rponse mdiation humorale avec Anticorps
circulants (lymphocytes B)
La rponse mdiation cellulaire (lymphocytes T)

Les sous-populations lymphocytaires

CELLULES T

Th

CLP
Prcurseur lymphode
commun

CTL

Activent les cellules B et Lysent les cellules infectes

les macrophages
CYTOTOXIC T
T HELPER CELL (TH)
LYMPHOCYTES (CTL)

CELLULES B

PC
Produisent les anticorps
PLASMOCYTES

Les anticorps
Site antignique

site effecteur
Fc
CH2

CH3

hydrate de carbone
CDRs

Immunoglobulines A, G, M
IgA, IgG, IgM

Activation des lymphocytes T par une cellule

prsentatrice dantigne (CPA)

CPA = Monocyte, Macrophage, cellule dendritique, lymphocyte B

Lyse des cellules infectes par les

lymphocytes T cytotoxiques (CTL)

Les rponses immunes: le scnario

Barrires
Invasion
& infection

Immunit inne
+

Peau & muqueuses

Surfaces en rgnration rapide,
mouvements pristaltiques, mucociliaires
vomissements, flux urinaires/lacrymaux,
toux

Dfenses cellulaires et humorales:

lysosyme, secretions muqueuses et
cbaces, acidit de lestomac,
organismes commensaux,pt du
complment, phagocytose, cellules NK

Inflammation

Immunit adaptative

Dfenses cellulaires et humorales

Anticorps, cytokines, T helper cells,
cytotoxic T lymphocytes (CTL)

La rponse immune de lhte face

un virus
ADAPTATIVE

INNEE

Rponses lymphocytaires T

Anticorps antiviraux

Titre Viral

Activit Relative

PNN
TNF- Rponse NK
IL-12
IFN-

Jours aprs infection

10

11

12

Les drglements de limmunit spcifique:

Immunopathologie

Les maladies auto-immunes

Phnomnes dallergie
Dficits immunitaires

Les drglements de limmunit spcifique:

Immunopathologie

Les maladies auto-immunes

Lorganisme dveloppe des ractions
immunitaires contre les molcules du soi
Thyrodites auto-immunes (auto-AC) , maladies
systmiques (lupus rythmateux), diabte
insulino-dpendants (LyT autoractifs)
Dominance Ly TH1

Les drglements de limmunit spcifique:

Immunopathologie

Phnomnes dallergie (HS de type 1)

Rentrent dans la catgories des
hypersensibilit (I, II, III, IV, V)
Dominance TH2
Dclenchs par certains antignes : les
allergnes, induisant la gnration dune
classe particulire dAC: Les IgE
Raction allergique: combinaison de lAg avec
lIgE spcifique fixe sur des mastocytes ou
des PN basophiles

Les drglements de limmunit spcifique:

Immunodficience

Dficits immunitaires
Congnitaux ou acquis
Concernent les lymphocytes B et T

Chapitre 10: La prvention et

lhygine

Loin de nous, les pathognes.!!

Strilisation
Dsinfectants
Antiseptiques
Les vaccins

Le systme immunitaire nest pas infaillible lgard de

notre protection vis vis des infections

Dans l histoire de l humanit, jusqu au 20e sicle, les infections ont reprsent la cause essentielle de la
mortalit (60% la fin du 19e sicle en Europe), avec une dure moyenne de vie trs stable autour de 25
ans. A la fin du 19e sicle en Europe, 35% des individus pouvaient esprer atteindre l ge de 40 ans.
L allongement de la dure de la vie prs de 80 ans aujourdhui rsulte d un bon contrle des
maladies infectieuses grce l effet combin des mesures d hygine, de la vaccination et des
antibiotiques

Stratgies anti-microbiennes:
celles qui tuent (-cides)
Strilisation
Dsinfectants
Antiseptiques

Strilisation
Moyens physiques
Chaleur

Incinration (>500C)
Ebullition (>100C) au moins 30 minutes
Autoclavage (>121C) au moins 15 minutes
Chaleur sche (four 160C, au moins 2h)
sporulation

Irradiation (UV)

germination

Strilisation
Moyens chimiques (Substances dtruisant,
inactivant, ou liminant les microbes
potentiellement nuisibles)
Dsinfectants: utiliss pour le traitement des
surfaces ou dobjets inertes
Chlore, Alcool, Peroxyde dhydrogne, surfactants et
dtergents, phnols, mtaux lourds (As, Cu, Ag, Hg)

Antiseptiques : dsinfection de tissus vivants

(prophylactiques ou thrapeutiques)
Alcool, Chlorhexidine (driv phnol et chlor)

Filtration et al.
Filtration
0,45 m
0,22 m

Masques
Filtres pour locaux (HEPA)

Les vaccins
Prparation de micro-organismes morts ou vivants
ou de leurs composants (bactries, virus, protozoaires)
Utilise pour immuniser un homme ou un animal contre
une maladie donne
- Vaccins inactivs
- Vaccins vivants attnus
- Vaccins sous-unitaires (protines-peptides)

8 mai 1980 : l OMS proclame

lradication plantaire de la variole

Tracines

La prvention par les vaccins

Pourquoi vacciner?
Protger les populations

Tuberculose (bactrie)
Paludisme (malaria, parasite)
Diphtrie (intoxication bactrienne)
Ttanos (intoxication bactrienne)
Hpatite B (virus)
Rougeole, Oreillons, Rubole (virus)
Grippe (virus)
Fivre jaune, hpatite A, Fivres typhodes (voyageurs)
Pneumonie pneumocoque chez le sujet g

Eradiquer une maladie (variole, poliomylite,

hpatite B?)

Les principaux tueurs

(millions de morts 1998)

Les vaccinations sauvent 3 millions de

vie /an
1,65 millions dindividus meurent de
maladies potentiellement vitables
par vaccination

TB

Rougeole

Diarrhes

Infections SIDA
resp
Aigues

Paludisme

Ncessit daugmenter la couverture

vaccinale (70%) et de diminuer les cots

Six maladies infectieuses causent 90% des

dcs dorigine infectieuse

Chapitre 11: La prise en charge de la

maladie
Les antibiotiques: les armes de la
guerre
Autres thrapies anti-infectieuses
Les antiviraux

La rsistance: une forme dadaptation

des microbes

ANTIBIOTIQUES

Les antibiotiques sont des substances chimiques secrtes par les microorganismes vivant en milieu terrestre ou aquatique. Ces substances ont des
caractristiques antibiotiques, cest--dire faisant obstacle la vie, et
servent tuer les micro-organismes concurrents ou les empcher de se
dvelopper (bactries).

Antibiotiques naturels et synthtiques

Substance naturelle produite par les
micro-organismes (ex. organismes du
sol: Streptomyces, Penicillium,
Cephalosporium,) et active sur dautres
bactries faible concentration.
Peut tre aussi produit par synthse
chimique partielle ou totale

Effet des antibiotiques

La plupart des infections gurissent spontanment aprs plus

ou moins de temps grce au contrle immunitaire

En cas dinfection bactrienne aigu ou dvolution spontane

dfavorable ou encore chez des patients dont la rsistance est
affaiblie, les antibiotiques appropris peuvent influencer de
manire favorable lvolution de la maladie.

Les antibiotiques ne gurissent aucune maladie infectieuse,

mais empchent les bactries de se multiplier. Notre corps a
ainsi le temps dorganiser sa dfense et de dtruire et
dvacuer les germes pathognes

Cibles bactriennes des principaux

antibiotiques

Effet des antibiotiques sur la croissance

bactrienne
Bactriostase et bactricidie

Incubation dun inoculum (106 UFC/ml)

en bouillon seul ou en prsence dune
gamme dantibiotiques
Numration des bactries viables
intervalles rguliers

Courbes de croissance en prsence dantibiotiques

Con sub-inhibitrice

Ralentissement de la croissance
Cons bactriostatiques

Courbes de croissance en prsence dantibiotiques

Con sub-inhibitrice

Ralentissement de la croissance

Instabilit de lAB

Le nombre de bactries devient

Infrieur linoculum
Cons bactricides

Selon lantibiotique,
leffet bactricide peut tre
temps dpendant
(indpendant de la Con au-del dun seuil)

Dose dpendant

Apparition de la rsistance

La rsistance un antibiotique, c'est un mcanisme que

la bactrie met en place pour neutraliser l'effet d'un
antibiotique qui se trouve dans son milieu de vie.

La rsistance aux antibiotiques est donc la rgle chez les

bactries dans la nature et la sensibilit aux
antibiotiques lexception

RESISTANCE
Pour un micro-organisme: mieux vaut tre
rsistant que virulent
Rsistance intrinsque (ou naturelle): insensibilit
un ou plusieurs antibiotiques de toutes les souches
dune mme espces ou genre bactrien
R acquise (mutation ou plasmidique pour les
bactries): une souche est dite rsistante
lorsquelle supporte une concentration dAB
beaucoup plus forte que celle qui inhibe le
dveloppement de la majorit des autres souches
de la mme espces

ANTIVIRAUX
Agents virostatiques (administrs par voie
gnrale)
Classs selon la cible (ARN ou ADN
polymrase, thymidine kinase, protase,
neuraminidase) ou selon la fonction
inhibe (entre-fusion)
Certains composants dorigine biologiques
(interfrons, immunostimulants)

Cibles virales des antiviraux

Interaction virus-cellule (via les rcepteurs)

Dcapsidation
Echaffaudage
Traduction

Cytoplasme
Virus ARN
Relarguage
Sortie du virus

Gertrude Elion 1918-1999, Prix Nobel 1988

Dcouverte de lacyclovir 1981

Rplication
du gnome

Noyau
Virus ADN
Rtrovirus

Le Tamiflu: Inhibition de la sortie

(virus de la grippe)

Rsistance et Persistance
Virus (HIV, HCV, virus grippal)
Certains virus humains persistent en
diminuant leur expression et/ou en
chappant au contrle immunitaire
(Herpesvirus, adnovirus, HIV, HCV)

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