Primer bloque

Clulas eucariontes y sus organulos

Clula ancestral hace 3000 millones de ao
Las diferencias entre las bacterias y las arqueas es el
hbitat donde se encuentran (Las arqueas viven en
climas ms extremos)
El ncleo es el organismo mas importante de la clula
contiene el ADN, adems de que constituye el
citoplasma
Citoplasma contiene todo el contenido extra celular de
las clulas
Mitocondria respiracin celular
Cloroplastos:fotosntesis
Citoesqueleto se extiende a travs del citoplasma

Segundo captulo
Molculas polmericas: Cadenas de subunidades qumicas
unidas a los extremos.
Enlaces qumicos:
Isotopos, variacin en el numero de protones en
un tomo
El tomo consta de neutrones, protones (+) y
electrones (-)
Los dalton son una medida para la masa de un
atomo con respecto a la masa del hidrgeno
Orbital de electrones, es el numero de electrones
que puede ocupar una orbita 2,8,8,18,18,
Los tomos ms estables son los que completan
sus electrones en su ultima orbita

 Enlace ionico: ceden sus electrones otro para completar

su orbital electronico externo
Enlace covalente:
una molcula es agrupacin de tomos que se mantienen
unidos por enlaces covalentes en el que los tomos
comparten electrones en lugar de transferirlo. Asi ambos
completan sus orbitales externos

Fuerza de enlace: cantidad de energa que debe utilizar

para romper el enlace, kcal/mol kj/mol
Enlace de hidrgeno: Cundo una regin con carga
positiva de una molcula de agua (H) se acerca a una
regin con carga negativa de una segunda molcula de
agua
CHON elementos de lo que estn compuestas las clulas

 El carbono constituye las denominadas molculas

organicas
-CH3 Metilo
-OH hidroxilo
-COOH Carboxilo
-C=O Carbonilo
-PO32- Fosforilo
-NH2 Amino
Las molculas que tienen la misma frmula qumica pero
distinta estructura se denominan ismeros
Los pares de molculas que son imgenes especulares (en
espejo) se denominan ismeros pticos
Los monosacridos se pueden unir por enlaces covalentes
(enlaces glucosidicos)
El monosacrido glucosa desempea un papel
importante como fuente de energa para las clulas
Glucogeno: Animales y Almidn: Plantas
Una molcula de cido graso tiene dos regiones qumicas
diferenciadas. Una cadena de hidrocarburos hidrfoba
(anfiptica) y la otra un grupo carboxlico
Los aminocidos compuestos por un grupo carboxilo y un
grupo amino

Son las subunidades de las protenas

La unin covalente de entre dos aminocidos se

denomina enlace peptdico
Hay 20 diferentes tipos de aminocidos
Un nucleosido es una molcula de formada por un
compuesto cclico nitrogenado unido a una azcar de 5
carbonos, que puede ser ribosa o desoxirribosa

 Los nucletidos que contienen ribosa se llaman

ribonucletidos
Los nucletidos que contienen desoxirribosa se llaman
desoxirribonucleotidos
Pirimidinas: Citosina, Tiamina y Uracilo (RNA)
Purinas: Guanina y Adenina
Su funcin principal es el de almacenar y recuperar
informacin biolgica
Enlaces Fosfodister
Capitulo 3
Las vas catablicas degradan los nutrientes
Las vas anablicas utilizan energa generada por el
catabolismo para impulsar la sntesis de las numerosas
molculas que forman la celula
La segunda Ley de la termodinmica dice que solo el grado
de desorden puede aumentar (entropa)
Primera ley de la termodinmica la energa no se crea ni se
destruye solo se transforma
La fotosntesis se divide en dos etapas:
Una en la que depende de la luz , la cual almacena
transitoriamente como energa de enlace qumico en
molculas pequeas especializadas que transportan
energa en sus grupos qumicos reactivos
La segunda etapa las molculas que actan como
transportadoras de energa ayudan a impulsar el
proceso de fijacin del carbono, en el que se
sintetizan azcares a partir de anhdrido carbnico y
agua.
Captulo 4.

 Las protenas se ensamblan a partir de un grupo de 20

aminoacido diferentes. Una molcula de protena est
formado por una larga cadena de esos aminocidos cada
uno ligado por un enlaces peptdico covalente
Cada protena tiene un orden singular de aminocidos
El Esqueleto polipetidico est formado por la secuencia
repetitiva de los tomo centrales de los aminocidos que
forman la cadena
Las cadenas laterales le otorgan a cada aminocido sus
propiedades particulares
Las cadenas largas son muy flexibles
Los enlaces no covalentes que ayudan a mantener la
forma de las protenas son: puentes de hidrogeno,
atracciones electroestticas y las atracciones de
van der Waals, son ms dbiles que los enlaces
covalentes normales.
Factor importante que rige el plegamiento de cualquier
protena es la distribucin de sus aminocidos polares y no
polares
Las cadenas hidrfobas pueden evitar el contacto con el
citosol acuoso que los rodea dentro de las clulas
Las cadenas laterales polares tienden a disponerse cerca
de la parte externa de la protena plegada
Cada protena tiene una esctructura tridimensional
particular
Una protena se suele plegaren la que la forma de energa
libre (G) se disminuye al minimo
Una protena se puede desplegar o desnaturalizar,
mediante el tratamiento con solventes que rompen las
interacciones no covalentes, que mantienen plegada a
la cadena. Este tratamiento convierte a la protena en una
cadena polipeptidica flexible, que ha perdido su forma
natural

 Cuando se elimina el solvente desnaturalizador a

menudo tiende a volverse a plegar de manera espontanea
o renaturaliza a su conformacin natural
Cuando las protenas se pliegan de modo incorrecto
pueden daar las clulas e incluso tejidos enteros:
Alzheimer y enfermedad de Huntington
Enfermedades por priones: encefalopata espongiforme
(bovina/ovina) (enfermedad de las vacas locas)
Enfermedad Creutzfeldt-jacob
La insulina es una protena de seal
Las chaperonas moleculares, evitan que las cadenas
proteicas recin sintetizadas se asocien de manera
incorrecta (Vigila el correcto plegamiento de las protenas)
DOMINIOS:
Primarias: Secuencia lineal de aminocidos
Secundarios: Abarca las hlices a y las hojas B que se
forman en ciertos segmentos de una cadena
polipeptdica
Terciario: : Abarca las hlices a y las hojas B, espirales
aleatorios, cualquier otro bucle y pliegue que se forma
entre N-terminal y C-Terminal
Estructura cuaternaria: se forma como un complejo de
ms de una cadena polipeptidica
Los diferentes dominios de una protena a menudo se
asocian con diferentes funciones

 La primera protena secuenciada en 1955 es la insulina

Las hlices es una estructura que se asemeja a una
escalera en forma de caracol. Se forma cuando una
cadena polipeptdica gira sobre s mismo formando un
cilindro rgido, con vueltas de cada 3,6 aminocidos ya sea
dextrgira o levgira. Abundan como protenas de
transporte y receptores
Las hojas B se forman cuando se generan enlaces de
hidrogeno entre segmentos adyacentes de las cadenas
poli peptdicas, cuando corren en una misma direccin se
le considera una hoja B paralela
Las familias proteicas a pesar de ser similares en su
secuencia y en su forma, tienen funciones diferentes.
Los sitios de unin es cualquier regin de la superficie de
una protena que interacta con otra molcula por medio
de grupos de enlaces no covalentes
Cada cadena en un complejo de protenas es una
subunidad

 Un Dmero es la unin de dos subunidades idnticas que

forman un complejo simtrico (formado a partir de copias
idnticas )
Las enzimas tienden a ser protenas globulares
La mayor parte de las protenas tienen forma redondeadas
Filamentos de queratina son en extremo estables
A-queratina es un dimero de dos hlices a largas, forma
una disposicin en espiral.
Dominios globulares contienen sitios que permiten
ensamblarse en filamentos intermedios
Las protenas fibrosas son especialmente abundantes en
el exterior de la clula forman la matriz extracelular de
tipo gel, que ayuda a las clulas a unirse entre s y
constituir tejidos
El colgeno es la ms abundante de las protenas fibrosas
La elastina que se diferencia por completo del colgeno
Los enlaces cruzados ms comunes de las protenas son
los enlaces azufre-azufre (Enlaces S-S)
Los enlaces S-S actan como una especie de grapa
atmica, un ejemplo es la lizosima que se encuentra en
saliva, y otras secreciones
Las propiedades de la protena se basa en su interaccin
con otras molculas
El ligando es el sitio de unin de la protena a otra
molecula
La especificidad : cada molecula solo puede unir a una o a
unas pocas molculas de los muchos miles de molculas
diferentes con la que se encuentra
La capacidad de unin de una protena se debe a sus
enlaces dbiles
La interaccin eficaz se debe a muchos enlaces dbiles

 Cuando las molculas tienen poco espacio compatibles se

forman escasos enlaces no covalentes y las dos molculas
se disocian rpido (evita asociaciones incorrectas)
La regin de una protena que se asocia con un ligando,
conocida como sitio de unin
Los tomos situados en el interior de una protena no tiene
contacto con el ligando.
Un mnimo cambio en la estructura de los aminocidos
puede cambiar la estructura y anular su capacidad.
Los anticuerpos o inmunoglobinas, son protenas
producidas por el sistema inmunitario en respuesta a
molculas extraas, se une estrechamente a una molcula
diana, para su desactivacin o destruccin.
Las enzimas determinan todas las transformaciones
qumicas que se producen en las clulas
Se unen a uno o ms ligandos denominados
sustratos
Actuan como catalizadores
Forman o rompen enlaces covalentes a voluntad
Cada una tiene una funcin en especifica
El producto de una enzima suele ser el sustrato del
siguiente
La lizosima es la primera estructura en detalle
atomico
La energa de activacin para reacciones de este tipo
es una barrera de energa
El estado de trancision
Sitio activo: sitio de unin sobre la superficie
Pasos para la hidrolizacion:
La enzima pone tensin a su sustrato
El cido asprtanico de carga negativa reacciona con
el atomo de carbono del azcar distorcionado

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 Una molecula de agua interacciona

La unin de las enzimas cambia la forma de los sustratos
El sitio activo tambin funciona como molde o plantilla
acercade a los reactantes en la orientacin apropiada de
modo que se produzcan la reaccion qumica entre ellos
La mayora de los frmacos inhiben la actividad de una
enzima
Rodopsina: Pigmento purpura sensible a la luz elaborado
por los bastones de la retina
Las enzimas usan molculas no proteicas como un
pequeo atomo de metal Carboxipeptidas: ion de zinc
Las enzimas completan una compleja red de vas
metablicas
Regulacion negativa: Impide que una enzima actue
Regulacin positiva la actividad enzimtica es
estimulada
Proteinas motoras: generan fuerzas responsables de la
contraccin muscular.
Receptor tirosincinasa: esta fosforilacion suele
desencadenar el ensamblaje y la activacin de complejos
intracelulares elaborados de protenas de sealizacin,
que transmiten el mensaje para crecer o dividirse.

Captulo 5

Las protenas son macromolculas que realizan la mayora

de las funciones de las clulas: estructura, enzimas, regulan
la expresin de genes y permite que las clulas se muevan y
comuniquen entre si

1940 descubrimiento del ADN

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La condensacin de los cromosomas es necesaria para la

duplicacin del ADN

La totalidad de la informacin del DNA recibe el nombre de

genoma

El ADN consiste en dos largas cadenas de polinucleotidos.

Cada caden de DNA (Hebras) esta compuesta por 4
subunidades (nucleotidos) y ambas denas unidas por
enlaces de hidrogeno ente las bases de los nucleotidos.

Los nucleotidos que estan compuestos por una pentosa,

carbohidrato simple de 5 carbonos a la cual se une uno o
ms grupos fosfatos y una base nitrogenada.

Las bases pueden ser Adenina, Citosina, guanina y tiamina.

Pentosa-fosfato-Pentosa-fosfato

Se aparean A-T y G-C

Hay 10 pares de bases por cada vuelta helicoidal

Los cromosomas materno y paterno de un par se conoce

como cromosomas homlogos

El cariotipo humano es el ordenamiento de los 46

cromosonas humanos

Un cromosoma es una cadena lineal enormemente larga.

La cromatina es el complejo de DNA y proteinas (Histonas)

Un gen suele definirse como un segmento de ADN que co

tiene instrucciones para la elaboracin de una protena
particular o conjunto de protenas de parentesco muy
cercano.

Un cromosoma funcional tiene que ser capaz de duplicarse

y las copias producto de la duplicacin deben separarse y
distribuirse de forma confiable en cada divisin celular
(ciclo celular)

Los cromosomas de interfase o interfasicos son los

cromosomas en estado extendido

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o Un tipo de secuencia de nucletidos actua como

origen de la replicacin
o Otra secuencia de DNA forma los telomeros que
se encuentran en cada uno de los extremos de
ADN , que contienen secuencias repetidas de
nucletidos que permiten los extremos de los
cromosomas se dupliquen.
Cuando el ciclo celular alcanza la fase M, el DNA se enrolla
y adopta una estructura cada vez ms compacta
formando finalmente los cromosomas mitticos muy
compactados o condensados.
Una vez que los cromosomas se han condensado la
presencia de la tercera secuencia especializada el
centrmero permite que una copia de cada cromosoma
sea duplicado y distribuido a cada celula hija
El nucleo est delimitado por una envoltura nuclear
formado por dos membranas concntricas

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-La lisina y la arginina proteinas

en las histonas

que se encuentran

-Silenciador: Presente porque mantiene una lnea, pero no se

expresa
-Inhibidor: Inhibe y no est presente

Capitulo 6
Repliacin: duplicacin precisa de la informacin gentica
Mutacion: Cambios en la estructura gentica

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 Las horquillas de replicaccion son uniones de ADN en

forma de Y en el proceso de replicacin
Se replican del 5 al 3
Segmentos pequeos de ADN segmentos de okasaki
DNA polimerasa sintetiza el DNA utilizando una de las
cadenasantiguas como molde

DNA polimerasa puede corregir un error mediante

correccin
Primasa enzima que sintetiza el cebador del RNA
RNA polimerasa enzima que sintetiza RNa usando ADN
como molde
Helicasa: separa a la doble hlice

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 Proteina de unin a cadena simple se adhiere al ADN de

cadena simple expuesto por la helicasa. Mantienedo la
forma estirada
Abrazadera deslizante: mantiene el ADN polimerasa
firmemete adherida al molde de ADN mientras se sintetiza
las cadenas nuevas de ADN, forma un anillo alrededor de
la hlice de ADN , sujetando de manera ceida a la
polimerasa , y permite asi que la misma se mueva a lo
largo de la cadena sin molde sin despegarse a medida
que sintetiza el ADN nuevo.
Cargador de la abrazadera: hidroliza ATP cada vez que
asegura una abrazadera alrededor del ADN, se disocia y
se vuelve a adheriri cada vez que se sintetiza un
fragmento de okazaki
Telomerasa enzima que se encarga agrega los
nucletidos que se pierden cada vez que un cromosoma
eucarionte se duplica mediante la replicacin de la cadena
retrasada mediante la replicacin convencional del ADN
Una mutacin que afecta a un solo par de nucletidos
puede daar gravemente a un organismo: Anemia
falciforme: Alteracion de la hemoglobina
Reparacin de apareamientos errneos de DNA se
dedica a corregir esos errores pocos frecuentes
Apareamiento errneo o incorrecto: en la maquinaria
aparece un error de copiado, deja por detrs un nucletido
mal apareado, si queda sin corregir, produce una mutacion
permanente en el siguiente ciclo de replicacin del ADN
Despurinizacin: perdida de una A o una G
Desaminacin: Perdida de un grupo amino
Reparacion de ADN daado:
El ADN daado es reconocido y eliminado por
uno de los diferentes mecanismos.
Involucran a las nucleasas, que escinden
enlaces covalentes que unen los nucletidos
daados al resto de la molecula de ADN y

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deja un pequeo espacio en una de las

cadenas de doble hlice
Un ADN polimerasa de reparacin se une al
extremo 3 hidroxilo y corta la cadena de
ADN. Despues llena el espacio al hacer una
copia complementaria de informacin
almacenada en la cadena inalterada
Cuando la polimerasa que repara el dao
lleno el espacio.
En las celulas somaticas humanas la forma ms comn de
reparacin de una cadena bicatenaria es mediante un
mecanismo que se denomina unin de extremos no
homologos. Los dos extremos rotos son aproximados a
travs de un grupo especializado de enzimas y vueltos a
unir por ligacin del ADN. Aunque repara la ruptura, se
suelen perder nucletidos en elsitio de reparacin.
La recombinacin homologa: se encarga del
intercambio de informacin gentica entre un par de
molculas de ADN homologas, es decir DNA bicatenarios
que son similares o idnticos en su secuencia nucleotida
Punto de ramificacin: Donde las dos cadenas
bicatenarias se cruzan
Entrecruzamiento
Elementos genticos mviles o transposones: segmentos
de ADN
Retrotransposones: L1. Una copia de ADN de este ARN se
sintetiza mediante la enzima transcriptasa inversa una
ADN polimerasa inusual que suele usar ARN como molde
ALU y L1: moldes
Lisis estallo
Los virus son genes rodeados de una cubierta proteica
protectora
Retrovirus se asemeja a los retrotansposones
Captulo 7

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18

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