La Idea Qumica

agosto-diciembre 2015

Novena edicin

ACS UPR-Ag
Divisin de Qumica Verde

El control y orientacin de genes activados por luz

Por Widaliz Vega | Miembro activo de ACS UPR-Ag

Cristina C. Torres Cabn, Editora

Hola! En esta edicin, honramos
algunos avances en la rama de la
biologa. Tambin, los invitamos a
conocer acerca de algunas de las organizaciones activas en nuestro Departamento de Ciencias Naturales.
Consejera: Dra. Brenda J. Ramos
Santana

En esta edicin:

El control y orientacin de
genes activados por luz

La bio-impresin del ADN

Vida a escala nano

4-5

Bacterias para un planeta mas

limpio

Conoce a las organizaciones

estudiantiles

6-7

Charles Gersbach, profesor asistente del departamento de ingeniera

biomdica de Duke University, dirigi el estudio
y luego lo public en la
revista Nature Chemical
Biology el 9 de febrero
de 2015. ste y su equipo
de investigacin, lograron crear un sistema en
el cual podan activar
genes al exponerlos a la
luz. Este sistema se compone de 2 factores: un
sistema de defensa viral
de una bacteria y la habilidad fototxica de las
plantas de reaccionar a
la luz solar. Segn Lauren Polstein, candidata a
PhD de Duke University,
la tecnologa, tiene la
capacidad de activar o
desactivar, utilizando la
luz, cualquier gen de un
cromosoma. Adems,
nos comenta que la ventaja de utilizar la luz es
por su facilidad y rapidez
al activar o desactivar el
gen, controlando a su
vez el nivel de activacin
al cambiar la intensidad
de la luz. Para evitar que
el gen se active o desactive en cualquier momento que el mismo se

exponga a la luz, se usan

patrones especficos de
luz para llevar a cabo el
proceso.
Para poder orientar el
gen, se utiliza el
CRISPR/Cas9 System,
tambin conocido como
LACE System. Este
sistema, induce la transcripcin de genes endgenos en presencia de la
luz. La induccin del sistema se debe a la unificacin de protenas heterodimerizantes que
inducen la luz, como:
CRY2, dominio de transactivacin, y CIB1, se
une a la nucleasa Cas9
inactiva en LACE. Lo
conveniente del sistema
es que puede ser utilizado para orientar o controlar nuevas secuencias
de ADN. Por qu es
beneficioso este sistema? Todo se debe a su
accin fototxica, ya que
los investigadores pueden llegar a tener una
mejor descripcin de
cmo funcionan los genes, o para poder crear
sistemas beneficiosos
para el crecimiento de
tejido. Lo interesante es
que al unir el LACE

System con una de las

dos protenas que hacen
que las plantas crezcan o
florezcan al ser expuestas al sol, y protenas
activadoras de genes a la
otra protena, el equipo
logr exitosamente activar y desactivar algunos
genes al exponerlos con
luz azul.
Entre las aplicaciones
potenciales para este
nuevo sistema, se encuentra su gran utilidad
para la ingeniera de tejidos o como menciona
Gersbach, como un aparato con una luz azul que
cuando se expone a una
herida hace que se cure
automticamente, siendo esta, evidentemente
una visin futurstica.
Este sistema es excelente y nos muestra cmo
se pueden reducir los
costos al momento de
utilizarlo. Podemos ver
entonces, como se pueden observar cmo se
cumplen 2 de los 12 principios de la qumica verde, siendo stos: disminucin del consumo
energtico y la potencia
de la catlisis.

La Idea Qumica

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La bio-impresin del ADN

Por Erika N. Ortiz | Miembro activo de ACS UPR-Ag
Desde el descubrimiento del
ADN, han surgido un sin nmero
de investigaciones interdisciplinarias que han abierto las puertas para el profundo entendimiento y la posibilidad de manipular el mismo. Entre la infinidad
de temas que emergen de un
siglo de investigacin, se destaca
la medicina regenerativa, y dentro de ella, la bio-impresin tridimensional. El principio es simple:
Si tenemos el cdigo, por qu
no fabricar el producto?
La impresin tridimensional no
es otra cosa que un proceso
aditivo en el cual capas sucesivas
de material son distribuidas para
formar una figura tridimensional.3 Originalmente, esta se
utiliz solo para materiales inertes, pero mientras fue progresando el entendimiento de cmo
se desarrolla el embrin humano, floreci la idea de la construccin de rganos y tejidos
mediante un impresor tridimensional. El proceso de bioimpresin conlleva varios pasos:
1. Obtener la imagen del tejido u rgano perjudicado. La
imagen del tejido u rgano
es esencial ya que provee
informacin de la estructura
y el funcionamiento del sujeto in vivo. Los mtodos
ms comunes son la tomografa computadorizada y
las imgenes por resonancia
magntica (CT y MRI respectivamente por sus siglas
en ingls).
2. Elegir el modelo o diseo a
utilizarse, Hay tres tipos de
modelos en los que se basa
la impresin tridimensional:
Biomimtica,
Autoensamblaje y Minitejidos. La biomimtica se
alinea por la reproduccin
artificial del tejido u rgano,
utilizando solo el biomaterial micro. El autoensamblaje sugiere que se manipule a

3.

4.

las clulas proveyndole el ambiente extracelular necesario para que ella misma se diferencie en el tejido deseado. Por su parte, el
concepto de mini-tejidos es relevante para
ambas de las estrategias anteriores3 y consiste de utilizar las unidades funcionales ms
bsicas de un tejido (como el osten del hueso por ejemplo) y de ah hacer una de dos
cosas, o ensamblarlas a un macro-tejido sinttico (biomimtica) o disear varios minitejidos y permitir que ellos mismos formen el
macro-tejido (autoensamblaje).
Seleccionar el material que se utilizar como
andamio. El andamio se refiere a la matriz
extracelular en la que se coloca la clula al
principio del proceso. El propsito de sta es
proveerle a la clula el ambiente necesario
para que comience a desarrollarse. Adems,
parte de su funcin es ir degradndose y permitiendo que el tejido secrete su propia matriz mientras se va madurando. El andamio es
imprescindible para la impresin efectiva del
rgano o tejido y la capacidad del tejido de
permanecer viable. No solo esto, en el caso
de las clulas madres, la diferenciacin celular depende en gran medida de su ambiente.
El material a seleccionarse debe ser capaz de
proteger a la clula durante el proceso de
impresin, as como permitir la precisin espacial y temporal de esta. Debe ser biocompatible, esto no solo significa una sana interaccin con el tejido endgeno, sino que debe
facilitar y apoyar el funcionamiento del tejido. Adems, debe ser degradable, y esta degradacin debe coincidir con la taza en la que
el tejido va produciendo su propia matriz y no
debe secretar sustancias txicas para el tejido. Tambin, el andamio debe proveerle al
tejido todo el apoyo estructural que recibira
si se estuviese produciendo naturalmente.
Esto, no solo porque es clave para la creacin
correcta del tejido, sino porque varios estudios han revelado que la diferenciacin celular tambin es afectada por factores fsicos,
tales como tensin, interacciones adhesivas,
mecanotransduccin y la figura que adopte la
clula a causa de la topografa a nano-escala.
Como se pudiese imaginar, esto se ha presentado como un gran reto para investigadores,
y es aqu donde la bioqumica, utilizando principios de la qumica verde, ha aportado grandemente al desarrollo de la bio-impresin.
Seleccionar el tipo de clula a utilizarse. El
uso de clulas madres es comn porque su
manejo no es tan restrictivo como el de clu-

5.

6.

las ya diferenciadas. An ms,

las clulas madres son preferibles ya que tienen una alta
capacidad de dividirse y mantenerse en su estado indiferenciado, como diferenciarse
en una amplia variedad de
tejidos.
La Bio-impresin en s. Este
quinto paso conlleva una de
las tres tecnologas principales
utilizadas para bio-impresin:
la bio-impresin inkjet,
microextrusin y bioimpresin lser-asistida. Finalmente, la aplicacin. Este
ltimo paso se ha logrado con
piel y cartlago, y se pronostica
que pronto se lograr con tejido tubular. Los retos a largo
plazo son los rganos huecos
como la vejiga y los rganos
slidos.
La aplicacin. Desde la concepcin, el cdigo de ADN
reacciona a condiciones externas, tejiendo una amalgama
de protenas, transmitiendo
una amalgama de seales que
resultan en un organismo organizado y funcional. Y nosotros, mediante el estudio de
este cdigo y las condiciones
que lo hacen funcionar, podremos en algn futuro, no tan
lejano, ser capaces de grandes
cosas, incluyendo el diseo de
rganos de reemplazo.

La expresin de ADN resulta en un organismo.

Drury University

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Novena edicin

Sonre!

Beatrice the Biologist

Vida a escala nano

Nanotecnologa y cncer
Por Andrs Hernndez | Miembro activo de ACS UPR-Ag

La nanotecnologa ha
tenido un crecimiento
exponencial en estos
ltimos aos en el campo de la medicina. La
razn es la gran ventaja
que tienen las nano partculas para tratar enfermedades. Las nano
partculas son estructuras, mayormente esfricas, a escala nano (10-9)
que pueden ser utilizadas para enviar drogas a
alguna parte del cuerpo
en especfico. Entre sus
ventajas podemos incluir que son fcilmente
modificadas para tener
afinidad a tejidos del
cuerpo. Estas liberan las
drogas o genes solo
cuando reciben el estimulo adecuado; de esta
forma se evita la perdida de medicamento y el
dao a otros tejidos
sanos. Su composicin
puede variar dependiendo de la enfermedad o rea del cuerpo
que se est tratando.
Estas pueden tener una
composicin orgnica,
inorgnica o una combinacin de ambos.
Estas han mostrado ser
efectivas para tratar
enfermedades como el
cncer. El cncer es una
condicin causada por
varias mutaciones genticas, especficamente en aquellos genes
que regulan la divisin
celular. Por esta razn,

las clulas cancerosas

se dividen incontrolablemente creando acumulacin de tejidos llamados tumores. El cncer empieza cuando las
clulas del tumor logran
tener acceso al corriente sanguneo y emigran
a otras partes del cuerpo, este proceso se conoce como metstasis.
Las clulas cancerosas
desarrollan caractersticas distintivas como: un
ambiente acdico causado por la liberacin de
cido lctico por el proceso de gluclisis y una
permeabilidad mayor
para adquirir ms nutrientes del ambiente
extracelular. Los cientficos han utilizado estas
caractersticas para
crear nano partculas
que sean afn con los
tejidos cancerosos.
Recientemente, se han
desarrollado varias tcnicas nanotecnolgicas
para tratar el cncer. La
primera es la creacin
de las nano partculas
teransticas. Las mismas tienen la habilidad
de diagnosticar y tratar
la enfermedad a la misma vez. Son creadas
con un imn en su centro que puede asistir en
el anlisis hecho por las
mquinas de MRI. De
esta manera se pueden
visualizar los tumores
con mayor contraste y

resolucin. Adems,
estas contienen drogas
que son liberadas al entrar en contacto con los
tejidos cancerosos.
Otra tcnica muy interesante y revolucionaria es la creacin de
una nano partcula que
simboliza un capullo
esfrico. El casco o
membrana que rodea el
capullo esta hecho de
una hebra de ADN con
protenas de cido flico y en su interior contiene la protena
DNAasa y una droga
llamada doxorubicina
(DOX). Esta protena
tiene la habilidad de
romper las hebras del
ADN. La razn por la
cual est inactiva dentro del capullo es porque est rodeada por un
polmero. Este complejo polmero protena
se visualiza como una
espada adentro de su
vaina. Al entrar en contacto con el tejido canceroso las nano partculas se pegan a los receptores utilizando las protenas de cido flico en
su membrana. El tejido
las absorbe y dentro el
ambiente acdico degrada el polmero que
inhibe la protena
DNAasa y esta a su vez
comienza a degradar el
capullo y libera DOX
dentro de la clula can-

cerosa. Como consecuencia la

droga causa la muerte de la
clula. Este mtodo es muy
especfico porque el ambiente
acdico que causa la liberacin
de la DNAasa no se encuentra
en clulas normales, slo se
encuentra en clulas cancerosas.
Es importante enfatizar los
principios de la qumica verde
que se exponen en este artculo. El primero es resaltar que
la cantidad del uso de materiales es muy pequeo ya que
son estructuras a escala nano.
Adems, el uso de reactivos es
preciso y casi nada se pierde
en el cuerpo innecesariamente, cumpliendo con el principio de economa atmica. La
razn es la gran afinidad que
tienen las nano partculas a su
blanco. La nanotecnologa ha
demostrado ser una ciencia
muy prometedora en la batalla contra el cncer. No obstante, esta no se limita solo al
cncer sino que tambin podra ser utilizada para combatir otras enfermedades y para
la terapia gnica en un futuro.

La Idea Qumica

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Nanotecnologa y Alzheimers
Por Fabiola Gallardo | Miembro activo de ACS UPR-Ag
Las enfermedades neurolgicas son difcil de tratar dado que el cerebro est cubierto por una barrera hematoenceflica (Blood-brain en
Ingls) la cual regula y restringe diversas sustancias
encontradas en la sangre de
entrar al sistema nervioso. El
Alzheimer es una enfermedad neurolgica y progresiva
que afecta el cerebro mediante la perturbacin de las
neuronas causando prdida
de memoria. Es una enfermedad predominante en la
etapa senil del ser humano y
an se desconoce de su causa
y cura, en su totalidad. Actualmente, se est trabajando con la protena -amiloide
que asiste el crecimiento y
reparacin neural, la misma
se dificulta con el tiempo
tornndose en un causante
del Alzheimer.
Como inicio a tratamientos
del Alzheimer tenemos que
traspasar la barrera hematoenceflica para la distribucin de medicamentos contra el exceso o acumulacin
de la protena -amiloide
formada por la enzima secretasa. Actualmente hay
varios mtodos siendo desarrollados para traspasar la
barrera hematoenceflica
como los catteres, nano
partculas y anticuerpos de
doble cara. Cada mtodo

ofrece una manera distinta

para traspasar la barrera pero
no necesariamente son convenientes a la salud del ser
humano. Los catteres es un
mtodo en cual se inserta un
tubo directamente en el cerebro para administrar un
medicamento, pero se ha
comprobado inconveniente
ya que no hay una distribucin eficaz del mismo con
este mtodo.
Los mtodos predominantes
en este momento son los
anticuerpos de doble cara y
nano partculas. Los anticuerpos de doble cara se basan
en traspasar la barrera al
pegarse de la protena transferrina, que si es aceptada a
travs de la barrera hematoenceflica. Funciona dado
que es un anticuerpo modificado con dos puntos de adhesin, uno para la transferrina y otro para la enzima secretasa, formador de amiloide. Al adherirse con la
enzima -secretasa la inhibe
de crear -amiloide y reduce
la posibilidad del Alzheimer.
Este mtodo tiene como
efecto colateral que el anticuerpo se apegue a los glbulos rojos por los niveles de
transferrina en ellos. Con las
nano partculas existen diversos mtodos, los ms destacados se basan en adherirse a

molculas que s traspasan la

barrera y administran la medicina en ellos para luego
verse afectado en el cerebro.
El otro mtodo relacionado
con nano partculas conlleva
el magnetismo, las partculas
llegan a la barrera y con una
resonancia magntica elevan
su temperatura para penetrar
la barrera formando un orificio por dos horas.

mtodo y mantener los efectos de

toxicidad a un mnimo. Un procedimiento ejemplar va directamente a
traspasar la barrera hematoenceflica y distribuye la medicina de manera controlada y sin daos a la barrera
y cuerpo, eficazmente combatiendo
el Alzheimer.

Cada uno de los mtodos

falla en cumplir con algunos
de los 12 principios de la qumica verde. Los anticuerpos
de doble cara y nano partculas ambos fallan con el uso de
metodologas que generen
productos con toxicidad reducida dado que los anticuerpos de doble cara se consideran gravemente txicos para
el cuerpo al atacar los glbulos rojos y las nano partculas
pueden ser altamente neurotxicas si no son administradas correctamente. Otro
principio que se observa es la
generacin de un producto
eficaz pero no txico, en
otras palabras lograr que
algn de estos mtodos o
variaciones de ellos llegue a
combatir el Alzheimer sin
afectar el cuerpo. Al poder
controlar y observar el proceso estaramos cumpliendo
con el desarrollo de la metodologa para monitorizar el

Las nano partculas inhiben la formacin de la protena -amiloide. ACS

Pgina 6

La Idea Qumica

Bacterias para un planeta mas limpio

Por Karyliz Hernndez | Miembro activo de ACS UPR-Ag
Uno de los principales
problemas del planeta
Tierra es la contaminacin
y el abuso de fuentes susceptibles de agotamiento
(entindase petrleo, etc.)
estos factores provocan
un grave impacto al planeta. Sin embargo existen
otras fuentes, las cuales
son seguras para el medio
ambiente, conocidas como las energas renovables. Estas energas son
un poco ms costosas y
presentan dificultad para
almacenar, sin embargo
son fuentes inagotables.
Una de las energas renovables reconocida, son las
bioenergas. Esta energa
involucra a los biocarburantes, biocombustibles y
biogas, los cuales intenta
sustituir el carbono fsil y
crear energa con fermentacin. Para producir bioenerga se debe transformar la biomasa por termoqumica, conversin
biolgica o conversin

qumica. La biomasa se
realiza con la utilizacin
de las plantas, a travs de
la fotosntesis transforma
la energa solar en energa
qumica; esta se puede
almacenar o transformar
en combustible. Uno de
los combustibles ms utilizados en reas industriales y domsticas es el etanol. Sin embargo existe
otro tipo de etanol el cual
es producido a partir de
materiales biolgicos como plantas y animales,
est se llama bioetanol.
Bilogos de la Universidad
de Indiana creen haber
encontrado una manera
ms rpida, econmica y
limpia de incrementar la
produccin de bioetanol
con el uso del gas nitrgeno (N2). Esto podra
ayudar ya que se evita el
uso de fertilizantes industriales los cuales son muchos ms costosos El etanol celulsico es un bio-

etanol producido a partir

de materiales de madera,
pastos o de partes incomible de plantas, este
ofrece emisiones de carbono ms baja que el etanol convencional. El nitrgeno es un nutriente importante que facilita el
crecimiento de los microbios productores de etanol. Los productores del
etanol celulsico gastan
millones de dlares al ao
para poder obtener fertilizantes nitrogenados como
licor de maz fermentado
y fosfato diamnico. Sin
embargo, se descubri
que la bacteria Zymomonasmobilis, productora del
bioetanol, puede utilizar el
N2 como fuente de nitrgeno. Se encontr que el
rendimiento de etanol se
mantuvo sin algn cambio
cuando la bacteria utilizaba N2 y que en ciertas condiciones, convertan las
azcares en etanol mucho
ms rpido. Esto sera una

forma eficaz de sustituir los fertilizantes nitrogenados y utilizar

N2 para la produccin de etanol
celulsico. El nuevo uso del gas
N2 puede reducir ms de 1 milln
de dlares al ao.
Tambin puede beneficiar al medio ambiente ya que se evita las
emisiones de CO2 que estn asociados con los fertilizantes industriales. El principio de la qumica
verde aplicado es: la utilizacin
de materias primas renovables.

Conoce a las organizaciones del Dept. de Ciencias Naturales!

Vida Marina

Por Erick Soto | Project Manager en Vida Marina

El Centro de Restauracin
y Conservacin Ecolgica:
Vida Marina, es un centro
dedicado a la restauracin
ecolgica y a la biologa de
conservacin marina
(incluyendo las tortugas
marinas del rea noroeste
de la isla) cuya misin es
restaurar ecolgicamente y
conservar reas costeras.
El centro opera desde la
Universidad de Puerto Rico
en Aguadilla y tiene una

base comunitaria fuerte ya

que cuenta con un grupo de
estudiantes, sub graduados
de la Universidad de Puerto
Rico en Aguadilla quienes son
los principales recursos del
mismo y voluntarios de la comunidad.
El Centro contribuye con la
restauracin ecolgica de
reas importantes como las
dunas de arena y monitorea
las tortugas marinas en el

rea noroeste de la isla, mientras

contribuye a la creacin de futuras generaciones de un nuevo
tipo de especialista ambiental,
uno que pueda traducir asuntos
cientficos y sociales en poltica
pblica efectiva. El Centro actualmente opera con fondos del Servicio de Pesca y Vida Silvestre de
los Estados Unidos de Amrica y
del Departamento de Recursos
Naturales y Ambientales de
Puerto Rico.

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Novena edicin

Sociedad Ambientalista Universitaria (SAU)

Por Tatiana M. Carrero | Presidente SAU 2015-2016
Nuestro grupo fundado en
el 1999, es una
organizacin estudiantil
dedicada a la educacin,
demostracin y
diseminacin de la
informacin tcnica y
cientfica asociada con el
ambiente a la comunidad
universitaria y general.
Tambin, la SAU se
involucra y promueve la
investigacin de los temas
ambientales y actividades
relacionadas a dichos
temas. Somos una
organizacin abierta a
toda la comunidad
estudiantil universitaria de
nuestro recinto lo que
significa que no
necesariamente tienes que
ser del Departamento de
Ciencias Naturales para
poder ser miembro de
SAU. Nuestros miembros
deben cumplir con: tener

inters por el ambiente,

tener un promedio de
general de 2.00 o ms y
cumplir con una membresa
de $40 por ao acadmico.
Al igual que el Sol, nuestro
smbolo, estamos llenos de
energa para trabajar por
nuestro Planeta Tierra. Por
ser un rea tan extensa,

tenemos diferentes
actividades de acuerdo a
tus intereses. Entre estas
actividades estn: charlas
educativas dentro y fuera
del Recinto, asistencia a
congresos y talleres,
caminatas y visitas
interpretativas a la
naturaleza, visitas tcnicas
a entidades

As! Que anmate y nete a un

grupo dinmico y lleno de
oportunidades, adems de
ayudar y aprender sobre nuestro
planeta Tierra. Estamos ubicados
en el Departamento de Ciencias
Naturales y nos puedes encontrar
a travs de nuestra pgina de
Facebook: www.facebook.com/
SocAmbUni o nuestro tabln de
informacin en el primer piso de
Ciencias Naturales.

Sociedad Nacional de Honor de Biologa ()

Por Sue Heidi Loperena | Presidente 2015-2016
La Sociedad Nacional
de Honor de Biologa,
mejor conocida como
Tribeta (), es una
organizacin nacional
fundada en el 1922 por
el Dr. Frank G. Brooks
en la Universidad de
Oklahoma. Actualmente, existen ocho captulos en Puerto Rico, siendo Zeta-Lambda el captulo de UPRAguadilla. La tiene

gubernamentales y privadas,
trabajo voluntario para ayuda
(limpiezas de playa y embalses,
reciclaje del plstico en nuestro
departamento, huerto
demostrativo, contaje de aves,
investigacin ambiental,
propagacin de plantas en
peligro y otros), movie nights,
pasadas y camping. Adems,
nos gusta trabajar en
colaboracin con distintas
organizaciones y proyectos de
nuestro Recinto.

como metas desarrollar el

inters intelectual por las
ciencias biolgicas, promover la diseminacin del conocimiento cientfico y la
investigacin cientfica, y
proveer las herramientas
necesarias para el mejoramiento acadmico. Como
captulo de excelencia nos
involucramos en actividades
comunitarias, proveemos
charlas al estudiantado y
realizamos viajes de estudio

para promover el amor a la

ciencia. Gracias a la excelente
labor de nuestros miembros,
nuestro captulo ha ganado
Outstanding Chapter a nivel
nacional por cuatro aos consecutivos, y en 2014 fue el nico captulo de Puerto Rico en
ganar este premio.

La Idea Qumica
Vistanos en la web!
facebook.com/upragacs || acsuprag.com || acsuprag@gmail.com

La Sociedad de Qumica de los Estados Unidos de

Amrica, (ACS por sus siglas en ingls), est constituida
por profesionales y estudiantes con pasin a la qumica.
El captulo estudiantil de la Universidad de Puerto Rico
en Aguadilla demuestra esta pasin a travs de la educacin, la confraternizacin, y el trabajo voluntario con
la comunidad. Los invitamos a ser parte de nosotros
este ao acadmico 2015-2016.
nete!

Directiva del captulo de ACS UPRAg:

Ao 2015 - 2016

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