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(continuacin, parte 2)
Sumario
Dao en el DNA
Reparacin directa
Mecanismos de escisin
Reparacin de desapareamiento de bases
Reparacin inducida
2) NER: Reparacin por escisin de nucletidos, se corta la cadena de azcar - fosfato. Los
genes implicados, en el caso de E. coli, son Uvr (A, B, C, D). Los mutantes en genes Uvr son
muy sensibles a la luz ultravioleta, por tanto, los genes Uvr confieren resistencia a UV. Las
figuras siguientes muestran el mecanismo:
2 UvrA rastrean el DNA hasta encontrar una distorsin estructural (por ejemplo un dmero de
timina). UvrB queda unido en la zona lesionada, UvrA es eliminado y se recluta UvrC, que
produce dos cortes endonucleotdicos a ambos lados de la lesin, unos 5 nts en direccin 3' y
unos 8 nt 5'. UvrD que es una helicasa (tambin llamada helicasa II) desplaza el oligo que
incluye la distorsin (aproximadamente 14 nucletidos). La DNA polimerasa I rellena el hueco a
partir del extremo 3' OH libre y la ligasa lo sella. (Ver tambin la figura 14.28 Genes VII y otra
representacin alternativa del mecanismo).
sobre ellas, recordemos que la actuacin de la metilasa Dam tarda unos minutos, este es el
tiempo que permite reconocer la base errnea (ver Fig. 14.29Genes VII).
4.
Se asume que eventos similares tienen lugar durante la correccin de errores en levaduras y
humanos, excepto que la discriminacin de las cadenas no es dictada por metilacin, En su
lugar discontinuidades en la cadena nuevamente sintetizada pueden estar implicadas en el
proceso.
En organismos eucariotas se han encontrado que cnceres colorrectales (HNPCC, hereditary
nonpolyposis colon cancer) estn asociados (al menos un 90% de ellos) a mutaciones en
genes parecidos a los Mut L y Mut S, estos ltimos reconocen las mutaciones, lo que indica
que es un mecanismo muy conservado. No se han encontrado homlogos a Mut H, y parece
que no se necesita, ya que el mecanismo de reconocimiento se basa en la interaccin del
homlogo de Mut S con PCNA unido al ltimo cebador en la horquilla de replicacin.
En ocasiones el sistema reparador no tiene una forma intrseca de distinguir la base salvaje de
la mutada y es esta una forma en que se fijan las mutaciones. Existen sin embargo otras
formas de dirigir la restauracin de la secuencia salvaje. Por ejemplo para casos tales como la
desaminacin de 5-metil citosina a timina, hay un sistema especial para restablecer la propia
secuencia. La desaminacin genera un par G-T, y el sistema que acta sobre tal par tiene un
sesgo para corregilos a G-C (ms que a A-T). Se ha observado que el sistema Mut L, S
traslada siempre T de los dos apareamientos incorrectos G-T y C-T.
Otra actividad reparadora identificada por mut Y, reemplaza la A en los errores C-A y G-A. Este
sistema funciona por el traslado directo de la base del DNA (reparacin por escisin de bases).
Es interesante el hecho de que la DNA pol tiene la tendencia a introducir equivocadamente A y
la desaminacin de 5-metil C es frecuente (conduce a C U T/G). Es decir el residuo de G
codifica frecuentemente la informacin correcta y parece que las funciones de la glicosilasa han
evolucionado de acuerdo con los errores celulares intrnsecos de la replicacin y la reparacin
del DNA.
Ejemplos de genes mutadores, relacionados
con la replicacin o reparacin del DNA
Reparacin inducida
Ante una cantidad masiva de daos en el DNA, se disparan, como respuesta, mecanismos de
emergencia que se caracterizan por tener niveles superiores de protenas implicadas en
reparacin y recombinacin. El ejemplo tpico es larespuesta SOS, si la cantidad de lesiones
que hay en E. coli es muy superior a lo normal, se induce la respuesta SOS.
En los casos de reparacin vistos hasta ahora, los daos estaban en una sola de las dos
bandas, con lo que bastaba replicar la complementaria, pero si tenemos mutaciones masivas,
se puede replicar la zona antes de que d tiempo a reparar la lesin. Por ejemplo cmo se
reparan los dmeros de timina una vez que la horquilla ha pasado? Ahora la zona daada est
en la banda molde. Hay dos maneras de hacerlo:
1) Por recombinacin, suministrando el molde correcto de un DNA homlogo:
En la respuesta SOS se induce la expresin de una serie de genes (ver Tabla 25.6 Lehninger):
UmuD/C, que hace que la DNA polimerasa replique moldes daados a costa de
introducir mutaciones. Rec A activa, rompe proteolticamente, adems de lex A, a Umu
D generando la forma activa de la protena. El conjunto de Umu C y Umu D hace
perder fidelidad a la DNA polimerasa III (que estaba parada como consecuencia de la
existencia de daos en el DNA) y que copie la cadena molde aunque est daada,
dndose una replicacin errnea y en definitiva, generando mutaciones.
El gen sfi A est implicado en divisin celular, hace que se pare la divisin celular y se
producen filamentos de clulas.