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INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA

La Qumica es la ciencia que estudia la materia y sus transformaciones. Tiene que ver con varios campos como
son los de la Qumica Orgnica, inorgnica, fisicoqumica, qumica Analtica, bioqumica, la medicina, la
biologa y muchas otras disciplinas que tienen como centro de estudio los seres vivos.
La bioqumica es la ciencia que estudia la qumica de la vida. Ciencia que estudia los procesos qumicos en los
seres vivos, o ms especficamente de los procesos qumicos celulares. Tiene una extensa base de la qumica y la
biologa. Tiene una parte orgnica en su mayora y una parte inorgnica.
La bioqumica tuvo sus comienzos hace aproximadamente 100 aos, cuando algunos cientficos se dieron cuenta
que los procesos de la vida incluan fenmenos que podan ser explicados en trminos de las ciencias exactas
como la qumica y la fsica. En un principio fueron descubrimientos generales, como el descubrimiento o
separacin de sustancias orgnicas de los seres vivos, como la urea, la hemoglobina, la clorofila, etc. Luego se
desarrollo procesos en los cuales se explicaban sus funciones, hasta que en los ltimos 50 aos creci hasta ser
reconocida por qumicos y bilogos.
Actualmente se ayuda de muchas otras ciencias como la qumica orgnica, la cual analiza y separa los
compuestos del carbono, que es la base de los seres vivos; la qumica analtica, que nos dice qu clase de
compuestos contiene un organismo y las proporciones. La biologa que estudia los seres vivos integralmente, en
sus sistemas orgnicos y sus relaciones entre ellos. La fsica, la cual nos proporciona los instrumentos necesarios
para realizar el estudio ( microscopio electrnico, centrfuga, etc). La qumica analtica cualitativa y cuantitativa
que nos dicen qu compuestos y en qu proporcin estn en los seres vivos.
Hay una gran parte de la bioqumica que es esttica, es decir estructural, que nos habla del tipo de compuesto
que tiene un organismo. Se apoya en la q. Analtica cualitativa, la fsica, la biologa, la qumica orgnica y otras.
La bioqumica dinmica, que estudia las transformaciones de estos compuestos al interior de los organismos
vivos. O sea, aquellas reacciones qumicas que se realizan al interior de la clula, es decir se trata de la
bioqumica metablica. Se apoya en reas como la bioenergtica, la fsica, la q. General, la biologa y la
medicina.
Adems de las dos anteriores, existe la qumica de los procesos y las sustancias que almacenan y transmiten la
informacin biolgica. Este tercer campo es tambin rea de la gentica molecular, que pretende conocer la
herencia y la expresin de la informacin gentica en trminos moleculares.
El avance de la bioqumica ha sido tan amplio y expansivo que en la actualidad ya se aceptan varias reas de
especializacin: Bioenergtica, biologa molecular, bioqumica de las membranas, bioqumica de las protenas,
bioqumica de las plantas, neurobioqumica, bioqumica analtica y otras ms, as como subespecialidades de
cada campo. Existen decenas de miles de publicaciones de artculos, en distintas revistas cada ao, de revisiones
anuales y de monografas especializadas es el reflejo del crecimiento y del alcance de la bioqumica moderna.

LA LOGICA MOLECULAR DE LA VIDA.


La mayor parte de los componentes qumicos de los organismos son compuestos orgnicos de carbono en los
que el elemento se halla relativamente reducido o hidrogenado. Muchas biomolculas orgnicas contienen
tambin nitrgeno. Los compuestos orgnicos presentes en la materia viva muestran enorme variedad, y an la
mayor parte de ellos son extraordinariamente complejos. Las bacterias, que son clulas muy sencillas, contienen
gran nmero de distintas molculas orgnicas. Por ejemplo la Escherichia coli contiene alrededor de 5000
compuestos orgnicos diferentes y 3000 clases diferentes de protenas. La Clula humana posee 100000 clases
de protenas. Se ha calculado que en la naturaleza existen 1010 1012 tipos diferentes de molculas proteicas en
los seres vivos.

Las biomolculas sencillas - Protenas, cidos nucleicos, lpidos, carbohidratos- son idnticas en todas las
especies conocidas. Por ello se llega a la conclusin que todos los seres vivos proceden de un antepasado
comn. Esta identidad est preservada en un conjunto distintivo de cidos nucleicos y protenas.
Las clulas vivas contienen las molculas ms sencillas posibles en el mnimo nmero de tipos diferentes, que
les sean indispensables para la vida. Esto es lo que se conoce como el Principio de economa molecular:
La segunda Ley de la termodinmica establece que toda actividad fsica o qumica tiende a aumentar el
desorden del universo, es decir la entropa (S). Adems la energa disponible por los seres vivos no es creada
sino simplemente transformada (Primera ley de la termodinmica, La conservacin de la energa y la materia).
Los organismos vivos no constituyen excepciones de las leyes de la termodinmica. Su extremado orden
molecular no puede surgir espontneamente del desorden. Las clulas de su entorno absorben una forma de
energa (Energa Libre: energa capaz de realizar trabajo a T y P. Constantes) que les es til, a temperatura y
presin en que viven y devuelven otra energa que les es menos til (calor), los que aumenta la entropa o
desorden del entorno.
Segn los anteriores argumentos, se pueden establecer algunos Principios de las clulas vivas como los
siguientes:
-

En la organizacin molecular de la vida existe una simplicidad fundamental.

La identidad de cada una de las especies vivas, est preservada gracias a la presencia de un conjunto de
cidos nucleicos y protenas.

Los organismos vivos crean y mantienen su ordenacin esencial a expensas de su entorno, al que
transforman hacindolo cada vez ms desordenado y catico.

Las clulas vivas son un sistema abierto porque intercambian materia y energa con el entorno. Al
hacerlo lo transforman. Las clulas son un sistema abierto en estado estacionario, el cual se caracteriza
en que la velocidad de transferencia de materia y energa desde el entorno al sistema, se halla
compensada por esa misma velocidad desde el interior al exterior del sistema.

La clula es un sistema abierto que no est en equilibrio. Es una mquina de extraer energa libre del
medio y que contribuye al desorden del medio o aumento de la entropa. Las clulas vivas son muy
eficaces en la manipulacin de la energa y de la materia. Esta forma de manipulacin de la materia y la
energa es muy superior a cualquier mquina inventada por el hombre.

Las clulas estn construidas con molculas relativamente frgiles e inestables, incapaces de resistir
cambios bruscos de temperatura, presin, corriente elctrica, etc. Tienen tremenda eficacia, todas sus
actividades las realizan a concentraciones bajas de cidos y de lcalis, a T y P. del medio (bajas) con
presiones iguales en todas sus partes. Las clulas es una mquina qumica isotrmica.

La Energa Libre que absorben se recupera en forma de energa qumica por medio de la biosntesis, en
trabajo osmtico (e. Mecnica), locomocin y siempre a temperatura constante.

Las clulas pueden actuar como mquinas qumicas porque poseen enzimas, que son protenas que
catalizan reacciones qumicas especficas y con un rendimiento de 100%, donde no hay subproductos.
Actualmente se conocen unas 2000 enzimas.

El grado de especificificidad de las enzimas es consecuencia de que existe complementariedad estructural de las
clulas interactivas. Estas reacciones pueden ir en secuencias de 2 hasta de 20 etapas, formando secuencias
biolgicas importantes. Estas reacciones se hacen posible la transferencia de energa qumica. Son posibles
porque hay un intermediario comn entre las reacciones.
A

Donde B es el intermediario.
Las clulas heterotrficas utilizan molculas orgnicas para absorber energa de ellas, lo mismo que las
fotosintticas la extraen de la energa de la luz solar. Las dos la recuperan en forma de ATP, que es el
transportador de energa ms importante de las clulas.
El ATP transfiere su energa a otras molculas, perdiendo su grupo fosfato terminal y se transforma en ADP.
Este a su vez puede aceptar energa y recuperar su grupo PO4= para transformarse en ATP.
-

Las clulas tienen la capacidad de realizar muchsimas reacciones qumicas catalizadas por enzimas, a
una gran velocidad y simultneamente y tambin tienen la capacidad de regularlas. La acumulacin de
un producto final del metabolismo, tal como un aminocido, puede inhibir la etapa determinante de la
velocidad en la secuencia de reacciones, mediante las cuales se form. Esto es conocido como inhibicin
de retroalimentacin o feet-back. Regulan adems la sntesis de sus catalizadores. Otra forma es por
pre-alimentacin, es decir que un producto intermedio anterior puede regular una etapa posterior de la
cadena metablica. Conclusin: las clulas son capaces de regular sus reacciones metablicas y las
biosntesis de sus enzimas para obtener el mximo de eficiencia y economa.

La auto-rplica es una propiedad de las clulas vivas de reproducirse con fidelidad casi perfecta, muchas
veces. Toda la informacin se halla presente en los cromosomas, codificada en forma de secuencia
especfica de lo nucletidos constituyentes de una pequea cantidad de ADN. Los smbolos en los que se
halla codificada la informacin gentica en el ADN, son de dimensiones submoleculares. Esta
informacin es muy estable en el ADN. Se ha conservado por millones de aos en algunas bacterias.

La capacidad de las clulas de preservar su informacin gentica es resultado de la Complementariedad


Estructural. El ADN es un patrn para la rplica enzimtica de otra hebra de ADN. Este patrn
unidimensional, sirve para producir molculas o macromolculas tridimensionales como las protenas y
otras. Las protenas no son estables en forma unidimensional, sino que se enrosca y se pliega en una
estructura tridimensional para estabilizar as su estructura y de esa forma realizar su actividad biolgica.

Conclusin: La clula es un sistema isotrmico abierto de molculas orgnicas que se ensambla, ajusta y
perpeta por s mismo y opera segn el principio de mxima economa de partes y procesos; promueve muchas
reacciones orgnicas ligadas consecutivamente, destinadas a la transferencia de energa y a la sntesis de sus
propios componentes por medio de catalizadores orgnicos que ella misma produce.

La estructura de la clula
Las dimensiones celulares
En el caso de organismos procariotes (bacterias y arqueobacterias), el tamao celular oscila entre 0.1 y 10 m;
por su parte, los organismos eucariotes (protistas, hongos, plantas y animales) pueden tener tamaos que van
desde 5 hasta 100 m.
Diversidad celular. Correlacin estructura-funcin
Tanto las clulas procariotes como eucariotes se encuentran delimitadas por una bicapa lipdica denominada
membrana plasmtica que mantiene aislado el contenido de la clula del medio ambiente externo. A diferencia
de los organismos eucariotes, los procariotes carecen de organelos subcelulares, pero poseen invaginaciones de
la membrana plasmtica llamadas mesosomas, donde se llevan a cabo diversas funciones celulares como la
duplicacin del DNA o la fotosntesis (en el caso de bacterias fotosintticas). Adems de la membrana
plasmtica, muchas bacterias poseen una pared celular rgida que las protege de dao mecnico y de la presin
osmtica. La pared celular est compuesta principalmente por peptidoglicanos (polmeros formados por
oligosacridos y protenas). Las bacterias Gram-positivas tienen una pared celular gruesa (25 nm), mientras que

las Gram-negativas tienen una pared interna delgada (3 nm) y una segunda bicapa lipdica externa; el espacio
periplsmico separa a la pared de la membrana externa.
Por su parte los organismos eucariotes poseen una serie de cuerpos subcelulares delimitados por membranas
lipdicas; estos organelos poseen funciones altamente especficas, por lo que cada uno cuenta con protenas
especficas relacionadas con su funcin particular en el metabolismo celular. Cabe mencionar que algunos
eucariotes poseen estructuras particulares de las cules otros carecen; por ejemplo, adems de los organelos
caractersticos de las clulas animales, las clulas vegetales presentan cloroplastos y vacuolas, mientras que
existen algunos protistas que no tienen mitocondrias. A continuacin se detallan las funciones de las estructuras
y organelos celulares.

La membrana celular
Como ya se mencion, la membrana celular rodea a la clula y asla el contenido citoplasmtico del exterior,
contribuyendo as a la regulacin de la composicin inica y presin osmtica del citosol. La membrana es de
naturaleza semipermeable, es decir, nicamente permite el paso de ciertas molculas a travs de la accin de
protenas transportadoras o canales. Entre las funciones de la membrana celular se cuentan la comunicacin
intercelular -a travs de la unin de mensajeros qumicos a protenas receptoras localizadas en la cara externa
membranal-, la exocitosis (secrecin) y la endocitosis (internalizacin) de macromolculas.
El citoesqueleto
El citosol (definido como la fraccin citoplasmtica no incluida dentro de ningn organelo) no es una solucin
homognea; distribuido a todo lo largo del citosol se encuentra en citoesqueleto, formado por una red de fibras
que se entrecruzan. Las funciones de esta estructura son mantener y modificar la estructura celular (dependiendo
de las necesidades celulares de movimiento y desplazamiento) y guiar el transporte de vesculas intracelulares.
Las tres principales fibras que componen al citoesqueleto son los microtbulos (dimetro de 25 nm), los
filamentos intermedios (dimetro de 10 nm) y los microfilamentos (dimetro de 8 nm). Los microfilamentos
estn formados por actina y su papel es proporcionar soporte mecnico; la asociacin de la actina con miosina da
pie a la formacin de microfilamentos contrctiles que participan en el movimiento celular (como la formacin
de invaginaciones). Los filamentos intermedios parecen estar involucrados en la resistencia mecnica de la
clula. Por ltimo, la polimerizacin de unidades de tubulina da lugar a los microtbulos que a su vez forman
una red que gua el desplazamiento de los organelos y macromolculas dentro de la clula (la segregacin de los
cromosomas condensados durante la mitosis es consecuencia de la accin del huso mittico, formado por
microtbulos).
El retculo endoplsmatico
El retculo endoplsmatico (RE) esta formado por un conjunto de vesculas conectadas entre s; la membrana del
RE es en realidad una prolongacin de la membrana nuclear. A nivel microscpico se distinguen dos tipos: el RE
rugoso, en cuya cara citoslica se distribuyen los ribosomas (estructuras encargadas de la sntesis de protenas a
partir de RNAm) y el RE liso, que carece de ribosomas. En el lumen (parte interna) del RE rugoso se lleva a
cabo la modificacin post-traduccional (glicosilacin, ubiquitinacin, protelisis, etc.) de las protenas
sintetizadas por los ribosomas; estas protenas son en su gran mayora de membrana y secrecin. Por su parte, el
RE liso es donde se realiza la biosntesis de fosfolpidos y varias reacciones de destoxificacin.
El aparato de Golgi
Este organelo esta formado por una serie de vesculas planas, y se encarga de la distribucin de macromolculas
dentro de la clula. Las vesculas provenientes del RE rugoso que contienen protenas de membrana y secrecin
se funden con el aparato de Golgi, dentro del cul se realizan sucesivas reacciones de modificacin posttraduccional antes de almacenar dichas protenas en nuevas vesculas y finalmente distribuirlas a la membrana
plasmtica o a otros organelos (e.g. lisosomas y peroxisomas).
Los lisosomas
Estos organelos slo se encuentran en clulas animales y su funcin es degradar macromolculas tanto de origen
interno como de naturaleza extracelular. Con este fin, los lisosomas cuentan con una batera de proteasas,
lipasas, fosfatasas y nucleasas. Cabe mencionar que el pH de los lisosomas es cido (pH 4-5) y que las hidrolasas

exhiben su mayor actividad a estos valores de pH, pero se inactivan en regiones de pH neutro como el citosol y
el medio extracelular.
Las vacuolas
Las vacuolas son vesculas de gran tamao caractersticas de las clulas vegetales. Su funcin es almacenar
nutrientes, agua, iones y productos de desecho del metabolismo. Al igual que los lisosomas, su pH interno es
cido y contienen enzimas con actividades hidrolticas.
Los peroxisomas y los glioxisomas
La funcin de los peroxisomas es degradar cidos grasos y aminocidos. Uno de los productos secundarios de
estos procesos es el perxido de oxgeno, un compuesto txico para la clula. Por este motivo los peroxisomas
estn equipados con la enzima catalasa, que cataliza la descomposicin del perxido en agua y oxgeno
molecular.
Los glioxisomas son un tipo de peroxisomas especializados; adems de las reacciones tpicas de los peroxisomas,
en los glioxisomas se llevan a cabo las reacciones metablicas que componen el ciclo del glioxilato.
Las mitocondrias
La relacin estructura-funcin es particularmente importante en el caso de las mitocondrias y los cloroplastos.
Las mitocondrias tienen una membrana externa permeable y una membrana interna semipermeable con un gran
nmero de invaginaciones llamadas crestas. Rodeada por esta membrana interna se encuentra la matriz
mitocondrial. Entre el espacio intermembranal y la matriz se establece un gradiente de H+ que resulta
fundamental para la sntesis de ATP. La membrana interna es el sitio donde se lleva a cabo la fosforilacin
oxidativa y el transporte de electrones, necesarios ambos tambin para la sntesis de ATP. En la matriz
mitocondrial se efectan el ciclo del cido ctrico (o ciclo de Krebs) y el catabolismo de los cidos grasos. Las
mitocondrias poseen su propio genoma, que codifica varias protenas mitocondriales. Tanto las clulas animales
como vegetales poseen mitocondrias.
Los cloroplastos
Los cloroplastos tambin tienen una membrana interna y una externa, pero a diferencia de las mitocondrias en su
matriz cuentan con un sistema interconectado de vesculas planas con forma de disco llamadas tilacoides. Las
vesculas tilacoidales se agrupan una sobre otra para formar las estructuras denominadas grana. Dentro de los
tilacoides se encuentra la clorofila y dems enzimas que participan en la fotosntesis (proceso que implica la
conversin de energa luminosa en energa qumica en forma de ATP). El estroma (el espacio citoslico que
rodea a los tilacoides) es dnde se lleva a cabo la fijacin del carbono (en forma de CO2) en compuestos
orgnicos. Al igual que las mitocondrias, los cloroplastos poseen su propio DNA.
El ncleo
El ncleo es el organelo que contiene el DNA organizado en cromosomas. Dentro del ncleo se llevan a cabo los
procesos de duplicacin del DNA, la transcripcin y el procesamiento de los genes en RNAm. La envoltura
nuclear esta formada por un sistema de dos membranas (interna y externa) a lo largo de la cul se encuentran
dispersos los poros nucleares a travs de los cules diversas macromolculas (RNAm, protenas, ribosomas) son
capaces de desplazarse entre el citosol y el ncleo. El nuclolo es una regin dentro del ncleo donde se lleva a
cabo la sntesis del RNA ribosomal.
PREGUNTAS PARA EL ESTUDIO DE LA CELULA
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Qu factores hicieron posible el surgimiento de la vida en la tierra?


Cules son los elementos qumicos fundamentales de la vida?
Que es la sntesis prebitica?
Que organismos se consideran como el ancestro comn de los organismos vivos?
Hace cuanto tiempo pudieron haber surgido dichos organismos?
Por qu a los virus no se los considera clulas?
Con quin inici y cules son los principios de la teora celular.
Entre qu tamaos se encuentran las clulas?

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Cules son las tres partes en que se divide una clula eucaritica.
Que diferencia hay entre citoplasma y hialoplasma (citosol)?
Qu diferencias hay entre clulas procariticas y eucariticas
Cmo habran surgido las clulas eucariticas?
Una bacteria tpica de qu partes est constituida?
Qu son bacterias Gram-positivas y Gram-negativas?
De qu estn constituidas las membranas celulares.
Qu funcin tiene la membrana plasmtica?
Qu diferencias bsicas existen entre una clula vegetal y una animal?
Qu tipo de protenas contiene la membrana plasmtica.
Qu funcin cumple el colesterol en las membranas celulares animales?
De qu forma se unen las clulas del mismo tipo en un organismo pluricelular?
Qu funcin cumplen las CAMs en la unin entre clulas?
Qu mecanismos emplean las membranas para el transporte de sustancias?
Diga brevemente que funcin tiene cada tipo.
De qu est formado el ncleo celular?
Diga las funciones generales que cumple el ncleo.
Qu es la cromatina, heterocromatina y eucromatina?
Que son las histonas?
Qu son los cromosomas? De qu estn constituidos?
Qu es el ciclo celular y de qu periodos consta?
Que ocurre en cada periodo?
Que diferencias y semejanzas hay entre la mitosis y meyosis?
Qu organelos son comunes a la mayora de las clulas eucariticas.
Cmo habran surgido algunos organelos citoplasmticos.
Diga las funciones que cumplen: Las mitocondrias, ribosomas, lisosomas, corpsculo de golgi, retculo
endoplasmtico, peroxisomas, glioxisomas, cloroplastos, leucoplastos, cromoplastos, vacuolas, nucleolo.
De qu est formado el citoesqueleto?
qu funciones cumple?
Qu depsitos citoplasmticos pueden existir en una clula?
Qu clulas presentan pared celular;
De qu est constituida.
Cul es la diferencia de la pared celular animal con la bacteriana?
En qu parte del cloroplasto se lleva a cabo la fotosntesis?
Qu organelos contienen ADN
En qu organelos se efectan reacciones que producen energa?
Suponga que un cientfico asegura haber descubierto mitocondrias en bacterias. Es probable que tal
afirmacin sea cierta?
La bioqumica es distinta de la qumica orgnica? Explique su respuesta.
Por qu fue importante el desarrollo de la catlisis para el desarrollo de la vida?
Qu son los virus
De qu partes estn constituidos los virus.
Que son los virus bacterifagos
Que son los retrovirus.

BIBLIOGRAFA:
ALBERTS, B. Molecular Biology of de Cell. Fourth Edition. http://www.geocities.com/zrnet76/. 2002
LEHNINGER, A. L. Bioqumica, 4da Edicin. Ed. Omega. Barcelona. 2005.
MATHEWS, C. Y VAN HOLDE, K. Bioqumica. Segunda Edicin. Ed. McGraw- Hill Interamericana. Madrid.
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STRYER, L. Bioqumica. Vol I y II. Ed. New York: Worth Publishers, 2001.
VOET. D. Fundamentos de bioqumica. 2 edicin. Ed. Panamericana. Buenos Aires. 2008