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Enzimas celulares

• Sintasas: Catalizan reacciones de condensación en


las que no está involucrado el ATP.
• Sintetasas: Reacciones de condensación que utilizan
ATP
• Ligasas: Sintetasas.
• Liasas: Catalizan eliminaciones (cortes) en lo que
sucede un rearreglo electrónico. Pueden catalizar la
reacción inversa de adición.
• Cinasas: Transfieren el grupo fosfato de un nucleosido
trifisfato a un aceptor (azucar, proteína, otro nucleótido,
intermediarios metabólicos).
• Fosforilasas. Catalizan reacciones de fosforolisis,
reacciones de desplazamiento con fosfato como especie
atacante.
• Fosfatasas: Remueven grupos fosforilos con agua como
especie atacante.
En mamíferos, complejo
inhibido por fosforilación Decarboxilación
específica en serina
oxidativa de piruvato a
AcCoA

Decarboxilación

Oxidación

La cercanía de las enzimas


acelera la reacción y evita
reacciones secundarias

Transferencia
Deficiencia de tiamina:
Metabolismo cerebral
Beriberi
Regulación del complejo piruvato deshidrogenasa
Más fácilmente
oxidable
Reacciones 6-8:
Oxidar succinato de regreso a
oxalacetato
Enzyme: Citrate synthase
Reaction: Aldol condensation
Acetyl CoA condenses with oxaloacetate first,
to form citryl CoA, a high energy thioester
intermediate. Then citryl CoA is hydrolyzed
to citrate and CoA.
Prosthetic group: No

Citrate synthase: Dimer of two identical 49 kDa subunits.


Binding of oxalacetate induces an structural rearrengement creating the binding site for AcCoA

Se evitan reacciones no
deseadas por el cambio de
conformación de la enzima, la
que sólo es activa cuando
contiene el oxalacetato
Enzyme: Aconitase (aconitate hydratase)
Reaction: Dehydration
Citrate is isomerized to isocitrate by this first dehydration and
yields cis-aconitate as an intermediate. (bound to enzyme)
Prosthetic group: Fe-S

Enzyme: Aconitase
Reaction: Hydration
Hydration of cis-aconitate gives the interchange of H atom and OH
group from the step 2. Isocitrate is rapidly consumed.
Prosthetic group: Fe-S

Enzyme: Isocitrate dehydrogenase


Reaction: Oxidative decarboxylation
Dehydrogenation of isocitrate occurs and yields oxalosuccinate
as an intermediate. Then CO2 leaves to have alpha-
ketoglutarate.This reaction gives NADH.
Prosthetic group: No
Enzyme: -Ketoglutarate dehydrogenase complex
Reaction: Oxidative decarboxylation
This mechanism is almost the same as the reaction of oxidative
decarboxylation of pyruvate to acetyl CoA by the pyruvate
dehydrogenase complex. This reaction gives one NADH.
Prosthetic group: Lipoic acid, FAD, TPP

Enzyme: Succinyl CoA synthetase


Reaction: Substrate-level phosphorylation
The thioester bond of succinyl and CoA is an energy rich bond.
Thus only this step gives a high-energy phosphate compound,
GTP from the couple reactions of the thioester bond cleavage and
the phosphorylation of GDP.
Prosthetic group: No

La enzima tiene dos subunidades

Phosphorylated enzyme
intermediate
Enzyme: Succinate dehydrogenase (membrane bound, complex II)
Reaction: Oxidation, alkane --> alkene
The two hydrogens of succinate leave to an acceptor, FAD. Not
sufficiently exergonic to reduce NAD+.
Then this reaction yields fumarate and FADH2. Electrons are
transferred to the Fe-S cluster of the enzyme.
Prosthetic group: FAD & Fe-S

Enzyme: Fumarase (highly stereospecific)


Reaction: Hydratation with a carbanion intermediate
Fumarate is hydrated to give Malate.
Prosthetic group: No

Enzyme: Malate dehydrogenase


Reaction: Oxidation
Malate is dehydrogenated to form oxaloacetate. The hydrogen
acceptor is NAD. Therefore, this reaction yields NADH. This
reaction occurs because of depletion of oxaloacetate
Prosthetic group: No
Reacción neta del ciclo del ácido cítrico

Acetyl CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2H2O ---> 2CO2 + 3 NADH + FADH2 +
GTP + CoA

8 electrones extraídos.
1. Disponibilidad de substratos (AcCoA y
oxaloacetato)
2. Inhibición por acumulación de productos
3. Inhibición retroalimentada alostérica de
las enzimas que catalizan los primeros
pasos (ADP, ATP y Ca2+)

Inhibe la pfk1
TCA: an amphybolic pathway

AcCoA

Fructose 1,6 biphospahte


Ciclo del glioxilato

Los vertebrados son incapaces de


convertir ácidos grasos o acetato en
carbohidratos (conversión de Pyr a
partir de AcCoA es irreversible).
En plantas:
Fosforilación oxidativa (mitocondria)
Reducción de oxígeno a agua

Fotofosforilación (cloroplastos) Depende absolutamente de la


energía de la luz
Oxidación de agua a oxígeno, con NADP+ como aceptor de e-

• Consisten en el flujo de electrones a través de una cadena de


acarreadores unidos a membrana

• La energía libre proporcionada por el flujo de electrones exergónico


está acoplado por un transporte contrario de protones a través de
una membrana impermeable, conservando la energía libre de
oxidación como un potencial electroquímico.

• El flujo transmembranal de protones a través de canales protéicos


específicos aporta la energía necesaria para la síntesis de ATP por la
ATP sintasa
Mr<5000

Una mitocondria de hepatocito puede


contener hasta 10,000 conjuntos de
transferencia de electrones. Una de
corazón hasta 3 veces más.
Nicotinamida nucleotído transhidrogenasa
NADPH + NAD+ <===> NADP+ + NADH
En la fosforilación oxidativa ocurren 3 tipos de transferencia de electrones
1. Transferencia directa (reducción de Fe3+ a Fe2+)
2. Transferencia como átomo de hidrógeno (H+ + e-)
3. Transferencia de ión hidruro (:H-) que posee dos electrones
Complejo I
Complejo enzimático con 42 proteínas

NADH + H+ + Q ---> NAD+ + QH2

Complejo II
Succinato deshidrogenasa
Por su tamaño e hidrofobicidad puede difundir a través de la membrana
interna de la mitocondria
Complejo III (complejo citocromo bc1)

QH2 + 2Cytc1 (oxidado) + 2H+n ---> Q + 2Cyt c1 (reducido) + 4H+p


Complejo IV

4H+ 4H+
Substrato Trasferidos 2 H2O

4 cytc(reducido) + 8H+N + O2 ---> 4cytc (oxidado) + 4H+p + 2H2O


NADH + 11 H+N + 1/2 O2 ---> NAD+ + 10 H+P + H2O
ADP + Pi + nHP+ ---> ATP +H2O + nH+N

Transporte de protón en contra de un gradiente electroquímico:


Ghígado = 21 kJ/mol

Síntesis de ATP = 40-50 kJ/mol (ca. 3 protones)


ATP sintasa (complejo V)
8-13 subunidades

F1

F0

Transportadores
Ca2+
Mitocondria, RE y espacio extracelular son
reservorios
Mitocondria:
Sistema 1: potencial de membrana
Km > [Cacyt]
Sistema 2: Intercambio por Na (antiport)
corazón, cerebro, músculo esquelético
Máxima velocidad
Aumento en Cacyt ---> aumento Camit
Aumento TCA ---> aumento NADH
Transportadores: NADH
• Transportador malato-aspartato: 1 NADH = 2.7 mol ATP
Transportadores: NADH
• Transportador glicerofosfato: 1 NADH = 2 ATP
• Cerebro y músculo esquelético
• Es irreversible, aún en situación de bajo [NADH]
Complete reaction:
C6H12O6 + 6 O2 --> 6CO2 + 6 H2O G0’ = -2824 kJ/mol
C6H12O6 + 6 H2O --> 6CO2 + 24 H+ + 24e-
6 O2 + 24 H+ --> 12 H2O
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La velocidad de consumo de oxígeno depende de la
concentración de ADP