BIOCHIPS

Universidad Nacional de San Agustn

Per

RESUMEN
Un Biochip es un dispositivo a pequea escala, anlogo a un circuito integrado,
ensamblado o usado para analizar molculas orgnicas asociadas con los organismos
vivientes. En teora un biochip es un pequeo mecanismo construido de grandes
molculas orgnicas, tales como las protenas, capaz de desempear las funciones de
una computadora. Otro tipo de biochip es un pequeo aparato capaz de realizar
rpidas reacciones bioqumicas en escala reducida, con el propsito de identificar
secuencias genticas, agentes contaminantes, toxinas u otros elementos bioqumicos.
Palabras Clave: Biochip, circuito integrado, molculas orgnicas, protenas, reacciones bioqumicas,
secuencias genticas, agentes contaminantes, toxinas, elementos bioqumicos.

ABSTRACT
A Biochip is a small-scale device, similar to a integrated circuit, used to analyze
organic molecules associated with living organisms. In theory a biochip is a small
mechanism built of large organic molecules, such as proteins, capable of performing
functions of a computer. Another type of biochip s a small device capable of
performing fast biochemical reactions in a rediced scale, in order to identify polluting
agents, genetic sequences, toxins or other biochemical elements.
Key Words: Biochip, integrated circuit, organic molecules, proteins, biochemical reactions, genetic
sequences, polluting agents, toxins, biochemical elements.

INTRODUCCION
HISTORIA
A finales de los aos 80, la tecnologa que desembocara en la plataforma GeneChip
fue desarrollada por cuatro cientficos, en Affymax: Stephen Fodor, Michael Pirrung,
Leighton Read y Lubert Stryer. El proyecto original estaba destinado a la construccin
de pptidos sobre chips, pero desemboc en la capacidad para construir secuencias de
ADN sobre chips. La aplicacin prctica de esta idea se llev a cabo por la empresa
Affymetrix, que comenz a actuar como una compaa independiente en el ao 1993.
[1]
Los biochips, por tanto, surgieron de la combinacin de las tcnicas microelectrnicas
y el empleo de materiales biolgicos. Se basan en la ultraminiaturizacin y
paralelismo implcito y se concretan en chips de material biolgico de alta densidad
de integracin vlidos para realizar distintos tipos de estudios repetitivos con muestras
biolgicas simples. [1]
CONCEPTOS

En [4] indica que un Biochip es un dispositivo a pequea escala, anlogo a un

circuito integrado, ensamblado o usado para analizar molculas orgnicas
asociadas con los organismos vivientes.

Entendemos por biochip la disposicin ordenada y conocida de miles de

fragmentos de material biolgico (bio), tales como ADN, ARN, o protenas,
almacenados sobre un soporte slido (chip). [7]

Se designan como biochips los biodispositivos electrnicos con aplicaciones

directas sobre los seres vivos, como los implantes de chips para controlar los
temblores de los enfermos del Parkinson. [9]

Escner: dispositivo que permite la lectura de las matrices de material

biolgico. Detecta las emisiones de las molculas marcadoras presentes en los
ensayos. En general son escneres de fluorescencia que son capaces de emitir
un haz lser que excita los fluorocromos presentes en la matriz induciendo la
liberacin de fotones en una distinta longitud de onda para su deteccin.[13]

Polmero: Molcula de gran tamao, formada por la aposicin sucesiva de

otras molculas pequeas, llamadas monmeros.[13]

Bioinformtica: Disciplina cientfica dedicada a la investigacin y desarrollo

de herramientas tiles para llegar a entender el flujo de informacin desde los
genes a las estructuras moleculares, a su funcin bioqumica, a su conducta
biolgica y, finalmente, a su influencia en las enfermedades y en la salud.[12]

Protena: polmero lineal constitudo por aminocidos, cuya estructura

tridimensional es capaz de fijar especficamente ligandos y desarrollar as sus
funciones. Un conjunto muy importante de protenas son las enzimas,
catalizadores especficos de todas las reacciones metablicas.[13]

Clustering: Tcnica de anlisis de datos en la que se agrupan las observaciones

segn su similitud. Se pueden emplear distintos coeficientes de similitud:
Correlacin de Pearson, Coseno, Distancia Eucldea y diferentes algoritmos:
UPGMA, Ward, Jerrquicos, basados en la K-Media.[12]

ADNc: ADN sintetizado a partir de un ARN molde; a menudo es utilizado

como sonda de ADN para determinar la secuencia de nucletidos (bases) de
una molcula de ADN o ARN.[13]

Un circuito es una red elctrica (interconexin de dos o ms componentes,

tales como resistencias, inductores, condensadores, fuentes, interruptores y
semiconductores) que contiene al menos una trayectoria cerrada.[14]

Farmacogenmica: estudio del impacto que presentan las variaciones

genticas en la eficacia y toxicidad de los frmacos. Tambin se define como
el estudio de como el componente gentico de un paciente determina la
respuesta frente a una terapia determinada. Esta disciplina pretende predecir
esta respuesta por medio de informacin gentica y genmica, haciendo
posible una monitorizacin de los ensayos clnicos y del proceso de desarrollo
de nuevos compuestos farmacuticos.[11]

Una secuencia de ADN o secuencia gentica es una sucesin de letras

representando la estructura primaria de una molcula real o hipottica de ADN
o banda, con la capacidad de transportar informacin.
Las posibles letras son A, C, G, y T, que simbolizan las cuatro subunidades de
nucletidos de una banda ADN - adenina, citosina, guanina, timina, que son
bases covalentemente ligadas a cadenas fosfricas. En el tpico caso, las
secuencias se presentan pegadas unas a las otras, sin espacios, como en la
secuencia AAAGTCTGAC, yendo de 5' a 3' de izq. a derecha. [15]

Agentes contaminantes: Las sustancias extraas que provocan la

contaminacin atmosfrica son agentes gaseosos, lquidos y slidos que se
concentran en la atmsfera; sus potenciales fuentes de origen son las
siguientes [16]:
o Procesos industriales: a pesar de las medidas preventivas constituyen
uno de los principales focos contaminantes.
o Combustiones domsticas e industriales: principalmente los
combustibles slidos (carbn) que producen humos, polvo y dixido de
azufre.
o Vehculos de motor: su densidad en las regiones muy urbanizadas
determina una elevada contaminacin atmosfrica (xidos de carbono,
plomo, xidos de nitrgeno, partculas slidas).

ARQUITECTURA
El sistema de implante biochip consta de dos componentes; un transpondedor y un
lector o un escner. El transpondedor es el implante biochip real. El sistema biochip es
un sistema de identificacin por radiofrecuencia (RFID), con seales de radio de baja
frecuencia para la comunicacin entre el biochip y el lector. El rango de lectura o
rango de activacin, entre el lector y el biochip es pequea, normalmente entre 2 y 12
pulgadas. [10]
Tamao
El tamao de Biochip es el de grano de arroz crudo. Va desde 2 pulgadas a 12
pulgadas. [10]

Tamao actual de un chip [10]

El transpondedor
El transpondedor es el implante biochip real. Es un transpondedor pasivo, lo
que significa que no contiene la batera o la energa de su propio. En
comparacin, un transpondedor activo proporcionara su fuente de energa
propia, normalmente una pequea batera. Debido a que el biochip pasivo no
contiene la batera, o nada parecido, tiene una vida muy larga, hasta 99 aos, y
no hay mantenimiento. Ser pasivo, es inactivo hasta que el lector lo activa
mediante el envo de una carga elctrica de baja potencia. El lector "lee" o
"escanea" el biochip implantado y recibe de vuelta los datos (en este caso un
nmero de identificacin) del biochip. La comunicacin entre biochip y el
lector es a travs de ondas de radio de baja frecuencia. El biochiptranspondedor consta de cuatro partes; microchip ordenador, bobina de la
antena, el condensador y la cpsula de vidrio. [10]

Componentes [10]

o Microchip ordenador
El microchip almacena un nmero de identificacin nico de 10 a 15
dgitos de longitud. La capacidad de almacenamiento de los microchips
actuales es limitada, capaz de almacenar un nico nmero de
identificacin. AVID (American Veterinary Identification Devices),
reclama sus fichas, utilizando un formato nnn nnn-nnn, tiene la
capacidad de ms de 70 billn nmeros nicos. El nmero de
identificacin nico es "grabado" o codificada por medio de un lser
sobre la superficie del microchip antes del montaje. Una vez que se
codifica el nmero es imposible de alterar. El microchip tambin
contiene los circuitos electrnicos necesarios para transmitir el nmero
de identificacin al "lector". [10]
o Antena de bobina
Este es normalmente una simple, bobina de alambre de cobre alrededor
de un ncleo de ferrita o hierro. Este pequeo, primitivo, antena de
radio "recibe y enva" seales del lector o escner. [10]
o Condensador de sintonizacin
El condensador almacena la carga elctrica pequea (menos de 1/1000
de vatio) enviado por el lector o escner, que activa el transpondedor.
Este "activacin" permite al transpondedor devolver el nmero de
identificacin codificada en el chip de computadora. Porque "ondas de
radio" se utilizan para la comunicacin entre el transpondedor y el
lector, el condensador est "en sintona" con la misma frecuencia que
el lector. [10]
o Capsula de vidrio
La cpsula de vidrio "casas" el microchip, bobina de la antena y el
condensador. Se trata de una pequea cpsula, el ms pequeo que
mide 11 mm de longitud y 2 mm de dimetro, aproximadamente del
tamao de un grano de arroz sin cocer. La cpsula est hecha de
material biocompatible, tal como vidrio de sosa y cal. Despus del
montaje, la cpsula es hermticamente (hermtico) sellada, por lo que
no hay fluidos corporales que puede tocar los componentes
electrnicos en el interior. Debido a que el vidrio es muy suave y
susceptible de movimiento, un material tal como una funda de
polmero de polipropileno est unido a un extremo de la cpsula. Esta
vaina proporciona una superficie compatible que las corporales fibras
de tejido enlace o de interconexin, lo que resulta en una colocacin
permanente del biochip. [10]

FUNCIONALIDAD

Segn [6] se toma una muestra de material gentico de un paciente o de un

experimento que sea complementaria a la secuencia dispuesta en el chip, de tal
forma que se hibriden y eliminen todas las cadenas de ADN que no sean
complementarias al chip, que posteriormente sern ledas por un escner
arrojando como resultado un patrn de luz caracterstico, que luego ser
interpretado por un computador.
Esta interpretacin se efecta mediante un complicado software diseado para
tal fin, en la que se puede conocer las posibles deficiencias o mutaciones que
hay en un individuo o una clula especfica en su material gentico.
El patrn de colores indica las caractersticas afines del material gentico de la
muestra con la dispuesta sobre el biochip, los colores tenues, indican
deficiencias o incompatibilidades genticas atribuidas a algn tipo de
enfermedad.
El fundamento de estos dispositivos radica en la inmovilizacin del material
biolgico sobre una superficie slida, para la realizacin de un ensayo de
afinidad entre el material inmovilizado (sonda) y el material de muestra
(blanco) que se desea analizar en paralelo, para lo cual se inmovilizan
diferentes sondas. En estos dispositivos se dispone el material biolgico de
una forma regular, ordenada y conocida sobre la superficie. Esta disposicin
permite el establecimiento de una retcula formada por un conjunto de filas y
de columnas en el que cada posicin es inequvoca y est identificada como en
una matriz matemtica. Este tipo de disposicin permite el conocimiento del
material depositado en cada posicin.

Segn [1], Los biochips estn divididos en unas pequeas casillas que actan
cada una a modo de un tubo de ensayo en el que se produce una reaccin. El
nmero de estas casillas es muy elevado, llegando incluso a los centenares de
miles.
Cada casilla del chip posee una cadena de un oligonucletido, que puede
corresponder a una seccin del gen de estudio (cuando se conoce su secuencia)
o a mutaciones del mismo. Debido a la extrema miniaturizacin del sistema se
pueden analizar en un nico chip todas las posibilidades de mutacin de un
gen simultneamente. Solo aquellos fragmentos de DNA que hibriden
permanecern unidos tras los lavados y dado que se conocen las secuencias y
posiciones de los oligonucletidos empleados, tras los lavados se produce el
revelado que consiste en introducir el chip en un escner ptico que va a ser
capaz de localizar, mediante un proceso similar a la microscopa confocal, las
cadenas marcadas con el fluorocromo. Un ordenador analiza la informacin
procedente del escner y ofrece el resultado.

Segn [8], Pese a que la tecnologa es moderna, su funcionamiento es muy

sencillo. La parte principal es la base; una lmina delgada en cuya superfcie
se hacen orificios diminutos colocados de forma ordenada. Cada uno de estos
orificios se rellenan con fragmentos del ADN de la persona que se quiere
analizar. Previamente a esto es necesario saber la frecuencia de su ADN, es
decir la huella gentica que se puede ver en la imagen de la derecha. Ahora
mismo los genes del paciente se han unido a los genes de referencia del
biochip, de forma que las mutaciones, la ausencia o la presencia de genes
quedan en evidencia y se pueden concretar si determinan una enfermedad o
una malformacin. Por tanto, un investigador, en vez de comprobar los
cambios fisilogos gen por gen, puede revisar en un momento un grupo entero
de genes.

VENTAJAS / DESVENTAJAS [2]

Las ventajas ms caractersticas de las tecnologas basadas en biochips se pueden
enumerar en los siguientes epgrafes:
Alto rendimiento y capacidad
Baja relacin coste/eficiencia
Alta especificidad y sensibilidad
Permiten realizar ensayos con enfoques cuantitativos
Ensayos reproducibles y transportables
Paralelismo, es decir, realizar ensayos simultneos utilizando muestras
diferentes
Multiplexacin, es decir, realizar varios ensayos utilizando una nica muestra
No se precisa el manejo de radioactividad
No se precisa disponer de un plan especial para la gestin de los residuos
No se precisa un elevado coste en reactivos
Se pueden conservar por ms tiempo entidades biolgicas raras, al emplearse
cantidades microscpicas.
A pesar de las enormes potencialidades aportadas por el empleo de las tecnologas
basadas en biochips, stas presentan, en la actualidad, limitaciones que pueden ser
enumeradas en los siguientes epgrafes:
Reciente desarrollo y puesta a punto de las tcnicas
Escasa difusin de la tecnologa
Elevado coste de inversin en la adquisicin del equipamiento necesario para
el acceso a la tecnologa
Incompatibilidades entre los equipamientos
Kits comerciales difcilmente personalizables para las necesidades del
investigador
Algunas cuestiones que han de ser tenidas en cuenta antes de llevar a cabo la
compra de un equipo pueden ser las siguientes:
Velocidad y eficiencia en la limpieza del "pin"
Velocidad y precisin del "pin"
Precisin de impresin
Facilidad operativa de todo el equipo
Sensores para detectar las operaciones defectuosas
Mantenimiento del equipo (cunto tiempo se puede dejar sin ser
atendido sin que se deteriore de algn modo)
Enfriamiento de las placas (uno de los gastos mayores)

APLICACIONES [3]
La tecnologa en biochips tiene un amplio campo de aplicaciones, ya sea a nivel
experimental (in vitro), a nivel industrial (ex vivo) o a nivel humano (in vivo). As:
Medicina preventiva y/o personalizada: se emplea para el conocimiento de
rasgos genticos de las poblaciones, con el fin de prevenir algunas
predisposiciones a padecer ciertas enfermedades, antes que se manifiesten sus
sntomas (epidemiologa gentica).

Medicina Preventiva [5]

Seguimiento de terapia: permite valorar determinados rasgos genticos que

podran tener incidencia directa en la respuesta de una terapia gentica.

Monitorizacin de expresin gnica: permite cuantificar de manera simultnea

la expresin de un gran nmero de genes, para ello se emplea como
complemento sistemas robticos de alta precisin (por ejemplo la
monitorizacin empleada en el proyecto genoma humano). Tambin la
monitorizacin se usa para la cualificacin de determinados patrones de
expresin genticas, con el fin compararlos con otros que presenten
deficiencias expresas a travs de patologas descubiertas en una persona.

Monitorizacin de Expresin Gnica [5]

Secuenciacin: se emplean los biochips para comprobar o actuar como sistema

de control de calidad sobre la compatibilidad y/o complementariedad de largas
secuencias de ADN in vitro.

Deteccin de mutaciones y polimorfismos: permite el estudio de un gran

sinnmero de polimorfismos (elemento o sistema que puede tener diferentes
formas) y deteccin de mutaciones en secuencias genticas complejas
correlacionndolas con enfermedades especficas e infecciosas.

Diagnstico molecular y/o clnico: deteccin de microorganismos mediante la

identificacin de marcadores genticos patgenos y sus mecanismos
protenicos asociados, al igual que se emplean para el diagnstico de
diferentes tipos de tumores a travs de sus patrones moleculares. Tambin se
emplean los biochips para comprender la resistencia de los microorganismos
ante los antibiticos e identificar dianas genticas con valor teraputico,
estudiar su biologa interna, identificacin de cepas y desarrollo de medidas
preventivas frente a las enfermedades infecciosas.

Diagnstico Molecular y/o Clnico [5]

Screening y toxicologa de frmacos (farmacogenmica): anlisis en los

cambios de las expresiones gnicas presentes durante la administracin de un
frmaco y efectos toxicolgicos asociados, al igual que la localizacin de
nuevas dianas teraputicas.

Nanosensores: empleados en nanomedicina, neogentica y nanobiotecnologa,

como sistemas de deteccin y rastreo de trazas o fragmentos genticos con
fines teraputicos, militares e industriales in vivo e in vitro (por ejemplo, para
mejorar el procesamiento de productos qumicos y alimenticios).

Memorias de computadora basadas en bacteriorodopsina: molculas de

bacteriorodopsina para aplicaciones de computacin de ADN y biochips de
protenas (empleados para detectar microbios especficos, clulas enfermas o
productos qumicos peligrosos o teraputicos en forma rpida y barata).

Biochips para prtesis artificiales: se pretende crear retinas artificiales para

visin robtica y visin humana, interponer clulas nerviosas con
semiconductores para crear miembros electromecnicos que trabajen en
conjunto con el sistema nervioso humano.

Biochips para Prtesis Artificiales [5]

DISCUSIN

Diferencias entre Microarrays y Biochips [11]

Aplicaciones de Microarrays y Biochips [11]

Mtodos para la fabricacin de Microarrays y Biochips [11]

Mtodos para la fabricacin de Microarrays y Biochips [11]

CONCLUSIONES

Al final podemos ver que la ciencia y la tecnologa tiene un avance increble

con innovadoras ideas con el fin de encontrar soluciones y mejorar la vida del
hombre pero no todos piensan as y ah radica el problema porque lo pueden
utilizar para hacer el mal.[2]

Fuera de ello podemos ver que se puede aplicar en cualquier campo la

inteligencia artificial est abierto a todos esperando sus ideas.[2]

La aplicacin de los biochips, instrumentos que combinan la biologa

molecular con la informtica, har posible una atencin clnica hecha a la
medida de cada paciente, pues el tratamiento se administrar en funcin de las
caractersticas genticas de cada individuo.

Como se puede apreciar, las ingentes aplicaciones de los biochips van en

creciente aumento, conforme la industria farmacutica e industria en general
exigen nuevas herramientas y aplicaciones para el tratamiento de mltiples
enfermedades de origen molecular, gentico, bacteriano o viral. Donde las
ventajas de estos dispositivos son mayores que sus desventajas, como son: alto
rendimiento y capacidad de procesamiento de material gentico, alta
especificidad y sensibilidad en el momento del anlisis, los ensayos son
fcilmente reproducibles y transportables, poseen alto paralelismo a la hora de
efectuar mediciones simultneas de muestras diferentes, el coste de reactivos
no es muy elevado, permite la posibilidad de almacenamiento de la
informacin en sistemas de cmputo confiables y no se precisa de controles
biolgicos especiales para el manejo de residuos.

REFERENCIAS

[1]
M.
LUQUE,
BIOINFORMTICA
BIOCHIPS,
AVAILABLE:
http://www.solociencia.com/biologia/bioinformatica-biochips.htm
[2] MARIA ISABEL HUACANI MARCA QU SON LOS BIOCHIPS?
http://www.revistasbolivianas.org.bo/pdf/rits/n1/n1a41.pdf
[3] JAIRO E. MARQUEZ D, BIOCHIPS, LA INTEGRACIN DE LO ORGNICO CON LO
INORGNICO,
AVAILABLE:
http://unicrom.com/article_read.asp?
id=545&titulo_articulo=Biochips,%20la%20integraci%F3n%20de%20lo%20org
%E1nico%20con%20lo%20inorg%E1nico
[4] BIOCHIP, 2015, AVAILABLE: https://es.wikipedia.org/wiki/Biochip
[5] J. FERNNDEZ, LOS BIOCHIPS, 25 DE FEBRERO DEL 2014, AVAILABLE:
http://revistacmc.jgcalleja.es/?p=603
[6]
BIOCHIPS,
29
DE
SEPTIEMBRE
DE
2015,
AVAILABLE:
http://www.ecured.cu/index.php/Biochips
[7] R. ESTEVEZ, QUE ES UN BIOCHIP Y COMO FUNCIONA , AVAILABLE:
http://www.fisiotraining.com/cordoba/analisisgeneticos_biochip.htm
[8] A. RUBIO, A. CRESPO, B. CANTAL, M. GALIANO, A, JIMNEZ, LOS BIOCHIPS Y SUS
APLICACIONES, AVAILABLE: http://tema5.wikispaces.com/file/view/Los+biochips.pdf
[9] S. TORRADES, BIOCHIPS, HERRAMIENTA DEL FUTURO EN EL MUNDO DE LA SALUD,
9 DE OCTUBRE DEL 2002.
[10] I. D. SHENDE, L. KEWAT, BIOCHIP, USHA MITTAL INSTITUTE OF TECHNOLOGY,
2008 2009
[11] M. LOPEZ, P. MALLORQUIN, M. VEGA, MICROARRAYS Y BIOCHIPS DE ADN,
OCTUBRE DEL 2002
[12] HTTP://INFOBIOCHIP.ISCIII.ES/TEXTOS/GUIAREC/GLOSARIO.HTM
[13] HTTP://CAMPUS.USAL.ES/~DBBM/BIOTEC/GLOSARIO.HTM
[14] CIRCUITO, AVAILABLE: HTTPS://ES.WIKIPEDIA.ORG/WIKI/CIRCUITO
[15] SECUENCIA DE ADN, AVAILABLE:
HTTPS://ES.WIKIPEDIA.ORG/WIKI/SECUENCIA_DE_ADN
[16] AGENTES CONTAMINANTES, AVAILABLE:
HTTP://WWW7.UC.CL/SW_EDUC/CONTAM/POBL/POBL081.HTM