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Unidad 1. Biotransformaciones
Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
ndice
Unidad 1 Introduccin a las Biomolculas.......................................................................... 2
Presentacin de la unidad ................................................................................................. 2
Propsitos de la unidad ..................................................................................................... 2
Competencia especfica..................................................................................................... 3
Temario de la unidad3
1.1. Carbohidratos.4
1.1.1. Clasificacin y estructura..4
1.1.2. Importancia bioqumica de los carbohidratos..13
1.2. Lpidos...14
1.2.1. Clasificacin y estructura14
1.2.2. Importancia bioqumica de los lpidos..25
1.3. Protenas..31
1.3.1. Estructura..31
1.3.2. Clasificacin e importancia bioqumica de las protenas...35
1.3.3. Capacidad cataltica de las protenas...38
1.4. cidos nucleicos..39
1.4.1. Estructura del DNA..39
1.4.2. Clasificacin y estructura del ARN45
1.4.3. Importancia bioqumica de los cidos nucleicos.49
Actividades ...................................................................................................................... 51
Autorreflexiones ............................................................................................................... 52
Cierre de launidad ........................................................................................................... 52
Para saber ms ............................................................................................................... 53
Fuentes de consulta ........................................................................................................ 53
Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Propsitos de la unidad
Esta unidad tiene el propsito de:
Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Competencia especfica
Temario de la unidad
1.1. Carbohidratos.
1.1.1. Clasificacin y estructura.
1.1.2. Importancia bioqumica de los carbohidratos.
1.2. Lpidos.
1.2.1. Clasificacin y estructura.
1.2.2. Importancia bioqumica de los lpidos.
1.3. Protenas.
1.3.1. Estructura.
1.3.2. Clasificacin e importancia bioqumica de las protenas
1.3.3. Capacidad cataltica de las protenas.
1.4. cidos nucleicos.
1.4.1. Estructura del DNA.
1.4.2. Clasificacin y estructura del ARN
1.4.3. Importancia bioqumica de los cidos nucleicos.
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1.1. Carbohidratos
Los carbohidratos son compuestos de origen orgnico y son fundamentales para la vida.
Los carbohidratos son importantes ya que todos los seres vivos los utilizan como base
fundamental de su metabolismo, como reserva de energa adems de jugar un papel
estructural muy importante en las clulas. Todos los carbohidratos estn formados por
carbono, hidrgeno y oxgeno. En la naturaleza se encuentran en forma individual, es
decir, como monosacridos, en forma asociada formando disacridos (dos
monosacridos), trisacridos (tres monosacridos), etc., hasta generando molculas muy
complejas como los almidones y celulosa principalmente.
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Todas las aldosas se consideran como estructuras derivadas del gliceraldehdo ya sea D
o L. En el caso de las cetosas, se consideran estructuralmente derivadas de la D- o Leritrulosa (Fig. 4).
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BIOQUIMICA II
APUNTES
BIOQUIMICA II APUNTES
Archivo
FAMILIA DE
CETOSAS
Unidad
1. LAS
Biotransformaciones
Una cetosa es un monosacrido con un grupo cetona por molecula.
Con tres tomos de carbono, la dihidroxiacetona es la ms simple de todas las cetosas y es el unico que no tiene
actividad optica. Las cetosas pueden isomerizar en aldosas cuando el grupo carbonilo se encuentra al final de la
molcula. Este tipo de moleculas se denominan azcares reducidos.
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muchas gracias este esquema es muy preciso para lo q necesito
b. Disacridos:Escrito
cuando
monosacridos
estn asociados por uniones qumicas
por liliansdos
19/04/2009
19:12
me prodrian proporcionar completa la familia de las cetosas
de tipo covalente entre el hidroxilo anomrico de un azcar cclico y el hidroxilo de
Escrito por jessica 14/05/2009 01:25
un segundo azcar
lo que
se llama
un enlace glucosdico, por lo
me prodrian cclico
proporcionar forman
completa la familia
de las cetosas,
muchas gracias
tanto, cuando dos monosacridos se unen, necesariamente lo hacen a travs de
un enlace glucosdico. Ahora bien, hay dos formas de enlaces glucosdicos que
son los alfa y los beta. Por ejemplo, cuando el carbono anomrico (carbono 1)
de la D-glucosa reacciona con el carbono nmero 4 de otra molcula de la Dglucosa se forma un enlace llamado 1-4 D-glucosa (Fig. 8) y se llama alfa por la
posicin del grupo hidroxilo del carbono anomrico. En la naturaleza no solo se
encuentran los enlaces glucosdicos 1-4 tambin se encuentran los enlaces 12, 1-6, 1-4 y 1-6 (Fig. 9).
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Carbono
Hidrocarburos
Cetonas
SucrosaLas uniones covalentes entre el hidroxilo anomrico de un azcar cclico y el hidroxilo de un segun
azcar (o de otro compuesto que tenga alcohol) se llaman uniones glucosdicas, y las molculas resultantes s
los glucsidos. La unin de dos monosacridos para formar disacridos involucra una unin glucosdica. Vari
disacridos
con 1.
importancia
fisiolgica incluyen la sucrosa, lactosa, y maltosa.
Unidad
Biotransformaciones
Bioqumica
egreso al inicio
Disacridos
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Carbono
Hidrocarburos
Cetonas
SucrosaLas uniones covalentes entre el hidroxilo anomrico de un azcar cclico y el hidroxilo de un segundo
zcar (o de otro compuesto que tenga alcohol) se llaman uniones glucosdicas, y las molculas resultantes son
s glucsidos. La unin de dos monosacridos para formar disacridos involucra una unin glucosdica. Varios
Sucrosa
sacridos con importancia fisiolgica incluyen la sucrosa, lactosa, y maltosa.
1-4-enlace
glucosdico
(Curtis,
Lactosa: se encuentra exclusivamente Maltosa:
en la leche
mamferos
y consiste
de galactosa
glucosaesta
en una
el de
principal
producto
de degradacin
del y2009).
almidn,
compuesta de dos monmeros de gluco
" -(1,4)-enlace glucosdico.
Maltosa
egreso al inicio
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oligosacridos
a protenas
(tomado
Los oligosacridos seFigura
unen a10.
losUnin
lpidosdemediante
un enlace
O-glicosdico
a un de
grupo OH del lpido. La
figura izquierda dehttp://chemistry.umeche.maine.edu/CHY251/Enzym-Stereo.html).
la tabla inferior muestra un oligosacrido unido a un fosfolpido. La unin y la
estructura del oligosacrido son de tal manera que ste no presenta ningn grupo reductor libre. En la
composicin del oligosacrido suelen formar parte monosacridos como: D-glucosa, D-galactosa, Dmanosa,
N-acetil-D-glucosamina,
cido silico
y fucosa. con el
En el caso
de los
glicolpidos estos seN-acetil-D-galactosamina,
forman a partir de un enlace
O-glicosdico
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enlace glucosdico) aunque hay que considerar que los polisacridos son
considerados como no reductores ya que no es posible detectarlos por las
tcnicas comunes de deteccin (tcnica de Fehling o Tollens). Los polisacridos
tienen diversas funciones en las clulas vivas. En los vegetales son considerados
la principal fuente de energa (aunque no es la nica), el almidn el cual est
presente en tubrculos y granos llega a ser de alrededor del 70 % en peso. El
almidn est presente formando dos diferentes estructuras, como amilopectina y
como amilosa, siendo la forma ms abundante la amilopectina. Los almidones son
la principal fuente de glcidos de la humanidad de ah su importancia. La amilosa
es un polmero con alto peso molecular formado por unidades de glucosa unidos
por enlaces (1-4), llegando a tener de entre 250-600 unidades de glucopiranosa
(representacin de Haworth) (Fig. 12). La amilopectina presenta un mayor peso
molecular que la amilosa. Este es un polmero ramificado (a diferencia de la
amilosa) llegando a tener alrededor de 1000 unidades de D-glucosa. La
amilopectina presenta enlaces de tipo (1-4) y (1-6) los cuales estn
espaciados cada 25-30 residuos de glucosa y son los causantes de las
ramificaciones de este polisacrido (Fig. 13).
e.
Figura 12. Representacin de un fragmento de amilosa (Curtis, 2009).
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1.2. Lpidos
Las siguientes biomolculas de las que hablaremos son los lpidos, molculas
responsables, entre otras cosas, de la reserva de energa y la formacin de membranas.
Comenzaremos conociendo un poco su estructura y clasificacin para terminar
entendiendo su principal funcin en las clulas y por lo tanto su importancia biolgica.
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Lpido
Saponificables
cidos grasos
Acilglicridos
Fosfoglicridos
Esfingolpidos
Ceras o cridos
No saponificables
Terpenos
Esteroides
Eicosanoides o prostaglandinas
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Figura 17. Estructura de cidos graso saturado (a) donde se puede observar con una estructura
lineal, a diferencia del cido graso con una insaturacin (b) donde se observa un pliegue en el
doble enlace (Nelson y Cox, 2009).
En referencia a la nomenclatura de los cidos grasos, existen tres formas pero antes
de explicarles cada una es importante que entiendan la configuracin cis y trans presente
en las insaturaciones. Estos conceptos se refieren a la orientacin de los tomos de
hidrgeno con respecto al doble enlace (cis significa en el mismo lado y trans significa
en el lado opuesto) y para que les quede ms claro pueden observar la Figura 18
(McMurry, 2001).
Figura 18. Configuracin Cis y Trans de los cidos grasos insaturados (Nelson y Cox, 2009).
Ahora s, las tres formas de nombrar a los cidos grasos y para ello tomaremos como
ejemplo el cido oleico (Figura 19):
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1. La comn donde se le dan los nombres a los cidos grasos por tradicin, por
ejemplo el cido palmtico le debe su nombre a su origen en el aceite de palma,
as como el cido oleicos del aceite de oliva o cido esterico a su origen griego
stear que significa grasa o sebo.
2. Sistemtica segn las reglas definidas por la IUAC de manera que al carbono
carboxlico corresponde el nmero 1 y el resto de las posiciones se refieren a l.
En este caso se indica el nmero de carbonos con la terminacin decanoico
cuando se refiere a un cido graso saturado, por ejemplo: cido hexadecanoico
(16 tomos de C, saturado) o cido octadecanoico (18 tomos de C, saturado). En
caso de tener alguna insaturacin se comenzar con cis o trans (segn el tipo de
enlace), seguido del nmero del C donde se encuentra la insaturacin,
posteriormente el nmero total de C para terminar con enoico precedido del
nmero de insaturacin, por ejemplo: decenoico (cuando sola hay uno doble
enlace); dienoico (cuando tiene 2 dobles enlaces) o trienoico (cuando tiene 3
dobles enlaces). En nuestro ejemplo del cido linolico sera: cis,cis-9,12ocatadecadienico.
3. Finalmente, existe la forma abreviada o numrica donde aparecen nmero, letras
y el smbolo delta. En nuestro ejemplo sera 19: 29,12. El primer nmero
: 29,12 hace referencia al total de C que contiene. El segundo nmero
19: 9,12. indica el total de los dobles enlaces que posee. La letra 19: 29,12
son las configuraciones y posiciones de los dobles enlaces (c cuando es cis y t
cuando es trans). Delta y uno o ms nmeros 19: 2, corresponden al tomo
de carbono en el que inicia cada doble enlace, estos nmeros se designan
contando a partir del carboxilo.
Figura 19. Estructura del cido linolico (nomenclatura comn), cis, cis-9,12-ocatadecadienico
(nomenclatura sistemstica) o 19: 2c9,12 (nomenclatura abreviada o numrica). Observa que
cuenta con 18 tomo de carbono y dos insaturaciones tipo cis entre los carbonos 9 y 10 y entre 12
y 13 (Nelson y Cox, 2009).
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b)
Acilgliceroles
Su estructura bsica es de una molcula de glicerol unida a uno o ms cidos grasos por
un enlace ster; as pues de acuerdo al nmero de cidos grasos que posea la molcula
existen tres tipos:
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Fsicamente, los acilglicridos con abundantes cidos grasos insaturados son lquidos a
temperatura ambiente (como el aceite), mientras que los que poseen mayor cantidad de
cidos grasos saturados son slidos (como la mantequilla). Esto se debe a que las
cadenas saturadas se pueden acomodar extremadamente juntas hasta el punto de formar
estructuras semicristalinas (Mathews, 2002).
Los triacilglicridos son la principal reserva de energa de los seres vivos y los
acilglicridos ms abundantes en las clulas. En la Figura 21 pueden observar uno de
ellos representado de diferentes formas.
c)
Fosfoglicridos
Se caracterizan por tener un grupo fosfato lo cual les confiere una mayor polaridad. En
este caso se conforman por un cido fosfatidico, glicerol y dos cidos grasos que
pueden ser saturados o insaturados (Fig. 22).
Los diferentes tipos de fosfoglicridos difieren en el tamao, forma y carga elctrica de
sus grupos de cabeza polares (Nelson y Cox, 2009).
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Figura 22. Fosfatidilcolina formada por un fosfato, un glicerol y 2 cidos grasos, uno saturado
y uno insaturado (tomado de Nelson y Cox, 2008).
Figura 23. Representacin de una membrana plasmtica, en azul se puede observar la zona
hidroffica formada por los cidos grasos de los diferentes fosfolpidos, la zona hidroflica est
compuesta por el glicerol y el grupos fostato (las bolas blacas y azules, respectivamente).
Intercalada en las membrana se pueden ver diferentes protenas integrales que cumplen
diferentes funciones como transportadoras o receptores de seales externas (Madigan, 2003).
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Esfingolpidos
Su estructura est constituida por una cadena larga del aminoalcohol esfingosina en
lugar de un glicerol, se le une un cido graso, el ms comn es el grupo de las ceramidas.
En la Figura 24 est la estructura de la Esfingomielina y se puede observar un gran
parecido estructural con los fosfolpidos, es por ello, que ambos tipos de lpidos forman la
membrana plasmtica.
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Un resumen de los lpidos que forman la membrana plasmtica, con la estructura de cada
una de ellas, se presenta en la Figura 26.
Figura 26. Diferentes tipos de lpidos que conforman la membrana plasmtica (Nelson y Cox,
2009).
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e) Cridos o ceras
Son molculas que se obtienen mediante la esterificacin de un cido graso y un alcohol
monovalente de cadena lineal y larga (Figura 27). Son slidos y duros a temperatura
ambiente. Estas molculas son altamente hidrofbicas por lo que son insolubles en agua.
Figura 27. Estructura de la Triacontanilplamitato formado por el cido graso palmtico y el alcohol
triaconatrol. Es el principal componente de la cera de la abeja (Nelson y Cox, 2009).
2.
Lpidos no saponificables
a) Terpenos
Derivan del isopreno, constan de dos a ms molculas de isoprenos, ste es un
hidrocarburo de cinco tomos de carbono. Reciben una subclasificacin dependiendo de
las unidades de isopreno que presenten, tal como lo indica la tabla 2.
Nombre
Nmero de isoprenos en su
estructura
Monoterpenos
Dos unidades
Sesquiterpenos
Tres unidades
Diterpenos
Cuatro unidades
Triterpenos
Seis unidades
Tetraterpenos
Ocho unidades
Regularmente se encuentran unidos cola con cabeza, sin embargo no es raro encontrar a
las unidades de isopreno unidas cola con cola, un ejemplo de terpeno es el licopeno (Fig.
28).
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b) Esteroides
Derivan del hidrocarburo perhidrociclopentanofenantreno, el nmero y posicin de
sus dobles enlaces los hace diferentes unos de otros; as como en el tipo, nmero y
localizacin de sus grupos funcionales (Lehninger, 2009). Algunos ejemplos se pueden
obsevar en la Figura 29.
c) Eicosanoides
Son derivados de los cidos grasos escenciales de 20 carbonos, sus precursores son el
cido araquidnico, el cido linoleico y el cido linolnico.
Se dividen en prostaglandinas (Fig. 30), tromboxanos y leucotrienos, de los cuales los
ms estudiados y considerados como los ms importantes son las prostaglandinas. Las
prostaglandinas E y F fueron las primeras en aislarse, se denominan E a las que son ms
solubles en ter y F a las solubles en amortiguador de fosfatos, por esta razn ahora se
les conoce como PGE y PGF.
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Estructuralmente contienen dos grupos carboxilo, cada uno unido a una cadena lateral y
ambas unidas a un anillo de ciclopentano, al designarlos se cuenta con un subndice que
indica el nmero de dobles enlaces, por ejemplo la PGE2. Se designa alfa o beta para
indicar si es cis o trans respectivamente.
a) cidos grasos
Los cidos grasos no los encontramos de esta manera en las clulas, si no que estn
formando lpidos ms complejos como acilgliceroles. Existen cidos grasos esenciales
que sern aquellos que los organismos deben ingerir porque no son capaces de
sintetizarlos. Uno de los ms abundantes es el cido linolico (Fig. 31), este cido no es
sintetizado por los mamferos sino que son obtenidos mediante la dieta por medio de los
vegetales donde se encuentran en grandes cantidades. De esta manera tenemos un
ejemplo de un cido graso que es esencial para los mamferos pero no para los vegetales.
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b) Acilgliceroles
Los acilgliceroles, especficamente los triglicridos, se acumulan en las clulas con una
funcin principal que es la de reserva de energa ya que cuenta con largas cadenas
hidrocarbonadas altamente reducidas (como ya lo comentamos anteriormente) de manera
que la oxidacin de las mismas proporciona energa de manera rpida misma que se
transforma o se disipa en calor; en el mismo caso se produce ATP (molcula energtica
de las clulas por excelencia necesaria para llevar a cabo diversos procesos biolgico) y
en el segundo caso se obtiene la segunda funcin importante de estos lpidos, la
produccin de calor. (Mathews, 2002).
Finalmente, en los mamferos los triglicridos se acumulan en clulas especiales
denominadas adipocitos (Fig. 32) que forman el tejido adiposo, para el aislamiento del
fro cuando el tejido adiposo debajo de la piel acta como aislante en los ambientes
glidos, tambin recubren y protegen los rganos de algn dao mecnico o estructural.
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c) Fosfoglicridos
Los fosfoglicridos, como ya lo comentamos anteriormente, son los principales
formadores de membrana ya que tienen una regin altamente hidroflica (el fosfato) y una
zona altamente hidrofbica (la cadena hidrocarbonada). De esta manera, los fosfolpidos
siempre se van a asociar las zonas hidroflicas con las hidroflicas y las hidrofbicas con
las hidrofbicas formando una doble capa (Fig. 33). Si nicamente existen fosfolpidos
como en la imagen (Fig. 33 c), entonces hablamos de una micela.
Figura 33. Asociacin de fosfolpidos para formar una micela (Curtis, 2009).
Las micelas que hemos hablado contienen una zona altamente hidrofbica que no puede
ser atravesada por compuestos polares, como los azcares, que son necesarios para las
clulas como hemos visto en el apartado anterior. Es por ello, que las membranas
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plasmticas, estn formadas adems, por protenas (Fig. 34) cuya funcin principal ser
el transporte de micromolculas como comentaremos en el siguiente apartado. De esta
manera, las membranas se transforman en estructuras semipermeables y selectivas de
manera que solo se transporte aquellos metabolitos que son necesarios para la vida
celular. Adems, las membranas tiene, en su cara externa a la clula, un conjunto de
oligosacridos que le ayudarn en el sealamiento intercelular (Lodish, 2007).
Figura 34. Ilustracin de una membrana plasmtica formada por fosfolpidos (azul) donde se
observa una protena de canal (en amarillo) por donde se transportan molculas polares (Science
Photo Library).
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Figura 35. Neurona, la flecha seala una vaina de mielina (Science Photo Library).
e) Cridos o ceras
Las podemos encontrar formando cubiertas protectoras en los animales, ya sea sobre la
piel, en forma de pelo (como la lanolina de la lana de las ovejas) y plumas de las aves. En
los vegetales en las hojas, tallos y frutos recubrindolos y protegindolos de la prdida de
agua por efecto de la evaporacin. En los insectos los podemos encontrar en el
exoesqueleto y tambin en un gran ejemplo en las ceras producidas por las abejas
compuesta, principalmente, por steres del cido palmtico
a) Terpenos
Son importantes porque forman los aceites esenciales que aportan olor y sabor a
algunos vegetales algunos ejemplos son el geraniol, mentol, limoneno, alcanfor, pineno,
etc. Otro terpeno es el fitol que forma parte de la molcula de clorofila (Fig. 36). Tambin
conforman otros pigmentos fotosintticos como los carotenoides y pueden estar presentes
en bacterias y hongos como metabolitos secundarios con importancia biotecnolgica.
Tambin existen terpenos con importancia fisiolgica puesto que son vitaminas
liposolubles, son las vitaminas A, K y E, adems otros terpenos son coenzimas por
ejemplo la coenzima Q que acta como transportador de hidrgeno en las oxidaciones
biolgicas de las mitocondrias (Nelson y Cox, 2009).
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b) Esteroides
Cumplen entre otras con la funcin reguladora y hormonal, las hormonas esteroides
regulan el metabolismo y las funciones reproductivas. Algunos ejemplos de esteroides son
los cidos biliares, las hormonas sexuales, la vitamina D, el colesterol y los
corticosteroides; estos ltimos ampliamente utilizados para produccin de medicamentos
como la cortisona.
Un esteroide muy importante es el colesterol ya que es parte de las bicapas lipdicas de
las clulas eucariotas adems de ser el precursor de varios esteroides, dentro de los
cuales se encuentran las hormonas sexuales masculinas (andrgenos) y las femeninas
(estrgenos) es por ello que se presentan algunos problemas relacionados con los ciclos
menstruales cuando el consumo de grasas es muy pobre o nulo, tal como sucede con las
personas que no las incluyen en su dieta, al igual con las personas que sufren trastornos
alimenticios como la anorexia y la bulimia.
Otro problema relacionado con los esteroides es la produccin de esteroides anablicos
que son sustancias sintticas formadas a partir de los andrgenos u hormonas esteroides
masculinas, su efecto es promover el acelerado crecimiento muscular, lo cual es
considerado como deshonestidad deportiva conlleva varios riesgos a la salud adems de
acarrear la descalificacin de los atletas en eventos deportivos.
c) Eicosanoides
Una de las funciones de los eicosanoides es como biocatalizador, es decir que facilitan
las reacciones qumicas que se producen en los seres vivos; adems tienen accin en la
comunicacin celular, en los procesos de inflamacin y la respuesta inmune (Fig. 37)
de vertebrados e invertebrados, ya que las prostaglandinas son un tipo de eicosanoide
que tiene funciones en dicha respuesta.
30
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Ahora que terminaste de leer sobre los lpidos es momento de que aprendas sobre las
protenas, otras biomolculas que son de suma importancia y que se relacionan con los
lpidos por ejemplo las podemos encontrar incluidas en las membranas celulares para el
transporte de micromolculas. Seguimos?
1.3. Protenas
Las protenas se pueden considerar como los materiales de construccin de todos los
organismos vivos. Su funcin es muy variada, forman parte de los tejidos y son
consideradas como sustancias plsticas lo que implica que tienen funciones de
construccin y de reparacin de estructuras celulares y finalmente, presentan actividad
biolgica lo que significa que participan en procesos de reparacin, de transporte, de
regulacin, de defensa, de reserva y de catlisis lo que les hace diferentes a los glcidos
y lpidos los cuales son considerados como sustancias inertes.
1.3.1. Estructura
Para tratar el tema de las protenas es necesario mencionar que existen ms de 300
aminocidos, aunque slo 20 de ellos son los que destacan debido a que constituyen las
unidades monomricas de las protenas (Murray y col., 2010); las diferentes
combinaciones de aminocidos generan una cadena peptdica, pero para que una
protena sea funcional es necesario que su estructura tenga la correcta conformacin
tridimensional, as pues te voy a mencionar las estructuras de las protenas y brevemente
desarrollar algunas caractersticas, ten en cuenta que la funcin deriva de la estructura
tridimensional y la estructura tridimensional est establecida por la secuencia de
aminocidos (Lodish y col., 2007).
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a) Estructura primaria
Es la unin de dos o ms aminocidos, tambin se denominan pptidos cuando la
cadena es corta, de 20 a 30 aminocidos y polipptido cuando es larga (31 aminocidos
en adelante) (Fig. 38).
Los aminocidos estn unidos entre s por el enlace peptdico, este enlace se forma a
partir del extremo amino de un aminocido y el extremo carboxlico de otro aminocido
(Fig. 39). Su hidrlisis o ruptura tiene como resultado la liberacin de una molcula de
agua. Debido a su estabilidad, el enlace peptdico es considerado como un doble enlace a
pesar que no lo es, el porqu de esta consideracin?, quizs se deba a que como el
nitrgeno es menos electronegativo que el oxgeno, el enlace C-O tiene un 60 % de
carcter de doble enlace y un 40 % de enlace sencillo dado por el enlace C-N. Estas dos
caractersticas genera que el enlace peptdico presente resonancia dando origen a su
carcter de enlace doble parcial.
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b) Estructura secundaria
Ahora que conoces la estructura primaria es momento de que sepas que la estructura
secundaria se forma cuando ciertas partes de la estructura primaria se pliegan gracias a
enlaces de hidrgeno, las partes que se pliegan se encuentran bien establecidas de tal
manera que forman una hlice alfa, una hoja beta plegada y en menos proporcin realizan
un giro corto en forma de U; las hojas son las que brindan sostn a la protena, cualquiera
de los plegamientos que posea una protena, viene definido genticamente, as pues
dependiendo de la protena que se est produciendo su configuracin ya est definida y
se puede predecir en que sitio se encontrar una hoja beta plegada, un giro y una hlice
alfa.
Respecto a las hlices alfa, esta conformacin surge a partir de la unin del oxgeno del
carbonilo con un hidrgeno del aminocido de cuatro posiciones anteriores tal como se
muestra en la Figura 40.
Figura 40. Hlice alfa, forma parte de la estructura secundaria de una protena (Lodish, 2007).
Por otra parte la hoja beta se forma, como lo muestra la figura 41, por hebras de
aproximadamente 5 a 8 aminocidos que se agrupan lateralmente, los enlaces que posee
provocan que el pptido se pliegue.
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Figura 41. Hoja beta plegada, a) vista superior y b) vista lateral (Lodish, 2007).
Dentro de la estructura de las hojas beta plegada se pueden observar un par de giros
cortos que proporcionan la forma de U, estos giros estn compuestos por tres o cuatro
aminocidos, sirven para redirigir la estructura del pptido.
c) Estructura terciaria
Aqu encontramos que los elementos de la estructura secundaria, las hlices alfa, las
hojas beta plegadas y los giros azarosos (Fig. 42) que se mantienen compactados gracias
a que la cadena polipeptdica se estabiliza mediante las interacciones hidrfobas entre las
cadenas laterales no polares y tambin por los enlaces de hidrgeno entre las cadenas
laterales polares y enlaces peptdicos; sin embargo por la debilidad de los enlaces an se
modifica su estructura momentneamente.
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
d) Estructura cuaternaria
Consta de dos o ms polipptidos que se unen entre s, hace referencia al nmero de
subunidades que posee, mismas que pueden ser idnticas o diferentes, en este caso
pueden asociarse con otras protenas que se encuentran en el mismo lugar o bien que
cumplan funciones dentro del mismo proceso, es decir forman asociaciones multimricas
dentro de la clula formando de esta forma un sinfn de complejos protenicos; por
ejemplo un replisoma que es la unin de la helicasa, una DNA polimerasa y una primasa
(Fig. 43).
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Unidad 1. Biotransformaciones
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Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 46. Protena transmembranal con funcin de transporte (Science Photo Library).
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Unidad 1. Biotransformaciones
e) Protenas motoras que son las que originan el movimiento y conforman los
filamentos de actina y miosina (Fig. 48) forman la maquinaria contrctil del
msculo.
Figura 48. Tbulos de miosina (color verde) y actina (rojo) (Science Photo Library).
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Unidad 1. Biotransformaciones
El tipo de azcar as como la base nitrogenada presente es la principal diferencia entre los
dos tipos de cidos nucleicos: el cido desoxirribonucleico o ADN y los cidos
ribonucleicos o ARN. En este apartado iremos desarrollando la estructura e importancia
de cada uno de ellos, te apuntas?
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Unidad 1. Biotransformaciones
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Los desoxinucletidos estn formados por una pentonsa (desoxirribosa) un grupo fosfato
y una base nitrogenada que puede ser purina (Adenina o Guanina) o pirimidnica (Timina
o Citosina). Su estructura se puede observar en la Figura 51 (tomado de Nelson y Cox,
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
2009).
Figura 51. Estructura de los desoxinucletidos, los dos primeros (A y G) formados por bases
puricas y los dos ltimos (T y C) formados por bases pirimidnicas. As mismo, se observa que
existen tres formas correctas para denominar un desoxinucletido (tomado de Nelson y Cox, 2009).
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Ahora que sabemos cmo son los desoxinucletidos, pasemos a revisar cmo se unen
entre s para formar las cadenas de ADN. Esto ocurre mediante un enlace fosfodister
(tambin conocido como enlace nucleotdico) entre el OH del carbono 3 del nucletido
presente en la cadena con el fosfato del carbono 5 del nucletido que se incorpora; de
esta manera podemos observar cmo el crecimiento de todas las molculas de cidos
nucleicos siempre ocurre en direccin 5-3 (Fig. 54).
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 54. Enlace fosfodister (A) para la formacin de la cadena de ADN. Observa cmo el
nuevo nuclotido se incorpora en el extremo 3 (B) por lo que el crecimiento se dar en direccin
53 (modificado de http://cienciastella.com/ADN.html y
http://www.iesaltoalmanzora.es/centro/departamentos/biologia/2bto_bio/unid6.htm).
Finalmente, llegamos a la cadena de desoxinuclotidos que se unir con otra para formar
el ADN mediante puentes de hidrgeno entre las bases presentes: la adenina forma dos
puentes de hidrgeno con la timina; mientras que la guanina forma 3 puentes de
hidrgeno con la citosina; para ello, es importante que las cadenas sean antiparalelas los
que permitir la interaccin entre las bases nitrogenadas (Fig. 55).
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 55. Interaccin entre las bases nitrogenadas de las dos cadenas de desoxinucletidos para
la formacin de una cadena de ADN (Nelson y Cox, 2009).
El ADN es una molcula muy flexible y se han descrito 3 formas (Fig. 56): la forma A
presente cuando el ADN est en una solucin poco acuosa; la forma B, la ms estable,
descubierta por Watson y Crick en 1953, y la forma Z donde se observan giros levgiros
(a la izquierda) en vez de dextrgiro (a la derecha) como en las otras formas. Si quieres
conocer ms sobre estas estructuras o el crucial descubrimiento de estos dos grandes
investigadores, por favor, revisa el Captulo 12, pp. 331-337 de Nelson y Cox (2009).
Figura 56. Diferentes formas que puede adoptar el ADN. Cada una de las estructuras presentes
tienen 24 pares de bases (Nelson y Cox, 2009).
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Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 57. Estructura de los nucletidos presentes en el ARN (Nelson y Cox, 2009).
Tipo de ARN
mensajero
Sntesis de protenas
de transferencia
ribosmico
Reguladores
De interferencia
Micro ARN
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Interferente pequeo
Asociados a Piwi
Antisentido
Largo no codificante
Riboswitch
Ribozima
Con actividad cataltica
Espliceosoma
Pequeo nuclear
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Figura 58. Estructura del ARNm presente en una clula eucariota (tomado de
http://www.inmegen.gon.mx/es/divulgacion/glosario-de-terminos)
Figura 59. Estructura del ARNt, observe como el plegamiento es debido a las uniones de las
bases nitrogenadas G-C y A-U (http://sintesis-jmr.blogspot.mx/2010/11/arn-mensajero-arn-detransferencia-html)
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 60. ARNr presente en las clulas procariotas y eucariotas. La unidad S (svedberg) se
refiere al coeficiente de sendimentacin durante una centrifugacin que depende de una
combinacin de tamao y forma (Lodish y Cox, 2009).
Ahora que conocemos la estructura del ADN y del ARN es hora de hablar de su
importancia bioqumica.
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Unidad 1. Biotransformaciones
Siguiendo con los nucletidos pero cambiando de funcin tenemos al AMPc y el GMPc,
derivados del ATP y GTP respectivamente, donde el tomo de fosfato forma un anillo al
estar unido al carbono 5 y 3 (Fig. 62). Est implicada en la regulacin celular siendo uno
de los principales segundos mensajeros celulares. Todas las clulas se comunican unas
con otras y detectan el medio ambiente donde habitan para responder a los cambios que
se producen, para ello, en las membranas celulares existen protenas cuya funcin es la
recepcin de estos mensajes para comunicarlos a la clula y as actuar en consecuencia.
En la mayora de los casos, esta seal se transmite utilizando segundos mensajeros que
llevan la seal de la membrana hasta el ncleo o organelo que deben responder a ella.
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 62. Estructura del AMPc y GMPc importantes en la sealizacin celular (Nelson y Cox,
2009).
Continuando con las funciones de los cidos nucleicos y siguiendo con el tamao de los
mismos, pasemos a hablar de los ARN que tiene actividad cataltica como las
ribozimas. Supongo que muchos de ustedes piensan que las nicas molculas capaces
de acelerar reacciones qumicas son las enzimas de naturaleza protica, verdad?
Buenos, pues desde hace aos se ha demostrado que existen varios tipos de ARN que
pueden realizar esta misma funcin. Un ejemplo es el enlace peptdico durante la sntesis
de protenas ya que se ha demostrado que es un RNAr presentes en el ribosoma el
encargado de esta accin. Los primeros en sugerir esta accin fueron Crick y Orgen en
1967 pero no fue hasta 1980 cuando Cecha Altman lo demostraron de manera
independiente.
El resto de las funciones bioqumicas de los cidos nucleicos estn implicados en la
expresin de protenas, el almacenamiento y la transmisin del material gentico a
la descendencia. Para ello, es importante comenzar definiendo algunos conceptos
necesarios para entender este tema. En primer lugar, recordemos que las protenas son
cadenas polipeptdicas cuya diferencia es el nmero y la posicin de los aminocidos que
conforman su estructura primaria, por ello, para su sntesis es necesario tener la
informacin que nos indique la secuencia correcta. Esta informacin viene determinada en
el ADN, donde se encuentran los genes, que son secuencias que contienen la
informacin necesaria para la sntesis de un producto biolgico (ya sea protena, como
comentbamos, o ARN). Este proceso se lleva a cabo mediante dos procesos que
constituyen el Dogma Central de la Biologa Molecular (Fig. 63): en primer lugar se da el
proceso de transcripcin donde la secuencia de ADN se transforma en ARN y
posteriormente ocurre la traduccin donde la secuencia, especficamente del ARNm, es
ledo por el ARNt para formar la protena correspondiente en los ribosomas.
Por otro lado, es importante que se produzcan las protenas necesarias en cada situacin
ya que un exceso de las mismas equivaldra a un gasto de energa innecesario y una falta
de alguna protena podra conllevar la muerte de los organismos. Es por ello, que la
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Unidad 1. Biotransformaciones
Figura 63. Dogma central de la Biologa Molecular (modificado de Curtis y Barnes, 2009).
Los detalles de cmo ocurren estos procesos de replicacin, transcripcin y traduccin los
veremos en la Unidad III de este mismo curso, te interesa?
Actividades
La elaboracin de las actividades estar guiada por tu docente en lnea, mismo que
te indicar, a travs de la Planeacin didctica del docente en lnea, la dinmica que t
y tus compaeros (as) llevarn a cabo, as como los envos que tendrn que realizar.
Para el envo de tus trabajos usars la siguiente nomenclatura: BBIQ_U1_A1_XXYZ,
donde BBIQ corresponde a las siglas de la asignatura, U1 es la unidad de conocimiento,
A1 es el nmero de actividad, el cual debes sustituir considerando la actividad que se
realices, XX son las primeras letras de tu nombre, y la primera letra de tu apellido
paterno y Z la primera letra de tu apellido materno.
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Autorreflexiones
Para la parte de autorreflexiones debes responder las Preguntas de Autorreflexin
indicadas por tu docente en lnea y enviar tu archivo. Cabe recordar que esta actividad
tiene una ponderacin del 10% de tu evaluacin.
Para el envo de tu autorreflexin utiliza la siguiente nomenclatura:
BBIQ _U1_ATR _XXYZ, donde BBIQ corresponde a las siglas de la asignatura, U1 es la
unidad de conocimiento, XX son las primeras letras de tu nombre, y la primera letra de
tu apellido paterno y Z la primera letra de tu apellido materno.
Cierre de la unidad
Ya hemos llegado al final de la unidad, te ha parecido interesante? Hemos analizado los
componentes bsicos de todos los seres vivos: las biomolculas que por su estructura y
funcin se pueden dividir en 4 grandes grupos:
1. Los polisacridos, polmeros formados por monosacridos como monmeros. Su
principal caracterstica estructural es estar formados por (CH2O)n y aunque existen
muchos tipos su principal funcin biolgica est relacionada con la produccin y
reserva de energa, como precursores de otras biomolculas como lpidos y cidos
nucleicos y como sealizadores intercelulares.
2. Tambin hemos estudiado a los lpidos, cuya principal caracterstica es ser un
compuesto aliftico (contiene una zona polar o hidroflica y una apolar o
hidrofbica). Dentro de sus funciones vamos a destacar dos de ellas: la reserva de
energa en forma de acilgliceroles y especficamente triaciltriglicerdos y la
formacin de membranas plasmticas.
3. La siguiente biomolcula analizada fueron las protenas, formadas por la unin de
aminocidos unidos por enlaces peptdicos. Hemos visto su importancia
estructural, como transportadores de biomolculas a travs de la membrana
plasmtica, receptores de seales sin olvidar la capacidad que tiene las enzimas
de catalizar reacciones qumicas.
4. Finalmente, y si quitarle importancia, tenemos a los cidos nucleicos compuestos
por nucletidos unidos por enlaces fosfodister. Su principal caractersticas es
estar formados por un azcar, fosfato y una base nitrogenada. Se divide en cido
desoxirribonuclico (o ADN) y cido ribonucleico (o ARN). Adems de estar
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Bioqumica
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Para saber ms
Fuentes impresas
Curtis, H. Barnes, N.S. (2009) Biologa. Editorial Mdica Panamericana.
Daz, J. (2006). Bioqumica: un enfoque bsico aplicado a las ciencias de la vida.
Mxico. UNAM.
Lodish. H. Berk, A. Matsudaria, P. Kaiser, C. Scott, M. Zipursky, L. Darnell,
J. (2007). Biologa celular y molecular. 5 edicin. Mxico. Editorial Mdica
Panamericana.
Nelson, D.L., Cox, M.M. (2009). Lehninger: Principios de Bioqumica. Espaa.
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Fuentes electrnicas.
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http://biomodel.uah.es/model2/lip/nomen.htm
http://es.scribd.com/doc/23794366/Tips-de-arn
http://www.genomasur.com/lecturas/Guia07.htm
http://www.news-medical.net/health/Ribozyme-Discovery-(Spanish).aspx
Fuentes de consulta
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Bioqumica
Unidad 1. Biotransformaciones
Fell, David. (1999). Bases del Control del Metabolismo. Espaa. Editorial Omega.
Lehninger. (2009). Bioqumica. Mxico. Editorial Omega.
Lodish. H. Berk, A. Matsudaria, P. Kaiser, C. Scott, M. Zipursky, L. Darnell,
J. (2007). Biologa celular y molecular. 5 edicin. Mxico. Editorial Mdica
Panamericana.
Lozano, J. A. (2005). Bioqumica y biologa molecular en Ciencias de la salud.
Mxico. McGraw Hill.
Madigan, M.T., Martinko, J.M., Parker, J., Brock Biology of Microorganisms, 10
Ed. Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, EEUU, 2003
Mathews, C.K; Van Holde, K. E; Ahern, K.G. (2002). Bioqumica. 3a edicin.
Mxico. Pearson Addison Wesley.
McMurry, J.G. Jr. (2001) Qumica Orgnica. 2 Edicin. Mxico, Ed. International
Thomson Editores.
Murray, R. Mayers, P. Granner, D. Rodwell, V. (2010). Harper. Bioqumica
ilustrada. 28 ED. Mxico. McGraw Hill.
Nelson, D.L., Cox, M.M. (2009). Lehninger: Principios de Bioqumica. Espaa.
Editorial Omega.
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