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Fuerzas de estabilizacin de
secundaria, terciaria y cuaternaria
las
estructuras
Anticuerpos
Protena de la leche
Plumas
Transportadores
Cuernos de rinoceronte
20
aminocidos
Hormonas
estndar
Enzimas
Venenos de hongos
Antibiticos
Telaraas
SEMEJANZAS
Grupo amino
Grupo de
cadena lateral
DIFERENCIAS
El grupo R es el que
diferencia a los
aminocidos entre s.
Grupo carboxilo
tomo de carbono
tomo de
hidrgeno
AMINOCIDOS ESTNDAR
OTROS AMINOCIDOS
Aromticos (3)
4-hidroxiprolina
Derivado de la prolina. Se encuentra en paredes
celulares de plantas y en el colgeno
5-hidroxilisina
Derivada de la lisina, se encuentra en el colgeno
6-N-metil-lisina
Constituyente de la miosina, una protena
contrctil del msculo
-carboxiglutamato
Est en la protena protombina que interviene en la
coagulacin de la sangre
desmosina
Es un derivado de 4 residuos diferentes de Lys y se
encuentra en la protena fibrosa elastina
selenocistena
Proviene de la serina; se encuentra en unas pocas
protenas
Ornitina
Son intermediarios CLAVE (metabolitos) en la
biosntesis de la arginina y en el ciclo de la
urea.
Citrulina
NO SE ENCUENTRAN EN PROTENAS
MODIFICACIONES REVERSIBLES DE
AMINOCIDOS IMPLICADAS EN LA
REGULACIN DE LA ACTIVIDAD DE
PROTENAS
Las sustancias con esta naturaleza dual (cidobase) son anfteras y se les llama anfolitos.
Estructura neutra
In dipolar
A pH neutro
Grupo
carboxlico
pierde un protn
Componente minoritario
Componente mayoritario
Carboxilato
El grupo amino
se protona
In amonio
A esta estructura
se le denomia
In dipolar o
Zwitterin
*La
*La estructura
estructura real
real
del
del aminocido
aminocido es
es
inica
inica yy depende
depende
del
del pH
pH
Donador protones
Aceptor protones
CARGA
NETA
Sigue aumentando
el pH y el NH3+
pierde su protn a
pH entre 9 y 10
pKa2, por encima de
este pH tiene una
carga total negativa
Al aumentar el
pH el grupo
COOH pierde su
proton a pH=2
pKa1 (primera
constante de
disociacin)
En solucin
cida COOse protona y
se obtiene
COOH= carga
total positiva
pI
En este punto,
AA es menos soluble en agua
AA no migra en un campo elctrico
pK1 pK 2
2
Grupos amino y
carboxilo
en la glicina
Los valores de pKa para los grupos ionizables en la Gli son menores que los
econtrados en los grupos amino y carboxilos sustitudos por un grupo metilo.
Estas perturbaciones a la baja del pKa se deben a interacciones intramoleculares.
Efectos similares pueden ser causados por grupos qumicos que se posicionan cerca
de , por ejemplo, el sitio activo de una enzima.
Fuerzas de estabilizacin de
secundaria, terciaria y cuaternaria
las
estructuras
Enlace
ENLACE
amida sustituido = PEPTDICO
DIPPTIDO
AA
1
AA
2
AA
1
AA
2
AA
3
AA
3
AA
4
AA
AA
4
AA
2
AA
1
TRIPPTIDO
TETRAPPTIDO
AA
5
PENTAPPTIDO
4-10 AA
AA
1
AA
2
AA
3
AA
4
AA
5
AA
6
AA
7
AA
n
POLIPPTIDO
PROTENA
O
L
I
G
O
P
P
T
I
D
O
S
ESTRUCTURA DE UN PENTAPPTIDO
Extremo amino
Terminal
o
N-terminal
Serilglicil tirosilalanil-leucina
Ser-Gly- Tyr-Ala-Leu
SGYAL
Extremo
carboxilo
Terminal
o
C-terminal
Tetrapptido
-un grupo -amino libre
- un grupo -carboxilo libre
- dos grupos R ionizables
Alanilglutamilglicil-lisina
Neuropptidos
Polimixn B
(para bacterias
Gram -)
Bacitracn
(para bacterias
Gram +)
Antibiticos
Pptidos
Hormonas
y
feromonas
Insulina
Oxitocina
Pptido sexual
Proteccin
(toxinas)
Amanitina-- en hongos o setas