Variacin Somaclonal

En los laboratorios dedicados al cultivo in vitro de clulas y tejidos vegetales, es

comn observar que el fenotipo de algunas plantas obtenidas por esta tcnica no
corresponden al fenotipo de la planta que dona los explantes, a este hecho Larkin
y

Scowcroft

(1981)

lo

definieron

como

variacin

somaclonal,

causada

principalmente por dos tipos de causas: la variacin epigentica transitoria y las

variaciones genticas verdaderas producto de mutaciones.
A travs del tiempo muchos autores han proporcionado sus ideas respecto al tema
que finalmente aterrizan en lo similar, por ejemplo Kaepler et al., (2000) definen a
la variacin somaclonal como la variacin gentica y fenotpica encontrada entre
plantas propagadas por cultivo in vitro a partir de un genotipo donador.
El cultivo in vitro per se, puede ser muy estresante para las clulas vegetales e
involucra procesos mutagnicos durante el establecimiento del explante, la
induccin de callo, la formacin de embriones y la regeneracin de plantas.
Los mecanismos que generan estas variantes no han sido completamente
elucidados, pero entre sus causas se mencionan alteraciones de tipo gentico y
epigentico, como cambios en el cariotipo es decir, alteraciones en nmero y
estructura

cromosmica,

mutaciones

puntuales,

recombinacin

somtica,

intercambio de cromtidas hermanas, rearreglos gnicos somticos, elementos

genticos transponibles, amplificacin y/o metilacin del ADN y cambios en el ADN
de los organelos. Se ha observado que este tipo de variacin no es transmitida
muy a menudo a las siguientes generaciones, lo cual indicara que se trata de
variacin somaclonal de origen epigentico, ms que gentico (Cardone et al.,
2010).

Para Ong-Abdullah et al. (2015) la variacin somaclonal surge en plantas y

animales cuando las clulas somticas diferenciadas se inducen en un estado
pluripotente, sin embargo los clones resultantes difieren unos de otros y de sus
padres.
Dubrovina y Kiselev (2015), resaltan que la acumulacin de daos en clulas a
nivel ADN y ADN polimerasa conducen a una mayor tasa de mutacin somtica y
alteraciones en la transcripcin. Estudios recientes revelan que el cultivo
prolongado de clulas vegetales in vitro induce sustituciones de nucletidos
individuales y aumenta el nivel global de la metilacin del ADN de una manera
dependiente del tiempo. Los cambios en la metilacin del ADN son conocidos por
influir en la reparacin del ADN y pueden conducir a altas tasas de mutacin,
tambin se ha descubierto que los niveles de metilacin del ADN varan
dependiendo de la edad del tejido de la planta y la edad cronolgica de una planta
donante.

Variacin Somaclonal y su aplicacin al

mejoramiento de cultivos
La variacin somaclonal ha sido un tema de investigacin muy importante en los
ltimos aos, debido a que su conocimiento ha permitido aumentar el nivel de
variabilidad y ha logrado en algunas especies lograr una manipulacin eficiente de
las caractersticas que se desea modificar. A pesar de que la variabilidad gentica
es esencial para la creacin de plantas con caractersticas agronmicas
superiores, las mutaciones espontneas ocurren en frecuencia muy baja, por esto
la induccin de variacin somaclonal constituyen una herramienta para lograr un
incremento rpido en la variabilidad gentica de las especies (Okole, 2000).
Hay muchos factores que inciden en la obtencin de variacin somaclonal, pero
entre mayor sea el nivel de desorganizacin del tejido del explante y mayor el

tiempo que este pasa en cultivo in vitro, mayores sern las probabilidades de
generar variacin somaclonal, que se ve influenciada por la constitucin genotpica
y los niveles de ploida del explante (Torres, 2010). Se realiz un experimento en
el que causa variacin somaclonal con el uso de toxinas que ejercen una presin
de seleccin sobre el explante y que obtiene clulas con adaptacin al agente
selectivo. De acuerdo al mismo autor, la tcnica se adapta a generacin de
germoplasma resistente o tolerante a factores de estrs abitico, a seleccin
directa de mutantes con tolerancia o resistencia a factores biticos, generacin de
ornamentales con caractersticas novedosas y

al estudio y anlisis de los

mecanismos de interaccin molecular entre las clulas de las plantas y los

fitopatgenos, as como las respuestas de las clulas vegetales a los estrs
abiticos.

Variacin Somaclonal;
Un problema para la micropropagacin de
especies de inters agronmico
En la agricultura, la variacin somaclonal ha obstaculizado la micropropagacin de
los hbridos de lite y los cultivos modificados genticamente, pero el mecanismo
responsable sigue siendo desconocido.
Aunque la variacin somaclonal puede ser una fuente de variacin, cuando se
requiere obtener plantas idnticas al material parental puede ser indeseable, como
cuando se utiliza ingeniera gentica en los programas de mejoramiento gentico,
para lo cual se requiere que las plantas receptoras sean gentica y
morfolgicamente adecuadas para la correcta inclusin de las caractersticas
deseables y donde la variacin somaclonal originada por el cultivo de tejidos
puede

complicar

este

requerimiento,

reduciendo

transformacin (Vilaca de Vasconcelos et al., 2008).

la

efectividad

de

la

Kitimu et al., (2015) han encontrado en cinco cultivares de yuca (Manihot

esculenta) 105 epi-marcadores cuyas secuencias revelaron 102 sitios asociados
con genes cuyos homlogos se han implicado en una variedad de procesos
biolgicos fundamentales que incluyen la diferenciacin celular, el desarrollo, el
metabolismo del azcar, la metilacin del ADN, la respuesta al estrs, la
fotosntesis, y la activacin de los transposones.
Stelpflug et al. (2014) evaluaron el genoma el maz tras el cultivo de tejidos y
encontraron que aunque los niveles de metilacin del ADN en todo el genoma se
mantuvo similar tras el cultivo de tejidos, numerosas regiones exhibieron niveles
de metilacin de ADN alteradas. Se observaron eventos hipometilacin ms
frecuencia que la hipermetilacin siguiente cultivo de tejidos. Muchos de los
eventos hipometilacin ocurren en los mismos sitios genmicos a travs de los
regenerantes independientes y lneas celulares. Los cambios de metilacin del
ADN a menudo eran hereditarios en progenies producidas a partir de la autopolinizacin de regenerantes primarios. Regiones diferencialmente metilados
(DMR) que se encuentran en los regenerantes de cultivo de tejidos se superponen
con ms frecuencia de lo esperado por azar con 8% de cultivo de tejidos.
Ong-Abdullah et al., (2015) encontraron que el fruto anormal de la palma es una
variante somaclonal derivada de cultivo de tejidos que reduce drsticamente el
rendimiento, y ha detenido en gran medida los esfuerzos para clonar hbridos elite
para produccin de aceite, se encontr tambin que se debe a la metilacin del
ADN.

Formas de Evaluacin de la
Variacin Somaclonal
Es fundamental entonces, desarrollar mtodos que permitan la deteccin de los
cambios genticos ocasionados por el cultivo in vitro. En ese sentido, los
marcadores moleculares pueden ser usados para caracterizar la variacin
somaclonal con mayor precisin que con los anlisis fenotpicos y cariolgicos
(Cloutier y Landry, 1994).
Los marcadores moleculares mas utilizados son los RAPD (del ingls "Random
Amplified Polymorphism DNA"), que se utilizan para el desarrollo de huellas
digitales de ADN cuando se requiere identificar variacin dentro de una misma
especie, determinar parentesco y caracterizar y clasificar el material clonal
obtenido de cultivo in vitro (Marulanda y Mrquez, 2002) y los AFLP (del ingls
"Amplified Fragment Length Polymorphism") que presentan un alto poder de
deteccin de

variabilidad gentica debido a que exploran simultneamente la

presencia o ausencia se sitios de restriccin, ha sido muy utilizado para detectar

variacin somaclonal en platano (Musa spp) (Snchez-Chiang y Jimnez, 2009).
Cuadro 1. Ejemplos de trabajos en los cuales la tcnica RAPD ha sido empleada
para detectar variacin somaclonal. En algunos ejemplos se han utilizado otras
tcnicas para su comprobacin (Snchez-Chiang y Jimnez, 2009).

Cuadro 3. Ejemplos de trabajos en los cuales la tcnica AFLP y/o microsatlites

han sido empleados para detectar variacin somaclonal. En algunos ejemplos se
han utilizado otras tcnicas para su corroboracin (Snchez-Chiang y Jimnez,
2009).

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