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TEMA 3: BIOLOGA DE LA CLULA PROCARIOTA

OBJETIVOS

Conocer los distintos tipos trficos y los procesos y obtencin de carbono y energa
que utilizan los microorganismos.
Comprender los mecanismos de captacin de nutrientes
Entender el papel del gradiente de protones y la forma y funcin del poder reductor.
Aprender los mecanismos de obtencin de ATP y la gran importancia de sta y otras
molculas para las clulas

NUTRICIN MICROBIANA. OBTENCIN DE CARBONO Y ENERGA


Tabla peridica de los elementos microbiana

Nutrientes: sustancias que se emplean en la biosntesis y obtencin de energa, necesaria


para el crecimiento.
Hay nutrientes que solo se usan como materia prima para formar estructuras, y otros para
obtener energa.
El carbono del CO2 formar parte de las molculas orgnicas pero no ser fuente de energa
porque est muy oxidada. Otras fuentes de carbono ms reducidas tambin sern fuente de
energa.
Requerimientos nutritivos de los microorganismos.
- Macroelementos: C, O, H, N, S, P, K+, Ca2+, Mg 2+ y Fe 2+ (> 95% peso seco)
- Micronutrientes o elementos traza: Mn, Zn, Co, Mo, Ni y Cu
- Requerimientos especiales (morfologa y hbitat). Ej. Diatomeas, ac. siliclico.
Requerimientos de C, H y O
Hetertrofos: compuestos orgnicos en estado reducido (e -)
Auttrofos: CO2 (oxidado), no aporta energa (energa de la luz o compuestos
inorgnicos)
o Existen microorganismos capaces de degradas cualquier molcula orgnica
Requerimientos de N, P y S

Nitrgeno: sntesis de aa, purinas, pirimidinas, cofactores, algunos hidratos de


carbonos y lpidos, etc.
o N de aas o amonio directamente (enzimas)

o Algunas bacterias reducen y asimilar el N atomsfrico (Rhizobium)


Fosforo: en cidos nucleicos, fosfolpidos, nucletidos, cofactores, etc.
o Incorporacin a partir de fosfato inorgnico.
Azufre: sntesis de cys y met, biotina, tiamina y algunos hidratos de carbono
o A partir de sulfato

Factores de crecimiento
- Compuestos orgnicos esenciales que el microorganismo no puede sintetizar
- Existen tres clases principales:
aminocidos
purinas y pirimidinas
vitaminas
- Algunos microorganismos necesitan muchos factores de crecimiento
Ej. Enterococcusfaecalis: 8 vitaminas distintas

Tipos nutricionales entre microorganismos


La mayora de los microorganismos estudiados son:

Auttrofos fotolitotrficos (fotoauttrofos o fotolitoauttrofos)


o Energa lumnica y CO2
o Algas y cianobacterias (donador de electrones H2O)
o Bacterias verdes y prpuras del azufre (donador de electrones azufre,
hidrgeno, sulfuro de hidrgeno)
Hetertrofos quimiorganotrficos (quimiohetertrofos o quimioorganoheterotrficos)
o Casi todos los patgenos

Menos microorganismos se agrupan en los dos grupos siguientes:

Hetertrofos fotoorganotrficos (fotoorganohetertrofos)


o Algunas bacterias prpuras y verdes
Auttrofos quimiolitotrficos (quimiolitoauttrofos)
o Oxidan compuestos inorgnicos reducidos
o Transformaciones qumicas de los elementos en los ecosistemas.
Miccroorganismosmixotrficos: combinan procesos metablicos quimiolitoautotrficos
y heterotrficos.

Ej: Beggiatoa, puede obtener energa de fuentes inorgnicas usando una fuente
orgnica de carbono

Captacin celular de nutrientes


- Existen varios mecanismos de transporte distintos:
- Difusin (pasiva o facilitada). A favor de gradiente.
- Transporte activo. Contra gradiente.
- Translocacin de grupo (endocitosis en eucariotas)
Difusin pasiva: gradientes de concentracin (agua, O2, CO2, glicerol, etc)
Difusin facilitada
Difusin mediada por permeasas
Especificidad
No necesita energa, depende de gradiente de concentracin
Reversible
Ej: Acuaporinas (H2O, glicerol)

Transporte activo

En contra de gradiente de concentracin


Necesita energa metablica
Protenas transportadoras o permeasas
Especificidad
Transportadores ABC (ATP-bindingcassette): Ej. E. coli, azcares y aas
o Dominios transmembrana hidrofbicos
o Dominios citoplasmticos que unen ATP
o Protenas de unin en periplasma (G -) o unidas a lpidos de la membrana
plasmtica (G+)

Translocacin de grupo:

Implica alteracin del soluto


Sistema fosfotransferasa de azcares (PTS)
o Transporte de azcares fosforilados
PRP + azcar (exterior) piruvato + azcar-P (interior)
o En E. coli y S. typhimurium
o 2 enzimas y una protena termoestable de bajo Pm (HPr)
HPr y EI, citoplsmicas
EII (3 subunidades):
EIIA, citoplsmica soluble
EIIB, hidroflica, unida a EIIC
EIIC, hidrofbica, en la membrana
EII, es muy variable y especfica de cada azcar
EI y HPr son generales para todos los PTS
o PTS ausente en bacterias aerobias excepto algunos Bacillus

o
o

PTS en anaerobias facultativas y algunas anaerobias estrictas


Pueden actuar como quimiorreceptores.

Sistema de fosforelevo (phosphorelay): Presente en numerosas bacterias anaerobias


facultativas, algunas anaerobias. La mayora de las bacterias aerobias carecen de este
sistema

mtodos para transportar en contra de gradiente. Se fosforila la glucosa, por lo que


hace desaparecer la glucosa y sigue tendiendo a equilibrar su gradiente.

Captacin de hierro
- El hierro es esencial para los microorganismos (citocromos, enzimas)
- Fe3+ y sus derivados son muy insolubles
- Siderforos: acomplejan hierro frrico y lo aportan a la clula
* Hidroxamatos o fenolatos-catecolatos
- Protenas receptoras de siderforos:
liberacin de hierro al interior
internalizacin del complejo mediante transportador ABC
reduccin de Fe3+ a Fe2+ en el citoplasma

Papel de hierro
-Redfield ratio: describe la concentracin atmica relativa de nutrientes crticos en la
biomasa del plankton.
- Actualmente se piensa que esta relacin es:
106 C: 16 N: 1 P: 0.001 Fe
106000 C: 16000 N: 1000 P: 1 Fe
Interpretacin: se necesita 1 tomo de hierro para fijar 106000 tomos de carbono.
- Por cada kg de Fe, se pueden fijar 83000 kg de CO2.

Catlisis y enzimas
Energa de activacin: estado reactivo de las molculas
Catalizador:

disminuye la energa de activacin de una reaccin


aumenta la velocidad de la reaccin
no se modifica ni se consume durante la reaccin

Enzimas:

catalizadores de las reacciones biolgicas


alta especificidad
sitio activo
catlisis unidireccional aunque en teora su accin es reversible
protenas con estructuras especficas

E + S > E-S > E + P

Muchas enzimas contienen pequeas molculas no proteicas:


- grupos prostticos: se unen muy fuertemente y de modo permanente
Ej. Grupo hemo de citocromos
- coenzimas: se unen mas dbilmente y de modo no permanente
- transportan pequeas molculas de una enzima a otra
- la mayora derivan de vitaminas
Energa: capacidad de hacer trabajo
Las clulas vivas hacen 3 tipos de trabajo
1. trabajo qumico: sntesis de molculas a partir de precursores ms sencillos.
2. Trabajo de transporte: requiere energa para tomar nutrientes, eliminar residuos,
mantener balances inicos.
3. Trabajo mecnico: se requiere energa para la movilidad celular y el de estructuras
dentro de la clula

Energa libre
El cambio de energa libre es la cantidad de energa de un sistema (o clula), disponible para
realizar trabajo a temperaturas y presin constante.

Cambio de energa libre estndar

El papel del ATP en el metabolismo


Existe una diversidad metablica enorme en el mundo microbiano. Sin embargo, existen
varios principios comunes a todos los tipos de metabolismo:
El uso de ATP para almacenar la energa liberada durante las reacciones exergnicas,
de manera que pueda utilizarse para facilitar reacciones endergnicas.
La organizacin de las reacciones metablicas en rutas o ciclos.
Catlisis de reacciones metablicas por enzimas.
La importancia de las reacciones de oxidacin-reduccin en la conservacin de la
energa.
El ATP es una molcula de alta energa.
ATP + H2O ADP + Pi
G = -7,3 kcal/mol o -31.8 kJ/mol

Eficiencia de la oxidacin completa de la glucosa en condiciones aerobias

Gf de A + B -> C + D = Gf (C + D) Gf (A + B)

Glucosa + O2 ------> CO2 + H2O


C6H12O6 + 6O2 ------> 6CO2 + 6H2O

1*(-917.22) + 6*(0) ------> 6*(-394.4) + 6*(-237.17)


Gf de A + B -> C + D = [-2366.4 1423.02] [-917.22] = -2872.2 kJ

1 ATP > 31.8 kJ/mol


1 Glucosa >aprox. 90 ATPs tericos!

En realidad, se producen 36-38 ATPs (aprox. 40% eficiencia energtica)

Motor gasolina: aprox. 25%


Clula fotovoltica: aprox. 15%

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