LAMMPS

DESCARGAR EN WINDOWS
Se puede instalar en serie o en paralelo, en paralelo es ms rpido el
programa, pero necesita de varios procesadores, si se instala en un solo
computador, se recomienda instalar en serie, es un poco ms lento, pero es
seguro para hardware para evitar as el recalentamiento por falta de disipacin
Descargar en serie la ltima versin dependiendo si es 32 o 64-bit:
http://rpm.lammps.org/windows.html

INSTALACIN EN WINDOWS
El archivo descargado (lammps-64bit-latest) que es un ejecutable (.exe) se
debe llevar a una carpeta especificada por el usuario, y es en esa misma
carpeta en donde se debe instalar (especificar la ruta/path cuando se est
instalando)
RUNNING
Una vez se instala, el programa se debe usar a partir de DOS. Para ello se
puede dos rutas:

Presionar tecla Windows+R

Inicio y clikaremos en ejecutar,(en Windows 7 lo escribiremos en el
cuadro de bsqueda)

En el cuadro emergente escribir CMD:

Es en este cuadro en el que se realiza la ejecucin de lammps.

Para realizar la ejecucin especificamos la ruta donde se encuentra ubicada la
carpeta, entonces vamos a ejecutar uno de los ejemplos
Vamos a donde instalamos lammps e ingresamos en la carpeta examples,
luego en la colloid y dentro vemos archivos, el que nos interesa es el de
nombre in.colloid que es el que va a leer desde DOS.

Cada problema tiene un script de entrada (in.*) y produce un archivo de

registro (log.*) y un archivo dump (dump.*) cuando corre. Algunos usan
archivos de datos (data.*) para proveer las coordinadas iniciales de las
tomos/partculas. El que nos interesa es el archivo dump, para verlo en VMD.
En los ejemplos, el archivo in. Se abre como archivo de texto (wordpad o block
de notas) para modificarlo (programar) y hay que quitarle en la parte que
nombra la palabra dump los comentarios antes de ejecutar para que cree los
archivos respectivos, para quitarlos, se abre el archivo in. Y vamos a la parte
que dice dump y quitamos los smbolos # y le damos guardar.

Le damos copiar a esa ruta (click derecho, copiar) y nos dirigimos a la ventana
de DOS. En esa ventana, cada vez que queramos abrir una carpeta hay que

colocar el comando cd:

Despus de cd, damos un espacio, y pegamos nuestra ruta y le damos enter

Aca es donde se ejecuta el archivo in. Colloid, entonces para eso escribimos:
lmp_serial in in.colloid

Le damos enter y empieza a ejecutarse dentro de la mima carpeta colloid,

ABRIR CON VMD

Abrimos el programa VMD y se abren 3 ventanas, vamos a la que dice vmd
main:

En esa ventana vamos a file, new molecule

Y en la ventana emergente, en la opcin determine file type, buscamos

lammps trajectory y en browse buscamos nuestro archivo dump generado y le
damos load: