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PUEBLA
Programa Acadmico de Maestra en Ingeniera en Automatizacin de
Procesos Industriales
PRESENTA:
ING. ALDO HERNNDEZ DAZ
DIRECTOR
DRA. MARA LETICIA RAMREZ CASTILLO
Departamentos
de
Biotecnologa
Tecnologa
del
Estado
de
Puebla
PNPC-CONACYT
UNIVERSIDAD POLITCNICA DE PUEBLA
___________________________
Asesor:
___________________________
Asesor:
___________________________
Revisor:
___________________________
Agosto 2013
2
Contenido
Resumen ................................................................................................................. 8
Captulo 1 Planteamiento del problema de investigacin ...................................... 10
1.1 Introduccin ................................................................................................. 10
1.2 Objetivos ...................................................................................................... 12
1.2.1 Objetivo general ..................................................................................... 12
1.2.2 Objetivos especficos ............................................................................. 12
1.3 Justificacin ................................................................................................. 12
Captulo 2 Estudio del estado del
arte ................................................... 15
ndice de figuras
Figura 1.1. Diagrama a bloques del proceso de fermentacin. ............................. 14
Figura 2.1 Configuracin de un biorreactor agitado (Ramrez 2004). .................... 19
Figura 2.2 Perspectivas de reaccin y proceso involucrados en el crecimiento
celular y formacin de producto. ........................................................................... 22
Figura 2.3 Representacin de cultivo lote, esquema general en (a) y cintica de
cultivo en (b). ......................................................................................................... 29
Figura 2.4 Representacin de cultivo continuo. 2.4a. Esquema del biorreactor.
2.4b. Cintica de cultivo continuo. ......................................................................... 30
Figura 2.5. Representacin de cultivo lote alimentado. 2.4a. Esquema de
biorreactor. 2.4b. Cintica del cultivo lote alimentado. .......................................... 31
Figura 2.6. Electrodo de vidrio para medir pH. ...................................................... 35
Figura 2.7. Electrodo de Oxgeno disuelto. Instrumento. ...................................... 36
Figura 2.8. Electrodo de Oxgeno disuelto. Conexiones. ...................................... 37
Figura 2.9. Termopar convencional. ...................................................................... 39
Figura 2.10. Agitacin del medio de cultivo. .......................................................... 41
Figura 2.12. Bomba peristltica. ............................................................................ 42
Figura 3.1. Procesos e fermentacin en biorreactor escala laboratorio. ............... 53
Figura 3.2. Biorreactor de 4 litros de la UP-Puebla. .............................................. 53
Figura 3.3. Estructura del controlador PID y la planta a controlar. ........................ 56
Figura 3.4. Esquema del sistema de control como entrada al biorreactor de una
bomba peristltica. ................................................................................................ 56
Figura 3.5. Diagrama a bloques del controlador PID del motor de corriente directa.
.............................................................................................................................. 57
Figura 3.6. Diagrama a bloques del controlador PID del motor de corriente directa.
.............................................................................................................................. 58
Figura 3.7 Experimento de mediciones de porcentaje de saturacin de oxgeno. 60
Figura 3.8. Diagrama general de interfaz de usuario. ........................................... 61
Figura
3.9
Diagrama
de
interfaz
en
Labview
y
mbed
(http://mbed.org/cookbook/Homepage.). ............................................................... 62
Figura 4.1 Relacin Voltaje-pH.............................................................................. 64
Figura 4.2 electrodo de pH. ................................................................................... 65
Figura 4.3. Grfica de pH, datos tomados en lnea. .............................................. 65
Figura 4.4. Datos obtenido y exportados en hoja de clculo. ................................ 66
Figura 4.5. Mediciones de porcentaje de saturacin de oxgeno, ......................... 67
aireacin 1vvm. ..................................................................................................... 67
5
ndice de tablas
Tabla 2.1 Productos obtenidos por fermentacin (Quintero 1997) ........................ 16
Tabla 2.2 Aplicaciones de las enzimas producidas por fermentacin, extrado de
Quintero (1997) ..................................................................................................... 17
Tabla 2.3 Variables comnmente medidas en fermentadores y dispositivos
utilizados para su determinacin (Ramrez 2004). ................................................ 33
Tabla 2.4. Caractersticas de termopares de acuerdo al tipo. ............................... 39
Tabla 2.5. Clasificacin de procesos de agitacin. ................................................ 40
Tabla 3.1 Relaciones estndar del reactor de 4 litros utilizado. ............................ 54
Tabla 3.2 Voltajes obtenidos con sustancias buffer y amplificadas. ...................... 58
Tabla 4.2.Caracterizacin de la bomba peristltica. .............................................. 68
Tabla 4.3. Caractersticas de termopares de acuerdo al tipo. ............................... 69
Tabla 4.4. Parmetros de simulacin. ................................................................... 73
Tabla 4.5. Condiciones de operacin. ................................................................... 74
Tabla 4.6 Condiciones de operacinutilizadas en la simulacin del cultivo continuo
simple etapa. ......................................................................................................... 75
Tabla 4.7 Parmetros cinticos utilizados en la simulacin del cultivo continuo
simple etapa .......................................................................................................... 75
Tabla 4.7. Condiciones de operacin. ................................................................... 78
Tabla 4.8. Parmetros de simulacin. ................................................................... 78
Tabla 4.9 Parmetros cinticos utilizados en la simulacin de cultivo lote
alimentado lineal. .................................................................................................. 81
Tabla 4.10 Condiciones de operacinutilizadas en la simulacin de cultivo lote
alimentado lineal. .................................................................................................. 82
Resumen
Los biorreactores son recipientes en los que se pueden realizar reacciones
bioqumicas, con microorganismos, enzimas, clulas vegetales o clulas animales.
Su funcin es proveer un medio controlado para llevara cabo las reacciones en las
mejores condiciones y de esa forma lograr la transformacin de sustratos y
biosntesis de productos con altos rendimientos. En la mayora de los
biorreactores comerciales, el control de los parmetros se lleva a cabo
manualmente y la medicin de estos datos no es almacenada, el costo se va
incrementando conforme se aumentan los dispositivos para controlar los
parmetros y adquirir los datos en lnea, almacenarlos y graficarlos. En este
trabajo se desarroll un sistema de medicin y control de los parmetros de
operacin as como de adquisicin de los datos en lnea que permite almacenarlos
y graficarlos. Los parmetros medidos fueron pH, temperatura y oxgeno disuelto;
los parmetros controlados fueron pH y alimentacin de sustrato, este ltimo
mediante el flujo controlado por una bomba peristltica que permite llevar a cabo
cultivos alimentados y continuos. Se estudiaron los transductores que se utilizan
para dichas tarea. Adems se llevaron a cabo las simulaciones de los cultivos
(cultivos lote, continuo, lote alimentado exponencial y lineal) realizando los
balances de masa de acuerdo al modo de operacin y utilizando los modelos de
crecimiento y produccin establecidos por la bibliografa. El desarrollo de este
sistema fue menos costoso que un biorreactor comercial y presentar mayor
flexibilidad al poder realizar cultivos alimentados.
Abstrac
The bioreactors are containers in which biochemical reactions can be performed,
using microorganisms, enzymes, plant cells or animal cells. Its function is to
provide a controlled environment to carry out the reactions in the best condition
and thus transform substrates and synthesize products with high yields. In most
commercial bioreactors, the control of parameters is carried out manually and the
measurement of such data is not stored, the cost will increase with the increase of
devices to control the parameters, for online data acquisition, their storage and
graphing. In this work a system for measuring and controlling the operating
parameters was developed as well as acquisition of online data, storage and
graphing. The measured parameterswere pH, temperature and dissolved oxygen;
the controlledparameterswere pH and substrate feeding, the latter by the flow
control of a peristaltic pump that allows to perform fed-batch and continuous
cultures. The transducersfor these tasks were studied. Culture simulations were
also carried out (batch, continuous, fed batch lineal and exponential cultures) by
mass balances according to the operating mode and using models of growth and
8
definido como proveer las condiciones adecuadas para que los microorganismos
puedan crecer, reproducirse y sintetizar el producto deseado en las cantidades
esperadas, esto incluye: i) una concentracin correcta de nutrientes en el cultivo
(fuentes de carbono, nitrgeno, fsforo, oligoelementos y oxgeno); ii) remover las
toxinas producidas por el propio metabolismo de las clulas (dado el caso del
CO2), iii) controlar las condiciones de operacin (temperatura, pH, aireacin y
agitacin)(Alford2006, Wang y col. 2009). Lo anterior permitir controlar al
microorganismo y en el mejor de los casos su metabolismo para producir lo
previsto.
11
1.2 Objetivos
1.2.1 Objetivo general
Monitorear y controlar un biorreactor escala laboratorio para procesos de
fermentacin de cultivos celulares.
1.3 Justificacin
El cultivo de microorganismos requiere de un ambiente controlado que slo se
logra con un biorreactor, los existentes en el mercado, adems de alto costo son
limitados en su funcionamiento. En su mayora en estos biorreactores el control de
los parmetros se lleva a cabo imponiendo manualmente un valor y la medicin de
estos datos no es almacenada en caso de que se vare. El costo se va
incrementando conforme se aumentan los dispositivos para adquirir los datos en
lnea, almacenarlos y graficarlos. Los biorreactores para llevar a cabo cultivos
alimentados an no se existen en el mercado. Por lo anterior es necesario
desarrollar un biorreactor con mayor flexibilidad disminuyendo los costos; un
biorreactor que no solamente cuente con sistema de medicin y control de
12
13
14
que
son
de
los
productos
biotecnolgicos
ms
aceptados
y
15
Ejemplo
cidos orgnicos
Aminocidos
Alcoholes y solventes
Antibiticos
Esteroides
Protena unicelular
Vitaminas
Otros
Polisacridos
Goma xantana
Enzima
Accin
Glucosa
oxidasa/catalasa
(hongo)
Elimina el oxgeno
Diacetilreductasa
(levadura)
Convierte el
radical diacetilo en
acetona (requiere
NADH)
Lactasa (hongo)
Rompe la lactosa
Amilasa
Hidroliza
almidones
Naringinasa
Destruye la
naringina
Gelatina
Lipasa (hongo)
Rompe grasa
Glucosa
Celulasa
Hidroliza la
celulosa
Cerveza
Pan
Jugos de
frutas
Posible utilidad
Impide el crecimiento
de microorganismos
aerbicos que
generan
cidosvoltilesy
empobrecen el sabor.
Elimina el diacetilo
que contribuye a la
aparicin de sabores
indeseables en la
cerveza.
Provee de ms
azcares
fermentables a la
levadura de pan a
partir de la leche
utilizada en la mezcla.
Con pectinasa
clarifica los jugos de
fruta
Elimina el sabor
amargo del jugo
ctrico y de las
cscaras
Aumenta el
rendimiento de
gelatina de hueso de
alta calidad por
desengrasado
Hidrlisis de pulpa de
papel, peridico o
desperdicio agrcola
para producir glucosa
o azcares
fermentables.
17
18
El diseo debe ser tal que permita mantener el cultivo puro; una vez que
todo el sistema ha sido esterilizado y posteriormente inoculado con el
microorganismo deseado (Ruiz 2007).
20
21
23
Suministro de protenas
Gran variedad de tubos y puertos que permiten gran flexibilidad para conectarse a
otros biorreactores.
24
25
26
27
28
(a)
(b)
(2.1)
(2.2)
= (
+
+ )
/ /
(2.3)
(2.4)
(a)
(b)
30
y el
(a)
(b)
= ( )
=
( )
= ()
(2.5)
(2.6)
(2.7)
temperatura, etc.) sino que tambin depende del modo de operacin del
biorreactor (cultivo
lote,
cultivo
continuo
cultivo
alimentado), descrito
anteriormente.
de
dichas
variables
con
respecto
las
demandas
del
32
Dixido disuelto
Capacitancia y conductancia
Potencial redox
Composicin de gases a la salida
Biolgicos o bioqumicos
NADH Y NADPH
Densidad celular
Dispositivo/Instrumento
Termopar
Manmetro
Manmetros, sensor de conductividad
o capacitancia
Balanza, celdas de carga
Rotmetro, controladores de flujo
msico
Tacmetro
Sensor de conductividad o fibra
ptica, ultrasonido.
Anemmetros
Torqumetro y tacmetro
Sensores de fluorescencia
Sensores de turbidez, absorbancia,
amperomtricos o ultrasnicos.
Parmetros medidos en sistemas de flujo inyectado
cidos orgnicos
Aminocidos
Carbohidratos
Densidad y ciclo celular
Actividades enzimticas
Contenido de cidos nucleicos
Equipos conectados a travs de sistemas de flujo inyectado
Cromatgrafo de gases, cromatgrafo de alta resolucin (HPLC), cromatografa
de protenas (FLPC), Cromatografa de iones, espectrmetro de masas,
espectrofotmetro, analizadores bioqumicos (basados en biosensores), citmetro
de flujo, resonancia magntica nuclear.
33
34
36
2.3.3 Temperatura
La medicin de temperatura es un parmetro del crecimiento celular muy
importante debido a la relacin que tiene con la cantidad de oxgeno disuelto en el
biorreactor, as como permitir un funcionamiento adecuado en el mismo debido a
las reacciones bioqumicas que se suscitan. El cambio de temperatura dentro de
un biorreactor se produce debido al metabolismo celular, ya que mientras este se
lleva a cabo se linera energa y esto le da condiciones inadecuadas al
microorganismo para realizar su metabolismo, durante el anlisis de crecimiento
celular y produccin de producto generalmente no se considera modelar el
balance de energa, es decir el cambio de temperatura ya que si se mantiene la
temperatura constante, puede considerarse despreciable. Una razn ms de
mantener la temperatura constante.
37
38
8 = 3.25
14 = 1.63
20 = 0.81
24 = 0.51
28 = 0.33
***
370 C
260 C
200 C
150 C
760 C
590 C
480 C
370 C
320 C
860 C
650 C
540 C
430 C
430 C
1260 C
1090 C
980 C
870 C
760 C
***
***
***
1480 C
***
***
***
***
1480 C
***
***
***
***
1700 C
***
1260 C
1090 C
980 C
870 C
760 C
de Windows,
conectado
al
microcontrolador
(Rowe
1995,
Anatychuk1998).
Tratamiento qumico
Dissolving
Absorcin
Extraccin
Reaccin
Transferencia trmica
40
41
42
Condiciones de operacin.
(2.8)
Esta ecuacin se debe plantear para cada variable, es decir: biomasa, sustrato y
producto.
Una extensa revisin bibliogrfica permiti desarrollar las ecuaciones para cada
tipo de cultivo y revisar los principios de modelado (Pirt 1975, Levenspiel 1985,
Atkinson 1986, Bailey 1986, Lee 1992, Geankoplis 1998, Jakymec y col. 2001,
Najafpour 2007) y obtener la solucin de las ecuaciones diferenciales para realizar
la simulacin (Cooker 2001, Zill 2002, Kreyszig 2003, Chung 2004, Yang y col.
2005).
43
(2.9)
(2.10)
(2.11)
( 0 + 0 )
=
+ 0 + 0
(2.12)
= (1
)
(2.13)
(2.14)
44
1
1
=
(2.15)
1
1
(
+ )
(2.16)
= ( +
)
(
+ )
(2.17)
(2.18)
= +
(2.19)
= 0 (1
)
(2.20)
45
= ( )
(2.21)
=0
(2.22)
Por lo tanto: =
A se le llama velocidad de dilucin, manipulando su valor se puede controlar la
velocidad
especfica
de
crecimiento,
es
decir
el
metabolismo
del
(2.23)
= ( )
(2.24)
(2.25)
46
= ( )
(2.26)
=0
(2.27)
= ( )
(2.28)
(2.29)
(2.30)
=0
(2.31)
(2.32)
(2.33)
47
cultivo lote por su bajo costo en implementarlo y del cultivo continuo por su
alta productividad.
el sustrato de manera
()
= ( ) + ( ) =
(2.34)
(2.35)
48
= ( )
= ( )
(2.36)
(2.37)
(3.38)
(2.39)
Resolviendo la diferencial:
= 0
(2.40)
= 0 0
(2.41)
= ( ) + ( ) =
()
= ( ) + ( ) =
(2.42)
(2.43)
(2.44)
(2.45)
= ( )
(2.46)
49
0 0
==
( )
(2.47)
= ( ) + ( ) =
(2.48)
(2.49)
(2.50)
= 0 0
(2.51)
(2.52)
=
= 0 +
(2.53)
= ( )
= ( )
(2.54)
(2.55)
(2.56)
= + +
(2.58)
= +
(2.59)
(2.60)
(2.61)
(2.62)
51
52
53
Nomenclatura
Valor
HL/Ht
~0.7-0.8
Ht/Dt
Da/Dt
1/3
Db/Dt
0.1
W/Da
0.2
L/Da
0.25
E/W
54
1 =
1 2
1
+ 2 3 1
2 =
1 1 2
2
1
+ 2
3
3 = () = 1
(3.1)
(3.2)
(3.3)
(3.4)
0
exp()
(3.5)
55
PID
Referencia
Proceso
u
Medicin
Yref
Control de Flujo
= ()
= ()
56
Figura 3.5. Diagrama a bloques del controlador PID del motor de corriente
directa.
Figura 3.6. Diagrama a bloques del controlador PID del motor de corriente
directa.
Voltaje con
amplificacin (V)
4.32
0.33
-3.55
Con los datos obtenidos se pretende conocer que voltajes sern medidos con
cualquier sustancia de pH desconocido, una buena aproximacin a partir de la
58
191 2 1943
+7
10000
2500
(3.60)
60
61
2% de glucosa
0.1% de sulfato deamonio
0.1% de fosfato de potasio
0.05% de Sulfato de magnesio heptahidratado
Para la fermentacin la glucosa se sustituyo con sacarosa
62
Captulo 4 Resultados y
discusiones
4.1 Medicin de pH.
La figura 4.1 muestra la curva de interpolacin voltaje-pH que fue implementada
en un microcontrolador de 32 bits, de acuerdo al polinomio encontrado en la
Ecuacin 3.60. La figura 4.2 muestra al electrodo de pH utilizado.
63
64
65
66
60
% de saturacin
50
N=6 (2)
40
N=8 (2)
30
N=8 (1)
20
N=6 (1)
10
Revoluciones (6)
0
0
200
400
600
800
Revoluciones (8)
Tiempo (s)
25
25
14
4.5
4.5
5
Dimetro
exterior
(mm)
8
8
1.5
Flujo
(l/h)
1.612
0.502
0.021
68
69
70
71
Valor
0.5
0.5
0.216
0.37
0.4
0.226
gp/gx)
0.6
n (adim)
1
73
gp/gxh)
0.035
Valor
40
2
0.11
0.12
16
45
14
40
12
35
30
10
25
20
Sustrato (g/l)
15
10
0
0
10
15
20
25
Tiempo (h)
x Experimental
p con X logstico
x Monod
Sustrato
x logstico
s con X logstico
Producto
Valor
10
2
Volumen de operacin, 0 (l)
Tabla 4.7 Parmetros cinticos utilizados en la simulacindel cultivo
continuo simple etapa
Parmetros
Valor
0.5
0.5
0.216
0.37
0.4
0.226
gp/gx)
0.6
n (adim)
gp/gxh)
0.035
1
1
tr9
0.8
tr8
0.8
0.7
tr7
Flujo, F (l/h)
0.9
0.6
tr6
0.6
0.5
tr5
0.4
tr4
0.4
0.3
tr3
tr2
0.2
0.2
tr1
F
0
0.1
0
tr10
Tiempo (h)
Figura 4.14.Comportamiento de la velocidad especfica de crecimiento, en
funcin del flujo para un tiempo dado.
76
1.0
0.9
2.5
0.8
0.7
2.0
0.6
1.5
0.5
0.4
1.0
Flujo (l/h)
3.0
0.3
0.2
0.5
0.1
0.0
0.0
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
Velocidad especfica de crecimiento, (h-1)
Sustrato, S
Biomasa, x
Producto, P
0.5
Flujo, F
Valor
0.05
4.5
250
0.01
4.43
13.9
17
Valor
0.5
0.5
0.216
0.37
0.4
0.226
gp/gx)
1.4
n (adim)
gp/gxh)
78
0.3
0.25
Flujo (l/h)
0.2
0.15
0.1
0.05
0
0
10
12
14
16
18
Tiempo (h)
120
100
80
60
40
Simulado
20
Experimental
0
0
8
10
Tiempo (h)
12
14
16
18
9
8
Biomasa (g/l)
5
4
3
2
Simulado
Experimental
8
10
Tiempo (h)
12
14
16
18
A
Volumen (l)
17
16
0.25
15
0.1
0.05
14
0.025
0.01
13
10
15
20
25
Tiempo (h)
30
35
40
1.2
Flujo (l/h)
1.0
0.25
0.1
0.8
0.05
0.025
0.6
0.01
0.4
0.2
0.0
10
15
20
25
Tiempo (h)
30
35
40
80
Valor
0.5
0.5
0.216
0.37
0.4
0.226
gp/gx)
1.4
n (adim)
gp/gxh)
81
Valor
4.5
250
0.01
4.43
13.9
17
Volumen (l)
17
16
Flujo (l/h)
15
0.1
0.2
0.4
0.6
0.8
14
13
0
10
20
Tiempo (h)
30
40
82
Biomasa (g/l)
12
11
10
9
8
7
6
5
4
Flujo (l/h)
0.1
0.2
0.4
0.6
0.8
10
20
Tiempo (h)
30
40
200
Flujo (l/h)
175
0.1
0.2
0.4
0.6
0.8
150
125
100
75
50
0
10
20
Tiempo (h)
30
40
83
Captulo
sistema
5.
Validacin
del
se diseo para presentar este trabajo. Una imagen que muestra el lanzamiento de
la fermentacin, es la que se muestra en la figura 5.1, que muestra el biorreactor y
todos los aditamentos que son necesarios para su correcto funcionamiento.
Para llevar a cabo la fermentacin es necesario seguir pasos estrictos para que
esta sea un xito, lo primero que debe hacerse es esterilizar, tanto el frasco que
contendr al microorganismo, as como los puertos de sensores y puertos de
entrada y salida tanto de sustrato, como de sustancia cida o lcali, y toma de
muestra. Posterior a esto se procede a inocular o sembrar al microorganismo que
en este caso se trat de Saccharomyces cerevisiae, como se mencion al
principio, la primera etapa de la fermentacin es realizar un cultivo lote el cual tuvo
un proceso de duracin de 18 horas aproximadamente, para despus agregar
sustrato y el modo de operacin sea cultivo lote alimentado.
5.1.1 Medicin de pH
Las mediciones de pH se realizaron con un equipo
comercial demarca
pHmanu
2
1
00:00
00:37
01:20
02:09
02:45
03:12
03:50
04:21
05:04
05:48
06:31
07:10
08:10
09:00
12:51
15:20
20:13
21:51
22:44
23:25
Temperatura manu
Temperatura auto
28
27
00:00
00:46
01:34
02:24
03:07
03:40
04:21
05:08
05:58
06:48
07:53
08:51
12:51
16:20
21:26
22:12
23:12
26
40
140
35
120
30
100
25
80
20
60
15
40
10
5
20
0
0
10
15
20
Tiempo (h)
Abs 600 nm
25
Abs 600 nm
microorganismo.
30
pO2 (%)
89
1000
900
800
700
600
500
400
300
200
100
0
30
25
20
15
10
5
0
0
pH
10
15
20
Tiempo (h)
Temperatura (C)
25
Agitacin (rpm)
35
30
Agitacin (rpm)
90
Captulo 6. Conclusiones
6.1 Conclusiones
92
Captulo 7. Referencias
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