Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas

Gentica y Evolucin
2016

BIO226E
Gua de Ayudanta 2
Mapas fsicos, genomas y secuenciacin.
I.

Definir y/o explicar conceptos de gentica

a)
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h)
i)
j)
k)
l)
m)
n)
o)
p)
q)

II.

Alelo.
Locus.
Loci.
Fenotipo, genotipo.
Haplotipo.
Mapa fsico.
Mapa gentico.
Marcadores moleculares.
Secuencias LINE.
Secuencias SINE (Alu).
Minisatlites y microsatlites.
STR.
STS.
SNP.
EST.
Genes parlogos.
Genes ortlogos.

Revisar estrategias de mapeo del Genoma, estructura y evolucin

1.

Cules fueron los objetivos principales del proyecto genoma humano?

2.

Qu vectores de clonamiento se usaron para el mapeo del genoma? Indique el tamao de las
secuencias que pueden insertarse en cada uno.

3.

En qu consiste la anotacin de un genoma?

4.

Segn sus conocimientos sobre estructura del genoma, explique cmo vara la tasa de
recombinacin. Cmo es posible que en dos regiones de 2Mb, una tenga 3CM y la otra tenga
1 CM?

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5. Explique la siguiente figura, que muestra la tasa de recombinacin en relacin al tamao de los

Tasa de recombinacin (CM/Mb)

cromosomas:

Largo del cromosoma (Mb)

6.

Con respecto a la siguiente afirmacin: Se ha encontrado que existe sintenia entre los
cromosomas de ratn (Mus musculus) y los del Humano (Homo sapiens).
a)

Qu es la sintenia?

b)

Cmo puede explicarse la sintenia?

7.

Qu son los islotes CpG? En qu regin del gen se encuentran? Haga un esquema.

8.

Fundamente la siguiente afirmacin: El splicing alternativo permite que se genere ms de 1

transcrito por gen.

9.

Qu ocurre con la frecuencia de recombinacin en las cercanas del centrmero en

comparacin con los telmeros?

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10. El plasmidio pParc (figura adjunta) fue digerido en 3 tubos distintos con las siguientes
enzimas de restriccin:
A. BamHI
B. PstI
C. HincII y PstI
Realice un esquema de los fragmentos esperados, indicando el tamao aproximado en una
electroforesis en gel de agarosa, despus de una digestin total. Qu ocurrira con estos
fragmentos si la digestin es parcial en los casos A y B? Realice un esquema.

11. Para realizar el mapa fsico de un fragmento de DNA correspondiente al vector pUC226
(1000pb), usted realiza digestiones simples (1 enzima) y dobles (2 enzimas) con las enzimas
PstI, BamHI y XhoI y las resuelve en un gel de agarosa al 2,5%. En el mismo gel usted coloca
un estndar de tamao molecular. Luego de teirlo con GelRed y tomar una fotografa con luz
UV, usted encuentra las siguientes bandas:
ER
PstI
BamHI
XhoI
PstI - XhoI
XhoI BamHI
PstI - BamHI

Bandas (Tamao en pb)

135 515 350
1000
220 780
80 55 165 350
190 220 590
110 135 515 - 240

En base a los resultados obtenidos, grafique el resultado de la electroforesis resulta (incluya el

estndar, los controles y las digestiones). Adems construya el mapa fsico del fragmento.

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III.

Secuenciacin de DNA
12. Explique en qu consiste el mtodo de secuenciacin Sanger

13. Explique en qu consiste la pirosecuenciacin

14. A continuacin se muestran distintas direcciones URL, a las cuales deber acceder y buscar la
informacin que se le pide:
http://www.youtube.com/watch?v=JNqXgLKOzKU
https://www.youtube.com/watch?v=Zqr8_KiuzHU
http://www.youtube.com/watch?v=nlvyF8bFDwM&list=PL504C6C8D168E1CF4

De acuerdo a lo que usted vio, indique cules son las diferencias entre las plataformas y los
mtodos de secuenciacin empleados por las distintas tecnologas: 454 Roche, Ilumina, y SOLiD

15. Usted tiene una secuencia de DNA. Con ayuda de la simbologa de colores lea la secuencia
registrando en el espacio disponible.
(Imagen adjunta en web curso)