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No todos los genes se inactivan en el cromosoma X inactivado; los pocos que escapan a la
inactivacin de X abarcan los que tienen unhomlogo funcional en el cromosoma Y y algunos
genes en los quela dosis gnica no parece importante .
Una pequea minora de genes humanos ligados a X tiene homlogos funcionales en el
cromosoma Y. Debido a que estos genes no muestran diferencias de sexo en la dosis gnica,
cabra esperar que escaparan a la inactivacin de X. Todos los genes
PAR-1 estudiados escapan a la inactivacin de X. Los genes PAR2 son diferentes. Los dos genes
ms telomricos, IL9R y CXYorfl, escapan a la inactivacin, pero los dos genes proximales, SYBL1
y HSPRY3, los inactiva X. La discrepancia aparente se debe a un mecanismo compensador de
inactivacin de Y para estos genes: cuando se presentan en el cromosoma Y, SYBL1 y HSPRY3 se
metilan y no se expresan.
Adems de los genes en las regiones seudoautosmicas, tal vez una quinta parte del total de
genes en el cromosoma X elude la inactivacin (vase Carrel y cois., 1999). Los genes que la
eluden tienden a concentrarse en grupos, sobre todo en Xp, y muchos de ellos al parecer derivan
de adiciones autosmicas recientes a los cromosomas del sexo. Los genes que no tienen un
homlogo funcional en el cromosoma Y, pero que escapan a la inactivacin, suelen ser aquellos en
los que no son un problema las diferencias de dosis 2:1. Pueden ocurrir asimismo diferencias de
especie paralos patrones de expresin no seudoautosmicos. Por ejemplo, los genes no
seudoautosmicos humanos ZFX, RPS4X y UBE1escapan a la inactivacin, pero los homlogos
murinos Zfic, Rps4 y UbelX (que a diferencia del gen humano UBE1 tiene un homlogo en Y) se
someten a inactivacin de X. En genes ligados a X en los que la dosis gnica debe en apariencia
controlarse de modo estrecho, la inactivacin de X evolucion como una adaptacin para la
decadencia de un gen homlogo ligado a Y.