Operones

Un Opern se define como una unidad gentica funcional formada por un grupo o
complejo de genes capaces de ejercer una regulacin de su propia expresin por
medio de los sustratos con los que interaccionan las protenas codificadas por sus
genes. El operador permite la activacin o desactivacin del promotor a modo de
interruptor gnico por medio de su interaccin con un compuesto inductor. Y de
esta manera el promotor dar lugar a la expresin/represin del resto de los genes
estructurales.
Tipos de regulacin de los operones
Los operones inducibles como los reprimibles pueden estar bajo control positivo
negativo.
Se han investigado tanto los operones inducibles como los reprimibles,
representados por los complejos gnicos lac y trp, respectivamente.
Control positivo: La transcripcin no se produce hasta que la molcula reguladora
estimule la produccin de ARN.
Control negativo: La expresin gentica se produce hasta que es desconectada
por algn tipo de regulador.

Opern lactosa en presencia de lactosa

Si la bacteria crece en presencia de lactosa, la lactosa funciona como inductor
para el opern lac, la lactosa se une al represor y se separa del operador. Y en
presencia de lactosa y glucosa la transcripcin es baja tambin llamada basal.
En presencia de lactosa y ausencia de glucosa la transcripcin es alta llamada de
otra forma constitutiva.
El opern lac es un ejemplo de un opern inducible, que quiere decir que es aquel
en el cual la presencia de una sustancia especifica como en este caso la lactosa
induce la transcripcin de los genes estructurales.
Para que se exprese el opern lac deben darse dos condiciones en el medio: que
est presente la lactosa y que la concentracin intracelular de glucosa sea baja.
El AMPc acta unindose a una protena fijadora de AMPc denominada CAP que
es una protena activadora de catabolitos. Cuando la concentracin de este
complejo es alta existe poca glucosa, el CAP-AMPc se fija a un sitio especfico del

promotor lac, aumentando la afinidad de la regin promotora para la ARN

polimerasa, lo que estimula la transcripcin del opern.
La lactosa es el inductor del opern. Es capaz de unirse a la protena represora
Lac I y generar un cambio conformacional que disminuye su afinidad por la regin
operadora. De esta forma, la regin operadora queda libre, la RNA polimerasa
puede transcribir libremente los genes estructurales y la -galactosidasa puede
degradar la lactosa a glucosa ms galactosa.
La verdadera molcula inductora del opern lac es la alolactosa, un ismero de la
lactosa que se obtiene por una transglicosilacin llevada a cabo ocasionalmente
por la -galactosidasa.
El opern lactosa se compone de:
1.
2.
3.
4.

Inductor que aqu debe ser lactosa.

Gen regulador (codifica para la protena reguladora).
Elementos de control (promotor y operador).
Genes estructurales (-galactosidasa, Permeasa, Transacetilasa).

Un ejemplo claro de regulacin de la expresin gentica en procariotas, es el que

ocurre
en
el
opern
lac.
En E. Coli se requieren dos enzimas para la metabolizacin de la lactosa, la
lactosa permeasa, una enzima de membrana que permite el transporte de la
lactosa al interior celular y la -Galactosidasa, que cataliza la ruptura del enlace
-1,4 entre la galactosa y la glucosa.
La lactosa se degrada mediante rutas catablicas para la obtencin de energa,
pero si en el medio no hay lactosa estas dos enzimas no son necesarias.

Opern lactosa en ausencia de lactosa

Simplemente en la ausencia de lactosa no se va a llevar a cabo la transcripcin.
En ausencia de lactosa y glucosa, aunque el activador est presente no hay
transcripcin
En ausencia de inductor, la protena represora Lac I mantiene su elevada afinidad
por la regin operadora, impidiendo que la RNA polimerasa transcriba los genes
estructurales. De esta forma, el sistema permanece cerrado con el consecuente
ahorro energtico para la bacteria.
En ausencia de lactosa el represor impide el acceso de la ARN-Polimerasa al
promotor por eso es que no se lleva a cabo la transcripcin.

Opern lactosa en presencia de glucosa

Cuando la bacteria se encuentra creciendo en presencia de glucosa no se
expresan los genes estructurales del opern lac, porque el represor se encuentra
unido al sitio operador.
El opern lac tambin se encuentra bajo control positivo, es decir, cuando en el
medio hay glucosa, la bacteria metaboliza este monosacrido y cuando existe
menor concentracin de glucosa aumenta la concentracin de AMPc el cual tiene
influencia para la activacin del opern.

Activacin en el opern lac

Los activadores son factores de transcripcin que activan la transcripcin. Todos
los factores de transcripcin estn en dos formas:
Activa, unida a DNA
No activa, no unida al DNA.
La interconversin de ambas formas la lleva a cabo una molcula pequea
llamada efector.
El efector que hace que CAP se una DNA es el AMPc, la forma activa de CAP es
cuando est unido a AMPc. Si los niveles de glucosa son altos, los de AMPc son
bajos. Si los niveles de glucosa son bajos, los de AMPc son altos.

Si existe el sistema lactosa y altas concentraciones de glucosa la expresin

ser negativa.
Lactosa y bajas concentraciones de glucosa la expresin ser positiva.
Ausencias de lactosa y altas concentraciones de glucosa la expresin ser
negativa.
Ausencia de lactosa y bajas concentraciones de glucosa la expresin ser
negativa.

Opern arabinosa
El opern arabinosa o en su forma abreviada ara opern codifica para 3 enzimas
las cuales son requeridas para catalizar el metabolismo de la arabinosa. Las tres
enzimas necesarias son:

Arabinosa isomerasa (araA): Se encarga de convertir la arabinosa en

ribulosa.
Rubulokinasa (araB): Su funcin es fosforilizar la rubulosa
Ribulosa-5-fosfato-epimerasa (araD); Se encarga de convertir ribulosa-5fosfato en xylulosa-5-fosfatopara que pueda ser metabolizada por via de las
pentosas

El gen araC codifica la protena reguladora C la cual inhibe su propia sntesis

autoregulandose. Al unir la protena C con la arabinosa esto se convierte en un
activador.
Existen tres lugares en los cuales se lleva a cabo la unin para la protena C los
cuales son.

araO1: Es el lugar en donde la protena C se une para autoregularse ya que

de esta manera impide la transcripcin del gen araC.
Aral y araO2estos sitios actan de manera conjunta en la regularizacin del
promotor BAD, para activar la sntesis de las 3 enzimas.

El opern esa sensible a la glucosa, si la concentracin de glucosa es baja

habr ms CAP-Camp con lo que se activar la transcripcin; si la
concentracin de glucosa es alta pasar lo contrario.
En presencia de arabinosa de la protena C estimular la sntesis de los
productos codificados por los genes BAD; adems de que se uniera al dimero
que provoca un cambio conformacional que har que el brazo amino ter,minal
se repliegue y no se una a araO2.
En cambio en ausencia de arabinosa, se formar un bucle que impedir que
haya transcripcin de los genes BAD; la presencia del bucle impide que la ARN
polimerasa llegue a cualquiera de los promotores y adems impide la unin del
CAP-Camp.

Opern del triptfano

Cuando hay triptfano en el medio, la clula no necesita sintetizarlo, por lo tanto
el opern del triptfano est bloqueado, cuando no hay triptfano en el medio, la
clula ha de sintetizarlo, con lo que deja de estar reprimida la expresin de las
enzimas implicadas en el metabolismo del triptfano. La estructura de este opern
se representa a continuacin:
El represor del triptfano reprime tres operones. Uno de ellos, trp, es el de los
genes que codifican por las enzimas de sntesis del triptfano. Los otros dos son:
el del gen del propio represor trpR y el de genes implicados en la biosntesis de
aminocidos aromticos aroH. Cuando hay triptfano en el medio, ste se une con

el represor interaccionando con el operador, por lo que no hay expresin de genes

de sntesis de triptfano; cuando no hay triptfano presente en el medio el
represor no puede unirse al operador y se expresan los genes del opern.
El triptfano, se une a DNA cuando est presente el aminocido pero no en su
ausencia; sto es as por un cambio alostrico producido por la interaccin del
triptfano. El sitio de unin del triptfano con el represor est prximo a las
cabezas lectoras de DNA. Cuando el triptfano est unido al represor, las cabezas
lectoras se encuentran a la distancia y orientacin adecuada para interaccionar
con surcos mayores consecutivos, cosa que no ocurre en ausencia de triptfano.
Se puede concluir que:

En ausencia de triptfano en el medio: la RNA polimerasa va

transcribiendo. Los ribosomas reconocen el AUG y comienzan a sintetizar
el pptido hasta que llegan a lostripletes del triptfano en los que se
detienen, debido a que no hay triptofanil tRNA en el medio.Como los
ribosomas quedan detenidos en el codon del triptfano, la regin 1 del RNA
leader queda "bloqueada"y no puede hibridar con la regin 2 y se impide la
formacin del hbrido 1-2. Al sintetizarse la regin 3, la 2 hibrida con la 3,
con lo que no puede formarse el hbrido 3-4 y no se da la seal de
terminacin. La RNA polimerasa contina la transcripcin del opern.

Cuando hay triptfano en el medio, los ribosomas continuamente traducen

la regin correspondiente al pptido leader de 14 aminocidos. En este
caso los ribosomas quedan parados en la seal de terminacin de
traduccin (UGA) impidiendo la hibridacin de la regin 2 con la 3, con lo
que al transcribirse la regin 4 se forma el hbrido 3-4. Aparece la seal de
terminacin de transcripcin y no se transcribe el opern.

Regulacin de la expresin gnica.

De los 4.000 genes presentes en el genoma bacteriano o de los 100.000
estimados para el genoma humano, nicamente se expresa una fraccin en un
momento dado.
La regulacin de la expresin gnica constituye un aspecto fundamental en la
regulacin global del metabolismo celular, la direccin y mantenimiento de las
diferencias estructurales y funcionales existentes en clulas en desarrollo. Debido
al alto coste energtico de la sntesis proteica, la regulacin de la expresin gnica

es esencial para que la clula pueda hacer uso ptimo de la energa disponible.
Regular la concentracin de una protena celular implica mantener un equilibrio
preciso entre muchos factores.
Existen al menos seis puntos potenciales en los que la cantidad de protena
puede ser regulada:

Sntesis del transcrito primario de RNA.

Procesamiento post-transcripcional del mRNA.
Degradacin del mRNA.
Sntesis proteica (Traduccin).
Modificacin postraduccional de protenas.
Degradacin proteica.

Las bacterias son microorganismos con una capacidad extraordinaria de

adaptacin a diferentes condiciones ambientales. Para comprender la esencia de
esta capacidad es importante conocer sus bases genticas, es decir como est
organizada la informacin gentica, como realizan y regulan su expresin y que
mecanismos de variacin gnica poseen.
Toda la informacin gentica esencial para la vida de la bacteria est contenida en
una nica molcula de cido desoxirribonucleico (ADN) de doble cadena y circular,
cerrado por enlace covalente. Dicha molcula se denomina cromosoma
bacteriano. Muchas bacterias poseen adems ADN extracromosmico, tambin
circular y cerrado, denominado ADN plasmdico por estar contenido en los
plsmidos. stos, portan informacin gnica para muchas funciones que no son
esenciales para la clula en condiciones normales de crecimiento.
Las bacterias se pueden emplear para obtener energa distintas fuentes de
carbono, como la glucosa, lactosa, galactosa, maltosa, ramnosa y xilosa. Existen
enzimas capaces de introducir cada uno de estos azcares en la bacteria y
enzimas capaces de romperlos para obtener energa. Lgicamente, sera un
despilfarro energtico producir simultneamente todos los enzimas necesarios
para metabolizar los diferentes azcares mencionados. Por consiguiente, sera
mucho ms econmico para la clula producir solamente las enzimas necesarias
en cada momento, es decir, si en el medio en el que vive la bacteria la principal
fuente de carbono es la lactosa, solamente se expresaran los genes necesarios
para metabolizar la lactosa, mientras que los otros genes no se expresaran. Por
tanto, es esencial que exista un mecanismo de regulacin de la expresin gnica,
de manera que los genes se expresen cuando sea necesario.
La regulacin de la produccin de protenas (sntesis de protenas) considerando
el proceso en su conjunto, puede llevarse a cabo en tres niveles:

Replicacin
Transcripcin

Traduccin.

De los tres niveles de regulacin, uno de los mejor conocidos actualmente es la

regulacin durante la transcripcin. Aunque la regulacin de la transcripcin en
eucariontes es ms compleja que en bacterias, muchos de sus aspectos son
similares.
Un sistema bsico de regulacin gentica en las bacterias es el sistema opern.
Un opern comprende al promotor, a los genes estructurales y al operador.
Los genes estructurales del opern codifican un grupo de protenas
funcionalmente relacionadas y se transcriben como una sola molcula de ARNm.
La transcripcin es controlada por secuencias en el promotor y en el operador,
adyacentes a los genes estructurales y capaces de unir protenas especficas. El
promotor contiene el sitio de unin para la ARN polimerasa y puede contener un
sitio de unin para el complejo CAP-AMP cclico. El operador es el sitio de unin
para un represor, protena codificada por otro gen, el regulador, que puede estar
localizado a cierta distancia en el cromosoma bacteriano. El operador se puede
superponer con el promotor, con el primer gen estructural, o con ambos; cuando el
represor se une a la molcula de ADN en el sitio operador, la ARN polimerasa no
puede iniciar la transcripcin del ARNm. Cuando el represor no est presente, la
ARN polimerasa puede unirse al ADN y comenzar su movimiento a lo largo del
cromosoma, permitiendo que ocurra la transcripcin y la sntesis de protenas.
Los operones pueden ser inducibles, cuando la interaccin represor-ADN se
elimina al actuar sobre el represor protenas o molculas inductoras (ej. opern
lac), o reprimibles, cuando se requiere un correpresor para promover la unin
represor-ADN (ej. opern trp). Estos operones son de regulacin negativa, pero,
en otros casos, puede haber una regulacin positiva cuando actan protenas o
molculas activadoras.
Adems de la regulacin de la transcripcin, los elementos mviles
interfieren con la expresin gnica bacteriana. Una bacteria puede adquirir la
capacidad de sntesis de nuevos productos fundamentalmente por la adquisicin
por conjugacin con otra, de un nuevo plsmido o mediante transduccin por
integracin en su cromosoma de un virus. Las bacterias tambin pueden perder de
forma reversible o irreversible la capacidad de expresar algn gen por interrupcin
de este al integrarse en el cromosoma un plsmido (episoma) o una secuencia de
ADN capaz de moverse de un lugar del cromosoma a otro (transposn). Los
transposones simples, conocidos tambin como secuencias de insercin, llevan
slo los genes esenciales para la transposicin; los transposones compuestos
llevan (mueven) genes que codifican protenas adicionales. La integracin de
estos elementos removibles se da mediante cortes en sitios especficos del

cromosoma (recombinacin especfica de sitio) o al azar en el caso de los

transposones.

Regulacion gnica en eucariotas.

En eucariotas, el escenario es diferente. En primer lugar, el cromosoma
eucaritico difiere en muchos aspectos del cromosoma procaritico. Adems,
existe una separacin fsica entre la transcripcin que sucede en el ncleo y la
traduccin que tiene lugar en el citoplasma. Por ello, an siendo la transcripcin el
principal punto de regulacin, la expresin de los genes suele estar sometida
tambin a los distintos tipos de control postranscripcional, siendo muy importante
la regulacin del splicing, que puede a veces dar lugar a distintos ARNm y distintos
productos a partir de un transcrito (splicing alternativo).
La regulacin gnica en eucariotas es mucho ms compleja, especialmente en
organismos pluricelulares, con complicados programas de desarrollo. Un
organismo multicelular usualmente inicia su desarrollo en forma de huevo
fecundado, el cigoto. El cigoto se divide repetidamente produciendo muchas
clulas que se diferencian y cada tipo celular comienza a producir protenas
caractersticamente diferentes que lo distinguen de otros tipos de clulas. A su
vez, un mismo tipo celular puede producir variantes de las protenas que sintetiza
en distintas etapas del desarrollo del organismo. Sin embargo, toda la informacin
gentica originalmente presente en el cigoto tambin est presente en cada clula
diploide del organismo. Resulta claro que la diferenciacin de las clulas de un
organismo multicelular depende de la inactivacin de ciertos grupos de genes y de
la activacin de otros, es decir, de una regulacin de la expresin.
Una variedad de protenas reguladoras especficas desempean papeles centrales
en la regulacin de la expresin gnica. Para poder iniciar la transcripcin, la ARN
polimerasa requiere que un grupo de protenas, llamadas factores generales de
transcripcin, se ensamblen en la regin promotora del gen que se va a transcribir.
Esto permite la unin de la ARN polimerasa y la posterior transcripcin. En
eucariotas pluricelulares, un gen parece responder a la suma de muchas de estas
protenas reguladoras diferentes, algunas de las cuales tienden a activar el gen y
otras a desactivarlo. Adems, existen sitios de regulacin positiva a los que se
unen otras protenas distintas a los factores de transcripcin, que pueden estar a
centenares o miles de pares de bases de distancia de la secuencia promotora en
la que se une la ARN polimerasa, como las secuencias denominadas enhancers
(potenciadoras), por incrementar la transcripcin.
Muchas evidencias indican que el grado de condensacin y, en general, los
cambios en la estructura de la cromatina, desempean un papel principal en la
regulacin de la expresin gnica en las clulas eucariticas, ya que la
transcripcin no se puede dar en las zonas donde la cromatina est muy
condensada o no accesible a la formacin del complejo de transcripcin, pudiendo

distinguir, por lo tanto, entre una cromatina activa transcripcionalmente y una

cromatina inactiva.
Otro factor que est involucrado en la regulacin gnica es la metilacin de la
citosina, que ocurre despus de la replicacin. La metilacin diferencial de ciertos
genes en ambos sexos, que ocurre durante la gametognesis (inprinting),
desempea un papel en el desarrollo temprano del embrin.
Adems, el genoma eucaritico contiene un sorprendente reordenamiento o
arreglo, delecciones y adiciones, debido a elementos mviles. Por ejemplo, los
genes funcionales de anticuerpos se forman por reordenamiento de secuencias
gnicas que codifican para diferentes partes de la molcula del anticuerpo. Los
virus, tanto con genoma de ADN como los retrovirus con genoma de ARN, pueden
integrarse al cromosoma eucaritico (llamndose provirus). Las clulas eucariotas
tambin tienen transposones que, al insertarse en el genoma, activan o inactivan
genes, ya sea interrumpiendo las secuencias codificadoras o interfiriendo con la
regulacin. Muchos transposones eucariticos, los retrotransposones, difieren de
los procariotas en que primero se transcriben a RNA y luego nuevamente a ADN,
antes de insertarse en otro sitio del cromosoma. En ocasiones, las clulas
escapan a los factores que regulan el crecimiento celular normal. En
consecuencia, las clulas se multiplican sin control, amontonndose, invadiendo y
destruyendo otros tejidos. En estos casos se produce el cncer. Hay varias
evidencias que han relacionado el desarrollo del cncer con cambios en el
material gentico (delecciones, traslocaciones) a veces debido a
reordenamientos por retrotransposones o por insercin de retrovirus. Se han
localizado en clulas tumorales un grupo de genes conocidos como oncogenes,
muy similares a ciertos genes normales (protooncogenes) de las clulas
eucariticas en las cuales se encuentran. Sus productos son protenas
reguladoras, implicadas en el control del crecimiento celular o bien de la divisin
celular. De acuerdo con la hiptesis del oncogn, el cncer es causado cuando
algo funciona mal en la expresin de los protooncogenes celulares normales,
como resultado de mutaciones en los propios genes, cambios en la regulacin
gnica, o ambos. Cuando el protooncogen est alterado en alguno de esos
modos, se comporta como oncogn.

Remodelacin de cromatina en eucariotas

Son los cambios en la organizacin de la cromatina. Para la transcripcin de un

gen es necesario una estructura de la cromatina abierta (la ARN polimerasa y los
activadores deben unirse al ADN).
Por el efecto de la remodelacin de la cromatina son afectadas grandes regiones
gnicas y por lo tanto los dominios funcionales sern modificados reversiblemente
y va a afectar directamente al ADN o a las histonas que forman los nucleosomas.
La Epigentica se refiere a los cambios heredables en el ADN e histonas que no
implican alteraciones en la secuencia de nucletidos y modifican la estructura y
condensacin de la cromatina,por lo que afectan la expresin gnica y el fenotipo.
Las modificaciones epigenticas son metilacindel ADN y modificaciones de
histonas
Las modificaciones de la cromatina en mam feros ocurren en dos mbitos
distintos: metilacin del ADN y modificaciones de histonas.
En eucariotas el ADN es empaquetado como cromatina en el ncleo y
posteriormente es organizada en dos reas estructurales diferentes llamadas
heterocromatina silenciosa y eucromatina activa. La heterocromatina corresponde
a la mayor parte del material nuclear e incluye los telmeros y regiones
pericentromricas; estas regiones tienden a ser ricas en secuencias repetitivas y a
tener un bajo contenido gnico
Las diferentes modificaciones en el ADN (metilacin, M) y en las histonas (por
ejemplo, acetilacin, A) dirigen a cambios en la condensacin de la cromatina que
regulan el ingreso de la maquinaria transcripcional y por lo tanto la expresin
gnica. Aunque se desconocen cules cambios ocurren primero, es claro que las
diferentes marcas epigenticas interactan entre s.