UNIVERSIDAD PERUANA

CAYETANO HEREDIA
Facultad de Ciencias y Filosofa
Departamento Acadmico de Bioqumica, Biologa Molecular y Farmacologa
SILABO:

I. DATOS GENERALES
1.1.
1.2.
1.3.
1.4.
1.5.
1.6.
1.7.
1.8.
1.9.

Nombre de la asignatura
Cdigo
Ao
Semestre Acadmico
Crditos
Tipo de asignatura
Prerrequisitos
Semestre/Ao de estudios/Nivel

Horario
N de horas lectivas (total semestral)

1.10.

Duracin de la asignatura

1.11.

Profesor coordinador/
responsable
Profesores participantes

Profesor Invitado

BIOQUIMICA
2007
PRIMER SEMESTRE 2007
OBLIGATORIO
CDIGO Y NOMBRE DE LA ASIGNATURA)
5TO SEMESTRE
Teora: Lunes 10:00-12:00, Jueves 14:00-16:00,
Viernes 10:00-12:00
Teora: 85
Prctica/Tutorial: 6
Del: 15 de Marzo
Al: 6 de Julio
PhD. Patricia Herrera Velit
MSc. Jorge Arvalo Zelada
PhD. Daniel Clark Leza
MSc. Ana Colarossi Salinas
MSc. Carla Gallo Lpez-Aliaga
PhD. Patricia Herrera Velit
Lic. Giovanni Poletti Ferrara
MSc. Mirko Zimic Peralta
MSc. Miguel Albrech Ruiz

II. SUMILLA
En el curso de Bioqumica I se desarrollan los fundamentos de la Bioqumica y est dirigido a
los estudiantes de Ciencias del rea de Biologa, Qumica y Farmacia. En el curso se
desarrollan los tpicos de estructura y funcin de las protenas, catlisis enzimtica y
metabolismo general e intermedio. El curso Bioqumica I es obligatorio para quienes
posteriormente decidan profundizar sus conocimientos en Bioqumica y Biologa Molecular con
los cursos programados para tal fin por la Divisin de Bioqumica y Biologa Molecular.
Actualmente los cursos de Bioqumica I y Biologa Molecular de la Clula son necesarios para
aquellos alumnos que opten por estudios en Biologa y son recomendables para los alumnos de
Licenciatura en Farmacia y Bioqumica y Qumica.
Este curso es mayormente de tipo terico pero se han incorporado clases tutoriales a fin de
facilitar el aprendizaje de algunos tpicos por parte de los alumnos, y seminarios en donde se
vern problemas cientficos relacionados con los temas vistos durante cada captulo

III.

OBJETIVOS EDUCATIVOS COMPETENCIAS

1. El estudiante adquiera el conocimiento de los eventos moleculares del metabolismo
general e intermedio de los procesos celulares.

2. El estudiante tenga una visin cientfica de las funciones bioqumicas de los

organismos vivos.
3. Desarrollar en el estudiante la capacidad de autoformacin mediante la lectura crtica
y discusin de los temas tratados en clase, de textos y de artculos cientficos bajo la
asesora continua de los profesores del curso.
En concordancia con lo dispuesto por la Facultad de Ciencias y Filosofa, el presente curso
propone para el desarrollo de las competencias programadas, la ejecucin de los siguientes
ejes transversales de trabajo. Estos sern desarrollados en las diversas actividades y
captulos del curso:
1. Comprensin y redaccin de textos cientficos mediante la presentacin de
Seminarios
2. Capacidad de anlisis y sntesis del lenguaje escrito y numrico
3. Uso de herramientas informticas y estadsticas
4. Nociones bsicas de investigacin a travs de lo mostrado en clase y lo que se
discuta durante los Seminarios
5. Capacidad para la obtencin de informacin
6. Trabajo en equipo
7. Capacidad de aprender y actualizarse permanentemente

IV. CONTENIDOS
MODULO 1: Estructura y Funcion de Macromolculas Parte 1. Responsable: PhD. Patricia
Herrera V.
Objetivo: Establecer el concepto de Estructura y Funcin en las biomolculas,
principalmente de las protenas.
Se abordar los siguientes temas: Agua y Biolomculas. Aminocidos, estructura y
propiedades. Fuerzas que estabilizan las protenas. Enlace peptdico. Estructura
primaria.
Determinacin de la secuencia de aminocidos de una protena.
Estructura secundaria: alfa-helix, beta-plegada. Plot de Ramachandran. Estructura
supersecundaria y el concepto de dominios. Estructura terciaria y cuaternaria.
Separacin y caracterizacin de una protena. Protenas estructurales y globulares.
Funciones de las protenas, conceptos bsicos de enzimas
MODULO 2: Estructura y Funcin de Macromolculas Parte 2. Responsable: MSc. Ana
Colarossi S.
Objetivo: Establecer el concepto de Estructura y Funcin de las enzimas, carbohidratos y
lpidos
Los temas a tratar sern:
Biocatlisis: Perspectiva histrica. Enzimas: Clasificacin. Cofactores enzimticos.
Iones metlicos y coenzimas. Cintica de las reacciones enzimticas. Ecuacin de
Michaelis Menten. Efecto del pH y temperatura en la actividad enzimtica. Medida de la
actividad enzimtica. Actividad especfica. Tipos de Inhibicin enzimtica. Mecanismos
de las reacciones enzimticas. Uso de las enzimas como reactivos. Control de la
actividad enzimtica: gentico, alosterismo, cooperatividad y modificaciones covalentes.
Estructura y clasificacin de los carbohidratos. Principales mono, di y polisacridos en
tejidos animales y vegetales.

Clasificacin de los lpidos. Digestin, absorcin y transporte de los lpidos. Lpidos y

membranas biolgicas. Funcin de los lpidos en procesos de sealizacin celular.
Transporte a nivel de membrana.

MODULO 3: Bioenergtica y Metabolismo Intermedio Responsable: MSc. Ana Colarossi

Objetivo: Conocer las principales vas catablicas utilizadas por los seres vivos para obtener
energa a partir de la degradacin de las diferentes molculas energticas.
Contenido:

Bioenergtica: Primera y segunda ley de la termodinmica. Entalpa, energa libre,

entropa. Equilibrio qumico y concepto de espontaneidad. Reacciones de xidoreduccin. Enlaces fosfato de alta energa. Visin panormica del metabolismo.
Digestin, absorcin y transporte de los carbohidratos. Gliclisis y fermentacin.

Ciclo de Krebs y descarboxilacin del piruvato. Fosforilacin oxidativa. Regulacin.

Desacoplamiento de la Fosforilacin oxidativa. Va de las pentosas. Metabolismo de
carbohidratos en la clula vegetal.

Catabolismo de los lpidos. Obtencin de energa mediante la oxidacin de los cidos

grasos

MODULO 4: Metabolismo Intermedio 2da Parte. Responsable: MSc. Carla Gallo L-A
Objetivo: Conocer las vas metablicas de sntesis de carbohidratos, lpidos aminocidos y
nucletidos, componentes necesarios para la estructura y funcin celular.
Contenido:
Degradacin de aminocidos. Balance de nitrgeno, dieta y excrecin. Ciclo de la urea.
Principales vas de biosntesis de azucares, lpidos aminocidos cidos nucleicos y porfirinas
MODULO 5: Metabolismo Intermedio Integracin. Responsable: PhD. Patricia Herrera V.
Objetivo: Relacionar los conocimientos adquiridos durante el curso e integrar conceptos.
Contenido:
Integracin del metabolismo, interaccin entre rganos, seales de control. Transporte
de metabolitos entre rganos. Seales de activacin e inhibicin del metabolismo. El
balance calrico y proteico de la nutricin en humanos.
Tpicos especiales del metabolismo de los seres vivos como la generacin y funcin de
especies reactivas de oxgeno. Caractersticas particulares del metabolismo en
bacterias, organismos eucariticos unicelulares.

V.

EVALUACIN

El curso tendr varios criterios para la evaluacin de los alumnos:

1. Exmenes Parciales: Corresponde a los contenidos de cada mdulo o captulo
2. Pasos Cortos: Las fechas estarn programadas en los Syllabus. Sin embargo a criterio
del profesor, se podr tomar ms pasos cortos de lo programado los cuales podran no
ser anunciados con anticipacin. La hora de inicio del paso corto quedar a criterio del
profesor encargado.
El alumno que no asista al paso corto tendr como nota: 0 (no hay sustitutorios para
estas evaluaciones).
3. Presentacin de Seminario: La presentacin oral y la monografa sern calificadas para
cada grupo que presente un trabajo.
4. Exmenes de Seminario: Los temas tocados en los Seminarios sern evaluados junto con
el examen Terico Parcial pero consituirn una nota aparte
La nota final (NF) del curso se determinar de la siguiente manera:
NF = (Promedio de Pasos cortos x 0.2) + (Promedio de Exmenes x 0.6) +
(Promedio de Exmenes de Seminario x 0.1) + (Presentacin de Seminario x 0.05)
Exmenes Sustitutorios:
Se programar Exmenes Sustitutorios, los que se aplicarn al final del semestre segn el
calendario de evaluaciones que se anexa del presente Syllabus y forma parte de l. En este
curso, de acuerdo al creditaje del mismo, los alumnos podrn rendir hasta 03 Exmenes
Sustitutorios (segn lo determinado en el Manual de la Actividad Acadmicas). (50 % de

examenes totales programados). La nota obtenida en estas evaluaciones reemplaza a la nota

del examen materia de sustitucin cualquiera sea el resultado. Los alumnos que no rindan un
Examen debern rendir el Examen Sustitutorio correspondiente, de no hacerlo, tendr nota 0
en dicho examen.
Para rendir el examen sustitutorio deber abonar los derechos
correspondientes en la caja de la Universidad indicando el cdigo de la Facultad de Ciencias y
Filosofa, as como satisfacer los requisitos acadmicos y administrativos vigentes.
Criterios de Aprobacin:
Para ser aprobado en un curso se requiere obtener como mnimo la Nota Final 11. De acuerdo
con el articulo 50 del Manual de la Actividad Acadmica son notas aprobatorias parciales o
finales aquellas comprendidas entre 11 y 20.
Slo para efectos del clculo de la Nota Final del curso (NF), la fraccin 0.50 se redondear
a la unidad inmediata superior a favor del alumno. Este redondeo no es aplicable a los
promedios parciales o a calificaciones obtenidas en evaluaciones.
El alumno que desapruebe el 50% de los exmenes tericos programados deber rendir
necesariamente por lo menos un examen sustitutorio, an cuando su promedio de
exmenes parciales sea aprobatorio.
Se considerar como desaprobado en el curso a :
1. Los alumnos que obtengan un promedio inferior a 11
2. Los alumnos que luego de dar los exmenes sustitutorios tengan tres o ms exmenes
tericos parciales DESAPROBADOS
El alumno puede solicitar retiro del curso hasta la fecha determinada al efecto por el Consejo de
Facultad, o cuando conozca la nota de su tercer examen parcial (aproximadamente el Lunes 4 de
Junio), lo que ocurra primero.

VI.

REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

Libro de Texto:

1. Nelson D.L., Cox MM. 2005. Lehninger. Principles of Biochemistry. Worth

Publishers (Fourth Edition)

Libros de Consulta:

1. Stryer L. 2002. Biochemistry. Ed. W.H. Freeman. 5th Edition

2. Watson JD, Hopkins NH, Roberts JW, Steitz JA & Weiner AM. 2003. Molecular
Biology of the gene. 5th Edition. Benjamin/Cummings, Menlo Park CA, USA
3. Bioqumica de Harper. Eds. RK Murray, PA Mayers, DK Gramer & VW Rodwell. 2004.
12 edicin. Manual Moderno
4. Voet D & Voet J. 2006. Bioqumica. 3ra Edicin. Editorial Mdica Panamericana.
5. Alberts B y col. Molecular Biology of the Cell. 4 d edition. Garland Publishing Inc.
2002
6. Lodish, H, Berk A., Zipursky SL, Matsudaira P, Baltimore D, Darnell J. 2004.
Molecular Cell Biology. WH Freeman & Co. 5th Edition
7. Osgood M & Ocorr K. 2000. Study guide and solutions Manual. The absolute,
ultimate guide to Lehninger Principles of Biochemistry. Worth Publishers
8. Mathews, C.K. & van Holde, .K. E. 2000. Bioqumica. B. Cummings Publishing Co,
Inc.

Enlaces de Internet
1.
2.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov
http://www.worthpublishers.com/lehninger

3.
4.

http://www.scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop
http://www.expasy.ch/prosite

ANEXO 1
DOCENTES PARTICIPANTES
Grado
Ttulo
MSc.
PhD
MSc
MSc
PhD
Lic
MSc

Nombre
Jorge
Daniel
Ana Cecilia
Carla
Patricia
Giovanni
Mirko

Apellidos
Arvalo Zelada
Clark Leza
Colarossi Salinas
Gallo Lpez-Aliaga
Herrera Velit
Poletti Ferrara
Zimic Peralta

Anexo 2 Programacin de Actividades

CURSO BIOQUIMICA I
DIA

HORA

TEMA / ACTIVIDAD

Prof. Encargado

MODULO 1. ESTRUCTURA Y FUNCION DE MACROMOLECULAS 1A PARTE

1. Jue 15/03

2-4 pm

Biomolculas, Agua
Lehninger Cap 1 (pp. 13-29), Cap 2 (pp. 47-70)

P. Herrera

2. Vie 16/03

10-12m

Protenas: Aminocidos. Estructura primaria.

Captulo 3 (pp. 75-88; 96-106)

P. Herrera

3. Lu 19/03

10-12m

4. Ju 22/03

2-4 pm

5. Vi 23/03

10-12m

Lu 26/03

Estructura secundaria, supersecundaria, terciaria y

cuaternaria. Captulo 4 (pp. 116-134)
Plegamiento y desnaturalizacin. Estudio de protenas:
secuencia-miento, electroforesis. Captulo (pp 89-95) Cap 4
(pp. 147-151) Paso Corto
Protenas estructurales: colgeno, queratinas, elastina y
fibroina
Captulo 7 Voet (pp. 156-165)

P. Herrera

10-12m

Tutorial captulo 1 Caractersticas de aa. y pptidos

P. Herrera/Asistentes

6. Ju 29/03

2-4 pm

Funcin proteica: Protenas transportadoras de oxgeno,

motores moleculares. Captulo 5 (pp. 148-164; 182-185)

A. Colarossi

Vi 30/03

10-12m

Seminarios 1-2 Paso Corto

P. Herrera/M. Zimic

Lu 02/04

10-12m

PRIMER EXAMEN TEORICO + SEMINARIOS

M. Zimic

P. Herrera

P. Herrera

MODULO 2 ESTRUCTURA DE MACROMOLECULAS 2DA PARTE

1. Lun 09/04

10-12m

Enzimas, consideraciones generales, clasificacin, cofactores.

Biocatlisis: Cintica; Michaelis-Menten, efecto de pH y

A. Colarossi

temperatura. (Captulo 6 pp. 193-209)

MODULO 2 ESTRUCTURA DE - 2DA PARTE- CONT.

Biocatlisis: Inhibidores.
Captulo 6 (pp. 209-213)
Biocatlisis:. Mecanismos de reacciones enzimticas,
enzimas alostricas. Captulo 6 (pp. 225-232) Paso Corto
Carbohidratos: Estructura. Mono-, di- y polisacridos.
Proteoglicanos, glicolpidos, glicoprot. Cap.7 (pp.239-264)
Nucletidos y Acidos nucleicos. Estructura y Qumica.
Captulo 8 (pp. 273-291)

A. Colarossi

2. Jue 12/04

2-4 pm

3. Vie 13/04

10-12m

4. Lun 16/04

10-12m

5. Jue 19/04

2-4 pm

6. Vie 20/04

10-12m

Tutorial captulo 2 Problemas de cintica enzimtica

A.Colarosssi/Asist.

7. Lu 23/04

10-12m

Lpidos: Estructura, Lpidos de almacenamiento, estructurales

y de seal. Captulo 10 (pp. 343-363) Paso Corto

C. Gallo

Jue 26/04

2-4 pm

Membranas: Composicin y transporte Cap. 11 (pp. 369-395)

C. Gallo

Vie 27/04

10-12m

Seminarios 3-4

A. Colarossi+C. Gallo

Lun 30/04

10-12m

SEGUNDO EXAMEN TEORICO + SEMINARIO

AC/CG

A. Colarossi
A. Colarossi
J. Arvalo

MODULO 3: BIOENERGETICA Y METABOLISMO INTERMEDIO 1 PARTE

Bioenergtica: Energa libre y Keq', potencial redox. Enlaces
Pi de alta energa. Captulo 13 (pp. 489-503)

1. Jue 03/05

2-4 pm

M. Zimic

2. Vie 04/05

10-12m

3. Lu 07/05

10-12m

4. Jue 10/05

2-4 pm

5. Vie 11/05

10-12m

6. Lu 14/05

10-12m

7. Ju 17/05

2-4 pm

Vie 18/05

10-12m

Seminarios 5-6

M. Zimic/A. Colarossi

Lun 21/05

10-12

Tutorial captulo 3 Problemas de Bioenergtica

M. Zimic/Asistentes

Lun 28/05

10-12m

TERCER EXAMEN TEORICO + SEMINARIOS

A. Colarossi/C. Gallo

Carbohidratos: Gliclisis y fermentacin: regulacin

Captulo14 (pp. 522-539)
Digestin, movilizacin y transporte de Acidos grasos;
Oxidacin de c. grasos. Cap.17(pp 632-643) Paso Corto

A. Colarossi
C. Gallo

Gluconeognesis, va de pentosas, metb. de glucgeno

Captulo 14 (pp. 543-554); Captulo 15 (pp 562-575)
Ciclo de acido ctrico y Glioxalato Cap 15 (pp 601-624)
Oxidacin de cidos; grasos impares, oxidacin peroxisomal,
cuerpos cetnicos. Captulo 17 (pp. 646-652) Paso Corto
Fosforilacin oxidativa y transporte de electrones
Captulo 19 (pp 691-718)

A. Colarossi
A. Colarossi
C.Gallo
A. Colarossi

MODULO 4: METABOLISMO INTERMEDIO 2DA PARTE

1. Jue 24/05

2-4 pm

2. Vie 25/05

10-12m

3. Ju 31/05

2-4 pm

4. Vi 01/06

10-12m

5. Lu 04/06

10-12m

6. Ju 07/06

2-4 pm

Aminocidos: Balance de N2, dieta y excrecin de N2. Ciclo de

urea, Degradacin de a.a. Cap. 18 (pp. 657-684)
Biosntesis de carbohidratos en plantas
Captulo 20 (pp. 751-771)
Lpidos: Sntesis de c. grasos y triglicridos. Captulo 21 (pp.
787-802) Paso Corto
Lpidos: Sntesis fosfolpidos y colesterol. Captulo (pp. 804828)
Aminocidos: Ciclo del nitrgeno, sntesis de aminocidos
Captulo 22 (pp. 834-854)
Sntesis de porfirinas, metabolismo de nucletidos
Captulo 22 (pp. 862-878) Paso Corto

G. Poletti
D. Clark
C. Gallo
C. Gallo
G. Poletti
J. Arvalo

MODULO 4: METABOLISMO INT. 2DA PARTE- CONT.

Vier 08/06

10-12m

Seminarios 7-8

P. Herrera/ D. Clark

Lun 11/06

10-12m

CUARTO EXAMEN TEORICO + SEMINARIO

PH/DC

MODULO 5: METABOLISMO INTERMEDIO: IINTEGRACION.

1. Jue 14/06

2-4 pm

Integracin del metabolismo, regulacin hormonal en

mamferos. Captulo 23 pp 881-909

A. Colarossi

2. Vi 15/06

10-12m

Nutricin y obesidad Captulo 23 pp. 910-916

A. Colarossi

3. Lun 18/06

10-12m

Metabolismo en bacterias Paso Corto

P. Herrera

4. Ju 21/06

2-4 pm

Metabolismo en eucariotes unicelulares

M. Albrecht

5. Vi 22/06

10-12m

Metabolismo en plantas-Respuesta a Herbvoros

D. Clark

6. Lu 25/06

10-12m

Especies reactivas de oxgeno y nitrgeno. Paso Corto

J. Arvalo

Ju 28/06

2-4 pm

Seminario 9-11

J. Arvalo

Lun 02/07

10-12m

Vie 06/07

10-12m

Vier 13 Jul 10-12 md

I EXAMEN
II EXAMEN
III EXAMEN
IV EXAMEN
V EXAMEN
EXAMENES
SUSTITUTORIOS

C. Gallo/P. Herrera

Seminarios 12-14

QUINTO EXAMEN TEORICO + SEMINARIO

Encuesta de Facultad de Ciencias y Filosofa

Exmenes Sustitutorios

JA/PH
PHV

CRONOGRAMA DE EVALUACIONES
PROFESOR(ES)
DIA
ENCARGADO(S)
P. Herrera
Lunes 02 Abril

10-12m

A. Colarossi + C. Gallo
A. Colarossi + C. Gallo
C. Gallo + G. Poletti
A. Colarossi + P. Herrera

Lunes 30 Abril
Lunes 28 Mayo
Lunes 11 Junio
Viernes 06 de Julio

10-12m
10-12m
10-12m
10-12m

P. Herrera

Viernes 13 de Julio

10-12m

Horas de Clases Tericas:

Horas de Seminario
Horas de Tutorial
Horas de Examen (no sustitutorios)
Total horas del curso

HORA

64
14
6
7.5
91.5