QBQ 2451 Introduo Bioqumica 2013

Maria Teresa Machini

Laboratrio de Qumica de Peptdeos
Bloco 8 Superior sala 0854
mtmachini@iq.usp.br

resumo da aula anterior:

Estrutura e funo de proteinas

IDENTIFICAO
1) Massa molar
2) Sequncia de aminocidos
Separao das
Purificao de
3) Determinao do aminocido N-terminal
proteinas
uma delas
(no. de cadeias polipeptdicas)
4) Desenovelamento (pontes dissulfeto)
5) Quebra em pedaos ou fragmentos peptdicos
6) Sequenciamento de cada fragmento peptdico obtido
7) Combinao das informaes para obteno da sequncia de aminocidos (est. 1.)
8) Localizao das pontes dissulfeto
8) Alinhamento da sequncia de aminocidos com as de protenas conhecidas

Comparao entre sequncias: Homologia

1) identificao da classe proteica/funo/proteina
2) evoluo e velocidade evolutiva das protenas
3) criao das rvores genticas:
proximidade e distanciamento entre os organismos vivos
4) estudar recombinao gentica

Enovelamento e estabilidade de protenas

Seq. aminocidos estruturas 2., 3. e 4. Enovelamento funo
Funo exibida quando a protena est na estrutura nativa
(conformao de menor energia)
Proteina pode se desnaturar: perder estrutura nativa (reversvel ou no)
Enovelamento assistido por outras chaperonas (Hsp70 e chaperoninas)

Funes de protenas
Transporte hemoglobina, p. ex.
Estruturao seda e colgeno
Movimentao msculos e flagelos
Catlise de reaes qumicas enzimas
Sinalizao hormnios, p. ex.
Defesa anticorpos

Tipos de enzima
Especificidade
Catlise
pH timo

Desestabiliza S

Estabiliza S

interaes compensam
aumento de G

M. Teresa Machini IQ/USP

Hemoglobina: transporte de O2
cooperatividade e alosteria

Protoporfirina IX
4 anis pirrlicos
pontes de metenos

Heme
6 ligaes de coordenao

Heme com ligantes

Aminocidos
da protena

Heme
com ligantes

Hemoglobina
Proteina com subunidades
estruturalmente similares
mioglobina

Mioglobina

Hemoglobina

(120 dias)
hemcias

proteina globular
Mr 64500
tetrmero com 4 grupos heme
estrutura 4. /interao dominante intercadeias

Sangue fluindo nos vasos:

O2 sendo transportado

Importncia da sequncia primria de Hb: Hb deficiente em funo

1945: doena molecular Hb mutante (L. Pauling):

ANEMIA FALCIFORME
Depois: HbA 2 unidades mais negativa que HbS

(60 dias)

1956: fingerprinting peptides (V.Ingram)

digesto trptica de ambas: diferena em
sequenciamento: Glu 6 Val 6
mutao: HbS desoxigenada
agrega em filamentos:
deformao do eritrcito

- Baixa [O2]/ Rigidez do eritrcito/ Fluxo sanguneo

- Fragilidade celular/ Danos em tecidos/Dor

Hb liga O2 cooperativamente nos pulmes, libera nos tecidos

estado T baixa afinidd.

Hb uma protena alostrica

Estado R alta afinidd.

Alosteria (modulao): interconverso de formas ou conformaes causada pelo

ligante
Ligantes de protenas alostricas: moduladores: ativadores
inibidores
Modelos de mecanismos para ligao cooperativa de ligantes
(interconverso de formas de cooperatividade/alosteria)

modelo concertado (1965)

modelo sequencial (1966)

M. Teresa Machini IQ/USP

Bibliografia
As informaes esto disponveis nos captulos sobre
proteinas, enzimas e carboidratos
de diferentes edies no perodo 2005-2013
do livro
Princpios de Bioqumica de Lehninger - D.L. Nelson & M.M. Cox

QBQ 2451 Introduo Bioqumica 2013

Maria Teresa Machini
Laboratrio de Qumica de Peptdeos
Bloco 8 Superior sala 0854
mtmachini@iq.usp.br

- Monossacardeos: aldoses e cetoses

- Equilbrio entre forma cclica e forma aberta, configurao do carbono anomrico
- Dissacardeos, polissacardeos (glicognio, amido, celulose)

Grnulos de glicognio

Fibras de celulose

Staphylococcus
Aureus
parede celular contm
peptidoglicano

Monossacardeos com 3 carbonos

Aldohexoses

Isomeria

o composto
de referncia

Reao de aldedo ou cetona com lcool

D-glucose em gua: ciclizao

D-glucose em gua: estrutura cclica devido mutarrotao

Menos impedida estericamente

Favorecida e mais estvel

Monossacardeos dissacardeos polmeros

Formao de ligaes glicosdicas

Tipos: exemplos
a seguir

Exemplo de polissacardeos

Ligaes de hidrognio em azul

Fibras de celulose

Grnulos de amido em cloroplasto

Exemplos de polissacardeos

Polmero linear de D-glucose

Polmero ramificado
de D-Glucose

Estrutura compacta de um segmento de amilose

Exemplos de dissacardeos presentes em polissacardeos

M. Teresa Machini IQ/USP

Bibliografia
As informaes podem ser encontradas nas diferentes
edies do perodo 2005-2013
do livro
Princpios de Bioqumica de Lehninger - D.L. Nelson & M.M. Cox.