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GRADO: BIOLOGA
AO ACADMICO:
CURSO: SEGUNDO
1 SEMESTRE
2 SEMESTRE
TIPO DE ASIGNATURA:
BSICA
OBLIGATORIA
OPTATIVA
NMERO DE CRDITOS (ECTS): 9
IDIOMA EN QUE IMPARTE LA ASIGNATURA: CASTELLANO
TUTORAS: PENDIENTE DE HORARIO, SE ACORDAR CON LOS ALUMNOS
MODALIDAD DE ENSEANZA: PRESENCIAL
PRERREQUISITOS: Tener conocimientos de Biologa Celular y Tisular, Bioqumica, Gentica,
Microbiologa
1- DESCRIPCIN DE LA ASIGNATURA
La Biologa Molecular es la Ciencia que se ocupa del estudio de las bases moleculares
de la vida; es decir, relaciona las estructuras de las biomolculas con las funciones
especficas que desempean en la clula y en el organismo. Por lo tanto su objetivo
fundamental es la comprensin, a nivel molecular, de todos aquellos procesos celulares,
que contribuyen a que la informacin contenida en los genes se traduzca en una funcin
celular, que va a determinar el funcionamiento y las caractersticas de los seres vivos.
Esto convierte esta Ciencia en bsica para entender el fenmeno de la vida y su
evolucin.
En la asignatura de Biologa Molecular los alumnos realizan en el laboratorio las tcnicas
bsicas de biologa molecular que permiten aislar macromolculas a partir de clulas y
estudiarlas en forma pura, tanto in vitro, como in vivo para entender el comportamiento
biolgico de las mismas y explicar las funciones biolgicas en el ser vivo. As como la
utilizacin de la bioinformtica para disear in silico los futuros experimentos in vitro y/o
in vivo o identificar y analizar genes y protenas. La asignatura tambin da al alumno los
principios tericos en los que se basan estos mtodos, ya que los mtodos en biologa
molecular se desarrollaron a partir de la comprensin de las propiedades de las
macromolculas biolgicas en s y dependen de ella.
Por lo tanto esta asignatura proporciona a los alumnos una formacin bsica y una
experiencia terico-prctica de los procesos y mecanismos biolgicos a nivel molecular,
lo que le da a la asignatura un enfoque multidisciplinar e integrador de reas como la
fsica, qumica, bioqumica, biologa celular, gentica y fisiologa, materias que los
alumnos deben haber cursado con anterioridad. Adems forma al alumno con un
conocimiento de las estructuras y procesos moleculares de los seres vivos, y con la
capacidad de utilizar las herramientas experimentales y computacionales actuales para
su estudio, esto da al alumno la base necesaria para cursar futuras asignaturas del
Grado en Biologa como Biotecnologa, Mejora Gentica, Ingeniera Bioqumica, etc.
Debido a los temas que trata, la Biologa Molecular es necesaria para los Graduados en
Biologa que aspiren a realizar una carrera cientfica o desarrollar su actividad profesional
en las ramas sanitaria, agraria, de control de calidad, ambiental, industrial, educativa, etc.
2- OBJETIVOS Y COMPETENCIAS
Con la asignatura de Biologa Molecular se pretende que el alumno adquiera las siguientes
competencias:
Competencias transversales:
Capacidad de anlisis y de sntesis con visin crtica
Capacidad de interrelacionar los conceptos aprendidos con los de otras asignaturas
Capacidad de resolucin de problemas tanto tcnicos como interpersonales
Comprender la necesidad de un aprendizaje permanente y global
Capacidad de gestin de la informacin
Aumentar su potencial y responsabilidad para el trabajo, tanto en equipo, como de
forma individual
Capacidad para tomar decisiones
Mejora de su capacidad de comunicacin: saber escuchar y transmitir sus opiniones
de forma clara y respetuosa
Tener unos conocimientos de ingls.
Competencias especficas:
Conceptuales (Saber):
Conocer el concepto de Biologa Molecular y su relacin con otras ciencias
Recordar la base terica de los procesos moleculares que rigen el funcionamiento de
los seres vivos
Aplicar los conocimientos de la naturaleza, transmisin, variacin, expresin y
regulacin de la informacin gentica a las tcnicas de experimentacin
Entender el fundamento de las tcnicas empleadas en un laboratorio de Biologa
Molecular
Conocer las aproximaciones experimentales ms actuales para el estudio de los
mecanismos moleculares y su implicacin en el control de respuestas.
Adquirir capacidad de acceder y hacer bsquedas en bases de datos pblicas con
informacin cientfica y tcnica.
Procedimentales (Saber hacer):
Manejar algunas de las tcnicas bsicas utilizadas en un laboratorio de Biologa
Molecular
Evaluar la validez de los resultados obtenidos con estas tcnicas
Elegir la tcnica adecuada para resolver los problemas que se puedan plantear en
los distintos mbitos del ejercicio de la profesin
Actitudinales:
Llegar con puntualidad a las clases
Respetar a los compaeros en los turnos de trabajo y ayudarles
Preocuparse por mantener el orden y la limpieza durante la realizacin de las prcticas
Preocuparse por recoger el material de laboratorio una vez finalizadas las prcticas
Valorar y aceptar las limitaciones que supone trabajar en condiciones de esterilidad
Conocer y aprender a respetar los aparatos que van a utilizar durante el desarrollo de las
prcticas
Aprender a respetar el medio ambiente y a los animales
Aprender a valorar el trabajo propio y el de los dems
Capacidad de motivacin por la calidad
La colaboracin y el trabajo en equipo.
La destreza en el trabajo habitual en un laboratorio (preparacin de medios, manejo de
aparatos, utilizacin de programas informticos bsicos, etc).
La capacidad de elaborar y mantener un cuaderno de laboratorio claro y completo.
Editado por el Departamento de Publicaciones del IE.
Versin original,
. ltima revisin,
.
3-
CONTENIDOS
Objetivo
Qu es y para que
se emplea las
tcnicas
bioinformtica
Diseo experimental
in silico
Tcnicas de
Aislar RNA de
aislamiento de
cultivos celulares
cidos nucleicos
Conocer el
fundamento de la
Hacer una RT-PCR.
transcripcin
Amplificar por PCR
inversa y la
DNA, cDNA.
amplificacin de
cidos nucleicos.
INTRODUCCIN
Reconocer la
dinmica del
pensamiento
cientfico
Adquirir capacidad
de acceder y hacer
bsquedas en bases
de datos pblicas
con informacin
cientfica y tcnica.
BIOINFORMTICA
Reconocer distintos
niveles de
organizacin en el
sistema vivo
Un.
Aislamiento
de cidos
nucleicos
Concepto de la
Biologa Molecular
Saber hacer
Amplificacin
de cidos
nucleicos
Saber
Ninguna
3 y 4. Lecture-IntroduccIn a la Bioinformtica
Da 2
3 hs
Aula
Da 2
3 hs
Aula
Da 3
3 hs
Aula
Da 4
3 hs
Aula
Da 5
3 hs
Aula
Da 7
Lab
1,5 hs
Tcnicas de
extraccin de
cidos nucleicos
2hs
Da 8
Fundamentos
de la
amplificacin de
cidos nucleicos
3hs
Tcnicas de
hibridacin I
Lectura Previa
y trabajo de
alumno
Da 1
3 hs
Aula
El concepto de
hibridacin de
cidos nucleicos Una hibridacin de
cidos nucleicos
Los factores que (Southern blot)
influyen en la
hibridacin de
cidos nucleicos
CyU
Lab
3 hs
Apuntes y
guiones
porporcionados
por el profesor
Da 9
Lab
3 hs
Da 10
Lab
4,5 hs
Tcnicas de
hibridacin I
4h
Las principales
tcnicas de
marcaje de
sondas
Una interpretacin
correcta de los
resultados
Electroforesis de
El fundamento de DNA en gel de
la electroforesis agarosa
de DNA y RNA
Purificar DNA a
partir de agarosa
Los diferentes
tipos de
Analizar resultados
electroforesis
de electroforesis de
Las aplicaciones DNA: cuantificar la
concentracin de
de la
DNA y el tamao del
electroforesis
mismo
El concepto de
DNA
recombinante
Clonar un inserto de
Las herramientas
DNA en un vector
de clonacin
Los vectores de
clonacin
Los organismos
de clonacin
Los procesos de
transformacin
Transformacin por
electroporacin y
choque trmico
Analizar los
resultados de la
Las aplicaciones
transformacin
de la
transformacin
Disear una PCR y
llevarla a cabo
La PCR y sus
variantes
Tcnicas de
hibridacin II
Marcaje de sondas
Los tipos de
marcadores
Tcnicas electroforticas I
Las principales
tcnicas de
hibridacin de
cidos nucleicos
Una hibridacin de
cidos nucleicos
(Southern blot)
El concepto de
rigor de la
hibridacin
Da 11
Lab
4,5 hs
Tcnicas de
hibridacin II
4h
Da 12
Lab
3 hs
Analizar los
resultados
1h
Da 13
Lab
3 hs
Estudios
Electroforticos
3h
Da 14
Lab
3 hs
Tecnologa del
DNA I
4h
Da 15
Lab
1,5 hs
Tecnologa del
DNA II
1h
Da 16
Lab
4,5 hs
Tecnologa del
DNA III
4h
23. Sesin
Hibridacin. O/N
25. Sesin
Anlisis de los resultados
27. Sesin.
Electroforesis para cuantificar.
Dejar el inserto a -20
29. Sesin.
Clonacin. Poner a crecer clulas O/N
31. Sesin.
Anlisis de transformacin
32. Sesin. PCR
PCR in situ
33. Sesin
Electroforesis de la PCR
Crecimiento en medio lquido
Extraccin de
cidos nucleicos.
Secuenciacin
Las aplicaciones
del DNA
recombinante
37. Sesin
Electroforesis de la digestin
Tecnologa del DNA IV
39. Sesin.
Anlisis del cuaderno de laboratorio
Tecnologa de
protenas
Extraccin y
cuantificacin de
Los fundamentos de
protenas
distintos mtodos de
extraccin y
cuantificacin.
Cultivos celulares.
Transfeccin
Extraer protenas y
cuantificar su
concentracin.
Extraccin de
cidos
nucleicos.
Secuenciacin
Da 18
Lab
3 hs
38. Sesin.
Anlisis de los resultados de las reacciones de
corte
Transfectar clulas
Tcnicas de
eucariotas, las
cultivos celulares tcnicas que hay.
Estimular clulas y
Concepto de
saber cuando y para
transfeccin
que se utiliza un
celular.
determinado
mitogeno..
Da 17
Lab
3 hs
35. Sesin
Gel de electroforesis del plsmido recombinante
36. Sesin. Reacciones de corte
Digestin O/N
Disear las
El fundamento de
digestiones de DNA
la reacciones de
para hacer un mapa
corte del DNA
de restriccin
Qu son y cmo
se hacen las
genotecas
Da 19
Lab
3 hs
Tecnologa del
DNA IV
Da 20
Lab
3 hs
Da 21
Lab
3 hs
Cultivos
celulares.
Tcnicas de
transfeccin.
2hs
Da 22
Lab
4,5hs
Tcnicas de
extraccin y
cuantificacin de
protenas. 3hs
Proliferacin
celular
Anlisis de
resultados
Mtodos de
determinacin de la
proliferacin celular
Analizar, interpretar
y valorar los
resultados
Tcnicas
electroforticas II
Tipos de
transferencia de
protenas a soportes
de papel
Transferencia a
soporte de
nitrocelulosa
Electroforesis de
protenas en SDSPAGE. Otros tipos
de eletroforesis para
protenas.
Proliferacin celular
El fundamento de
la electroforesis
de protenas.
Tipos de
electroforesis.
Da 23
Lab
4,5hs
Tcnicas de
electroforesis de
protenas.
Transferencias.
3hs
Da 24
Lab
Western blot y
ELISA. 3 hs
4,5hs
Da 25
Lab
Proliferacin
celular. 1 h
4,5hs
56. Sesin. Anlisis de los resultados
Da 26
Aula
1,5 hs
Da 27
Aula
3 hs
Recursos:
Material que debe traer el alumno a clase:
Bata
Guin de prcticas
Material necesario para las clases:
Clases tericas: Ordenador conectado a can. En las clases de teora se utilizarn
diapositivas, presentaciones en PowerPoint y pizarra, as como cualquier otro medio
audiovisual que pudiera ser necesario.
Clases prcticas: Ordenador conectado a can. En las clases de prcticas se utilizarn
guiones detallados o cuadernos de prcticas, para una mejor integracin de los conocimientos
y seguimiento de la actividad. Aula con un ordenador para cada alumno.
Agitador de geles
Agitador magntico-calefactor
Armarios, cajoneras, baldas
Autoclave con cestos
Balanza
Balanza de precisin
Baos con termostato
Cmara fra para almacenar la garrafa de nitrgeno lquido para conservar clulas
Campana extractora de gases
Congelado de - 20 C
Congelador de - 80 C
Cubeta para transferencia sumergida de protenas
Cubetas de electroforesis para geles de acrilamida
Cubetas de electroforesis para geles de agarosa
Destilador de agua
Electroporador
Equipo de agua destilada
Equipo de agua MiliR/MiliQ
Estufa
Fregadero
Frigorfico
Fuente de alimentacin
Gafas de proteccin
Horno de hibridacin con botellas
Incubador orbital con termostato
Lavavajillas
Lector de ELISA
Mquina de hielo
Mscara para UV
Microcentrfuga
Microondas
Micropipetas automticas
Ordenador
pHmetros
Pinzas
Pipeteros para lavar pipetas
Placa para transferencia semiseca de protenas
Termobloque
Termociclador
Transiluminador con luz ultravioleta
UV-VIS Espectrofotmetro
Vortex
Congelador 20C
Frigorfico
Incubador de clulas con CO2
Microscopio de contraste de fase
Material fungible:
Algodn
Asas de siembra de vidrio
Bandejas de siembra
Bandejas
Cmaras de Neubauer
Chupetes
Cubetas de electroporacin de 0,2 cm de paso
Cubetas de cuarzo para espectrofotmetro
Cubetas de plstico para espectrofotmetro
Cubreobjetos 24x 24
Embudos
Guantes de nitrilo de todos los tamaos
Matraces Erlenmeyers
Papel de aluminio
Papel de filtro
Parafilm
Pipetas de plstico estriles de 2, 5 y 10 ml
Pipetas Pasteur
Pipetas Pasteur estriles
Placas de cristal
Placas petri estriles
Placas P100 estriles para cultivos celulares
Placas de 6 pocillos para cultivos celulares
Placas P60 para cultivos celulares
Placas de 96 pocillos para ELISA
Portarrollos de papel de mano
Probetas
Puntas para pipetas automticas
Tubos de ensayo
Tubos Eppendorf 0.2, 0.5 y 1.5 ml
Tubos Falcon 15 y 50ml
Vasos de precipitados
Reactivos
-mercaptoetanol
5-Bromo-4-chloro-3-indolil B-D-Galactopiranosido (X-Gal)
Aceite mineral
Acetona
cido actico
cido clorhdrico
cido maleico
cido sulfosaliclico
cido sulfrico
cido tricloroactico
Acrilamida
Agar
Agarosa
Agua destilada estril
Agua ultrapura estril
Albmina bovina (BSA)
Editado por el Departamento de Publicaciones del IE.
Versin original,
. ltima revisin,
.
Anticuerpos: Rabbit anti mouse Ig F(ab)2 PA conjugated, Rabbit anti mouse Ig F(ab)2
peroxidase conjugated, Mouse monoclonal IgG1 NFATc1 (7A6):
Enzimas de restriccin: Xho I, Pst I, Kpn I, Hind III, Eco RI y Bam H I
Inhibidores de proteasas: Aprotinina, Leupeptina, PMSF y Pepstatina
Marcadores de peso molecular: Lambda DNA EcoR I Hind III digest
Medios de cultivos bacterianos: LB, L-Broth y S.O.C
Medios de cultivos celulares: Fetal bovine serum, Gentamicina, Glutamina, RPMI con
Glutamina
Mitgenos: Ciclosporina A, Ionoforo de calcio A23187 y PMA
Vectores de clonacin: pUC19 10, pGEM-T y pGEM-T Easy Vectors
Lneas celulares: Jurkat y Cos-7
Clulas: E. coli estirpe DH5, Clulas electrocompetentes y E.coli DH5 F
Cronograma:
Est reflejado en el apartado 3.- CONTENIDOS
10
Factor
Horas
trabajo
autnomo
alumno
Total horas
alumno
ECTS
12
24
36
1,4
45
67,5
1,6
108
175,5
7,0
Tutoras
grupales
0,5
1,5
4,5
0,2
Talleres
0,5
Sesiones
Horas
presenciales
alumno
Clases
tericas
Clases
Prcticas
Actividades
Exposiciones
Exmenes
Total
60
88,5
9,0
0,4
0,0
0,0
136,5
225,0
9,0
225,0
9,0
60
5. EVALUACIN
5.1. CONSIDERACIONES GENERALES
Dado el carcter prctico de esta asignatura ser obligatoria la asistencia y la realizacin de
las prcticas para poder presentarse en la convocatoria ordinaria.
Para valorar las competencias especficas conceptuales y procedimentales, adquiridas por el
alumno, el profesor har:
Una evaluacin contina. Para ello preguntar, por escrito y a lo largo del curso, una
serie de cuestiones relacionadas con las diferentes unidades temticas, prcticas y
mtodos experimentales que se van desarrollando. Esta evaluacin del conocimiento
terico y prctico adquirido por el alumno supondr el 25% de la calificacin final de la
asignatura.
Elaboracin de un cuaderno de laboratorio: 25%
11
Un examen final terico-prctico que podr incluir preguntas de tipo test, breves o
desarrollo de temas. Este examen incluir preguntas que evalen el nivel de
comprensin de la materia, as como la memorizacin de los aspectos fundamentales
de la fisiologa vegetal y la aplicacin de los conocimientos adquiridos. La nota obtenida
en el examen supondr un 25% de la nota final de la asignatura.
Una parte de las competencias transversales tambin queda valorada en esta evaluacin
continua y examen final terico-prctico, y para valorar el resto de competencias transversales
los alumnos debern realizar un trabajo sobre la resolucin del problema biolgico planteado
en las clases prcticas. Ser un trabajo individual y deber ser presentado de forma escrita. En
l se valorar la calidad del trabajo escrito (capacidad de sntesis, gestin de la informacin,
visin crtica, utilizacin de conceptos aprendidos,) y la claridad de la exposicin (capacidad
de transmitir las opiniones) as como la capacidad de toma de decisiones y la responsabilidad
en el trabajo. La nota obtenida en este trabajo supondr el 20% de la nota final de la signatura.
Las competencias especficas actitudinales, adquiridas por el alumno, sern evaluadas tanto
por el profesor como por los alumnos y supondr el 5% de la nota final de la asignatura. Esta
nota resultar de la media aritmtica de la nota adjudicada por el profesor y la nota adjudicada
por los alumnos. El profesor evaluar teniendo en cuenta la puntualidad, la predisposicin y
actitud positiva del alumno a la hora de realizar las actividades y de enfrentarse a las
dificultades que puedan surgir, el cuidado del material, el orden y la limpieza en el laboratorio,
etc.
5.2. CRITERIOS DE EVALUACIN Y PONDERACIN
Competencias
especficas conceptuales
y procedimentales
Competencias
transversales
Competencias
actitudinales
Dominio,
asimilacin
e
integracin de los contenidos
tericos y prcticos de la
materia
Calidad del trabajo y claridad
de la exposicin (capacidad de
sntesis,
gestin
de
la
informacin, comunicacin, )
Puntualidad,
predisposicin
positiva del alumno en la
realizacin de las prcticas y
en
la
resolucin
de
imprevistos, el cuidado del
material, el orden y la limpieza
en el laboratorio.
Respuestas
a
los
cuestionarios entregados
y problemas planteados
Cuaderno de laboratorio
Examen terico-prctico
25%
25%
25%
Trabajo escrito
20%
Valoracin de la actitud
global del alumno
5%
12