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Delimitadores
Los delimitadores son secuencias responsables de la formacin y mantenimiento
de un dominio en el cual un gen o grupo de genes se encuentran activos
Clase I, genes que codifican para las subunidades largas de los RNA
ribosomales (RNAr). Estos genes son transcritos por la RNA polimerasa I, la
cual se encuentra localizada en el nucleolo.
Clase II, genes que codifican para algunos RNA nucleares pequeos, y
principalmente para los RNA mensajeros (RNAm) que codifican para
protenas estructurales. Estos son transcritos por la RNA polimerasa II.
Clase III, genes que codifican para RNA estructurales pequeos y
componentes de la maquinaria de procesamiento o "splicing" de los RNA's
pre-mensajeros. Estos genes son transcritos por la RNA polimerasa III.
Para el grupo de genes transcritos por la RNA polimerasa II, al menos se requiere
de 6 factores generales de transcripcin, que en conjunto formarn lo que
conocemos como el CPT. La asociacin estable de la RNA pol-II con la secuencia
promotora, requiere de la unin previa de TFIID, en particular TBP y sus factores
asociados conocidos como TAFs, TFIIB y TFIIF. Sin embargo para que la
transcripcin se pueda llevar acabo se necesita de los factores transcripcionales
TFIIE y TFIIH.
El inicio de la transcripcin requiere del previo reconocimiento de la caja TATA, por
la protena TBP y su unin genera una distorsin en la estructura de ADN. Este
complejo formado por la TBP y el ADN ahora distorsionado, ser el blanco que
reconocer el TFIIB. La asociacin de la RNA polimerasa II al complejo ADN-TBPTFIIB, requiere de la interaccin del TFIIF con la polimerasa, su funcin ser la de
asistir la unin al promotor. Cabe sealar que el TFIIF interacciona ri abajo del
elemento TATA.
Una vez que se ha establecido la unin de la RNA pol-II a la secuencia promotora,
se necesita de la unin de los factores TFIIE y TFIIH para lograr el proceso
conocido como alarge del promotor. Este evento permitir liberar a la RNA
polimerasa II de la secuencia promotora y facilitar el inicio de la transcripcin, en
un proceso mejor conocido como elongacin. El complejo TFIIH adems de incluir
a la cinasa responsable de fosforilar a la regin CTD de la RNA pol-II, tiene la
capacidad de reparar el ADN mediante el proceso conocido como reparacin por
escisin de nucletidos.