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METABOLISMO E INGENEIRIA
METABOLICA
I.- METABOLISMO.
Es el conjunto de todas las reacciones qumicas que se
producen en el interior de las clulas de un organismo. (Varela y
Grotiuz)
Las caractersticas metablicas especficas de un
microorganismo constituyen el principal criterio para
determinar su papel ecolgico, y su utilidad en los procesos
industriales.
Segn la utilidad de las molculas producidas, el metabolismo
puede ser primario o secundario.
2.1.- Catabolismos
Se clasifican segn tres criterios:
2.1.1.- Quimihetertrofo
Los quimiorganohetertrofos, oxidan los compuestos orgnicos
para producir energa (catabolismo) y usan su carbono para
sintetizar material celular (anabolismo).
Estos microorganismos son responsables de la degradacin de los
polmeros orgnicos naturales como celulosa, quitina, etc.
El catabolismo hetertrofo puede ocurrir por fermentacin o por
respiracin.
2.1.1.1.- Fermentacin
Es un proceso catablico que realizan muchos organismos en ausencia
de un aceptor externo de electrones, en l ocurre una oxidacin
incompleta de compuestos orgnicos con liberacin de energa. El
producto final es un compuesto orgnico
Los organismos que fermentan no utilizan la cadena de transporte de
electrones para oxidar NADH a NAD+, sino que lo hacen a travs de la
oxidacin parcial de un compuesto orgnico.
fermentacin
los compuestos orgnicos producidos son generalmente cidos orgnicos
cortos y alcoholes. Ejemplos: el etanol, acetato, lactato y el butirato.
a.- Va Embden-Meyerhof-Parnas
Estas fermentaciones
pueden llevar a un
amplio espectro de
productos dependiendo
de los pasos de
reduccin despus de la
formacin de piruvato.
Homolctica
Del cido
propinico
De cidos mixtos
Butanol-acetona
Levaduras
Zymomonas mobilis
Produccin de cido
La lactosa es el azcar mayoritario de la leche (4.2-5%).
En funcin de los productos resultantes se distinguen dos vas
principales:
Va homofermentativa, propia de los gneros Lactococcus,
Streptococcus, Enterococcus, Pediococcus y de especies de
Lactobacillus de los grupos I y II.
Metabolizan la glucosa a piruvato por la ruta glicoltica o de
Embden-Meyerhof-Parnas, obtenindose cido lctico como
producto mayoritario de la fermentacin.
La produccin de este cido como nico producto metablico tiene
lugar solamente en condiciones de exceso de fuente de carbono
(glucosa o lactosa).
Cuando sta se encuentra en condiciones limitantes y en
anaerobiosis, o cuando el azcar fermentado es la galactosa, tiene
lugar la fermentacin heterolecita.
Va heterofermentativa, propia
del gnero Leuconostoc y de
algunas especies de Lactobacillus.
La fermentacin de la glucosa
tiene lugar por la ruta de la
fosfocetolasa, siendo ste el
enzima clave de la misma.
Los productos originados por
esta va son cido lctico, CO2 y
cantidades variables de actico y
etanol.
El crecimiento de las bacterias
con este tipo de metabolismo se
ve favorecido en condiciones de
aerobiosis ya que la regeneracin
de NAD+ consumido en la
oxidacin de la glucosa se realiza
utilizando el oxgeno del medio
como aceptor de electrones, lo
que permite desviar el acetil-CoA
hacia la sntesis de actico y
generar una molcula extra de
ATP.
Actividad proteoltica
Produccin de aromas
Las bacterias del cido lctico contribuyen al desarrollo del aroma de los
productos fermentados mediante la produccin de determinados
compuestos (alcoholes, cetonas o steres) que actan modificando las
caractersticas organolpticas del producto.
As, la produccin de diacetilo es necesaria para un correcto desarrollo
del aroma en productos como la mantequilla y algunos quesos y leches
fermentadas, mientras que el acetaldehdo es el principal responsable del
aroma del yogur. Otros voltiles como el cido actico o las metilcetonas
tambin intervienen en el desarrollo de aromas en diferentes variedades
de quesos.
Sntesis de Acetilo
b.- Respiracin
Es la oxidacin de los sustratos reducidos, que ocurre con
transporte de electrones hasta una aceptor final externo.
Puede ser de dos tipos:
Aerobia: el aceptor final de electrones es O2 (se reduce y se
forma H2O).
Anaerobia: el aceptor final de electrones no es O2.
Respiracin anaerobia
Respiracin anaerobia
b.1.- Desnitrificacin
reduccin de sulfatos.
Proceso
Los electrones donados por el
sustrato (lactato) en el citoplasma son
recibidos por la enzima hidrogenasa,
la cual los transfiere al citocromo c3 y
ste a su vez al complejo Hmc. Este los
transporta por la membrana celular
hasta el citoplasma donde los recibe la
APS (Adenosin-fosfo-sulfato) que se
reduce a sulfuro por accin de la
sulfato reductasa.
Si el lactato o piruvato es el donador
de electrones se genera otra molcula
de ATP producida por la oxidacin del
piruvato a acetato.
Este es un proceso tpico en
Desulfovibrio desulfuricans.
Transporte de electrones en bacterias
reductoras de sulfato
Nuevas celdas.
Existen una serie de bacterias Shewanella y Geobacter que son capaces de
transferir directamente electrones a electrodos slidos.
Esta celda no requiere catalizadores ni membranas.
Usando bacterias Rhodoferax ferrireducens, como electrocatalizador, y
glucosa, como combustible, la oxidacin de glucosa puede generar 24 e/mol, mayor que la de otros combustibles, como el hidrgeno (2
electrones) o metanol (6 electrones).
La glucosa se oxida en el nodo liberando electrones, iones
compensadores de carga y productos de la oxidacin (nCO2, donde n
representa el nmero de equivalentes).
Los iones de compensacin de carga elctrica migran a travs de un
electrlito, mientras que los electrones fluyen a travs de un circuito
externo y generan la potencia elctrica, utilizando O2 como aceptor final
de electrones generando nH2O que se extrae del sistema.
2.2.2.- Quimiolitotrofa
Uso de un compuesto inorgnico como fuente de energa.
(donadores de electrones)
Littrofos aerobios: remueven electrones del substrato inorgnico
y los ponen en un sistema de transporte de electrones hasta el O2,
que producir ATP.
Fuentes de donadores inorgnicos de electrones: S, N y Fe:
agricultura, minera.
Oxidaciones litotrficas
H2 + O2 H2O
Go = -237 kJ
En estos organismos, el hidrgeno es oxidado por una hidrogenasa ligada
a la membrana, realizando el desplazamiento del protn va una
transferencia de electrones a varias quinonas y citocromos.
Bacteriasoxidantes de azufre
Microorganismos que crecen en mediosde cultivo orgnicos
Gneros y especies
Thiobacillus denitrificans
Halothiobacillus neapolitanus
S, S2O3 2-
68
Acidithiobacillus thiooxidans
2-4
Acidithiobacillus ferrooxidans*
S, sulfuros metlicos,
Starkeya movella*
S2O3 2-
Thiobacillus thioparus
Thiomomas intermedia*
S2O3
6-8
Fe2+
2-
Acidithiobacillus thiooxidans
Oxida el S y produce cido sulfrico. Aunque ha sido aislado del
suelo se le ha observado en la corrosin del concreto de tubos de
alcantarilla, transformando el sulfuro en cido sulfrico en aguas
residuales.
2-4
6-8
3-7
Desnitrificacin
El proceso de desnitrificacin consiste en la reduccin del nitrato a
nitrito y, posteriormente, a compuestos de nitrgeno gaseoso (xido
ntrico NO, xido nitroso N2O y nitrgeno diatmico N2) en
presencia de una fuente de carbono orgnica.
El nitrato y el nitrito reemplazan al oxgeno en la cadena de
transporte de electrones (respiracin microbiana), por lo que la
desnitrificacin suele producirse en ambientes denominados
anxicos, carentes de oxgeno y con disponibilidad de nitrito y
nitrato como aceptores de electrones
Desnitrificacin con metanol como fuente de carbono orgnico
6O3 + 5H3OH 32 + 52 + 7H2O + 6OH
Proceso Anammox
La oxidacin anaerobia del amonaco, en Candidatus Brocadia
anammoxidans, implica el acoplamiento de la oxidacin de
amonaco con la reduccin de nitrito, en ausencia de oxigeno.
cido cianrico
cianato
2.2.3.- Fottrofos
Utilizan la luz como fuente de energa, convierten la energa
luminosa en energa qumica utilizable como ATP.
La fotosntesis puede ser: oxigenica o anoxigenica.
a. Autotrofa: fotosntesis.
La mayora de los
microorganismos
fotosintticos son
auttrofos, fijan CO2 va el
ciclo de Calvin.
Algunas bacterias
fotosintticas (por ejemplo,
Chloroflexus aurantiacus)
son fotohetertrofos, es
decir que utilizan
compuestos orgnicos como
fuente de carbono para el
crecimiento.
b.gluconeognesis
Proceso inverso
a la va glicoltica
Por accin enzimtica se condensan un acetil-ACP y un malonilACP (derivado del anterior), dando una molcula de 4 carbonos.
Reacciones
catablicas
Biosntesis
Polimerizacin
Ensamblaje
Ejemplos:
Griseofulvina (antibitico producido por Penicillium griseofulvum)
Aflatoxinas (toxinas producidas por Aspergillus flavus y por A. parasiticus)
Ocratoxinas (toxinas producidas por algunos tipos de Aspergillus y de
Penicillium)
Lovastatina (producida por A. terreus). Figura N 11.8
B. TERPENOS
Se inician a partir del Acetil-CoA.
Produce tanto metabolitos primarios (carotenos, esteroles) como secundarios.
Ejemplos:
Ciertos carotenos.
Toxinas como la toxina T2 y los tricotecenos (producidos especies de Fusarium).
Ahora ya es posible distinguir como aminocidos alifticos precursores al triptfano,
lisina y a la ornitina y como aminocido aromticos a la fenilamina y a la tirosina. A la par
ya podemos reconocer nuevos intermediarios como el cido glico, cido cinmico y los
isoprenoides.
Los grupos de metabolitos secundarios pueden ser reordenados segn la clasificacin
anterior de la siguiente manera:
Compuestos terpenoides: Terpenos y esteroides
Todos los terpenoides, tanto los que participan del metabolismo primario como los ms
de 25.000 metabolitos secundarios, (son derivados del compuesto IPP (Isopentenil
difosfato o "5-carbono isopentenil difosfato") que se forman en la va del cido
mevalnico.
Es un grupo grande de metabolitos con actividad biolgica importante.
Compuestos fenlicos: Compuestos fenlicos como los fenilpropanoides y sus derivados.
Los ms de 8.000 compuestos fenlicos que se conocen estn formados o bien por la va
del cido shikmico o bien por la va del malonato/acetato. Incluyen a los
fenilpropanoides, lignanos, cumarinas, taninos galicos, antraquinonas, flavonoides y
taninos condensados.
Ingeniera metablica.
En la parte central de la figura se muestra la relacin existente
entre la informacin gentica contenida en el genoma de una
clula, la composicin de protenas y su efecto sobre el
metabolismo.
Este esquema representa el dogma central de la biologa molecular,
el cual dicta que la informacin gentica fluye del cido
desoxirribonucleico (ADN), hacia el cido ribonucleico (ARN) y,
finalmente, hacia las protenas.
Las protenas son las responsables de llevar a cabo la mayora de
las funciones celulares; por lo tanto, el tipo y la cantidad de
protenas especficas (proteoma) presentes en una clula
determinan qu funciones celulares estarn activas.
El metabolismo es un proceso celular en que participan un gran
nmero de protenas diferentes.
La clula posee mecanismos para coordinar cules protenas y en
qu cantidad son necesarias dependiendo de las condiciones
externas.
herramientas
La relacin entre una actividad enzimtica y el flujo metablico
se expresa como un coeficiente de control de flujo (CCF).
El CCF se define como el cambio en el flujo en una va
metablica que resulta al incrementar la actividad de una
enzima en particular.