Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

Programa de Biologa
Sistemtica Animal
Laboratorio N 6: Elaboracin de Cladogramas con la utilizacin de
WinClada-Nona
14 de Mayo de 2016

WinClada Caractersticas
Winclada es un programa de men con todas las funciones y ventanas de ratn
impulsada con capacidades de impresin WYSIWYG
Lee Hennig 86, NONA, dada, clados, y la mayora de los archivos de formato nexo
que contienen matrices de datos cladsticos.
Permite al usuario editar y manipular matrices de datos, tanto morfolgicos y
moleculares.
Muestra los cladogramas (rboles filogenticos) con la capacidad de asignar
carcter cambia como hashmarks de colores y la etiqueta de nmero de caracteres
o el nombre del personaje y estados.
Manipula cladogramas (rboles filogenticos) con funciones tales como mover una
rama y el colapso, y vuelve a calcular la longitud del rbol automticamente bajo los
parmetros de optimizacin seleccionado actualmente (por ejemplo, mostrar slo
los nodos soportados de forma inequvoca, optimizacin rpida, lenta) de
optimizacin.
Prints cladogramas (rboles filogenticos). Los rboles se imprimen "exactamente"
como aparecen en la pantalla, a cualquier tipo de impresora que soporta grficos de
trama y est instalado en Windows. Todas las impresoras lser comunes son
compatibles, as como impresoras de inyeccin de tinta de color, tales como.
Tambin hay una funcin de vista previa de impresin que permite al usuario rboles
de posicin en una pgina. Varios estilos de rboles son compatibles.
Winclada puede ser configurado para generar directamente los programas NONA,
PIWE, y Hennig 86. Nona y TNT son actualmente los programas ms rpidos
disponibles para el anlisis de parsimonia.
NONA Caractersticas
A / programa de texto de Windows 95/98 NT lnea de comandos /
Se utiliza para buscar los rboles ms parsimoniosos

Utilizado para calcular consenso rboles, etc.

Extremadamente rpido!

Laboratorio N6
1. Elabore un Cladograma para cada una de las matrices empleando el
programa de WinClada.
Matriz A
Raz
Wus
Yus
Sus
Aus
Bus

1
0
1
1
1
0
0

2
0
0
0
0
1
1

3
0
1
1
1
0
0

4
0
0
0
0
1
1

5
0
1
1
0
0
0

6
0
1
1
0
0
0

7
0
0
1
0
0
1

8
0
0
0
0
0
1

9
0
1
0
0
0
0

10
0
0
0
1
0
0

Se tomaron estos datos y se introdujeron en el programa de Winclada, creando una

nueva matriz, luego se le asignaron nombres a los taxones y caracteres, para luego
meter la presencia (1) o ausencia (0) de caracteres.
Con todos estos datos ubicados en la nueva matriz nos vamos a la opcin interface
que nos permite visualizar el cladograma.

RAIZ
8

WUS
6

YUS
9

SUS
0

AUS

3
6

BUS
L=15, Ci=66, Ri=44, T=5, C=6
Luego a esta misma matriz se le realiz un anlisis de Heuristics y quedo de la
siguiente forma que nos muestra una mejor relacin entre los taxones y los
caracteres que comparten.

RAIZ
1

AUS

3
6

BUS
9
0

SUS

8
4

WUS

5
6

YUS
En este cladograma podemos observar una homaplasia en entre los taxones YUS
y BUS, con el carcter 7 que aparece como 6 en el clado (circulo blanco), tambin
se pueden observar autapomorfias en los taxones WUS, SUS, BUS con los
caracteres 8, 9,7 respectivamente.
L=11, Ci=90, Ri=88, T=5 C=6

2. Matriz B
Raz
A
B
C
D
E

1
0
0
0
0
0
0

2
0
0
0
0
0
0

3
0
0
0
0
1
1

4
0
1
1
1
1
1

5
0
1
1
1
1
1

6
0
1
0
0
1
1

7
0
0
1
0
1
0

Con esta matriz se realiz el mismo procedimiento empleado en la matriz A, asi

la
matriz
sin
aplicarle
el
anlisis
Heuristics
obtenemos

RAIZ
5

6
1

B
C
6
2

L= 7, Ci= 71, Ri= 50, T=5, C=6

Cuando a la matriz se le realiza el anlisis de Heuristics obtenemos

RAIZ
C
6

B
A

E
En este cladograma se observa un homoplasia entre los taxones B y D con el
Carcter 6 que se muestra como un circulo blanco.

L= 6, Ci= 83, Ri= 75, T=5, C=6

1. Para la tercera matriz C tenemos:

Matriz C
OG
A
B
C
D

1
0
1
0
0
0

2
0
0
1
0
0

3
0
0
0
1
0

4
0
0
0
0
1

5
0
1
1
0
0

6
0
1
1
1
0

7
0
1
1
1
1

8
0
1
0
0
1

El cladograma para esta matriz C sin hacerle un anlisis seria el siguiente:

OG
0

A
1

B
2

C
3

D
L= 11, Ci= 72, Ri= 0, T=4, C=7
Al realizarle el anlisis Heuristics obtenemos:

OG
3

D
2

4
1

B
En este Cladograma podemos observar una homoplasia entre los taxones A y D
con el carcter 7 sealado con un circulo blanco, tambin se observan muchas
autapomorfias, en el taxn C con el carcter 2, en el taxn B con el carcter 1,
el en taxn D con el carcter 3, en el taxn A con el carcter 0.
Grupo monofiltico: Taxones C, A, B con el carcter 5.
Aqu podemos observar
L= 9, Ci= 88, Ri= 66, T=4, C=7
Finalmente tenemos a la Matriz D
Matriz D
OG
A
B
C
D
E
F

1
0
0
1
1
1
1
1

2
0
0
1
1
1
0
1

3
0
0
1
1
1
1
1

4
0
0
0
0
1
1
0

5
0
0
0
0
1
1
0

6
0
0
1
1
1
0
0

7
0
0
1
1
0
0
0

8
0
0
0
0
1
1
1

9
0
0
0
0
1
1
1

Para esta matriz un Cladograma sin un anlisis concreto seria as:

10
0
0
0
1
0
0
0

11
0
1
0
1
0
0
1

OG
10

B
0

10

C
D
1
5

0
10

E
F

L= 18, Ci= 61, Ri= 53, T=6, C=10

Una vez realizado el anlisis Heuristics podemos apreciar que cambio:

OG
A

B
9

F
5
3

1
1
0

D
E

Aqu en este clado se observa una homoplasia entre los taxones A, C y F con el
carcter 10.
Homoplasia en los taxones: D, B y C con el Carcter 5
Reversin del carcter 2 en el taxn E
Autapomorfia en el taxn C con el carcter 9
Sinapomorfias en los taxones D, E, F con los caracteres 7 y 8
Sinapomorfias en los taxones B y C con el carcter 6.
L= 15, Ci= 73, Ri= 73, T=6, C=10