Laboratorio de Biogeografa

Modelos de distribucin de especies (MDE)

El laboratorio tiene como objetivo realizar un ejercicio de
proyeccin de la distribucin espacial de una especie de rbol endmico
en Chile. Para esto se utilizara el software de MDE Maxent, este
programa utiliza el concepto de Maxima Entropia para establecer la
distribucin potencial de una especie basado en sus registros de
colectas y variables ambientales. En este ejercicio se tendr que realizar
una proyeccin espacial actual de la especie y una proyeccin espacial
futura. Para esto se entregara a cada grupo de trabajo un shape de
puntos con la distribucin espacial de una especie de rbol endmico y
un conjunto variables bioclimticas (19) que tendrn que usar para
realizar las proyecciones.

Gua Metodolgica

Como primer paso para la realizacin del ejercicio, se debe

preparar el archivo de presencias de la especies para poder ser utilizado
por el programa Maxent. El programa requiere una tabla en formato csv,
que tenga los siguientes campos: Sp, Long, Lat. Que corresponden
respectivamente a el campo con el nombre de la especie (no puede
tener espacios), a la longitud (con smbolo decimal de punto) y a la
latitud (con smbolo de punto). Una forma de realizar este paso, es
importar la tabla *.dbf del shape que se les entrego y editarla utilizando
un programa de edicin de texto como Notepad. Otra opcin es hacerlo
directamente en Excel.

El siguiente paso consiste en agregar los registros ya en formato

csv a Maxent y hacer lo mismo con las variables bioclimticas. Para esto
el programa tiene dos ventanas en su zona superior, donde en el lado
izquierdo, se agrega el archivo csv y en el lado derecho se debe indicar
la carpeta donde estn las variables actuales.
Una vez que se han ingresado correctamente los registros y las
variables,

se

deben

definir

algunos

parmetros

en

Maxent,

continuacin se detallan estos:

-Parmetros de Maxent
-Marcar, Create response curves (crea curvas de respuesta
por variable)
-Definir Carpeta Salida (Output Directory)
-Definir variables futuras (Projection layers directory file) las
variables futuras deben tener el mismo nombre de las actuales y
ubicarse en una carpeta distinta.
-Definir Settings
-Definir set de calibracion (Random test percentage) 30%
-Definir Settings (Advanced)
-Maximum iterations (1000)
-Definir umbral para mapa binario (Apply threshold value:
Max training sens plus spec)
Una vez que se hayan definido los parmetros, ya es posible correr
el modelo, para esto solo hay que ejecutar el botn Run.
Los resultados se entregan en dos formatos, por una parte se crea
en la carpeta de salida definida un archivo html que se abre con
cualquier

navegador.

En

este

archivo

que

tiene

formato

(nombre_especie.html) se presentan todos los resultados del modelo.

Partiendo por la evaluacin, la importancia de las variables utilizadas y
los mapas de salidas de las proyecciones actuales y futuras, entre otras
informaciones del modelo realizado. El otro tipo de resultados, son los
mapas mismos de las proyecciones espaciales actuales y futuras, los
que se entregan en formato de probabilidad y binario, este ltimo
entrega un mapa de presencia/Ausencia en funcin de un umbral de
corte definido. Ambos archivos debern ser importados a Arcgis o
software SIG similar para su posterior edicin y anlisis.
Finalmente una vez que se haya corrido el modelo con todas las
variables ambientales (19), el paso final para realizar el anlisis para el
informe final del laboratorio, ser realizar un modelo con las mejores 7
variables que se identifican en la primera corrida con el nmero de
variables totales (19). Para esto se debe revisar la tabla que viene en el
archivo html llamada (Percent contribution en Analysis of variable
contributions) y elegir las siete primeras, con estas se construye el
modelo final.