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ESCUELA DE AGRONOMA
CARRERA: AGRONOMIA
1 Ttulo Curso
2 Cdigo
3 Crditos y PMA
Bioqumica
AGRO1109
7 / crditos 4 2 6
4
5
6
7
8
9
10
II.
Nombre y apellidos
Grado acadmico
Fono oficina
Email institucional
Contacto va plataforma
Horario atencin
Unidad Acadmica
Descripcin
III. Competencias
Competencias Genricas a validar
Nombre:
Gestin del conocimiento
Definicin: Procesa informacin para la generacin del conocimiento lo que implica
conocer, comprender, aplicar, analizar, sintetizar, evaluar y transformar
segn las necesidades de aprendizaje y trabajo, y de acuerdo a las
exigencias del medio sociocultural.
Nivel: 1
Reconoce las habilidades y/o procesos cognitivos con los cuales puede
identificar, seleccionar, relacionar e interpretar informacin bsica
relacionada con su profesin futura.
Competencias Especficas
Nombre:
Aplica las Ciencias Bsicas, Biotecnologa y Agricultura de Precisin.
Definicin: Aplica herramientas de las Ciencias Bsicas, Biotecnologa y de la
Agricultura de Precisin en la produccin agropecuaria para alcanzar el
desarrollo sustentable.
Nivel: 1
Utiliza los conocimientos adquiridos en las ciencias bsicas para
comprender y explicar las tecnologas y manejo agropecuario.
V.
Cronograma
P
Semanas
P:
A:
P:
M:
A:
P:
M:
A:
P:
P:
A:
P:
6
M:
A:
P:
7
M:
A:
P:
M:
A:
P:
9
M:
A:
10
P:
M:
A:
11
P:
M:
A:
12
P:
M:
A:
13
P:
M:
A:
14
P:
M:
A:
15
P:
A:
16
P:
A:
17
P:
69
22
102
Subtotal
Total
195
Semana
3-4
9-10
14-15
Ponderacin
6
11
13
14-15
6
8
12
16
Descripcin
Portada
Se debe incluir el logo de la
Universidad, donde se
seale, la facultad, la
escuela y carrera a la cual
pertenece el o los
estudiantes. Se incluye el
nombre del docente,
ayudante y el nombre de
los integrantes del grupo.
Extensin (pginas)
1
I
II
III
IV
VI
Resumen
Introduccin
Materiales y mtodos
En este captulo, se deber
detallar tanto los
materiales usados y los
tratamientos y/o
metodologas que indique
el profesor, las cuales
fueron necesarias para
llevar a cabo la actividad.
Se debe redactar en
pasado y tercera persona,
ya que dan cuenta de lo
realizado.
Resultados y discusin
En este captulo se deben
presentar los resultados de
lo realizado, las
observaciones, y las
variantes o modificaciones
realizadas en el
experimento. En este
punto se debe de
contrastar los resultados
propios con la literatura.
Para la presentacin, de
deben incluir grficos,
imgenes, tablas cuando
sea necesario.
Conclusiones:
Se deben considerar como
conclusiones solo lo que se
desprenda del ensayo,
apoyndose en la
literatura.
Literatura citada.
1
1
1
5 (mximo)
Nivel 1
Reconoce las habilidades y/o procesos cognitivos con los cuales
puede identificar, seleccionar, relacionar e interpretar informacin
bsica relacionada con su profesin futura.
Gestiona la informacin integrando de manera restringida tcnicas
adecuadas de recogida de datos y diversas fuentes de consulta bsica
para la organizacin y el control de procesos que permitan resolver
problemas simples de su rea acadmica o profesional.
Utiliza buscadores, sitios Web y bibliotecas de fcil acceso o indicadas por el profesor para hallar
informacin solicitada.
Construccin
del
conocimiento
Transferencia
Insuficiente 1
El seminario no
contempla en su
totalidad
los
contenidos
analizados en el
taller presencial.
Son expuestos
de
manera
superficial,
no
cuenta de lo que
se
trata
el
trabajo, dejndo
de
considerar
algunos puntos.
Suficiente 2
El seminario
no contempla
en su totalidad
los contenidos
analizados en
el
taller
presencial. Son
expuestos de
manera
general,
no
presenta
ejemplos que
se relacionen
con la biologa
vegetal
o
biomedicina.
Bueno 3
El
seminario
contempla los
contenidos
analizados en el
taller
presencial,
descritos
de
forma general,
presentando los
principales
tpicos
del
tema. Relaciona
la bioqumica
con ejemplos
en
biologa
vegetal
o
biomedicina.
Exposicin
No
existe
dominio de lo
que se va a
presentar,
titubeo, mal uso
de la voz y de
lenguaje
adecuado
al
tema que se est
tratando. No hay
sintona con el
resto del grupo
que
est
exponiendo. No
respeta
el
tiempo (muy por
debajo
o
sobrepasado)
lmite definido
con anterioridad
por el profesor.
La presentacin
no se realiza
mediante
programa
de
presentaciones
en
formato
keynote
o
powepoint.
Presenta
un
nmero
extremadamente
corto o extenso
de diapositivas.
Presenta
demasiado
Dominio
mediocre del
tema
a
exponer. Fallas
en la sintona
con el resto
del
grupo.
Manejo
suficiente del
lenguaje
de
acuerdo
al
tema que se
est tratando.
Utiliza mayor
tiempo que el
lmite definido
con
anterioridad
por
el
profesor.
Buen dominio
del
tema,
claridad
al
exponer
las
ideas,
los
integrantes del
grupo
tienen
sintona
y
coordinacin
con las distintas
etapas de la
exposicin.
respeta
el
tiempo lmite
definido
con
anterioridad
por el profesor.
La
presentacin
se
realiza
mediante
programa de
presentaciones
en
formato
keynote
o
powepoint.
Nmero
excesivo
de
diapositivas.
No presenta
de grficos ,
esquemas
o
La presentacin
se
realiza
mediante
programa
de
presentaciones
en
formato
keynote
o
powepoint.
Nmero
de
diapositivas en
concordancia
con el tiempo,
claramente
definidas
las
diapositivas a
Formato
Presentacin
Sobresaliente 4
El
seminario
contempla los
contenidos
analizados en el
taller
presencial, son
descritos
o
expuestos
en
profundidad.
Relaciona
la
bioqumica con
ejemplos
en
biologa vegetal
o biomedicina, y
cita
investigaciones
o
avances
cientficos
de
dominio
pblico.
Dominio
absoluto
del
tema. Expone
claramente y en
orden las ideas
de acuerdo al
tema tratado. El
lenguaje
es
apropiado,
logra transmitir
las ideas al
resto de los
estudiantes,
respeta
a
cabalidad
el
tiempo lmite
definido
con
anterioridad por
el profesor.
La presentacin
se
realiza
mediante
programa
de
presentaciones
en
formato
keynote
o
powepoint .
Nmero
de
diapositivas en
concordancia
con el tiempo,
claramente
definidas
las
diapositivas a
Preguntas
texto, dificultoso
de leer, con
prrafos
no
justificados.
Ausencia
de
grficos
,
esquemas
o
imgenes
que
ayuden en la
presentacin del
tema
en
cuestin.
No se responden
las preguntas de
la audiencia ni
las del profesor.
imgenes que
ayuden en la
presentacin
del tema en
cuestin. Uso
de
la
informacin
discreta que
incluye fuentes
generales.
cada integrante
del curso. Uso
de
la
informacin de
manera
adecuada que
incluye fuentes
especializadas.
cada integrante
del curso.
Uso
de
la
informacin
sobresaliente
que
incluye
fuentes
especializadas
Las preguntas
realizadas por
la audiencia y
por
el
profesor, son
respondidas
de
manera
insegura, con
resuestas
vagas
o
incorrectas.
Las preguntas
realizadas por
la audiencia y
por el profesor
son
respondidas de
manera
correcta
fundamentando
tal respuesta.
Comenta con el
profesor
las
implicancias de
tales
respuestas.
Las preguntas
realizadas por la
audiencia y por
el profesor son
respondidas de
manera
sobresalientes
por todos los
integrantes del
grupo;
fundamentando
de
manera
slida
sus
respuesta.
Comenta
y
relaciona
sus
respuestas con
lo visto en las
clases y en el
contexto
biolgico de la
bioqumica.
Entrega
ejemplos
concretos
en
biologa vegetal
y
en
biomedicina.
Anexo 2:
Introduccin al instrumental bioqumico. Normas del laboratorio y actividades
prcticas.
Introduccin
Para la comprensin de la Bioqumica, actividad intelectual abierta con limitaciones
que establece el mtodo cientfico, se requiere una actitud de curiosidad despierta
para observar hechos en condiciones experimentales.
La capacidad de obtener informacin precisa al mximo de exactitud, registrar,
ordenar y presentar los datos en forma comprensibles a los observadores
independientes que tengan acceso a ellos es una habilidad que no se logra sino es por
la prctica personal del ejercicio.
La presente gua de laboratorio, tiene la finalidad de cumplir con los siguientes
Objetivos Especficos:
1. Ejercitar a los alumnos en el mtodo cientfico mediante el manejo de tcnicas
generales y sencillas, aplicables a mltiples problemas particulares.
2. Desarrollar habilidad para programar experimentos, sistematizar el trabajo de
laboratorio, manipular los equipos y realizar mediciones u observaciones rigurosas, as
como saber expresar sus resultados.
3. Procurar el desarrollo de iniciativa personal y de razonamiento lgico frente a
problemas que se planteen, de tal modo que el alumno pueda realizar innovaciones o
variaciones en los mtodos de trabajo.
4. Desarrollar el sentido de responsabilidad social para manejar los recursos humanos
y materiales que inciden en su propia formacin.
5. Exigir en forma intransigente una actitud de honestidad intelectual.
El registro de los resultados de los experimentos es una parte esencial de cualquier
trabajo cientfico. Los experimentos de laboratorio son el fundamento de las hiptesis,
teoras, conocimientos cientfico y tecnologa, y son intiles si no se consigna por
escrito la descripcin de lo que se ha hecho y observado en tal forma que permita a
cualquiera, con cierto conocimiento del asunto, que repita, compruebe o corrija el
trabajo realizado sin necesidad de gua especial.
Las anotaciones deben ser breves y muy claras; se llevarn en el cuaderno exclusivo de
laboratorio, as como los grficos y calibraciones de los experimentos que lo requieran.
Se harn inmediatamente despus de cada experimento sin confiar a la memoria un
momento ms de lo necesario.
Para que los experimentos de laboratorio tengan valor formativo, se aprenda a hacer
observaciones exactas, se estimule la curiosidad y se desarrolle un sentido crtico
basado en los aspectos cuantitativos de la ciencia es necesario que antes de iniciar el
trabajo en el laboratorio:
Se revise en textos, los principios fundamentales implicados
Anexo 3:
Introduccin a tcnicas de anlisis en bioqumica. Espectrofotometra
Laboratorio Bioqumica: Espectrofotometra de absorcin molecular.
Objetivo: Comprender los principios de la absorcin molecular de la luz visible y valorar
su uso en el anlisis cuantitativo.
Introduccin
Todas las molculas y tomos son capaces de absorber radiacin
electromagntica, lo que nos permite, por ejemplo, sentir el calor de una estufa
encendida. Pero no fue hasta que se describi la Ley de Lambert y Beer que esta
propiedad alcanz una forma prctica, La Ley de Lambert y Beer dice:
Cuestionario
1.- Qu es un espectro de absorcin?
2.- Cules son las aplicaciones y limitaciones del mtodo espectrofotomtrico?
3.- De que color aproximado se ve un cuerpo que absorbe luz de longitudes de onda
correspondientes al color verde y al azul?
4.- Puede efectuarse una determinacin fotomtrica en un lquido transparente
incoloro? Qu requisitos exigira a su instrumento? Explique.
5.- Si las soluciones coloreadas presentan una absorbancia muy grande que dificulta la
medida en el espectrofotmetro. Qu hara usted para poder medir las
concentraciones de estas soluciones?
Anexo 4:
LABORATORIO BIOQUIMICA
PIGMENTOS VEGETALES
CROMATOGRAFA EN PAPEL Y ESPECTROFOTOMETRA.INTRODUCCIN.La funcin de los pigmentos fotosintticos es la absorcin de energa luminosa durante
el proceso de fotosntesis. Estos pigmentos se encuentran unidos a travs de enlaces
covalentes y no covalentes a protenas presentes en las membranas de los
cloroplastos, constituyendo as los Fotosistemas (I y II). Entre los pigmentos
fotosintticos destacan las clorofilas (a y b), como pigmentos principales y tambin los
carotenoides y ficobilinas, como pigmentos antena o accesorios. Todos estos
pigmentos tienen diferentes colores debido a las diferentes propiedades de absorcin
de la luz visible que ellos presentan.
ACTIVIDAD 1
OBTENCIN DE PIGMENTOS FOTOSINTTICOS.ACTIVIDAD 1.1.- EXTRACCIN DE LOS PIGMENTOS.- Pesar 6 grs de hojas de espinaca.
- Colocarlas en un mortero y molerlas.
- Agregar directamente a las hojas maceradas 10 mL de Acetona y dejar reposar
durante 5 minutos.
- Filtrar el extracto por papel de filtro en embudo cnico, dentro de un matraz
Erlenmeyer de 100 mL y guardar este extracto.
ACTIVIDAD 1.2.- CROMATOGRAFA DE LOS PIGMENTOS.- Dentro del matraz Erlenmeyer conteniendo el extracto acetnico de los pigmentos
vegetales, colocar una tira de papel de filtro de 3x 9 cm de largo con ayuda de las
pinzas (evite manipular el papel de filtro directamente con los dedos).
-Tapar la boca del matraz con un vidrio de reloj.
- Dejar que el extracto de los pigmentos ascienda por el papel, durante 10 a 15
minutos aprox.
- Sacar el papel del matraz, dejar secar al aire unos instantes y luego recortar las
zonas que presenten diferente coloracin.
- Colocar cuidadosamente con una pinza el trozo de papel RECORTADO dentro de
un tubo de ensayo.
- Agregar 4 mL de acetona sobre el pedazo de papel y dejar reposar por 5 minutos
-Retirar cuidadosamente el lquido y traspasarlo al tubo de ensayo pequeo para
leer en el espectrofotmetro.
A qu se deben los diferentes colores observados en el papel de filtro?
ACTIVIDAD 2
ESPECTROFOTOMETRA DE PIGMENTOS FOTOSINTTICOS.ACTIVIDAD 2.1.- ABSORBANCIA DE LOS PIGMENTOS FOTOSINTTICOS.
- Encender el Espectrofotmetro para que se estabilice. En el tablero principal
presionar el botn test y luego en el men principal seleccione la opcin
mltiples longitudes de ondas.
- Seleccione las opciones que le permitan hacer un barrido de la absorbancia de
sus muestras en el rango de longitudes de onda de 350 a 700 nm, registrando
valores a cada 20 nm.
- Coloque dentro del espectrofotmetro un tubo de vidrio conteniendo slo
acetona, en la celda correspondiente al blanco (B). Cere el espectrofotmetro
con este solvente.
- Introduzca los tubos conteniendo sus muestras y comience a registrar sus
lecturas de absorbancia.
- Complete la siguiente tabla.
- Con los valores de absorbancia y diferentes longitudes de onda construya los
espectros respectivos para sus dos muestras.
- Indique en sus espectros el o los peaks de mxima absorbancia y a qu
pigmentos corresponderan. Analice e interprete los espectros de absorcin
obtenidos por Usted y compare con datos de la literatura.
A qu se debe la absorbancia de los diferentes pigmentos fotosintticos?
A qu se deben los diferentes colores que presentan los diferentes pigmentos?
Qu funcin cumplen las clorofilas en el proceso de fotosntesis?
Qu funcin cumplen los carotenoides en el proceso de fotosntesis?
Tabla 1 :
Longitud de Onda (nm)
340
360
380
400
420
440
460
480
500
520
540
560
580
600
620
640
660
680
700
ABS
ABS
Cromatografa en Columna
La cromatografa en columna es la tcnica ms utilizada para separar e
identificar compuestos de inters biolgico de una mezcla. Se emplea un medio a
travs del cual fluye un lquido provocando una migracin diferencial de los
compuestos que se aplican. Los solutos se distribuyen entre la fase mvil y la fase
estacionaria de acuerdo a las caractersticas de la fase estacionaria. sta se encuentra
empacada en una columna de vidrio.
Fase mvil
Muestra
Fase estacionaria
Protenas
separadas
Los
distintos tipos de cromatografa en columna se clasifican en su mayora de acuerdo a
las caractersticas de la fase estacionaria.
As tenemos la cromatografa de intercambio inico, en el cual la fase estacionaria
posee carga neta positiva o negativa, cromatografa de exclusin molecular, en la que
tenemos un gel con un entramado o malla de un tamao conocido, que retiene ciertas
protenas y excluye otras, y la cromatografa de afinidad, en la que la fase estacionaria
posee un sustrato de afinidad que permite que se una un solo compuesto o protena
de la muestra a la columna, excluyendo a los dems.
Otras tcnicas cromatogrficas se clasifican de acuerdo a su equipamiento,
como la cromatografa lquida de alta resolucin (HPLC, por sus siglas en ingls), que
ocupa pequeas columnas de acero que permiten el paso de la fase mvil a altas
presiones, y la cromatografa de gases, en la que la fase mvil es un gas.
En este laboratorio abordaremos la cromatografa en papel como tcnica para
separar pigmentos presentes en muestras biolgicas.
Anexo 5:
Introduccin tcnica de anlisis de biomolculas (cidos nucleicos y protenas)
electroforsis, tipos y aplicaciones.
EXTRACCIN Y ELECTROFORESIS DE PROTEINAS DE PLANTAS.
INTRODUCCION.La electroforesis es una tcnica que mide la tasa de migracin de molculas cargadas
en un medio que contiene lquido cuando se aplica un campo elctrico al lquido. Las
molculas cargadas negativamente (aniones) emigrarn hacia el electrodo positivo
(nodo), y las molculas cargadas positivamente (cationes) emigrarn hacia el
electrodo negativo (ctodo). Varios factores afectan la tasa de migracin, como la
potencia del campo elctrico y la accin de tamiz molecular del medio en que se
realizar la migracin. Como las protenas y cidos nucleicos estn electricamente
cargados, la electroforesis se ha utilizado extensamente para proporcionar
informacin del tamao, la conformacin y la carga neta de stas macromolculas.
En la prctica, la electroforsis emplea un sistema de tampones, un medio ( gel de
almidn, gel de agarosa o gel de poliacrilamida) y una fuente de electricidad. Se
aplican las muestras y la corriente elctrica elctrica pasa por el sistema durante un
tiempo adecuado. Despus de la migracin de las molculas, el gel puede tratarse con
colorantes selectivos para ver la localizacin de los componentes separados (Klug y
Cummings, 1999).
Uso de electroforesis en la identificacin de las variedades.
De acuerdo a su potencial gentico las diversas especies vegetales desarrollan
sustancia qumicas especficas detectables segn un adecuado estado electrofortico.
De este modo la estabilidad de protenas y enzimas solubles en agua, otorga la
posibilidad de estudios taxonmicos.
El principio bsico es la migracin de partculas coloidales (protenas) como
consecuencias de ser sometidas a un campo elctrico. Esta migracin de depende de
la carga elctrica neta de la partcula o molcula, de su configuracin, de grado de
disociacin, pH, y el tipo o medio de soporte que se utilice.
Estas partculas que han migrado de acuerdo al proceso electrofortico, tendrn
caractersticas especficas tales como: tamao (peso molecular), intensidad de banda
(cantidad de protena), nmero para cada variedad y que sern reveladas con los
colorantes apropiados.
En el caso de investigacin clonal de especies como la papa y relativo a la identificacin
de las protenas, estas se caracterizan por la presencia de todas o algunas de cuatro
bandas principales ubicadas en el tercio superior del sector catdico del gel de soporte
y por muchas bandas finas en el sector andico.
Esquema tpico de un foregrama de papa con sus cuatro bandas principales.
A
- : CATODO
+: ANODO
1
+
-
2
+
+
3
+
+
-
combinaciones
4
5
+
+
+
+
+
+
6
+
+
-
7
+
+
+
-
8
+
+
+
+
9
+
-
Se retira el gel, se corta la parte donde estuvo inserta la peineta. Sacar una muesca
arriba a la izquierda (para saber el lado). Y poner en solucin de teido.
Solucin de Teido: solucin de teido: Acido tricloroactico 30 g en 800 ml de agua
destilada + 200 ml de metanol + 70 ml de cido actico. Teir agitando en 150 ml de
solucin de teido + 0.9 ml de azul de coomasie brillante (al 1%). Dejar 3 horas
tiiendo en agitacin constante.
Lavar el gel de tres a cuatro veces (durante 30 minutos cada vez), en agitacin en
solucin de agua, metanol y acido actico en proporcin 14:6:1.
REACTIVOS:
Na2S2O5 ( metabisulfito)
Na2 SO3 (sodio sulfito anhidro )
Tris
Acido brico
Acrilamida
Methylen-bis-acrilamida
Themed
Persulfato de amonio
Amido negro ( Indicador )
Acido tricloroactico
Azul de coomasie
Metanol
Acido actico
BIBLIOGRAFIA.
STEGEMAN, H Y V. LOESCHCKE, 1976. Index Europischer Kartoffel-sorten;
Bestimmung durch elecktrophoretische Spektren. Paul Parey, Berlin 214 p.
COUTO, A., PETERS, I., BRUNE, W. Y G, CANDIA. 1991. Electroforese de protena e isoenzimas
de fungos e essencias florestais. Universidad Federal de Vicosa. 242 p.
GRIFFITHS, AJF et al. 1996. An Introduction to Genetics Analysis. WH Freeman & Company.
Nfew York, USA.KLUG, W. y M. CUMMINGS. 1999.
Prentice Hall
Anexo 6:
Espectrofotometra aplicada a la cuantificacin de protenas. Mtodos de
cuantificacin y aplicaciones.
Determinacin de la concentracin de protenas.
Objetivo: Conocer y determinar la concentracin de protenas que estn presentes en
muestras biolgicas, segn el mtodo de Biuret.
Introduccin
Las protenas son los componentes principales de todos los seres vivos, y si
queremos estudiar protenas en particular, lo primero que tenemos que conocer es la
concentracin de protenas totales en una muestra biolgica.
La longitud de onda donde tenemos mximo de Absorcin de luz de las
protenas est cercano a los 220 nm, lamentablemente, las bases nitrogenadas del
DNA y, RNA, coenzimas y una multitud de compuestos biolgicos tambin comparten
ese mximo de absorcin, por lo que se necesita un mtodo que desplace el mximo
de absorcin de luz de las protenas a una longitud de onda donde no tengamos
interferencia con otros compuestos biolgicos.
Dado que las protenas son totalmente heterogneas entre s, no existe un
mtodo que pueda calcular en forma absoluta la concentracin de protenas en una
muestra, pues depender de que tipo de protena utilicemos como Standard y la
reactividad de sta al mtodo. As, la eleccin del mtodo estar dada por los
materiales que dispongamos en el laboratorio y la sensibilidad que queremos. Por
ejemplo, para muestras relativamente concentradas de protenas, como el plasma
sanguneo, pensamos en el mtodo de Lowry o el de Biuret, para muestras ms
diluidas, como homogenados celulares, seleccionaremos el mtodo de Bradford o el
del cido Bicinconnico (BCA).
El reactivo de Biuret es el sulfato cprico diluido en solucin alcalina. Los
compuestos que contienen dos o ms enlaces peptdicos tales como el Biuret
(NH2CONHCONH2) y protenas, forman complejos rgano metlicos con los iones
cpricos para dar un color prpura caracterstico. Los dipptidos y todos los
aminocidos con excepcin de la histidina, serina y treonina, no reaccionan con Biuret.
Protocolo
Prepare una batera de tubos que incluyan el blanco, los cinco tubos de la curva
de calibrado y el tubo de muestra, como lo indica la tabla:
Reactivos
Blanco
Std 1
Std 2
Std 3
Std 4
Std 5
Muestra
Gelatina (ml)
H2O destilada (ml)
Reactivo de Biuret (ml)
-0,5
2,50
0,1
0,4
2,50
0,2
0,3
2,50
0,3
0,2
2,50
0,4
0,1
2,50
0,5
-2,50
Muest
ra
0,5
2,50
Cuestionario
1.- Si tuviera muestras biolgicas con protenas y alto contenido de grasas. Cmo
tratara a su muestra para la determinacin de protenas? Explique con detalle.
2.- Qu otras tcnicas se pueden utilizar para la determinacin de protenas?
3.- Si tenemos una muestra biolgica animal y una vegetal. Es posible encontrar
diferencias sustanciales en la concentracin de protenas totales entre las dos
muestras? Fundamente.