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htm
https://books.google.com.mx/books?
id=WuXjJltGSdsC&pg=PA506&lpg=PA506&dq=genes+rec&source=bl&ots=KKB
1BCzbAg&sig=ShvHLVjGKnpKQLz8AvIA2yTCaU8&hl=es&sa=X&ved=0ahUKEwjI
h4LpgcDOAhUCJCYKHaUZBfgQ6AEIJzAB#v=onepage&q=hfr&f=false
Romero Cabello
https://books.google.com.mx/books?
id=Wv026CUhR6YC&pg=PA659&lpg=PA659&dq=genes+rec&source=bl&ots=n
5uqkAzHJ8&sig=1N9A36EfZDP6uvDOMdfmYbnNn0&hl=es&sa=X&ved=0ahUKEwil5djKgsDOAhWHYiYKHXzLAUoQ6AE
IRTAF#v=onepage&q=genes%20rec&f=false
http://www.microcsalud.us.es/web/docencia/grado/biomedicina-basicaexp/virologia/practicas/gion-practica-virologia-ciclo-01.pdf
Glosario
http://www.biorom.uma.es/contenido/Glosario/D.html
Bacterifago M13:
http://www.cultek.com/inf/otros/soluciones/DNA-recombinante/Tecnica%20DNA
%20recombinante.pdf
duplex
: bicatenario,
hbrido.
Adjetivo que se aplica a los cidos nucleicos de dos cadenas o hebras. Segn la clase de nucletidos que componen
estas
cadenas
(ribonucletidos,
desoxirribonucletidos)
admite
distintas
traducciones:
a) duplex RNA-DNA (ADN-ARN hbrido, doble hlice hbrida) cuando el cido nucleico est formado por una hebra
de
ADN
y
otra
de
ARN;
b) duplex DNA (ADN bicatenario) cuando el cido nucleico est formado por dos hebras de ADN (vase doublestranded
DNA);
c) duplex RNA (ARN bicatenario) cuando el cido nucleico est formado por dos hebras de ARN (vase doublestranded
RNA).
Observacin: los libros de texto tambin recogen las variantes doble y dplex. No son incorrectas desde el
punto de vista semntico, pero s mucho menos frecuentes que el adjetivo bicatenario.
BACTERIFAGO M13
Cuando el fago M13 infecta a una clula bacteriana, la cadena sencilla (cadena
+) se replica y produce una molcula de doble cadena denominada forma
replicativa (RF). Las molculas RF pueden considerarse similares a los
plsmidos, pudindose insertar DNA exgeno en sitios de restriccin nicos
presentes en el DNA del fago. Cuando se reinsertan en clulas bacterianas, las
molculas RF se replican y producen cadenas sencillas (+), en las que hay una
cadena del DNA insertado. La clula hace salir los clones de DNA de cadena
sencilla que produce M13, que pueden recuperarse y utilizarse directamente
para su secuenciacin, o como molde para alteraciones mutacionales de la
secuencia clonada.
Tambin se utilizan otros bacterifagos como vectores, entre los que destaca el
fago de cadena sencilla M13. Cuando M13 infecta a una clula bacteriana, la
cadena sencilla (cadena +) se replica y produce una molcula de doble cadena
denominada forma replicativa (RF). Las molculas RF pueden considerarse
similares a los plsmidos, pudindose insertar DNA exgeno en sitios de
restriccin nicos presentes en el DNA del fago. Cuando se reinsertan en
clulas bacterianas, las molculas RF se replican y producen cadenas sencillas
(+), en las que hay una cadena del DNA insertado. La clula hace salir los
clones de DNA de cadena sencilla que produce M13, que pueden recuperarse y
utilizarse directamente para su secuenciacin, o como molde para alteraciones
mutacionales de la secuencia clonada.
Virus M13
Fago M13
Fago M13
Grupo:
Familia:
Inoviridae
Gnero:
Inovirus
Especie:
El fago M13 es un bacterifago filamentoso compuesto por una nica molcula de ADN
monocatenario circular la cual tiene aproximadamente 6407 nucletidos de longitud; esta
molcula se encuentra encapsulada en una cubierta proteica formada por aproximadamente
2700 copias de la protena mayor de recubrimiento P8, y encapuchada en los extremos por
cinco copias de dos diferentes protenas de recubrimiento menores (P9, P6, P3). La protena
de recubrimiento menor P3 permite que el fago se una a un receptor presente en la punta de
los pilli del hospedador Escherichia coli. La infeccin con bacterifagos filamentosos no es
letal para las bacterias; sin embargo la infeccin causa placas turbias en los cultivos de E. coli.
Aunque no se trata de un virus ltico, si se ha observado una disminucin en la velocidad de
reproduccin de las clulas infectadas. Los plsmidos M13 llamados fagmidos son utilizados
parte exterior de la cubierta. En el otro extremo del fago hay cinco copias de la protena pIII
(p3) expuestas en la superficie y de la protena accesoria pVI (p6) la cual se encuentra un
poco menos expuesta. Estas forman el extremo redondeado del fago y son las primeras
protenas en interaccionar con el hospedador E. coli en el momento de la infeccin. La
protena p3, es adems el ltimo punto de contacto con el hospedador cuando la partcula
viral abandona la superficie bacteriana.
Infeccin[editar]
Los fagos filamentosos utilizan una estructura bacteriana conocida como pilus F para infectar
a E. coli. La protena p3 del extremo del fago se ancla a la protena To1A del pilus bacteriano
permitindole al fago transferir su genoma hacia el citoplasma de la bacteria, donde las
enzimas de la maquinaria metablica bacteriana convierten el genoma formado por una
cadena simple de ADN (llamada cadena positiva o +), en la forma replicativa (FR) de ADN
doble cadena. Esta forma replicativa sirve adems de molde para la expresin de los genes
virales.
complementaria formando de esta manera mltiples copias del ADN viral en su forma de doble
cadena. La protena pV (p5) compite con la formacin de ADN de doble cadena secuestrando
copias sencillas de la cadena + formando un complejo nucleoproteico que servir de ncleo
para la formacin de nuevas partculas virales.
La protena Rep del husped es una helicasa que ayuda a desenredar el ADN en el punto
donde se encuentra la muesca. La ADN Pol III del anfitrin utiliza extremo 3' libre como un
cebador para la sntesis de una nueva hebra +, mientras que la vieja se quita. Una vez
completada la replicacin se obtienen dos molculas de ADN: una circular de doble cadena y
una de cadena sencilla, sobre esta ltima acta la protena p2 soldando el extremo 5 'y 3' por
medio de una reaccin de transesterificacin recreando de esta forma una hebra +. Este
proceso contina hasta que se empieza a acumular p5. Esta protena se une al ADN de
cadena sencilla + y evita que se siga replicando.
Existe adems una protena adicional codificada por el genoma del fago, la pX (p10), que es
importante para regular el nmero de genomas de doble cadena en el hospedador bacteriano.
Sin la protena p10 no se acumulan cadenas +. Lo que resulta particularmente interesante con
respecto a esta protena es que es idntica a la porcin carboxilo terminal de p2, ya que el gen
que codifica para p10 se encuentra de hecho dentro del gen p2 y la protena surge de
una iniciacin diferencial de la transcripcin dentro del gen de p2. Esto hace que la
manipulacin de p10 se encuentre inextricablemente unida a la manipulacin de p2 (un
verdadero dolor de cabeza desde el punto de vista de la ingeniera) pero esto logra una
estructura gentica sumamente compacta y eficiente en la naturaleza.
Excresin[editar]
Para iniciar la secrecin del fago, dos de las protenas menores de la envoltura: p9 y p7,
interactan con el complejo formado por ADN monocatenario y p5 a la altura de la regin del
ADN llamada secuencia de empaque (tambin conocida como secuencia PS). Entonces las
protenas p5 que recubren la hebra de ADN monocatenario son reemplazadas por las
protenas p8 que se encuentran empotradas en la membrana celular de la bacteria y el fago
en crecimiento es "hilado" al atravesar el canal formado por p1, p11 y p4. Este proceso de
reemplazo de p5 por p8 explica la evidencia de microfagos presentada anteriormente
indicando como es que el tamao de la partcula viral se encuentra determinado por el nmero
de bases empacadas dentro del fago. Una vez que el ADN viral se encuentra completamente
recubierto con p8, se finaliza la secresin aadiendo los capuchones p3/p6 y el fago se
desprende de la superficie bacteriana.
Replicacin en E. coli
Debajo se listan los pasos involucrados en la replicacin del fago M13 en el anfitrin E. coli.
La ADN girasa, una topoisomerasa tipo II, acta sobre el ADN de doble cadena y
cataliza la formacin de superenrrollamientos de ADN doble cadena.
Una protena del fago, pII, hace una muesca en la cadena RF (+).
El extremo 3'-hidroxilo acta como cebador en la creacin de una nueva cadena viral.
Los dmeros pV unen a las cadenas simples de ADN recin sintetizadas, y previenen
la conversinn de estas a ADN RF.
La replicacin del ADN cambia hacia la sntesis de ADN viral (+) de simple cadena.
Los complejos pV-ADN sirven como sustrato para la reaccin de ensamble del fago.
Otras investigaciones
George Smith, entre otros, mostr que los fragmentos producidos por la endonucleasa EcoRI
pueden ser soldados en un sitio Bam nico de los fagos filamentosos f1, y por lo tanto resultar
expresados en el gen III; cuya protena pIII resulta accesible desde el exterior. ste no es el
nico sitio Bam existente en el gen III de M13. Se puede modificar al M13 para obtener
diferentes sitios de insercin accesibles, hacindolo til en su flexibilidad para el manejo de
insertos de diferente tamao. Debido a que el sistema de expresin M13 permite una gran
flexibilidad en la localzacin y nmero de protenas recombinantes que pueden obtenerse del
fago, es una herramienta popular para la construccin e investigacin de nanoestructuras. 2 por
ejemplo, el fago puede ser genticamente modificado para expresar protenas diferentes en
sus extremos y en su segmento medio. Esto puede ser utilizado para ensamblar estructuras
tales como nanocables de oro u xido de cobalto para la fabricacin de bateras,3 o para
empacar nanotubos en forma de manojos orientados para su utilizacin en celdas
fotovoltaicas.4
MUTANTE
SUPRESO
RA
Mutante condicional
Mutante que expresa el fenotipo normal bajo determinadas condiciones (permisivas) y el
fenotipo mutante bajo otras condiciones (restrictivas).
Existen tres codones de terminacin, que reciben distintos nombres. UAG, el primero
descubierto, se conoce como codn mbar; UGA, como codn palo; y UAA, como
codn ocre.3 4
-Por tRNA supresores: esto ocurre cuando la mutacin afecta a un tARN. Este nuevo tARN
mutado puede incorporar un aa en lugar de un codn de parada al leer la secuencia de ARN.
Esto es debido a una mutacin en la regin del ARN que codifica para el anticodn en el
tRNA. Este proceso no es completamente efectivo, ya que parte se sintetizar como protena
truncada y parte como normal (en este caso participar el tRNA mutado). Las cepas en las
que existe este doble mutante tienen un crecimiento lento debido a la falta de protena correcta
en cantidad suficiente.
Relacionados
https://books.google.com.mx/books?id=ALR9bgLtFhYC&pg=PA476&lpg=PA476&dq=mutaci
%C3%B3n+supresora&source=bl&ots=droS_hopsy&sig=vgjGqbg4_ILF4cpvZuVck7e7ADQ&hl=es&sa=X&sqi=2&ved=0ahUKEwipypuBp9HOAhWJbSYKHQ
nODrkQ6AEIPjAF#v=onepage&q=mutaci%C3%B3n%20supresora&f=false
https://books.google.com.mx/books?
id=NVVtJcqvVxgC&pg=PA150&lpg=PA150&dq=mutante
+condicional+AMBAR&source=bl&ots=OIDUFB3PP&sig=GuzBDOc94fymkrmfAgQc1F2H2cI&hl=es
&sa=X&ved=0ahUKEwjH45jEk8rOAhUJdyYKHYryCTAQ6
AEIIDAB#v=onepage&q=mutante%20condicional
%20AMBAR&f=false
http://depa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/Clase09_23
097.pdf
encontraba cerca del origen como la histidina. Para las cruzas que contenan
cepas con Rec- que fueron la cruza JC4046 x KL323 y la cruza CSH62 X KL323,
las cepas receptoras al no tener un sistema recombinante, o sea, que no
puedan poder integrar un DNA ajeno al genmico, se esperaba que no se
encontraran transconjugantes, sin embargo en la cruza de JC4046 x KL323 se
encontr un marcador para la prolina, esto se debi a que en la cepa donadora
se pueden formar Hfr temporales para poder transferir el DNA y dependiendo
del lugar donde se pegue el marcador en el DNA de la receptora, ste ser la
frecuencia con la que se transfiere, y por ese motivo slo en un medio se
encontr que las transconjugantes resultantes tuvieran un marcador para la
Prolina. Para la experiencia que requera el fago, no se obtuvo resultado, pero
sin embargo se esperaba que con el fago M13 hubiera un pequeo halo de
inhibicin que realmente era un halo de crecimiento tene de las bacterias, y
que al utilzar este fago, se esperaba poder saber el tipo sexula de las
trasnconjugantes obtenidas, ya que el fago al ser tener su sitio de fijacin en la
protena pilina del extremo del pili, se esperaba que con esto se pudiera
indentificar a las sexductantes. Conclusiones En la cruza CHS62 x RC712 el
marcador transferido de mayor frecuencia es el de Prolina. No hay
recombinacin en la cruza de una Hfr y una Rec-. En la cruza JC4046 x RC712
el marcador trasnferido de mayor frecuencia es el histidina. Bibliografa. 1.
BD..Davis, R.Dulbecco Tratado de microbiologa, Salvat editores, S.A, Espaa
1972 (204-214). 2. http://cienciasnaturales.es/CONJUGACION.swf. 3.
http://cvb.ehu.es/open_course_ware/castellano/salud/tecnicasmol/tema2pdf.pdf
AGAR
ES
El ensayo de formacin de colonias en agar blando es una tcnica ampliamente utilizada para
evaluar la transformacin celular in vitro. Histricamente, se utiliz otro ensayo, el ensayo
clonognico, descrito por Pucket al. En 1956 para evaluar la capacidad de las clulas para
formar colonias 1. En esta tcnica, las clulas se dispersaron en una placa de cultivo y se
cultivaron en la presencia de clulas alimentadoras '' o medio acondicionado para proporcionar
factores de crecimiento necesarios. La limitacin de esta tcnica es que slo se proporciona
informacin con respecto a la formacin de colonias. Las clulas normales se impide el
crecimiento independiente de anclaje, debido a un tipo particular de muerte apopttica,
denominado anoikis 2.Sin embargo, las clulas transformadas tienen la capacidad de crecer y
dividirse sin unirse a un sustrato. Para sacar provecho de este concepto, los investigadores
desarrollaron el ensayo de formacin de colonias en agar blando. El ensayo de formacin de
colonias en agar blando desde entonces ha sido modificada, en aos ms recientes, para
abordar specific necesidades. Una variacin consiste en la incorporacin de colorante
fluoromtrico para permitir de alto rendimiento recuento de colonias. Otra variacin implica el
uso de solucin especializada agar para permitir la recuperacin de clulas viables despus
de la formacin de colonias cuando se necesitan muestras de protenas o de ADN.
En el ensayo de formacin de colonias en agar blando tradicional, las clulas se cultivan en
una capa de agar blando mezclado con medio de cultivo celular que descansa sobre otra capa
de agar blando, tambin mezclado con medio de cultivo celular, pero que contiene una mayor
concentracin de agar. Esto evita que las clulas se adhieran a la placa de cultivo, sin
embargo, permite que las clulas transformadas para formar colonias visibles. El fundamento
de esta tcnica es que las clulas normales dependen de contacto clula a la matriz
extracelular para ser capaz de crecer y dividirse. Por el contrario, las clulas transformadas
tienen la capacidad de crecer y dividirse independientemente de su entorno. Por lo tanto, las
clulas capaces de formar colonias de una manera independiente de anclaje fueron
considered a transformar y cancergeno. El objetivo general de este mtodo es medir esta
capacidad en las clulas de una manera semi-cuantitativa y rigurosa.
https://books.google.com.mx/books?
id=TX4UDZaKIUsC&pg=PA555&lpg=PA555&dq=tipos+sexuales+de+escherichia+coli&source
=bl&ots=NmOX2KrDSD&sig=suh605pHWpoB3GkwMbro2tG93_Q&hl=es&sa=X&ved=0ahUKE
wiHoK6B39LOAhWCSCYKHWSbB3oQ6AEITTAK#v=onepage&q=tipos%20sexuales%20de
%20escherichia%20coli&f=false
http://www.ugr.es/~eianez/Microbiologia/18conjuga.htm