TIPS

Recientemente se encuentran en muchas especies animales y vegetales,

Pptidos policatinicos naturales son activos contra un amplio espectro de
bacterias. Estos pptidos suprimir las infecciones bacterianas con un
mnimo txico y efectos secundarios alrgicos. Por lo tanto, los pptidos
antimicrobianos puede potencialmente ser aplicados en la medicina y la
agricultura, nuevos antibiticos seguras.
Pptidos antimicrobianos codificados por genes son un componente
importante de la defensa del husped en animales, desde insectos hasta los
mamferos. Ellos no se dirigen a receptores moleculares especficos en el
superficie microbiana, sino ms bien asumir estructuras anfipticas que les
permiten interactuar directamente con las membranas microbianas, que
pueden permeabilizar rpidamente. por lo que se perciben como una
prometedora solucin al creciente problema de la resistencia microbiana a
los antibiticos convencionales. UN particularmente abundante y extendida
clase de pptidos antimicrobianos son los que tienen anfiptico, dominios ahelicoidales. Debido a su tamao relativamente pequeo y la accesibilidad
sinttica, estos pptidos tienen sido ampliamente estudiado y han generado
una cantidad sustancial de relacin estructura-actividad (SAR) de datos. En
esta revisin, a-helicoidales pptidos antimicrobianos son considerados
desde el punto de vista de seis parmetros estructurales y fisicoqumicas
interrelacionados que modulan su actividad yespecificidad: secuencia,
tamao, estructuracin, carga, anfipaticidad, y la hidrofobicidad.
Las AMP relativamente cortos, lineales son considerados aqu generalmente
no estructurada en solucin (Figura 1). Siendo catinico, que se sienten
atrados electrostticamente a negativa superficies cargadas microbianas.
En el caso de bacterias gramnegativas bacterias, interactan inicialmente
con el lipopolisacrido (LPS) hoja externa rica en el exterior de membrana,
que pueden atravesar desplazando iones de magnesio y la interrupcin de
puente covalente las interacciones entre las molculas de LPS, alterando as
la ordenada disposicin supramolecular el prospecto.
La superficie de las bacterias gram-positiva es cargado negativamente
debido a la presencia de los cidos teicoicos y teicurnico, y de grupos
carboxilo de aminocidos en los peptidoglicano de varias capas, que tienen
que atravesar. Una vez que la membrana citoplasmtica microbiana se
alcanzaron, los pptidos inicialmente interactan con el negativamente
cargada grupos de cabeza de fosfolpidos de la externa prospecto, entonces
ellos asumen una hlice anfiptica conformacin que les permite insertar el
hidrfobo enfrentar en la bicapa. Estos datos pueden visualizarse como
flotante como troncos con sus ejes paralelos a la membrana superficie,
donde pueden acumularse para formar agregados balsa similar. Esta
interaccin electrosttica inicial de interaccin hidrfoba seguido de la
particin confiere a los AMP la caracterstica nica de ser altamente soluble
en agua y an capaz de interactuar fuertemente con bicapas de fosfolpidos.
No es tan fcil para definir la anfipaticidad de a-helicoidal AMP, ya que es
definir carga o hidrofobicidad,
ya que a menudo tienen colas no
estructuradas de diferente longitudes que no contribuyen a este efecto en

una manera predecible. Una comparacin directa entre los diferentes

pptidos es posible slo mediante la limitacin del anlisis a un tramo de 20
residuos N-terminal que normalmente coincide con un dominio helicoidal
anfiptica. Los resultados se muestran en una plot188 Eisenberg (Figura 6),
en el que el momento hidrofbico residuo medio est relacionado a la
hidrofobicidad media.
Tossi, A., Sandri, L., and Giangaspero, A. (2000). Amphipathic,
Antimicrobial Peptides. Biopolymers (Peptide Science), Vol. 55, 430.

a-Helical

IDPs
La reaccin ms comn de una protena globular a los cambios
medioambientales es la desnaturalizacin; es decir, la prdida de la
actividad biolgica causada por la disminuida o distorsionada estructura 3D
[4]. Desnaturalizacin de las protenas no siempre es equivalente a
completar despliegue, y diversas conformaciones parcialmente plegadas se
pueden formar en condiciones ligeramente desnaturalizantes, lo que indica
que una de las propiedades intrnsecas de una cadena de polipptido es su
capacidad adoptar diferentes intermedios estables.
De hecho, la falta de Estructura extendidos PDI / IDPRs se determina por la
fuerte repulsin electrosttica entre los numerosos restos cargados de
forma similar y la atraccin hidrfoba dbil entre los residuos hidrofbicos
con baja representacin. Estos sesgos de aminocidos tambin definen la
oscura conformacionales de las respuestas extendidas PDI / a IDPRs
cambios en su entorno.
Debido a su alto contenido de residuos cargados, IDPs extendidos poseen la
respuesta "resultado" de cambios en el pH, donde los valores de pH
extremos provocan parcial plegado de una cadena polipeptdica y la
formacin de un premolten glbulo conformacin [60, 75-78]. Muchos PDI
extendidos conservan su mayora conformacin desordenada y alta
solubilidad en condiciones muy cidas.
El descubrimiento de la abundancia natural de los desplazados internos
funcionales y las protenas hbridas con IDPRs funcionales est remodelando
ciencia de las protenas moderna. Estas protenas y son regiones muy
diferente de las protenas intrnsecamente plegables y dominios en
mltiples niveles. PDI / IDPRs tienen reconocible secuencias de aminocidos
con mltiples sesgos. Son caracterizados por la heterogeneidad estructural
excepcional, poseer una multitud de funciones trastorno dependiente, y
estn implicados profundamente en varios patolgicos procesos. Todo esto
define PDI / IDPRs como muy atractivo objetivos de la investigacin
multifocal. Esta revisin muestra que comprensin del fenmeno trastorno
intrnseca de protenas se puede utilizar en la biotecnologa para descubrir y
caracterizar los unfoldomes de diferentes organismos.
Uversky,
V.N.
(2014).
Proteins
without
unique
3D
structures:
Biotechnological applications of intrinsically unstable/disordered proteins.
Biotechnology Journal, 10, 356366

Funcin que domin el campo de la biologa molecular para muchos aos

est experimentando recientemente una revisin a fondo. Los mltiples
funciones de forma nativa sin plegar o intrnsecamente desordenados
protenas ahora se han reconocido como importante muchos procesos
biolgicos, como la regulacin, el reconocimiento, la sealizacin celular y
celular cycle.
El estado desplegado de esta grupo de protenas no significa un requisito
para la actividad chaperones moleculares de superar una gran barrera
energtica para alcanzar un mnimo de energa global, sino una verdadera
energticamente favorables state.6,7 desplegada La forma nativa desdobl
Estado tambin es distinto del estado de mal plegada en la que las
protenas
auto-ensamblan
para
formar
grandes
agregados
supramoleculares. 8,9 Sin embargo, en la mayora de los casos, toda la
protena no es desordenados en lugar protenas tienen regiones no
estructurados, los cuales participar en varios procesos biolgicos
interactivos. el intriganteparte de las protenas no plegadas de forma nativa
es el trastorno / Para la transicin inducida durante la unin de concreto
objetivos en vivo. La falta de estructura intrnseca proporciona funcional
ventaja a la protena para interactuar con varios diferentes objetivos y
tienen una rpida rotacin, lo que permite precisa respuesta de la clula a
los cambios de entorno.
Helix Amphiptic
El anfiptico a-hlice es un motivo de unin a la membrana se encuentra en
muchos protenas y pptidos. Se ancla protenas perifricas en las
membranas 1-3 y sirve como un agente de membrana de desestabilizacin
en el caso de antibacterial pptidos 4, o como promotor de la curvatura de
la membrana en el caso de capas de protena 5-7. La segregacin de
hidrfobo y polar residuos en dos caras opuestas de la a-hlice se adapta
muy bien al la qumica de la interfaz de la membrana. Por lo tanto, la
anfiptico a-hlice adopta una orientacin paralela con respecto al plano de
la membrana, con su eje central colocado a nivel del fosfolpido grupo
glicerol: residuos hidrofbicos estn incrustados dentro de acilo graso
cadenas y residuos polares enfrentan cabezas polares de lpidos 8. Las dos
caras de la a-hlice contribuir a la adsorcin de la membrana. En particular,
la citoslica prospecto de las membranas biolgicas se enriquece en carga
negativa lpidos anfipticos, y a-hlices generalmente contienen residuos
positivos en sus caras polares, por lo que la adsorcin de la membrana es
accionado tanto por la efecto hidrfobo y por interacciones electrostticas.
Hiptesis de trabajo es que la falta de interacciones electrostticas entre el
motivo Alpes y membranas, debido a la abundancia de serina y treonina en
la cara polar, hace una curvatura requisito previo para la adsorcin de la
membrana y hace que este motivo un sensor de curvatura de la membrana.
Esto contrasta con las hlices anfipticas que son ricos en restos bsicos,
que puede promover en lugar de sentido curvatura de la membrana debido
a una fuerte interaccin electrosttica supera el costo de lpidos difusin de
molculas apar.

A primera vista, una hlice anfiptica que no es rica en restos bsicos no

parece ptima para interactuar con carga negativa membranas. Hemos
demostrado que este diseo aparentemente imperfecta se puede convertir
en un activo funcional: la capacidad de detectar la membrana curvatura. El
uso de un enfoque de la bioinformtica, encontramos numerosas protenas
que incluyen un potencial motivo helicoidal anfiptico con una cara polar
rica en residuos de serina y treonina. En tres casos, demostraron que estos
motivos Alpes como son capaces de reconocer curvatura de la membrana.
Esto debera ayudar en la comprensin de la funcin de las protenas
correspondientes.
Drin, G., Casella, J.F., Gautier, R., Boehmer, T., Schwartz, T.U., and Antonny,
B. (2007). A general amphipathic a-helical motif for sensing membrane
curvature. Nature structural & molecular bilogy, 14(2); 138-146
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