Enzima

Estructura de la triosafosfato isomerasa. Conformacin en forma de diagrama de

cintas rodeado por el modelo de relleno de espacio de la protena. Estaprotena es una
eficiente enzima involucrada en el proceso de transformacin de azcares en energa en
las clulas.
Las enzimas son molculas de naturaleza proteica y estructural que catalizan reacciones
qumicas, siempre que seantermodinmicamente posibles: una enzima hace que una
reaccin qumica que es energticamente posible (ver Energa libre de Gibbs), pero que
transcurre a una velocidad muy baja, sea cinticamente favorable, es decir, transcurra a
mayor velocidad que sin la presencia de la enzima. En estas reacciones, las enzimas
actan sobre unas molculasdenominadas sustratos, las cuales se convierten en
molculas

diferentes

denominadas

productos.

Casi

todos

los

procesos

en

las clulas necesitan enzimas para que ocurran a unas tasas significativas. A las
reacciones mediadas por enzimas se las denomina reacciones enzimticas.
Debido a que las enzimas son extremadamente selectivas con sus sustratos y su
velocidad crece solo con algunas reacciones, el conjunto (set) de enzimas sintetizadas en
una clula determina el tipo de metabolismo que tendr cada clula. A su vez, esta
sntesis depende de la regulacin de la expresin gnica.
Como todos los catalizadores, las enzimas funcionan disminuyendo la energa de
activacin de una reaccin, de forma que se acelera sustancialmente la tasa de reaccin.
Las enzimas no alteran el balance energtico de las reacciones en que intervienen, ni
modifican, por lo tanto, el equilibrio de la reaccin, pero consiguen acelerar el proceso
incluso millones de veces. Una reaccin que se produce bajo el control de una enzima, o
de un catalizador en general, alcanza el equilibrio mucho ms deprisa que la
correspondiente reaccin no catalizada.
Al igual que ocurre con otros catalizadores, las enzimas no son consumidas por las
reacciones que catalizan, ni alteran su equilibrio qumico. Sin embargo, las enzimas
difieren de otros catalizadores por ser ms especficas. Las enzimas catalizan alrededor
de 4 000 reacciones bioqumicas distintas. No todos los catalizadores bioqumicos son
protenas, pues algunas molculas de ARN son capaces de catalizar reacciones (como la
subunidad 16S de los ribosomas en la que reside la actividad peptidil transferasa).

Tambin

cabe

nombrar

unas

molculas

sintticas

denominadas enzimas

artificiales capaces de catalizar reacciones qumicas como las enzimas clsicas.

La actividad de las enzimas puede ser afectada por otras molculas. Los inhibidores
enzimticos son molculas que disminuyen o impiden la actividad de las enzimas,
mientras que los activadores son molculas que incrementan dicha actividad. Asimismo,
gran cantidad de enzimas requieren de cofactores para su actividad. Muchas drogas o
frmacos son molculas inhibidoras. Igualmente, la actividad es afectada por
la temperatura, el pH, la concentracin de la propia enzima y del sustrato, y otros factores
fsico-qumicos.
Algunas enzimas son usadas comercialmente, por ejemplo, en la sntesis de antibiticos y
productos domsticos de limpieza. Adems, son ampliamente utilizadas en diversos
procesos industriales, como son la fabricacin de alimentos, destincin de vaqueros o
produccin de biocombustibles.

Estructuras y mecanismos

Diagrama de cintas que representa la estructura de una anhidrasa carbnica de tipo II. La
esfera gris representa al cofactor zinc situado en el centro activo.
Las enzimas son generalmente protenas globulares que pueden presentar tamaos muy
variables, desde 62 aminocidoscomo en el caso del monmero de la 4-oxalocrotonato
tautomerasa, hasta los 2 500 presentes en la sintasa de cidos grasos.
Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura tridimensional, la
cual viene a su vez determinada por la secuencia de aminocidos. Sin embargo, aunque
la estructura determina la funcin, predecir una nueva actividad enzimtica basndose
nicamente en la estructura de una protena es muy difcil, y un problema an no resuelto.
Casi todas las enzimas son mucho ms grandes que los sustratos sobre los que actan, y
solo una pequea parte de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminocidos) est directamente
involucrada en la catlisis. La regin que contiene estos residuos encargados de catalizar
la reaccin es denominada centro activo. Las enzimas tambin pueden contener sitios con
la capacidad de unir cofactores, necesarios a veces en el proceso de catlisis, o de unir

pequeas molculas, como los sustratos o productos (directos o indirectos) de la reaccin

catalizada. Estas uniones de la enzima con sus propios sustratos o productos pueden
incrementar o disminuir la actividad enzimtica, dando lugar as a una regulacin
por retroalimentacinpositiva o negativa, segn el caso.
Al igual que las dems protenas, las enzimas se componen de una cadena lineal
de aminocidos que se pliegan durante el proceso de traduccin para dar lugar a
una estructura terciaria tridimensional de la enzima, susceptible de presentar actividad.
Cada secuencia de aminocidos es nica y por tanto da lugar a una estructura nica, con
propiedades nicas. En ocasiones, protenas individuales pueden unirse a otras protenas
para formar complejos, en lo que se denomina estructura cuaternaria de las protenas.
La mayora de las enzimas, al igual que el resto de las protenas, pueden ser
desnaturalizadas si se ven sometidas a agentes desnaturalizantes como el calor,
los pHs extremos o ciertos compuestos como el SDS. Estos agentes destruyen la
estructura terciaria de las protenas de forma reversible o irreversible, dependiendo de la
enzima y de la condicin. Una consecuencia de la desnaturalizacin es la prdida o
merma de la funcin, de la capacidad enzimtica.

Modelo de la "llave-cerradura"
Las enzimas son muy especficas, como sugiri Emil Fischer en 1894. Con base a sus
resultados

dedujo

que

ambas molculas,

la

enzima

su sustrato,

poseen

complementariedad geomtrica, es decir, sus estructuras encajan exactamente una en la

otra, por lo que este modelo ha sido denominado como modelo de la "llave-cerradura",
refirindose a la enzima como a una especie de cerradura y al sustrato como a
una llave que encaja de forma perfecta en dicha cerradura. Una llave solo funciona en su
cerradura y no en otras cerraduras. Sin embargo, si bien este modelo explica la
especificidad de las enzimas, falla al intentar explicar la estabilizacin del estado de
transicin que logran adquirir las enzimas.

En 1958, Daniel Koshland sugiere una modificacin al modelo de la llave-cerradura: las

enzimas son estructuras bastante flexibles y as el sitio activo podra cambiar su
conformacin estructural por la interaccin con el sustrato. Como resultado de ello,
la cadena aminoacdica que compone el sitio activo es moldeada en posiciones precisas,
lo que permite a la enzima llevar a cabo su funcin cataltica. En algunos casos, como en
las glicosidasas, el sustrato cambia ligeramente de forma para entrar en el sitio
activo. El sitio activo continua dicho cambio hasta que el sustrato est completamente
unido, momento en el cual queda determinada la forma y la carga final.
Modulacin alostrica,

Transicin alostrica de una enzima entre los estados R y T, estabilizada por

unagonista (A), un inhibidor (I) y un sustrato (S).
Los sitios alostricos son zonas de la enzima con capacidad de reconocer y unir
determinadas molculas en la clula. Las uniones a las que dan lugar son dbiles y
no covalentes, y generan un cambio en la conformacin estructural de la enzima que
repercute en el sitio activo, afectando as a la velocidad de reaccin. Las interacciones
alostricas pueden tanto inhibir como activar enzimas, y son una forma muy comn de
controlar las enzimas en las clulas

Enzimas alostricas

En las enzimas alostricas la unin de un sustrato a un sitio activo puede afectar las
propiedades de otros sitios activos en la misma molcula. Un posible resultado de
esta interaccin entre subunidades es que la unin del sustrato resulte cooperativo, es
decir que la unin del sustrato en un sitio activo facilita la unin de los otros sustratos en
los sitios activos vecinos.
Adems la actividad de una enzima alostrica puede ser alterada por molculas
regulatorias que se unan de manera reversible sitios sobre la protena que se encuentren
en sitios diferentes al sitio activos. As, las propiedades catalticas de las enzimas

alostricas pueden ajustarse para cumplir con las demandas inmediatas de la clula.
Debido a ello las enzimas alostricas son los puntos clave de regulacin de las vas
metablicas.
Las enzimas reguladas por modificaciones no-covalentes son llamadas de alostricas.
Las mismas son encontradas en casi todas las vas metablicas y generalmente est
catalizando una reaccin irreversible localizada en el inicio de la va. En cuanto a
su estructura, son oligomricas o sea compuestas de varas cadenas polipeptdicas, cada
una con una casa de campo activa. La conexin del substrato a la casa de campo activa
de una de las subunidades afecta la conformacin de las dems, facilitando la conexin
de los dems substratos a casas de campo activas.
Las enzimas alostricas son sensibles reguladores del metabolismo, porque al se
conecten la determinados metabolitos celulares su actividad sufre grandes alteraciones.
Estos metabolitos tambin pueden ser llamados de efetuadores o moduladores
alostricos, y pueden ser positivos (aumento de la velocidad de reaccin) o negativos
(reduccin de la velocidad de reaccin) de acuerdo con su efecto. Por lo tanto el
moduladores alostricos pueden tutear tanto como inhibidores como activadores de la
reaccin enzimtica.
En la mayora de las vas metablicas es comn que el producto final tute como
modulador alostrico negativo de la enzima que cataliza las primeras reacciones de la va.
Por lo tanto cuando la concentracin de este producto queda aumentada l va a actuar
como un inhibidor alostrico, disminuyendo la velocidad de la va y su propia produccin.
Este mecanismo es denominado inhibicin por retroalimentacin o feedback. Si el
producto final comience a ser consumido y consecuentemente su concentracin
disminuya l va a dejar de inhibir la va, haciendo con eso que la va haya su velocidad
aumentada.

MODELO DE LA TRANSICION CONCERTADA

Referido tambin como el modelo de conservacin de la simetra propuesto por Monod,
Wymann y Changeux (MWC)
Postula que las subunidades estn conectadas que el cambio conformacional en una
subunidad se confiere a todas la subunidades

 Todas las subunidades estn en la misma conformacin

La unin del ligando (sustrato o modulador) favorece el equilibrio de uno de los estados
conformacionales T o R
El equilibrio entre los estados R y T es favorecido por la unin del ligando.

El Modelo Monod-Wyman-Changeux (MWC)

o Protenas Alostricas las subunidades estn en conformacin de simetra
o Protmeros (subunidades) pueden existir en dos conformaciones en equilibrio, T: tensa
y R, relajada: alta afinidad por el sustrato este unidad o no al sustrato
o Ligandos pueden unirse a cada una de las conformaciones o El cambio de
conformacin altera la afinidad de unin por el sustrato
o La simetra de la protena es conservada durante el cambio conformacional: transicin
concertada.

MODELO SECUENCIAL
El modelo secuencial de la regulacin alostrica sostiene que las subunidades estn
conectadas en forma que el cambio conformacional en una subunidad no induce un
cambio similar en los otras. Todas las subunidades de la enzima no estn
necesariamente en la misma conformacin
La unin de la sustrato a la enzima es va de adecuacin inducida, que indica que
cuando una molcula de sustrato colisiona con el sitio activo, la conformacin del sitio
activo cambia para unir al sustrato.
Esta unin propaga el cambio en las subunidades adyacentes que aumentan la afinidad
por el sustrato, no necesariamente a todas.

Bibliografa
Amando Garrido Pertierra. Bioqumica metablica. Editorial Tebar, 2001