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GENETICA MOLECULAR
PRACTICA DE LABORATORIO: comparacin de PCR
en la deteccin de parsitos de Leishmania (Viannia)
spp. en Lutzomyia (Diptera: Psychodidea)
INTRODUCCION
La leishmaniosis o leishmaniasis es una enfermedad causada por un parsito
llamado Leishmania el cual se transmite por medio de la picadura de un mosquito
del gnero Phlebotomus. La leishmaniosis en perros puede ser muy grave y hasta
mortal si no se detecta y trata a tiempo. Es una enfermedad incurable y crnica y
el perro no la transmite a los humanos ni a otros animales (Espinosa, 2015).
La reaccin en cadena de la polimerasa (PCR: polymerase chain reaction) es una
tcnica de amplificacin de secuencias de DNA in vitro
El diagnstico de la enfermedad en el laboratorio se realiza usando mtodos
microscpicos y cultivos in vitro e in vivo a partir de biopsias de la lesin,
demostrando la presencia del parsito. Estos mtodos son lentos, trabajosos y de
limitada sensibilidad, adems, requieren personal calificado.
En las ltimas dos dcadas, la PCR se ha constituido en una tcnica alternativa,
altamente sensible y especfica, que ha permitido identificar diferentes especies de
Leishmania a partir de muestras de pacientes, reservorios y vectores. Teniendo en
cuenta que en el control de las leishmaniasis es de vital importancia conocer la
especie o especies de Lutzomyia involucradas en la transmisin en cada foco
especfico, para disear programas de control basados en la biologa y el
comportamiento de estas especies el objetivo general del presente estudio fue
valorar el uso de la PCR basada en los iniciadores B1 y B2, para la deteccin de
parsitos de Leishmania en grupos de insectos del gnero Lutzomyia sin disecar.
OBJETIVOS
Evaluar la aplicabilidad de la reaccin en cadena de la polimerasa (PCR), basada
en los iniciadores B1 y B2, en la deteccin e identificacin de parsitos de
Leishmania (Viannia) en insectos vectores enteros sin disecar.
METODOLOGIA
Materias y mtodos
Antes de realizar todos los procesos es necesario dar una explicacin del material
requerido
Los principios de BIOSEGURIDAD se pueden resumir en:
A) Universalidad: Todo el personal debe seguir las precauciones estandarizadas
de manera rutinaria para prevenir la exposicin de la piel y de las membranas
mucosas, en todas las situaciones que puedan dar origen a accidentes. Estas
precauciones, deben ser aplicadas por y para TODAS las personas.
B) Uso de barreras: Comprende el concepto de evitar la exposicin directa a
agentes biolgicos infecciosos o sustancias potencialmente contaminantes,
mediante la utilizacin de materiales adecuados que se interpongan para evitar el
contacto con estos agentes y sustancias. La utilizacin de barreras (ej. bata de
laboratorio, guantes, lentes de proteccin, mascarillas, etc.) no evitan los
accidentes de exposicin a estos fluidos, pero disminuyen las consecuencias de
dicho accidente.
C) Medios de eliminacin de material contaminado: Comprende el conjunto de
dispositivos y procedimientos adecuados a travs de los cuales los materiales
biolgicos y qumicos utilizados en los laboratorios son depositados para su
almacenamiento y posterior eliminacin sin que se presente ningn riesgo.
Cuantificacin de ADN
Para que la cuantificacin de cidos nucleicos sea adecuada se requiere la
habilidad de medir de manera exacta y reproducible. El transferir volmenes
pequeos de lquidos es crtico para obtener resultados confiables es por ello que
MATERIALES
MANEJO DE LA MICROPIPETA
Importante: Para el uso adecuado de la micropipeta asegrese que est
usando la micropipeta correcta para el volumen que necesita medir. Tambin,
asegrese que la micropipeta est realmente lista para el volumen que
necesita revisando la ventana de volumen. Si es necesario, cambiar el
volumen mediante el dispositivo del control o mando del volumen hasta que la
micropipeta corrija el volumen (la micropipeta no lee su mente varias personas
usarn las pipetas, no siempre se encontrar como usted la necesita).
NO trate de colocar la micropipeta para volmenes mayores que el mximo, o
para volmenes menores del cero, esto descalibrar y daar la micropipeta.
1) Partes de la micropipeta
a) Identificar las partes de la micropipeta ayudndose de la imagen en la Figura
1.
b) Observar las diferencias entre la micropipeta a usar y la mostrada en la
Figura
2) Llenado de la pipeta
a) Colocar una punta segn corresponda.
b) Colocar el pulgar sobre el mando o mbolo de pipeteado.
c) Oprimir el mbolo hasta el primer un punto de resistencia alto o "tope". Si
contina presionando encontrar un punto donde el mbolo ya no se mueve
hacia abajo, este corresponde al segundo punto de resistencia alto o "tope".
d) Oprimir el mbolo hasta el primer tope y colocar la punta dentro del lquido
hasta una profundidad menor a 1 mm. De una manera lenta y controlada,
disminuya la presin del mbolo para permitir que se desplace hacia arriba. No
suelte el mbolo abruptamente, al permitirlo causar que el lquido pueda
salpicar dentro de la punta produciendo volmenes inexactos y generando
contaminacin de la pipeta. Una vez el mbolo se haya desplazado hasta
arriba mantenga la micropipeta en el lquido durante un segundo, esto evita
que se aspire aire en la parte final.
3) Expulsin de la muestra
a) Llevar la micropipeta al tubo de polipropileno de 1.5 mL.
b) Se apoya la punta en la pared inferior del tubo.
c) Oprimir el mbolo hasta el primer tope y luego hasta el segundo tope. Haga
este procedimiento a una velocidad moderada, hacerlo muy rpido har que
queden gotas de muestra en la punta. Si observa cuidadosamente, entonces
notar que al oprimir hasta el segundo alto se expele todo el lquido de la punta.
d) Lo anterior es cierto para la mayora de soluciones acuosas, excepto para las
soluciones de alta viscosidad como el Glicerol. Si es usada inadecuadamente, la
micropipeta transferir volmenes inexactos.
4) Calibracin de Micropipeta
La micropipeta puede perder su calibracin. Comprobar la calibracin de la pipeta
es un procedimiento simple que puede ahorrar tiempo considerable, energa, y
reactivos. En esta prctica aprender a usar la micropipeta de tamaos diversos
medir su exactitud, precisin y calibracin.
Para cada micropipeta revisar el porcentaje de exactitud (E%) y el coeficiente de
variacin (CV%) en todo el rango usando al menos dos volmenes diferentes por
ejemplo: Para la micropipeta P1000 revisar los volmenes de 300 L y 1000 L.
Para P200 revisar los volmenes de 60 y 200 L. Para P10 revisar 3 y 10 L.
Gradillas
Medio LB lquido
Termobloques
Tubos de polipropileno 1.5 mL
Centrifuga
Vortex
En este caso se aplicara la toma de muestras en E. coli y las muestras que
necesitamos en esta prctica ya fueron extradas y donadas por un instituto
Muestras biolgicas
Una alcuota de 3 mL de un cultivo lquido de E. coli incubado por 14-16 h a 37C
con agitacin constante de >200 rpm.
Una muestra de suelo.
METODOLOGA EXPERIMENTAL
IMPORTANTE:
Adems de los aspectos bsicos de bioseguridad (bata obligatoria, zapatos
cerrados) se Deber usar en todo momento guantes de ltex o vinilo.
Primera Sesin. Extraccin de DNA
Extraccin de ADN de E. coli
1. Propagar un cultivo de E. coli en medio LB (3 mL) durante toda la noche (14-16
h) a 37C con agitacin constante de >200 rpm.
2. Colocar 1 mL del cultivo en un tubo de polipropileno de 1.5 mL.
3. Centrifugar el tubo a 7000 g durante 2 min.
4. Decantar el sobrenadante.
5. Agregar 250 L de agua desionizada estril al paquete celular.
6. Agitar vigorosamente utilizando un vortex hasta lograr la resuspensin de las
clulas (aproximadamente 30 s).
7. Agregar 250 L de fenol (equilibrado con Tris 1M pH 8.0).
Cmara de Electroforesis
Fuente de Poder
Marcador de Peso Molecular (100pb)
METODOLOGA EXPERIMENTAL
1. Colocar 20 mL de TBE en un vaso de precipitado de 100 mL (para un volumen
de gel de 20 mL, si es mayor hacer los clculos conservando la proporcin de la
concentracin del gel)
2. Agregar 100 mg de agarosa
3. Calentar en parrilla de calentamiento hasta fundir completamente
4. Adicionar 0.5L de reactivo para teir ADN (Rojo Texas, Syber green, etc.)
5. Mezclar
6. Verter la solucin en una canastilla para electroforesis
7. Colocar el formador de pozos (peine) en la canastilla
8. Dejar gelificar (cubrir el gel con papel aluminio)
9. Colocar la canastilla adentro de la cmara de electroforesis 10. Agregar buffer
de corrimiento (TBE)
11. Preparar las muestras a analizar (con buffer de carga, no ms de 10 L en
total)
12. Colocar las muestras adentro de los pozos
13. Llevar a cabo la electroforesis a 100 V durante 30 a 45 min
14. Visualizar el gel en el transiluminador y cuantificar segn instrucciones
COMPOSICIN DE SOLUCIONES
6x Amortiguador de carga
Azul de bomofenol 0.25% (w/v)
Glicerina en agua 30% (v/v)
TBE
Prepare una solucin madre 5x en 1 litro de H2O
Practica realizada
Parsitos
Para los ensayos de sensibilidad y como controles positivos y de especificidad se
trabaj con formas promastigotes de las siguientes cepas de referencia del
Laboratorio de Parasitologa del Instituto Nacional de Salud de Colombia:
Leishmania (Viannia) panamensis (MHOM/CO/87/CL412), L. (V.) braziliensis
(MHOM/CO/86/CL250),
L.
(Leishmania)
mexicana
amazonensis
(MHOM/ME/94/CL856) y L. (L.) chagasi (MHOM/CO/84/CL044B). As mismo, se
utilizaron formas epimastigotas de cepas de referencia de Trypanosoma cruzi
(MHOM/CO/92/FCh) y T. rangeli (MHOM/CO/99/99/5048). Los parsitos se
cultivaron en masa segn lo descrito por Duque et al. a una concentracin
promedio de 1 x 106 parsitos por ml.
Vectores
Se trabaj con grupos de hembras de L. ovallesi, L. serrana y L. longipalpis,
provenientes de colonias del Laboratorio de Entomologa del INS, establecidas y
mantenidas segn la metodologa de Modi y Tesh y Ferro et al.