фармацевт

药剂师

‫רוקח‬ Apotheker 薬剤師

‫ﺻﻴﺪﻟﻲ‬ φαρμακοποιός

약사
ljekarnik फाम$%स'ट

Farmacéutico
The Initiation of Translation in Pro- and Eukaryotic Cells

5’ cap: After 20-30 nucleotides have been synthesized, the 5’-

end of the mRNA is capped 5’ to 5’ with a guanine
nucleotide. Essential for the ribosome to bind to the 5’
end of the mRNA.

Poly (A) tail: 50-250 adenine nucleotides are added to 3’ end of

mRNA. Stabilizes the mRNA, and plays an important role
in transcription termination.
 GEN  TIPICO  DE  UN  PROCARIONTE

 control                     Terminación    de

Empieza  la
                     promotor +1     transcripción         transcripción        

Transcripción

ATG STOP mRNA

 región  codificante
5’ 3’

Traducción
RBS  o  Shine
Delgarno
proteína
 TRADUCCION
ORF = open reading frame
(marco de lectura abierto)

ATG Codón de stop

Secuencia que codifica la proteína

mRNA 5´ 3´

Traducción
rbs = ribosome binding site
(o sitio Shine Delgarno)

proteína

Secuencia no traducida (UTR =untranslated)

Secuencia codificante
 TRADUCCION TGA, TAA
O TAG

ATG Codón de stop

Secuencia que codifica la proteína

mRNA
2. Elongación
Cuando se encuentra un codón
de stop el ribosoma se cae,
terminando traducción
mRNA
Traducción
El ribosoma

1. Iniciación 3. Terminación

proteína
Un mRNA posee varios ribosomas durante traducción
 TRADUCCION EN BACTERIA
3 tipos de RNA
5´ UTR 3´ UTR
mRNA
aa binding site
tRNA - transfer RNA

anticodon
2 rRNAs+ ~34
proteínas
rRNA - ribosomal RNA 50S

30S 1 rRNAs+ ~21

proteínas
 Pseudouridna
Dihidrouridina
Aminoacil tRNA sintetasa
Adenililación Carga del tRNA
Ribosoma
Eukaryotic cytoplasm

Prokaryotes, Eukaryotic organelles

(mitochondria, chloroplasts)
La subunidad grande del ribosoma tiene tres
bolsillos para recibir los tRNAs

P
E A E = Empty pocket
P = Peptidyl pocket
A = Aminoacyl pocket
 E, P and A Sites of Ribosomes

E: Exit site for free tRNA P: peptidyl-tRNA A: aminoacyl-tRNA

Prokaryotic mRNAs may be polycistronic

sites of ribosome ‘re-cycling’

cistron 3
cistron 1 cistron 2

The ability to bind ribosomes and initiate translation at sites internal to

the prokaryotic mRNA allows
• genes to be organised into operons,
• an operon to be transcribed into a single (polycistronic) mRNA,
• the expression of a number of genes (related functions) to be controlled
by a single promoter (or single translational control mechanism)
 Some translational initiation sequences recognized by E. coli ribosomes.

Shine-Dalgarno (ribosome binding) sequence: A nucleotide sequence (consensus = AGGAGG) that is present
in the (5') untranslated region(s) of prokaryotic mRNAs. This sequence serves as a binding site for ribosomes.
No involvement of mRNA 5’ end

Shine – Dalgarno sequences +AUG initiation codons can occur within 5’

non-translated regions, and, may also occur within site(s) internal to
the mRNA …….
 Initiation of Translation in Prokaryotes
IF-2 = initiation factor 2

In complex with GTP, it brings

fMet-tRNAfMet to the partial P site
on the small subunit.
50S IF-3
50S Activates a GTPase activity in the
small subunit, which allows
3 dissociation of IF2, IF3, and IF1.
+ +
mRNA
30S 3
30S
IF-2•GTP•fMet-tRNAfmet
GTP

fMet
1 + 2
IF-1: 71aa, assists IF-2 binding
mRNA
IF-2: 890aa, binds initiator tRNA (fMet-tRNAfMet)
and GTP

IF-3: 180aa, releases mRNA and

tRNA from recycled 30S
fMet
subunit and (new)
GTP 1 3
mRNA binding 2

30S Initiation Complex

30S Initiation Complex

1 + 3
fMet fMet

GTP 2 1 3 2 GTP

2 + GDP +Pi

Psite Asite
aa

fMet fMet

Elongation Phase of Translation 70S Initiation Complex

 Initiation of Translation in Prokaryotes

IF1: impide que los tRNAs se unan a la porción de la subunidad menor que se convertirá en parte del sitio A.
IF2: GTPasa que interactua con los 3 componentes fundamentales de la maquinaria de iniciación: Subunidad menor, IF1 y el
tRNA iniciador
IF3: se une a la subunidad menor y la bloquea contra su reasociación con la subunidad mayor o contra la unión a tRNAs cargados.
 Iniciación
E = Empty pocket
P = Peptidyl pocket P
A = Aminoacyl pocket E
A

fM fMet

STOP
ATG

3´ UTR
RBS

5´ UTR
 Iniciación
E = Empty pocket
P = Peptidyl pocket P
A = Aminoacyl pocket E
A

fM fMet

RBS
STOP

AUG 3´ UTR
Elongación
 Elongación

EF1α
EF-Tu

P
fM
E
3´ UTR
AUG AAA

5´ UTR
 Elongación

P
M L

E EF1α
3´ UTR
AUG AAA

5´ UTR
 Elongación
E = Empty pocket
P = Peptidyl pocket
A = Aminoacyl pocket

GTP GDP

A
P
M L
E
5´ UTR 3´ UTR
AUG AAA
UCC
RBS
 EF-Tu

EF-G
 Terminación

Release factor

M
L
S
T Y R
L V M W
5´UTR AUG
3 ´ UTR
AGA UGA
RBS
 Terminación

M
L
S
T Y R
L V M W

5´UTR AUG

AGA UGA
3 ´ UTR
RBS
 5’

3’
Código genético
•Hipótesis del tambaleo (Crick):
•El apareamiento de la 3ª base del codón no es rígido