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1. Introduction
Les mathmatiques ont un rle normatif en physique (elles ont organis le rel, en particulier
depuis le calcul infinitsimal et, plus tard, par la gomtrisation de la physique) ; elles
mritent davoir un rle similaire, si possible, dans les autres disciplines. Lide commune
selon laquelle les mmes outils mathmatiques qui ont eu tant de succs en physique
paraissent jouer un rle similaire en biologie est souvent base sur la confusion entre la
dpendance des phnomnes biologiques vis--vis des phnomnes physiques, et leur
rductibilit. Le fait que les phnomnes de vie dpendent de la structure physique est une
prsupposition de base pour nimporte quel moniste ; la rduction la physique est une
opration thorique : on rduit le vivant une organisation conceptuelle donne et propre
linerte. Cela tant, la premire est la prsupposition de la science moderne, la seconde doit
tre implmente, et cest en gnral le cas lorsquon fait rfrence aux thories physiques
existantes, qui peuvent tre inadquates pour remplir cette tache.
Dans cet article, nous allons nous essayerons de dvelopper des concepts organisateurs de
quelques phnomnes biologiques, dans le dessein dunifier des faits diffrents. Cest un essai
trs modeste de unifier par concepts, une tentative qui devrait toujours prcder la
mathmatisation. Malheureusement, la pression du temps oblige souvent faire des calculs
avant de comprendre et de conceptualiser. Cependant, les mathmatiques elles-mmes sont le
rsultat dune conceptualisation progressive, o les notions cruciales et les structures sont le
rsultat dune stabilisation difficile dexercices informels. Dans ce sens, les invariances
conceptuelles parfaitement stables des mathmatiques sont le fruit dune praxis , dune
tentative active de comprendre et dorganiser le monde. La gomtrie grecque, disons, nest
pas sortie dune approche axiomatique, mais a t le rsultat dun longue pratique
dabstraction partir de laction et la mesure dans lespace physique et sensible. Lutilisation
de linfini en acte par Newton et Leibniz, dans le calcul des mouvements finis, vitesse et
acclration, est dans la continuation de plusieurs sicles de dbats sur la diffrence entre
linfini potentiel et linfini en acte, souvent mme de nature religieuse. Ensuite, lunification
des physiques sub-lunaire et supra-lunaire, la contribution majeure de Newton puisquelles
taient considres jusque l comme relevant d'ontologies bien distinctes, a t obtenue par
des mathmatiques radicalement nouvelles, lorigine du calcul infinitsimal moderne. En
gnral, lunification de niveaux objectifs (ou pistmiques), diffrents (en apparence),
ncessite vraisemblablement de nouveaux outils techniques ou mme de nouvelles
organisations conceptuelles de lobjet ; elle est le rsultat dune nouvelle synthse, pas
seulement dun transfert de techniques (mathmatiques) mme si une bonne pratique de ce
transfert peut ventuellement aider trouver des nouveaux outils. Dans ce dessein, nous
1
Confrence invite aux Actes du Colloque "Dtermination et complexit", Crisy, Juin 2004, (P. Bourgine,
ed.), La Dcouverte, Paris, 2006. Certains thmes prsents ici dveloppent des ides en partie esquisses dans
[Bailly, Longo, 2003].
essayons ici dunifier, par des concepts relativement techniques, quelques phnomnes et
structures biologiques, et ne faisons que suggrer une possible mathmatisation. Dans cette
tentative trans-disciplinaire, nous prvoyons dappliquer notre exprience de thorisation
la biologie, laquelle diffre de la pratique biologique, mais qui pourtant s'applique sur la
base dun dialogue rigoureux avec des praticiens de cette discipline.
Un point de vue de moniste, comme le ntre, ne devrait pas nous rendre aveugle : il ny a
aucun doute sur le fait que la matire physique est unique et quil ny a rien dautre au-
del de cela dans le monde. Pourtant les mthodes que lon sest donnes afin de comprendre
les phnomnes naturels tout au long de lhistoire ne sont pas unifies et nous ne pouvons pas
prtendre les unifier par un monisme mthodologique forc. Mme la physique, en tant que
construction thorique, est loin dtre unifie (par exemple la Mcanique Quantique et la
Thorie de la Relativit Gnrale). En bref, nous sommes monistes pour la matire, non pour
la mthode, puisque lunit est dans lobjet et non ncessairement dans les thories existantes,
au sein desquelles lunit doit tre construite. Le dialogue des disciplines pourrait nous mener
de nouvelles ides et synthses mthodologiques.
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La renormalisation en une technique mathmatique originaire, dans ses mthodes modernes, de
llectrodynamique quantique. Dun point de vue conceptuel, cest une redfinition de lobjet
considr, en ajoutant ses caractristiques initiales (typiquement sa masse) certaines classes
dinteractions qui les modifient. Plus gnralement, le groupe de renormalisation fournit loutil
mathmatique utilis pour reprsenter le passage du local au global le long des transitions critiques,
dans maints domaines de la physique : la renormalisation dcrit alors un changement de mesure et
dobjet, obtenu en intgrant les nouvelles classes dinteraction dues la transition.
critique comme maximum pour la complexit moyenne pourrait tre vu comme un point de
divergence comme la longueur de corrlation, une moindre chelle.
En conclusion, aller du local au global, en physique, ncessite le passage par un tat critique ;
cela est compris comme une divergence mathmatique de la longueur dinteraction, donc
comme un point o les variations infinitsimales crent des changements finis (ou des
variations finies menant des changements infinis, mathmatiquement).
D'un point de vue conceptuel, du fait de la dtermination essentiellement globale d'un objet
biologique par rapport ses composants locaux, on est tent de faire le rapprochement avec
ces situations critiques, mais en les considrant cette fois spatio-temporellement tendues, et
de considrer certaines limites infinies (d'tats physico-chimiques) comme co-constituantes de
cet objet biologique. De ce point de vue, l'existence et le maintien du vivant serait alors
assimilables l'existence et au maintien d'un situation (ou zone) de criticit tendu(e). Sous
l'angle de la complexit, il en rsulterait que le vivant, quel que soit le niveau auquel on le
considre, prsenterait une complexit infinie par rapport au physico-chimique, sans pour
autant renoncer hirarchiser ces niveaux eux-mmes selon des ordres d'infinit varis (ou de
renormalisations successives). Dans la section suivante, on essayera de dvelopper ce point de
vue.
Le rle des transitions critiques pour lanalyse du vivant a t dj mis en vidence par
dautres auteurs. Lide au coeur des approches dveloppes essentiellement partir de
larticle de 1988 par Bak, Tang et Wiesenfeld est que la physique propose maints exemples de
construction de self-organization prs des tats critiques, loin de lquilibre, une ide dj
au cur de [Nicolis, Prigogine, 1977]. Un autre regard au sujet de la self-organized
criticality voit celle-ci merger du chaos: order for free, dans la terminologie de
[Kauffman, 1995] (voir aussi [Sol, Goodwin, 2000]). Tout en reprenant rapidement le point
de vue de [Kauffman, 1995], la simple interaction dlments a priori non-organiss, peut tre
lorigine de la formation de structures organises. Cest le rseau mme qui corrle des
lments simples qui produit lmergence (un mot cl dans ces approches) de structures ou
phnomnes complexes. And this, possibly by reaching for free a critical point: the early
and paradigmatic case, analyzed in [Bak et al., 1988], is provided by the sand piles (dropping
sand in a point up to the formation of a pile and, then, avalanches).
Ce que les analyses que nous dvelopperons ci-dessous partagent avec ces approches,
surtout celle propose par Kaufman, est le rle attribu lmergence de structures de
cohrence au cours des transitions de phases, en tant que passage dun tat, voire dun
processus, un autre. Life may exist near a phase transition, propose explicitement
Kauffman, [Kauffman, 1995] : elle parat situe entre ordre et chaos, on the edge of chaos,
car trop dordre, voire lquilibre, correspond la mort, tandis que le chaos est loppos de
lorganisation (et le vivant est trs organis). Dans les cas tudis, la notion de edge of
chaos, un point de passage entre ordre et dsordre, a une signification physico-mathmatique
bien prcise et elle fait toujours rfrence un point mathmatique dans lespace des
paramtres (ou, le plus souvent, du paramtre) de contrle.
Ce qui intresse particulirement dans ces transitions, critiques dans le sens mathmatique
mentionn, est que la structure globale, qui se constitue (merge) dans la transition, est
entirement implique dans les activits locales et vice-versa (laimant qui se forme la
temprature critique, de Curie, corrle les spins locaux et lorientation globale). Bref, la
situation locale dpend du global, par une structure de cohrence, mergente au paramtre
critique. Mathmatiquement, cela est exprim par le fait que la longueur de corrlation tend
formellement vers linfini ou que des variations infinitsimales du paramtre de contrle
induisent des changements finis dans les observables ; physiquement, cela veut dire que la
dtermination est globale et non plus locale.
Lide donc dutiliser la physique de la criticit, avec ses formations de structures de
cohrence pour analyser lmergence de la stabilit structurelle du vivant, est aussi au cur
de nos analyses ; car cette physique de la criticit dveloppe depuis une vingtaine danne une
belle thorie de lmergence de formes organises en prsence de transitions critiques. Ces
structures se constituent toutes seules (order for free): la criticit sauto-organise, donc.
Voici quelques caractristiques de cette auto-organisation, vue par les auteurs mentionns:
- lexistence de nombreux tats stables
- le passage de lun lautre de ces tats peut dpendre de fluctuations (infinitsimales)
- la cration dune structure spatio-temporelle dans un milieu lorigine homogne;
- lexistence de bifurcations, qui se prsentent des valeurs bien prcises des paramtres de
contrle (valeurs critiques) ; en franchissant ces valeurs exactes, et seulement dans ces cas,
ces structures de cohrence apparaissent.
Dans le cas paradigmatique, la formation du tas de sable, quand un certain angle critique est
atteint, par lajout de grains de sable, des avalanches se forment, selon une structuration
mathmatique bien prcise. Une des limites de cet exemple, au coeur des analyses de Per Bak,
est que lauto-organisation se rduit atteindre spontanment (for free) un angle critique et
osciller autour de cet angle. Moreover, these dynamic sand piles are a dissipative-
morphogenetic processes, but they are not inherently dissipative: the sand pile stabilizes if the
flux of energy/matter stops; particularly, this distinguishes them from the autopoietic and
homeorhetic phenomena essential to life. Nor there seem to be a global coherence structure
neither a global correlation length : the arrival of a new sand grain produces avalanches at all
scales, a very interesting phenomenon, but insufficient to develop the views on life we will
focus on (cell activities do not seem to be scale invariant).
Par contre, un lment dintrt que lon trouve dans dautres exemples plus complexes,
cest que les rgles de formation peuvent changer au cours du temps et selon les
caractristiques du systme : on est en prsence dune dynamique adaptive [Sol, Goodwin,
2000].
En gnral, la physique de la criticit permet de traiter maints cas o ce sont moins les
individus que les interactions qui comptent. Or, il ne fait pas de doute que la biologie (et la
cognition) sont avant tout une histoire dinteractions, de formations de structures organises
(cohrentes), relativement stables. En plus, des seuils critiques apparaissent partout : des
mutations gntiques, qui se propagent seulement partir dun certain seuil critique-
probabiliste, aux potentiels daction des neurones. De mme, on peut analyser nombreuses
activits crbrales en termes dattracteurs (des structures cohrentes qui apparaissent au-del
of the edge of chaos, dans des situations proprement chaotiques), o ces attracteurs se
forment et disparaissent dynamiquement, dans un milieu excitable. La moindre perturbation
peut engendrer le passage dun seuil critique, typiquement at the edge of chaos, qui
dclenche des cascades dactivits diffrentes : la thorie de la criticit peut donc nous
renseigner aussi sur ce sujet. Est-ce que les mthodes de la physique suffisent rendre ces
aspects du vivant intelligibles?
Nous le croyons, en partie, car il sagit dune piste nouvelle et intressante pour les
analyses de la complexit du vivant et de sa singularit physique . Le cadre reste toutefois
entirement interne la physique et pas un seul des exemples dans la littrature ne demande
des outils diffrents de ceux qui sont utiliss pour des structures inertes ( lexception peut-
tre des correlated landscapes de Kauffman, sur lesquels on reviendra). En fait, la plupart
des exemples suffisamment mathmatiss sont de nature physique ou ne reprsentent que la
friction physique du vivant son intrieur ou son environnement : une composante
essentielle de son tre au monde, mais fort incomplte. Essayons de nous expliquer par un
exemple. Les structures fractales de maints organes (poumon, systmes vasculaires) sont le
rsultat dun problme doptimalit (maximiser lchange nergtique par une surface, dans
un volume) o la structure physique se forme en prsence dun seuil critique. La pousse
(croissance) du vivant est essentielle pour cela, mais linteraction est physique : on peut
reproduire des structures optimale similaire avec des matriaux inertes (la cire des abeilles, la
fractalit prsente dans maintes structures physiques ou de simulation informatiques). Ces
structures sont des godsiques dans lespace de phases (paramtres et observables)
appropri, comme pour toute volution physique ; une de leurs caractristiques principales
rside dans la ponctualit des passages critiques (les valeurs critiques des paramtres sont des
points mathmatiques). Toute la phyllotaxie, aux mathmatiques fort dveloppes et
intressante, reprsente cette friction entre la pousse du vivant et le milieu physique ; elle
dcrit toujours, et ce nest pas un hasard, des phnomnes au niveau des organes, (voir
[Bailly, Longo, 2003] : lieu dchange, nergtique en particulier, entre organisme vivant et
milieu physique). Encore une fois, lutilisation faite de la physique de la criticit par Bak,
Kauffman est dun trs grand intrt. Elle donne un aperu possible, en particulier, de
lmergence de la vie partir de linerte [Kauffman, 1995]. Elle enrichie lanalyse de
lvolution darwinienne, ancre sur la slection, par un moteur qui lui manquait : la
construction de lordre partir du dsordre, sur la base de seules considrations physiques ;
citons, par exemple, les rseaux (mtaboliques, informationnels) qui se stabilisent au-del
dun certain seuil, voire lmergence de corrlations structurellement stables. En fait (et les
dmonstrations en sont dsormais nombreuses), le hasard des mutations ne suffit pas pour
comprendre la phylogense : la formation spontane de lordre, order for free, fournit une
alternative fascinante (et pertinente) un ordre ensuite soumis la slection, bien
videmment.
Ces analyses, toutefois, sarrtent au seuil de la physique : elles nous amnent at the
edge of chaos, qui reste une transition ponctuelle, comme partout en physique (une valeur
bien prcise des paramtres de contrle). Une ponctualit bien ncessaire aux mthodes
physico-mathmatiques largement utiliss dans ce domaine : le groupe de renormalization.
(Un des plus beaux exemples cet gard, la percolation, [Sol, Goodwin, 2000 ; Lesne,
2003], est intressant justement et surtout pour la ponctualit de la transition critique ; mais
cette ponctualit est tout fait gnrale, voir [Sol, Godwin, 2000]). Le nombre modeste de
paramtres, voire un seul, par rapport auxquels on examine la criticit, est aussi un aspect
essentiel (parfois soulign comme positif) de ses approches et des mthodes de
renormalisation. La formation de la vie elle mme serait alors une transition critique, par
rapport un ou deux paramtres ; et la vie se situerait, avec ses phnomnes propres, dans une
zone proche, mais au-del, du seul critique.
Or, de notre point de vue, la singularit physique du vivant consiste, entre autres, dans la
robustesse de la criticit, qui tolre une extension du passage critique. Le edge of chaos
ponctuel des analyses physiques ne nous parat plus suffisant : il doit se transformer en un
intervalle par rapport tous les paramtres pertinents (trs nombreux : espace-temps,
temprature, pression). Dans un certain sens, les travaux cits essayent de rendre
intelligible la formation de la vie, partir de linerte, en tant que passage critique, mais ils
nexaminent pas proprement la vie perdurante, sa criticit tendue. Notons galement que la
singularit conceptuelle du vivant se situe aussi dans la dynamique de lespace de phase, nous
y reviendrons.
Pour nous rsumer, le dfi mathmatique, par rapport aux thories physico-mathmatiques
courantes, consiste dans la non-ponctualit de la stabilit structurelle du vivant (criticit
tendue par rapport nombreux paramtres de contrle) ainsi que dans la difficult tablir
un paysage (espace de phase) fig, lintrieur duquel tout processus se droulerait, suivant
des godsiques ponctues par des transitions critiques. cet gard, cest lespace de phases
lui-mme qui change dynamiquement (un nouvel organe, une espce des observables et des
paramtres inattendus poussent au cours de lontogense, de la phylogense) : la dynamique
est aussi dans les observables et les paramtres mmes de lcosystme, un cadre co-volutif
o lmergence de la nouveaut change les donnes de bases. La notion de Kauffman de
correlated landscapes, avec leurs dynamiques, et les dynamiques adaptives [Sol,
Goodwin, 2000] sont proches de lide que nous mentionnons dans ce texte ; elles sont mme
trs riches, du point de vue mathmatique en particulier, car la premire, par exemple, spcifie
une notion fort intressante de corrlation dans un espace de phase normalement considr
comme rgi par le hasard. Elles paraissent toutefois forcer une stabilit conceptuelle et
mathmatique, propres aux thories physiques (lespace des paramtres et des observables est
donn a priori) qui est insuffisante, notre avis, pour cerner les dynamiques volutives du
vivant (voir plus bas).
Par contre, dans ces espaces volutifs changeants, ce qui est relativement stable et robuste
cest la criticit perdurante de lobjet vivant : autant quil reste dans une plage des possibles
(en sadaptant), lindividu vivant survit sur un parcours gnrique (possible, et pas
ncessairement optimal) dans des espaces (des cosystmes) intrinsquement changeants. Et
cela galement en vertu de lextension de sa situation critique. Notre esquisse conceptuelle se
situe donc la limite des thories physiques de la criticit et essaye de saisir certains aspects
de la phnomnalit propre au vivant, dans lespoir quune unit (ou une transition critique)
puisse ensuite stablir avec les concepts et, surtout, les mathmatiques, de lmergence et de
lauto-organisation physique. We finally observe that the notion of extended criticality, as
developped here, was first presented in [Bailly, 1991b], whose scientific reference goes back
to the early work on self-organised non-equilibrium systems, summarized in [Nicolis,
Prigogine, 1977], more than to the approach by the authors above (see also the end of the next
section, where we better stress the difference).
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La thorie de la viabilit (voir [Aubin, 1991]) propose une analyse mathmatique voisine, mais diffrente de
lapproche que nous proposons : on remplace lquation dvolution ( dx/dt = ) par lappartenance un
ensemble dvolutions possibles ( dx/dt . ) Toutefois, la fonction x(t) et lensemble qui dterminent ce
passage sont donns lavance et contiennent, selon notre interprtation, la liste des tous les espaces futurs
possibles, avec leurs godsiques ; x(t), en particulier, reprsente une trajectoire despaces de phases, au lieu
dune trajectoire dans un espace de phases. Cest l, pensons-nous, quil faut passer dune trajectoire dtermine,
une indtermination intrinsque comparable aux chemins possibles et indtermins de la physique quantique,
mais concernant lespace des phases lui-mme. De plus, comme nous lavons dit plusieures reprises, dans
chaque espace, ce sont les trajectoires gnriques qui jouent un rle important et non pas seulement les
godsiques.
Cette stabilit dynamique est aussi compatible avec les variations et mme l'instabilit des
trajectoires individuelles, qui peuvent tomber lintrieur du mme attracteur (les biolons
plus petits, inclus dans le plus grand - un mtazoaire, une cellule, respectivement). Alors un
biolon du niveau intermdiaire (un mtazoaire) constitue une trajectoire pour une espce, cette
dernire tant considr comme un attracteur ; en mme temps, ce biolon se comporte comme
un attracteur stabilisant pour ses propres composantes, ses cellules.
Comme nous lavons observ, en physique, la dynamique de la trajectoire est donne par la
godsique dans un espace des phases prdfini ; ainsi, celle-ci est slectionne selon la
stabilit la plus leve et gnralement d'une manire unique (elle est spcifique). Par
contraste, les biolons individuels sont selon nous reprsents par des chemins simultans
diffrents, gnriques et soumis simplement des contraintes de compatibilit avec les
conditions aux limites (qui leur tour n'ont pas besoin d'tre stables et peuvent tre modifies
par les processus continus). Cette approche permettrait de capturer simultanment les
proprits associes :
linteraction de la stabilit relative globale et de la variabilit individuelle, en tant que
attracteur vs. trajectoire ;
la compatibilit au lieu de l'"optimalit", car les trajectoires doivent seulement rester dans
les frontires d'volution de l'attracteur.
Chaque trajectoire individuelle trouverait donc son origine sur un tat instable et actualiserait
diffrentes potentialits contextuelles (typiquement la premire mitose dans l'embryogense,
dans le mme gnotype) et voluerait selon les potentialits accessibles, dans le cadre de la
stabilit structurale globale.
La slection naturelle peut rduire la variabilit au niveau des espces, tout en l'augmentant au
niveau des individus. Les pathologies plus ou moins supportables concerneraient plutt les
cellules chez des individus. Naturellement, ce modle conceptuel sadapte parfaitement la
notion propose ci-dessus de situation critique tendue, comme tat paradigmatique des
biolons. D'ailleurs, il peut galement tre vue comme une gnralisation de la notion de
chrode de Waddington ([Waddington, 1977]), par les aspects de gnricit et indtermination
sur lesquels nous avons insist.
Observons que ce schma se rfre seulement aux biolons, divers niveaux, puisque seuls les
biolons sont concerns par les identits (identits prserves par les changements). Les orgons
constituent plutt, par des changes nergtiques et des activits fonctionnelles, le support
matriel la stabilit et la variation : un orgon n'est pas une trajectoire, mais il peut tre
lorigine de la variation continue de l'individu reprsent par la trajectoire.
Les paradigmes physiques nous ont aid formuler ces notions, qui ne sont pas proprement
de nature physique. Nous rappelons, encore une fois, que, tout en travaillant dans un cadre
moniste, nous faisons face diffrentes phnomnalits. On les rend intelligibles en les
organisant au moyen de structures conceptuelles (et, si possible, mathmatiques) diffrentes,
avant de viser une unification. Une synthse, en fait, est loin dtre vidente ; elle doit tre
construite par une nouvelle unit conceptuelle (et mathmatique) en tant que but long terme,
aprs avoir spcifi, pensons-nous, la structure causale et la dynamique propre chaque
niveau phnomnal, dans son autonomie conceptuelle et exprimentale et aprs avoir tabli
des passerelles conceptuelles qui relient une intelligibilit une autre, sans ncessairement, ou
sans immdiatement, la rduire lune lautre.
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http://www.di.ens.fr/users/longo ).
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