Manaus Maro 2017 Em relao ao artigo intitulado: DNA Replication Origins responda:
1 Quantas origens de replicao de DNA so usualmente encontradas em genomas
eucariotos? R:Os genomas eucariotos contm origens, variando, de 400 em leveduras, at 30.000- 50.000 em humanos.
2 Como a montagem de iniciadores nos complexos pr-replicativos so organizados
procariontes e eucariontes? R: Em procariontes, monmeros iniciadores interagem com a origem de mltiplos repetidos motivos de sequncia de DNA, e os arranjos desses motivos podem direcionar a montagem de oligmeros que medeiam a separao das cadeias. Em eucariontes, um complexo de reconhecimento de origem hexamrico (ORC) se liga as origens de replicao e ento recruta fatores adicionais (como Cdc6 e Cd+1) que vo recrutar hexamricos MCM2-7 DNA helicase para formar um complexo pr-replicativo. Esse processo ocorre durante a mitose, ao longo do G1, e apenas um subconjunto dessas origens pr-montadas ser ativado na fase S.
3 Quais so os aspectos comuns encontrados entre todas as OriC bacterianas?
O nmero e o arranjo das caixas de DnaA variam entre os tipos de bactrias, mas essas caixas so frequentemente agrupadas dentro de oriCs, desempenhando um papel na direo da montagem de oligmeros de DnaA. O comprimento e a orientao destes oligmeros variam.
4- O que fazem as protenas Fis e IHF nas oriC de bactrias?
As protenas Fis e IHF so protenas de flexo que podem modular a montagem de pr-RC dobrando o DNA de origem. No so necessrias para a viabilidade celular mas a sua perda perturba o momento da montagem pr-RC.
5 Que tipo de similaridade caracteriza as OriC de Archaea, bacteria e eukarya?
Em todos os casos as helicases de DNA (MCMs em eukarya e Archeae ou DnaB em bactria) so recrutadas para a origem e carregadas em filamentos de DNA nico.
6 - O que so as ORBs de archaea e quais so os motivos que as caracterizam?
Caixas de reconhecimento de origem. Um motivo ORB grande (22-35 pb) e uma verso mais curta (7+15 pb) chamada mini ORB. As miniORBs so normalmente encontradas como repeties diretas (7-15) anlogo a algumas origens bacterianas. Cdc6/Orc1 entra em contao com nucleotdeos por meio de ORBs, alterando a topologia do DNA levando o desenrolamento de origem e distorce a hlice do DNA a um grau maior do que observado durante a montagem pr-RC. Cdc6/Orc1 estabelece contatos adicionais com ORBs atravs do domnio AAA da protena. Ainda no se sabe se a diferena entra ORB e miniORB est na incluso de sequncias reconhecidas ou distorcidas pelo domnio AAA.
7 Qual a principal diferena entre as origens de replicao de Saccharomyces
cerevisiae e demais eucariotos multicelulares?
R:As sequncias conservadas que fazem parte das sequncias autnomas,
sequncias especficas que no existem em eucariontes multicelulares.
8- O que so ARS e ACS? Qual o segundo aspecto importante das origens em S.
cerevisiae? 9- Como esto organizadas as origens de replicao nos genoma de metazorios?
10 Em relao especificidade de sequncia em metazorios (pgina 11) o
caracteriza uma origem de replicao nesses organismos? As regies de cromatina isentas de nucleossomas ou instveis de regies promotoras ativas so frequentemente associadas com origens, porque as regies rica em AT ou G no so favorveis formao de nucleossomas. Essas regies tambm so marcadas por variantes hitnicas especficas, e pela associao de remodeladores de cromatina que contribuem para o recrutamento do complexo pr-RC.
11- Como as modificaes de histonas interagem para a escolha de das origens de
replicao e sua ativao? A metilao da H4K20 parece estar envolvida no controle de origens de DNA. H4K20me1 alta durante a formao pr-RC da mitose, para G1, mas baixa na fase S, ainda sendo possvel encontr-la em origens de DNA humano. A metilase responsvel pela metilao da H4K20 um locus genmico especfico promove a montagem pr-RC. A H3K4 outra metilao encontrada nas origens de replicao.