Agnatos o peces sin mandbulas, que incluye unas pocas especies actuales
(lampreas y mixines). Es un grupo parafiltico.
Condrictios o peces cartilaginosos, que incluyen a tiburones, rayas y quimeras,
caracterizados por poseer hendiduras branquiales externamente visibles y un esqueleto compuesto slo de cartlago. Son un grupo de vertebrados muy primitivos, pero muy exitosos evolutivamente, ya que los tiburones son animales antiqusimos que no han cambiado mucho desde su origen.
Osteictios o peces seos, con esqueleto seo y branquias protegidas mediante
un oprculo. Es un grupo parafiltico. A su vez se subdividen en:
Actinopterigios, peces seos con aletas provistas de radios.
Sarcopterigios, peces seos con aletas lobuladas. Son el grupo hermano de
los tetrpodos (vertebrados provistos de cuatro patas); los primeros anfibios se originaron a partir de sarcopterigios primitivos. El siguiente cladograma muestra las relaciones filogenticas de los distintos grupos de peces y de stos con los tetrpodos:1