TRADUCCIN

Exportacion del RNAm al citosol

El mensajero tiene una serie de seales que van a identificar que esta
maduro y apto para ser transportado.
Para que se produzca el reconocimiento tiene que haber una protena
particular.
Al llegar al citosol, el mensajero es reconocido por los factores de inicio que
van a comenzar el proceso de traduccin.
Los factores de inicio vuelven a corroborar que el mensajero est completo,
de manera que el mensaje se encuentre intacto.
Solo si esta completo va a ser traducido

Cdigo gentico

El proceso de traduccin se va a fundamentar en la definicin del cdigo

gentico
El cdigo gentico relaciona las 64 posibilidades de combinacin de 4 letras
en codones de 3 letras.
Cada codn codifica para un determinado aminocido.
3 de los codones son de termino, para los cuales no existe un anticodon en
el tRNA, de modo que no codifica para ningn aa.
Los 61 codones restantes estar repartidos el 20 aa, lo que hace que el
cdigo gentico sea redundante o degenerado. (mas de un codn para un
mismo aa)
Hay dos aminocidos que los codifica un nico codn, metionina (AUG) y
triptfano (UGG).

Tres marcos de lectura posibles para la traduccin

1. Partir leyendo del primer nucletido

2. Partir del segundo nucletido, lo que se llama correr el marco de lectura.
Esto cambia completamente la secuencia a traducir.
3. Partir del tercer codn
Solo una de estas posibilidades va a codificar la secuencia aa correcta.
Esto se soluciona porque exite un codn de inicio de la traduccin, que va a
marcar/definir el marco de lectura correcto.
Si no hay un reconocimiento del codn de inicio, no se sintetiza la protena.
Se puede producir una mutacion que reconozca otro codn de inicio y lo que
se obtiene es una protena trunca, pero normalmente no sucede.
La sntesis de todas las protenas parte con una metionina en su extremo
amino-terminal, sin embargo, como despus sufren modificaciones, no
necesariamente todas las protenas maduras tienen este aminocido.
Procesamiento de los tRNAs y RNAr

No solo los mensajeros maduran

Los RNA de transferencia y los ribosomales, que son productos finales de la
transcripcin, tambin son madurados y tambin tienen intrones.
Todos estos procesos son activos y utilizan generalmente ATP (enzimas con
actividad ATPasa)

La maduracin del rRNA es diferente, ya que esta sufre cortes.

Los rRNA se sintetizan en comienzo como precusor comn, dentro del cual
estn contenidos los rRNA chiquititos (18S, 5.8S y 28S, que se deniminan
asi por su coeficiente de sedimentacin al ponerlos en un gradiente de
densidad. El 28S por tanto es el de mayor tamao)
El precursor comn es cortado por enzimas endonucleasas (que cortan
dentro), exonucleasas 5 y 3 (que degradan desde los extremospacman)
Las enzimas son las encargadas de madurar y separar los tres RNA
funcionales.
Todo este proceso ocurre en el nuclolo.

RNA de transferencia

Fundamental para el proceso de traduccin.

Tiene una estructura secundaria tridimensional especifica que es parte de
su funcionalidad (si se altera su plegamiento, no funciona)
T-loop: contiene una timina, que es un nucletido que no se encuentra
normalmente en el RNA (derecha)
D-loop: contiene una dihidroudimina, que son nucletidos modificados
(izquierda)
Su extremo 3 es el aceptor del aminocido que va a cargar.
RNAt es una molecula adaptadora que lleva el aa al ribosoma
El aa es cargado a travs de un enlace covalente de alta energa que se
genera entre el grupo carboxilo del carbono alfa del aa y el extremo 3OH
libre del RNA.
El aa lo reconoce por su estructura y el tRNA por la secuencia de su
anticodon.
Los codones en el mensajero se leen de 5 a 3 (direccin de la traduccin) y
el anticodon se escribe de 3 a 5.
Aminoacil tRNA sintetasa:
la especificidad de la unin del aa al RNAt esta dada por una enzima
especifica, que son las aminoacil tRNA sintetasa. (son 20 enzimas distintas,
una para cada aminocido)
 tienen dos sitios de unin: 1) sitio de unin para el aminocido que van a
cargar y 2)sitio de unin que reconoce el tRNA sobre el que va a cargar el
aa.
Como es sintetasa, ocupa ATP (proceso activo)
La aminoacil tRNA sintetasa es la encargada de formar el enlace que va a
unir el aa con el tRNA, que cuando se rompe libera alta energa que es
utilizada para formar el enlace peptidico de la protena que se esta
sintetizando.
Son fundamentales para cumplir con el cdigo gentico. (lo define)
El sitio de entrada de las tRNA sintetasa de los tRNA de un aa que es
sintetizado por varios codones diferentes, es mas promiscuo. Acepta 6 tRNA
distintos para un mismo aa.
Son 20 tRNA sintetasas (una para cada aa)

Ribosoma

Esta conformado por protenas y las subunidades ribosomales.

La subunidad mayor y menor del ribosoma se enzamblan solo cuando estn
sintetizando alguna protena
Cuando se conforma la estructura completa del ribosoma, tiene que haber
un RNAm.
Hay 4 sitios de unin a RNA que reconoce el RNAm.
El RNAm se va moviendo y el ribosoma lo va leyendo
3 de los sitios estn localizados entre las dos subunidades (A, P y E)
Sitio A: aminoacil-tRNA (tRNA + aa)
Sitio P: peptidil-tRNA (tRNA + pptido sintetizado)
Sitio E: salida de los tRNA (exit)
El cuarto sitio es el sitio de reconocimiento del mensajero que est ubicado
exclusivamente en la subunidad menor.
El enlace peptdico ocurre entre P y A.

Inicio de la traduccin

Un factor de inicio tiene que reconocer el mensajero, reconoce la polaridad

y la caperuza del extremo 5. (comprueba de que el RNAm esta completo)
Otro factor importante del inicio de la traduccin es el factor que conforman
la subunidad pequea del riboma unido a un tRNA para la metionina (tiene
el anticodo complementario al AUG), que es el nico tRNA que tiene la
capacidad de unirse a un ribosoma no ensamblado. El RNA de la subunidad
menor ayuda a la identificacin del codn de inicio.
Otro factor es la protena elf2 que va a regular las uniones (protena de
unin a GTP)
En total son 3 factores que regulan el incio; factores que reconocer que el
mensajero esta completo, la subunidad pequea del ribosoma unido al tRNA
para la metionina y la protena elf2.
 Estos factores se van llamando el uno al otro.
La maquinaria se monta en el extremo 5 del mensajero y parte recorriendo.
Hay una helicasa (dependiente de ATP) que se encarga de ir elongando el
RNAm, que tiende a plegarse para defenderse de la accin de nucleasas, y
de este modo permite el avance del factor de inicio leyendo el mensajero
hasta que llega al primer AUG.
El AUG que va a marcar el inicio de la traduccin, que va a definir el marco
de lectura del mensajero no es necesariamente el primero. (los nucletidos
vecinos son importantes)
Cuando llega al codn de inicio la protena elf2 lo reconoce, se produce un
correcto apareamiento entre el anticodon del tRNA y el codn del mensajero
(que ocupa el sitio P de la subunidad menor) y esto gatilla la hidrlisis del
GTP de la protena elf 2 que abandona el complejo de inicio.
La salida de elf 2 permite la entrada de la subunidad mayor del ribosoma.
(la funcin del elf 2 evita que la subunidad mayor se ensamble a la menor,
mantiene al factor de inicio de la traduccin)
Cuando se activa la actividad GTPasa de la protena elf 2, producto del
correcto apareamiento del anticodon de la metionina, provoca que la
protena abandone en tRNA para que pueda entrar la subunidad mayor.

Traduccin del mensajero

Luego del inicio de la traduccin, el sitio A queda disponible con el codn

vecino al AUG.
Llega un segundo tRNA al sitio A, se produce un optimo apareamiento, se
forma el enlace peptidico entre los aminocidos y se produce el avance del
ribosoma en torno al mensajero.
Todos los tRNA vienen con factores de elongacin (protena de unin a GTP)
que ayudan a que entre solamente el tRNA que se aparea correctamente
con el codn.
Cuando se produce el corecto apareamento del siguiente tRNA, ocurre
hidrlisis de GTP de la protena reguladora, la protena sale y el ribosoma
toma la posicin correcta.
Cuando esta el tRNA correctamente posicionado en el sitio A, ocurre la
actividad peptidiltransferasa (ribosimaRNA con actividad cataltica), que
esta ubicada en uno de los RNA del ribosoma.
La peptidiltransferasa rompe el enlace de alta energa del
aminoacil/peptidil-tRNA que esta en el sitio P, y cataliza la formacin del
nuevo enlace peptidico.
Esto hace que la subunidad mayor del ribosoma se desplace y los tRNA
cambien su posicin dentro del ribosoma.
El tRNA que estaba en el sitio P pasa al E y como no tiene carga, se va. Su
salida hace que el ribosoma vuelva a su posicin normal, teniendo
nuevamente disponible el sitio A.
 Hay factores de elongacin que impide que, cuando el sitio A no esta bien
constituido, entren tRNA (bloquea)

Trmino de la traduccin

Se produce cuando hay un codn de termino de la traduccin en el sitio A

del ribosoma.
El codn de termino (cualquiera de los 3) no tiene un anticodon
complementario a el.
En vez del tRNA entra una protena que es un factor de termino.
Es una protena que hace una mmica molecular (tiene la misma estructura
que el tRNA), por lo que engaa al ribosoma, entra, se establece una
conexin qumica (no nucletido-nucletido, sino que grupos funcionales de
la protena que se complementan correctamente con el codn).
El ribosoma queda con el sitio A ocupado (con una correcta
complementariedad), se activa la peptidil transferasa, la enzima corta el
enlace de alta energa; pero como no hay un aminocido con el cual formar
un enlace polipentidico, toma una molecula de agua y termina la sntesis
liberando el extremo carboxi terminal del pptido sintetizado.
Luego el factor de termino ocupa el sitio P del ribosoma provocando que
todo el complejo se desensamble liberando el RNAm, el factor de termino y
las subunidades ribosomales.

El RNA mensajero procarionte es policistrnico

Codifican para mas de una protena

Cada unidad tiene su propia secuencia de reconocimiento en el ribosoma,
es decir, la transcripcin es comn para el operon pero la traduccin es
independiente.
Cada gen se traduce por un ribosoma diferente, osino tendramos un
pptido grande.
Esta es la razn por la cual los genes estn separados por regiones no
codificantes, la cuales van a ser las reconocidas por los ribosomas.
La secuencia de reconocimiento (no codificante) en los procariontes se
denimina secuencia Shine-Dalgarno
Todos los factores/drogas/compuestos que logren alterar la sntesis de una
protena en los procariontes, son los conocidos con actividad antibitica.
Los antibiticos bloquean alguna etapa de la traduccin.
Una bacteria incapaz de sintetizar protenas, va a morir.
Tetracyclina: bloquea la unin del aminoacil-tRNA al sitio A del ribosoma
Cloranfenicol: bloquea la actividad de la peptidil transferasa en el ribosoma
(accin cataltica del ribosoma)
Eitromiosina: bloquea la traslocacion de ribosomas (evita que la subunidad
mayor avance)
Puromicina: hace lo mismo que el factor de termino de la traduccin,
engaa al ribosoma y entra al sitio A bloqueando la traduccin.
Polirribosoma

Un mensajero que esta siendo traducido por muchos ribosomas a la vez.

Ocurre tanto en procariontes como eucariontes
Aumenta la eficiencia de proceso de traduccin.
La eficiencia de la traduccin esta relacionada con el largo de la cola poliA,
ya que se postula que cada vez que se monta una maquinaria de traduccin
y luego se libera se lleva un pedacito de la cola, por lo tanto se va
acortando la cola
El acortamiento de la cola poliA hace que las nucleasas puedan acceder y
partan degradando el mensajero
La vida media del RNAm esta regulada por la capacidad que tengan las
nucleasas de acceder a la degradacin del mensajero (puede ser tanto por
perdida de la caperuza como de la cola poliA)
Se postula que el factor de inicio de la trdaduccion tambin se podra llevar
la caperuza, dejando el extremo 5 expuesto.
Durante el proceso de traduccin se pueden producir accidentes que corten
el mensajero, dejndolo expuesto a la accin de nucleasas.
Las secuencias no codificantes que estn despus del factor de termino de
la traduccin, tambin son secuencias que determinan la vida media de un
mensajero.

Proteosoma

La cadena polipetidica liberada en la traduccin es asistida en su

plegamiento por las chaperonas y chaperoninas (tienen distintos
mecanismos pero ambras corrigen errores de mal plegamiento)
Si la protena no corrige y queda mal plegada, expone sitios que son
blancos para enzimas que se encargan de ubiquitinar las protenas.
Cuando la protena esta bien plegada, esos sitios ubiquitinables quedan
escondidos.
Todas las protenas ubiquitinadas son blancos del proteosoma, el cual las
degrada a pequeos pptidos que son reciclados.
Las protenas que tienen una vida medida corta (que se sintetizan y que
luego tienen que rpidamente desaparecer), son protenas que dentro de su
estructura correctamente plegada, dejan al tiro expuesta la secuencia que
es blanco de la ubiquitinacin.