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8. RECONSTRUCCIN. (R: 03-2) 8.

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RECONSTRUCCIN DE LA IMAGEN

Una vez realizada la excitacin selectiva del plano y cerrado el gradiente de seleccin del
plano Gz da comienzo la relajacin de los ncleos. Durante la relajacin se obtiene en la antena
receptora una seal elctrica que convenientemente analizada, permitir obtener la imagen. Cuando
la antena capta la seal, en ella concurren seales de relajacin procedentes de todos los ncleos
del plano. Para poder reconstruir la imagen es preciso un mtodo que permita individualizar la seal
que proviene de cada voxel. Ello se logra mediante un sistema de gradientes magnticos
perpendiculares aplicados sobre el plano tomogrfico durante la relajacin que establecern
una identificacin espacial de la situacin de los ncleos en el plano mediante una codificacin por
frecuencias y por fases de tal forma que realizando un anlisis matemtico (anlisis de Fourier) de la
seal recogida en la antena receptora podamos identificar la seal individual que corresponde a cada
voxel del plano tomogrfico.

8.1. RECONSTRUCCIN POR DOBLE ANLISIS DE FOURIER.

Es el mtodo actualmente utilizado para la obtencin de imgenes 2D. Opera con dos
gradiente perpendiculares que entran en juego durante la relajacin. Estos gradientes se establecen
a lo largo de los lados del plano tomogrfico. Uno de ellos (Gy) codificar en fases, el otro (Gx)
codificar en frecuencias ( Ver Fig 8.1)

Gy
Fig 8.1.
Orientacin de los gradientes de codificacin de fase
Gy y de frecuencia Gx establecidos durante la
relajacin a lo largo de los lados del plano tomogrfico.

Gx
8.2 8. RECONSTRUCCIN. (R :03-2)

Cuando la relajacin va a empezar, despus de cerrar el gradiente de seleccin del plano


(Gz), se abre un gradiente a lo largo de uno de los lados (Gy). Por filas perpendiculares a la
direccin del gradiente, todos los ncleos de la misma fila perciben la misma frecuencia. Los ncleos
sobre la fila con un campo magntico mayor se relajan a una frecuencia mayor por lo que se
adelantan en fase respecto a los ncleos de la fila que perciben un campo magntico menor. Si al
cabo de un cierto tiempo (ty) (Fig 8.2) quitamos el gradiente Gy, queda un desfase entre filas que
depende de la fila. Se ha establecido mediante el gradiente Gy una codificacin espacial de la
filas a travs de la fase. El gradiente Gy recibe el nombre de Gradiente de codificacin de fase o
Phase-Encoding Gradient.
El desfase originado por Gy permitira identificar filas. Falta dentro de cada fila identificar la
seal de los diferentes voxels. Para ello se utiliza un gradiente Gx perpendicular al anterior que se
llama Gradiente de codificacin de frecuencias (Frequency-Encoding Gradient). El gradiente Gx
implica que por columnas perpendiculares a la direccin del gradiente, todos los ncleos se relajen a
la misma frecuencia. Por tanto dentro de cada fila cada ncleo se relajar a una frecuencia distinta en
funcin de la columna que ocupe. Ahora bien, como Gx acta durante un tiempo (tx) implica que
dentro de cada columna aquellos ncleos bajo un campo magntico mayor se relajan a una
frecuencia mayor por lo que se creara tambin un desfase debido a Gx, que se aadira al que ya
haba creado Gy y por tanto alterara la codificacin realizada de fase. Para corregir esta alteracin
producida en la fase por la presencia de Gx y que las columnas queden diferenciadas nicamente
por las frecuencias, el gradiente Gx es un gradiente bipolar (-Gx,+Gx) (ver Capitulo 2.3.). El primer
lbulo (-Gx) se aplica a lo largo un tiempo tx en el que se realiza la codificacin de frecuencias y el
desfase consecuente por lo que -Gx recibe el nombre de dephase lobe o Gradiente de desfase. La
aplicacin del segundo lbulo (+Gx) del gradiente bipolar invierte el sentido de la accin del gradiente
sobre los spins pero manteniendo la misma frecuencia con lo que, los que se haban adelantado
ahora van en sentido contrario y al cabo del mismo tiempo de aplicacin (tx), todos los spins vuelven
a encontrarse en fase. Este segundo lbulo del gradiente (+Gx) recibe el nombre de readout lobe o
readout gradient o Gradiente de lectura ya que generalmente se aplica cuando va a recogerse el
ECO al ser al final de tx, el momento de mximo refase y por lo tanto de mxima seal. Por lo general
este segundo lbulo se deja actuar otro tiempo tx para recoger el eco completo (fig 8.2)

Fig 8.2.
Gy
t Diagrama temporal de la
ty intervencin de los gradientes de
codificacin de fase Gy durante el
tiempo ty, y del gradiente bipolar de
codificacin de frecuencias: Lbulo
tx tx de desfase (-Gx) durante el tiempo tx
Gradiente y lbulo de refase (+Gx) durante el
de
+ Gx tiempo tx, al final del cual existe la
refase
mxima seal del eco. El gradiente
Gx de refase se prolonga un tx mas
Gradiente - Gx t para poder recoger el decaimiento
de del eco.
desfase
tx

Eco
t
8. RECONSTRUCCIN. (R: 03-2) 8.3

Por tanto, la aplicacin del un gradiente Gy y de un gradiente Gx bipolar, permite una


codificacin espacial de la seal de los ncleos del plano en filas y columnas mediante la fase y la
frecuencia de la relajacin. En la antena receptora se recoger la seal que proviene de todo el
plano, pero la seal llevar implcita una codificacin espacial.
Si en el plano estuviese formado por una sola fila, bastara con una codificacin de fase (un
solo valor de Gy) para identificar la seal de cada voxel. Si el plano est constituido por dos filas,
habra que repetir el proceso: Activar la codificacin de fase mediante Gy y activar la codificacin de
frecuencias mediante el gradiente bipolar Gx . Pero ahora hay que resolver un numero doble de
incgnitas que antes (hay doble nmero de voxels) por lo tanto tenemos que obtener un juego de
valores distintos. Ello se consigue variando el valor del gradiente de codificacin de fase Gy. Es decir,
si tuvisemos dos filas recogeramos dos seales correspondientes a codificaciones de Gy distintas.
Siguiendo este razonamiento, es evidente que tendremos que repetir todo el proceso cambiando
el valor del gradiente codificador de fase Gy tantas veces como indique el valor de la Dim-Fase.
Estos valores se denominan valores de codificacin de Gy (phase encoding steps).
En resumen, en la obtencin de la imagen mediante doble trasformada de Fourier, por cada
codificacin se recoge una seal S1 que corresponde al juego del gradiente bipolar de Gx y a un valor
del Gy (Gy1) (Fig 8.3). Esta seal se digitaliza y almacena. Seguidamente se vuelve a repetir el ciclo
con los mismos valores de Gx pero variando Gy (Gy2). El eco recogido S2 se digitaliza y almacena,
volvindose a repetir el proceso tantas veces como indique la Dim-Fase. El conjunto de datos
almacenados ordenadamente constituye el ESPACIO K. A partir de los datos del Espacio K,
mediante un proceso matemtico llamado TRANSFORMACIN DE FOURIER, sensible a la amplitud,
frecuencia y fase, se reconstruye sobre una escala de grises el valor de la seal en el pixel
correspondiente.

Gy1
Gy2
Gy3
Gy
t

Gx
t

S3
S2
S1

Eco
t

Fig 8.3. Obtencin de los datos para la reconstruccin por doble transformada de Fourier.
Para la obtencin de la imagen entran en juego dos gradientes perpendiculares: El gradiente codificador de
frecuencias Gx (Es bipolar para corregir el desfase que produce) y el gradiente codificador de fase Gy. Para cada
lnea de voxels el gradiente bipolar Gx es el mismo, mientras que varia el gradiente codificador de fase Gy: (Gy1,
Gy2, Gy3,...), lo que permite obtener tantas seales (S1,S2,S3,..) como valores de Gy indique la Dim-fase que
hemos seleccionado. Cada una de estas seales se digitaliza y almacena en el llamado Espacio K. Una vez
adquiridas todas las seales, mediante un procedimiento matemtico (Transformacin de Fourier) podremos
obtener la imagen.
8.4 8. RECONSTRUCCIN. (R :03-2)

Los valores de codificacin del gradiente de fase Gy, se toman la mitad positivos y la otra
mitad los mismos valores pero negativos. Por ejemplo una matriz de adquisicin con una DIM-Fase
de 256, tendr 128 valores positivos y 128 valores negativos. Cada uno de estos steps de
codificacin corresponde a un valor concreto del Gy en Gauss/cm. Este valor de Gy se calcula de tal
forma que toda la DIM-Fase del FOV sea cubierto por un nmero de ciclos enteros. Por ejemplo: Si
no se aplica ningn Gy (step o valor de codificacin 0) no se produce desfase entre las filas. Si se
aplica el valor de codificacin +1, el valor real de Gy es tal que se crea a travs de la imagen un
desfase de +360 entre la primera fila y la ltima. Si se aplica el valor de codificacin Gy =-1 se crea
un desfase entre la primera fila y la ltima de -360. Si se aplica el valor de codificacin Gy =+2, la
diferencia de fases a travs de las filas se ha ampliado a 720. Para el mximo valor de codificacin,
se calcula Gy de tal forma que la resolucin espacial mxima en la dimensin de la codificacin de la
fase sea cuando dos filas contiguas estn separadas por un desfase de 180 ( ciclo).

La manera esquemtica de representar la necesidad de recoger tantas seales como indica


la dimensin de fase, se muestra en la fig 8.4. El gradiente de codificacin de fase Gy aparece
dividido en tantos steps (tantos como la Dim-fase), la mitad con valores positivos y la otra mitad con
valores negativos. La secuencia se repite manteniendo los mismos valores de codificacin de
frecuencia pero variando la codificacin de fase y recogiendo para cada uno de ellos una seal.

+(Dim-Fase)/2

Gy Fig 8.4.
t
Diagrama esquemtico de la
recogida de todas las seales
-(Dim-Fase)/2 necesarias para la reconstruccin
del plano tomogrfico. A cada
step en el gradiente de
codificacin de fase Gy le
corresponde la obtencin de un
eco. En cada obtencin el valor
del gradiente de codificacin de
Gx t frecuencia Gx no varia. Se tienen
que recoger tantos ecos como
valores indique la Dim-Fase.

Eco
t

Los valores que va tomando el gradiente de codificacin de fase a lo largo de la secuencia no


tienen porqu ser consecutivos. Por el contrario las nuevas tecnologas de los gradientes permite dar
valores previamente programados segn las necesidades de las secuencias. Tambin en algunos
casos se aprovechar las semejanzas que representa obtener un eco con un gradiente +Gy o - Gy.
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8.2. DIGITALIZACIN DE LA SEAL.

La seal recogida por la antena receptora es una seal analgica de radiofrecuencia que hay
que transformarla (digitalizarla) en valores discretos para poder almacenarla (conversin
analgica/digital: C(A/D)). Antes de digitalizarla, al ser una seal del orden de los microvolts debe
pasarse por un preamplificador con unas ganancias del orden de los 80 dB. Despus se le sustrae la
seal de referencia correspondiente a la frecuencia nominal de trabajo y se la convierte en una seal
de audiofrecuencia que es la que se digitaliza. Ello implica que la banda de lectura del receptor
trabaje en el orden de los kHz. Por ejemplo si la seal de entrada en el receptor contiene frecuencias
entre -32 kHz y +32 kHz. Diremos entonces que la amplitud de banda de frecuencias de la seal es
de 32kHz. Esta amplitud de banda se llama BANDWITH: BW.
La amplitud de banda: BW indica que frecuencias sern admitidas en el receptor. Fuera del
intervalo marcado por la BW, las frecuencias sern rechazadas. Como la codificacin de frecuencias
implica una relacin de la frecuencia con la situacin en el plano, establecer una BW equivale (bajo
un gradiente determinado) a delimitar la zona que vamos a representar. Es decir, fijar el CAMPO DE
VISION o FOV. El FOV queda fijado por el gradiente y la BW . Un determinado FOV puede
alcanzarse con gradientes elevados y BW amplias o con gradientes bajos y BW estrechas. (Fig 8.5.)

Fig 8.5 :
Relacin entre el FOV, la
BW y el valor del Gradiente.
Gx1
Si tenemos una BW amplia (
BW1) alrededor de la
frecuencia principal fo, el
+BW 1 GX2 receptor slo puede recibir
frecuencias dentro de esta
+BW 2 banda. Si se ha establecido
f0
-BW 2 el gradiente Gx1 en el
receptor entrarn las
-BW 1
seales de los ncleos
comprendidos entre A y B
(FOV). Para obtener la
imagen del mismo FOV con
un gradiente menor (Gx2)
tenemos que trabajar con
una BW mas estrecha (
BW2) .
A O B

FOV

Si utilizamos gradientes bajos, la diferencia de frecuencias entre los ncleos de un lado y otro
de la imagen disminuye lo que permite utilizar una banda de frecuencias pequea. Cada pixel de la
imagen corresponder a un menor intervalo de frecuencias.

Si queremos FOV pequeos con BW amplias tenemos que tener gradientes elevados.

Para un determinado FOV, cuanto menor es la BW, menor es la amplitud del gradiente de
codificacin de frecuencias utilizado y la seal se codifica empleando un nmero menor de
frecuencias.
8.6 8. RECONSTRUCCIN. (R :03-2)

Hay que tener en cuenta que aparte de la seal a leer, existe tambin un ruido. Este ruido se
presenta con un rango amplio de frecuencias aleatorias. En consecuencia cuanto mayor sea la BW
mayor ser el ruido que penetrar en nuestro receptor. Utilizando BW pequeas, la seal la leemos
igualmente y tendremos menor ruido al eliminarse el que queda fuera de la banda de lectura. En
consecuencia:
Cuanto menor es la BW utilizada mejor cociente seal/ruido.

La relacin aproximada es: S/R 1/ BW

La digitalizacin de la seal obtenida en la antena corresponde a una conversin de una seal


analgica a una digital: C(A/D). Se hace midiendo el voltaje de la seal a intervalos de tiempo
determinados y representando estos voltajes como valores digitales. El nmero de lecturas la
fijamos al fijar la DIM-frec de la matriz de adquisicin. El tiempo de muestreo, es decir, el tiempo
que permanece abierto el receptor para captar la seal viene dada por el nmero de muestras por
intervalo de tiempo para captar una muestra. Este intervalo de tiempo es inverso de la frecuencia de
muestreo.
Disminuir la amplitud de la banda de lectura implica aumentar el tiempo de muestreo.
En efecto, la BW del receptor define cuantas frecuencias van a ser usadas para codificar la seal en
la direccin de las frecuencias. Este nmero se expresa en Kilohertz (KHz) como un nmero (BW)
desde el centro de frecuencias marcado durante el preescan. Por ejemplo si el centro de frecuencias
de una imagen es 100 KHz y la BW del receptor es de 16 KHz, Va a trabajarse para la codificacin
de la seal con frecuencias entre 84 KHz y 116 Khz, anulando toda las seales fuera de esta banda.

En teora de seales se demuestra que, para tener una correcta representacin digital, la
frecuencia del muestreo ( nmero de lecturas / tiempo de lectura ) tiene que ser como mnimo dos
veces la amplitud de la banda de frecuencias en que se ha codificado la seal, es decir dos veces la
BW.(Teorema de Nyquist)1.
Por tanto,
Frecuencia mnima de lectura de la seal (frecuencia de Nyquist) = 2BW

Tiempo de lectura de la seal = DIM-frec / 2BW

Fijmonos que:
Al disminuir la BW, aumentamos el tiempo de lectura de la seal.

En secuencias rpidas se utilizarn BW amplias para disminuir en lo posible los tiempos. Ello implica
por otro lado como hemos visto, aumentar el ruido.

Las frecuencias presentes en la seal pero superiores a la de Nyquist sern interpretadas


incorrectamente en su representacin digital y aparecern como contribuciones a frecuencias ms
bajas creando un problema de undersampling, lo que dar origen al fenmeno de WRAP-
AROUND o ALIASING o DOBLAMIENTO DE LA IMAGEN EN LA DIRECCIN DE LA
FRECUENCIA y ocurre cuando un objeto se extiende mas all del FOV en la direccin de la
codificacin de frecuencia. (Fig8.6)

1
El teorema de Nyquist indica que par una digitalizacin no ambigua de una seal peridica tiene que ser
muestreada al menos dos veces por perodo. Es decir tiene que muestrearse a una frecuencia al menos doble
de la seal a digitalizar.
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Eje cod. Fig 8.6.


Frec. Artefacto de doblamiento en la direccin de
frecuencia

8.3. EL DESPLAZAMIENTO QUMICO ENTRE EL AGUA Y LA GRASA


( grasa,agua , WATER-FAT SHIFT: WFS)

La imagen de Resonancia Magntica se debe al ncleo de H y bsicamente a los ncleos de


H del agua (en sus distintos estados: libre, ligada) y de la grasa. Es decir a los ncleos de H que se
encuentran en radicales Hidroxilo (- OH) del agua y a los ncleos de H que se encuentran en
radicales - CH2 - - CH3 de las grasas. Estos entornos bioqumicos diferentes implica que la
frecuencia de Resonancia del H del agua ( fagua ) sea diferente de las frecuencias de Resonancia del
H en los radicales grasos (fgrasa ), aunque estn sometidos al mismo campo magntico externo.

Normalmente, como veremos en el captulo sobre Espectroscopia, las diferencias de


frecuencias (en este caso: fgrasa - fagua ), se expresan de forma relativa a una de ellas que se toma
como valor de referencia (por ejemplo la fagua ). El cociente resultante: ( fgrasa - fagua ) / fagua se
conoce como DESPLAZAMIENTO QUMICO ENTRE LA GRASA Y EL AGUA (CHEMICAL SHIFT :
grasa,agua )(WATER-FAT SHIFT:WFS). Como la diferencia es muy pequea, se multiplica por 106 para
trabajar con valores mas manejables y se expresa en partes por milln (ppm):

grasa,agua (ppm) = 106 ( fgrasa - fagua ) / fagua

De esta forma el desplazamiento qumico es independiente del valor del campo magntico
externo. El Desplazamiento qumico del H de la grasa respecto al del agua es de aproximadamente -
3.5 ppm, es decir la fgrasa es menor que la fagua. En IRM se toma como referencia la frecuencia del H
del agua para el tunnig. Como en la reconstruccin de la imagen a cada frecuencia le corresponde
una posicin, los H de la grasa al tener una frecuencia mas baja, aparecen desplazados hacia el lado
de las frecuencias menores del gradiente de codificacin de frecuencias. Cuando el desplazamiento
es mayor que el tamao del pixel aparece una suma de seal en el pixel de frecuencias menores,
mientras disminuye la seal en el voxel original. Esto origina lo que se conoce como ARTEFACTO
DEL DESPLAZAMIENTO QUMICO o CHEMICAL SHIFT ARTIFACT .
8.8 8. RECONSTRUCCIN. (R :03-2)

Imaginemos ( Fig .8.7.) un volumen con agua rodeado de dos volmenes con grasa, alineados en
la direccin del gradiente de codificacin de frecuencia. (Gx). Al aplicar el gradiente si tomamos la
frecuencia del agua como referencia, la grasa presenta una frecuencia menor con los volmenes de
grasa aparecen en la imagen desplazados hacia las regiones de campo magntico menor, dando
lugar a una superposicin de seales en la zona del agua limitante con el volumen de grasa de la
direccin del gradiente y por el contrario, la grasa situada en la direccin contraria al gradiente se
desplaza del volumen del
agua.

GRASA AGUA GRASA


Fig. 8.7.
Artefacto de desplazamiento
qumico.
Asumiendo la frecuencia del H
del agua como referencia, la
grasa aparece desplazada
siempre hacia la zona de
frecuencias menores originando
una solapamiento de seal en
Artefacto de desplazamiento qumico el lado del volumen de agua
con frecuencias mayores y una
+ Gx separacin en lado opuesto es
decir en sentido contrario a la
direccin del gradiente de
codificacin de frecuencias.

La diferencia de frecuencias entre la grasa y el agua aumenta al aumentar el campo


magntico, con lo que la diferencia en la colocacin espacial en la imagen que da origen al artefacto
de desplazamiento qumico aumente con el valor del campo magntico.

Otro factor que afecta al artefacto de desplazamiento qumico es el valor del la BW. En
efecto, para un mismo FOV, hemos visto que disminuir la BW, implicaba disminuir el valor del
gradiente de codificacin de frecuencias (ver Fig 8.5), con lo que el desplazamiento correspondiente a
una misma diferencia de frecuencias aumenta.

En consecuencia, disminuir la BW, manteniendo el FOV , (lo que equivale a disminuir el valor del
gradiente de codificacin de frecuencia), aumenta el artefacto del desplazamiento qumico.

Algunas veces en lugar de expresar el BW utilizado se da el valor del desplazamiento qumico


WFS.

Para un FOV determinado si aumentamos el WFS, equivale a disminuir la BW ( mayor


cociente (seal/ruido), menor rapidez en la lectura de la seal)

Otro factor que aumenta el desplazamiento qumico es (manteniendo la BW) aumentar el


FOV. Esto es consecuencia de lo visto anteriormente. Si aumentamos el FOV manteniendo la BW,
implica disminuir el gradiente para que un espacio mayor sea codificado con la misma banda de
frecuencias, en consecuencia una misma diferencia de frecuencias se representa con un mayor
desplazamiento espacial.
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En consecuencia:
Aumentar el FOV, manteniendo la BW, lo que equivale a disminuir el gradiente de codificacin
de frecuencia, aumenta el artefacto de desplazamiento qumico.

Por ltimo, si disminuimos la DIM-frec, manteniendo FOV y BW, implica aumentar el artefacto
de desplazamiento qumico ya que aumenta el tamao del pixel.

En resumen:
El ARTEFACTO DE DESPLAZAMIENTO QUMICO entre el agua y la grasa, (Fig 8.8) se
produce como consecuencia del desplazamiento en la posicin de la grasa hacia las frecuencias
menores. Aparece en las interfases agua-grasa/grasa-agua. Se caracteriza por un aumento de seal
en un lado y una disminucin de la seal en el otro siempre en la direccin de la codificacin de
frecuencias.

Fig 8.8
Artefacto por desplazamiento
qumico entre el aguay la grasa
Eje
cod.
Frec.

El artefacto de desplazamiento qumico disminuye si:


El campo magntico disminuye
Si la BW aumenta (manteniendo FOV constante)
Si FOV disminuye (manteniendo BW constante)
Si DIM-frec aumenta (manteniendo FOV y BW)

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