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rbol filogentico, en este caso con forma de dendrogramanota 1 , como cada nodo del dendrograma
se corresponde con un clado, entonces es un cladograma. Cada clado agrupa a todos los
descendientes de una poblacin ancestral comn, es decir es un grupo monofiltico. Los nodos
terminales (aqu simbolizados por letras individuales) no pueden ir ms all de las especies, ya que
por definicin, por debajo de la categora especie las poblaciones no evolucionan como linajes
independientes.
rbol filogentico (en este caso, las lneas representan la secuencia de organismos ancestros y
descendientes, es un filogramacita 1 ) que muestra un ejemplo de diversificacin de una especie
ancestral en tres especies presentes en la actualidad. Cada nodo del rbol (como el marcado con un
crculo rojo) representa la divergencia de un linaje ancestral en dos linajes que evolucionan
independientemente, esto es, que tienen el potencial de adquirir su propio set de cambios
evolutivos. En barras rojas se muestran las apomorfas: los nuevos estados del carcter.
Un cladograma se puede interpretar como una secuencia de ancestros y descendientes, lo cual es
una hiptesis que se superpone al dendrograma obtenido al determinar las apomorfas de los linajes
ancestrales. No todos los investigadores estn de acuerdo en interpretar un cladograma de esta
forma, porque por ejemplo la historia filogentica del grupo puede no haberse dado en forma
de cladognesis.cita 2
Del rbol filogentico se puede derivar una clasificacin de los organismos. Los taxones terminales
se circunscriben y agrupan en taxones de rango sucesivamente ms alto. Los anidamientos deben
tener congruencia o "consistencia lgica" con el rbol filogentico, aunque la forma en que se tiene
que dar esta consistencia est en discusin.14 Ntese que la clasificacin tiene forma de
dendrograma.
ndice
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1Definicin de taxn
2La taxonoma segn las diferentes escuelas
3Las dos funciones de los sistemas de clasificacin
4Construyendo una clasificacin
5La clasificacin en la categora especie
6Nomenclatura biolgica
o 6.1Categora taxonmica
o 6.2Nombre cientfico
o 6.3Por qu cambian los nombres de los taxones?
7Determinacin o identificacin de especmenes
8Historia de la taxonoma
o 8.1De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos
o 8.2Taxonoma y evolucin
o 8.3Formalizacin de las normas: los Cdigos
o 8.4Relacin con las taxonomas populares
9Perspectivas actuales de la ciencia de la Taxonoma
o 9.1El impedimento taxonmico
o 9.2El rol del ADN y los "marcadores de ADN"
o 9.3La crisis de biodiversidad
o 9.4Biodiversidad informtica
o 9.5La armonizacin de los Cdigos y el BioCode
o 9.6Propuestas de un registro central de nombres
o 9.7El PhyloCode
10Vase tambin
11Notas
12Citas
13Referencias citadas
14Bibliografa general utilizada como referencia
15Enlaces externos
Definicin de taxn[editar]
El taxn es un grupo de organismos con circunscripcin, posicin y rango. De la estructura
de la clasificacin biolgica como dada en la introduccin, comnmente llamada
"taxonoma linneana" o "sistema linneano" (pero vercita 9 ), se deriva la definicin de taxn,
que como explicitan los Cdigos de Nomenclatura,cita 11 es un grupo de organismos que
posee:
las que se utilizaron para tomar los datos, las que en el mtodo original de Hennig el
fundador39 , o la "voz ms articulada"37 del cladismo se asocian como descendientes de
un mismo linaje cuando se "encuentran" o determinan sus apomorfas: los cambios de
carcter en el linaje ancestral.cita 1 Otras formas de anlisis filogentico como los mtodos
fenticos (cuyo punto de partida es ciego en lo que respecta a la evolucin de los
caracterescita 17 cita 18 ) fueron incorporados a la definicin de clado, de forma que pueden
hipotetizar un "clado" (poblaciones agrupadas por poseer caracteres compartidos desde el
ancestro comn ms reciente) mediante mtodos de anlisis no Hennigianos.cita 1 El lector
interesado puede recurrir a las siguientes lecturas, listadas en Judd et al. (200718 ): Farris
(197952 ), Donoghue y Cantino (198853 ), Nelson y Platnick (19815 ), Humphries y Parenti
(198654 ), Brooks y McLennan (199155 ), Forey et al. (199256 ), Cracraft y Donoghue
(200457 ).
"Clado" proviene de cladognesis.cita 1 Los grupos descendientes de un linaje comn y
nico se llaman grupos monofilticos (mono: nico, phylum: linaje) sensu Hennig,cita 14 y los
trminos usualmente son utilizados como sinnimos (pero vercita 2 ). Los taxones que
representan grupos monofilticos se llaman "taxones monofilticos", y las apomorfas del
clado que representan, que pueden haberse encontrado, no alcanzan normalmente como
circunscripcin. Las apomorfas pueden haberse perdido en algunos miembros del grupo y
pueden ser compartidas por otros clados que las hubieran adquirido independientemente.
Slo despus de haber obtenido una circunscripcin y decidido una categora se puede
considerar al grupo un taxn y decidir si nombrarlo segn las reglas formales de
nomenclatura.
La taxonoma en la actualidad. La taxonoma (definida segn la escuela cladista) decide qu cladoscita 1 se correspondern con
taxones con su circunscripcin, posicin taxonmica, categora taxonmica, y nombre formal o cientfico.
Otra escuela que fue encabezada por RR Sokal y PHA Sneath69 (Sokal y Sneath 196346 ,
Sneath y Sokal 197370 , comentarios de los autores originales en Sokal 19862 y Sneath
199569 ) recordaba que como no haba forma de testear si eran verdaderas las "hiptesis
previas" sobre evolucin, los razonamientos se hacan circulares: los "grupos preferidos"
determinan las "apomorfas preferidas" que a su vez determinan los "grupos preferidos".cita
21
En los '60 cada autor de una clasificacin propona un rbol completamente distintocita
22
y eran pocos los grupos que se mantenan entre autores. Sokal y Sneath no slo
presentaban novedosos mtodos de anlisis "numricos"nota 3 cuantitativos que sacaban
provecho de las en ese momento novedosas computadoras, sino que tambin eran
mtodos "fenticos"nota 3 : intentaban no asumir hiptesis de evolucin para armar el rbol,
que deba buscarse siempre que existiera la posibilidad.cita 17 cita 23 En las ltimas dcadas,
en que "toda la sistemtica es en alguna forma numrica"69 debido a la cantidad de
caracteres que se obtienen a su vez de cantidad de lneas de evidencia diferentes (a las
tradicionales se sumaron los anlisis moleculares de ADN, los caracteres bioqumicos y
de ultraestructura), se pudo dar vida til a los mtodos de esta escuela fentica que al
mismo tiempo perdi visibilidad, porque a medida que se agregan hiptesis evolutivas para
aumentar la congruencia entre lneas de evidencia diferentes, los taxnomos van llegando
a un consenso acerca de cules sern las "verdaderas" de ellas con las que estimar la
filogenia, con las que inferir las relaciones cladsticas.cita 23 Desde mediados de los '90 la
sistemtica vivi momentos emocionantes: se empezaba a vislumbrar un nico rbol
predictivo y robusto, y efectivamente, muchos grupos fueron abandonados por no estar
basados en hiptesis evolutivas correctas, incluidos algunos de larga data que causaron
mucha sorpresa. Los autores de esta tradicionalmente llamada "escuela"cita 19 enfatizaban
que slo propusieron mtodos de anlisis numrico4 , que fueron slo una parte de
importantes avances numricos en anlisis filogentico, sistemtica molecular, anlisis
morfomtrico e identificacin numrica.69
Hoy, las clasificaciones cladistas predominan por sobre las evolucionistas.cita 15 Las dos
escuelas admiten que se necesitan nombres tanto para los grupos parafilticos como para
los monofilticos que los abarcan, la discusin entre cladistas y evolucionistas radica en
cul es el sistema de nombres que debera formalizarse en una clasificacin.cita 24 Los
evolucionistas formalizan nombres de grupos parafilticos, y mencionan con nombres
informales los grupos monofilticos no clasificados (por ejemplo Cavalier-Smith 1998 en
adelantecita 20 formaliza los reinos y nombra los supergrupos de eucariotas sin
formalizarlos), mientras que los cladistas formalizan slo grupos monofilticos, llamando
con nombres informales a los grupos parafilticos (por ejemplo Adl et al. 200589formalizan
los supergrupos de eucariotas y proponen el nombre informal procariotas o bacterias para
ese grupo parafiltico).
Deben permitir hacer identificaciones,18 cita 25 o visto de otra manera, deben funcionar
como un sistema de almacenamiento y recuperacin de datos; para lo que cada
taxn debe estar claramente delimitado: un especmen encontrado del que se
pudieran extraer los estados de sus caracteres, debera poder ubicarse
inequvocamente en un taxn conocido. Los cientficos en todas las disciplinas deben
utilizar los taxones como unidad de trabajo, y publicar los resultados de sus trabajos
en relacin con el taxn estudiado. Por lo tanto los nombres cientficos de los
organismos, los taxones formales, deben representar el consenso de la comunidad
cientfica, slo de esta forma funcionan como llave de acceso a un cuerpo de
informacin que refiere siempre al mismo grupo de organismos, aunque est disperso
en libros y revistas escritos en muchas lenguas por diferentes autores, o proceda de
diferentes campos de la biologa o la divulgacin: como idealmente hacen referencia
los taxnomos, "El nombre de un organismo es la llave hacia su literatura"cita 26
Deben permitir hacer predicciones.18 cita 25 . Por ejemplo, cuando se encuentra un
compuesto de inters mdico en una planta, es comn que haya inters en investigar
si ese compuesto se encuentra tambin en otras especies relacionadas con ella; una
taxonoma bien armada debera permitirle al investigador presuponer a priori lmites de
su investigacin para los que sea ms probable confirmar sus hiptesis y ahorrar
esfuerzos de muestreo.18
La decisin de si armar la clasificacin para predecir o para identificar recorri toda la
historia de la taxonoma; las dos funciones coincidiran en una clasificacin que fuera al
mismo tiempo "natural" como "artificial",cita 27 con claves de identificacin que la
reensamblen en grupos con parecidos superficiales y por lo tanto muy poco predictivos,
pero con las que se llega con facilidad al taxn terminal.cita 25 La dificultad radica en que si
se hace el ejercicio de buscar un solo carcter que sea diagnstico de un taxn (si el
organismo posee un estado del carcter, pertenece al taxn, si posee otro estado, no
pertenece al taxn, invariablemente, es decir una clasificacin monottica), se notar que
esta bsqueda puede fallar al menos potencialmente en todos los grupos "naturales",
debido a que todos los caracteres son inestables en algn grado y pueden evolucionar, y
esto puede suceder tambin si se toma un conjunto de caracteres. La forma alternativa de
circunscripcin es proponer los estados de forma probabilstica, esto es, un organismo es
miembro de un taxn si posee un nmero muy alto de estados de caracteres similares a la
descripcin del taxn, especialmente de los poco lbiles.cita 28 El mismo algoritmo polittico
dar siempre el mismo resultado, basado en las probabilidades, pero a veces puede no ser
el esperado. Aqu se encuentra la diferencia fundamental entre las clasificaciones
"naturales" y las "artificiales": en la clasificacin natural, la determinacin es una
probabilidad de estar acertado, dicho de otra manera un porcentaje de veces se espera
que la determinacin est equivocada. Esto es porque el grupo existe independientemente
de si el taxnomo lo circunscribi correctamente, e independientemente de la clave de
identificacin utilizada. En las clasificaciones artificiales, la determinacin, aunque
provenga de un pesaje probabilstico de los caracteres, siempre es la correcta, aunque el
grupo no resulte ser lo que el taxnomo tena en mente. El trabajo del taxnomo se
manifiesta en su habilidad para corregir los grupos artificiales creados por el hombre de
forma de acercarlos cada vez ms a los grupos naturales con cada agregado de
informacin nueva.nota 4
Si un grupo "natural" es un grupo "predictivo" y esto, en taxones superiores a especie, se
logra debido al nmero de caracteres medidos y no medidos compartidos por los
miembros del grupo, entonces la "naturalidad" de los grupos ser una cuestin de grado, y
habr grupos ms o menos similares, o ms o menos "naturales".cita 27 Su componente
ms importante es el histrico o filogentico,2 que adems ofrece impresas en sus
similitudes fenticas las restricciones construccionales que restringen las direcciones en la
evolucin del grupo de una forma que no puede ser explicada por factores
ecolgicos.39 Tanto cladistas como evolucionistas se adjudican las clasificaciones con
mayor valor predictivo, o "ms naturales" (p.ej. T Cavalier-Smithcita 29 , E Mayrcita 30 , NI
Platnickcita 31 , Hrandl y Stuessycita 32 ).
pero algunos autores las desestiman por considerarlas arbitrariasnota 7 y hasta los hay que
proponen eliminar el sistema de clasificacin con categoras (por ejemplo en de Queiroz
2006nota 8 ). Por razones histricas se utilizan las categoras linneanas de
clasificacin: reino, filo o divisin, clase, orden, familia, gnero y especie.
Las gaviotas del gnero Larus presentan alrededor del rtico un anillo de poblaciones cuyos
extremos no son interfrtiles. Los taxnomos reconocen entre 2 y 8 especies. Sobre la base de este
grfico en el primer concepto taxonmico de la taxonoma moderna Linneo hubiera nombrado 7
"tipos" en correspondencia con los 7 nombres vulgares, y hubiera reconocido la existencia de
hbridos entre ellos, dejando a resolver el dilema de los lmites de cada especie.
Nomenclatura biolgica[editar]
Nomenclatura biolgica redirige aqu. Para otras acepciones, vase Nomenclatura
(desambiguacin).
Dominio
Reino
Filo o
divisin
Clase
En los Cdigos de Nomenclatura, son siete
las categoras primarias o principales:cita
49
Reino, Filo o Divisin, Clase, Orden, Orden
Familia, Gnero, Especie. Histricamente,
el Cdigo de Zoologa utiliz la
categora Filo (Phylum en ingls y en latn), y
Familia
el Cdigo de Botnica, del que se escindi el
de Bacterias, la de Divisin (Division, en Gnero
ingls, Divisio en latn), hoy en da en una
direccin hacia la armonizacin se los trata Especie
como sinnimos.cita 49
Categoras taxonmicas
Una regla mnemotcnica para recordarlas es
la siguiente:
Por arriba de reino no hay categoras
El rey es un filsofo de propuestas en los Cdigos, los taxnomos
que las utilizan pueden hacer uso
mucha clase que ordena para del Dominio, el Superreino o el Imperio.
su familia gneros de buena especie
La reina es una diva de mucha clase que ordena para su familia gneros de
buena especie
En los Cdigos de Nomenclatura, cada especie queda designada por un binomio (una
expresin de dos palabras) en latn, donde la primera palabra, el "nombre de gnero",
es compartida por las especies del mismo gnero; y la segunda, el "adjetivo
especfico" o "epteto especfico", hace alusin a alguna caracterstica o propiedad
distintiva de esa especie en particular, como pueden ser el color (albus,
blanco; cardinalis, rojo cardenal; viridis, verde; luteus, amarillo; purpureus,
prpura; etc.), el origen (africanus, africano; americanus, americano; alpinus,
alpino; arabicus, arbigo; ibericus, ibrico; etc.), al hbitat (arenarius, que crece en
la arena; campestris, de los campos; fluviatilis, de los ros; etc.), un homenaje a una
personalidad de la ciencia o de la poltica o atender a cualquier otro criterio. No es
necesario que el nombre est en latn, slo es necesario que est latinizado. Los
nombres de gnero siempre van con la primera letra en maysculas, los eptetos
especficos siempre van en minsculas, y los nombres de gnero y de especie van
siempre en itlicas (o subrayados, si se escribe a mano).nota 14 Al escribir el nombre de
especie, el epteto especfico nunca es utilizado solo, y es mandatario que est
precedido por el nombre del gnero, de forma que el nombre de la especie sea el
binomio completo. La abreviacin a la primera letra del nombre del gnero
precediendo el epteto especfico completo tambin es aceptable una vez que el
nombre ya apareci en su forma completa en la misma pgina o en un artculo
pequeo. As por ejemplo, la lombriz de tierra fue llamada Lumbricus terrestris por
Linneo, y si el nombre ya apareci antes en el artculo y no hay ambigedad, puede
volver a referirse a ella como L. terrestris. Con respecto a los taxones ubicados en la
categora de gnero y superior, los nombres son uninomiales (constan de una sola
palabra) y siempre se escriben con la primera letra en maysculas (aunque solamente
en la categora de gnero van en itlicasnota 15 ). Como los Cdigos de Nomenclatura
prohben que dentro de cada Cdigo haya dos taxones con el mismo nombre, no
puede haber dos gneros con el mismo nombre (ni dos taxones por arriba de gnero
con el mismo nombre), pero como ocurre que el epteto especfico de las especies
slo se usa despus del nombre del gnero, puede haber dos especies diferentes
pertenecientes a gneros diferentes que compartan el mismo epteto especfico. Una
vez fijado, un nombre no es sustituido por otro sin un motivo nomenclatural. Por
ejemplo el roble de los alrededores de Madrid fue bautizado como Quercus
pyrenaica errneamente, puesto que no se encuentra en los Pirineos, pero tal
circunstancia no justifica un cambio de nombre.
La recomendacin es que los nombres sean fciles y descriptivos,cita 52 pero no hay
reglas que impidan a los investigadores utilizar su propia inventiva para crear los
nombres cientficos ms inslitos: el nombre de la araa Pachygnatha zappa, porque
tiene una mancha en el abdomen igual al bigote del artista Frank Zappa;
algunas moscas chupadoras de sangre del gnero Maruina: Maruina amada, M.
amadora, M. cholita, M. muchacha, M. querida, M. chamaca, M. chamaguita, M. chica,
M. dama, M. nina, M. tica y M. vidamia, todos adjetivos cariosos; el dinosaurio que
fue llamado Bambiraptor debido al Bambi de Disney; el molusco bivalvo Abra
cadabra (aunque despus se lo cambi de gnero); y quizs el caso ms
sobresaliente, el gnero de araas brasileas Losdolobus, llamado as porque los
investigadores que lo describieron, queriendo homenajear a dos argentinos que
haban colaborado, les pidieron a stos que inventasen un nombre para el nuevo
gnero, que qued como Losdolobus por "los dolobus", trmino del lunfardo argentino
intraducible en una enciclopedia.157 . Los Cdigos en una de sus recomendaciones
hacen un llamado a la responsabilidad, "Los autores deberan ejercitar un razonable
cuidado y consideracin en la formacin de nombres nuevos para asegurarse de que
son elegidos con sus subsecuentes usuarios en mente y que, mientras sea posible,
sean apropiados, compactos, eufnicos, fciles de memorizar y no causen ofensa".cita
52
En las categoras superiores a gnero los nombres cientficos son la raz del tipo (un
gnero del taxn, en los rangos ms bajos el ms antiguo) con un sufijo que denota la
categora en la que el taxn fue ubicado,cita 53 segn se indica en la siguiente tabla:
- -
-phytinacita
54
phycotinacit mycotinacit Hay
o a 54 o a 54 o
Subdivisi recomendacio
nombre -
n / Subfilo nombre nombre nes en el
descriptivo
cita 53
descriptivo descriptivo BioCode.cita 55
cita 53 cita 53
Grup
o -idae (pero
- -
Clase no -
phycidaecita mycetidaeci Hay
iridae)cita 54 o ta 54 o
Nombre
54 o
recomendacio
Subclase descriptivo
nombre nombre nes en el cita 56
nombre
descriptivo descriptivo BioCode.cita 55
descriptivo cita 53 cita 53
cita 53
Hay
recomendacio
Orden -alescita 57 o nombre descriptivocita 53 -alescita 58
nes en el
Grup BioCode.cita 55
o
Orde
Hay
n
recomendacio
Suborden -ineaecita 57 o nombre descriptivocita 53 -ineaecita 58
nes en el
BioCode.cita 55
Superfamil
- -oideacita 59 -
ia
Grup
Familia -aceaecita 60 -idaecita 59 -aceaecita 58
o
Famili
-oideaecita
a Subfamilia -oideaecita 61 -inaecita 59 58
El color rojo indica la categora primaria y el grupo de categoras generado por ella. El
azul indica las celdas para las que el principio de prioridad en la eleccin del gnero
tipo es mandatario en cada Cdigo. Las celdas dejadas en blanco indican que no est
formalizada esa categora en el Cdigo dado.
Un "nombre descriptivo" es por ejemplo Monocotyledoneae ("un cotiledn"), o un
nombre con una raz descriptiva en lugar de derivar de un gnero tipo como
Coniferales (raz: "Conifer-" sufijo: "ales").cita 53 Estos nombres no estn asociados a un
gnero "tipo" en Botnica, sino a la descripcin del nombre (p.ej. las monocotiledneas
pueden recircunscribirse de forma de dejar cualquiera de sus subtaxones fuera del
grupo, pero poseer "un cotiledn"), en cambio s estn asociados a un gnero tipo en
Bacteriascita 53 . Los Cdigos llaman a los nombres descriptivos sin gnero
tipo typeless ("sin tipo"), algunos autores definen como "tipo" al contenido del taxn
que est asociado al nombre en un taxn nominal, por lo que la descripcin en un
nombre descriptivo sera tambin un "tipo". Ntese que esta situacin difiere de la de
taxones inferiores, en los que la descripcin del nombre descriptivo nunca se agrega al
"tipo". En taxones superiores al grupo familia, o superiores al grupo orden en
bacterias, no es mandatario que el gnero seleccionado como "tipo" sea el primero de
los nombrados en regla.
Un ejemplo de taxn es el orden Primates. En esta expresin, "orden" especifica la
categora taxonmica del grupo, ms abarcativa que la categora de familia y menos
abarcativa que la de clase. "Primates" es el nombre del taxn. El orden Primates est
incluido en la clase Mammalia (los mamferos), y a su vez incluye diversas familias
como la familia Cebidae (cbidos, las monas americanas) o la
familia Hominidae (homnidos, nuestra propia familia).
Por debajo de la categora especie se encuentran la subespecie, variedad y forma. Su
nombre se arma con el nombre de la especie seguido de subsp. o de var. o f.
respectivamente, seguido de un epteto subespecfico: Carpinus
caroliniana subsp. caroliniana, Lyonia ligustrina var. ligustrina, salvo en las
subespecies de animales que no llevan la partcula subsp: Canis lupus familiaris. Son
nombres trinomiales.
Adems, en todos los taxones, la primera vez que se nombra un taxn en una
publicacin cientfica, el nombre cientfico puede verse seguido del apellido del autor
de su descripcin (normalmente llamado la "autoridad"), mejor an si se sigue del ao
en que el taxn fue descrito. El nombre del autor puede estar abreviado, por ejemplo a
Linneo se lo abrevia con una L.. Las veces posteriores que se nombra al taxn en la
publicacin se evita el autor y el ao de publicacin. A veces se encuentran
variaciones en la forma en que autor y ao son escritos (por ejemplo hay dos autores
conectados por palabras en latn como in o et o ex, o el autor est entre parntesis), y
cada una de estas variaciones tiene su significado en Nomenclatura. Por ejemplo, en
el caso de los animales, si en la actualidad una especie en particular est ubicada en
un gnero diferente al que le fue asignado por su autoridad original, el nombre del
autor y el ao se ponen entre parntesis indicando as que originalmente se la
describi con otro nombre. As, el len en la actualidad es Panthera leo (Linnaeus,
1758), y se pone autor y ao entre parntesis porque Linneo lo describi originalmente
como Felis leo. El autor y ao de publicacin no son reglas sino recomendaciones de
los Cdigos de Nomenclatura, pero son de uso corriente en la literatura y
recomendados por muchos autores. Cuando se hace referencia a la circunscripcin de
un concepto taxonmico utilizado en la actualidad que difiere de la circunscripcin de
la publicacin del taxn nominal, se puede encontrar el conector sensu158 (p.ej.
"Arenariasensu McNeill (1962)"). El autor y ao del taxn nominal original se
mantienen tiles para evitar errores con nombres homnimos, y esperablemente en el
futuro ambos autores puedan reemplazarse por un Identificador Global de Conceptos
Taxonmicos (de nombres segn cada autor), que cuando se resuelva gue a la cita
del concepto utilizado con todas sus referencias y quizs un enlace a la
publicacin.33 159 158
Por qu cambian los nombres de los taxones?[editar]
La descripcin formal y la tipificacin de los taxones son procedimientos en los que es
frecuente observar errores e inconsistencias, y esto ocurra aun en mayor medida
antes de que los Cdigos Internacionales reglamentaran estos trabajos muy
pormenorizadamente. Los nombres de los taxones pueden cambiar cuando son
redescubiertas descripciones ms antiguas del mismo taxn, y se aplica el principio de
prioridad, o cuando se observa que la descripcin original en realidad refera a un
taxn diferente. No suelen darse estos casos en los grupos ya bien estudiados, y en
los Cdigos hay adems mecanismos para la supresin de nombres pobremente
definidos en los grupos ms complicados. Una vez asentada la taxonoma
fundamental de un grupo, es poco probable que los cambios de nombres se den por
esta clase de motivos.
Los nombres cambian cuando el descubrimiento de nueva informacin obliga a
modificar las circunscripciones, pero tambin -y sin necesariamente nueva informacin
que lo justifique-, los nombres cambian por diferencias de criterio entre los
especialistas.
Por ejemplo, es muy comn que a distintos grupos de organismos recin descubiertos
se les d nombres de especie (y de gnero incluso) nuevos y que aos despus un
taxnomo que los estudie llegue a la conclusin de que todos pueden hibridar entre s
y dar descendencia frtil, y unifique todos los taxones en una nica especie (en este
caso todos los nombres cambian al nombre de la primera especie descrita dentro del
grupo), dejando, en todo caso, los antiguos nombres de especies como subespecies.
Con posterioridad puede llegar otro taxnomo que considere que esos grupos de
organismos deberan dividirse en dos especies distintas, que en la naturaleza conviven
sin hibridarse (aunque pudieran), debido a que cada una de las especies que l
propone forma una unidad monofiltica en un anlisis de filogenia. Entonces a los que
se encuadran en la "nueva" especie, se les cambia el nombre de especie por el
nombre de la especie ms antigua descrita dentro de la "nueva" especie. Otro
taxnomo podra argumentar ms tarde que todos los grupos originalmente descritos
son especies vlidas del mismo gnero, debido a que cada uno de ellos puede ser
identificado por su propio grupo de caracteres morfolgicos, y que dentro de cada uno
de ellos hay un patrn de ascendencia y descendientes. En este caso, todos los
nombres de especies cambiaran al primer nombre dado a cada grupo cuando fue
descrito, pero todos los nombres de gnero se unificaran en uno solo, por lo que
todos los gneros pasaran a nombrarse como el gnero ms antiguo descrito dentro
del grupo. Esta inestabilidad de los nombres se habra producido casi nicamente por
cambios de "filosofa taxonmica": lo que cada autor considera que se corresponde
con la categora especie. Estas diferencias conceptuales entre taxnomos son
extremadamente comunes hoy en da, lo cual lleva a una gran inestabilidad potencial
en los nombres de los taxones (Vane-Wright 2003160 citado en Mallet y Willmott 2003137 ).
Si se han realizado identificaciones para un trabajo que se est por publicar, es buena
prctica175 176 citar cul fue el taxnomo consultado o las publicaciones taxonmicas
que fueron utilizadas para identificar las especies, y agregar una seccin
de Especmenes examinados177 donde se cite la ubicacin de los especmenes que
fueron depositados o visitados en la coleccin que los preserva como referencia
(los voucher178 ) de los datos sobre los que se realiz la hiptesis publicada. La
seccin "especmenes examinados" debera incluir el nombre cientfico actual [o el
aceptado sensu qu autor], el nmero de identificacin del especmen individual dentro
de la coleccin (el accesion), el nombre de la coleccin o su acrnimo, la localidad
donde fue colectado, y si se las obtuvieron, los accession de las secuencias de ADN
publicadas por ejemplo en GenBank.177 Si fue publicado el dataset de ocurrencias por
ejemplo en GBIF, puede citarse la ubicacin del mismo en el repositorio pblico en el
que fue compartido o las ocurrencias dentro del mismo utilizadas. Las colecciones de
especmenes poseen una infraestructura especfica para cada taxn, y cada autor
puede tener una coleccin privada -incluso unicata (unicate collection155 ), con un solo
especmen o lote, quizs holotipo o isotipo- pero si es posible se alojan179 en
instituciones pblicas como museos de historia natural o jardines botnicos, que son
los sitios ms estables y las hacen perdurar por centurias, el taxnomo especializado
que dirige su manutencin y crecimiento el curador idealmente debera permitir al
pblico un acceso a los especmenes aunque sea restringido. Las colecciones suelen
tener catlogos electrnicos con la informacin de los especmenes que poseen, que
son cada vez ms fciles de acceder y, a pesar de que en sus inicios carecan de
estandarizacin en sus formatos, se prev que en el futuro muchas de esas bases de
datos puedan ser accedidas por un mismo portal, esperablemente mediante los
estndares TDWG. Uno de esos portales, creado en el 2001 por acuerdos
internacionales entre agencias gubernamentales despus de la Convention on
Biological Diversity (CBD) es GBIF, que aloja tanto datasets compartidos desde los
catlogos de museos y herbarios como datasets que se publican asociados a
publicaciones cientficas. En las colecciones, no es raro que los especmenes se
reclasifiquen si estn lo suficientemente bien documentados, se calcula que un
porcentaje que puede llegar a ser de hasta un 20% o un 25% de los especmenes
puede ser reclasificado durante el rechequeo (ver175 ); algunos de ellos podrn ser
designados como el "tipo"179 de un nombre de especie nueva o de una ya nombrada
cuyo tipo original se ha perdido18 19 180 181 . Son cada vez ms comunes los softwares
que formatean la seccin de especmenes examinados a partir de la planilla de datos,
y tambin puede formatearse en forma de data paper un set de ocurrencias para
publicacin formal (p.ej. el GBIF IPT182 )
El primer paso en una identificacin es una observacin a simple vista, que implica
una apreciacin inconsciente de muchos caracteres del espcimen al mismo tiempo,
en la que se asocia el espcimen a cierto taxn formal o informal (lo que se llama
apreciacin gestalt u holstica del espcimen183 ), los mtodos ms formales de
identificacin entran en juego cuando el interesado necesita que la identificacin
contine hasta taxones ms especficos, o cuando necesita confirmar una posible
apreciacin (18 :6-7;183 ). Los mtodos formales tienen en cuenta pocos caracteres,
expresados adems de forma "tipolgica"184 , resultando ser una simplificacin de la
apreciacin gestalt del taxnomo que los realiza; pero siempre que se dispone de
ellos, es importante seguirlos. Comparar directamente con las colecciones o las fotos
puede inducir errores, ya que en las fotos pueden no mostrarse o no ser evidentes
para el lector no entrenado los caracteres que diferencian el taxn de los dems.169
Los taxnomos concuerdan en que la mejor forma (19 :498) y la ms rpida (18 :6-7) de
identificar un espcimen con mtodos formales es consultar a un especialista, sea
profesional o experto local, al que le sean familiares la flora o la fauna de la regin y
que est bien entrenado y al tanto de las ltimas actualizaciones publicadas sobre el
taxn. La determinacin que l haga ser muchas veces ms exacta y actualizada que
el nombre que el usuario final pueda obtener con la literatura y los instrumentos a los
que tenga acceso (19 :498).
Los instrumentos para la identificacin de plantas y artrpodos, por ejemplo,
son lupa de mesa y elementos para manipular la muestra en la lupa (dos agujas de
diseccin y una pinza de punta fina), en el caso de las plantas un bistur para
seccionar rganos o una hoja de afeitar, puede ser til un calibre para hacer las
mediciones, y quizs saber hacer preparados para observar al microscopio (18 :557). Si
adems se tiene acceso a las fotografas del especmen vivo o recin colectado la
tarea de identificacin se ve muy facilitada. Raramente dos especies no pueden
discernirse morfolgicamente y se debe recurrir al envo de muestras para la
extraccin y anlisis de ADN.
En la lupa se observan los caracteres con un aumento de hasta unos 40x (amplifica una imagen 40 veces su tamao).
Bistur de hoja delgada para seccionar rganos de plantas, tambin puede ser una hoja de afeitar.
El microscopio ptico tiene un aumento de 40x a 400x. A diferencia de la lupa, la muestra debe presionarse entre dos
vidrios (portaobjetos y cubreobjetos) hasta formar una capa delgada, y a veces es necesario teirla.
Las lupas de mano o de bolsillo, que se pueden llevar al campo, tienen un aumento de unos 2x a 6x. Las de bolsillo
consisten de una lente con tapa rebatible similar a la de la foto.
Calibre.(18 :557)
Las herramientas literarias para la comparacin formal de esos datos son las claves
de identificacin, que hacen uso de los estados de los caracteres del espcimen para
descartar posibilidades hasta llegar al nombre del taxn183 ; de ellas el mtodo ms
difundido todava es la -arcaica- clave dicotmica (18 :557).
En la clave dicotmica se elige siempre uno de dos caminos, dos descripciones
mutuamente excluyentes de los estados de algunos caracteres. La eleccin enva al
usuario al siguiente par de descripciones, hasta que, si el usuario no cometi un error,
se llega al nombre del taxn (18 :558,19 :496-497). La tarea se ve muy facilitada si la clave
tiene fotografas del aspecto de los estados de los caracteres.
Clave dicotmica de plantas que parte de la familia de las ninfceas (una familia de nenfares), y llega hasta el gnero
(tomada de la Wikipedia):
Flores hipginas. pice del gineceo formando un disco plano a ligeramente cncavo con estigmas radiales. Spalos
5-14. Polen anasulcado, espinoso.
Subfamilia Nupharoideae Mot. Ito, 1987.
Flores perginas a epginas. pice del gineceo en forma de copa, toda su superficie estigmtica. Spalos 4-5.
Polen de otro tipo.
Subfamilia Nymphaeoideae Arn., 1832.
Borde del limbo levantado formando un reborde continuo. Envs foliar aculeado. Estaminodios y apndices
carpelares presentes.
Gnero Victoria Lindl., 1837. Amrica meridional tropical.
Borde del limbo no levantado. Haz y envs foliares aculeados. Estaminodios y apndices carpelares
ausentes o inconspicuos.
Gnero Euryale Salisb., 1805. Asia, de la India al Japn.
Plantas sin acleos. Hojas de diversas formas, peciolo inserto en una escotadura del borde del limbo.
Spalos 4-5. Estambres pndulos, epiptalos sobre la cara interna del tubo de la corola. Semillas espinosas,
sin arilo.
Gnero Barclaya Wall., 1827. Sureste de Asia.
Spalos 4(-5). Estambres erectos, perginos sobre la cara externa del tubo de la corola. Semillas lisas,
papilosas o pelosas, con arilo.
Ptalos 0-5. Eje floral central prominente por encima de la copa estigmtica. Hojas sumergidas lineares con
bordes fuertemente ondulados.
Gnero Ondinea Hartog, 1970. Australia occidental.
Ptalos (6-)8-40(-50). Eje floral central visible como pequea proyeccin en la base de la copa
estigmtica. Hojas sumergidas (si existen) anchas, de bordes apenas ondulados.
Gnero Nymphaea L., 1753. Cosmopolita.
Historia de la taxonoma[editar]
Los orgenes de la taxonoma se remontan a los orgenes del lenguaje,
cuando las personas llamaban con los mismos nombres a organismos ms o
menos similares, sistema que persiste hoy en da en lo que llamamos los
"nombres vulgares" de los organismos. Todas las sociedades humanas
poseen un sistema taxonmico que nombra a las especies y las agrupa en
categoras de orden superior. El ser humano posee un concepto intuitivo de lo
que constituye una especie, producto de agrupar a los organismos segn
las propiedades emergentes observadas a ese nivel de organizacin, y esto
se ve reflejado en que todas las clasificaciones populares de los organismos
poseen remarcables similitudes entre ellas y tambin con las utilizadas hoy en
da por los bilogos profesionales204 .
La taxonoma biolgica como la disciplina cientfica que conocemos hoy en da
naci en Europa. All, a mediados de la Edad Media se haban formado las
primeras universidades, donde se discutan temas de ndole filosfica y
tcnica. Pronto los naturalistas se dieron cuenta de que, si bien los nombres
vulgares son tiles para el habla cotidiana, necesitaban un sistema ms
universal y riguroso para nombrar a los organismos: cada especie deba ser
nombrada, cada especie deba poseer un nico nombre, y cada especie deba
ser descripta de forma inambigua. Al finalizar la Edad Media, con la
dominacin militar y cultural que una Europa revitalizada sostendra sobre el
resto del mundo, el sistema all consensuado se extendera a todo el globo.
De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos[editar]
Vase tambin: Taxonoma de Linneo
Portada de la obra de Linneo Species Plantarum (1753), su largo ttulo informa al lector
la estructura del contenido, en la que encontrar los gneros "naturales" y las clases y
rdenes "artificiales". Est escrito en latn, el idioma universal de la poca.
Linneo fall en encontrar caracteres que fueran comunes a todos los miembros de una
familia, aun en las ms "naturales" de ellas, como las umbelferas.
En la foto: hojas de apio (Apium) con sus pequeas inflorescencias, hbito de la zanahoria (Daucus),
inflorescencias de hinojo (Foeniculum), inflorescencias del cardo corredor (Eryngium), raz de perejil
(Petroselinum).
Los sistemticos siempre han sido, son, sern, y deberan ser tipologistas.
Nelson y Platnick (19815 :328)
Los nombres nativos parecen perder toda importancia y repetidamente los expedicionarios los sea
"el lenguaje Quechua de los Incas se aproxima ms al lenguaje de los nios". Al parecer, los nativos
propios de cualquier sociedad civilizada como Dios, virginidad o inmaculada concepcin. Los indgen
plantas pero no una nica palabra que se pudiera traducir como rbol. Culturas cuya supervivencia
circundante, reconocan numerosas plantas de utilidad, saban cules eran sus usos, y les haban da
compartan con los naturalistas europeos [sus] conceptos de especie, gnero o clase. Para conquista
contingencias locales y fabricar "tipos ideales" conformes con el sistema de clasificacin europeo.
Pocas veces los conocimientos locales han sido utilizados tanto con criterios
antropolgicos como para la investigacin farmacutica. La adecuacin o no
de las taxonomas tradicionales al criterio cientfico ha sido objeto de algunas
investigaciones. nota 17
(1) Las colecciones237 229 236 a las que hoy se suman las de archivos
digitales y las de cultivos vivos de bacterias, protozoos, algas y
hongos238 , que se sugiere que se depositen en instituciones dedicadas
como museos y jardines botnicos. Algunos de ellos poseen colecciones
ya centenarias que preservan los ejemplares de la distribucin de las
especies en otras pocas y son una referencia de su evolucin,235 y son
independientes de los arbitrios de un investigador o "pequeo lab"cita
65 que quizs se deshaga de las colecciones despus de la muerte del
QD Wheeler (200423 )
caractersticas
cristalografa geobiologa
de los datos
datos binarios:
imagen CIF: estndar Plantilla de
formato
de texto amplio en el Excel
campo
cada imagen o
frame = 0.251 MB
set es de
tamao aproximadamente <1 MB
2400 frames (aprox. 1
GB) archivo de texto
>500 kB
repositorios de
pedidos
amplio uso en el
directos de los
campo en los que
datos,
muchas revistas
dificultuosos y
requieren que se
accesibilidad ad hoc,
depositen los CIFs
muchas veces
herramientas OAI-
sobre la base
PMHb se estn
de
volviendo disponibles
publicaciones
para los CIFs
variable
dependiendo
de la fuente
del
modelo de servicio:
presupuesto:
soluciones de
primariamente
estructura de
gobierno e
cristales provistos a
industria; la
propiedad los qumicos; la
autora y
intelectual autora de los datos
derechos
es ambigua, requiere
varan desde
negociacin antes de
completo
que los datos pasen
copyright a
de manos
muy limitado;
comn el
embargo de
largo plazo
La autora de la publicacin de los datos primarios asociados a
las publicaciones primarias, como fotografas digitales de los caracteres,
secuencias de ADN, datos de ocurrencia o de coleccin y de estados de los
caracteres de cada especmen de referencia (R Page258 , MJ
Costello283 278 284 , B Vanhoorne283 , W Appeltans283 , WK Michener278 , M
Gahegan278 , ZQ Zhang278 , PE Bourne278 , E Vanden Berghe284 , X Huang256 ,
BA Hawkins256 , F Lei256 , GL Miller256 , C Favret256 , R Zhang256 , G Qiao256 ,
VS Chavan285 240 , L Penev285 , D Hobern285 , P Ingwersen240 , Thomson
Reuters 2012286 ), evaluara al taxnomo con la evaluacin de la calidad de los
mismos y del trabajo que respaldan283 278 285 . Los datos crudos son el
fundamento del trabajo taxonmico, pero hace muchas dcadas que se
bajaron los costos de la publicacin en papel278 y a pesar de que revistas
electrnicas como Zootaxa y Phytotaxa y repositorios externos con la
infraestructura y la capacidad de almacenamiento requeridas han reabierto
esa posibilidad278 al 2015, como en biologa en general, la situacin no se ha
revertido y todava son raramente publicados,235 como son raramente citados
formalmente.287 288 Cuando se les pregunta, la mayora de los cientficos
contesta que guarda datos no publicados de experimentos publicados y
tambin de experimentos "que no dieron" (que no rechazaban una hiptesis
nula y no seran aceptados para publicacin), que "descansan en el sector
inferior de la cajonera del lado izquierdo de su escritorio", y la mayora de las
veces termina en la basura al momento del retiro del especialista, "an en los
retiros ms planificados", porque nadie -ni siquiera el cientfico- sabe
exactamente qu hay en esos medios de almacenamiento y formatos que van
quedando obsoletos ya que les falta la documentacin adecuada para
retomarlos cuando los metadatos no anotados ya fueron olvidados.241 En las
encuestas como la publicada en Huang et al. (2012256 ) o la hecha por
Thomson Reuters en 2010 (Fig.1288 ) la mayora de los cientficos estara de
acuerdo en publicar sus datos en internet de forma open access si recibiera
reconocimiento por ello en alguna forma similar a la publicacin en revistas
cientficas, como coautora o citas indexadas en bases de datos utilizadas en
clculos de mtricas relevantes como las mediciones de factor de
impacto288 256 245 . Sin embargo, y a pesar de que parece evidente que la
publicacin de los datos aumenta el nmero de citas de la publicacin
cientfica que hace uso de ellos289 , al 2010 la proporcin de datos subidos a
GBIF, el repositorio ms grande de ocurrencias de especmenes creado en el
2001 para satisfacer un objetivo clave de la Convention on Biological
Diversity,278 baj ao a ao en relacin a la que se detecta o "encuentra",278 y
de ella slo fragmentos estn asociados a publicaciones cientficas, siendo la
mayor parte datos de colecciones financiadas por organizaciones
gubernamentales278 , y ms de la mitad de los que lo haban hecho que
contestaron la encuesta denegaban la responsabilidad de la calidad de los
datos subidos a ese repositorio278 . Al 2013 est demostrado que una poltica
que hiciera mandataria la publicacin de los datos con un aseguro de su
preservacin y acceso al momento de la publicacin del paper altera este
paisaje para los autores,290 y desde el 2011 se han reforzado polticas en esta
direccin por parte de varias editoriales, gobiernos y organizaciones (p.ej.
Canad291 , USA292 , UK293 , la National Science
Foundation NSF294 , Evolution295 296 , The American Naturalist296 , Journal of
Evolutionary Biology296 , otras adherentes a la
poltica JDAP297 296 , PLOS journals298 ). El mismo presidente Obama resalt
en su discurso al estilo inicio de sesiones State of the Union 2012 que la "data
management" ser una de las habilidades crticas de trabajo en este siglo
XXI.299
Variadas propuestas se han hecho del tipo de modernizar la infraestructura
para mejorar la eficiencia del trabajo y facilitar la evaluacin del mismo,
algunas de las cuales se vern en las secciones siguientes. La que sobrevuela
todas ellas es la de digitalizar y proveer acceso online a los recursos
taxonmicos.279 Se propone digitalizar la literatura en papel300 301 302 , que las
publicaciones sean de contenido libre (ej.228 303 304 , pero ver305 ), que los museos
digitalicen sus colecciones306 304 239 307 , que stas sean de contenido
libre304 308 , que hubiera "megarrevistas" electrnicas para las publicaciones
taxonmicas -que pueden llevar ms de mil pginas-,309 310 , que stas sean
open-access310 , que se alojen los datos primarios utilizados en las
publicaciones en bases de datos pblicas para verificacin247 , que esos datos
estn relacionados con claves interactivas224 279 , que stas sean
accesibles224 , que sean actualizables.279 Son muchas las propuestas de un
nico portal que tenga acceso a todas las bases de datos, tanto de
colecciones como de bibliografa (p.ej. EOL280 ), a veces asociada a la
propuesta de relacionar esos datos en una nica clasificacin, tambin se
propone relacionarlos mediante buscadores (search engines) especializados
que detecten e indexen sus identificadores estandarizados311 , como son
comunes las propuestas de crear listas de taxones establecidos312 .
Tecnologas que se promueven son la digitalizacin 3D de imgenes de
preparados al microscopio (ej224 ,rSEM313 ), la creacin de fotografas focus
stacking de especmenes tipo, ensamblarlas en imgenes 3D306 313 , que los
museos compren la tecnologa para el anlisis de ADN y quizs
encontrar barcodes (ej. Tautz et al. 2003257 ), o que haya un "molecular lab"
cada 10 laboratorios22 , que se implemente la toma de datos telemtricos y
monitoreo satelital de distribucin y ecologa (Patterson et al. 2006280 ). Estas
iniciativas son tecnolgicamente sencillas, en este momento las principales
dificultades estn relacionadas con su integracin: la falta de estandarizacin
de los formatos235 -para lo cual est trabajando el TDWG-, las dificultades en
la creacin y mantenimiento de registros150 235 , ndices, e Identificadores
Globales reusables314 (algunos proponen en bases de datos copiables314 y
cosechables por buscadores especficos314 ), y que la financiacin no debe
perder el objetivo de obtener descripciones de especies publicadas, que
incluyan claves de identificacin bien documentadas203 y accesibles224 203 que
eviten la duplicacin de esfuerzos en el futuro, lo que han llamado a veces
peyorativamente "la actitud hacia el usuario final" o del usuario final (end-user
attitude315 cita 66 ). Se han financiado proyectos "horizontales" en miras de
organizar una "big science" a partir de una "small science" articulada,241 como
GBIF (repositorio de ocurrencias y fichas de coleccin de especmenes) y los
proyectos asociados de digitalizacin de los catlogos de museos y herbarios;
y el registro de nombres y actos nomenclaturales Zoobank y algn proyecto de
digitalizacin de catlogos de bibliotecas y hemerotecas; y desde el punto de
vista del trabajo del taxnomo, al '2010 ha demostrado en vistas del nmero
real de especies316 -mucho ms alto que el estimado en centurias previas316 -,
organizarse por taxones de tamao ms pequeo que los Reinos gobernados
por los Cdigos150 228 . Las monografas son "consumidoras de tiempo ms
que consumidoras de dlares" adems del salario,22 y los subsidios son pocos
y muy grandes y de corto plazo para el equipo y el tiempo que necesita cada
taxnomo,22 por lo que la falta de taxnomos en cada taxn podra solventarse
otorgando subsidios de tamao ms realista y con evaluaciones curriculares
ms realistas22 (PEET poda haber otorgado 10 veces ms subsidios 10 veces
ms pequeos, a 400 labs en lugar de 40, por los 5 aos que duraba el
subsidio22 ; la Flora of North America poda haber pagado pequeos subsidios
a quienes colaboraron en ella a medida que iban terminando su trabajo22 ), en
lugar de ser un equivalente a "ganarse una lotera".22 En cada taxn de
tamao ms pequeo cuando cada cuerpo mandatario internacional lo decida
puede organizarse una nueva fecha de inicio de la nomenclatura, la que hoy
en da slo existe en bacterias, fijada en 1980.150 228
El copyright ("derecho de copia") es de concernimiento en la preservacin de
la literatura taxonmica. La literatura taxonmica primaria en una distribucin
sin formato no se vera afectada por las leyes que restringen la realizacin de
copias y su distribucin (p.ej. el Convenio de Berna), pero son pocos los
investigadores que publican comentarios al respecto (p.ej. Costello 2009) y
parece que las editoriales no se hacen eco del tema.
nicamente las publicaciones de De Carvalho y colaboradores brasileos
denuncian que los "piratas de la biodiversidad" pueden boicotear el trabajo del
taxnomo.
El rol del ADN y los "marcadores de ADN"[editar]
Los anlisis moleculares de ADN se utilizan hoy habitualmente en los anlisis
filogenticos y desde los '90 que unos pocos cientos de bases, con su
cantidad enorme de combinaciones potenciales, parecen bastar para hacer
anlisis de identificacin y parentesco.137 Esto llev a algunos autores, como
Hebert et al. (2003317 ) y Tautz et al. (2003257 ), a proponer asignar un rol
central al ADN en la descripcin e identificacin de las especies, de forma que
una muestra de ADN y la lectura de una de sus secuencias de bases debera
ser una especie de marcador para ubicar el taxn al cual pertenece un
espcimen, de una forma similar a como se usa el cdigo de barras en los
supermercados. Tautz et al.257 incluso proponen refomar los Cdigos para que
este "identificador" sea un carcter agregado al "tipo". Esta "Taxonoma
basada en ADN" an adolecera de muchos de los mismos problemas que
tienen las dems propuestas de identificaciones o de agregar atributos al
"tipo", en particular, hay que decidir qu secuencia usar, ya que algunas
secuencias no dan informacin que diferencie al taxn de los dems. Esto
puede ser porque un mismo gen puede mantenerse inalterado durante
millones de generaciones y muchas especiaciones despus de su formacin,
o debido al fenmeno de introgresin, de forma que un gen que se haba
diferenciado vuelve a su estado anterior. Por lo tanto, de la misma forma en
que no es conveniente confiar en un solo carcter morfolgico para identificar
una especie, tampoco es conveniente confiar en una sola secuencia de ADN.
Adems, aun cuando la "Taxonoma basada en ADN" fuera financiada, habra
que preguntarse si es necesario agregar un requerimiento extra al ya lento
proceso de describir nuevos taxones, en especial teniendo en cuenta que se
calcula que slo el 10 % de las especies del planeta ha sido descrito. Debido a
eso, probablemente la mayora de los bilogos ver las secuencias de ADN
como un complemento de la informacin morfolgica, ms que intentar
reemplazarla buscando verdaderos barcodes. De todas formas, los Cdigos
no especifican ningn carcter en particular para diagnosticar nuevos taxones,
as que la "Taxonoma de ADN", con el tipo nomenclatural de costumbre, ya
es vlida, aunque la identificacin mediante caracteres visibles puede ser de
uso ms inmediato y su realizacin ms econmica que la lectura de un
verdadero barcode.137 203 318 319 320 263
BOLD(Barcoding of 2005 en
Life Data System). adlnte. Opera como banco de trabajo online: repositorio
de barcodes, anlisis, interfaz para submisin
a GenBank, herramienta de identificacin de
especies, conectividad con recursos externos.
Eucariotas,
Una regin de 658 pares de bases del gen Hebert et al.
principalmente
mitocondrial cytochrome c oxidase I (COI). (2003317 )
animales
Pero si bien ya en el 2010 Padial et al.225 calcularon que tomara 400 aos de
trabajo taxonmico constante llegar a describir las cerca de 10 millones357 de
especies de eucariotas, al 2012, la realidad es que las colecciones de historia
natural estn casi tan lejos de la digitalizacin completa como 20 aos atrs, y
an no hay una verdadera database central de acceso a colecciones, ni un
registro completo de las mismas para ofrecer a los usuarios.239 A travs de
GBIF, la fuente ms grande de informacin, Ario (2010358 ) estim que eran
accesibles no ms del 3% de los datos de especmenes preservados en las
colecciones de todo el mundo.239 Blagoderov et al. (2012239 ) calcularon que el
costo de la digitalizacin de los cerca de 30 millones de especmenes de
insectos alojados en la coleccin de entomologa del Museo de Historia
Natural de Londres, por ejemplo, tomara 23 aos de trabajo continuo de las
65 personas que componen el staff del departamento, y en el mundo,
dependiendo de la coleccin los costos varan entre 0,50 a unos cuantos
dlares por especmen para capturar sus datos completamente, por lo que la
digitalizacin completa de todas las colecciones de historia natural del planeta
costara unos 150 mil millones de euros y tomara unos 1500 aos.239 La
solucin ms comn propuesta es la prioridad de la digitalizacin sobre la
base de la demanda, tambin se propone financiar los costos de una
digitalizacin "industrial" de las colecciones.239
Zootaxa fue la primera "megarrevista"309 electrnica con referato. Creada en el
2001,309 lleg a publicar monografas de ms de mil pginas309 , y en el 2004
ya se perfilaba como la mayor revista en taxonoma zoolgica,309 momento en
el que entr a las mediciones de factor de impacto de ISI.309 359 Al 2008 se
promocion como la primera en publicar un "paper cibertaxonmico" con
enlaces y otras utilidades.309 A ella sigui una generacin de nuevas "revistas
rpidas" en taxonoma,309 incluyendo Phytotaxa (2009360 361 )
y Zookeys (2008313 ). Pensoft (Zookeys, Phytokeys, Mycokeys) distribuye
desde el 2011 de rutina los datos taxonmicos publicados hacia una serie de
recursos online que incluyen GBIF, EOL, y la indexacin en Zoobank,362 al
2015, una actualizacin del software permite que estas bases de datos
externas "cosechen" los datos de los papers que corrigen datos de papers
anteriores, as los datos se corrigen dinmicamente en ellas.362 Estas revistas
tambin hicieron las primeras pruebas de publicar papers "de datos" (data
papers).285 En el 2012 los dos Cdigos permitieron la publicacin electrnica
de actos nomenclaturales, facilitando el uso de este recurso.309 363 360
Algunas revistas tradicionales hoy exigen que los datos crudos (raw data)
sobre los que fueron tomados los datos de publicaciones taxonmicas sean
alojados en bases de datos pblicas.247 Tambin son usuales los artculos
"suplementarios" publicados en formato exclusivamente electrnico.
Por otro lado, al 2014, las bases de datos externas ofrecen la posibilidad de
publicar monografas taxonmicas fuera del circuito de las revistas cientficas,
con las facilidades que podra dar una base de datos interactiva.279 262 Algunos
softwares para monografas son las plataformas Scratchpads, KE-EMU,
Diversity Workbench Platform, EDIT Platform for Cybertaxonomy (el ltimo el
nico de los listados con capacidad de alojar clasificaciones alternativas),
softwares para alojar una base de datos descriptivos y crear claves
son Lucid2, Xper2.262
La armonizacin de los Cdigos y el BioCode[editar]
La IUBS es un organismo que tiene su participacin en los Cdigos en uso y
en 1985 form un Comit de Nomenclatura Biolgica, el cual desde ese
momento ha organizado numerosos congresos y reuniones, a los que se han
sumado el auspicio de la IUMS (International Union of Microbiological
Societies) y del IAPT, y el apoyo de organismos como CAB International,
el Linnean Society of London, la Royal Society of London, entre otras. En 1994
se form el IUBS/IUMS International Committee on Bionomenclature (ICB).
Fue el ICB quien propuso un primer borrador de un Cdigo unificado de
nomenclatura despus de sus esperables congresos y revisiones que fue
presentado como el "Borrador del BioCdigo 1997" (Draft BioCode 1997) (DL
Hawksworth, presidente de la IUBS150 ).
El Biocode propuso que fuera utilizado en reemplazo de los Cdigos en uso,
pero su uso no fue implementado por los autores de publicaciones
taxonmicas. La crtica principal consista en que haba baja disposicin de
botnicos y zologos en aprenderse todo un conjunto de reglas nuevas364 ,
argumentando que los problemas existentes podan superarse reformando
cada Cdigo en uso, lo que quizs est relacionado con la crtica de haber
sido "poco maduros"365 366 367 368al presentar una propuesta semejante.
La crtica fue escuchada y la nueva versin del BioCode, el Draft BioCode
2011, ha sido sustancialmente reescrita de forma no de reemplazar los
Cdigos actuales, sino para proveer un marco comn que los englobe. Est
repensado para ser utilizado junto con los Cdigos en uso -a los que llama los
Cdigos Especiales-, como su complemento, y est listo para su
implementacin inmediata. Es un "terso texto de slo 35 artculos", que refiere
a los dems Cdigos cuando lo considera apropiado, pero para la mayora de
los propsitos puede funcionar por s mismo. Propone un nmero de mejoras
futuras, que dependen de que se hagan reformas en los Cdigos Especiales
para poder efectuarse "y que esperablemente disparen esas reformas". Una
de ellas es el requerimiento de registrar nombres nuevos y actos
nomenclaturales (por ejemplo las designaciones de lectotipos), que en la
nueva versin fue modificada para tomar ventaja de los recientes progresos
tecnolgicos. Otras innovaciones propuestas son el requerimiento de que las
descripciones de nuevos taxones sean en ingls o latn (en el 2011 todava se
deban hacer en latn para plantas, y en cualquier lengua en animales), la
opcin de proteger nombres y sus atributos por medio de Listas de Nombres
Adoptados, el prospecto de evitar los homnimos entre-Cdigos para los
nombres futuros, y el permiso, para los llamados organismos "ambirregnos",
de usar sufijos de cualquier Cdigo para los nombres supragenricos,
independientemente del Cdigo que se est aplicando. Introduce rangos
adicionales a los primarios (profamilia entre familia y subfamilia, prognero
entre gnero y subgnero, proespecie entre especie y subespecie) de forma
de implementar las reglas de forma retroactiva para todos los tipos de
organismos sin efectos desestabilizadores en el sistema actual de nombres.
(W Greuter, secretario de la ICB369 ).
A comienzos de este siglo, la rpida evolucin de las bases de datos dej en
evidencia que es ms prctica la produccin de listas de nombres adoptados
por taxn, y la nueva edicin fue creada para que sus provisiones puedan ser
adoptadas en diferente momento por diferentes taxones dentro de cada
Cdigo, lo cual estara determinado por el cuerpo internacional mandatario
apropiado para cada taxn si fuera operacional. (DL Hawksworth150 ).
Algunos cambios menores fueron realizados en los Cdigos Especiales desde
1997150 370 Con la llegada de los anlisis moleculares aument la cantidad de
grupos que fueron tratados sucesivamente bajo los Cdigos de Botnica y
Zoologa, por lo que se acentu la necesidad de armonizar la nomenclatura de
protistas, que al 2011 queda pendiente. Tambin queda pendiente un registro
mandatario de nombres y una lista de nombres en uso, que al 2011 slo sigue
existiendo en bacterias (DL Hawksworth150 ).
Las variaciones de terminologa entre Cdigos, y la terminologa unificada
propuesta:
ICNCP (de
BioCode (unificado BC (de ICBN (de ICZN (de
Plantas
) Bacterias) Botnica) Zoologa)
Cultivadas)
efectivament efectivament
publicado publicado publicado
e publicado e publicado
fecha (o
fecha fecha fecha prioridad
prioridad)
precedencia prioridad prioridad precedencia precedencia
Estatus nomenclatural
vlidamente vlidamente
establecido establecido disponible
publicado publicado
potencialment
aceptable legtimo legtimo -----
e vlido
Estatus taxonmico
estndar
nomenclatura
l (nombre del
especmen o
fotos de
tipo tipo referencia; ya
tipo portador de tipo
nomenclatura nomenclatura que el "tipo"
nombre nomenclatural
l l es toda la
descripcin
original, que
es
invariable)nota
19
nombre y nombre y
taxn nominal ------ taxn nominal
tipo tipo
Sinonimia
nomenclatura
homotpica objetiva lu ------ objetiva
homotpica
taxonmica o
heterotpica subjetiva ------- subjetiva
heterotpica
sustituto
declarado
nombre de (avowed reemplazo
reemplazo substitute) o explcito
------- -------
(replacement nombre de (explicit
name) reemplazo replacement)
(replacement
name)
supresin
supresin rechazo ------- supresin
explcita
Vase tambin[editar]
Este artculo trat sobre el campo de accin de la taxonoma. Para la
clasificacin de la biodiversidad ver:
Taxn
Concepto de Taxn
Circunscripcin (taxonoma)
Escuelas de la Sistemtica
Escuela cladista
Escuela fentica
Escuela evolucionista
Sistema natural de clasificacin
Sistema artificial de clasificacin
Taxonoma popular
Categora taxonmica
Notas[editar]
1. Saltar a:a b Definicin de dendrograma en libros de matemtica como por
ejemplo en Everitt et al. 20111 Un dendrograma es un rbol donde cada nodo
representa la agrupacin de todos los nodos terminales conectados a l. La
"topologa del rbol" est dada exclusivamente por las relaciones entre
nodos. Un dendrograma es una representacin pictrica de un proceso
de agrupamiento jerrquico, sea ste aglomerativo (como el de la figura) o
divisivo, y es la aproximacin a la filogenia, o al menos a la clasificacin, que
utilizan todas las escuelas de taxonoma.
Dendrograma aglomerativo
(Sobre los dendrogramas) Como el sistema linneano requiere que las entidades
taxonmicas sean ordenadas de una forma jerrquica y sin solapamientos, la mayora
de los mtodos de agrupamiento usados en taxonoma biolgica han sido tcnicas
jerrquicas, sin solapamientos."
Sokal (19862 )
Citas[editar]
1. Saltar a:a b c d e f g h En la argumentacin original de Hennig (195035 en
alemn, 2ed 196636 en ingls) considerado el fundador del cladismo, o "su
voz ms articulada" como lo llamaba Mayr 198237 p.167., y como se puede
ver por ejemplo en el cuadro "Hennigian Argumentation" de Judd et
al. (200718 p. 20.), son las apomorfas las que determinan la topologa del
rbol y por lo tanto sus secuencias de ancestros y descendientes, asumiendo
que cada vez que se gener una lnea filtica hubo cambios evolutivos
(apomorfas) en ella; si bien tambin se pueden usar otros mtodos para
obtener la topologa del rbol. Autores posteriores se refirieron a los rboles
de Hennig como cladogramas y a sus ramificaciones derivadas de un corte
como clados el primero en utilizar el trmino "cladismo" en reemplazo del
confuso trmino Hennigiano "sistemtica filogentica" fue Mayr (196538 ),
pero adems se utiliza "clado" en un sentido ms amplio, como hiptesis de
ser todos los derivados de una secuencia de ancestros y descendientes con
un ancestro comn. Muchos libros de texto incluyen los ancestros en el
grupo, p. ej. Judd et al. (200718 )p. 5-6., traduccin: "Los grupos monofilticos
tambin son referidos como clados", "Una aproximacin filogentica
demanda que cada taxn sea un grupo monofiltico, definido como un
grupo compuesto por un ancestro y todos sus descendientes mono:
nico, phylum: linaje)". Esta definicin resulta poco rigurosa ya que los
mtodos de obtencin de clados lo hacen sobre los organismos de los que se
tomaron los datos: las poblaciones vivientes. Una de las voces ms
conspicuas del cladismo como K de Queiroz uno de los creadores
del PhyloCode reconoce en su publicacin del 201227 que su intencin es
nombrar a la ...secuencia de ancestros y descendientes, o sus productos, los
clados. De la misma forma Cavalier-Smith (201039), llama "clado Hennigiano"
al dendrograma formado por el mtodo de las apomorfas: "Uno no podra
enfatizar lo suficientemente fuertemente que un cladograma Hennigiano no
es un rbol filogentico, los cladogramas no tienen ancestros, slo especies
vivientes". El trmino monofiltico tambin fue utilizado sin los ancestros
por GG Simpson y E Mayr y al menos segn Mayr fue tradicionalmente
definido as, como un adjetivo que califica a un taxn -a una circunscripcin-,
como se puede leer en las citas textuales de "monofiltico sensu Hennig"cita
14
.
Sobre la etimologa de clado, s lo cuenta Dupuis (198440 ), traduccin:
"Cuando acu el trmino "clado" (clade) a partir del trmino "cladognesis"
(cladogenesis)... que fue tomado directamente de Rensch41 , "Huxley intent
denotar "unidades monofilticas delimitables" (Huxley 195742 p.454) o, ms
precisamente, "unidades monofilticas de cualquier magnitud" (Huxley
195843 p.27). l parece no haber conocido un uso ms antiguo de este
trmino en Cunot 194044 (...(sin la misma definicin)...). El adjetivo
"cladstico" (cladistic) ha sido explcitamente derivado de "clado"
(clade) sensu Huxley por Cain y Harrison, para quienes "la cercana de las
relaciones genealgicas (relationship) en trminos de lneas filticas pueden
ser llamadas cladsticas..., las similitudes debido a un ancestro comn, no a
una convergencia, pueden ser llamadas patrsticas" (Cain y Harrison
196045 p.3). Tanto cladstico como patrstico (Cain y Harrison 196045 ) refieren
a afinidades filticas y necesitan la clarificacin que fue abordada por Sokal y
Sneath (Sokal y Sneath 196346 :220): Cladstica es una relacin "por el
ancestro comn ms reciente" (through recency of common ancestry), y
patrstica, una por ancestro comn sin ms especificaciones. Para esos
autores, que confan en las relaciones (relationships) de los tipos opuestos de
Hennig I y Ia (Hennig 195747 fig.6), cladstica es "el tipo I de las relaciones
filogenticas (phylogenetic relationship) de Hennig 195747 ". Entonces igualan
una relacin cladstica (cladistic) con una Hennigiana. El trmino "cladista"
(cladist) fue introducido en 1965 "en lnea con la terminologa desarrollada
por Rensch (1960), Huxley (195843 ) y Cain y Harrison (196045 )" (Mayr
1965a48:167). Si bien ninguno de esos autores se refera a Hennig, al acuar
el trmino "cladismo" (cladism) Mayr tipifica "al cladista" (the cladist) como a
quien adhiere a aquella "escuela filogentica" de la cual Hennig es el "vocero
ms articulado" (Mayr 198237 :167). El trmino "cladograma" (cladogram) fue
introducido en ese mismo ao (1965) pero tiene dos significados diferentes.
Para Mayr (1965b38 :81), "el cladograma de los cladistas" es el diagrama
filtico de la escuela Hennigiana. Para Camin y Sokal (Camin y Sokal
196549 :312), el trmino "cladograma" es usado "para distinguir un
dendrograma cladstico de uno fentico que podra ser llamado un
fenograma", desafortunadamente, estos autores construyeron sus
"cladogramas" por tcnicas fenticas y no Hennigianas. Consecuentemente,
hay dos tipos de cladogramas: aquellos que se basan en atributos
(el Stufenreihe de Hennig, los sinapomorfogramas -synapomorphograms- de
Sneath, ver Moss 198350 ) y aquellos que se basan en objetos (es decir en
construcciones fenticas); el utilizarlos inadvertidamente como sinnimos (por
ejemplo en Sokal 198351 :160) lleva a confusiones. En los trabajos de Hennig,
estos trminos son siempre utilizados entre comillas y aparecen como meras
citas. En trabajos de otros autores, "cladista" y "cladismo" comnmente
aplican hoy en da a la escuela nacida por el pensamiento Hennigiano,
mientras que "cladstico" y "cladograma" se han vuelto igualmente populares
tanto en la escuela fentica como en la Hennigiana, y consecuentemente, su
significado se mantiene ambiguo. An peor, "cladograma" se ha vuelto una
palabra de moda que es a veces utilizada para denotar construcciones
intuitivas que no hacen referencia a un procedimiento definido."
Ver tambin la nota "dendrograma".nota 1
2. Saltar a:a b c d :
Como Hull (19793 ) ya ha hecho notar, los cladistas en realidad clasifican caracteres en
lugar de organismos, tienen que hacer la suposicin arbitraria de que nuevas
apomorfas se originan cada vez que una lnea [filtica] se ramifica de su lnea
hermana. Esto es poco probable en la mayora de los casos.
E Mayr (19814 )
Los sistemticos siempre han sido, son, sern, y deberan ser tipologistas.
Platnick (200110 )
4. Saltar a:a b
El autor E Mayr (196916 ) en Principles of Systematic Zoology sigue a GG
Simpson15 en la distincin entre taxonoma (la teora y prctica de clasificar
organismos) de la sistemtica (la ciencia de la diversidad de organismos). Es
ventajoso que uno de estos dos trminos no se desperdicie volvindolos, como en el
pasado reciente, sinnimos, si bien uno puede argumentar cul es cul.
Richards (197017 ), review del libro de E Mayr (1969) Principles of Systematic Zoology.
Al 2007 la primera cita del libro de texto de los cladistas Judd et al. (200718 ),
y la nica sobre este tema, es:
De acuerdo con el paleontlogo George Gaylord Simpson (196115 :7), "la sistemtica
es el estudio cientfico de los tipos (the kinds) y la diversidad de organismos y cada
una y todas las relaciones entre ellos".
Judd et al. (200718 ), un libro cladista cuya primera edicin en 1998 fue muy premiada.
5. Saltar a:a b
De acuerdo con el punto de vista del autor [E Mayr], que pienso que casi todos los
bilogos deben compartir, la especie es la nica categora taxonmica que tiene al
menos en los ejemplos ms favorables una existencia completamente objetiva.
Richards (197017 ), review del libro de E Mayr (1969) Principles of Systematic Zoology.
7. Volver arriba
Sistemticos, bilogos evolutivos, bilogos de poblaciones, bilogos de la
conservacin, eclogos, agrnomos, horticultores, biogegrafos y muchos otros
cientficos estn ms interesados en las especies que en ningn otro taxn.
de Queiroz (200026 ):
de Queiroz (201227 ):
-...Taxonoma basada en rangos (lo que otros autores llaman
'taxonoma linneana')...
Rule 23a. Each taxon above species, Regla 23a. Cada taxn por arriba de
up to and including order, with a especie hasta orden, con sus
given circumscription, position, and circunscripcin, posicin y rango
rank can bear only one correct dados, pueden llevar slo un nombre
name, that is, the earliest that is in correcto, esto es, el ms antiguo de los
accordance with the Rules of this que estn de acuerdo con las reglas de
Code. The name of a species is a este Cdigo. El nombre de una especie
binary combination of a generic es una combinacin binaria de un
name and specific epithet (see Rule nombre genrico y un epteto especfico
12a). In a given position, a species (ver regla 12a). En una posicin dada,
can bear only one correct epithet, una especie puede llevar slo un epteto
that is, the earliest that is in correcto, esto es, el ms antiguo de los
accordance with the Rules of this que estn de acuerdo con las reglas de
Code. Example: The este Cdigo. Ejemplo: la
species Haemophilus pertussis bears especie Haemophilus pertussis lleva
this name in the genus Haemophilus. este nombre en el gnero Haemophilus.
If placed in the genus Bordetella, it Si se la ubica en el gnero Bordetella,
bears the name Bordetella pertussis. lleva el nombre Bordetella pertussis.
...I would only amend the proposal ...Yo slo modificara la propuesta de
of Wgele et al. to note that the Wgele et al. de forma de tener en
taxonomic concept of the original cuenta que el concepto taxonmico
describer is often not the concept in (taxonomic concept) utilizado en la
current use. Therefore, logic would descripcin original muchas veces no
dictate that citations should be es el utilizado en la actualidad.
demanded for both the paper of the Entonces, la lgica dictara que debera
original description as well as that demandarse que se citaran ambas
circumscribing that actual publicaciones, la de la descipcin
taxonomic concept being used. original como la que circunscribi el
concepto taxonmico que se est
utilizando.
Johnson (201133 )
19.
Page (201334 )
20.
21. Ver tambin Franz et al. (200821 ), On the Use of Taxonomic Concepts in
Support of Biodiversity Research and Taxonomy. Taxonomic concept: The
meaning of a name as specified in a particular source. Propone especificarlos
con el conector sensu seguido de la fuente taxonmica.
22. Saltar a:a b Existe una lucha moral (sociolgica3 ) y conceptual acerca de la
definicin de "monofilia". Citas.